{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.3098965884302, 2, 0, 0.2967884573954823, 0.01027250137666228, 0, -0.01558577049888613, 1, 0.08808338844318997, 0.003033618805151917],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5937197870809, 461.3199717980231, 0, 1, 0.2966758009225556, 0, 0.002167692840399773, 0.003288893511302393, 0.7033241990774444, 1, 0.001515908696759967],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004906832879641346],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.00102529684875433],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5597790706195, 461.3539125144845, 0, 1, 0.2966240552174472, 0, 0.002167533368363066, 0.003288651555183434, 0.7033759447825528, 1, 0.001515911273011347],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.74311198593, 451.9939009802634, 0, 0, 0.295671136543788, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004848131385585838],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7852985971664, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2969267976173533, 0.005133857674074728, 0, -0.007789254491010097, 1, 0.2969267976173533, 0.001031153093884941],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.6107433600924, 0, 0, 0.2956484443993479, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005270502934571775],
[189.5616083854374, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2955601326398566, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7044398673601434, 1, 0.0007001070346458341],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000287788004241126],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2953607223521111, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7046392776478889, 1, 0.001516780454167513],
[189.3801047849448, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2952724979226432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006704197372624904],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6037949966737, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2967322171751318, 0.005138645934510642, 0, -0.007796519394221754, 1, 0.2967322171751318, 0.000844952345467436],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006223899828029527],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.0006508789343867787],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002399905354577892],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004469832908332781],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001068969270055915],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.8311438380386, 451.7243655276623, 0, 0, 0.2958920016534853, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004784973082916741],
[194.8293145232207, 461.0843770618833, 0, 1, 0.2970349864970638, 0, 0.002168800440327623, 0.003290573997646183, 0.7029650135029362, 1, 0.001036506316949743],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0035832325106, 452.0816235940078, 2.5, 4.75, 0.2959164628190019, 0.01315764659522609, 0.0105069521787635, -0.004021719085044139, 0.7480829412117554, 0.5247821839540472, 0.007662360614586806],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.4382732158301, 1, 0, 0.2967303888153876, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2967303888153876, 0.001517427212178581],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.6530011674588, 449.9043960292352, 1.75, 0, 0.2954362473845844, 0.009276290274579855, 0, -0.01407428687516293, 1, 0.1599761252453551, 0.0008592398423210323],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006562509094048606],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.00151584742191857],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515395631880995],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5880870840306, 461.3256045010733, 1, 0, 0.2966672133551325, 0.005139060746139929, 0, -0.007797148759808311, 1, 0.2966672133551325, 0.001516389670974752],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005090038352265687],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.0005749085871373812],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004313267962244738],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515907767635915],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.0843770618833, 0, 1, 0.296890521658241, 0, 0.002168800440327622, 0.003290573997646182, 0.703109478341759, 1, 0.001515871747696534],
[194.6945467969201, 461.2759558719688, 0, 1, 0.2968038135934217, 0, 0.002167899686229383, 0.003289207344468313, 0.7031961864065783, 1, 0.001515658533271419],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7576599782862, 461.2637460529341, 0, 1, 0.2968769893600356, 0, 0.002167957071322144, 0.0032892944109824, 0.7031230106399644, 1, 0.001515715368683659],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515225310421875],
[189.3486889596585, 452.2068204060423, 0, 0, 0.2951399936489761, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004708545725474313],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.455148672548, 452.1003606931528, 1, 0, 0.2953059336359847, 0.005278294134557346, 0, -0.008008398148646186, 1, 0.2953059336359847, 0.0005264164357553204],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005180995088449835],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000484812249529888],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4708565851911, 452.0846527805098, 1, 0, 0.2953304177412784, 0.005277856542282394, 0, -0.00800773421952908, 1, 0.2953304177412784, 0.0005344982037156589],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004958315364125061],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4479862178676, 452.1075231478333, 0, 0, 0.2952947694349516, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000434344461247856],
[194.6377357131352, 461.2759558719688, 0, 1, 0.2967429071998281, 0, 0.002167899686229383, 0.003289207344468313, 0.7032570928001719, 1, 0.001082740567467439],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.0029679868346, 461.3445285315811, 0, 1, 0.297103240312829, 0, 0.002167577457096785, 0.003288718448032617, 0.7028967596871709, 1, 0.001515717291606561],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004824588098424],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001032462653421444],
[190.3928999426755, 451.1626094230254, 0, 1, 0.296767617397464, 0, 0.002216495735936233, 0.003362938838883505, 0.703232382602536, 1, 0.001515936980267391],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.2920729328362, 451.2634364328646, 0, 0, 0.2966104571699119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006168980373694664],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.0597790706195, 460.8539125144845, 0, 1, 0.2973863506328572, 0, 0.002169885017453487, 0.003292219553052043, 0.7026136493671429, 1, 0.000899209725681878],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.1004941227507, 451.4550152429501, 0, 1, 0.2963118410606451, 0, 0.002215060119471374, 0.003360760675267333, 0.7036881589393549, 1, 0.001516518809418368],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.2920729328362, 451.2634364328646, 0, 0, 0.2966104571699119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000669438707215799],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.0597790706195, 460.8539125144845, 0, 1, 0.2973863506328572, 0, 0.002169885017453487, 0.003292219553052043, 0.7026136493671429, 1, 0.0008458212968435896],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0876989650201, 452.3541882331109, 1, 0, 0.2947853932504629, 0.005288551320226246, 0, -0.008023960681659142, 1, 0.2947853932504629, 0.001516273825998672],
[189.3700295753519, 452.128668706564, 0, 1, 0.2951993980385764, 0, 0.002211759769316929, 0.003355753277537506, 0.7048006019614237, 1, 0.0009394918479509615],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005756795175173385],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.001515908926607314],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5937197870809, 461.3199717980231, 0, 1, 0.2966758009225556, 0, 0.002167692840399773, 0.003288893511302393, 0.7033241990774444, 1, 0.001516969293962859],
[194.3898435685651, 461.3322692064533, 1, 0, 0.2964515604726316, 0.005144301685943177, 0, -0.007805100482760373, 1, 0.2964515604726317, 0.001516422093693641],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[184.9486220770853, 447.8525428552504, 1.5, 3, 0.2922697244036545, 0.008110360505280275, 0.006698633395880091, -0.002141917915353573, 0.7450116420646489, 0.592828736580264, 0.004584416305087749],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006675900021916886],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.000848021361542711],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5597790706195, 461.3539125144845, 0, 1, 0.2966240552174472, 0, 0.002167533368363066, 0.003288651555183434, 0.7033759447825528, 1, 0.001516971886915051],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515873195945311],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515644313804865],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2952724979226432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006039398136473148],
[194.6037949966737, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2967322171751318, 0.005138645934510642, 0, -0.007796519394221754, 1, 0.2967322171751318, 0.0009114043186264813],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7531871955229, 451.9159443377478, 0, 1, 0.2957181168152923, 0, 0.00221280088151223, 0.003357332886548454, 0.7042818831847077, 1, 0.001515182621576514],
[194.6945467969201, 461.2759558719688, 0, 1, 0.2968038135934217, 0, 0.002167899686229383, 0.003289207344468313, 0.7031961864065783, 1, 0.001515758135359154],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9607813755982, 451.5947279901027, 1, 0, 0.2960940691841465, 0.005264244507516313, 0, -0.007987081601232139, 1, 0.2960940691841465, 0.001516169378196151],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.00151678103490649],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515572067866596],
[189.0709923683407, 452.5981391649299, 1, 0, 0.2946549601296153, 0.005289018624558965, 0, -0.008024669690868859, 1, 0.2946549601296153, 0.001516245934301227],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.4492387883717, 461.5212638805172, 0, 1, 0.2964298516430744, 0, 0.00216674740312483, 0.003287459063367265, 0.7035701483569256, 1, 0.00151570025043591],
[194.7352873602631, 461.0436364985403, 1, 0, 0.2969526471122024, 0.0051351761334862, 0, -0.007791254900165164, 1, 0.2969526471122024, 0.001515870395182013],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4836517429218, 452.0718576227791, 0, 1, 0.295350361701768, 0, 0.002212037717318884, 0.003356174989213198, 0.7046496382982319, 1, 0.00151666272597562],
[189.4268406591368, 452.128668706564, 0, 1, 0.2952618096077472, 0, 0.002211759769316929, 0.003355753277537506, 0.7047381903922528, 1, 0.001257788375634635],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.00025837454723366],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3700295753519, 452.1854797903489, 0, 1, 0.2951732575137264, 0, 0.002211481891155902, 0.003355331671826725, 0.7048267424862735, 1, 0.001515530029010766],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.001515690578441495],
[190.2160303611969, 452.1378249848256, 0, 0, 0.2961234353590538, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006706507110172808],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.0217577847998, 461.2911067904649, 0, 1, 0.2971475470178523, 0, 0.002167828482447281, 0.003289099311792939, 0.7028524529821477, 1, 0.0008445330887748899],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7352873602631, 461.1784042248408, 1, 0, 0.2968916335465707, 0.0051351761334862, 0, -0.007791254900165164, 1, 0.2968916335465708, 0.00151658182724767],
[194.7576599782862, 461.5552045969785, 0, 1, 0.2967451508120664, 0, 0.002166588070159845, 0.003287217318252408, 0.7032548491879336, 1, 0.001515726025574394],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.2053165273612, 450.5667937618356, 0, 0.5, 0.2946360892966247, 0, 0.001109713380840698, 0.001683692942852234, 0.8398594588997467, 1, 0.0005332785700009487],
[189.3832742596624, 452.2799495521548, 0, 1, 0.2951443486734772, 0, 0.002211019968915701, 0.003354630828501411, 0.7048556513265228, 1, 0.0005529719989236029],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004289073972947072],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.0937197870809, 460.8199717980231, 1, 0, 0.2974380963379657, 0.005125741623520062, 0, -0.007776940557269504, 1, 0.2974380963379657, 0.00151582353190935],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.00151532051437078],
[188.9895112416547, 452.5659981240461, 0, 0, 0.2945801391815755, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007059762981880212],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.4084982250287, 461.5051933600752, 0, 1, 0.2963934138273808, 0, 0.002166822853539984, 0.003287573539171308, 0.7036065861726193, 1, 0.0008095709652960553],
[189.0940562130535, 452.4614531526474, 0, 1, 0.2947430946388548, 0, 0.002210133024663714, 0.003353285128067807, 0.7052569053611452, 1, 0.001516698475689266],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006951049930524147],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.0008203533234429241],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006052882395424545],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.0009100187429006637],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.001516241529536968],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.8707208020415, 452.5711663960895, 0, 0, 0.2944471269674074, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004634752815304627],
[194.3491030052221, 461.5077774960969, 1, 0, 0.2963285265173509, 0.00514538006369461, 0, -0.007806736632275342, 1, 0.2963285265173509, 0.001052745660820517],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.74311198593, 451.8123973797709, 0, 0, 0.2957547853864228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004478076011006169],
[194.7852985971664, 461.1283929879376, 1, 0, 0.2969678802197914, 0.005133857674074729, 0, -0.007789254491010099, 1, 0.2969678802197915, 0.001068189284343507],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000447807650124879],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001068189233740028],
[189.5616083854374, 451.6107433600924, 0, 0, 0.2956484443993479, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004634623354779662],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.0275659780984, 0, 1, 0.2969162439451249, 0, 0.00216906769528724, 0.003290979485493062, 0.7030837560548751, 1, 0.001052758689516112],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004634618375278832],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.00105275916606269],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4801272587514, 452.0753821069495, 0, 0, 0.2953448680474873, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004501714678198648],
[194.6538062335771, 461.2598853515269, 1, 0, 0.2967674081679403, 0.005137325692979456, 0, -0.007794516281177163, 1, 0.2967674081679403, 0.001065763984987132],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004634526938321298],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.001052765579047923],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000463452646220053],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.0010527656497774],
[188.9522019287275, 452.2201498168023, 0, 0, 0.2946979878566557, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004634623278274865],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.3898435685651, 461.3322692064534, 1, 0, 0.2964515604726315, 0.005144301685943177, 0, -0.007805100482760373, 1, 0.2964515604726315, 0.001052758697908106],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004634752839278585],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001052745659546899],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.74311198593, 451.8123973797709, 0, 0, 0.2957547853864228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000447820831208907],
[194.7852985971664, 461.1283929879376, 1, 0, 0.2969678802197914, 0.005133857674074729, 0, -0.007789254491010099, 1, 0.2969678802197915, 0.001068175989851839],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004501850497167659],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001065750170012376],
[190.2524959688333, 451.4166355644374, 0, 0, 0.2964962573690031, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004478343475079721],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.039990588618, 460.9305120802709, 1, 0, 0.2973304284187721, 0.005127153651833478, 0, -0.007779082932181307, 1, 0.2973304284187721, 0.001068162357145735],
[189.4801272587514, 452.0753821069495, 0, 0, 0.2953448680474873, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004405156021931573],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6538062335771, 461.2598853515269, 1, 0, 0.2967674081679403, 0.005137325692979456, 0, -0.007794516281177163, 1, 0.2967674081679403, 0.001075286080338808],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.359954365759, 452.0505170070858, 0, 0, 0.2952242952324459, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004635919474694421],
[194.5937197870809, 461.247452801595, 0, 1, 0.2967086055591759, 0, 0.002168033652925447, 0.003289410603061599, 0.7032913944408241, 1, 0.001052655076591284],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.001516389854063329],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.001516389869929828],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.2482759953829, 461.0992205230328, 0, 1, 0.297476987466356, 0, 0.002168730623456016, 0.003290468069236158, 0.7025230125336439, 1, 0.001515715053964222],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7576599782862, 461.3751600344639, 0, 1, 0.2968265784578519, 0, 0.002167433547842719, 0.003288500104269564, 0.7031734215421481, 1, 0.001515638948247997],
[194.7352873602631, 461.1784042248408, 1, 0, 0.2968916335465707, 0.0051351761334862, 0, -0.007791254900165164, 1, 0.2968916335465708, 0.001515904792150939],
[194.6945467969201, 461.1077308066541, 0, 1, 0.2968799491035177, 0, 0.002168690596990462, 0.003290407339791291, 0.7031200508964823, 1, 0.001515982220143534],
[189.5616083854374, 452.1075231478333, 0, 0, 0.2954195535828243, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004382525355638589],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2759558719688, 0, 1, 0.2968038135934217, 0, 0.002167899686229383, 0.003289207344468313, 0.7031961864065783, 1, 0.001077890765673406],
[194.6945467969201, 461.4382732158301, 1, 0, 0.2967303888153876, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2967303888153876, 0.00151598225640384],
[195.1945467969201, 460.7191447881839, 0, 1, 0.2975918162726656, 0, 0.002170519743562536, 0.00329318257998215, 0.7024081837273344, 1, 0.001516081714717735],
[189.9447660056084, 451.6107433600924, 0, 0, 0.296069105841527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004012502809486481],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8861256070056, 461.0275659780984, 0, 1, 0.2971216001544913, 0, 0.00216906769528724, 0.003290979485493062, 0.7028783998455086, 1, 0.00111644845944518],
[194.7852985971664, 461.1126850752945, 1, 0, 0.2969749922183589, 0.005133857674074729, 0, -0.007789254491010099, 1, 0.2969749922183589, 0.001516081725062464],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.00151608170645442],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516081715749206],
[194.8007837789124, 461.2206222523079, 0, 1, 0.2969427247159702, 0, 0.00216815977376865, 0.003289601957673801, 0.7030572752840298, 1, 0.001515982256604524],
[194.6945467969201, 461.0000163605378, 1, 0, 0.2969287191575604, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2969287191575605, 0.001519012201035762],
[193.7953738067593, 462.1183177783447, 0, 1, 0.2954586499611353, 0, 0.002163947979399619, 0.0032832116873767, 0.7045413500388646, 1, 0.001516908380186896],
[194.3491030052221, 461.5077774960969, 1, 0, 0.2963285265173509, 0.00514538006369461, 0, -0.007806736632275342, 1, 0.2963285265173509, 0.001516356785701152],
[194.6945467969201, 461.0275659780984, 0, 1, 0.2969162439451249, 0, 0.00216906769528724, 0.003290979485493062, 0.7030837560548751, 1, 0.001516389929319057],
[194.8293145232206, 461.0843770618833, 0, 1, 0.2970349864970638, 0, 0.002168800440327623, 0.003290573997646183, 0.7029650135029362, 1, 0.001516590463188632],
[194.5883098149278, 461.2176673240598, 0, 1, 0.2967162798116552, 0, 0.002168173664729504, 0.003289623033487758, 0.7032837201883448, 1, 0.001515990709160038],
[194.3430018063794, 461.5706897787245, 0, 1, 0.2962935585880566, 0, 0.002166515383546986, 0.003287107035778371, 0.7037064414119434, 1, 0.001515691243704074],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.001516389881254926],
[194.8747802394645, 460.747452801595, 1, 0, 0.297236381590586, 0.005131500334579918, 0, -0.007785677859476366, 1, 0.2972363815905861, 0.001516590438137774],
[194.7228548103312, 461.1908367747727, 0, 1, 0.2968726789949409, 0, 0.002168299801863497, 0.003289814412816873, 0.703127321005059, 1, 0.0015159822500604],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515982267018753],
[194.6721741788969, 461.1338029600907, 0, 1, 0.296844159652481, 0, 0.002168567980878526, 0.003290221302670435, 0.703155840347519, 1, 0.001519012171109771],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.00151599072617917],
[194.751357880705, 461.162333704399, 0, 1, 0.2969161345146829, 0, 0.002168433818016437, 0.003290017746447726, 0.7030838654853171, 1, 0.001515691232254913],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.00151659895213575],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516039567502229],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001516081706441188],
[194.6538062335771, 461.3946530778275, 1, 0, 0.2967064451883444, 0.005137325692979456, 0, -0.007794516281177163, 1, 0.2967064451883444, 0.001515982249598181],
[194.6945467969201, 461.3991893506985, 0, 1, 0.29674806520804, 0, 0.002167320669564341, 0.003288328841703944, 0.70325193479196, 1, 0.001522272449879696],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.0015160817286],
[194.2953738067593, 461.6183177783447, 1, 0, 0.2962209453765453, 0.005146802934147942, 0, -0.007808895457231614, 1, 0.2962209453765453, 0.001518183835797852],
[194.8010065098095, 461.1126850752945, 1, 0, 0.2969918283593785, 0.005133443701943314, 0, -0.007788626399136796, 1, 0.2969918283593784, 0.001516081715749206],
[194.7852985971664, 461.1283929879376, 1, 0, 0.2969678802197914, 0.005133857674074728, 0, -0.007789254491010097, 1, 0.2969678802197915, 0.001516081774357821],
[194.6945467969201, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2967428484146308, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7032571515853692, 1, 0.001518183837256242],
[194.9805953688114, 460.9330962162925, 0, 1, 0.2972656278871302, 0, 0.002169512252881817, 0.003291653982617818, 0.7027343721128698, 1, 0.001516081778852601],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001516616529391394],
[194.5597790706195, 461.3539125144845, 0, 1, 0.2966240552174472, 0, 0.002167533368363066, 0.003288651555183434, 0.7033759447825528, 1, 0.001516908365417677],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.001516356813535743],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.00151501035830367],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515200120949407],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516389887704312],
[194.9492387883717, 461.1835812243784, 0, 1, 0.2971185602094762, 0, 0.0021683339145447, 0.003289866169677334, 0.7028814397905238, 1, 0.001515982242540563],
[194.7169194149432, 461.5959451603215, 0, 1, 0.2966830759000206, 0, 0.002166396846602887, 0.00328692718770256, 0.7033169240999794, 1, 0.001518183823950177],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.0015165904545392],
[194.6000770351142, 461.404366350236, 0, 1, 0.2966444495876718, 0, 0.002167296352026575, 0.003288291946351116, 0.7033555504123281, 1, 0.001516081767183632],
[194.8861256070056, 461.0275659780984, 0, 1, 0.2971216001544913, 0, 0.00216906769528724, 0.003290979485493062, 0.7028783998455086, 1, 0.001515982232175946],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516081772451556],
[194.7289852626819, 461.0769918763058, 0, 2, 0.2969307875359791, 0, 0.004337670357094168, 0.006581253407186939, 0.4943063175147787, 1, 0.003044390480540695],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516081772082751],
[194.6945467969201, 461.43827321583, 0, 1, 0.2967303888153877, 0, 0.00216713709729983, 0.003288050319941842, 0.7032696111846124, 1, 0.001516471713059403],
[194.7953738067593, 461.1183177783447, 0, 1, 0.2969832407919554, 0, 0.002168640805288266, 0.003290331794214345, 0.7030167592080446, 1, 0.001516081715908394],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001516357243882754],
[194.5937197870809, 461.3199717980231, 0, 1, 0.2966758009225556, 0, 0.002167692840399773, 0.003288893511302393, 0.7033241990774444, 1, 0.001516908384565119],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516389904178993],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.00151772558441748],
[194.7890165587259, 461.0339232261317, 0, 1, 0.2970146433466117, 0, 0.002169037785771594, 0.003290934105810987, 0.7029853566533883, 1, 0.001516389909222389],
[194.5029679868346, 461.3539125144845, 0, 1, 0.296563127977192, 0, 0.002167533368363066, 0.003288651555183434, 0.703436872022808, 1, 0.001516471749150402],
[194.8861256070056, 461.0275659780984, 0, 1, 0.2971216001544913, 0, 0.00216906769528724, 0.003290979485493062, 0.7028783998455086, 1, 0.001516081839645427],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516590863517555],
[188.2632624051158, 453.292246960585, 0, 1, 0.2934481267119812, 0, 0.002206082293939946, 0.003347139228729514, 0.7065518732880187, 1, 0.001516261075787432],
[188.791570418527, 452.7639389471739, 0, 1, 0.2942716065289241, 0, 0.00220865646306844, 0.003351044841178802, 0.7057283934710759, 1, 0.001515837490471393],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.7632624051158, 452.792246960585, 0, 0, 0.2942274825006866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005036134885229616],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1624353952766, 452.3930739704243, 1, 0, 0.2948496780618399, 0.005286461859673065, 0, -0.008020790484697927, 1, 0.2948496780618399, 0.0005825738829279887],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000428895286507659],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.3801047849448, 453.175404580756, 0, 0, 0.2936302502821529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004483210522730162],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.4708565851911, 453.0846527805098, 1, 0, 0.2937717061638676, 0.005305860110780511, 0, -0.008050222137102209, 1, 0.2937717061638676, 0.001068200204410063],
[188.9607813755982, 452.5947279901027, 1, 0, 0.2945353576067357, 0.005292103433951702, 0, -0.008029350063201272, 1, 0.2945353576067358, 0.001519321953102002],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.5616083854374, 453.0947279901026, 0, 1, 0.2938669778444744, 0, 0.002207043998141254, 0.003348598357370125, 0.7061330221555256, 1, 0.0015193215433267],
[188.5616083854374, 452.9939009802634, 1, 0, 0.2939131620455824, 0.005303306481963748, 0, -0.008046347689076548, 1, 0.2939131620455824, 0.001516389864683619],
[188.5616083854374, 452.9939009802634, 0, 1, 0.2939131620455824, 0, 0.002207535240178806, 0.00334934368563789, 0.7060868379544176, 1, 0.001516780087094677],
[188.5616083854374, 452.9939009802634, 0, 0, 0.2939131620455824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003914753338079605],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0616083854374, 452.4939009802634, 0, 1, 0.2946925178342878, 0, 0.002209974538515641, 0.003353044667770889, 0.7053074821657122, 1, 0.000842010812084246],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002816930345622943],
[188.8801047849448, 452.675404580756, 0, 1, 0.2944096060708583, 0, 0.002209088432640044, 0.003351700239348991, 0.7055903939291417, 1, 0.001516714491504546],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006680176861939553],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6037949966737, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947195, 0.005138645934510642, 0, -0.007796519394221754, 1, 0.2966911614947195, 0.0008473542345711331],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 1, 0.2954718736229933, 0, 0.002212419233603034, 0.003356753838027943, 0.7045281263770067, 1, 0.001515076096289841],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 1, 0.2954718736229933, 0, 0.002212419233603034, 0.003356753838027943, 0.7045281263770067, 1, 0.001169955678535547],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003451387691118341],
[189.2632624051158, 452.292246960585, 0, 1, 0.295006838289392, 0, 0.002210959853324979, 0.003354539619187725, 0.704993161710608, 1, 0.001515837490532333],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1624353952766, 452.3930739704243, 1, 0, 0.2948496780618399, 0.005286461859673064, 0, -0.008020790484697926, 1, 0.2948496780618399, 0.0007737959775985127],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007415690553575407],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.774082349422, 451.9968559085116, 0, 0, 0.2957037644374449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006031617356054626],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8007837789124, 461.220622252308, 0, 1, 0.2969427247159702, 0, 0.00216815977376865, 0.003289601957673801, 0.7030572752840298, 1, 0.0009116756401265553],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4708565851911, 452.0846527805098, 1, 0, 0.2953304177412784, 0.005277856542282394, 0, -0.008007734219529078, 1, 0.2953304177412784, 0.0007909872480870087],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000724587247124765],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1784507652664, 452.3770586004345, 1, 0, 0.2948746414044595, 0.005286014321159682, 0, -0.008020111464826989, 1, 0.2948746414044594, 0.00151642633199982],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1784507652664, 452.3770586004345, 0, 0, 0.2948746414044595, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006096669630040447],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.0009056136078192588],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1784507652664, 452.3770586004345, 0, 0, 0.2948746414044595, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006127630547182558],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.0009033795839753362],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.3801047849448, 453.175404580756, 0, 0, 0.2936302502821529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000457329606064666],
[188.8801047849448, 452.675404580756, 0, 1, 0.2944096060708583, 0, 0.002209088432640044, 0.003351700239348991, 0.7055903939291417, 1, 0.001059301660857989],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 1, 0, 0.2951889618595637, 0.005280385714938611, 0, -0.008011571561878959, 1, 0.2951889618595638, 0.001516418606308879],
[189.5716835950303, 451.9838257706705, 0, 1, 0.2954875779688306, 0, 0.002212468550826826, 0.003356828663710947, 0.7045124220311694, 1, 0.001516319119833237],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3075857885167, 452.6470965673449, 1, 0, 0.2948924448900208, 0.005282408498501169, 0, -0.008014640594358873, 1, 0.2948924448900208, 0.001516898546220039],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000268628994169342],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4708565851911, 452.0846527805098, 1, 0, 0.2953304177412784, 0.005277856542282394, 0, -0.008007734219529078, 1, 0.2953304177412784, 0.0009742848050168759],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002723084159311404],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.001516727163434296],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.359954365759, 451.1955549999419, 1, 0, 0.2967162647452998, 0.005253205714047361, 0, -0.007970333187648806, 1, 0.2967162647452999, 0.001515837485111859],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.0937197870809, 460.8199717980231, 0, 1, 0.2974380963379657, 0, 0.002170044835726649, 0.003292462034492121, 0.7025619036620343, 1, 0.001521346397734895],
[193.7598033737125, 461.3388266173138, 4, 11, 0.2957719563180382, 0.02064411673810918, 0.02384364671982104, 0.004854430111107874, 0.5300429886782851, 0.6906594324400398, 0.02466208854706972],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000654021464990466],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.000861258469780007],
[189.8311438380386, 451.7243655276623, 0, 1, 0.2958920016534853, 0, 0.00221373934264514, 0.003358756750055826, 0.7041079983465146, 1, 0.001516163903867344],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.8311438380386, 451.7243655276623, 0, 0, 0.2958920016534853, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006177997485408998],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8293145232207, 461.0843770618833, 0, 1, 0.2970349864970638, 0, 0.002168800440327623, 0.003290573997646183, 0.7029650135029362, 1, 0.0008979750545913029],
[194.7352873602631, 461.0706897787246, 1, 0, 0.2969403972342753, 0.005135176133486201, 0, -0.007791254900165165, 1, 0.2969403972342753, 0.001515907565654945],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0616083854374, 452.4939009802634, 0, 1, 0.2946925178342878, 0, 0.002209974538515641, 0.003353044667770889, 0.7053074821657122, 1, 0.001516260941746375],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515717715872286],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001516470337057678],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.001516962794362314],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515990670856299],
[194.6945467969201, 461.1183177783446, 0, 1, 0.2968751564869247, 0, 0.002168640805288266, 0.003290331794214345, 0.7031248435130752, 1, 0.001515691274912524],
[194.6538062335771, 461.3946530778275, 1, 0, 0.2967064451883444, 0.005137325692979456, 0, -0.007794516281177163, 1, 0.2967064451883444, 0.001515982278271999],
[194.6945467969201, 461.3199717980231, 1, 0, 0.2967838992556419, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.296783899255642, 0.001518183835409532],
[189.7505479090491, 451.4218038364808, 0, 0, 0.2959431226135555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000438253579012257],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7890165587259, 460.9330962162925, 0, 1, 0.2970603137575734, 0, 0.002169512252881817, 0.003291653982617818, 0.7029396862424266, 1, 0.001077890107042091],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001516389848462242],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.001516389879714861],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2759558719688, 0, 1, 0.2968038135934217, 0, 0.002167899686229383, 0.003289207344468313, 0.7031961864065783, 1, 0.001518253801651061],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516081716626849],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515859695313099],
[194.9805953688114, 460.9330962162925, 0, 1, 0.2972656278871303, 0, 0.002169512252881817, 0.003291653982617818, 0.7027343721128697, 1, 0.00151608172704185],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516081716467664],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.0015158596772689],
[195.0937197870809, 460.8199717980231, 0, 1, 0.2974380963379657, 0, 0.002170044835726649, 0.003292462034492121, 0.7025619036620343, 1, 0.001516389854081422],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6752305530073, 451.8802788126936, 0, 0, 0.2956489778110349, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004382525267438292],
[194.751357880705, 461.162333704399, 0, 1, 0.296916134514683, 0, 0.002168433818016437, 0.003290017746447726, 0.7030838654853171, 1, 0.001077890774338653],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515982238070518],
[195.0217577847998, 461.2911067904649, 0, 1, 0.2971475470178523, 0, 0.002167828482447281, 0.003289099311792939, 0.7028524529821477, 1, 0.001515982216388936],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.8169916035787, 452.6817066783373, 0, 1, 0.2943372950081971, 0, 0.002209057678380124, 0.00335165357799365, 0.7056627049918029, 1, 0.001516267504237056],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.3491030052221, 461.5077774960969, 1, 0, 0.2963285265173509, 0.00514538006369461, 0, -0.007806736632275342, 1, 0.2963285265173509, 0.001515633221866865],
[193.7953738067593, 462.1183177783447, 0, 1, 0.2954586499611353, 0, 0.002163947979399619, 0.0032832116873767, 0.7045413500388646, 1, 0.001516943371321332],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515982217373953],
[194.6538062335771, 461.3946530778275, 1, 0, 0.2967064451883444, 0.005137325692979456, 0, -0.007794516281177163, 1, 0.2967064451883444, 0.001515982254332999],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515859665707241],
[194.6037949966737, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947195, 0.005138645934510642, 0, -0.007796519394221754, 1, 0.2966911614947195, 0.001516389860146011],
[189.5616083854374, 452.4321578355558, 1, 1, 0.2952701698355506, 0.005275329791287119, 0.002210276132412911, -0.004650398295639495, 0.9128155268052851, 0.5033558664763864, 0.003043492287028143],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.43827321583, 1, 0, 0.2967303888153877, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2967303888153876, 0.001515151052468784],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5029679868346, 461.6298520259156, 0, 2, 0.2964384070637633, 0, 0.004332475448073322, 0.006573371523622977, 0.4949989150549747, 1, 0.003035151196315373],
[189.5616083854374, 451.9213819838354, 0, 1, 0.2955052764163167, 0, 0.002212774256465184, 0.003357292490168103, 0.7044947235836833, 1, 0.001516163009430918],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.8488629874074, 0, 0, 0.2955386867627974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004682910786150051],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.1466257917558, 0, 1, 0.2968623424913073, 0, 0.002168507680790402, 0.003290129813431339, 0.7031376575086927, 1, 0.001048004310557855],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.001516389832391745],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001516389886547374],
[194.8861256070056, 461.0275659780984, 0, 1, 0.2971216001544913, 0, 0.00216906769528724, 0.003290979485493062, 0.7028783998455086, 1, 0.001517426160322132],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516081703001482],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004382527597517138],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001077890499251819],
[194.8293145232207, 461.0843770618833, 0, 1, 0.2970349864970638, 0, 0.002168800440327622, 0.003290573997646182, 0.7029650135029362, 1, 0.00151608172008807],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516389851355243],
[194.7852985971664, 461.1283929879376, 1, 0, 0.2969678802197914, 0.005133857674074729, 0, -0.007789254491010099, 1, 0.2969678802197915, 0.001516081713590679],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.0937197870809, 460.8199717980231, 0, 1, 0.2974380963379657, 0, 0.002170044835726649, 0.003292462034492121, 0.7025619036620343, 1, 0.001521031460081823],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515785952379796],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515270281254709],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516389872013439],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6662387835089, 461.247452801595, 0, 1, 0.2967863627195701, 0, 0.002168033652925447, 0.003289410603061599, 0.7032136372804298, 1, 0.001516963372196169],
[194.5937197870809, 461.3199717980231, 0, 1, 0.2966758009225556, 0, 0.002167692840399773, 0.003288893511302393, 0.7033241990774444, 1, 0.001516289421425192],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.74311198593, 451.8123973797709, 0, 0, 0.2957547853864228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004478208734509782],
[194.7852985971664, 461.1283929879376, 1, 0, 0.2969678802197914, 0.005133857674074728, 0, -0.007789254491010097, 1, 0.2969678802197915, 0.001068175948962611],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.001516245375740736],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000669976088375498],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.0008454974578934971],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.001516698473381776],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515630223182088],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515635172920235],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515677326964326],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001516058633658308],
[187.6808601590208, 450.8813664824344, 1.6875, 1.8125, 0.2939116225933628, 0.008991327078159125, 0.004019904424394997, -0.007542802837735606, 0.8809217739848054, 0.4079122467986789, 0.003052282085879654],
[188.5628023535801, 449.9962881198503, 0.75, 1, 0.2952942103036679, 0.003977454676313366, 0.002222240552645767, -0.00266306749493718, 0.8401167409690153, 0.4579819876574056, 0.001611282728456286],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.00151719741654282],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.001517054336343183],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.1466257917559, 1, 0, 0.2968623424913073, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968623424913073, 0.001515860206004274],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7890165587259, 460.9330962162925, 0, 1, 0.2970603137575734, 0, 0.002169512252881817, 0.003291653982617818, 0.7029396862424266, 1, 0.001515640357280576],
[194.4084982250287, 461.5051933600752, 0, 1, 0.2963934138273808, 0, 0.002166822853539984, 0.003287573539171308, 0.7036065861726193, 1, 0.001515898650505797],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7670657933481, 461.1466257917559, 0, 1, 0.29694008265427, 0, 0.002168507680790402, 0.003290129813431339, 0.70305991734573, 1, 0.00151571650320649],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515907192576043],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1146463572106, 452.4976740922751, 0, 1, 0.2947490880859724, 0, 0.002209956110837547, 0.003353016708703172, 0.7052509119140276, 1, 0.001516780472867668],
[194.5937197870809, 461.3199717980231, 0, 1, 0.2966758009225556, 0, 0.002167692840399773, 0.003288893511302393, 0.7033241990774444, 1, 0.001515630277472266],
[194.4492387883717, 461.5212638805172, 0, 1, 0.2964298516430744, 0, 0.00216674740312483, 0.003287459063367265, 0.7035701483569256, 1, 0.001515717969156613],
[189.3486889596586, 452.2068204060423, 0, 0, 0.2951399936489761, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006043667902414129],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5880870840307, 461.3256045010733, 1, 0, 0.2966672133551326, 0.005139060746139928, 0, -0.00779714875980831, 1, 0.2966672133551326, 0.0009109426203756976],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5937197870809, 461.3482798114342, 0, 2, 0.2966629975000634, 0, 0.004335119664513445, 0.006577383414113328, 0.4946829390855958, 1, 0.003033486585056831],
[194.5937197870809, 461.3199717980231, 0, 1, 0.2966758009225556, 0, 0.002167692840399773, 0.003288893511302393, 0.7033241990774444, 1, 0.001515998818068064],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4189741000316, 452.1991616480439, 0, 2, 0.2952207295063196, 0, 0.004422829959947254, 0.006710460304044592, 0.4967138201176043, 1, 0.003040166253118067],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.001515012699724643],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515208680635073],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3700295753519, 452.1854797903489, 0, 1, 0.2951732575137264, 0, 0.002211481891155902, 0.003355331671826725, 0.7048267424862735, 1, 0.001074708053906572],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004404005013423911],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515715941279427],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1624353952766, 452.3930739704243, 0, 1, 0.2948496780618399, 0, 0.002210467086119396, 0.003353791976885818, 0.7051503219381601, 1, 0.0007805581166798777],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007347132408409357],
[193.867470950542, 461.6470476444012, 0, 2, 0.2957485539238482, 0, 0.004332314070251708, 0.006573126675985673, 0.4959700993003509, 1, 0.003041297976473038],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6538062335771, 461.2598853515269, 1, 0, 0.2967674081679403, 0.005137325692979456, 0, -0.007794516281177163, 1, 0.2967674081679403, 0.001515982636001603],
[189.5716835950303, 451.9838257706705, 0, 1, 0.2954875779688305, 0, 0.002212468550826826, 0.003356828663710947, 0.7045124220311695, 1, 0.001516319202964555],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005274473008532346],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4708565851911, 452.0846527805098, 1, 0, 0.2953304177412784, 0.005277856542282394, 0, -0.008007734219529078, 1, 0.2953304177412784, 0.0007042138971690374],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002834592177673403],
[189.4708565851911, 452.0846527805098, 1, 0, 0.2953304177412784, 0.005277856542282394, 0, -0.008007734219529078, 1, 0.2953304177412784, 0.00151593739598237],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.8930739704243, 0, 1, 0.2955183173489936, 0, 0.002212912871653015, 0.003357502801603067, 0.7044816826510064, 1, 0.001515160074586713],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.1183177783447, 0, 1, 0.2968751564869247, 0, 0.002168640805288266, 0.003290331794214345, 0.7031248435130752, 1, 0.001515800151304443],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515224920365805],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000474787992728666],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.001041137002781822],
[194.8293145232207, 461.0843770618833, 0, 1, 0.2970349864970638, 0, 0.002168800440327622, 0.003290573997646182, 0.7029650135029362, 1, 0.001515224883611481],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7531871955229, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2957704897322601, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7042295102677398, 1, 0.001515866155655149],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.00151654673669261],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005628237943134685],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.0009525478187249362],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5597790706195, 461.3539125144845, 0, 1, 0.2966240552174472, 0, 0.002167533368363066, 0.003288651555183434, 0.7033759447825528, 1, 0.001515907571935058],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.455148672548, 452.1003606931528, 1, 0, 0.2953059336359847, 0.005278294134557346, 0, -0.008008398148646186, 1, 0.2953059336359847, 0.0007784039729690825],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007371848997293941],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515906395173665],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.0009442765553192275],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005709759030316673],
[189.5616083854374, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2955601326398566, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7044398673601434, 1, 0.001518564444405771],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2955601326398566, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7044398673601434, 1, 0.001516170169311824],
[189.5616083854374, 451.6107433600924, 1, 0, 0.2956484443993479, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2956484443993479, 0.001516418810382413],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2955601326398566, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7044398673601434, 1, 0.0007982143994897315],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007173352147703404],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9745961629726, 451.7783168579857, 0, 2, 0.2960245170819637, 0, 0.004426949956141189, 0.006716711295188855, 0.4955814805496823, 1, 0.003058176325907464],
[189.7034626697634, 451.8658215684918, 0, 2, 0.2956866348347726, 0, 0.004426092668522063, 0.006715410590755406, 0.4960573163503669, 1, 0.003794618645566274],
[194.7576263992021, 461.2627170409129, 0, 3, 0.296877419041473, 0, 0.006503885723185182, 0.009867905246801983, 0.3476107005306667, 1, 0.003810069905394103],
[189.6523601856837, 451.9031491800172, 1, 0, 0.295613329504708, 0.005272805458476372, 0, -0.008000070552221118, 1, 0.295613329504708, 0.001516762466514218],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515906897584408],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9522019287275, 452.0285710067168, 0, 1, 0.2947860683299429, 0, 0.002212249543812886, 0.003356496379203818, 0.7052139316700571, 1, 0.001516726876270381],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.3898435685651, 461.3322692064533, 1, 0, 0.2964515604726316, 0.005144301685943177, 0, -0.007805100482760373, 1, 0.2964515604726317, 0.001515636763494375],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2967428484146308, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7032571515853692, 1, 0.001515324232273929],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6538062335771, 461.2598853515269, 1, 0, 0.2967674081679403, 0.005137325692979456, 0, -0.007794516281177163, 1, 0.2967674081679403, 0.001515224846558957],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1784507652664, 452.3770586004345, 0, 0, 0.2948746414044595, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005275825863721564],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3700295753519, 452.185479790349, 0, 1, 0.2951732575137264, 0, 0.002211481891155902, 0.003355331671826724, 0.7048267424862736, 1, 0.0005626708184243312],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004248978707483647],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.00151641865711277],
[189.7531871955229, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2957704897322601, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7042295102677398, 1, 0.001516319109837132],
[189.3476569573288, 452.1001379622558, 0, 1, 0.2951879458578019, 0, 0.002211899347138634, 0.003355965049511641, 0.7048120541421981, 1, 0.001518034876484473],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 1, 0.2954718736229933, 0, 0.002212419233603034, 0.003356753838027943, 0.7045281263770067, 1, 0.0007949719113904581],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007204606083330259],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0522244025341, 451.2878560709341, 0, 0, 0.2963361096381633, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004597556596336306],
[189.8069163939858, 451.6408785255988, 0, 1, 0.2959039190676164, 0, 0.002214148558174236, 0.003359377625058634, 0.7040960809323835, 1, 0.0006340119371810235],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000423243699848234],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6299875676606, 451.5263488078795, 0, 1, 0.2957624791476597, 0, 0.002214710177247023, 0.003360229731634753, 0.7042375208523404, 1, 0.001516652392033039],
[194.7852985971664, 461.1283929879376, 1, 0, 0.2969678802197914, 0.005133857674074729, 0, -0.007789254491010099, 1, 0.2969678802197915, 0.001515353490836487],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 1, 0, 0.2951889618595637, 0.005280385714938611, 0, -0.008011571561878959, 1, 0.2951889618595638, 0.001516422181932226],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005327102398749217],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.0009827830398809641],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.001515933773008391],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005645090242261034],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.0009516938391787669],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 1, 0, 0.2951889618595637, 0.005280385714938611, 0, -0.008011571561878959, 1, 0.2951889618595638, 0.001516387415771442],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006654799839257431],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.000850569814299761],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5333003720262, 452.0222089936746, 0, 1, 0.2954277495947558, 0, 0.002212280680248597, 0.0033565436204086, 0.7045722504052443, 1, 0.001517416468463786],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515326576829687],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.001515848588423936],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.00151531794139607],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7531871955229, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2957704897322601, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7042295102677398, 1, 0.001515558296632216],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001521034273548409],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.001515972931164398],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515722373001545],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 1, 0.2954718736229933, 0, 0.002212419233603034, 0.003356753838027943, 0.7045281263770067, 1, 0.001275564092466613],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002400031645539325],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515717425428894],
[189.5616083854374, 451.9372849534411, 1, 0, 0.2954979507428386, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954979507428386, 0.001516799208538271],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.1908367747727, 1, 0, 0.2968423320194917, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968423320194917, 0.001515913165943489],
[194.6945467969201, 461.2916637846119, 1, 0, 0.2967967064800391, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2967967064800391, 0.001515715617454423],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5937197870809, 461.3199717980231, 0, 1, 0.2966758009225556, 0, 0.002167692840399773, 0.003288893511302393, 0.7033241990774444, 1, 0.001515917993062102],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515718767410896],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006013306645646155],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.0009139988659133845],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 2, 0, 0.2954718736229933, 0.01055065958257424, 0, -0.01600780110280262, 1, 0.08730362810228209, 0.003037605550989292],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515721273525982],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515905396290414],
[189.4708565851911, 451.9939009802634, 1, 0, 0.295372199876246, 0.005277856542282394, 0, -0.008007734219529078, 1, 0.295372199876246, 0.001516730822676108],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4708565851911, 452.0846527805098, 1, 0, 0.2953304177412784, 0.005277856542282394, 0, -0.008007734219529078, 1, 0.2953304177412784, 0.001516698842901632],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005639289467474959],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.0009514518967799466],
[189.3801047849448, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2953607223521112, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7046392776478888, 1, 0.001516698840421521],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1986011844522, 452.175404580756, 0, 0, 0.2949895060974974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004464701441943752],
[189.2893529846985, 452.0846527805098, 1, 0, 0.2951310020100703, 0.005282917312738855, 0, -0.008015412583735594, 1, 0.2951310020100704, 0.00107015032436891],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4338339834077, 451.8833606980157, 0, 1, 0.2953824340816398, 0, 0.002212960438408971, 0.003357574971419795, 0.7046175659183602, 1, 0.001516780152174781],
[189.2792777751056, 452.0947279901027, 0, 1, 0.2951152932200315, 0, 0.00221192581573721, 0.003356005208523326, 0.7048847067799685, 1, 0.001516971168091501],
[189.4708565851911, 451.9939009802634, 1, 0, 0.295372199876246, 0.005277856542282394, 0, -0.008007734219529078, 1, 0.295372199876246, 0.0009439449718016231],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005714864964806807],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.2893529846985, 452.175404580756, 1, 0, 0.2950892480876217, 0.005282917312738855, 0, -0.008015412583735594, 1, 0.2950892480876217, 0.001516696192603381],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.00151555605168233],
[189.4708565851911, 451.9939009802634, 1, 0, 0.295372199876246, 0.005277856542282394, 0, -0.008007734219529078, 1, 0.295372199876246, 0.001517103989025389],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515956729791965],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.00151513099641864],
[190.0333003720262, 451.5222089936746, 0, 1, 0.2962071053834612, 0, 0.002214730482978323, 0.003360260540145382, 0.7037928946165388, 1, 0.001521670725972025],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515903121179981],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0876989650201, 452.3770586004345, 1, 0, 0.2947748831637499, 0.005288551320226246, 0, -0.008023960681659142, 1, 0.29477488316375, 0.001516730873830237],
[189.1784507652664, 452.3770586004345, 1, 0, 0.2948746414044595, 0.005286014321159682, 0, -0.008020111464826989, 1, 0.2948746414044594, 0.001516780651899343],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3700295753519, 452.1854797903489, 0, 1, 0.2951732575137264, 0, 0.002211481891155902, 0.003355331671826725, 0.7048267424862735, 1, 0.0007857437105141103],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007299385887061795],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4708565851911, 451.9939009802634, 1, 0, 0.295372199876246, 0.005277856542282394, 0, -0.008007734219529078, 1, 0.295372199876246, 0.001516281391513886],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515732507305834],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515905967400768],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[192.6970418977206, 456.9319972429566, 0.75, 1.75, 0.2966262748238876, 0.003892119944415565, 0.003829891560580518, -9.441491155923036e-05, 0.7430087545540793, 0.58507906051775, 0.001520602766375932],
[189.2692025655127, 452.1955549999419, 1, 0, 0.2950578349523743, 0.005283479755000632, 0, -0.008016265939280608, 1, 0.2950578349523743, 0.001516730762380438],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.359954365759, 452.1955549999419, 0, 0, 0.2951575531678891, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004939526415937901],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4607813755982, 452.0947279901026, 0, 1, 0.2953147133954412, 0, 0.00221192581573721, 0.003356005208523327, 0.7046852866045588, 1, 0.0006531801083462115],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003681265103567402],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515861933233248],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9607813755982, 451.5947279901027, 1, 0, 0.2960940691841465, 0.005264244507516313, 0, -0.007987081601232139, 1, 0.2960940691841465, 0.001516168809944795],
[189.7154733670499, 451.9477504447673, 0, 1, 0.2956620643459043, 0, 0.002212645154259287, 0.003357096612136236, 0.7043379356540957, 1, 0.001522128643565083],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515568355912013],
[190.359954365759, 451.1955549999419, 2, 0, 0.2967162647452998, 0.01050641142809472, 0, -0.01594066637529761, 0.9999999999999999, 0.08804054176440301, 0.003032935261882975],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7505479090491, 451.4218038364808, 1, 0, 0.2959431226135555, 0.005270077009102068, 0, -0.007995930860805515, 1, 0.2959431226135556, 0.001516245710028658],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7890165587259, 460.9330962162925, 0, 1, 0.2970603137575734, 0, 0.002169512252881817, 0.003291653982617818, 0.7029396862424266, 1, 0.001515628991804572],
[188.9548412152013, 452.6006681504995, 0, 1, 0.2945260986099535, 0, 0.002209453212003386, 0.003352253694367522, 0.7054739013900465, 1, 0.001515869348102252],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.7632624051158, 452.792246960585, 0, 0, 0.2942274825006866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000569351171950375],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.2953738067593, 461.6183177783446, 1, 0, 0.2962209453765453, 0.005146802934147943, 0, -0.007808895457231615, 1, 0.2962209453765453, 0.0009460382562068499],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0609171587478, 451.7100210991857, 0, 1, 0.2961507070959961, 0, 0.002213809641784373, 0.003358863410177854, 0.7038492929040039, 1, 0.001515557871604108],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8484117785325, 461.1729942526878, 0, 1, 0.2970153260048646, 0, 0.002168383692155391, 0.003289941693874193, 0.7029846739951354, 1, 0.001521035179400713],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7531871955229, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2957704897322601, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7042295102677398, 1, 0.0007803734118495476],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006187356190197373],
[188.9455722130598, 449.6133310825856, 1, 0.5, 0.2958937245066962, 0.005292529421501208, 0.001112066670256624, -0.006342732955778923, 0.9632541590443864, 0.4091770964495275, 0.001516527689128674],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001155240381906331],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.7210407841985, 452.4965086216581, 1.666666666666667, 10.33333333333333, 0.2943167119475517, 0.008831377040636879, 0.02283627196331199, 0.02124867840093219, 0.2083128441577183, 0.9338605803359092, 0.01852681464179548],
[189.4801272587514, 452.0753821069495, 0, 0, 0.2953448680474872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006599360566242853],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6538062335771, 461.2598853515269, 1, 0, 0.2967674081679403, 0.005137325692979456, 0, -0.007794516281177163, 1, 0.2967674081679403, 0.0008548718921676299],
[194.6538062335771, 461.2598853515269, 1, 0, 0.2967674081679403, 0.005137325692979456, 0, -0.007794516281177163, 1, 0.2967674081679403, 0.001515315930247743],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7576599782862, 461.263746052934, 0, 1, 0.2968769893600356, 0, 0.002167957071322144, 0.0032892944109824, 0.7031230106399644, 1, 0.001516458701899319],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.8486889596586, 452.7068204060423, 0, 1, 0.2943606378602707, 0, 0.002208935131799161, 0.003351467646367429, 0.7056393621397293, 1, 0.00151577987671168],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3220212590826, 452.2081448893477, 2, 5, 0.29511008405999, 0.01056401144831984, 0.01105685524798202, 0.0007477585129153515, 0.6581373099490695, 0.6601313551810661, 0.6814110162959029],
[194.5880870840307, 461.3256045010733, 1, 0, 0.2966672133551326, 0.005139060746139928, 0, -0.00779714875980831, 1, 0.2966672133551326, 0.00151602497858986],
[194.6037949966737, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947195, 0.005138645934510642, 0, -0.007796519394221754, 1, 0.2966911614947195, 0.001516375533644676],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.8321758403684, 452.7233335253325, 0, 1, 0.294334898670054, 0, 0.002208854560716041, 0.003351345401320746, 0.705665101329946, 1, 0.001516474704798174],
[194.4368062384399, 461.4768853466641, 1, 0, 0.2964365719650662, 0.005143059173548086, 0, -0.007803215302868755, 1, 0.2964365719650661, 0.001516929177926929],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006148601483485283],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.0009004007718027385],
[189.5616083854374, 451.9252703992786, 0, 1, 0.295503485191401, 0, 0.002212755217508625, 0.003357263603648979, 0.704496514808599, 1, 0.001516518757321307],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.3305587697137, 0, 1, 0.2967791097396417, 0, 0.002167643094502176, 0.003288818035221662, 0.7032208902603583, 1, 0.001515858380589312],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9084982250287, 461.0051933600752, 0, 1, 0.2971557092427908, 0, 0.002169172960311826, 0.003291139196984411, 0.7028442907572092, 1, 0.001516014118777003],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1784507652664, 452.2634364328646, 0, 0, 0.2949268741890444, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004905881714123739],
[189.3700295753519, 452.128668706564, 0, 1, 0.2951993980385764, 0, 0.002211759769316929, 0.003355753277537506, 0.7048006019614237, 1, 0.0005464837519634424],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004781710135994847],
[189.2920729328362, 452.2634364328646, 0, 1, 0.2950517455925011, 0, 0.002211100698051772, 0.003354753313351131, 0.7049482544074989, 1, 0.001516726883907103],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.2920729328362, 452.2634364328646, 0, 0, 0.2950517455925011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004782959040813515],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4268406591368, 452.128668706564, 0, 1, 0.2952618096077472, 0, 0.002211759769316929, 0.003355753277537506, 0.7047381903922528, 1, 0.0006314141934273951],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004056135318450605],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.256407407782, 452.2991019579188, 0, 1, 0.2949961533256847, 0, 0.002210926344251372, 0.003354488778140183, 0.7050038466743153, 1, 0.001504648335483965],
[189.4479862178676, 452.1075231478333, 0, 0, 0.2952947694349516, 0, 0, 0, 1, 1, 9.888436235107327e-06],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6377357131352, 461.2759558719688, 0, 1, 0.2967429071998281, 0, 0.002167899686229383, 0.003289207344468313, 0.7032570928001719, 1, 0.001515799005111741],
[194.8293145232207, 461.0843770618833, 0, 1, 0.2970349864970638, 0, 0.002168800440327622, 0.003290573997646182, 0.7029650135029362, 1, 0.001515368438272915],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004755513453410544],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001039746919519016],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 2, 0, 0.2954718736229933, 0.01055065958257424, 0, -0.01600780110280262, 1, 0.08730362810228209, 0.003034239053228589],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 1, 0.2954718736229933, 0, 0.002212419233603034, 0.003356753838027943, 0.7045281263770067, 1, 0.00151560471357386],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 1, 0.2954718736229933, 0, 0.002212419233603034, 0.003356753838027943, 0.7045281263770067, 1, 0.00151558164821693],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 1, 0.2954718736229933, 0, 0.002212419233603034, 0.003356753838027943, 0.7045281263770067, 1, 0.001515944383519778],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 7.666388121583673e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001439708601971133],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.792246960585, 1, 0, 0.295564775677797, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.295564775677797, 0.001515968884799437],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.8930739704243, 0, 1, 0.2955183173489936, 0, 0.002212912871653015, 0.003357502801603067, 0.7044816826510064, 1, 0.0009702586763080913],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005451439801756677],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515908200062718],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7531871955229, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2957704897322601, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7042295102677398, 1, 0.001516508557442072],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515952295602783],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004500372926558725],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.001065838850201716],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9070521771354, 451.7052682723505, 1, 0, 0.295984110847645, 0.005265733886845089, 0, -0.007989341335599935, 1, 0.2959841108476451, 0.001515629040543145],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001521031778193811],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515717838083949]
],
"NAMES": [
["epi_isl_465573_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_442621_England_20200412_null_1"],
["epi_isl_469821_England_20200420_null_1"],
["epi_isl_468251_Basel_Landschaft_20200427_null_1"],
["epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1"],
["epi_isl_474814_Castilla_La_Mancha_20200514_null_1"],
["epi_isl_472992_Wales_20200519_null_1"],
["epi_isl_471888_Michigan_20200508_null_1"],
["epi_isl_468528_California_20200331_null_1"],
["epi_isl_468480_California_20200428_null_1"],
["epi_isl_468206_Geneva_20200417_null_1"],
["epi_isl_467156_Basque_Country_20200313_null_1"],
["epi_isl_466607_England_20200416_null_1"],
["epi_isl_466567_England_20200416_null_1"],
["epi_isl_466561_England_20200414_null_1"],
["epi_isl_466542_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_466428_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_466384_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_466373_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_466358_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_466352_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_466288_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_466013_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_465905_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_465574_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_465258_England_20200418_null_1"],
["epi_isl_464271_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_459241_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_458506_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_456582_Victoria_20200517_null_1"],
["epi_isl_456567_Victoria_20200510_null_1"],
["epi_isl_456545_Victoria_20200509_null_1"],
["epi_isl_456418_Victoria_20200414_null_1"],
["epi_isl_454653_California_20200410_null_1"],
["epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2"],
["epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1"],
["epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1"],
["epi_isl_423653_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_458498_England_20200416_null_1"],
["epi_isl_465261_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_464634_England_20200308_null_1"],
["epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1"],
["epi_isl_466940_Basel_Stadt_20200308_null_1"],
["epi_isl_465894_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_465252_England_20200418_null_1"],
["epi_isl_457384_England_20200429_null_1"],
["epi_isl_465675_England_20200518_null_1"],
["epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1"],
["epi_isl_465632_England_20200505_null_1"],
["epi_isl_474821_Castilla_La_Mancha_20200525_null_1"],
["epi_isl_456475_Victoria_20200501_null_1"],
["epi_isl_468304_Zurich_20200504_null_1"],
["epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_459173_England_20200507_null_1"],
["epi_isl_465529_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_465851_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_449004_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1"],
["epi_isl_423445_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_464759_England_20200310_null_1"],
["epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1"],
["epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1"],
["epi_isl_459620_Scotland_20200323_null_4"],
["epi_isl_464610_England_20200308_null_1"],
["Node1343"],
["epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1"],
["epi_isl_456438_Victoria_20200417_null_1"],
["epi_isl_452607_Andalusia_20200326_null_1"],
["epi_isl_456623_Victoria_20200101_null_4"],
["epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2"],
["epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1"],
["Node1361"],
["epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1"],
["Node1360"],
["epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1"],
["epi_isl_473371_England_20200529_null_19"],
["Node1351"],
["epi_isl_458364_England_20200501_null_1"],
["Node1350"],
["epi_isl_473488_England_20200604_null_40"],
["epi_isl_474982_HOLON_20200416_null_1"],
["Node1356"],
["epi_isl_470183_England_20200420_null_2"],
["Node1355"],
["epi_isl_466387_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_468114_Oregon_20200506_null_2"],
["Node1367"],
["epi_isl_465545_England_20200501_null_1"],
["Node1366"],
["epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1"],
["epi_isl_453618_England_20200505_null_7"],
["epi_isl_468272_Graubunden_20200428_null_1"],
["Node1373"],
["epi_isl_456568_Victoria_20200510_null_1"],
["epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1"],
["epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_459208_England_20200505_null_1"],
["epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1"],
["epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2"],
["Node1270"],
["epi_isl_456609_Timor_Leste_20200412_null_1"],
["epi_isl_448978_England_20200421_null_1"],
["epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1"],
["epi_isl_457519_England_20200507_null_2"],
["epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2"],
["epi_isl_468548_California_20200420_null_1"],
["epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1"],
["epi_isl_454312_Portugal_20200328_null_1"],
["Node1277"],
["epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1"],
["epi_isl_455205_Netherlands_20200327_null_1"],
["epi_isl_448615_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_423378_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_466416_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_467421_New_York_20200318_null_4"],
["Node1036"],
["epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1"],
["epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1"],
["epi_isl_423856_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1"],
["epi_isl_473447_England_20200602_null_62"],
["Node1058"],
["epi_isl_468294_Bern_20200501_null_1"],
["Node1057"],
["epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1"],
["epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1"],
["epi_isl_468269_Luzern_20200427_null_1"],
["epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1"],
["epi_isl_474478_Wales_20200425_null_8"],
["epi_isl_465551_England_20200502_null_1"],
["epi_isl_465558_England_20200502_null_7"],
["Node1063"],
["epi_isl_421892_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_443318_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1"],
["epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2"],
["epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1"],
["Node1081"],
["epi_isl_468777_Aragon_20200323_null_4"],
["Node1080"],
["epi_isl_441103_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1"],
["epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2"],
["epi_isl_468253_Vaud_20200427_null_1"],
["Node1098"],
["epi_isl_456571_Victoria_20200510_null_1"],
["Node1097"],
["epi_isl_466978_Vaud_20200312_null_1"],
["epi_isl_467299_Morocco_20200521_null_1"],
["Node1094"],
["epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_440816_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_473815_Scotland_20200518_null_47"],
["epi_isl_443107_England_20200411_null_1"],
["epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1"],
["epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1"],
["epi_isl_456444_Victoria_20200422_null_1"],
["epi_isl_456473_Victoria_20200430_null_54"],
["Node1117"],
["epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1"],
["Node1116"],
["epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1"],
["epi_isl_474301_Wales_20200404_null_25"],
["Node1111"],
["epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3"],
["Node1110"],
["epi_isl_465222_England_20200417_null_1"],
["epi_isl_457288_England_20200417_null_2"],
["epi_isl_474349_Wales_20200415_null_2"],
["Node1135"],
["epi_isl_459311_England_20200502_null_1"],
["Node1134"],
["epi_isl_448896_England_20200413_null_3"],
["epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1"],
["Node1127"],
["epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2"],
["Node1126"],
["epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_463969_Quebec_20200413_null_2"],
["epi_isl_465578_England_20200502_null_1"],
["epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1"],
["epi_isl_465719_England_20200314_null_1"],
["epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1"],
["epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1"],
["epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1"],
["epi_isl_473462_England_20200531_null_5"],
["Node1154"],
["epi_isl_457554_England_20200511_null_1"],
["Node1153"],
["epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1"],
["epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1"],
["epi_isl_470430_England_20200410_null_1"],
["epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1"],
["epi_isl_454302_Portugal_20200324_null_2"],
["epi_isl_473507_England_20200612_null_12"],
["epi_isl_462317_Singapore_20200423_null_1"],
["epi_isl_449030_England_20200419_null_3"],
["epi_isl_458042_Tamil_Nadu_20200506_null_6"],
["Node1178"],
["epi_isl_461309_Zuid_Holland_20200507_null_5"],
["epi_isl_468277_Ticino_20200428_null_4"],
["epi_isl_473477_England_20200602_null_3"],
["Node1172"],
["epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1"],
["epi_isl_439409_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2"],
["epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1"],
["epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_3"],
["Node1190"],
["epi_isl_466399_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_473059_Wales_20200423_null_17"],
["Node1182"],
["epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1"],
["epi_isl_474352_Wales_20200415_null_20"],
["Node1194"],
["epi_isl_472151_Northern_Ireland_20200329_null_8"],
["epi_isl_465270_England_20200419_null_18"],
["epi_isl_465271_England_20200419_null_1"],
["Node1206"],
["epi_isl_466411_England_20200409_null_1"],
["Node1205"],
["epi_isl_466848_Telangana_20200513_null_2"],
["Node1204"],
["epi_isl_473145_Wales_20200513_null_4"],
["epi_isl_474116_Wales_20200510_null_37"],
["Node1200"],
["epi_isl_455395_Hubei_20200315_null_1"],
["epi_isl_466031_England_20200401_null_1"],
["Node1211"],
["epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_443713_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_467613_New_Mexico_20200318_null_2"],
["Node1216"],
["epi_isl_458756_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1"],
["epi_isl_466037_England_20200402_null_1"],
["Node1225"],
["epi_isl_443381_England_20200412_null_1"],
["Node1224"],
["epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1"],
["epi_isl_473437_England_20200603_null_3"],
["epi_isl_475521_Uppsala_20200519_null_5"],
["epi_isl_470385_England_20200405_null_10"],
["epi_isl_472510_Wales_20200503_null_3"],
["Node1235"],
["epi_isl_462888_Minnesota_20200511_null_2"],
["epi_isl_473811_Scotland_20200514_null_28"],
["Node1239"],
["epi_isl_472708_Wales_20200506_null_2"],
["Node1238"],
["epi_isl_438435_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_468249_Uri_20200426_null_1"],
["epi_isl_466202_England_20200402_null_7"],
["epi_isl_474695_Wales_20200501_null_15"],
["Node1247"],
["epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1"],
["epi_isl_468417_California_20200411_null_19"],
["Node1250"],
["epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1"],
["epi_isl_468348_California_20200425_null_1"],
["epi_isl_475071_Ghent_20200318_null_2"],
["Node659"],
["epi_isl_471822_Michigan_20200519_null_2"],
["epi_isl_474541_Wales_20200427_null_2"],
["Node656"],
["epi_isl_468239_Bern_20200420_null_1"],
["epi_isl_474958_BAT_YAM_20200409_null_1"],
["Node653"],
["epi_isl_471767_Michigan_20200430_null_8"],
["epi_isl_472640_Wales_20200505_null_3"],
["Node650"],
["epi_isl_466946_Basel_Stadt_20200310_null_1"],
["epi_isl_469071_Vastra_Gotaland_20200527_null_1"],
["Node647"],
["epi_isl_462679_Michigan_20200429_null_3"],
["epi_isl_470573_Ceara_20200402_null_10"],
["Node641"],
["epi_isl_458476_England_20200429_null_3"],
["epi_isl_471725_Michigan_20200427_null_9"],
["Node638"],
["epi_isl_467961_California_20200319_null_8"],
["epi_isl_470000_Scotland_20200330_null_4"],
["Node632"],
["epi_isl_454828_North_Carolina_20200301_null_2"],
["epi_isl_465917_England_20200330_null_1"],
["Node629"],
["epi_isl_453466_Northern_Ireland_20200325_null_1"],
["epi_isl_454614_California_20200429_null_4"],
["Node626"],
["epi_isl_440436_England_20200316_null_2"],
["epi_isl_463010_Odisha_20200507_null_5"],
["Node623"],
["epi_isl_423549_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_472511_Wales_20200326_null_2"],
["Node620"],
["epi_isl_420198_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_465882_England_20200329_null_1"],
["Node610"],
["epi_isl_442012_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_456422_Victoria_20200416_null_1"],
["Node607"],
["epi_isl_456627_Victoria_20200523_null_1"],
["epi_isl_464561_England_20200304_null_19"],
["Node597"],
["epi_isl_452832_Virginia_20200422_null_3"],
["epi_isl_471692_Michigan_20200429_null_1"],
["epi_isl_468238_Bern_20200420_null_1"],
["epi_isl_468949_Basque_Country_20200410_null_29"],
["epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1"],
["epi_isl_454936_Hubei_20200211_null_1"],
["epi_isl_472008_England_20200421_null_3"],
["epi_isl_460813_Overijssel_20200414_null_1"],
["epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_3"],
["epi_isl_469977_Scotland_20200330_null_3"],
["Node222"],
["epi_isl_474354_Wales_20200415_null_3"],
["epi_isl_463017_Odisha_20200509_null_1"],
["epi_isl_441573_England_20200404_null_1"],
["epi_isl_470371_England_20200408_null_1"],
["Node235"],
["epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1"],
["epi_isl_473316_England_20200503_null_2"],
["epi_isl_463021_Odisha_20200509_null_1"],
["epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1"],
["epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1"],
["epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1"],
["epi_isl_452002_Denmark_20200311_null_2"],
["epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1"],
["epi_isl_455638_KZN_20200504_null_1"],
["epi_isl_459493_England_20200427_null_1"],
["epi_isl_465333_England_20200420_null_1"],
["epi_isl_470216_England_20200420_null_8"],
["epi_isl_448657_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_471402_Kinshasa_20200426_null_2"],
["epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1"],
["epi_isl_435059_EC_20200320_null_1"],
["epi_isl_445096_California_20200313_null_1"],
["epi_isl_471949_England_20200421_null_1"],
["epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1"],
["epi_isl_449684_England_20200415_null_1"],
["Node290"],
["epi_isl_473700_Scotland_20200516_null_2"],
["epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1"],
["epi_isl_456032_New_York_20200327_null_1"],
["epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1"],
["epi_isl_475264_England_20200430_null_1"],
["epi_isl_471266_Wisconsin_20200331_null_12"],
["epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1"],
["epi_isl_470119_England_20200417_null_3"],
["epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1"],
["epi_isl_455917_Bangkok_20200312_null_2"],
["epi_isl_450495_GP_20200325_null_1"],
["epi_isl_463139_Connecticut_20200330_null_3"],
["epi_isl_433051_England_20200404_null_3"],
["epi_isl_473375_England_20200531_null_6"],
["Node309"],
["epi_isl_470689_Utah_20200413_null_3"],
["epi_isl_438652_England_20200423_null_2"],
["epi_isl_443744_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1"],
["epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1"],
["epi_isl_473394_England_20200515_null_4"],
["epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2"],
["epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1"],
["epi_isl_475736_Utah_20200512_null_47687"],
["epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1"],
["epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2"],
["epi_isl_475597_California_20200405_null_3"],
["epi_isl_429814_Nova_Scotia_20200315_null_1"],
["epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1"],
["epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1"],
["epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1"],
["epi_isl_452334_Beijing_20200319_null_1"],
["epi_isl_467231_Madrid_20200402_null_3"],
["epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1"],
["epi_isl_461240_Utrecht_20200430_null_2"],
["epi_isl_465850_England_20200323_null_3"],
["epi_isl_457312_England_20200504_null_1"],
["epi_isl_469034_Gujarat_20200605_null_2"],
["Node382"],
["epi_isl_465604_England_20200504_null_2"],
["Node381"],
["epi_isl_458314_England_20200429_null_1"],
["Node380"],
["epi_isl_465165_England_20200416_null_1"],
["epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1"],
["epi_isl_452182_Veneto_20200323_null_1"],
["Node369"],
["epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1"],
["epi_isl_475295_England_20200330_null_759"],
["epi_isl_464625_England_20200308_null_1"],
["epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1"],
["epi_isl_464350_England_20200304_null_1"],
["epi_isl_462990_elinac_20200429_null_1"],
["epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1"],
["epi_isl_460855_Friesland_20200501_null_4"],
["Node352"],
["epi_isl_468283_Basel_Landschaft_20200430_null_1"],
["Node351"],
["epi_isl_466515_England_20200414_null_37"],
["Node350"],
["epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1"],
["epi_isl_473627_Scotland_20200422_null_8"],
["Node376"],
["epi_isl_462374_Singapore_20200408_null_3"],
["Node375"],
["epi_isl_456556_Victoria_20200508_null_1"],
["epi_isl_460634_Washington_20200406_null_1"],
["Node395"],
["epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1"],
["epi_isl_452299_Michigan_20200316_null_1"],
["Node391"],
["epi_isl_456546_Victoria_20200502_null_1"],
["Node390"],
["epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1"],
["epi_isl_475497_England_20200528_null_7"],
["Node401"],
["epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1"],
["Node400"],
["epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_463684_Washington_20200505_null_18"],
["epi_isl_472891_Wales_20200519_null_3"],
["Node412"],
["epi_isl_472078_England_20200608_null_6"],
["epi_isl_472131_England_20200603_null_27"],
["Node408"],
["epi_isl_468290_Basel_Landschaft_20200501_null_1"],
["epi_isl_459573_Scotland_20200325_null_12"],
["epi_isl_473446_England_20200606_null_5"],
["Node419"],
["epi_isl_468302_Zurich_20200504_null_1"],
["Node418"],
["epi_isl_418703_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1"],
["Node423"],
["epi_isl_452371_Andalusia_20200401_null_1"],
["epi_isl_465540_England_20200430_null_1"],
["Node439"],
["epi_isl_467846_Georgia_20200313_null_1"],
["epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3"],
["epi_isl_465716_England_20200421_null_1"],
["epi_isl_433666_England_20200403_null_2"],
["epi_isl_475341_England_20200324_null_171"],
["Node429"],
["epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1"],
["Node428"],
["epi_isl_462716_Michigan_20200417_null_10"],
["Node427"],
["epi_isl_442782_England_20200407_null_4"],
["epi_isl_472322_England_20200505_null_35"],
["epi_isl_461567_England_20200525_null_4"],
["epi_isl_470126_England_20200417_null_5"],
["Node448"],
["epi_isl_459878_Ontario_20200327_null_1"],
["Node445"],
["epi_isl_474909_Andalusia_20200318_null_4"],
["Node444"],
["epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2"],
["epi_isl_461722_Scotland_20200506_null_22"],
["Node458"],
["epi_isl_445178_California_20200405_null_1"],
["Node457"],
["epi_isl_462461_Maglaj_20200411_null_2"],
["epi_isl_465392_England_20200421_null_1"],
["epi_isl_444084_England_20200404_null_1"],
["epi_isl_468236_Bern_20200420_null_5"],
["Node467"],
["epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1"],
["epi_isl_442065_England_20200404_null_1"],
["epi_isl_469408_England_20200515_null_1"],
["Node472"],
["epi_isl_463172_Connecticut_20200401_null_4"],
["epi_isl_459045_England_20200409_null_2"],
["epi_isl_467652_New_Mexico_20200402_null_3"],
["epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1"],
["epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1"],
["epi_isl_441250_England_20200401_null_2"],
["epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2"],
["Node488"],
["epi_isl_423427_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1"],
["epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1"],
["epi_isl_465712_England_20200430_null_3"],
["epi_isl_468691_British_Columbia_20200401_null_2"],
["epi_isl_468289_Vaud_20200501_null_2"],
["epi_isl_475664_California_20200406_null_1"],
["epi_isl_457836_Kenya_20200323_null_2"],
["epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1"],
["epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2"],
["epi_isl_462715_Michigan_20200417_null_1"],
["epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1"],
["epi_isl_454496_Sormland_20200309_null_11"],
["Node511"],
["epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1"],
["epi_isl_457474_England_20200508_null_3"],
["epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1"],
["epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6"],
["epi_isl_464508_England_20200304_null_2"],
["epi_isl_475572_London_20200317_null_13"],
["Node519"],
["epi_isl_469595_England_20200422_null_10"],
["epi_isl_460852_Friesland_20200413_null_1"],
["epi_isl_467262_Galicia_20200414_null_1"],
["epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_454281_Portugal_20200421_null_1"],
["epi_isl_452076_Denmark_20200428_null_4"],
["epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1"],
["epi_isl_458267_California_20200410_null_2"],
["Node539"],
["epi_isl_474799_Castilla_La_Mancha_20200331_null_1"],
["epi_isl_475587_California_20200402_null_1"],
["epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1"],
["epi_isl_460383_Massachusetts_20200404_null_1"],
["Node553"],
["epi_isl_465303_England_20200420_null_2"],
["Node552"],
["epi_isl_455591_Nonthaburi_20200320_null_1"],
["epi_isl_421787_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1"],
["epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2"],
["epi_isl_454647_Virgin_Islands_20200427_null_2"],
["epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1"],
["epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1"],
["Node559"],
["epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5"],
["epi_isl_457704_Muscat_20200224_null_1"],
["epi_isl_470238_England_20200417_null_7"],
["epi_isl_470088_Northern_Ireland_20200406_null_2"],
["epi_isl_475701_California_20200404_null_1"],
["epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1"],
["epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1"],
["epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_464065_Houthalen_Helchteren_20200407_null_2"],
["epi_isl_452438_Andalusia_20200312_null_1"],
["epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1"],
["epi_isl_454897_Stockholm_20200310_null_4"],
["epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1"],
["epi_isl_469549_England_20200423_null_1"],
["Node190"],
["epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2"],
["epi_isl_469111_Singapore_20200408_null_7"],
["Node593"],
["epi_isl_423216_England_20200325_null_1"],
["Node592"],
["epi_isl_468371_California_20200412_null_3"],
["epi_isl_447679_France_20200301_null_1"],
["epi_isl_475586_California_20200322_null_1"],
["Node587"],
["epi_isl_462228_Vlamertinge_20200402_null_8"],
["epi_isl_465833_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_460791_Noord_Holland_20200401_null_1"],
["epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1"],
["epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1"],
["Node160"],
["epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1"],
["epi_isl_465958_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_470196_England_20200420_null_2"],
["epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2"],
["epi_isl_433845_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_474198_Wales_20200508_null_4"],
["epi_isl_424156_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_420758_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_468288_Basel_Landschaft_20200501_null_1"],
["epi_isl_453047_Scotland_20200414_null_1"],
["epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1"],
["epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3"],
["epi_isl_454247_Portugal_20200323_null_8"],
["Node184"],
["epi_isl_423528_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2"],
["epi_isl_465968_England_20200330_null_1"],
["Node138"],
["epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1"],
["epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1"],
["epi_isl_460272_Massachusetts_20200404_null_1"],
["epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1"],
["epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1"],
["Node148"],
["epi_isl_441046_England_20200404_null_1"],
["Node147"],
["epi_isl_421917_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_471712_Michigan_20200516_null_1"],
["epi_isl_458747_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_473223_Wales_20200603_null_3"],
["Node602"],
["epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_468513_California_20200321_null_1"],
["epi_isl_442072_England_20200405_null_1"],
["epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1"],
["Node614"],
["epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1"],
["epi_isl_468286_Bern_20200430_null_1"],
["epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1"],
["epi_isl_461329_Zuid_Holland_20200428_null_1"],
["epi_isl_471433_Liege_20200523_null_6"],
["Node122"],
["epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1"],
["Node121"],
["epi_isl_466932_Graub_nden_20200305_null_1"],
["Node120"],
["epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1"],
["epi_isl_456995_Scotland_20200521_null_7"],
["Node131"],
["epi_isl_471896_Michigan_20200515_null_12"],
["epi_isl_475169_Dhaka_20200524_null_18"],
["Node127"],
["epi_isl_453570_England_20200424_null_1"],
["epi_isl_470158_England_20200417_null_1"],
["epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1"],
["epi_isl_464453_England_20200304_null_1"],
["epi_isl_473829_Scotland_20200412_null_27"],
["Node113"],
["epi_isl_472519_Wales_20200329_null_1"],
["Node112"],
["epi_isl_455105_Jonkoping_20200507_null_1"],
["epi_isl_462341_Singapore_20200330_null_1"],
["epi_isl_425380_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1"],
["epi_isl_462973_Wyoming_20200329_null_11"],
["Node85"],
["epi_isl_453286_England_20200403_null_1"],
["Node84"],
["epi_isl_454626_California_20200430_null_2"],
["epi_isl_466197_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_468257_Bern_20200427_null_1"],
["epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2"],
["epi_isl_474505_Wales_20200424_null_50"],
["Node668"],
["epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1"],
["epi_isl_468365_California_20200411_null_1"],
["epi_isl_473993_Wales_20200429_null_2"],
["epi_isl_473579_Scotland_20200421_null_1"],
["epi_isl_462736_Michigan_20200427_null_1"],
["epi_isl_466609_England_20200416_null_1"],
["epi_isl_475752_Egypt_20200501_null_30"],
["Node74"],
["epi_isl_442846_England_20200411_null_1"],
["epi_isl_439458_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_461267_Zeeland_20200424_null_1"],
["epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4"],
["epi_isl_473623_Scotland_20200422_null_12"],
["Node683"],
["epi_isl_474824_Castilla_La_Mancha_20200520_null_6"],
["Node682"],
["epi_isl_462984_Wyoming_20200330_null_1"],
["epi_isl_473747_Scotland_20200525_null_1"],
["Node694"],
["epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1"],
["Node693"],
["epi_isl_456297_Southern_20200401_null_1"],
["epi_isl_470184_England_20200421_null_75"],
["Node70"],
["epi_isl_423815_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_471790_Michigan_20200422_null_39"],
["Node699"],
["epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1"],
["epi_isl_440052_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_465643_England_20200506_null_1"],
["epi_isl_443823_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_456655_Victoria_20200526_null_6"],
["epi_isl_466283_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_466368_England_20200410_null_1"],
["epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_1"],
["epi_isl_466123_England_20200331_null_1"],
["Node731"],
["epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1"],
["Node730"],
["epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1"],
["epi_isl_470298_England_20200419_null_6"],
["epi_isl_448539_England_20200406_null_1"],
["epi_isl_469213_British_Columbia_20200401_null_34"],
["Node721"],
["epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_3"],
["Node720"],
["epi_isl_466285_England_20200407_null_2"],
["epi_isl_466400_England_20200412_null_1"],
["epi_isl_465974_England_20200330_null_1"],
["Node737"],
["epi_isl_417938_California_20200318_null_1"],
["Node736"],
["epi_isl_465408_England_20200421_null_1"],
["epi_isl_469289_Kanto_20200401_null_2"],
["Node742"],
["epi_isl_465465_England_20200429_null_1"],
["epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1"],
["epi_isl_474254_Wales_20200402_null_38"],
["Node775"],
["epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_8"],
["Node774"],
["epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3"],
["epi_isl_452115_Texas_20200311_null_1"],
["Node770"],
["epi_isl_458741_England_20200414_null_2"],
["Node769"],
["epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1"],
["epi_isl_465108_England_20200314_null_9"],
["Node765"],
["epi_isl_474127_Wales_20200502_null_5"],
["Node764"],
["epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1"],
["epi_isl_468460_California_20200413_null_1"],
["epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1"],
["epi_isl_475686_California_20200403_null_310"],
["Node755"],
["epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2"],
["epi_isl_473947_Scotland_20200606_null_6"],
["Node760"],
["epi_isl_443337_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_470125_England_20200417_null_8"],
["Node79"],
["epi_isl_471630_Telangana_20200601_null_5"],
["Node78"],
["epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2"],
["epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1"],
["epi_isl_456255_Counties_Manukau_20200323_null_2"],
["Node780"],
["epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1"],
["epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1"],
["epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1"],
["epi_isl_475721_Donostia_San_Sebatian_20200327_null_4"],
["Node789"],
["epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5"],
["epi_isl_448684_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1"],
["epi_isl_461237_Utrecht_20200428_null_5"],
["Node798"],
["epi_isl_468228_Basel_Landschaft_20200420_null_3"],
["epi_isl_473106_Wales_20200601_null_1"],
["epi_isl_440230_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_433949_England_20200412_null_2"],
["epi_isl_471753_Michigan_20200420_null_2"],
["epi_isl_461148_Noord_Brabant_20200320_null_3"],
["epi_isl_465352_England_20200416_null_1"],
["Node814"],
["epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_469499_England_20200503_null_3"],
["Node811"],
["epi_isl_441198_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_466925_Bavaria_20200526_null_12"],
["epi_isl_469024_Gujarat_20200527_null_1"],
["epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2"],
["epi_isl_466882_Bavaria_20200415_null_1"],
["Node857"],
["epi_isl_466240_England_20200405_null_1"],
["Node856"],
["epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1"],
["epi_isl_455309_Odisha_20200404_null_1"],
["epi_isl_456569_Victoria_20200510_null_1"],
["epi_isl_475492_England_20200324_null_19"],
["Node833"],
["epi_isl_475753_Egypt_20200501_null_460"],
["epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1"],
["epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1"],
["epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2"],
["epi_isl_461204_Noord_Holland_20200426_null_1"],
["Node824"],
["epi_isl_470345_England_20200419_null_7"],
["Node823"],
["epi_isl_473012_Wales_20200520_null_10"],
["epi_isl_475347_England_20200525_null_1"],
["Node842"],
["epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1"],
["epi_isl_473546_Scotland_20200418_null_4"],
["Node853"],
["epi_isl_458145_Amapa_20200420_null_1"],
["epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1"],
["epi_isl_468353_California_20200516_null_1"],
["Node847"],
["epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1"],
["epi_isl_461485_Gujarat_20200527_null_1"],
["epi_isl_452954_England_20200512_null_1"],
["epi_isl_456688_England_20200518_null_7"],
["Node865"],
["epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1"],
["Node864"],
["epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1"],
["epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1"],
["epi_isl_455478_Odisha_20200409_null_1"],
["Node877"],
["epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1"],
["epi_isl_474895_Andalusia_20200403_null_1"],
["epi_isl_464336_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_466477_England_20200410_null_1"],
["epi_isl_469244_Jeddah_20200315_null_1"],
["epi_isl_473310_England_20200505_null_10"],
["Node893"],
["epi_isl_456437_Victoria_20200418_null_1"],
["Node892"],
["epi_isl_466242_England_20200403_null_4"],
["Node891"],
["epi_isl_429065_California_20200328_null_1"],
["epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2"],
["epi_isl_443629_England_20200417_null_4"],
["epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1"],
["epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5"],
["epi_isl_460452_Massachusetts_20200319_null_8"],
["epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4"],
["epi_isl_471424_Valcea_20200607_null_20"],
["Node902"],
["epi_isl_464932_England_20200313_null_1"],
["epi_isl_469113_Singapore_20200406_null_1"],
["epi_isl_473060_Wales_20200529_null_1"],
["epi_isl_472852_Wales_20200520_null_1"],
["epi_isl_474639_Wales_20200429_null_78"],
["Node909"],
["epi_isl_454527_Maharashtra_20200313_null_1"],
["epi_isl_466672_Nebraska_20200504_null_25"],
["Node108"],
["epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1"],
["Node107"],
["epi_isl_465840_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_443673_England_20200412_null_1"],
["epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1"],
["Node920"],
["epi_isl_467008_Vaud_20200507_null_1"],
["epi_isl_475579_California_20200402_null_406"],
["epi_isl_458970_England_20200410_null_1"],
["epi_isl_459072_England_20200410_null_1"],
["Node95"],
["epi_isl_466961_Vaud_20200311_null_51"],
["Node94"],
["epi_isl_423718_England_20200323_null_2"],
["Node93"],
["epi_isl_452240_Stockholm_20200424_null_3"],
["epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_1"],
["Node103"],
["epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1"],
["Node102"],
["epi_isl_468436_California_20200506_null_1"],
["epi_isl_466927_Basel_Stadt_20200305_null_1"],
["epi_isl_468601_California_20200422_null_3"],
["epi_isl_474989_BEIT_SHEMESH_20200411_null_13"],
["epi_isl_475346_England_20200429_null_32"],
["epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4"],
["epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1"],
["epi_isl_470842_Western_Australia_20200401_null_1"],
["Node931"],
["epi_isl_461087_Netherlands_20200508_null_6"],
["epi_isl_452145_Connecticut_20200512_null_1"],
["epi_isl_471151_Wisconsin_20200612_null_1"],
["Node944"],
["epi_isl_471512_England_20200604_null_1"],
["epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2"],
["epi_isl_456528_Victoria_20200507_null_1"],
["Node954"],
["epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3"],
["epi_isl_469918_England_20200413_null_1"],
["Node950"],
["epi_isl_466304_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_3"],
["epi_isl_456583_Victoria_20200517_null_1"],
["epi_isl_470572_Amazonas_20200402_null_2"],
["Node975"],
["epi_isl_473159_Wales_20200528_null_2"],
["Node974"],
["epi_isl_471620_Telangana_20200526_null_1"],
["epi_isl_473439_England_20200602_null_9"],
["Node962"],
["epi_isl_465251_England_20200418_null_2"],
["Node961"],
["epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1"],
["Node960"],
["epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_1"],
["epi_isl_475654_California_20200401_null_1"],
["Node969"],
["epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1"],
["Node968"],
["epi_isl_460056_Minnesota_20200323_null_5"],
["epi_isl_438511_England_20200401_null_2"],
["epi_isl_474783_Wales_20200430_null_4"],
["Node1027"],
["epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4"],
["epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1"],
["epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1"],
["Node1019"],
["epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4"],
["Node1018"],
["epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1"],
["Node1016"],
["epi_isl_465918_England_20200330_null_1"],
["Node1015"],
["epi_isl_465213_England_20200417_null_1"],
["epi_isl_462991_USA_20200511_null_1"],
["epi_isl_474044_Wales_20200423_null_13"],
["Node1007"],
["epi_isl_471903_Michigan_20200516_null_4"],
["Node1006"],
["epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1"],
["epi_isl_466544_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_441307_England_20200401_null_2"],
["epi_isl_452407_Andalusia_20200315_null_9"],
["epi_isl_465516_England_20200429_null_1"],
["Node986"],
["epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1"],
["epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3"],
["epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1"],
["Node1002"],
["epi_isl_423067_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_1"],
["epi_isl_470599_Mato_Grosso_20200319_null_19"],
["Node996"],
["epi_isl_459024_England_20200410_null_1"],
["epi_isl_462436_Uzice_20200428_null_1"]
],
"RESOLVED": [
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.3098965884302, 2, 0, 0.2967884573954823, 0.01027250137666228, 0, -0.01558577049888613, 1, 0.08808338844318997, 0.003033618805151917],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5937197870809, 461.3199717980231, 0, 1, 0.2966758009225556, 0, 0.002167692840399773, 0.003288893511302393, 0.7033241990774444, 1, 0.001515908696759967],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004906832879641346],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.00102529684875433],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5597790706195, 461.3539125144845, 0, 1, 0.2966240552174472, 0, 0.002167533368363066, 0.003288651555183434, 0.7033759447825528, 1, 0.001515911273011347],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.74311198593, 451.9939009802634, 0, 0, 0.295671136543788, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004848131385585838],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7852985971664, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2969267976173533, 0.005133857674074728, 0, -0.007789254491010097, 1, 0.2969267976173533, 0.001031153093884941],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.6107433600924, 0, 0, 0.2956484443993479, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005270502934571775],
[189.5616083854374, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2955601326398566, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7044398673601434, 1, 0.0007001070346458341],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000287788004241126],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2953607223521111, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7046392776478889, 1, 0.001516780454167513],
[189.3801047849448, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2952724979226432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006704197372624904],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6037949966737, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2967322171751318, 0.005138645934510642, 0, -0.007796519394221754, 1, 0.2967322171751318, 0.000844952345467436],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006223899828029527],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.0006508789343867787],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002399905354577892],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004469832908332781],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001068969270055915],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.8311438380386, 451.7243655276623, 0, 0, 0.2958920016534853, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004784973082916741],
[194.8293145232207, 461.0843770618833, 0, 1, 0.2970349864970638, 0, 0.002168800440327623, 0.003290573997646183, 0.7029650135029362, 1, 0.001036506316949743],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0031980648925, 452.0823939292439, 2, 3.75, 0.2959156854381303, 0.01052613861434549, 0.008294948112018089, -0.003385234212532988, 0.7752211800974433, 0.545597716576244, 0.007662360614586806],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.4382732158301, 1, 0, 0.2967303888153876, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2967303888153876, 0.001517427212178581],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.6530011674588, 449.9044311435673, 1, 0, 0.2954362311385179, 0.005300737299759917, 0, -0.008042449642950245, 1, 0.2954362311385179, 0.0008592398423210323],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006562509094048606],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.00151584742191857],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515395631880995],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5880870840306, 461.3256045010733, 1, 0, 0.2966672133551325, 0.005139060746139929, 0, -0.007797148759808311, 1, 0.2966672133551325, 0.001516389670974752],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005090038352265687],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.0005749085871373812],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004313267962244738],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515907767635915],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.0843770618833, 0, 1, 0.296890521658241, 0, 0.002168800440327622, 0.003290573997646182, 0.703109478341759, 1, 0.001515871747696534],
[194.6945467969201, 461.2759558719688, 0, 1, 0.2968038135934217, 0, 0.002167899686229383, 0.003289207344468313, 0.7031961864065783, 1, 0.001515658533271419],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7576599782862, 461.2637460529341, 0, 1, 0.2968769893600356, 0, 0.002167957071322144, 0.0032892944109824, 0.7031230106399644, 1, 0.001515715368683659],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515225310421875],
[189.3486889596585, 452.2068204060423, 0, 0, 0.2951399936489761, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004708545725474313],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.455148672548, 452.1003606931528, 1, 0, 0.2953059336359847, 0.005278294134557346, 0, -0.008008398148646186, 1, 0.2953059336359847, 0.0005264164357553204],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005180995088449835],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000484812249529888],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4708565851911, 452.0846527805098, 1, 0, 0.2953304177412784, 0.005277856542282394, 0, -0.00800773421952908, 1, 0.2953304177412784, 0.0005344982037156589],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004958315364125061],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4479862178676, 452.1075231478333, 0, 0, 0.2952947694349516, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000434344461247856],
[194.6377357131352, 461.2759558719688, 0, 1, 0.2967429071998281, 0, 0.002167899686229383, 0.003289207344468313, 0.7032570928001719, 1, 0.001082740567467439],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.0029679868346, 461.3445285315811, 0, 1, 0.297103240312829, 0, 0.002167577457096785, 0.003288718448032617, 0.7028967596871709, 1, 0.001515717291606561],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004824588098424],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001032462653421444],
[190.3928999426755, 451.1626094230254, 0, 1, 0.296767617397464, 0, 0.002216495735936233, 0.003362938838883505, 0.703232382602536, 1, 0.001515936980267391],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.2920729328362, 451.2634364328646, 0, 0, 0.2966104571699119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006168980373694664],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.0597790706195, 460.8539125144845, 0, 1, 0.2973863506328572, 0, 0.002169885017453487, 0.003292219553052043, 0.7026136493671429, 1, 0.000899209725681878],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.1004941227507, 451.4550152429501, 0, 1, 0.2963118410606451, 0, 0.002215060119471374, 0.003360760675267333, 0.7036881589393549, 1, 0.001516518809418368],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.2920729328362, 451.2634364328646, 0, 0, 0.2966104571699119, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000669438707215799],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.0597790706195, 460.8539125144845, 0, 1, 0.2973863506328572, 0, 0.002169885017453487, 0.003292219553052043, 0.7026136493671429, 1, 0.0008458212968435896],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0876989650201, 452.3541882331109, 1, 0, 0.2947853932504629, 0.005288551320226246, 0, -0.008023960681659142, 1, 0.2947853932504629, 0.001516273825998672],
[189.3700295753519, 452.128668706564, 0, 1, 0.2951993980385764, 0, 0.002211759769316929, 0.003355753277537506, 0.7048006019614237, 1, 0.0009394918479509615],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005756795175173385],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.001515908926607314],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5937197870809, 461.3199717980231, 0, 1, 0.2966758009225556, 0, 0.002167692840399773, 0.003288893511302393, 0.7033241990774444, 1, 0.001516969293962859],
[194.3898435685651, 461.3322692064533, 1, 0, 0.2964515604726316, 0.005144301685943177, 0, -0.007805100482760373, 1, 0.2964515604726317, 0.001516422093693641],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[184.9501306193189, 447.8508501258872, 1.5, 1.5, 0.2922721933861668, 0.008110294353278593, 0.003349329357258923, -0.007223489689645861, 0.8843488363663461, 0.4259249011727627, 0.004584416305087749],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006675900021916886],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.000848021361542711],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5597790706195, 461.3539125144845, 0, 1, 0.2966240552174472, 0, 0.002167533368363066, 0.003288651555183434, 0.7033759447825528, 1, 0.001516971886915051],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515873195945311],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515644313804865],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2952724979226432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006039398136473148],
[194.6037949966737, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2967322171751318, 0.005138645934510642, 0, -0.007796519394221754, 1, 0.2967322171751318, 0.0009114043186264813],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7531871955229, 451.9159443377478, 0, 1, 0.2957181168152923, 0, 0.00221280088151223, 0.003357332886548454, 0.7042818831847077, 1, 0.001515182621576514],
[194.6945467969201, 461.2759558719688, 0, 1, 0.2968038135934217, 0, 0.002167899686229383, 0.003289207344468313, 0.7031961864065783, 1, 0.001515758135359154],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9607813755982, 451.5947279901027, 1, 0, 0.2960940691841465, 0.005264244507516313, 0, -0.007987081601232139, 1, 0.2960940691841465, 0.001516169378196151],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.00151678103490649],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515572067866596],
[189.0709923683407, 452.5981391649299, 1, 0, 0.2946549601296153, 0.005289018624558965, 0, -0.008024669690868859, 1, 0.2946549601296153, 0.001516245934301227],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.4492387883717, 461.5212638805172, 0, 1, 0.2964298516430744, 0, 0.00216674740312483, 0.003287459063367265, 0.7035701483569256, 1, 0.00151570025043591],
[194.7352873602631, 461.0436364985403, 1, 0, 0.2969526471122024, 0.0051351761334862, 0, -0.007791254900165164, 1, 0.2969526471122024, 0.001515870395182013],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4836517429218, 452.0718576227791, 0, 1, 0.295350361701768, 0, 0.002212037717318884, 0.003356174989213198, 0.7046496382982319, 1, 0.00151666272597562],
[189.4268406591368, 452.128668706564, 0, 1, 0.2952618096077472, 0, 0.002211759769316929, 0.003355753277537506, 0.7047381903922528, 1, 0.001257788375634635],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.00025837454723366],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3700295753519, 452.1854797903489, 0, 1, 0.2951732575137264, 0, 0.002211481891155902, 0.003355331671826725, 0.7048267424862735, 1, 0.001515530029010766],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.001515690578441495],
[190.2160303611969, 452.1378249848256, 0, 0, 0.2961234353590538, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006706507110172808],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.0217577847998, 461.2911067904649, 0, 1, 0.2971475470178523, 0, 0.002167828482447281, 0.003289099311792939, 0.7028524529821477, 1, 0.0008445330887748899],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7352873602631, 461.1784042248408, 1, 0, 0.2968916335465707, 0.0051351761334862, 0, -0.007791254900165164, 1, 0.2968916335465708, 0.00151658182724767],
[194.7576599782862, 461.5552045969785, 0, 1, 0.2967451508120664, 0, 0.002166588070159845, 0.003287217318252408, 0.7032548491879336, 1, 0.001515726025574394],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.2053379527822, 450.5667937618356, 0, 0, 0.2946361129556386, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005332785700009487],
[189.3832742596624, 452.2799495521548, 0, 1, 0.2951443486734772, 0, 0.002211019968915701, 0.003354630828501411, 0.7048556513265228, 1, 0.0005529719989236029],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004289073972947072],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.0937197870809, 460.8199717980231, 1, 0, 0.2974380963379657, 0.005125741623520062, 0, -0.007776940557269504, 1, 0.2974380963379657, 0.00151582353190935],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.00151532051437078],
[188.9895112416547, 452.5659981240461, 0, 0, 0.2945801391815755, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007059762981880212],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.4084982250287, 461.5051933600752, 0, 1, 0.2963934138273808, 0, 0.002166822853539984, 0.003287573539171308, 0.7036065861726193, 1, 0.0008095709652960553],
[189.0940562130535, 452.4614531526474, 0, 1, 0.2947430946388548, 0, 0.002210133024663714, 0.003353285128067807, 0.7052569053611452, 1, 0.001516698475689266],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006951049930524147],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.0008203533234429241],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006052882395424545],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.0009100187429006637],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.001516241529536968],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.8707208020415, 452.5711663960895, 0, 0, 0.2944471269674074, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004634752815304627],
[194.3491030052221, 461.5077774960969, 1, 0, 0.2963285265173509, 0.00514538006369461, 0, -0.007806736632275342, 1, 0.2963285265173509, 0.001052745660820517],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.74311198593, 451.8123973797709, 0, 0, 0.2957547853864228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004478076011006169],
[194.7852985971664, 461.1283929879376, 1, 0, 0.2969678802197914, 0.005133857674074729, 0, -0.007789254491010099, 1, 0.2969678802197915, 0.001068189284343507],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000447807650124879],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001068189233740028],
[189.5616083854374, 451.6107433600924, 0, 0, 0.2956484443993479, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004634623354779662],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.0275659780984, 0, 1, 0.2969162439451249, 0, 0.00216906769528724, 0.003290979485493062, 0.7030837560548751, 1, 0.001052758689516112],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004634618375278832],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.00105275916606269],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4801272587514, 452.0753821069495, 0, 0, 0.2953448680474873, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004501714678198648],
[194.6538062335771, 461.2598853515269, 1, 0, 0.2967674081679403, 0.005137325692979456, 0, -0.007794516281177163, 1, 0.2967674081679403, 0.001065763984987132],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004634526938321298],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.001052765579047923],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000463452646220053],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.0010527656497774],
[188.9522019287275, 452.2201498168023, 0, 0, 0.2946979878566557, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004634623278274865],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.3898435685651, 461.3322692064534, 1, 0, 0.2964515604726315, 0.005144301685943177, 0, -0.007805100482760373, 1, 0.2964515604726315, 0.001052758697908106],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004634752839278585],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001052745659546899],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.74311198593, 451.8123973797709, 0, 0, 0.2957547853864228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000447820831208907],
[194.7852985971664, 461.1283929879376, 1, 0, 0.2969678802197914, 0.005133857674074729, 0, -0.007789254491010099, 1, 0.2969678802197915, 0.001068175989851839],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004501850497167659],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001065750170012376],
[190.2524959688333, 451.4166355644374, 0, 0, 0.2964962573690031, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004478343475079721],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.039990588618, 460.9305120802709, 1, 0, 0.2973304284187721, 0.005127153651833478, 0, -0.007779082932181307, 1, 0.2973304284187721, 0.001068162357145735],
[189.4801272587514, 452.0753821069495, 0, 0, 0.2953448680474873, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004405156021931573],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6538062335771, 461.2598853515269, 1, 0, 0.2967674081679403, 0.005137325692979456, 0, -0.007794516281177163, 1, 0.2967674081679403, 0.001075286080338808],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.359954365759, 452.0505170070858, 0, 0, 0.2952242952324459, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004635919474694421],
[194.5937197870809, 461.247452801595, 0, 1, 0.2967086055591759, 0, 0.002168033652925447, 0.003289410603061599, 0.7032913944408241, 1, 0.001052655076591284],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.001516389854063329],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.001516389869929828],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.2482759953829, 461.0992205230328, 0, 1, 0.297476987466356, 0, 0.002168730623456016, 0.003290468069236158, 0.7025230125336439, 1, 0.001515715053964222],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7576599782862, 461.3751600344639, 0, 1, 0.2968265784578519, 0, 0.002167433547842719, 0.003288500104269564, 0.7031734215421481, 1, 0.001515638948247997],
[194.7352873602631, 461.1784042248408, 1, 0, 0.2968916335465707, 0.0051351761334862, 0, -0.007791254900165164, 1, 0.2968916335465708, 0.001515904792150939],
[194.6945467969201, 461.1077308066541, 0, 1, 0.2968799491035177, 0, 0.002168690596990462, 0.003290407339791291, 0.7031200508964823, 1, 0.001515982220143534],
[189.5616083854374, 452.1075231478333, 0, 0, 0.2954195535828243, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004382525355638589],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2759558719688, 0, 1, 0.2968038135934217, 0, 0.002167899686229383, 0.003289207344468313, 0.7031961864065783, 1, 0.001077890765673406],
[194.6945467969201, 461.4382732158301, 1, 0, 0.2967303888153876, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2967303888153876, 0.00151598225640384],
[195.1945467969201, 460.7191447881839, 0, 1, 0.2975918162726656, 0, 0.002170519743562536, 0.00329318257998215, 0.7024081837273344, 1, 0.001516081714717735],
[189.9447660056084, 451.6107433600924, 0, 0, 0.296069105841527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004012502809486481],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8861256070056, 461.0275659780984, 0, 1, 0.2971216001544913, 0, 0.00216906769528724, 0.003290979485493062, 0.7028783998455086, 1, 0.00111644845944518],
[194.7852985971664, 461.1126850752945, 1, 0, 0.2969749922183589, 0.005133857674074729, 0, -0.007789254491010099, 1, 0.2969749922183589, 0.001516081725062464],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.00151608170645442],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516081715749206],
[194.8007837789124, 461.2206222523079, 0, 1, 0.2969427247159702, 0, 0.00216815977376865, 0.003289601957673801, 0.7030572752840298, 1, 0.001515982256604524],
[194.6945467969201, 461.0000163605378, 1, 0, 0.2969287191575604, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2969287191575605, 0.001519012201035762],
[193.7953738067593, 462.1183177783447, 0, 1, 0.2954586499611353, 0, 0.002163947979399619, 0.0032832116873767, 0.7045413500388646, 1, 0.001516908380186896],
[194.3491030052221, 461.5077774960969, 1, 0, 0.2963285265173509, 0.00514538006369461, 0, -0.007806736632275342, 1, 0.2963285265173509, 0.001516356785701152],
[194.6945467969201, 461.0275659780984, 0, 1, 0.2969162439451249, 0, 0.00216906769528724, 0.003290979485493062, 0.7030837560548751, 1, 0.001516389929319057],
[194.8293145232206, 461.0843770618833, 0, 1, 0.2970349864970638, 0, 0.002168800440327623, 0.003290573997646183, 0.7029650135029362, 1, 0.001516590463188632],
[194.5883098149278, 461.2176673240598, 0, 1, 0.2967162798116552, 0, 0.002168173664729504, 0.003289623033487758, 0.7032837201883448, 1, 0.001515990709160038],
[194.3430018063794, 461.5706897787245, 0, 1, 0.2962935585880566, 0, 0.002166515383546986, 0.003287107035778371, 0.7037064414119434, 1, 0.001515691243704074],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.001516389881254926],
[194.8747802394645, 460.747452801595, 1, 0, 0.297236381590586, 0.005131500334579918, 0, -0.007785677859476366, 1, 0.2972363815905861, 0.001516590438137774],
[194.7228548103312, 461.1908367747727, 0, 1, 0.2968726789949409, 0, 0.002168299801863497, 0.003289814412816873, 0.703127321005059, 1, 0.0015159822500604],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515982267018753],
[194.6721741788969, 461.1338029600907, 0, 1, 0.296844159652481, 0, 0.002168567980878526, 0.003290221302670435, 0.703155840347519, 1, 0.001519012171109771],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.00151599072617917],
[194.751357880705, 461.162333704399, 0, 1, 0.2969161345146829, 0, 0.002168433818016437, 0.003290017746447726, 0.7030838654853171, 1, 0.001515691232254913],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.00151659895213575],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516039567502229],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001516081706441188],
[194.6538062335771, 461.3946530778275, 1, 0, 0.2967064451883444, 0.005137325692979456, 0, -0.007794516281177163, 1, 0.2967064451883444, 0.001515982249598181],
[194.6945467969201, 461.3991893506985, 0, 1, 0.29674806520804, 0, 0.002167320669564341, 0.003288328841703944, 0.70325193479196, 1, 0.001522272449879696],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.0015160817286],
[194.2953738067593, 461.6183177783447, 1, 0, 0.2962209453765453, 0.005146802934147942, 0, -0.007808895457231614, 1, 0.2962209453765453, 0.001518183835797852],
[194.8010065098095, 461.1126850752945, 1, 0, 0.2969918283593785, 0.005133443701943314, 0, -0.007788626399136796, 1, 0.2969918283593784, 0.001516081715749206],
[194.7852985971664, 461.1283929879376, 1, 0, 0.2969678802197914, 0.005133857674074728, 0, -0.007789254491010097, 1, 0.2969678802197915, 0.001516081774357821],
[194.6945467969201, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2967428484146308, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7032571515853692, 1, 0.001518183837256242],
[194.9805953688114, 460.9330962162925, 0, 1, 0.2972656278871302, 0, 0.002169512252881817, 0.003291653982617818, 0.7027343721128698, 1, 0.001516081778852601],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001516616529391394],
[194.5597790706195, 461.3539125144845, 0, 1, 0.2966240552174472, 0, 0.002167533368363066, 0.003288651555183434, 0.7033759447825528, 1, 0.001516908365417677],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.001516356813535743],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.00151501035830367],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515200120949407],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516389887704312],
[194.9492387883717, 461.1835812243784, 0, 1, 0.2971185602094762, 0, 0.0021683339145447, 0.003289866169677334, 0.7028814397905238, 1, 0.001515982242540563],
[194.7169194149432, 461.5959451603215, 0, 1, 0.2966830759000206, 0, 0.002166396846602887, 0.00328692718770256, 0.7033169240999794, 1, 0.001518183823950177],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.0015165904545392],
[194.6000770351142, 461.404366350236, 0, 1, 0.2966444495876718, 0, 0.002167296352026575, 0.003288291946351116, 0.7033555504123281, 1, 0.001516081767183632],
[194.8861256070056, 461.0275659780984, 0, 1, 0.2971216001544913, 0, 0.00216906769528724, 0.003290979485493062, 0.7028783998455086, 1, 0.001515982232175946],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516081772451556],
[194.7289852626819, 461.0769918763058, 0, 2, 0.2969307875359791, 0, 0.004337670357094168, 0.006581253407186939, 0.4943063175147787, 1, 0.003044390480540695],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516081772082751],
[194.6945467969201, 461.43827321583, 0, 1, 0.2967303888153877, 0, 0.00216713709729983, 0.003288050319941842, 0.7032696111846124, 1, 0.001516471713059403],
[194.7953738067593, 461.1183177783447, 0, 1, 0.2969832407919554, 0, 0.002168640805288266, 0.003290331794214345, 0.7030167592080446, 1, 0.001516081715908394],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001516357243882754],
[194.5937197870809, 461.3199717980231, 0, 1, 0.2966758009225556, 0, 0.002167692840399773, 0.003288893511302393, 0.7033241990774444, 1, 0.001516908384565119],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516389904178993],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.00151772558441748],
[194.7890165587259, 461.0339232261317, 0, 1, 0.2970146433466117, 0, 0.002169037785771594, 0.003290934105810987, 0.7029853566533883, 1, 0.001516389909222389],
[194.5029679868346, 461.3539125144845, 0, 1, 0.296563127977192, 0, 0.002167533368363066, 0.003288651555183434, 0.703436872022808, 1, 0.001516471749150402],
[194.8861256070056, 461.0275659780984, 0, 1, 0.2971216001544913, 0, 0.00216906769528724, 0.003290979485493062, 0.7028783998455086, 1, 0.001516081839645427],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516590863517555],
[188.2632624051158, 453.292246960585, 0, 1, 0.2934481267119812, 0, 0.002206082293939946, 0.003347139228729514, 0.7065518732880187, 1, 0.001516261075787432],
[188.791570418527, 452.7639389471739, 0, 1, 0.2942716065289241, 0, 0.00220865646306844, 0.003351044841178802, 0.7057283934710759, 1, 0.001515837490471393],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.7632624051158, 452.792246960585, 0, 0, 0.2942274825006866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005036134885229616],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1624353952766, 452.3930739704243, 1, 0, 0.2948496780618399, 0.005286461859673065, 0, -0.008020790484697927, 1, 0.2948496780618399, 0.0005825738829279887],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000428895286507659],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.3801047849448, 453.175404580756, 0, 0, 0.2936302502821529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004483210522730162],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.4708565851911, 453.0846527805098, 1, 0, 0.2937717061638676, 0.005305860110780511, 0, -0.008050222137102209, 1, 0.2937717061638676, 0.001068200204410063],
[188.9607813755982, 452.5947279901027, 1, 0, 0.2945353576067357, 0.005292103433951702, 0, -0.008029350063201272, 1, 0.2945353576067358, 0.001519321953102002],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.5616083854374, 453.0947279901026, 0, 1, 0.2938669778444744, 0, 0.002207043998141254, 0.003348598357370125, 0.7061330221555256, 1, 0.0015193215433267],
[188.5616083854374, 452.9939009802634, 1, 0, 0.2939131620455824, 0.005303306481963748, 0, -0.008046347689076548, 1, 0.2939131620455824, 0.001516389864683619],
[188.5616083854374, 452.9939009802634, 0, 1, 0.2939131620455824, 0, 0.002207535240178806, 0.00334934368563789, 0.7060868379544176, 1, 0.001516780087094677],
[188.5616083854374, 452.9939009802634, 0, 0, 0.2939131620455824, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003914753338079605],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0616083854374, 452.4939009802634, 0, 1, 0.2946925178342878, 0, 0.002209974538515641, 0.003353044667770889, 0.7053074821657122, 1, 0.000842010812084246],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002816930345622943],
[188.8801047849448, 452.675404580756, 0, 1, 0.2944096060708583, 0, 0.002209088432640044, 0.003351700239348991, 0.7055903939291417, 1, 0.001516714491504546],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006680176861939553],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6037949966737, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947195, 0.005138645934510642, 0, -0.007796519394221754, 1, 0.2966911614947195, 0.0008473542345711331],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 1, 0.2954718736229933, 0, 0.002212419233603034, 0.003356753838027943, 0.7045281263770067, 1, 0.001515076096289841],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 1, 0.2954718736229933, 0, 0.002212419233603034, 0.003356753838027943, 0.7045281263770067, 1, 0.001169955678535547],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003451387691118341],
[189.2632624051158, 452.292246960585, 0, 1, 0.295006838289392, 0, 0.002210959853324979, 0.003354539619187725, 0.704993161710608, 1, 0.001515837490532333],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1624353952766, 452.3930739704243, 1, 0, 0.2948496780618399, 0.005286461859673064, 0, -0.008020790484697926, 1, 0.2948496780618399, 0.0007737959775985127],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007415690553575407],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.774082349422, 451.9968559085116, 0, 0, 0.2957037644374449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006031617356054626],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8007837789124, 461.220622252308, 0, 1, 0.2969427247159702, 0, 0.00216815977376865, 0.003289601957673801, 0.7030572752840298, 1, 0.0009116756401265553],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4708565851911, 452.0846527805098, 1, 0, 0.2953304177412784, 0.005277856542282394, 0, -0.008007734219529078, 1, 0.2953304177412784, 0.0007909872480870087],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000724587247124765],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1784507652664, 452.3770586004345, 1, 0, 0.2948746414044595, 0.005286014321159682, 0, -0.008020111464826989, 1, 0.2948746414044594, 0.00151642633199982],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1784507652664, 452.3770586004345, 0, 0, 0.2948746414044595, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006096669630040447],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.0009056136078192588],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1784507652664, 452.3770586004345, 0, 0, 0.2948746414044595, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006127630547182558],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.0009033795839753362],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.3801047849448, 453.175404580756, 0, 0, 0.2936302502821529, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000457329606064666],
[188.8801047849448, 452.675404580756, 0, 1, 0.2944096060708583, 0, 0.002209088432640044, 0.003351700239348991, 0.7055903939291417, 1, 0.001059301660857989],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 1, 0, 0.2951889618595637, 0.005280385714938611, 0, -0.008011571561878959, 1, 0.2951889618595638, 0.001516418606308879],
[189.5716835950303, 451.9838257706705, 0, 1, 0.2954875779688306, 0, 0.002212468550826826, 0.003356828663710947, 0.7045124220311694, 1, 0.001516319119833237],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3075857885167, 452.6470965673449, 1, 0, 0.2948924448900208, 0.005282408498501169, 0, -0.008014640594358873, 1, 0.2948924448900208, 0.001516898546220039],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000268628994169342],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4708565851911, 452.0846527805098, 1, 0, 0.2953304177412784, 0.005277856542282394, 0, -0.008007734219529078, 1, 0.2953304177412784, 0.0009742848050168759],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002723084159311404],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.001516727163434296],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.359954365759, 451.1955549999419, 1, 0, 0.2967162647452998, 0.005253205714047361, 0, -0.007970333187648806, 1, 0.2967162647452999, 0.001515837485111859],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.0937197870809, 460.8199717980231, 0, 1, 0.2974380963379657, 0, 0.002170044835726649, 0.003292462034492121, 0.7025619036620343, 1, 0.001521346397734895],
[193.7598033737125, 461.3388266173138, 4, 11, 0.2957719563180382, 0.02064411673810918, 0.02384364671982104, 0.004854430111107874, 0.5300429886782851, 0.6906594324400398, 0.02466208854706972],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000654021464990466],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.000861258469780007],
[189.8311438380386, 451.7243655276623, 0, 1, 0.2958920016534853, 0, 0.00221373934264514, 0.003358756750055826, 0.7041079983465146, 1, 0.001516163903867344],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.8311438380386, 451.7243655276623, 0, 0, 0.2958920016534853, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006177997485408998],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8293145232207, 461.0843770618833, 0, 1, 0.2970349864970638, 0, 0.002168800440327623, 0.003290573997646183, 0.7029650135029362, 1, 0.0008979750545913029],
[194.7352873602631, 461.0706897787246, 1, 0, 0.2969403972342753, 0.005135176133486201, 0, -0.007791254900165165, 1, 0.2969403972342753, 0.001515907565654945],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0616083854374, 452.4939009802634, 0, 1, 0.2946925178342878, 0, 0.002209974538515641, 0.003353044667770889, 0.7053074821657122, 1, 0.001516260941746375],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515717715872286],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001516470337057678],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.001516962794362314],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515990670856299],
[194.6945467969201, 461.1183177783446, 0, 1, 0.2968751564869247, 0, 0.002168640805288266, 0.003290331794214345, 0.7031248435130752, 1, 0.001515691274912524],
[194.6538062335771, 461.3946530778275, 1, 0, 0.2967064451883444, 0.005137325692979456, 0, -0.007794516281177163, 1, 0.2967064451883444, 0.001515982278271999],
[194.6945467969201, 461.3199717980231, 1, 0, 0.2967838992556419, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.296783899255642, 0.001518183835409532],
[189.7505479090491, 451.4218038364808, 0, 0, 0.2959431226135555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000438253579012257],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7890165587259, 460.9330962162925, 0, 1, 0.2970603137575734, 0, 0.002169512252881817, 0.003291653982617818, 0.7029396862424266, 1, 0.001077890107042091],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001516389848462242],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.001516389879714861],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2759558719688, 0, 1, 0.2968038135934217, 0, 0.002167899686229383, 0.003289207344468313, 0.7031961864065783, 1, 0.001518253801651061],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516081716626849],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515859695313099],
[194.9805953688114, 460.9330962162925, 0, 1, 0.2972656278871303, 0, 0.002169512252881817, 0.003291653982617818, 0.7027343721128697, 1, 0.00151608172704185],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516081716467664],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.0015158596772689],
[195.0937197870809, 460.8199717980231, 0, 1, 0.2974380963379657, 0, 0.002170044835726649, 0.003292462034492121, 0.7025619036620343, 1, 0.001516389854081422],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6752305530073, 451.8802788126936, 0, 0, 0.2956489778110349, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004382525267438292],
[194.751357880705, 461.162333704399, 0, 1, 0.296916134514683, 0, 0.002168433818016437, 0.003290017746447726, 0.7030838654853171, 1, 0.001077890774338653],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515982238070518],
[195.0217577847998, 461.2911067904649, 0, 1, 0.2971475470178523, 0, 0.002167828482447281, 0.003289099311792939, 0.7028524529821477, 1, 0.001515982216388936],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.8169916035787, 452.6817066783373, 0, 1, 0.2943372950081971, 0, 0.002209057678380124, 0.00335165357799365, 0.7056627049918029, 1, 0.001516267504237056],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.3491030052221, 461.5077774960969, 1, 0, 0.2963285265173509, 0.00514538006369461, 0, -0.007806736632275342, 1, 0.2963285265173509, 0.001515633221866865],
[193.7953738067593, 462.1183177783447, 0, 1, 0.2954586499611353, 0, 0.002163947979399619, 0.0032832116873767, 0.7045413500388646, 1, 0.001516943371321332],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515982217373953],
[194.6538062335771, 461.3946530778275, 1, 0, 0.2967064451883444, 0.005137325692979456, 0, -0.007794516281177163, 1, 0.2967064451883444, 0.001515982254332999],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515859665707241],
[194.6037949966737, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947195, 0.005138645934510642, 0, -0.007796519394221754, 1, 0.2966911614947195, 0.001516389860146011],
[189.5616083854374, 452.4321578355558, 1, 1, 0.2952701698355506, 0.005275329791287119, 0.002210276132412911, -0.004650398295639495, 0.9128155268052851, 0.5033558664763864, 0.003043492287028143],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.43827321583, 1, 0, 0.2967303888153877, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2967303888153876, 0.001515151052468784],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5029679868346, 461.6298520259156, 0, 2, 0.2964384070637633, 0, 0.004332475448073322, 0.006573371523622977, 0.4949989150549747, 1, 0.003035151196315373],
[189.5616083854374, 451.9213819838354, 0, 1, 0.2955052764163167, 0, 0.002212774256465184, 0.003357292490168103, 0.7044947235836833, 1, 0.001516163009430918],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.8488629874074, 0, 0, 0.2955386867627974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004682910786150051],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.1466257917558, 0, 1, 0.2968623424913073, 0, 0.002168507680790402, 0.003290129813431339, 0.7031376575086927, 1, 0.001048004310557855],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.001516389832391745],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001516389886547374],
[194.8861256070056, 461.0275659780984, 0, 1, 0.2971216001544913, 0, 0.00216906769528724, 0.003290979485493062, 0.7028783998455086, 1, 0.001517426160322132],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516081703001482],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004382527597517138],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001077890499251819],
[194.8293145232207, 461.0843770618833, 0, 1, 0.2970349864970638, 0, 0.002168800440327622, 0.003290573997646182, 0.7029650135029362, 1, 0.00151608172008807],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516389851355243],
[194.7852985971664, 461.1283929879376, 1, 0, 0.2969678802197914, 0.005133857674074729, 0, -0.007789254491010099, 1, 0.2969678802197915, 0.001516081713590679],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.0937197870809, 460.8199717980231, 0, 1, 0.2974380963379657, 0, 0.002170044835726649, 0.003292462034492121, 0.7025619036620343, 1, 0.001521031460081823],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515785952379796],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515270281254709],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001516389872013439],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6662387835089, 461.247452801595, 0, 1, 0.2967863627195701, 0, 0.002168033652925447, 0.003289410603061599, 0.7032136372804298, 1, 0.001516963372196169],
[194.5937197870809, 461.3199717980231, 0, 1, 0.2966758009225556, 0, 0.002167692840399773, 0.003288893511302393, 0.7033241990774444, 1, 0.001516289421425192],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.74311198593, 451.8123973797709, 0, 0, 0.2957547853864228, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004478208734509782],
[194.7852985971664, 461.1283929879376, 1, 0, 0.2969678802197914, 0.005133857674074728, 0, -0.007789254491010097, 1, 0.2969678802197915, 0.001068175948962611],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.001516245375740736],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000669976088375498],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.0008454974578934971],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.001516698473381776],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515630223182088],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515635172920235],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515677326964326],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001516058633658308],
[187.6807277281038, 450.8816125261094, 1, 1, 0.2939113629115486, 0.005328197583764255, 0.0022178770928302, -0.004719078593633832, 0.9136161107514759, 0.5014388365745732, 0.003052282085879654],
[188.5628023535801, 449.9962881198503, 0.75, 1, 0.2952942103036679, 0.003977454676313366, 0.002222240552645767, -0.00266306749493718, 0.8401167409690153, 0.4579819876574056, 0.001611282728456286],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.00151719741654282],
[194.5029679868346, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2965374415600197, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7034625584399803, 1, 0.001517054336343183],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.1466257917559, 1, 0, 0.2968623424913073, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968623424913073, 0.001515860206004274],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7890165587259, 460.9330962162925, 0, 1, 0.2970603137575734, 0, 0.002169512252881817, 0.003291653982617818, 0.7029396862424266, 1, 0.001515640357280576],
[194.4084982250287, 461.5051933600752, 0, 1, 0.2963934138273808, 0, 0.002166822853539984, 0.003287573539171308, 0.7036065861726193, 1, 0.001515898650505797],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7670657933481, 461.1466257917559, 0, 1, 0.29694008265427, 0, 0.002168507680790402, 0.003290129813431339, 0.70305991734573, 1, 0.00151571650320649],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515907192576043],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1146463572106, 452.4976740922751, 0, 1, 0.2947490880859724, 0, 0.002209956110837547, 0.003353016708703172, 0.7052509119140276, 1, 0.001516780472867668],
[194.5937197870809, 461.3199717980231, 0, 1, 0.2966758009225556, 0, 0.002167692840399773, 0.003288893511302393, 0.7033241990774444, 1, 0.001515630277472266],
[194.4492387883717, 461.5212638805172, 0, 1, 0.2964298516430744, 0, 0.00216674740312483, 0.003287459063367265, 0.7035701483569256, 1, 0.001515717969156613],
[189.3486889596586, 452.2068204060423, 0, 0, 0.2951399936489761, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006043667902414129],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5880870840307, 461.3256045010733, 1, 0, 0.2966672133551326, 0.005139060746139928, 0, -0.00779714875980831, 1, 0.2966672133551326, 0.0009109426203756976],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5937197870809, 461.3482798114342, 0, 2, 0.2966629975000634, 0, 0.004335119664513445, 0.006577383414113328, 0.4946829390855958, 1, 0.003033486585056831],
[194.5937197870809, 461.3199717980231, 0, 1, 0.2966758009225556, 0, 0.002167692840399773, 0.003288893511302393, 0.7033241990774444, 1, 0.001515998818068064],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4189741000316, 452.1991616480439, 0, 2, 0.2952207295063196, 0, 0.004422829959947254, 0.006710460304044592, 0.4967138201176043, 1, 0.003040166253118067],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.001515012699724643],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515208680635073],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3700295753519, 452.1854797903489, 0, 1, 0.2951732575137264, 0, 0.002211481891155902, 0.003355331671826725, 0.7048267424862735, 1, 0.001074708053906572],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004404005013423911],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515715941279427],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1624353952766, 452.3930739704243, 0, 1, 0.2948496780618399, 0, 0.002210467086119396, 0.003353791976885818, 0.7051503219381601, 1, 0.0007805581166798777],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007347132408409357],
[193.867470950542, 461.6470476444012, 0, 2, 0.2957485539238482, 0, 0.004332314070251708, 0.006573126675985673, 0.4959700993003509, 1, 0.003041297976473038],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6538062335771, 461.2598853515269, 1, 0, 0.2967674081679403, 0.005137325692979456, 0, -0.007794516281177163, 1, 0.2967674081679403, 0.001515982636001603],
[189.5716835950303, 451.9838257706705, 0, 1, 0.2954875779688305, 0, 0.002212468550826826, 0.003356828663710947, 0.7045124220311695, 1, 0.001516319202964555],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005274473008532346],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4708565851911, 452.0846527805098, 1, 0, 0.2953304177412784, 0.005277856542282394, 0, -0.008007734219529078, 1, 0.2953304177412784, 0.0007042138971690374],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002834592177673403],
[189.4708565851911, 452.0846527805098, 1, 0, 0.2953304177412784, 0.005277856542282394, 0, -0.008007734219529078, 1, 0.2953304177412784, 0.00151593739598237],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.8930739704243, 0, 1, 0.2955183173489936, 0, 0.002212912871653015, 0.003357502801603067, 0.7044816826510064, 1, 0.001515160074586713],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.1183177783447, 0, 1, 0.2968751564869247, 0, 0.002168640805288266, 0.003290331794214345, 0.7031248435130752, 1, 0.001515800151304443],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515224920365805],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000474787992728666],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.001041137002781822],
[194.8293145232207, 461.0843770618833, 0, 1, 0.2970349864970638, 0, 0.002168800440327622, 0.003290573997646182, 0.7029650135029362, 1, 0.001515224883611481],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7531871955229, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2957704897322601, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7042295102677398, 1, 0.001515866155655149],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.00151654673669261],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005628237943134685],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.0009525478187249362],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5597790706195, 461.3539125144845, 0, 1, 0.2966240552174472, 0, 0.002167533368363066, 0.003288651555183434, 0.7033759447825528, 1, 0.001515907571935058],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.455148672548, 452.1003606931528, 1, 0, 0.2953059336359847, 0.005278294134557346, 0, -0.008008398148646186, 1, 0.2953059336359847, 0.0007784039729690825],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007371848997293941],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515906395173665],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.0009442765553192275],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005709759030316673],
[189.5616083854374, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2955601326398566, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7044398673601434, 1, 0.001518564444405771],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2955601326398566, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7044398673601434, 1, 0.001516170169311824],
[189.5616083854374, 451.6107433600924, 1, 0, 0.2956484443993479, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2956484443993479, 0.001516418810382413],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2955601326398566, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7044398673601434, 1, 0.0007982143994897315],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007173352147703404],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9745961629726, 451.7783168579857, 0, 2, 0.2960245170819637, 0, 0.004426949956141189, 0.006716711295188855, 0.4955814805496823, 1, 0.003058176325907464],
[189.7034626697634, 451.8658215684918, 0, 2, 0.2956866348347726, 0, 0.004426092668522063, 0.006715410590755406, 0.4960573163503669, 1, 0.003794618645566274],
[194.7576263992021, 461.2627170409129, 0, 3, 0.296877419041473, 0, 0.006503885723185182, 0.009867905246801983, 0.3476107005306667, 1, 0.003810069905394103],
[189.6523601856837, 451.9031491800172, 1, 0, 0.295613329504708, 0.005272805458476372, 0, -0.008000070552221118, 1, 0.295613329504708, 0.001516762466514218],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515906897584408],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9522019287275, 452.0285710067168, 0, 1, 0.2947860683299429, 0, 0.002212249543812886, 0.003356496379203818, 0.7052139316700571, 1, 0.001516726876270381],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.3898435685651, 461.3322692064533, 1, 0, 0.2964515604726316, 0.005144301685943177, 0, -0.007805100482760373, 1, 0.2964515604726317, 0.001515636763494375],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.4107235982694, 0, 1, 0.2967428484146308, 0, 0.002167266491341145, 0.003288246640755819, 0.7032571515853692, 1, 0.001515324232273929],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6538062335771, 461.2598853515269, 1, 0, 0.2967674081679403, 0.005137325692979456, 0, -0.007794516281177163, 1, 0.2967674081679403, 0.001515224846558957],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1784507652664, 452.3770586004345, 0, 0, 0.2948746414044595, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005275825863721564],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3700295753519, 452.185479790349, 0, 1, 0.2951732575137264, 0, 0.002211481891155902, 0.003355331671826724, 0.7048267424862736, 1, 0.0005626708184243312],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004248978707483647],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.00151641865711277],
[189.7531871955229, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2957704897322601, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7042295102677398, 1, 0.001516319109837132],
[189.3476569573288, 452.1001379622558, 0, 1, 0.2951879458578019, 0, 0.002211899347138634, 0.003355965049511641, 0.7048120541421981, 1, 0.001518034876484473],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 1, 0.2954718736229933, 0, 0.002212419233603034, 0.003356753838027943, 0.7045281263770067, 1, 0.0007949719113904581],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007204606083330259],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0522244025341, 451.2878560709341, 0, 0, 0.2963361096381633, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004597556596336306],
[189.8069163939858, 451.6408785255988, 0, 1, 0.2959039190676164, 0, 0.002214148558174236, 0.003359377625058634, 0.7040960809323835, 1, 0.0006340119371810235],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000423243699848234],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6299875676606, 451.5263488078795, 0, 1, 0.2957624791476597, 0, 0.002214710177247023, 0.003360229731634753, 0.7042375208523404, 1, 0.001516652392033039],
[194.7852985971664, 461.1283929879376, 1, 0, 0.2969678802197914, 0.005133857674074729, 0, -0.007789254491010099, 1, 0.2969678802197915, 0.001515353490836487],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 1, 0, 0.2951889618595637, 0.005280385714938611, 0, -0.008011571561878959, 1, 0.2951889618595638, 0.001516422181932226],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005327102398749217],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.0009827830398809641],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.001515933773008391],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005645090242261034],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.0009516938391787669],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 1, 0, 0.2951889618595637, 0.005280385714938611, 0, -0.008011571561878959, 1, 0.2951889618595638, 0.001516387415771442],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3801047849448, 452.175404580756, 0, 0, 0.2951889618595637, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006654799839257431],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.000850569814299761],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5333003720262, 452.0222089936746, 0, 1, 0.2954277495947558, 0, 0.002212280680248597, 0.0033565436204086, 0.7045722504052443, 1, 0.001517416468463786],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515326576829687],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.001515848588423936],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.00151531794139607],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7531871955229, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2957704897322601, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7042295102677398, 1, 0.001515558296632216],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001521034273548409],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.001515972931164398],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515722373001545],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 1, 0.2954718736229933, 0, 0.002212419233603034, 0.003356753838027943, 0.7045281263770067, 1, 0.001275564092466613],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002400031645539325],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515717425428894],
[189.5616083854374, 451.9372849534411, 1, 0, 0.2954979507428386, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954979507428386, 0.001516799208538271],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.1908367747727, 1, 0, 0.2968423320194917, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968423320194917, 0.001515913165943489],
[194.6945467969201, 461.2916637846119, 1, 0, 0.2967967064800391, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2967967064800391, 0.001515715617454423],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5937197870809, 461.3199717980231, 0, 1, 0.2966758009225556, 0, 0.002167692840399773, 0.003288893511302393, 0.7033241990774444, 1, 0.001515917993062102],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515718767410896],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006013306645646155],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.0009139988659133845],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 2, 0, 0.2954718736229933, 0.01055065958257424, 0, -0.01600780110280262, 1, 0.08730362810228209, 0.003037605550989292],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515721273525982],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515905396290414],
[189.4708565851911, 451.9939009802634, 1, 0, 0.295372199876246, 0.005277856542282394, 0, -0.008007734219529078, 1, 0.295372199876246, 0.001516730822676108],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4708565851911, 452.0846527805098, 1, 0, 0.2953304177412784, 0.005277856542282394, 0, -0.008007734219529078, 1, 0.2953304177412784, 0.001516698842901632],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005639289467474959],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.0009514518967799466],
[189.3801047849448, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2953607223521112, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7046392776478888, 1, 0.001516698840421521],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1986011844522, 452.175404580756, 0, 0, 0.2949895060974974, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004464701441943752],
[189.2893529846985, 452.0846527805098, 1, 0, 0.2951310020100703, 0.005282917312738855, 0, -0.008015412583735594, 1, 0.2951310020100704, 0.00107015032436891],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4338339834077, 451.8833606980157, 0, 1, 0.2953824340816398, 0, 0.002212960438408971, 0.003357574971419795, 0.7046175659183602, 1, 0.001516780152174781],
[189.2792777751056, 452.0947279901027, 0, 1, 0.2951152932200315, 0, 0.00221192581573721, 0.003356005208523326, 0.7048847067799685, 1, 0.001516971168091501],
[189.4708565851911, 451.9939009802634, 1, 0, 0.295372199876246, 0.005277856542282394, 0, -0.008007734219529078, 1, 0.295372199876246, 0.0009439449718016231],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005714864964806807],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.2893529846985, 452.175404580756, 1, 0, 0.2950892480876217, 0.005282917312738855, 0, -0.008015412583735594, 1, 0.2950892480876217, 0.001516696192603381],
[194.6037949966738, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947196, 0.005138645934510641, 0, -0.007796519394221752, 1, 0.2966911614947196, 0.00151555605168233],
[189.4708565851911, 451.9939009802634, 1, 0, 0.295372199876246, 0.005277856542282394, 0, -0.008007734219529078, 1, 0.295372199876246, 0.001517103989025389],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515956729791965],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.00151513099641864],
[190.0333003720262, 451.5222089936746, 0, 1, 0.2962071053834612, 0, 0.002214730482978323, 0.003360260540145382, 0.7037928946165388, 1, 0.001521670725972025],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515903121179981],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0876989650201, 452.3770586004345, 1, 0, 0.2947748831637499, 0.005288551320226246, 0, -0.008023960681659142, 1, 0.29477488316375, 0.001516730873830237],
[189.1784507652664, 452.3770586004345, 1, 0, 0.2948746414044595, 0.005286014321159682, 0, -0.008020111464826989, 1, 0.2948746414044594, 0.001516780651899343],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3700295753519, 452.1854797903489, 0, 1, 0.2951732575137264, 0, 0.002211481891155902, 0.003355331671826725, 0.7048267424862735, 1, 0.0007857437105141103],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007299385887061795],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4708565851911, 451.9939009802634, 1, 0, 0.295372199876246, 0.005277856542282394, 0, -0.008007734219529078, 1, 0.295372199876246, 0.001516281391513886],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515732507305834],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515905967400768],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[192.6968154967926, 456.9322236438845, 0, 1, 0.296625926315871, 0, 0.002188508378825481, 0.003320475517750295, 0.703374073684129, 1, 0.001520602766375932],
[189.2692025655127, 452.1955549999419, 1, 0, 0.2950578349523743, 0.005283479755000632, 0, -0.008016265939280608, 1, 0.2950578349523743, 0.001516730762380438],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.359954365759, 452.1955549999419, 0, 0, 0.2951575531678891, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004939526415937901],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4607813755982, 452.0947279901026, 0, 1, 0.2953147133954412, 0, 0.00221192581573721, 0.003356005208523327, 0.7046852866045588, 1, 0.0006531801083462115],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003681265103567402],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515861933233248],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9607813755982, 451.5947279901027, 1, 0, 0.2960940691841465, 0.005264244507516313, 0, -0.007987081601232139, 1, 0.2960940691841465, 0.001516168809944795],
[189.7154733670499, 451.9477504447673, 0, 1, 0.2956620643459043, 0, 0.002212645154259287, 0.003357096612136236, 0.7043379356540957, 1, 0.001522128643565083],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515568355912013],
[190.359954365759, 451.1955549999419, 2, 0, 0.2967162647452998, 0.01050641142809472, 0, -0.01594066637529761, 0.9999999999999999, 0.08804054176440301, 0.003032935261882975],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7505479090491, 451.4218038364808, 1, 0, 0.2959431226135555, 0.005270077009102068, 0, -0.007995930860805515, 1, 0.2959431226135556, 0.001516245710028658],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7890165587259, 460.9330962162925, 0, 1, 0.2970603137575734, 0, 0.002169512252881817, 0.003291653982617818, 0.7029396862424266, 1, 0.001515628991804572],
[188.9548412152013, 452.6006681504995, 0, 1, 0.2945260986099535, 0, 0.002209453212003386, 0.003352253694367522, 0.7054739013900465, 1, 0.001515869348102252],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.7632624051158, 452.792246960585, 0, 0, 0.2942274825006866, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000569351171950375],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.2953738067593, 461.6183177783446, 1, 0, 0.2962209453765453, 0.005146802934147943, 0, -0.007808895457231615, 1, 0.2962209453765453, 0.0009460382562068499],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0609171587478, 451.7100210991857, 0, 1, 0.2961507070959961, 0, 0.002213809641784373, 0.003358863410177854, 0.7038492929040039, 1, 0.001515557871604108],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8484117785325, 461.1729942526878, 0, 1, 0.2970153260048646, 0, 0.002168383692155391, 0.003289941693874193, 0.7029846739951354, 1, 0.001521035179400713],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7531871955229, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2957704897322601, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7042295102677398, 1, 0.0007803734118495476],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006187356190197373],
[188.9454638455497, 449.6134394500957, 1, 0, 0.2958935548003316, 0.005292532456970933, 0, -0.008030000990767139, 1, 0.2958935548003316, 0.001516527689128674],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001155240381906331],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.7210407841985, 452.4965086216581, 1.666666666666667, 10.33333333333333, 0.2943167119475517, 0.008831377040636879, 0.02283627196331199, 0.02124867840093219, 0.2083128441577183, 0.9338605803359092, 0.01852681464179548],
[189.4801272587514, 452.0753821069495, 0, 0, 0.2953448680474872, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006599360566242853],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6538062335771, 461.2598853515269, 1, 0, 0.2967674081679403, 0.005137325692979456, 0, -0.007794516281177163, 1, 0.2967674081679403, 0.0008548718921676299],
[194.6538062335771, 461.2598853515269, 1, 0, 0.2967674081679403, 0.005137325692979456, 0, -0.007794516281177163, 1, 0.2967674081679403, 0.001515315930247743],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7576599782862, 461.263746052934, 0, 1, 0.2968769893600356, 0, 0.002167957071322144, 0.0032892944109824, 0.7031230106399644, 1, 0.001516458701899319],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.8486889596586, 452.7068204060423, 0, 1, 0.2943606378602707, 0, 0.002208935131799161, 0.003351467646367429, 0.7056393621397293, 1, 0.00151577987671168],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3220212590826, 452.2081448893477, 2, 5, 0.29511008405999, 0.01056401144831984, 0.01105685524798202, 0.0007477585129153515, 0.6581373099490695, 0.6601313551810661, 0.6814110162959029],
[194.5880870840307, 461.3256045010733, 1, 0, 0.2966672133551326, 0.005139060746139928, 0, -0.00779714875980831, 1, 0.2966672133551326, 0.00151602497858986],
[194.6037949966737, 461.3098965884302, 1, 0, 0.2966911614947195, 0.005138645934510642, 0, -0.007796519394221754, 1, 0.2966911614947195, 0.001516375533644676],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.8321758403684, 452.7233335253325, 0, 1, 0.294334898670054, 0, 0.002208854560716041, 0.003351345401320746, 0.705665101329946, 1, 0.001516474704798174],
[194.4368062384399, 461.4768853466641, 1, 0, 0.2964365719650662, 0.005143059173548086, 0, -0.007803215302868755, 1, 0.2964365719650661, 0.001516929177926929],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006148601483485283],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.0009004007718027385],
[189.5616083854374, 451.9252703992786, 0, 1, 0.295503485191401, 0, 0.002212755217508625, 0.003357263603648979, 0.704496514808599, 1, 0.001516518757321307],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.3305587697137, 0, 1, 0.2967791097396417, 0, 0.002167643094502176, 0.003288818035221662, 0.7032208902603583, 1, 0.001515858380589312],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9084982250287, 461.0051933600752, 0, 1, 0.2971557092427908, 0, 0.002169172960311826, 0.003291139196984411, 0.7028442907572092, 1, 0.001516014118777003],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1784507652664, 452.2634364328646, 0, 0, 0.2949268741890444, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004905881714123739],
[189.3700295753519, 452.128668706564, 0, 1, 0.2951993980385764, 0, 0.002211759769316929, 0.003355753277537506, 0.7048006019614237, 1, 0.0005464837519634424],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004781710135994847],
[189.2920729328362, 452.2634364328646, 0, 1, 0.2950517455925011, 0, 0.002211100698051772, 0.003354753313351131, 0.7049482544074989, 1, 0.001516726883907103],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.2920729328362, 452.2634364328646, 0, 0, 0.2950517455925011, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004782959040813515],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4268406591368, 452.128668706564, 0, 1, 0.2952618096077472, 0, 0.002211759769316929, 0.003355753277537506, 0.7047381903922528, 1, 0.0006314141934273951],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004056135318450605],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.256407407782, 452.2991019579188, 0, 1, 0.2949961533256847, 0, 0.002210926344251372, 0.003354488778140183, 0.7050038466743153, 1, 0.001504648335483965],
[189.4479862178676, 452.1075231478333, 0, 0, 0.2952947694349516, 0, 0, 0, 1, 1, 9.888436235107327e-06],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6377357131352, 461.2759558719688, 0, 1, 0.2967429071998281, 0, 0.002167899686229383, 0.003289207344468313, 0.7032570928001719, 1, 0.001515799005111741],
[194.8293145232207, 461.0843770618833, 0, 1, 0.2970349864970638, 0, 0.002168800440327622, 0.003290573997646182, 0.7029650135029362, 1, 0.001515368438272915],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004755513453410544],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001039746919519016],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 2, 0, 0.2954718736229933, 0.01055065958257424, 0, -0.01600780110280262, 1, 0.08730362810228209, 0.003034239053228589],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 1, 0.2954718736229933, 0, 0.002212419233603034, 0.003356753838027943, 0.7045281263770067, 1, 0.00151560471357386],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 1, 0.2954718736229933, 0, 0.002212419233603034, 0.003356753838027943, 0.7045281263770067, 1, 0.00151558164821693],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 1, 0.2954718736229933, 0, 0.002212419233603034, 0.003356753838027943, 0.7045281263770067, 1, 0.001515944383519778],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 7.666388121583673e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001439708601971133],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.792246960585, 1, 0, 0.295564775677797, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.295564775677797, 0.001515968884799437],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.8930739704243, 0, 1, 0.2955183173489936, 0, 0.002212912871653015, 0.003357502801603067, 0.7044816826510064, 1, 0.0009702586763080913],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 0, 0.2968295208572555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005451439801756677],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515908200062718],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7531871955229, 451.8023221701779, 0, 1, 0.2957704897322601, 0, 0.002213357370977246, 0.003358177210318174, 0.7042295102677398, 1, 0.001516508557442072],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 0, 1, 0.2968295208572555, 0, 0.002168166719226828, 0.003289612495547023, 0.7031704791427444, 1, 0.001515952295602783],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 0, 0, 0.2954718736229933, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004500372926558725],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5616083854374, 451.9939009802634, 1, 0, 0.2954718736229933, 0.005275329791287119, 0, -0.008003900551401308, 1, 0.2954718736229933, 0.001065838850201716],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9070521771354, 451.7052682723505, 1, 0, 0.295984110847645, 0.005265733886845089, 0, -0.007989341335599935, 1, 0.2959841108476451, 0.001515629040543145],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001521031778193811],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6945467969201, 461.2191447881839, 1, 0, 0.2968295208572555, 0.00513625068833114, 0, -0.007792885249443066, 1, 0.2968295208572556, 0.001515717838083949]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.0005782046163200364, 6.100744239020026, 0, 1, 9.47670970779624e-05, 0, 0.1639144276208228, 0.2486962577740248, 0.999905232902922, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067105307073478, 1, 4, 0.3333667842201212, 0.4916762220909269, 0.9835004746602533, 0.7462116231735542, 0.4608392756263723, 0.868345791799247, 0.659094869733673],
[1.263487234257099, 4.837138321681665, 0, 11.5, 0.2071078158578565, 0, 2.377438732411924, 3.607126745460178, 0.0693366051311867, 1, 0.659094869733673],
[2.03314367472339, 4.068432657851836, 1, 2, 0.3332161336520202, 0.4918491557838628, 0.4915898008389343, -0.000393501689723923, 0.7408969932435066, 0.7035474099888126, 0.659094869733673],
[1.623722979578896, 4.477853352996329, 0, 1, 0.2661153267738583, 0, 0.2233212928536072, 0.3388302702824054, 0.7338846732261417, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.2458381110454634, 0.3729935132779924, 0.6666666666666666, 1, 0.659094869733673],
[2.032476453970669, 4.069099878604558, 0, 2, 0.3331067814590207, 0, 0.4915091935973498, 0.7457336055368763, 0.4447465649359463, 1, 0.659094869733673],
[1.485889660703901, 4.615686671871321, 0, 3, 0.2435255382729546, 0, 0.6499574631619699, 0.9861364319594911, 0.4328952425380879, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 3, 0, 0.3333333333333334, 1.475028666272781, 0, -2.237961079667954, 0.9999999999999999, 0.0370370370370372, 0.659094869733673],
[2.033548813927826, 4.0680275186474, 1, 2, 0.3332825327565062, 0.491751165819564, 0.491638758792121, -0.0001705475684985908, 0.740808472262216, 0.7036359644397392, 0.659094869733673],
[1.164056916900576, 4.046166863727873, 0, 1, 0.2234178349936764, 0, 0.247147493832883, 0.3749801510862167, 0.7765821650063236, 1, 0.659094869733673],
[0.9986683451380132, 4.212563354707019, 1, 2, 0.1916376785103819, 1.001333430531237, 0.4747703076715148, -0.7989185579194322, 0.9039007879449108, 0.4717759297663284, 0.659094869733673],
[2.033388521863357, 4.068187810711868, 0, 1, 0.3332562621576099, 0, 0.2458096937823074, 0.3729503976895377, 0.6667437378423902, 1, 0.659094869733673],
[1.163443871840513, 4.49930809112005, 1, 1, 0.205455559320004, 0.8595171835991083, 0.2222563958164202, -0.9668726264554182, 0.9577880131445042, 0.3686991317845124, 0.659094869733673],
[0.998330225839547, 4.665431750438396, 0, 3, 0.1762662749636983, 0, 0.6430273038970293, 0.9756217707427517, 0.5589340163224892, 1, 0.659094869733673],
[2.033561665292998, 4.068014667282228, 1, 2, 0.3332846389933984, 0.491748058132242, 0.4916403119402138, -0.0001634759986399665, 0.7408056641559511, 0.7036387731747308, 0.659094869733673],
[2.033107850536953, 4.068468482038273, 1, 2, 0.3332102623518046, 0.4918578223658404, 0.4915854722310679, -0.0004132184110044044, 0.7409048202325845, 0.7035395787668682, 0.659094869733673],
[1.163564797479473, 4.046658983148975, 0, 0, 0.2233233823479124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.16361633140629, 3.315572329895867, 0, 2, 0.2597828355521894, 0, 0.6032141063448959, 0.9152159029680242, 0.5479214505431571, 1, 0.659094869733673],
[0, 4.105888947042265, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.623514185493415, 4.478062147081809, 1, 0, 0.2660811070781436, 0.6159478056522693, 0, -0.9345358823702593, 1, 0.2660811070781436, 0.659094869733673],
[3.656662287071384, 2.444914045503833, 1, 0, 0.5992979662565431, 0.2734734360172207, 0, -0.4149227198927004, 1, 0.5992979662565431, 0.659094869733673],
[2.039539734374902, 4.059833016148843, 2, 2, 0.3343851602117233, 0.9806134032554064, 0.4926310988763769, -0.7403824954307614, 0.887951718987761, 0.4092773172068389, 0.659094869733673],
[0.8709519627543506, 5.230624369820873, 0, 1, 0.142742123556579, 0, 0.1911817651769641, 0.2900671420097941, 0.857257876443421, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.2458381110454634, 0.3729935132779924, 0.6666666666666666, 1, 0.659094869733673],
[1.623537180871264, 4.478039151703961, 1, 1, 0.2660848758383123, 0.6159390815203595, 0.2233120270106359, -0.5957064339893531, 0.92919883885011, 0.4613685905267345, 0.659094869733673],
[3.656666538466027, 2.444334360436987, 1, 0, 0.5993551876256092, 0.2734731180654773, 0, -0.4149222374860576, 1, 0.5993551876256092, 0.659094869733673],
[1.623614067311433, 4.477962265263791, 1, 0, 0.2660974769164565, 0.6159099136507945, 0, -0.9344783914031546, 1, 0.2660974769164566, 0.659094869733673],
[2.031866886884836, 4.06970944569039, 1, 1, 0.3330068782450629, 0.492158224761049, 0.2457177873125434, -0.3739073823288706, 0.8891064190414778, 0.5551201755316038, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 2, 0, 0.3333333333333334, 0.9833524441818537, 0, -1.49197405311197, 1, 0.111111111111111, 0.659094869733673],
[0.0007092747222264988, 4.106177291431943, 0, 1, 0.000172703752782412, 0, 0.2435355146711824, 0.3694999397728436, 0.9998272962472176, 1, 0.659094869733673],
[1.485493526744393, 4.616082805830829, 0, 1, 0.243460615056737, 0, 0.2166338954615036, 0.3286839352110887, 0.756539384943263, 1, 0.659094869733673],
[1.255010706017454, 4.615866039598279, 0, 2, 0.2137688730996906, 0, 0.4332881376631244, 0.6573987411527076, 0.6181593849069303, 1, 0.659094869733673],
[2.033687354941554, 4.067657905328495, 0.6875, 1.8125, 0.3333178615844372, 0.3380558955286213, 0.4455881104518858, 0.1631513456730685, 0.674761137881301, 0.6370915759488626, 0.659094869733673],
[3.655478687227434, 2.444775363248418, 1, 0, 0.5992338445219814, 0.273561983412484, 0, -0.4150570668574994, 1, 0.5992338445219814, 0.659094869733673],
[1.163564797479473, 3.314288555516852, 0, 0, 0.2598487948920617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.254832701656584, 4.846743630918638, 0, 1, 0.2056571340355536, 0, 0.2063240963728182, 0.3130415754202269, 0.7943428659644465, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 2, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0.4916762220909269, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.659094869733673],
[1.254570288564621, 4.067717555050151, 0, 0, 0.235720112370425, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.033626723926058, 4.067949608649168, 2, 4, 0.3332953015877042, 0.9834646528143872, 0.9832963494668923, -0.0002553552686018722, 0.6804592100840632, 0.6487588904830719, 0.659094869733673],
[1.623000930514409, 4.478575402060815, 1, 0, 0.2659969886551279, 0.6161425919103144, 0, -0.9348314183651364, 1, 0.2659969886551279, 0.659094869733673],
[1.429026642879287, 4.672054193131861, 1, 2, 0.2342251612934826, 0.6997770160429908, 0.4280772262744927, -0.4122316865829748, 0.8611155742441139, 0.5509411317280678, 0.659094869733673],
[1.254466948380283, 4.846611846056756, 0, 2, 0.2056139562603429, 0, 0.4126594131170658, 0.6261001747499767, 0.6310491864883445, 1, 0.659094869733673],
[1.429985729412087, 4.671590603163136, 0, 0, 0.2343633270270912, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.254779040227942, 4.84679729234728, 1, 0, 0.2056483393527181, 0.796953063400183, 0, -1.20916289899543, 1, 0.2056483393527181, 0.659094869733673],
[2.250814893573389, 3.619752074363125, 1, 1, 0.3834067315587653, 0.4442835360896347, 0.2762620144850513, -0.2549276732687625, 0.852999278195425, 0.6198127413129555, 0.659094869733673],
[1.254987992267791, 4.067717555050151, 1, 0, 0.2357800898642922, 0.7968203729128737, 0, -1.208961576707239, 1, 0.2357800898642922, 0.659094869733673],
[0.8709519627318646, 5.230624369843359, 0, 1, 0.1427421235528937, 0, 0.1911817651761422, 0.2900671420085472, 0.8572578764471063, 1, 0.659094869733673],
[1.485661731397995, 4.615914601177227, 0, 0, 0.2434881824662774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[0.9978436927664802, 4.665580696408751, 0, 0, 0.1761908739655297, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.418041378789048, 2.90455644369358, 1, 0, 0.4542972171549863, 0.4135578525545327, 0, -0.6274633160498474, 1, 0.4542972171549864, 0.659094869733673],
[1.486718023818462, 4.614858308756761, 0, 1, 0.2436613004218502, 0, 0.2166913766566756, 0.3287711475348551, 0.7563386995781498, 1, 0.659094869733673],
[1.62165861372519, 4.479917718850035, 3, 1, 0.2657769935725371, 1.849957799137857, 0.223218385416394, -2.468141520171133, 0.9950103562643495, 0.0601262629794268, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[0, 4.105888947042265, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.659094869733673],
[3.65448302210603, 2.447093310469188, 1, 0, 0.5989408020015093, 0.2736365154663418, 0, -0.4151701492941566, 1, 0.5989408020015093, 0.659094869733673],
[2.418041378787567, 2.904556443699954, 1, 0, 0.4542972171542904, 0.4135578525547859, 0, -0.6274633160502316, 1, 0.4542972171542905, 0.659094869733673],
[0, 4.105888947042265, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.034138906308629, 4.066869342490391, 1, 1, 0.3334102861947528, 0.4916085115419721, 0.2458893846310881, -0.3728129867103566, 0.888837581059533, 0.5556581534490386, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.419226217752779, 2.904461938323073, 2, 1, 0.4544267332773334, 0.8267106173550819, 0.3442978497343858, -0.7319322145772875, 0.9061592182317622, 0.4318294042148494, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.4916762220909269, 0.7459870265559848, 0.4444444444444444, 1, 0.659094869733673],
[1.254570288564621, 4.615866154826919, 0, 3, 0.2137098835261071, 0, 0.6499321902700385, 0.9860980871125017, 0.4861255528828601, 1, 0.659094869733673],
[1.254570288564621, 4.847006044010602, 0, 0, 0.205614126609659, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.034903619610022, 4.066541973176038, 2, 2, 0.3335117208970863, 0.9828475318075699, 0.4918183589871977, -0.7450053025276728, 0.8887302585213099, 0.4077245408313759, 0.659094869733673],
[2.034620596296722, 4.066955736278503, 1.75, 1, 0.3334581893918537, 0.860111218369278, 0.2458841612363003, -0.9319251072022066, 0.9266602837290232, 0.3340944923170732, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 2.75, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0.6760548053750245, 0.2797451349584943, 0.6284860284717875, 0.781396164009813, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 13, 2, 0.3333333333333334, 6.391790887182049, 0.4916762220909269, -8.951844318671817, 0.9999978395566994, 3.143096543867241e-05, 0.659094869733673],
[2.03210027303028, 4.069476059544946, 1, 4, 0.3330451283844897, 0.4921017005272058, 0.9829275173195847, 0.7446967642013534, 0.4614747664688488, 0.8680278641222687, 0.659094869733673],
[1.62066920657482, 4.067717555050151, 7, 0, 0.2849084062828126, 4.319203432509247, 0, -6.553234793428979, 0.9999999999999998, 0.0001523831137801857, 0.659094869733673],
[1.595706834125082, 4.067717555050149, 0, 0, 0.2817565353525388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[0.8702939800455997, 5.231282352529623, 0, 0, 0.1426342854057657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.254518726520009, 4.846809357188217, 0, 1, 0.2056140416165829, 0, 0.2063212984676027, 0.3130373303481683, 0.7943859583834172, 1, 0.659094869733673],
[0.00127340648588085, 4.105613158195511, 0, 1, 0.0003100661451991283, 0, 0.2435689777552052, 0.369550711043505, 0.9996899338548009, 1, 0.659094869733673],
[1.918584043414191, 4.182992289161032, 1, 0, 0.3144407180766083, 0.5212177196160055, 0, -0.7908083396653035, 1, 0.3144407180766082, 0.659094869733673],
[2.03362671460826, 4.067949617966966, 2, 1, 0.333295300060591, 0.9834646573204866, 0.2458240868036534, -1.11917207126024, 0.9629756392740689, 0.2592085496755759, 0.659094869733673],
[2.030940566139592, 4.069788370029343, 1, 5, 0.3329012954663346, 0.4923827002484855, 1.228565110859548, 1.116959704008224, 0.3520199417454911, 0.9118665880131009, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 3.179396654813023, 2, 1, 0.3901321935827164, 0.9833524441818537, 0.3145250840237828, -1.014766448460342, 0.9406206596199786, 0.3378507046489438, 0.659094869733673],
[1.485971730604005, 4.615604601971218, 0, 1, 0.243538988879098, 0, 0.2166563400107806, 0.3287179888053553, 0.756461011120902, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.2458381110454634, 0.3729935132779924, 0.6666666666666666, 1, 0.659094869733673],
[1.91847263674465, 4.183103695830573, 1, 0, 0.3144224594064764, 0.5212479869907577, 0, -0.79085426230276, 1, 0.3144224594064764, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[0.004041491874828353, 6.097534840700397, 0, 2, 0.0006623684855422608, 0, 0.3280014058550699, 0.4976543149055442, 0.9986757017609261, 1, 0.659094869733673],
[2.033417842630217, 4.068158489945009, 0, 3, 0.3332610675989026, 0, 0.7374343962790281, 1.118859257055074, 0.2963926610539207, 1, 0.659094869733673],
[1.254779040221154, 4.615838177764079, 1, 1, 0.2137388614568518, 0.7969530634044941, 0.2166453765249634, -0.8804615443509997, 0.9543156991031285, 0.3817934220168324, 0.659094869733673],
[2.037340227619082, 4.079189123944523, 1, 1, 0.3330876238006222, 0.4908360353580415, 0.2451467606956681, -0.3736812287306938, 0.8890526348708554, 0.5552278824720995, 0.6574835870052168],
[2.038401374661797, 4.077686346750265, 0, 2, 0.3332851763269311, 0, 0.4904742125626978, 0.7459870059977727, 0.4445086561054113, 1, 0.6574835870052168],
[2.038145440441908, 4.078049324210062, 1, 2, 0.3332374979654338, 0.4906421201144416, 0.4904305566209426, -0.0003217776043088593, 0.7408685120450955, 0.7035759048434553, 0.6574835870052168],
[2.257598816818499, 3.627665749791398, 1, 2, 0.3836019249885565, 0.4429484957868826, 0.5513187095903216, 0.1648257324522066, 0.6714430711161349, 0.7658016552413478, 0.6574835870052168],
[0, 6.116529351563603, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6574835870052168],
[0, 4.115951172284211, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6574835870052168],
[2.0397636171812, 4.076765734382405, 3, 0, 0.3334838271739452, 1.470758657881041, 0, -2.236951137564095, 0.9999999999999999, 0.03708722430237898, 0.6574835870052168],
[1.627869387316453, 4.48865996424715, 0, 2, 0.2661426593007866, 0, 0.4455672775238713, 0.6776857800411311, 0.5385465964981215, 1, 0.6574835870052168],
[1.627702207113244, 4.077686234375737, 0, 0, 0.2852920925202508, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6574835870052168],
[1.627702207113244, 4.488827144450359, 0, 0, 0.2661153267738584, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6574835870052168],
[1.48930261481386, 4.627226736749741, 0, 0, 0.2434881824662774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6574835870052168],
[2.038401075028435, 4.078128276535169, 0, 2, 0.3332610632379858, 0, 0.4904210619140273, 0.7459061664913258, 0.4445408097945412, 1, 0.6574835870052168],
[2.031627035952056, 4.069731906285394, 1.75, 2, 0.3329794321536885, 0.8613785744291002, 0.4914328624229893, -0.5612935694001054, 0.8401772834873679, 0.4734269042264907, 0.659094869733673],
[1.623005013846714, 4.47857131872851, 1, 0, 0.2659976578809284, 0.6161410417518559, 0, -0.9348290664147122, 1, 0.2659976578809284, 0.659094869733673],
[1.596121554870376, 4.066632182383092, 1, 0, 0.2818631409609068, 0.626518698997967, 0, -0.9505743827912522, 1, 0.2818631409609067, 0.659094869733673],
[3.654239423408641, 2.447166268044626, 2, 0, 0.5989176278717918, 0.5473095132158632, 0, -0.8303956506853405, 1, 0.358702324975574, 0.659094869733673],
[1.254570288564621, 4.847006044010602, 0, 0, 0.205614126609659, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0.2458381110454634, -0.3729935132779924, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.031543267098546, 4.07003306547668, 3, 1, 0.3329538395270907, 1.476709873024071, 0.2456982495995719, -1.867730549809811, 0.9877104463547666, 0.1107740713143759, 0.659094869733673],
[2.033546392617209, 4.068029939958017, 0, 2, 0.3332821359228874, 0, 0.4916384661664118, 0.7459297420492335, 0.4445127102795473, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[0.005101025005353848, 6.096475307569871, 0, 3, 0.0008360175678079102, 0, 0.4920876159827893, 0.7466112066410592, 0.9974940434883833, 1, 0.659094869733673],
[0, 4.105888947042265, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 3.657581757103967, 0, 0, 0.3573539537398748, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.62344887520371, 4.478127457371515, 1, 0, 0.2660704032393084, 0.6159725848308714, 0, -0.9345734781394573, 1, 0.2660704032393084, 0.659094869733673],
[1.254840689679062, 4.846735642896159, 1, 0, 0.205658443209125, 0.7969139096499649, 0, -1.209103493662425, 1, 0.205658443209125, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[1.163564797479473, 4.046658983148975, 0, 0, 0.2233233823479124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[1.622543983344193, 4.479032349231031, 3, 1, 0.2659220986356791, 1.848948337176512, 0.2232625089594814, -2.466542986253158, 0.99499945064438, 0.06021661143508505, 0.659094869733673],
[1.485661731397995, 4.615914601177227, 0, 0, 0.2434881824662774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[2.034777027525306, 4.06679930504992, 3, 0, 0.3334838272303494, 1.474363018364031, 0, -2.236951137185745, 1, 0.03708722432119715, 0.659094869733673],
[1.623180094593005, 4.478396237982219, 2, 0, 0.2660263522275608, 1.232149166110541, 0, -1.86945646627234, 1, 0.07077002007950228, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.034777161053911, 4.066799171521315, 0, 1, 0.3334838491146295, 0, 0.2458936273526185, 0.3730777444102686, 0.6665161508853705, 1, 0.659094869733673],
[2.033162851385629, 4.068413481189596, 3, 1, 0.3332192765549676, 1.47553355008206, 0.2457960589855291, -1.865797395135912, 0.987671209617499, 0.1110097533260159, 0.659094869733673],
[1.255219981627622, 4.842375971235603, 1, 7, 0.2058548961477536, 0.79667310482368, 1.445571356206331, 0.9845293616757443, 0.4862549328780738, 0.8418027602901714, 0.659094869733673],
[2.033394813652775, 4.068181518922451, 0, 2, 0.333257293332027, 0, 0.4916201478958945, 0.7459019489782226, 0.4445458368949347, 1, 0.659094869733673],
[2.033417620910373, 4.068158711664852, 1, 1, 0.3332610312607777, 0.4917828928581301, 0.245811452029304, -0.3731958055267798, 0.888937085043003, 0.5554591475645583, 0.659094869733673],
[1.485906615149315, 4.615669717425908, 1, 0, 0.2435283169721774, 0.6729898028615431, 0, -1.02108184081828, 1, 0.2435283169721774, 0.659094869733673],
[3.651616627368648, 2.449698368676599, 2, 2.5, 0.5984966568248902, 0.5477026216306826, 1.020533806107148, 0.7173947275109676, 0.415057347632502, 0.8730782621330635, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 2, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0.4916762220909269, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.659094869733673],
[1.594976966674968, 4.069086709247971, 0, 1.5, 0.2815958749642892, 0, 0.3686330882531679, 0.5593020142944295, 0.6089101676894907, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067332374023121, 3, 2, 0.3333543773676026, 1.475028666272781, 0.4917227843914166, -1.491903407287479, 0.9547221173522613, 0.2099077205410254, 0.659094869733673],
[2.031843089424367, 4.069733243150859, 1.5, 2.5, 0.33300297802991, 0.7382459835640944, 0.6142908762404428, -0.1880686878563316, 0.7411811052719056, 0.6044487108518195, 0.659094869733673],
[3.65549245804695, 2.44564309679863, 1.5, 0.5, 0.5991495230988145, 0.4103414292916958, 0.2044452032492005, -0.3123923967511594, 0.8205099244852317, 0.5991495230988144, 0.659094869733673],
[1.163443266714757, 4.046780513913691, 1, 0, 0.223300056907426, 0.8595176306479682, 0, -1.304087878874375, 1, 0.223300056907426, 0.659094869733673],
[1.254700934493669, 4.846875398081553, 0, 2, 0.2056355384419344, 0, 0.4126369744911582, 0.6260661301428373, 0.6310148977864355, 1, 0.659094869733673],
[1.163564797479473, 4.046658983148975, 0, 0, 0.2233233823479124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.033793604743869, 4.067782727831357, 1, 1, 0.3333226520310511, 0.4916919778228615, 0.245834172301805, -0.3730233943717431, 0.888896009642987, 0.555541313705089, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.9184648409304, 4.183111491644823, 1, 0, 0.3144211817343102, 0.5212501051179175, 0, -0.7908574759936216, 1, 0.3144211817343102, 0.659094869733673],
[2.032708748461135, 3.179762210528595, 2, 0.75, 0.3899702779073345, 0.983908787480795, 0.235866693904549, -1.134953597618678, 0.9610350888002188, 0.2915554093019852, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.4916762220909269, 0.7459870265559848, 0.4444444444444444, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 5, 0, 0.3333333333333334, 2.458381110454634, 0, -3.729935132779924, 1, 0.004115226337448541, 0.659094869733673],
[1.918774885605682, 4.182801446969542, 0, 1, 0.3144719955991841, 0, 0.2390742215900553, 0.3627311219804523, 0.6855280044008158, 1, 0.659094869733673],
[2.034336049709045, 4.06724028286618, 2, 1, 0.3334115544614411, 0.98312174150679, 0.2458669590318133, -1.118586741196888, 0.9629368831345703, 0.2593635602143239, 0.659094869733673],
[2.03341805227994, 4.068158280295286, 1, 1, 0.3332611019588306, 0.4917827885312442, 0.2458114780940665, -0.3731956076923642, 0.8889370379211861, 0.5554592418388471, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 3.177374095936382, 0, 1, 0.390283609831108, 0, 0.3147252951041942, 0.477511371362014, 0.609716390168892, 1, 0.659094869733673],
[1.254936288238817, 4.845721501804574, 1, 1, 0.2057050782764675, 0.79685320232743, 0.2063676172119249, -0.8959037799127588, 0.9576854207712723, 0.3690955773242075, 0.659094869733673],
[2.03341800915906, 4.068158323416165, 0, 1, 0.3332610948916601, 0, 0.2458114754885615, 0.3729531009517476, 0.6667389051083399, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[1.486852726933386, 4.614723605641836, 0, 1.5, 0.2436833771947335, 0, 0.3250465527699515, 0.4931711164756847, 0.6577418394732356, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 2, 1, 0.3333333333333334, 0.9833524441818537, 0.2458381110454634, -1.118980539833977, 0.9629629629629628, 0.2592592592592594, 0.659094869733673],
[2.032871529595754, 3.177856267712908, 1, 1, 0.3901319755458597, 0.4919150007471719, 0.3146775422664715, -0.2689103900206634, 0.8477970416566849, 0.628060992748404, 0.659094869733673],
[1.623514185494762, 4.478062147080463, 1, 0, 0.2660811070783644, 0.6159478056517581, 0, -0.9345358823694838, 1, 0.2660811070783644, 0.659094869733673],
[1.255336820270681, 4.845664078630329, 1, 2, 0.2057591600251703, 0.7965989556367638, 0.4127401255114073, -0.582403001073982, 0.8904118861510512, 0.4989781752496407, 0.659094869733673],
[3.654279847363845, 2.445454559165539, 0, 2, 0.5990883543146022, 0, 0.8178438615855774, 1.240859091978749, 0.160730147646174, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 3.176365003103379, 0, 0, 0.3903591982146595, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.012024774476358, 1.920231745605984, 2, 4, 0.3451351433768622, 1.976236205319024, 2.083081903605175, 0.07970550476478322, 0.6568777305562783, 0.6717289320196468, 1.340505886029576],
[0.6168423798289772, 2.26915028498315, 0, 0.5, 0.2137366415895352, 0, 0.2203467982305601, 0.1643758528231472, 0.8867149251086647, 1, 1.340505886029576],
[0.7521120242517446, 2.247887975748257, 2, 0, 0.2507040080839147, 2.659178334490456, 0, -1.983712538828633, 1, 0.06285249966933948, 1.340505886029576],
[0.8047955362854158, 2.195204463714585, 2, 2, 0.2682651787618052, 2.485103246510443, 0.9110768646195841, -1.174203260347438, 0.9383132958612299, 0.2928864240622064, 1.340505886029576],
[0.5235867025248706, 2.316469977018202, 0, 5, 0.1843578356362623, 0, 2.158456638594592, 1.610180649775206, 0.3609926354368211, 1, 1.340505886029576],
[0.8153284072364601, 2.184671592763542, 1, 2, 0.2717761357454865, 1.226499642505381, 0.9154694035592149, -0.2320245231204482, 0.8185611996452929, 0.6138156051179822, 1.340505886029576],
[3.631702199478269, 2.458522884263615, 2, 2, 0.5963165810034268, 0.5507059472793007, 0.8134965970020029, 0.3987144518798799, 0.5311550200037438, 0.8165306921032689, 0.659094869733673],
[2.026273622377953, 4.067801329183935, 0.6666666666666666, 2.333333333333333, 0.3324989663703803, 0.3290111756398889, 0.5736104456707666, 0.3711139037233219, 0.5937050812956701, 0.7025898215024489, 0.659094869733673],
[1.164126244493619, 4.502325941845689, 1, 1, 0.2054418190098024, 0.8590133627946752, 0.2221074202348972, -0.9663342438352446, 0.9577936590019436, 0.3686772970215484, 0.659094869733673],
[1.169694781338998, 4.048840110261136, 1.5, 3.5, 0.2241423705380917, 1.282385818873953, 0.8644451014822272, -0.6341131399802994, 0.8045395867285091, 0.5158231574238645, 0.659094869733673],
[1.913849976624345, 4.185707824508156, 1.5, 2.5, 0.3137686434037893, 0.7837604923692635, 0.597270546539823, -0.2829485623288151, 0.766429239057858, 0.5754483154557199, 0.659094869733673],
[2.028473596625117, 4.073102735950108, 0, 2, 0.3324507448666109, 0, 0.491026161051023, 0.7450007329740509, 0.4456220080291426, 1, 0.659094869733673],
[2.033548813171052, 4.068027519404174, 1, 1, 0.333282532632477, 0.4917511660025665, 0.2458193793503309, -0.3731356409307384, 0.888922753442082, 0.5554878187070358, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 2, 0, 0.3333333333333334, 0.9833524441818537, 0, -1.49197405311197, 1, 0.111111111111111, 0.659094869733673],
[2.033200857154365, 3.658992607013045, 0, 3, 0.3571911021565671, 0, 0.8198978030865708, 1.243975398288072, 0.2656107444535754, 1, 0.659094869733673],
[2.328678670812659, 2.150093373795864, 1, 0, 0.5199368593933881, 0.4294280754720965, 0, -0.651542130263614, 1, 0.5199368593933881, 0.659094869733673],
[2.015014291481469, 4.086562041093757, 3, 7, 0.3302448714316114, 1.488823187350376, 1.712931292761304, 0.3400240476784246, 0.567699283503128, 0.6935781051045224, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0.2458381110454634, -0.3729935132779924, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.2458381110454634, 0.3729935132779924, 0.6666666666666666, 1, 0.659094869733673],
[1.254845778995744, 4.067717555050151, 1, 0, 0.2357596707152538, 0.7969106775816727, 0, -1.209098589864139, 1, 0.2357596707152538, 0.659094869733673],
[1.62300431876394, 4.067717555050151, 1, 0, 0.2852018346270285, 0.616141305626092, 0, -0.9348294667732163, 1, 0.2852018346270284, 0.659094869733673],
[1.208698346832795, 4.674878401910358, 1, 0, 0.2054359785637192, 0.8273362850378209, 0, -1.30405664645894, 1, 0.2054359785637192, 0.6344327811866034],
[2.25194096109393, 3.619158047850914, 2, 1, 0.383563785530275, 0.8881227503533022, 0.2763073584459259, -0.9282660509170685, 0.9435696441994583, 0.3285028211098608, 0.659094869733673],
[2.026757626169438, 3.176729226063642, 0, 2, 0.3894999033772236, 0, 0.6295783674576022, 0.9552166104888696, 0.3727103679764194, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[2.027505381138757, 3.779986578449432, 2, 2, 0.3491189303829063, 0.986433880080107, 0.5291024077710904, -0.6938780641606497, 0.874359063198227, 0.4354551431900072, 0.659094869733673],
[1.000359631191971, 3.479329839941232, 2, 2, 0.2233100391529852, 1.999280996192254, 0.5748233401274141, -2.161233111464568, 0.9629167242530106, 0.217577425179819, 0.659094869733673],
[2.112458968812664, 4.226165057741668, 0, 1, 0.3332677502188111, 0, 0.2366211414691808, 0.372964872695606, 0.6667322497811889, 1, 0.6344327811866034],
[2.112920274268266, 4.225840548536532, 2, 0, 0.3333333333333333, 0.946557247974076, 0, -1.49197405311197, 1, 0.1111111111111109, 0.6344327811866034],
[2.112920274268266, 4.225599667826045, 1, 2, 0.3333460008915166, 0.473278623987038, 0.4733056032799589, 4.25250613159938e-05, 0.7407238505027003, 0.7037205934603493, 0.6344327811866034],
[2.112462347342285, 4.226162681086572, 0, 1, 0.3332682305496618, 0, 0.2366212745371397, 0.3729650824388016, 0.6667317694503382, 1, 0.6344327811866034],
[1.686558227656086, 4.652202595148711, 1, 1, 0.2660706524196967, 0.5929234956742416, 0.2149519457821536, -0.5957629572437189, 0.929206407920957, 0.4613477127603504, 0.6344327811866034],
[2.113146071228601, 3.799801709027208, 1, 2, 0.3573760753113198, 0.4732280525305056, 0.5263432550305427, 0.0837207724365909, 0.7081334939744411, 0.7346184841137967, 0.6344327811866034],
[2.112920274268266, 4.225766354752257, 2.75, 0, 0.3333372349714601, 1.301516215964355, 0, -2.051464323028958, 1, 0.07328378424710957, 0.6344327811866034],
[1.303919488654677, 5.034841334150117, 1, 1, 0.2057057404601228, 0.7669185165962606, 0.1986159907795387, -0.8957647565969157, 0.9576851483417527, 0.3690966292619982, 0.6344327811866034],
[2.112920274268266, 4.225840548536532, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.473278623987038, 0.7459870265559848, 0.4444444444444445, 1, 0.6344327811866034],
[2.112920274268266, 4.225840548536532, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.473278623987038, 0.236639311993519, -0.3729935132779924, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.6344327811866034],
[1.62003541064396, 4.06888972759246, 2, 1, 0.2847700349852336, 1.234540916118004, 0.2457672895922138, -1.500199245861727, 0.9769068665213936, 0.1970956515192599, 0.659094869733673],
[1.255011091426637, 4.844439477403336, 0, 3, 0.2057580559534528, 0, 0.6192666899841275, 0.9395714007520051, 0.501023914159897, 1, 0.659094869733673],
[2.03008602073576, 4.071490311839466, 1, 1, 0.3327150083983205, 0.4925899640634795, 0.2456103105764749, -0.3747254982986047, 0.8893007231865055, 0.5547307399831465, 0.659094869733673],
[0.3401702752881785, 0.8763113452696625, 0, 0, 0.2796345374558038, 0, 0, 0, 1, 1, 0.958340363816454],
[1.623722979578896, 4.067717555050151, 0, 0, 0.2852920925202508, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.416831578040077, 4.666386827305129, 0, 1, 0.232908221213155, 0, 0.2142985648229054, 0.3251406962240491, 0.767091778786845, 1, 0.659094869733673],
[1.483535967652747, 4.618040364922474, 0, 1, 0.2431397866371703, 0, 0.2165420656769828, 0.3285446080994123, 0.7568602133628297, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[0.7662640788182685, 0.5120173317720018, 0, 0, 0.5994486601071917, 0, 0, 0, 1, 1, 0.958340363816454],
[0.2628327157998814, 0.9670349932452168, 0, 0, 0.2137081198789679, 0, 0, 0, 1, 1, 0.958340363816454],
[0.506599763782954, 0.6084205590771073, 0, 0, 0.4543412827521476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.958340363816454],
[0.3112464173450544, 0.9670349932452168, 0, 0, 0.2434881824662774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.958340363816454],
[1.623758972775766, 4.476559774203019, 2, 2, 0.266176086877418, 1.231709898779534, 0.4467716507496135, -1.190933633495127, 0.939625050459908, 0.2892893123801037, 0.659094869733673],
[1.254501083139698, 4.069520539806151, 0, 4, 0.2356303508860594, 0, 0.982916773824795, 1.491313039990695, 0.3413608699486877, 1, 0.659094869733673],
[1.169148503650057, 4.493726857221345, 1, 3, 0.2064584560219155, 0.8553233373502348, 0.667597318510592, -0.2848239721779341, 0.8092012285548638, 0.603467605498172, 0.659094869733673],
[2.426885180843555, 2.922636005854426, 0, 1, 0.4536640002245813, 0, 0.3421568741358377, 0.5215514277997358, 0.5463359997754187, 1, 0.6560366934077656],
[1.623096627776094, 4.47847970479913, 1, 0, 0.2660126726778245, 0.6161062643387797, 0, -0.9347763010016081, 1, 0.2660126726778245, 0.659094869733673],
[2.031700029561502, 4.069584637583404, 0, 3.5, 0.3329954493849629, 0, 0.8600386308904405, 1.304878357250702, 0.2423543331758047, 1, 0.659094869733673],
[1.623514185498583, 4.477598476866855, 1, 2, 0.2661013286171865, 0.6159478056503084, 0.4466680097228092, -0.2568367676657865, 0.825255474759323, 0.6047168475934732, 0.659094869733673],
[1.255281759266299, 4.845853804928488, 1, 2, 0.2057455937601295, 0.7966338972251861, 0.4127239657882156, -0.5824805336325872, 0.8904251880098257, 0.4989525012577393, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0.2458381110454634, -0.3729935132779924, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.659094869733673],
[1.255281337741541, 4.846294994833681, 1, 1, 0.2057306619340021, 0.7966341647356643, 0.2063431964141751, -0.8956085010341741, 0.9576748947401974, 0.3691362186082014, 0.659094869733673],
[1.623722979578896, 4.477853352996329, 0, 0, 0.2661153267738583, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.254738748903522, 4.8468375836717, 0, 1, 0.2056417359239934, 0, 0.2063200969161534, 0.313035507315545, 0.7943582640760066, 1, 0.659094869733673],
[1.623004667693402, 4.478571664881822, 1, 0, 0.2659976011491441, 0.6161411731619911, 0, -0.9348292657944088, 1, 0.2659976011491441, 0.659094869733673],
[1.254570288564621, 4.847006044010602, 0, 0, 0.205614126609659, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.485971834628712, 4.61560449794651, 0, 1, 0.243539005927923, 0, 0.2166563448936974, 0.3287179962138741, 0.756460994072077, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[2.252413981331101, 3.618070908410749, 0, 0, 0.3836844866540742, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[0.998928861385548, 3.480248316355507, 0, 1, 0.2230161526875186, 0, 0.2873358189128278, 0.435955174448459, 0.7769838473124814, 1, 0.659094869733673]
],
"RESOLVED": [
[0.0005782046163200364, 6.100744239020026, 0, 1, 9.47670970779624e-05, 0, 0.1639144276208228, 0.2486962577740248, 0.999905232902922, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067105307073478, 1, 4, 0.3333667842201212, 0.4916762220909269, 0.9835004746602533, 0.7462116231735542, 0.4608392756263723, 0.868345791799247, 0.659094869733673],
[1.263266830045592, 4.837358725893173, 0, 11, 0.2070716877248501, 0, 2.273968217639049, 3.450137942293366, 0.07790640699741645, 1, 0.659094869733673],
[2.03314367472339, 4.068432657851836, 1, 2, 0.3332161336520202, 0.4918491557838628, 0.4915898008389343, -0.000393501689723923, 0.7408969932435066, 0.7035474099888126, 0.659094869733673],
[1.623722979578896, 4.477853352996329, 0, 1, 0.2661153267738583, 0, 0.2233212928536072, 0.3388302702824054, 0.7338846732261417, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.2458381110454634, 0.3729935132779924, 0.6666666666666666, 1, 0.659094869733673],
[2.032476453970669, 4.069099878604558, 0, 2, 0.3331067814590207, 0, 0.4915091935973498, 0.7457336055368763, 0.4447465649359463, 1, 0.659094869733673],
[1.485889660703901, 4.615686671871321, 0, 3, 0.2435255382729546, 0, 0.6499574631619699, 0.9861364319594911, 0.4328952425380879, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 3, 0, 0.3333333333333334, 1.475028666272781, 0, -2.237961079667954, 0.9999999999999999, 0.0370370370370372, 0.659094869733673],
[2.033548813927826, 4.0680275186474, 1, 2, 0.3332825327565062, 0.491751165819564, 0.491638758792121, -0.0001705475684985908, 0.740808472262216, 0.7036359644397392, 0.659094869733673],
[1.164056916900576, 4.046166863727873, 0, 1, 0.2234178349936764, 0, 0.247147493832883, 0.3749801510862167, 0.7765821650063236, 1, 0.659094869733673],
[0.9986683451380132, 4.212563354707019, 1, 2, 0.1916376785103819, 1.001333430531237, 0.4747703076715148, -0.7989185579194322, 0.9039007879449108, 0.4717759297663284, 0.659094869733673],
[2.033388521863357, 4.068187810711868, 0, 1, 0.3332562621576099, 0, 0.2458096937823074, 0.3729503976895377, 0.6667437378423902, 1, 0.659094869733673],
[1.163443871840513, 4.49930809112005, 1, 1, 0.205455559320004, 0.8595171835991083, 0.2222563958164202, -0.9668726264554182, 0.9577880131445042, 0.3686991317845124, 0.659094869733673],
[0.998330225839547, 4.665431750438396, 0, 3, 0.1762662749636983, 0, 0.6430273038970293, 0.9756217707427517, 0.5589340163224892, 1, 0.659094869733673],
[2.033561665292998, 4.068014667282228, 1, 2, 0.3332846389933984, 0.491748058132242, 0.4916403119402138, -0.0001634759986399665, 0.7408056641559511, 0.7036387731747308, 0.659094869733673],
[2.033107850536953, 4.068468482038273, 1, 2, 0.3332102623518046, 0.4918578223658404, 0.4915854722310679, -0.0004132184110044044, 0.7409048202325845, 0.7035395787668682, 0.659094869733673],
[1.163564797479473, 4.046658983148975, 0, 0, 0.2233233823479124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.16361633140629, 3.315572329895867, 0, 2, 0.2597828355521894, 0, 0.6032141063448959, 0.9152159029680242, 0.5479214505431571, 1, 0.659094869733673],
[0, 4.105888947042265, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.623514185493415, 4.478062147081809, 1, 0, 0.2660811070781436, 0.6159478056522693, 0, -0.9345358823702593, 1, 0.2660811070781436, 0.659094869733673],
[3.656662287071384, 2.444914045503833, 1, 0, 0.5992979662565431, 0.2734734360172207, 0, -0.4149227198927004, 1, 0.5992979662565431, 0.659094869733673],
[2.039539734374902, 4.059833016148843, 2, 2, 0.3343851602117233, 0.9806134032554064, 0.4926310988763769, -0.7403824954307614, 0.887951718987761, 0.4092773172068389, 0.659094869733673],
[0.8709519627543506, 5.230624369820873, 0, 1, 0.142742123556579, 0, 0.1911817651769641, 0.2900671420097941, 0.857257876443421, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.2458381110454634, 0.3729935132779924, 0.6666666666666666, 1, 0.659094869733673],
[1.623537180871264, 4.478039151703961, 1, 1, 0.2660848758383123, 0.6159390815203595, 0.2233120270106359, -0.5957064339893531, 0.92919883885011, 0.4613685905267345, 0.659094869733673],
[3.656666538466027, 2.444334360436987, 1, 0, 0.5993551876256092, 0.2734731180654773, 0, -0.4149222374860576, 1, 0.5993551876256092, 0.659094869733673],
[1.623614067311433, 4.477962265263791, 1, 0, 0.2660974769164565, 0.6159099136507945, 0, -0.9344783914031546, 1, 0.2660974769164566, 0.659094869733673],
[2.031866886884836, 4.06970944569039, 1, 1, 0.3330068782450629, 0.492158224761049, 0.2457177873125434, -0.3739073823288706, 0.8891064190414778, 0.5551201755316038, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 2, 0, 0.3333333333333334, 0.9833524441818537, 0, -1.49197405311197, 1, 0.111111111111111, 0.659094869733673],
[0.0007092747222264988, 4.106177291431943, 0, 1, 0.000172703752782412, 0, 0.2435355146711824, 0.3694999397728436, 0.9998272962472176, 1, 0.659094869733673],
[1.485493526744393, 4.616082805830829, 0, 1, 0.243460615056737, 0, 0.2166338954615036, 0.3286839352110887, 0.756539384943263, 1, 0.659094869733673],
[1.255010706017454, 4.615866039598279, 0, 2, 0.2137688730996906, 0, 0.4332881376631244, 0.6573987411527076, 0.6181593849069303, 1, 0.659094869733673],
[2.033418009158612, 4.068158323416613, 0, 1, 0.3332610948915868, 0, 0.2458114754885344, 0.3729531009517065, 0.6667389051084132, 1, 0.659094869733673],
[3.655478687227434, 2.444775363248418, 1, 0, 0.5992338445219814, 0.273561983412484, 0, -0.4150570668574994, 1, 0.5992338445219814, 0.659094869733673],
[1.163564797479473, 3.314288555516852, 0, 0, 0.2598487948920617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.254832701656584, 4.846743630918638, 0, 1, 0.2056571340355536, 0, 0.2063240963728182, 0.3130415754202269, 0.7943428659644465, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 2, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0.4916762220909269, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.659094869733673],
[1.254570288564621, 4.067717555050151, 0, 0, 0.235720112370425, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.033626723926058, 4.067949608649168, 2, 4, 0.3332953015877042, 0.9834646528143872, 0.9832963494668923, -0.0002553552686018722, 0.6804592100840632, 0.6487588904830719, 0.659094869733673],
[1.623000930514409, 4.478575402060815, 1, 0, 0.2659969886551279, 0.6161425919103144, 0, -0.9348314183651364, 1, 0.2659969886551279, 0.659094869733673],
[1.429026642879287, 4.672054193131861, 1, 2, 0.2342251612934826, 0.6997770160429908, 0.4280772262744927, -0.4122316865829748, 0.8611155742441139, 0.5509411317280678, 0.659094869733673],
[1.254466948380283, 4.846611846056756, 0, 2, 0.2056139562603429, 0, 0.4126594131170658, 0.6261001747499767, 0.6310491864883445, 1, 0.659094869733673],
[1.429985729412087, 4.671590603163136, 0, 0, 0.2343633270270912, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.254779040227942, 4.84679729234728, 1, 0, 0.2056483393527181, 0.796953063400183, 0, -1.20916289899543, 1, 0.2056483393527181, 0.659094869733673],
[2.250814893573389, 3.619752074363125, 1, 1, 0.3834067315587653, 0.4442835360896347, 0.2762620144850513, -0.2549276732687625, 0.852999278195425, 0.6198127413129555, 0.659094869733673],
[1.254987992267791, 4.067717555050151, 1, 0, 0.2357800898642922, 0.7968203729128737, 0, -1.208961576707239, 1, 0.2357800898642922, 0.659094869733673],
[0.8709519627318646, 5.230624369843359, 0, 1, 0.1427421235528937, 0, 0.1911817651761422, 0.2900671420085472, 0.8572578764471063, 1, 0.659094869733673],
[1.485661731397995, 4.615914601177227, 0, 0, 0.2434881824662774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[0.9978436927664802, 4.665580696408751, 0, 0, 0.1761908739655297, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.418041378789048, 2.90455644369358, 1, 0, 0.4542972171549863, 0.4135578525545327, 0, -0.6274633160498474, 1, 0.4542972171549864, 0.659094869733673],
[1.486718023818462, 4.614858308756761, 0, 1, 0.2436613004218502, 0, 0.2166913766566756, 0.3287711475348551, 0.7563386995781498, 1, 0.659094869733673],
[1.62165861372519, 4.479917718850035, 3, 1, 0.2657769935725371, 1.849957799137857, 0.223218385416394, -2.468141520171133, 0.9950103562643495, 0.0601262629794268, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[0, 4.105888947042265, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.659094869733673],
[3.65448302210603, 2.447093310469188, 1, 0, 0.5989408020015093, 0.2736365154663418, 0, -0.4151701492941566, 1, 0.5989408020015093, 0.659094869733673],
[2.418041378787567, 2.904556443699954, 1, 0, 0.4542972171542904, 0.4135578525547859, 0, -0.6274633160502316, 1, 0.4542972171542905, 0.659094869733673],
[0, 4.105888947042265, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.034138906308629, 4.066869342490391, 1, 1, 0.3334102861947528, 0.4916085115419721, 0.2458893846310881, -0.3728129867103566, 0.888837581059533, 0.5556581534490386, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.419226217752779, 2.904461938323073, 2, 1, 0.4544267332773334, 0.8267106173550819, 0.3442978497343858, -0.7319322145772875, 0.9061592182317622, 0.4318294042148494, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.4916762220909269, 0.7459870265559848, 0.4444444444444444, 1, 0.659094869733673],
[1.254570288564621, 4.615866154826919, 0, 3, 0.2137098835261071, 0, 0.6499321902700385, 0.9860980871125017, 0.4861255528828601, 1, 0.659094869733673],
[1.254570288564621, 4.847006044010602, 0, 0, 0.205614126609659, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.034903619610022, 4.066541973176038, 2, 2, 0.3335117208970863, 0.9828475318075699, 0.4918183589871977, -0.7450053025276728, 0.8887302585213099, 0.4077245408313759, 0.659094869733673],
[2.034160128782124, 4.067416203793101, 1, 1, 0.3333827224158627, 0.4916033825708265, 0.2458563249729502, -0.3728553640497577, 0.8888559603945878, 0.5556214052263133, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 2, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0.4916762220909269, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 13, 2, 0.3333333333333334, 6.391790887182049, 0.4916762220909269, -8.951844318671817, 0.9999978395566994, 3.143096543867241e-05, 0.659094869733673],
[2.03210027303028, 4.069476059544946, 1, 4, 0.3330451283844897, 0.4921017005272058, 0.9829275173195847, 0.7446967642013534, 0.4614747664688488, 0.8680278641222687, 0.659094869733673],
[1.62066920657482, 4.067717555050151, 7, 0, 0.2849084062828126, 4.319203432509247, 0, -6.553234793428979, 0.9999999999999998, 0.0001523831137801857, 0.659094869733673],
[1.595706834125082, 4.067717555050149, 0, 0, 0.2817565353525388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[0.8702939800455997, 5.231282352529623, 0, 0, 0.1426342854057657, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.254518726520009, 4.846809357188217, 0, 1, 0.2056140416165829, 0, 0.2063212984676027, 0.3130373303481683, 0.7943859583834172, 1, 0.659094869733673],
[0.00127340648588085, 4.105613158195511, 0, 1, 0.0003100661451991283, 0, 0.2435689777552052, 0.369550711043505, 0.9996899338548009, 1, 0.659094869733673],
[1.918584043414191, 4.182992289161032, 1, 0, 0.3144407180766083, 0.5212177196160055, 0, -0.7908083396653035, 1, 0.3144407180766082, 0.659094869733673],
[2.03362671460826, 4.067949617966966, 2, 1, 0.333295300060591, 0.9834646573204866, 0.2458240868036534, -1.11917207126024, 0.9629756392740689, 0.2592085496755759, 0.659094869733673],
[2.030940566139592, 4.069788370029343, 1, 5, 0.3329012954663346, 0.4923827002484855, 1.228565110859548, 1.116959704008224, 0.3520199417454911, 0.9118665880131009, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 3.179396654813023, 2, 1, 0.3901321935827164, 0.9833524441818537, 0.3145250840237828, -1.014766448460342, 0.9406206596199786, 0.3378507046489438, 0.659094869733673],
[1.485971730604005, 4.615604601971218, 0, 1, 0.243538988879098, 0, 0.2166563400107806, 0.3287179888053553, 0.756461011120902, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.2458381110454634, 0.3729935132779924, 0.6666666666666666, 1, 0.659094869733673],
[1.91847263674465, 4.183103695830573, 1, 0, 0.3144224594064764, 0.5212479869907577, 0, -0.79085426230276, 1, 0.3144224594064764, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[0.004041491874828353, 6.097534840700397, 0, 2, 0.0006623684855422608, 0, 0.3280014058550699, 0.4976543149055442, 0.9986757017609261, 1, 0.659094869733673],
[2.033417842630217, 4.068158489945009, 0, 3, 0.3332610675989026, 0, 0.7374343962790281, 1.118859257055074, 0.2963926610539207, 1, 0.659094869733673],
[1.254779040221154, 4.615838177764079, 1, 1, 0.2137388614568518, 0.7969530634044941, 0.2166453765249634, -0.8804615443509997, 0.9543156991031285, 0.3817934220168324, 0.659094869733673],
[2.037340227619082, 4.079189123944523, 1, 1, 0.3330876238006222, 0.4908360353580415, 0.2451467606956681, -0.3736812287306938, 0.8890526348708554, 0.5552278824720995, 0.6574835870052168],
[2.038401374661797, 4.077686346750265, 0, 2, 0.3332851763269311, 0, 0.4904742125626978, 0.7459870059977727, 0.4445086561054113, 1, 0.6574835870052168],
[2.038145440441908, 4.078049324210062, 1, 2, 0.3332374979654338, 0.4906421201144416, 0.4904305566209426, -0.0003217776043088593, 0.7408685120450955, 0.7035759048434553, 0.6574835870052168],
[2.257598816818499, 3.627665749791398, 1, 2, 0.3836019249885565, 0.4429484957868826, 0.5513187095903216, 0.1648257324522066, 0.6714430711161349, 0.7658016552413478, 0.6574835870052168],
[0, 6.116529351563603, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6574835870052168],
[0, 4.115951172284211, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6574835870052168],
[2.0397636171812, 4.076765734382405, 3, 0, 0.3334838271739452, 1.470758657881041, 0, -2.236951137564095, 0.9999999999999999, 0.03708722430237898, 0.6574835870052168],
[1.627869387316453, 4.48865996424715, 0, 2, 0.2661426593007866, 0, 0.4455672775238713, 0.6776857800411311, 0.5385465964981215, 1, 0.6574835870052168],
[1.627702207113244, 4.077686234375737, 0, 0, 0.2852920925202508, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6574835870052168],
[1.627702207113244, 4.488827144450359, 0, 0, 0.2661153267738584, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6574835870052168],
[1.48930261481386, 4.627226736749741, 0, 0, 0.2434881824662774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6574835870052168],
[2.038401075028435, 4.078128276535169, 0, 2, 0.3332610632379858, 0, 0.4904210619140273, 0.7459061664913258, 0.4445408097945412, 1, 0.6574835870052168],
[2.031627035952056, 4.069731906285394, 1.75, 2, 0.3329794321536885, 0.8613785744291002, 0.4914328624229893, -0.5612935694001054, 0.8401772834873679, 0.4734269042264907, 0.659094869733673],
[1.623005013846714, 4.47857131872851, 1, 0, 0.2659976578809284, 0.6161410417518559, 0, -0.9348290664147122, 1, 0.2659976578809284, 0.659094869733673],
[1.596121554870376, 4.066632182383092, 1, 0, 0.2818631409609068, 0.626518698997967, 0, -0.9505743827912522, 1, 0.2818631409609067, 0.659094869733673],
[3.654239423408641, 2.447166268044626, 2, 0, 0.5989176278717918, 0.5473095132158632, 0, -0.8303956506853405, 1, 0.358702324975574, 0.659094869733673],
[1.254570288564621, 4.847006044010602, 0, 0, 0.205614126609659, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0.2458381110454634, -0.3729935132779924, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.031543267098546, 4.07003306547668, 3, 1, 0.3329538395270907, 1.476709873024071, 0.2456982495995719, -1.867730549809811, 0.9877104463547666, 0.1107740713143759, 0.659094869733673],
[2.033546392617209, 4.068029939958017, 0, 2, 0.3332821359228874, 0, 0.4916384661664118, 0.7459297420492335, 0.4445127102795473, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[0.005101025005353848, 6.096475307569871, 0, 3, 0.0008360175678079102, 0, 0.4920876159827893, 0.7466112066410592, 0.9974940434883833, 1, 0.659094869733673],
[0, 4.105888947042265, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 3.657581757103967, 0, 0, 0.3573539537398748, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.62344887520371, 4.478127457371515, 1, 0, 0.2660704032393084, 0.6159725848308714, 0, -0.9345734781394573, 1, 0.2660704032393084, 0.659094869733673],
[1.254840689679062, 4.846735642896159, 1, 0, 0.205658443209125, 0.7969139096499649, 0, -1.209103493662425, 1, 0.205658443209125, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[1.163564797479473, 4.046658983148975, 0, 0, 0.2233233823479124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[1.622543983344193, 4.479032349231031, 3, 1, 0.2659220986356791, 1.848948337176512, 0.2232625089594814, -2.466542986253158, 0.99499945064438, 0.06021661143508505, 0.659094869733673],
[1.485661731397995, 4.615914601177227, 0, 0, 0.2434881824662774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[2.034777027525306, 4.06679930504992, 3, 0, 0.3334838272303494, 1.474363018364031, 0, -2.236951137185745, 1, 0.03708722432119715, 0.659094869733673],
[1.623180094593005, 4.478396237982219, 2, 0, 0.2660263522275608, 1.232149166110541, 0, -1.86945646627234, 1, 0.07077002007950228, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.034777161053911, 4.066799171521315, 0, 1, 0.3334838491146295, 0, 0.2458936273526185, 0.3730777444102686, 0.6665161508853705, 1, 0.659094869733673],
[2.033162851385629, 4.068413481189596, 3, 1, 0.3332192765549676, 1.47553355008206, 0.2457960589855291, -1.865797395135912, 0.987671209617499, 0.1110097533260159, 0.659094869733673],
[1.255219981627622, 4.842375971235603, 1, 7, 0.2058548961477536, 0.79667310482368, 1.445571356206331, 0.9845293616757443, 0.4862549328780738, 0.8418027602901714, 0.659094869733673],
[2.033394813652775, 4.068181518922451, 0, 2, 0.333257293332027, 0, 0.4916201478958945, 0.7459019489782226, 0.4445458368949347, 1, 0.659094869733673],
[2.033417620910373, 4.068158711664852, 1, 1, 0.3332610312607777, 0.4917828928581301, 0.245811452029304, -0.3731958055267798, 0.888937085043003, 0.5554591475645583, 0.659094869733673],
[1.485906615149315, 4.615669717425908, 1, 0, 0.2435283169721774, 0.6729898028615431, 0, -1.02108184081828, 1, 0.2435283169721774, 0.659094869733673],
[3.653004876047768, 2.448310119997479, 2, 2, 0.5987241895256309, 0.5474944786177853, 0.8168899779747099, 0.408735542829793, 0.5270034219239478, 0.8193271428334328, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 2, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0.4916762220909269, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.659094869733673],
[1.595268631179769, 4.06842043413266, 0, 1, 0.2816659976886935, 0, 0.2457956389193066, 0.3729290731979566, 0.7183340023113065, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067332374023121, 3, 2, 0.3333543773676026, 1.475028666272781, 0.4917227843914166, -1.491903407287479, 0.9547221173522613, 0.2099077205410254, 0.659094869733673],
[2.031843089424367, 4.069733243150859, 1.5, 2.5, 0.33300297802991, 0.7382459835640944, 0.6142908762404428, -0.1880686878563316, 0.7411811052719056, 0.6044487108518195, 0.659094869733673],
[3.656880706726069, 2.444254848119511, 1, 0, 0.5993770624915454, 0.2734571018848683, 0, -0.4148979372201256, 1, 0.5993770624915454, 0.659094869733673],
[1.163443266714757, 4.046780513913691, 1, 0, 0.223300056907426, 0.8595176306479682, 0, -1.304087878874375, 1, 0.223300056907426, 0.659094869733673],
[1.254700934493669, 4.846875398081553, 0, 2, 0.2056355384419344, 0, 0.4126369744911582, 0.6260661301428373, 0.6310148977864355, 1, 0.659094869733673],
[1.163564797479473, 4.046658983148975, 0, 0, 0.2233233823479124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.033793604743869, 4.067782727831357, 1, 1, 0.3333226520310511, 0.4916919778228615, 0.245834172301805, -0.3730233943717431, 0.888896009642987, 0.555541313705089, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.9184648409304, 4.183111491644823, 1, 0, 0.3144211817343102, 0.5212501051179175, 0, -0.7908574759936216, 1, 0.3144211817343102, 0.659094869733673],
[2.032708748461135, 3.179762210528595, 2, 0.75, 0.3899702779073345, 0.983908787480795, 0.235866693904549, -1.134953597618678, 0.9610350888002188, 0.2915554093019852, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.4916762220909269, 0.7459870265559848, 0.4444444444444444, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 5, 0, 0.3333333333333334, 2.458381110454634, 0, -3.729935132779924, 1, 0.004115226337448541, 0.659094869733673],
[1.918774885605682, 4.182801446969542, 0, 1, 0.3144719955991841, 0, 0.2390742215900553, 0.3627311219804523, 0.6855280044008158, 1, 0.659094869733673],
[2.034336049709045, 4.06724028286618, 2, 1, 0.3334115544614411, 0.98312174150679, 0.2458669590318133, -1.118586741196888, 0.9629368831345703, 0.2593635602143239, 0.659094869733673],
[2.03341805227994, 4.068158280295286, 1, 1, 0.3332611019588306, 0.4917827885312442, 0.2458114780940665, -0.3731956076923642, 0.8889370379211861, 0.5554592418388471, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 3.177374095936382, 0, 1, 0.390283609831108, 0, 0.3147252951041942, 0.477511371362014, 0.609716390168892, 1, 0.659094869733673],
[1.254936288238817, 4.845721501804574, 1, 1, 0.2057050782764675, 0.79685320232743, 0.2063676172119249, -0.8959037799127588, 0.9576854207712723, 0.3690955773242075, 0.659094869733673],
[2.03341800915906, 4.068158323416165, 0, 1, 0.3332610948916601, 0, 0.2458114754885615, 0.3729531009517476, 0.6667389051083399, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[1.486069350392661, 4.615506982182561, 0, 1, 0.2435549879887273, 0, 0.2166609223776159, 0.3287249413201535, 0.7564450120112727, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 2, 1, 0.3333333333333334, 0.9833524441818537, 0.2458381110454634, -1.118980539833977, 0.9629629629629628, 0.2592592592592594, 0.659094869733673],
[2.032871529595754, 3.177856267712908, 1, 1, 0.3901319755458597, 0.4919150007471719, 0.3146775422664715, -0.2689103900206634, 0.8477970416566849, 0.628060992748404, 0.659094869733673],
[1.623514185494762, 4.478062147080463, 1, 0, 0.2660811070783644, 0.6159478056517581, 0, -0.9345358823694838, 1, 0.2660811070783644, 0.659094869733673],
[1.255336820270681, 4.845664078630329, 1, 2, 0.2057591600251703, 0.7965989556367638, 0.4127401255114073, -0.582403001073982, 0.8904118861510512, 0.4989781752496407, 0.659094869733673],
[3.654279847363845, 2.445454559165539, 0, 2, 0.5990883543146022, 0, 0.8178438615855774, 1.240859091978749, 0.160730147646174, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 3.176365003103379, 0, 0, 0.3903591982146595, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.012024774476358, 1.920231745605984, 2, 4, 0.3451351433768622, 1.976236205319024, 2.083081903605175, 0.07970550476478322, 0.6568777305562783, 0.6717289320196468, 1.340505886029576],
[0.6168423798289772, 2.269535452601168, 0, 0, 0.2137081198789679, 0, 0, 0, 1, 1, 1.340505886029576],
[0.7521120242517446, 2.247887975748257, 2, 0, 0.2507040080839147, 2.659178334490456, 0, -1.983712538828633, 1, 0.06285249966933948, 1.340505886029576],
[0.8047955362854158, 2.195204463714585, 2, 2, 0.2682651787618052, 2.485103246510443, 0.9110768646195841, -1.174203260347438, 0.9383132958612299, 0.2928864240622064, 1.340505886029576],
[0.5235867025248706, 2.316469977018202, 0, 5, 0.1843578356362623, 0, 2.158456638594592, 1.610180649775206, 0.3609926354368211, 1, 1.340505886029576],
[0.8153284072364601, 2.184671592763542, 1, 2, 0.2717761357454865, 1.226499642505381, 0.9154694035592149, -0.2320245231204482, 0.8185611996452929, 0.6138156051179822, 1.340505886029576],
[3.631702199478269, 2.458522884263615, 2, 2, 0.5963165810034268, 0.5507059472793007, 0.8134965970020029, 0.3987144518798799, 0.5311550200037438, 0.8165306921032689, 0.659094869733673],
[2.026273622377953, 4.067801329183935, 0.6666666666666666, 2.333333333333333, 0.3324989663703803, 0.3290111756398889, 0.5736104456707666, 0.3711139037233219, 0.5937050812956701, 0.7025898215024489, 0.659094869733673],
[1.164126244493619, 4.502325941845689, 1, 1, 0.2054418190098024, 0.8590133627946752, 0.2221074202348972, -0.9663342438352446, 0.9577936590019436, 0.3686772970215484, 0.659094869733673],
[1.169694781338998, 4.048840110261136, 1.5, 3.5, 0.2241423705380917, 1.282385818873953, 0.8644451014822272, -0.6341131399802994, 0.8045395867285091, 0.5158231574238645, 0.659094869733673],
[1.913849976624345, 4.185707824508156, 1.5, 2.5, 0.3137686434037893, 0.7837604923692635, 0.597270546539823, -0.2829485623288151, 0.766429239057858, 0.5754483154557199, 0.659094869733673],
[2.028473596625117, 4.073102735950108, 0, 2, 0.3324507448666109, 0, 0.491026161051023, 0.7450007329740509, 0.4456220080291426, 1, 0.659094869733673],
[2.033548813171052, 4.068027519404174, 1, 1, 0.333282532632477, 0.4917511660025665, 0.2458193793503309, -0.3731356409307384, 0.888922753442082, 0.5554878187070358, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 2, 0, 0.3333333333333334, 0.9833524441818537, 0, -1.49197405311197, 1, 0.111111111111111, 0.659094869733673],
[2.033200857154365, 3.658992607013045, 0, 3, 0.3571911021565671, 0, 0.8198978030865708, 1.243975398288072, 0.2656107444535754, 1, 0.659094869733673],
[2.328678670812659, 2.150093373795864, 1, 0, 0.5199368593933881, 0.4294280754720965, 0, -0.651542130263614, 1, 0.5199368593933881, 0.659094869733673],
[2.015014291481469, 4.086562041093757, 3, 7, 0.3302448714316114, 1.488823187350376, 1.712931292761304, 0.3400240476784246, 0.567699283503128, 0.6935781051045224, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0.2458381110454634, -0.3729935132779924, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.2458381110454634, 0.3729935132779924, 0.6666666666666666, 1, 0.659094869733673],
[1.254845778995744, 4.067717555050151, 1, 0, 0.2357596707152538, 0.7969106775816727, 0, -1.209098589864139, 1, 0.2357596707152538, 0.659094869733673],
[1.62300431876394, 4.067717555050151, 1, 0, 0.2852018346270285, 0.616141305626092, 0, -0.9348294667732163, 1, 0.2852018346270284, 0.659094869733673],
[1.208698346832795, 4.674878401910358, 1, 0, 0.2054359785637192, 0.8273362850378209, 0, -1.30405664645894, 1, 0.2054359785637192, 0.6344327811866034],
[2.25194096109393, 3.619158047850914, 2, 1, 0.383563785530275, 0.8881227503533022, 0.2763073584459259, -0.9282660509170685, 0.9435696441994583, 0.3285028211098608, 0.659094869733673],
[2.026757626169438, 3.176729226063642, 0, 2, 0.3894999033772236, 0, 0.6295783674576022, 0.9552166104888696, 0.3727103679764194, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[2.027505381138757, 3.779986578449432, 2, 2, 0.3491189303829063, 0.986433880080107, 0.5291024077710904, -0.6938780641606497, 0.874359063198227, 0.4354551431900072, 0.659094869733673],
[1.000359631191971, 3.479329839941232, 2, 2, 0.2233100391529852, 1.999280996192254, 0.5748233401274141, -2.161233111464568, 0.9629167242530106, 0.217577425179819, 0.659094869733673],
[2.112458968812664, 4.226165057741668, 0, 1, 0.3332677502188111, 0, 0.2366211414691808, 0.372964872695606, 0.6667322497811889, 1, 0.6344327811866034],
[2.112920274268266, 4.225840548536532, 2, 0, 0.3333333333333333, 0.946557247974076, 0, -1.49197405311197, 1, 0.1111111111111109, 0.6344327811866034],
[2.112920274268266, 4.225599667826045, 1, 2, 0.3333460008915166, 0.473278623987038, 0.4733056032799589, 4.25250613159938e-05, 0.7407238505027003, 0.7037205934603493, 0.6344327811866034],
[2.112462347342285, 4.226162681086572, 0, 1, 0.3332682305496618, 0, 0.2366212745371397, 0.3729650824388016, 0.6667317694503382, 1, 0.6344327811866034],
[1.686558227656086, 4.652202595148711, 1, 1, 0.2660706524196967, 0.5929234956742416, 0.2149519457821536, -0.5957629572437189, 0.929206407920957, 0.4613477127603504, 0.6344327811866034],
[2.113146071228601, 3.799801709027208, 1, 2, 0.3573760753113198, 0.4732280525305056, 0.5263432550305427, 0.0837207724365909, 0.7081334939744411, 0.7346184841137967, 0.6344327811866034],
[2.112920274268266, 4.225840548536532, 2, 0, 0.3333333333333333, 0.946557247974076, 0, -1.49197405311197, 1, 0.1111111111111109, 0.6344327811866034],
[1.303919488654677, 5.034841334150117, 1, 1, 0.2057057404601228, 0.7669185165962606, 0.1986159907795387, -0.8957647565969157, 0.9576851483417527, 0.3690966292619982, 0.6344327811866034],
[2.112920274268266, 4.225840548536532, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.473278623987038, 0.7459870265559848, 0.4444444444444445, 1, 0.6344327811866034],
[2.112920274268266, 4.225840548536532, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.473278623987038, 0.236639311993519, -0.3729935132779924, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.6344327811866034],
[1.62003541064396, 4.06888972759246, 2, 1, 0.2847700349852336, 1.234540916118004, 0.2457672895922138, -1.500199245861727, 0.9769068665213936, 0.1970956515192599, 0.659094869733673],
[1.255011091426637, 4.844439477403336, 0, 3, 0.2057580559534528, 0, 0.6192666899841275, 0.9395714007520051, 0.501023914159897, 1, 0.659094869733673],
[2.03008602073576, 4.071490311839466, 1, 1, 0.3327150083983205, 0.4925899640634795, 0.2456103105764749, -0.3747254982986047, 0.8893007231865055, 0.5547307399831465, 0.659094869733673],
[0.3401702752881785, 0.8763113452696625, 0, 0, 0.2796345374558038, 0, 0, 0, 1, 1, 0.958340363816454],
[1.623722979578896, 4.067717555050151, 0, 0, 0.2852920925202508, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.416831578040077, 4.666386827305129, 0, 1, 0.232908221213155, 0, 0.2142985648229054, 0.3251406962240491, 0.767091778786845, 1, 0.659094869733673],
[1.483535967652747, 4.618040364922474, 0, 1, 0.2431397866371703, 0, 0.2165420656769828, 0.3285446080994123, 0.7568602133628297, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[0.7662640788182685, 0.5120173317720018, 0, 0, 0.5994486601071917, 0, 0, 0, 1, 1, 0.958340363816454],
[0.2628327157998814, 0.9670349932452168, 0, 0, 0.2137081198789679, 0, 0, 0, 1, 1, 0.958340363816454],
[0.506599763782954, 0.6084205590771073, 0, 0, 0.4543412827521476, 0, 0, 0, 1, 1, 0.958340363816454],
[0.3112464173450544, 0.9670349932452168, 0, 0, 0.2434881824662774, 0, 0, 0, 1, 1, 0.958340363816454],
[1.623758972775766, 4.476559774203019, 2, 2, 0.266176086877418, 1.231709898779534, 0.4467716507496135, -1.190933633495127, 0.939625050459908, 0.2892893123801037, 0.659094869733673],
[1.254501083139698, 4.069520539806151, 0, 4, 0.2356303508860594, 0, 0.982916773824795, 1.491313039990695, 0.3413608699486877, 1, 0.659094869733673],
[1.169148503650057, 4.493726857221345, 1, 3, 0.2064584560219155, 0.8553233373502348, 0.667597318510592, -0.2848239721779341, 0.8092012285548638, 0.603467605498172, 0.659094869733673],
[2.426885180843555, 2.922636005854426, 0, 1, 0.4536640002245813, 0, 0.3421568741358377, 0.5215514277997358, 0.5463359997754187, 1, 0.6560366934077656],
[1.623096627776094, 4.47847970479913, 1, 0, 0.2660126726778245, 0.6161062643387797, 0, -0.9347763010016081, 1, 0.2660126726778245, 0.659094869733673],
[2.031743605841967, 4.069584637583404, 0, 3, 0.3330002131964167, 0, 0.7371759693346632, 1.118467163357744, 0.296740678453869, 1, 0.659094869733673],
[1.623514185498583, 4.477598476866855, 1, 2, 0.2661013286171865, 0.6159478056503084, 0.4466680097228092, -0.2568367676657865, 0.825255474759323, 0.6047168475934732, 0.659094869733673],
[1.255281759266299, 4.845853804928488, 1, 2, 0.2057455937601295, 0.7966338972251861, 0.4127239657882156, -0.5824805336325872, 0.8904251880098257, 0.4989525012577393, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0.2458381110454634, -0.3729935132779924, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.659094869733673],
[1.255281337741541, 4.846294994833681, 1, 1, 0.2057306619340021, 0.7966341647356643, 0.2063431964141751, -0.8956085010341741, 0.9576748947401974, 0.3691362186082014, 0.659094869733673],
[1.623722979578896, 4.477853352996329, 0, 0, 0.2661153267738583, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.254738748903522, 4.8468375836717, 0, 1, 0.2056417359239934, 0, 0.2063200969161534, 0.313035507315545, 0.7943582640760066, 1, 0.659094869733673],
[1.623004667693402, 4.478571664881822, 1, 0, 0.2659976011491441, 0.6161411731619911, 0, -0.9348292657944088, 1, 0.2659976011491441, 0.659094869733673],
[1.254570288564621, 4.847006044010602, 0, 0, 0.205614126609659, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[1.485971834628712, 4.61560449794651, 0, 1, 0.243539005927923, 0, 0.2166563448936974, 0.3287179962138741, 0.756460994072077, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.4916762220909269, 0, -0.7459870265559848, 1, 0.3333333333333334, 0.659094869733673],
[2.252413981331101, 3.618070908410749, 0, 0, 0.3836844866540742, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[2.033858777525075, 4.067717555050151, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.659094869733673],
[0.998928861385548, 3.480248316355507, 0, 1, 0.2230161526875186, 0, 0.2873358189128278, 0.435955174448459, 0.7769838473124814, 1, 0.659094869733673]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node1002":{
"Global MG94xREV":0.001065838850201716,
"Nucleotide GTR":0.001056480801333997,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1006":{
"Global MG94xREV":0.0005451439801756677,
"Nucleotide GTR":0.0005403576243344808,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1007":{
"Global MG94xREV":0.0009702586763080913,
"Nucleotide GTR":0.0009617398199110852,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "TCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1015":{
"Global MG94xREV":0.001439708601971133,
"Nucleotide GTR":0.001427067982378433,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1016":{
"Global MG94xREV":7.666388121583673e-05,
"Nucleotide GTR":7.599077350666384e-05,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1018":{
"Global MG94xREV":0.00151558164821693,
"Nucleotide GTR":0.001502274864434045,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1019":{
"Global MG94xREV":0.00151560471357386,
"Nucleotide GTR":0.001502297727277495,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node102":{
"Global MG94xREV":0.0008548718921676299,
"Nucleotide GTR":0.000847366129977567,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAG", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1027":{
"Global MG94xREV":0.001039746919519016,
"Nucleotide GTR":0.001030617957405205,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACT", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node103":{
"Global MG94xREV":0.0006599360566242853,
"Nucleotide GTR":0.0006541418281006284,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAG", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1036":{
"Global MG94xREV":0.001516389670974752,
"Nucleotide GTR":0.001503075792764366,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATT", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1057":{
"Global MG94xREV":0.0004313267962244738,
"Nucleotide GTR":0.0004275397535244807,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1058":{
"Global MG94xREV":0.0005749085871373812,
"Nucleotide GTR":0.0005698608985005066,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTT", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1063":{
"Global MG94xREV":0.001515715368683659,
"Nucleotide GTR":0.001502407410837113,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "N", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node107":{
"Global MG94xREV":0.0009460382562068499,
"Nucleotide GTR":0.000937732054729357,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTT", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node108":{
"Global MG94xREV":0.000569351171950375,
"Nucleotide GTR":0.0005643522773341801,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTT", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1080":{
"Global MG94xREV":0.0005180995088449835,
"Nucleotide GTR":0.0005135506030500823,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1081":{
"Global MG94xREV":0.0005264164357553204,
"Nucleotide GTR":0.0005217945074688481,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATT", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1094":{
"Global MG94xREV":0.001082740567467439,
"Nucleotide GTR":0.001073234121779609,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "F", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "TTT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1097":{
"Global MG94xREV":0.0004958315364125061,
"Nucleotide GTR":0.0004914781430763311,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1098":{
"Global MG94xREV":0.0005344982037156589,
"Nucleotide GTR":0.0005298053176296131,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAT", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1110":{
"Global MG94xREV":0.000899209725681878,
"Nucleotide GTR":0.0008913146779890044,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATT", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1111":{
"Global MG94xREV":0.0006168980373694664,
"Nucleotide GTR":0.0006114816819992235,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATT", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1116":{
"Global MG94xREV":0.001032462653421444,
"Nucleotide GTR":0.001023397647053002,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1117":{
"Global MG94xREV":0.0004824588098424,
"Nucleotide GTR":0.0004782228288417895,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node112":{
"Global MG94xREV":0.001041137002781822,
"Nucleotide GTR":0.001031995835758141,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTT", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1126":{
"Global MG94xREV":0.0005756795175173385,
"Nucleotide GTR":0.0005706250601234718,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1127":{
"Global MG94xREV":0.0009394918479509615,
"Nucleotide GTR":0.0009312431238382264,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "C", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "TGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node113":{
"Global MG94xREV":0.000474787992728666,
"Nucleotide GTR":0.0004706193613854563,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTT", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1134":{
"Global MG94xREV":0.0008458212968435896,
"Nucleotide GTR":0.0008383949987425953,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "I", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATT", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1135":{
"Global MG94xREV":0.000669438707215799,
"Nucleotide GTR":0.0006635610455647135,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "I", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATT", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1153":{
"Global MG94xREV":0.000848021361542711,
"Nucleotide GTR":0.000840575746907174,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACT", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1154":{
"Global MG94xREV":0.0006675900021916886,
"Nucleotide GTR":0.0006617285721425515,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACT", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1172":{
"Global MG94xREV":0.001515758135359154,
"Nucleotide GTR":0.00150244980202185,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "F", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TTT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1178":{
"Global MG94xREV":0.0009114043186264813,
"Nucleotide GTR":0.000903402202593327,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAT", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1182":{
"Global MG94xREV":0.001515572067866596,
"Nucleotide GTR":0.001502265368199041,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1190":{
"Global MG94xREV":0.00151678103490649,
"Nucleotide GTR":0.001503463720526742,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1194":{
"Global MG94xREV":0.00151570025043591,
"Nucleotide GTR":0.001502392425327349,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "F", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTT", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node120":{
"Global MG94xREV":0.0002834592177673403,
"Nucleotide GTR":0.0002809704501535776,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1200":{
"Global MG94xREV":0.001515690578441495,
"Nucleotide GTR":0.001502382838252899,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "F", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "TTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1204":{
"Global MG94xREV":0.001515530029010766,
"Nucleotide GTR":0.001502223698443726,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "L", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "CTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1205":{
"Global MG94xREV":0.00025837454723366,
"Nucleotide GTR":0.0002561060226450415,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "L", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "CTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1206":{
"Global MG94xREV":0.001257788375634635,
"Nucleotide GTR":0.001246745012857787,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "I", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node121":{
"Global MG94xREV":0.0007042138971690374,
"Nucleotide GTR":0.0006980309098799298,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1211":{
"Global MG94xREV":0.0008445330887748899,
"Nucleotide GTR":0.0008371181011211123,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "R"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1216":{
"Global MG94xREV":0.00151658182724767,
"Nucleotide GTR":0.001503266261908134,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAA", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node122":{
"Global MG94xREV":0.0005274473008532346,
"Nucleotide GTR":0.0005228163215869071,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1224":{
"Global MG94xREV":0.0004289073972947072,
"Nucleotide GTR":0.00042514159688046,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1225":{
"Global MG94xREV":0.0005529719989236029,
"Nucleotide GTR":0.0005481169131970623,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "I", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "ATA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1235":{
"Global MG94xREV":0.0008095709652960553,
"Nucleotide GTR":0.0008024629445538078,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "I", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ATA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1238":{
"Global MG94xREV":0.0008203533234429241,
"Nucleotide GTR":0.0008131506337604072,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAT", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1239":{
"Global MG94xREV":0.0006951049930524147,
"Nucleotide GTR":0.0006890019818026849,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAT", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1247":{
"Global MG94xREV":0.0009100187429006637,
"Nucleotide GTR":0.0009020287922012756,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCT", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1250":{
"Global MG94xREV":0.001516241529536968,
"Nucleotide GTR":0.001502928952006145,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "H", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CAT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node127":{
"Global MG94xREV":0.001515800151304443,
"Nucleotide GTR":0.00150249144906778,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "Y", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "TAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1270":{
"Global MG94xREV":0.001036506316949743,
"Nucleotide GTR":0.001027405807277124,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "V", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "GTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1277":{
"Global MG94xREV":0.0006562509094048606,
"Nucleotide GTR":0.0006504890364176519,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node131":{
"Global MG94xREV":0.001515160074586713,
"Nucleotide GTR":0.001501856992213879,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "H", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "CAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1343":{
"Global MG94xREV":0.00102529684875433,
"Nucleotide GTR":0.0010162947580417,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTC", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1350":{
"Global MG94xREV":0.000287788004241126,
"Nucleotide GTR":0.0002852612299480684,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1351":{
"Global MG94xREV":0.0007001070346458341,
"Nucleotide GTR":0.0006939601055471154,
"amino-acid": [
["M", "A", "Y", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "TAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1355":{
"Global MG94xREV":0.000844952345467436,
"Nucleotide GTR":0.000837533676746285,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAT", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1356":{
"Global MG94xREV":0.0006704197372624904,
"Nucleotide GTR":0.0006645334621825396,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAT", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1360":{
"Global MG94xREV":0.001031153093884941,
"Nucleotide GTR":0.001022099585429279,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1361":{
"Global MG94xREV":0.0004848131385585838,
"Nucleotide GTR":0.0004805564865877113,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1366":{
"Global MG94xREV":0.0002399905354577892,
"Nucleotide GTR":0.0002378834222124997,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1367":{
"Global MG94xREV":0.0006508789343867787,
"Nucleotide GTR":0.0006451642272583912,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCT", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1373":{
"Global MG94xREV":0.001068969270055915,
"Nucleotide GTR":0.001059583736149564,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACC", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node138":{
"Global MG94xREV":0.0009109426203756976,
"Nucleotide GTR":0.0009029445580461532,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATT", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node147":{
"Global MG94xREV":0.001515208680635073,
"Nucleotide GTR":0.001501905171501876,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACG", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node148":{
"Global MG94xREV":0.001515012699724643,
"Nucleotide GTR":0.001501710911300853,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACT", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node160":{
"Global MG94xREV":0.00151719741654282,
"Nucleotide GTR":0.001503876446338647,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "F", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TTT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node184":{
"Global MG94xREV":0.001515630277472266,
"Nucleotide GTR":0.001502323066725262,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "F", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "TTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node190":{
"Global MG94xREV":0.001068175948962611,
"Nucleotide GTR":0.001058797380403376,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAC", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node222":{
"Global MG94xREV":0.001077890765673406,
"Nucleotide GTR":0.001068426901171445,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "F", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TTT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node235":{
"Global MG94xREV":0.00111644845944518,
"Nucleotide GTR":0.001106646058979294,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "L", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CTT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node290":{
"Global MG94xREV":0.001516039567502229,
"Nucleotide GTR":0.001502728763194996,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCC", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node309":{
"Global MG94xREV":0.001515200120949407,
"Nucleotide GTR":0.00150189668697012,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACG", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node350":{
"Global MG94xREV":0.0002816930345622943,
"Nucleotide GTR":0.0002792197740101654,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node351":{
"Global MG94xREV":0.000842010812084246,
"Nucleotide GTR":0.000834617969981389,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node352":{
"Global MG94xREV":0.0003914753338079605,
"Nucleotide GTR":0.0003880381863408846,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node369":{
"Global MG94xREV":0.001068200204410063,
"Nucleotide GTR":0.001058821422888369,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node375":{
"Global MG94xREV":0.0008473542345711331,
"Nucleotide GTR":0.0008399144773002426,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAT", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node376":{
"Global MG94xREV":0.0006680176861939553,
"Nucleotide GTR":0.0006621525010857938,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAT", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node380":{
"Global MG94xREV":0.000428895286507659,
"Nucleotide GTR":0.0004251295924259383,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node381":{
"Global MG94xREV":0.0005825738829279887,
"Nucleotide GTR":0.0005774588931108456,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node382":{
"Global MG94xREV":0.0005036134885229616,
"Nucleotide GTR":0.0004991917697658075,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node390":{
"Global MG94xREV":0.0003451387691118341,
"Nucleotide GTR":0.0003421084559768964,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node391":{
"Global MG94xREV":0.001169955678535547,
"Nucleotide GTR":0.001159683485501179,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "S", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "TCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node395":{
"Global MG94xREV":0.001515076096289841,
"Nucleotide GTR":0.001501773751245177,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "P", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "CCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node400":{
"Global MG94xREV":0.0007415690553575407,
"Nucleotide GTR":0.0007350580903486087,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node401":{
"Global MG94xREV":0.0007737959775985127,
"Nucleotide GTR":0.000767002060703251,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTT", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node408":{
"Global MG94xREV":0.000724587247124765,
"Nucleotide GTR":0.0007182253821334148,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node412":{
"Global MG94xREV":0.0009116756401265553,
"Nucleotide GTR":0.0009036711418947644,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "R", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AGG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node418":{
"Global MG94xREV":0.0009056136078192588,
"Nucleotide GTR":0.0008976623341387769,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "F", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node419":{
"Global MG94xREV":0.0006096669630040447,
"Nucleotide GTR":0.0006043140963565717,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "F", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node423":{
"Global MG94xREV":0.0009033795839753362,
"Nucleotide GTR":0.0008954479249901718,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "F", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "TTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node427":{
"Global MG94xREV":0.0002723084159311404,
"Nucleotide GTR":0.0002699175521876274,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node428":{
"Global MG94xREV":0.0009742848050168759,
"Nucleotide GTR":0.0009657305992711388,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node429":{
"Global MG94xREV":0.000268628994169342,
"Nucleotide GTR":0.0002662704356928451,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node439":{
"Global MG94xREV":0.001059301660857989,
"Nucleotide GTR":0.001050001008413121,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node444":{
"Global MG94xREV":0.000861258469780007,
"Nucleotide GTR":0.0008536966335358007,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "C", "Y", "R", "I", "G", "L", "C", "L", "I", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "CTG", "TGT", "TTA", "ATT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node445":{
"Global MG94xREV":0.000654021464990466,
"Nucleotide GTR":0.0006482791664912514,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "C", "Y", "R", "I", "G", "L", "C", "L", "I", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "CTG", "TGT", "TTA", "ATT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node448":{
"Global MG94xREV":0.001521346397734895,
"Nucleotide GTR":0.001507988999539064,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "CTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node457":{
"Global MG94xREV":0.0008979750545913029,
"Nucleotide GTR":0.0008900908472917964,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "T", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ACT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node458":{
"Global MG94xREV":0.0006177997485408998,
"Nucleotide GTR":0.0006123754761603086,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "T", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ACT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node467":{
"Global MG94xREV":0.001515717715872286,
"Nucleotide GTR":0.001502409737417461,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node472":{
"Global MG94xREV":0.001516470337057678,
"Nucleotide GTR":0.001503155750600309,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "V", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GTT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node488":{
"Global MG94xREV":0.001077890107042091,
"Nucleotide GTR":0.001068426248322904,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "L", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "TTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node511":{
"Global MG94xREV":0.001077890774338653,
"Nucleotide GTR":0.001068426909760612,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "I", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "ATT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node519":{
"Global MG94xREV":0.001515633221866865,
"Nucleotide GTR":0.00150232598526812,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "TTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node539":{
"Global MG94xREV":0.001515151052468784,
"Nucleotide GTR":0.001501848049310006,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGG", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node552":{
"Global MG94xREV":0.001048004310557855,
"Nucleotide GTR":0.001038802848676516,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "S", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "TCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node553":{
"Global MG94xREV":0.0004682910786150051,
"Nucleotide GTR":0.0004641794900787395,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "S", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "TCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node559":{
"Global MG94xREV":0.001077890499251819,
"Nucleotide GTR":0.001068426637089036,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "V", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GTT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node587":{
"Global MG94xREV":0.001515630223182088,
"Nucleotide GTR":0.001502323012911751,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "V", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node592":{
"Global MG94xREV":0.0008454974578934971,
"Nucleotide GTR":0.0008380740030935498,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "S", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "TCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node593":{
"Global MG94xREV":0.000669976088375498,
"Nucleotide GTR":0.0006640937085260167,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "S", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "TCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node597":{
"Global MG94xREV":0.001052655076591284,
"Nucleotide GTR":0.001043412781055023,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "C", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "TGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node602":{
"Global MG94xREV":0.0004404005013423911,
"Nucleotide GTR":0.0004365337916496919,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node607":{
"Global MG94xREV":0.001075286080338808,
"Nucleotide GTR":0.001065845084934405,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAG", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node610":{
"Global MG94xREV":0.001068162357145735,
"Nucleotide GTR":0.001058783907922444,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "CTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node614":{
"Global MG94xREV":0.0007347132408409357,
"Nucleotide GTR":0.0007282624697790176,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node620":{
"Global MG94xREV":0.001065750170012376,
"Nucleotide GTR":0.001056392899755368,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTG", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node623":{
"Global MG94xREV":0.001068175989851839,
"Nucleotide GTR":0.001058797420933594,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAC", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node626":{
"Global MG94xREV":0.001052745659546899,
"Nucleotide GTR":0.001043502568693668,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTT", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node629":{
"Global MG94xREV":0.001052758697908106,
"Nucleotide GTR":0.001043515492578262,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "TTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node632":{
"Global MG94xREV":0.0010527656497774,
"Nucleotide GTR":0.001043522383410249,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node638":{
"Global MG94xREV":0.001052765579047923,
"Nucleotide GTR":0.001043522313301775,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAT", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node641":{
"Global MG94xREV":0.001065763984987132,
"Nucleotide GTR":0.001056406593434857,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAG", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node647":{
"Global MG94xREV":0.00105275916606269,
"Nucleotide GTR":0.001043515956622454,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGT", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node650":{
"Global MG94xREV":0.001052758689516112,
"Nucleotide GTR":0.00104351548425995,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "Y", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "TAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node653":{
"Global MG94xREV":0.001068189233740028,
"Nucleotide GTR":0.001058810548540649,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "P", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CCT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node656":{
"Global MG94xREV":0.001068189284343507,
"Nucleotide GTR":0.001058810598699829,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGC", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node659":{
"Global MG94xREV":0.001052745660820517,
"Nucleotide GTR":0.001043502569956104,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "TTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node668":{
"Global MG94xREV":0.0007371848997293941,
"Nucleotide GTR":0.0007307124275400876,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node682":{
"Global MG94xREV":0.0007173352147703404,
"Nucleotide GTR":0.0007110370225125837,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node683":{
"Global MG94xREV":0.0007982143994897315,
"Nucleotide GTR":0.0007912060892222576,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node693":{
"Global MG94xREV":0.003810069905394103,
"Nucleotide GTR":0.003776617549667575,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "L", "S", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "TTA", "TCA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node694":{
"Global MG94xREV":0.003058176325907464,
"Nucleotide GTR":0.003031325584354438,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "K", "L", "-", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "AAA", "TTA", "---", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node699":{
"Global MG94xREV":0.001515636763494375,
"Nucleotide GTR":0.001502329495800195,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "TTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node70":{
"Global MG94xREV":0.001515906897584408,
"Nucleotide GTR":0.001502597258117034,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTA", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node720":{
"Global MG94xREV":0.0007204606083330259,
"Nucleotide GTR":0.0007141349751674014,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node721":{
"Global MG94xREV":0.0007949719113904581,
"Nucleotide GTR":0.0007879920701190986,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node730":{
"Global MG94xREV":0.0004248978707483647,
"Nucleotide GTR":0.0004211672739161136,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node731":{
"Global MG94xREV":0.0005626708184243312,
"Nucleotide GTR":0.0005577305772103263,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "F", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "TTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node736":{
"Global MG94xREV":0.000423243699848234,
"Nucleotide GTR":0.0004195276266112863,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node737":{
"Global MG94xREV":0.0006340119371810235,
"Nucleotide GTR":0.0006284453220311497,
"amino-acid": [
["K", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AAG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node74":{
"Global MG94xREV":0.0005709759030316673,
"Nucleotide GTR":0.0005659627433013302,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node742":{
"Global MG94xREV":0.001515353490836487,
"Nucleotide GTR":0.001502048710271927,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAC", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node755":{
"Global MG94xREV":0.001515326576829687,
"Nucleotide GTR":0.001502022032569698,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node760":{
"Global MG94xREV":0.00151531794139607,
"Nucleotide GTR":0.001502013472955056,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGC", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node764":{
"Global MG94xREV":0.000850569814299761,
"Nucleotide GTR":0.0008431018242878394,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTT", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node765":{
"Global MG94xREV":0.0006654799839257431,
"Nucleotide GTR":0.0006596370798048363,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTT", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node769":{
"Global MG94xREV":0.0009516938391787669,
"Nucleotide GTR":0.0009433379817689377,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "S", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "TCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node770":{
"Global MG94xREV":0.0005645090242261034,
"Nucleotide GTR":0.0005595526435931624,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "S", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "TCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node774":{
"Global MG94xREV":0.0009827830398809641,
"Nucleotide GTR":0.0009741542197625851,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node775":{
"Global MG94xREV":0.0005327102398749217,
"Nucleotide GTR":0.0005280330520841592,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node78":{
"Global MG94xREV":0.001521034273548409,
"Nucleotide GTR":0.001507679615798182,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node780":{
"Global MG94xREV":0.001515722373001545,
"Nucleotide GTR":0.001502414353657197,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCT", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node789":{
"Global MG94xREV":0.0002400031645539325,
"Nucleotide GTR":0.0002378959404253714,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node79":{
"Global MG94xREV":0.001515558296632216,
"Nucleotide GTR":0.001502251717875889,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node798":{
"Global MG94xREV":0.001515913165943489,
"Nucleotide GTR":0.001502603471440015,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCA", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node811":{
"Global MG94xREV":0.001515721273525982,
"Nucleotide GTR":0.00150241326383501,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACT", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node814":{
"Global MG94xREV":0.0009139988659133845,
"Nucleotide GTR":0.0009059739697945777,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCT", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node823":{
"Global MG94xREV":0.0005714864964806807,
"Nucleotide GTR":0.0005664688537476389,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node824":{
"Global MG94xREV":0.0009439449718016231,
"Nucleotide GTR":0.0009356571493293188,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node833":{
"Global MG94xREV":0.00107015032436891,
"Nucleotide GTR":0.001060754420823685,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node84":{
"Global MG94xREV":0.0009525478187249362,
"Nucleotide GTR":0.0009441844633877002,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node842":{
"Global MG94xREV":0.00151555605168233,
"Nucleotide GTR":0.001502249492636629,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node847":{
"Global MG94xREV":0.001515903121179981,
"Nucleotide GTR":0.001502593514869377,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACT", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node85":{
"Global MG94xREV":0.0005628237943134685,
"Nucleotide GTR":0.0005578822099734868,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node853":{
"Global MG94xREV":0.001515956729791965,
"Nucleotide GTR":0.001502646652798566,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACA", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node856":{
"Global MG94xREV":0.0009514518967799466,
"Nucleotide GTR":0.0009430981636206931,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "V", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GTT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node857":{
"Global MG94xREV":0.0005639289467474959,
"Nucleotide GTR":0.0005589776591859801,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "V", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GTT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node864":{
"Global MG94xREV":0.0007299385887061795,
"Nucleotide GTR":0.0007235297390172672,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node865":{
"Global MG94xREV":0.0007857437105141103,
"Nucleotide GTR":0.0007788448927058619,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "F", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "TTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node877":{
"Global MG94xREV":0.001515732507305834,
"Nucleotide GTR":0.001502424398982448,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "S", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "TCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node891":{
"Global MG94xREV":0.0003681265103567402,
"Nucleotide GTR":0.000364894365203869,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node892":{
"Global MG94xREV":0.0006531801083462115,
"Nucleotide GTR":0.0006474451969455156,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "F", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TTC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node893":{
"Global MG94xREV":0.0004939526415937901,
"Nucleotide GTR":0.0004896157449255005,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "F", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TTC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node902":{
"Global MG94xREV":0.001515568355912013,
"Nucleotide GTR":0.001502261688835362,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTT", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node908":{
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "C", "Y", "R", "I", "G", "L", "C", "L", "I", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "CTG", "TGT", "TTA", "ATT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node909":{
"Global MG94xREV":0.001515628991804572,
"Nucleotide GTR":0.001502321792345712,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "TTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node920":{
"Global MG94xREV":0.001521035179400713,
"Nucleotide GTR":0.001507680513697116,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node93":{
"Global MG94xREV":0.0001155240381906331,
"Nucleotide GTR":0.0001145097388952193,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node931":{
"Global MG94xREV":0.00151602497858986,
"Nucleotide GTR":0.001502714302373055,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATT", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node94":{
"Global MG94xREV":0.0006187356190197373,
"Nucleotide GTR":0.000613303129710599,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node944":{
"Global MG94xREV":0.001516929177926929,
"Nucleotide GTR":0.00150361056285372,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATA", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node95":{
"Global MG94xREV":0.0007803734118495476,
"Nucleotide GTR":0.0007735217451817631,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node950":{
"Global MG94xREV":0.001515858380589312,
"Nucleotide GTR":0.001502549167100415,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "K", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "AAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node954":{
"Global MG94xREV":0.0009004007718027385,
"Nucleotide GTR":0.0008924952667430688,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGT", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node960":{
"Global MG94xREV":0.0004056135318450605,
"Nucleotide GTR":0.0004020522512146012,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node961":{
"Global MG94xREV":0.0006314141934273951,
"Nucleotide GTR":0.0006258703864281033,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "I", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ATT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node962":{
"Global MG94xREV":0.0004782959040813515,
"Nucleotide GTR":0.0004740964733299055,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "I", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ATT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node968":{
"Global MG94xREV":0.001515799005111741,
"Nucleotide GTR":0.001502490312938631,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "S", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "AGT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node969":{
"Global MG94xREV":9.888436235107327e-06,
"Nucleotide GTR":9.801615915604105e-06,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "S", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "AGT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node974":{
"Global MG94xREV":0.0004781710135994847,
"Nucleotide GTR":0.0004739726793845671,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node975":{
"Global MG94xREV":0.0005464837519634424,
"Nucleotide GTR":0.0005416856329463688,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "C", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "TGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node986":{
"Global MG94xREV":0.001515952295602783,
"Nucleotide GTR":0.001502642257541496,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "N", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AAT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node996":{
"Global MG94xREV":0.001521031778193811,
"Nucleotide GTR":0.001507677142352759,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCY", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003043492287028143,
"Nucleotide GTR":0.003016770471112775,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "A", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GCT", "GGT", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515972931164398,
"Nucleotide GTR":0.001502662711923196,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCT", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516163903867344,
"Nucleotide GTR":0.00150285200788872,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "T", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ACT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515785952379796,
"Nucleotide GTR":0.001502477374809474,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "P", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "CCC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151593739598237,
"Nucleotide GTR":0.001502627488739524,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "H", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "CAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004382527597517138,
"Nucleotide GTR":0.0004344049071974617,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "V", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GTT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003034239053228589,
"Nucleotide GTR":0.003007598480565015,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACT", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.007662360614586806,
"Nucleotide GTR":0.007595085205119592,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "RGW", "P", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "IV", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "YC", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "V", "H", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTR", "KAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "NGG", "CCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "RTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TRT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GTG", "CAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004584416305087749,
"Nucleotide GTR":0.004544165199768344,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "PL", "T", "RS", "P", "M", "LV", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CYG", "ACT", "AGW", "CCC", "ATG", "STA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1.5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["KRM", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ADG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417938_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "TA", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "RCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418703_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "LF", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "YTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418703_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "GC", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "YF", "S", "RC", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "KGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TWC", "AGT", "YGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAR", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "RC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "YGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "ED", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAK", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCR", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420198_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004478343475079721,
"Nucleotide GTR":0.0004439023687591873,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "CTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420198_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "GC", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "KGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAW", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420758_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151571650320649,
"Nucleotide GTR":0.001502408535398854,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "I", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "ATC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420758_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCK", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421787_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516389886547374,
"Nucleotide GTR":0.001503076006444263,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "V", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GTG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421787_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "NK", "PL", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAS", "CYC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421892_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "SL", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TYA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421917_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTR", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "HP", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TS", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CMC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "WCG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516081772451556,
"Nucleotide GTR":0.001502770597585512,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTC", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACT", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0015165904545392,
"Nucleotide GTR":0.001503274813452176,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "H", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "CAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423067_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "SF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TYC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423067_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423216_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "AS", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "KCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423216_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423378_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "AV", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GYT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423378_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423427_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516389848462242,
"Nucleotide GTR":0.001503075968693519,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "V", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GTT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423427_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423445_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "GV", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GKC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423445_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423528_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515717969156613,
"Nucleotide GTR":0.001502409988477954,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "F", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTT", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423528_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTR", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423549_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423653_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "AV", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GYT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423653_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423718_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516527689128674,
"Nucleotide GTR":0.001503212599120997,
"amino-acid": [
["M", "A", "DG", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GRT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGT", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423718_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423815_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "DEAGV", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GNS", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 6.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423815_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423856_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "RC", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "YGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423856_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424156_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "NS", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "ARC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424156_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515225310421875,
"Nucleotide GTR":0.001501921655279404,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "A", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "GCG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515982256604524,
"Nucleotide GTR":0.001502671955486099,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "R", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AGG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425380_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515866155655149,
"Nucleotide GTR":0.001502556873901294,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425380_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516908380186896,
"Nucleotide GTR":0.001503589947717526,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "M", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "ATG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001519321953102002,
"Nucleotide GTR":0.001505982329499209,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTA", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516422181932226,
"Nucleotide GTR":0.001503108018276127,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00151577987671168,
"Nucleotide GTR":0.001502471352485634,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATT", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516081767183632,
"Nucleotide GTR":0.001502770592363839,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "S", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TCA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151584742191857,
"Nucleotide GTR":0.001502538304646635,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGG", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001519012201035762,
"Nucleotide GTR":0.00150567529705139,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGA", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515907767635915,
"Nucleotide GTR":0.001502598120529501,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "N", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001517427212178581,
"Nucleotide GTR":0.001504104224372228,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGT", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515982278271999,
"Nucleotide GTR":0.001502671976963337,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTG", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "LF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "LF", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "YTT", "CTR", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTW", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "NT", "R", "P", "LF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "AMC", "AGA", "CCG", "YTT", "CTR", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "LF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "YTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516726876270381,
"Nucleotide GTR":0.001503410037402633,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "TTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACR", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "S", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "TCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515871747696534,
"Nucleotide GTR":0.001502562416844639,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "Y", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516389929319057,
"Nucleotide GTR":0.00150307604884041,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "Y", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "TAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516780152174781,
"Nucleotide GTR":0.001503462845545406,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "L", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "TTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515982267018753,
"Nucleotide GTR":0.001502671965808891,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "S", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AGT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429065_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "NTSIYCF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "WNC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 10, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429065_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGR", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "TISF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "WYC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "IL", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "MTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151654673669261,
"Nucleotide GTR":0.001503231479447613,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTA", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006127630547182558,
"Nucleotide GTR":0.0006073830044326979,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "F", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "TTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516163009430918,
"Nucleotide GTR":0.001502851121305432,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "A", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "GCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001516319119833237,
"Nucleotide GTR":0.001503005861060797,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429814_Nova_Scotia_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516357243882754,
"Nucleotide GTR":0.001503043650381739,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "V", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GTC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429814_Nova_Scotia_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516714491504546,
"Nucleotide GTR":0.001503397761374856,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAT", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "TI", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "RGW", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "RC", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AYT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "NGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "YGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "TP", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "MCC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006148601483485283,
"Nucleotide GTR":0.0006094616856128442,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGT", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTY", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTR", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "DA", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GMT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAY", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "AS", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "MI", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "IM", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "LF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "KCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATK", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATN", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "YTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "DY", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "YS", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "PL", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "KAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACY", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TMC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CYA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTK", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "HY", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "YF", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "YAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TWC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AS", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "NTSI", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "QHPRL", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "TS", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "KCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ANT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTS", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CNN", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AST", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "NHDY", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAR", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAN", "NAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "DY", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "KAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "ND", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "GV", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "TPAS", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGR", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "RAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GKC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "NCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "YF", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TWC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTR", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATM", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433051_England_20200404_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00151501035830367,
"Nucleotide GTR":0.00150170859043752,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACT", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433051_England_20200404_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516389904178993,
"Nucleotide GTR":0.001503076023921075,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCT", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001516518757321307,
"Nucleotide GTR":0.001503203745734763,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "Q", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "CAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433666_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516898546220039,
"Nucleotide GTR":0.001503580200092747,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGC", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433666_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433845_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515640357280576,
"Nucleotide GTR":0.001502333058033009,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "L", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "TTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433845_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433949_England_20200412_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515917993062102,
"Nucleotide GTR":0.001502608256176601,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "H", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CAC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433949_England_20200412_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003052282085879654,
"Nucleotide GTR":0.003025483095664278,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "QHPRL", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "F", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "M", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTC", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CNN", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TTT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ATG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515715941279427,
"Nucleotide GTR":0.0015024079784055,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "L", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CTT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001518183835409532,
"Nucleotide GTR":0.001504854204462738,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCT", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516081839645427,
"Nucleotide GTR":0.001502770664189421,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "L", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "CTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "S", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "TCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "V", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GTT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516387415771442,
"Nucleotide GTR":0.001503073557361705,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTT", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001516418810382413,
"Nucleotide GTR":0.00150310467632847,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515848588423936,
"Nucleotide GTR":0.0015025394609101,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGC", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "CW", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TG-", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003044390480540695,
"Nucleotide GTR":0.003017660778499967,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "I", "A", "Y", "A", "N", "R", "K", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "ATT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAA", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001519012171109771,
"Nucleotide GTR":0.001505675267388148,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "K", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAA", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515936980267391,
"Nucleotide GTR":0.001502627076674518,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "L", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "CTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATT", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0015160817286,
"Nucleotide GTR":0.00150277055411897,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACC", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000484812249529888,
"Nucleotide GTR":0.0004805556053646744,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAT", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516908384565119,
"Nucleotide GTR":0.001503589952057308,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "D", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GAC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "CF", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "VF", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "QH", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TKT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "KTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAN", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "KQE", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "H", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCY", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "NAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CAT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "S", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "TCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TPAS", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "IV", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "NCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "RTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TPAS", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "AV", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "NCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GYT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TPAS", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "NCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCY", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "DY", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "RM", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "KAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AKG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "RM", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AKG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TA", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "RCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "IL", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "MTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001516267504237056,
"Nucleotide GTR":0.001502954698648764,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "V", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "GTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "NIYF", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "WWC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516422093693641,
"Nucleotide GTR":0.001503107930812275,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "TTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001521670725972025,
"Nucleotide GTR":0.001508310480179213,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATC", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACT", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516799208538271,
"Nucleotide GTR":0.001503481734594313,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCA", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515908696759967,
"Nucleotide GTR":0.001502599041495857,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "D", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GAC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001517426160322132,
"Nucleotide GTR":0.001504103181751064,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "L", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CTT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0004500372926558725,
"Nucleotide GTR":0.000446085972082249,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515944383519778,
"Nucleotide GTR":0.001502634414926462,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACY", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001517054336343183,
"Nucleotide GTR":0.001503734622380986,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "D", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GAT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001517103989025389,
"Nucleotide GTR":0.001503783839113398,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACA", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515982636001603,
"Nucleotide GTR":0.00150267233155208,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAG", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "LF", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTK", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0004708545725474313,
"Nucleotide GTR":0.0004667204765734906,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATT", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438435_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "LF", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "YTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438435_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438511_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACY", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438511_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438652_England_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515982242540563,
"Nucleotide GTR":0.00150267194154562,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "G", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GGG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438652_England_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "LF", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "YTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "WC", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGK", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439409_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516169378196151,
"Nucleotide GTR":0.001502857434153003,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTG", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439409_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439458_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "QPRL", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "HY", "GC", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CNA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "YAT", "KGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439458_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440052_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515324232273929,
"Nucleotide GTR":0.001502019708599103,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "H", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "CAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440052_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440230_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "PR", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CSC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCK", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440230_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440436_England_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAY", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440436_England_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440816_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGR", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440816_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441046_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACG", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441046_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441103_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "IV", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "RTC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441103_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441198_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACK", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441198_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441250_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000438253579012257,
"Nucleotide GTR":0.0004344057192649101,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "L", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "TTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441250_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441307_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516508557442072,
"Nucleotide GTR":0.001503193635410312,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "T", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441307_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441573_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004012502809486481,
"Nucleotide GTR":0.0003977273095945897,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "L", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CTT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441573_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442012_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0004405156021931573,
"Nucleotide GTR":0.0004366478819167413,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAG", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442012_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442065_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "AV", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "RC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GYT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "YGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442065_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442072_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "PL", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CYA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442072_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442621_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTY", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442621_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442782_England_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001516727163434296,
"Nucleotide GTR":0.001503410322045254,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442782_England_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442846_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001518564444405771,
"Nucleotide GTR":0.001505231471717789,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "N", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "AAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442846_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443107_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "SF", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TYT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443107_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTK", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443318_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAY", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443318_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443337_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "RC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "YGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443337_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443381_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "RI", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AKA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443381_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443629_England_20200417_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001515861933233248,
"Nucleotide GTR":0.001502552688552191,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "A", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "GCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443629_England_20200417_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443673_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515557871604108,
"Nucleotide GTR":0.001502251296579522,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443673_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443713_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAR", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443713_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443744_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001518183823950177,
"Nucleotide GTR":0.001504854193103997,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "H", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAT", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443744_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443823_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "KN", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAW", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443823_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444084_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516260941746375,
"Nucleotide GTR":0.001502948193776649,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444084_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516081772082751,
"Nucleotide GTR":0.001502770597219944,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTC", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151641865711277,
"Nucleotide GTR":0.001503104524404532,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151772558441748,
"Nucleotide GTR":0.001504399976907417,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "N", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "AAT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0004784973082916741,
"Nucleotide GTR":0.0004742961092143298,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "V", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "GTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003794618645566274,
"Nucleotide GTR":0.003761301951665645,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "F", "S", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "TTT", "TCA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445096_California_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151599072617917,
"Nucleotide GTR":0.001502680350698011,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "N", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AAT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445096_California_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445178_California_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "TI", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGR", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "AYT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445178_California_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006043667902414129,
"Nucleotide GTR":0.0005990604590300528,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATT", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001522128643565083,
"Nucleotide GTR":0.00150876437726278,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTT", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCY", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515270281254709,
"Nucleotide GTR":0.001501966231269009,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "A", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "GCC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516081774357821,
"Nucleotide GTR":0.001502770599475038,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTC", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515908200062718,
"Nucleotide GTR":0.001502598549159601,
"amino-acid": [
["M", "T", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "ACA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "HY", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "YAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "VL", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "KTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCC", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516245934301227,
"Nucleotide GTR":0.001502933318096643,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "F", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTT", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515905967400768,
"Nucleotide GTR":0.00150259633610039,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "T", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "ACT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "S", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "TCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "MI", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATK", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0015158596772689,
"Nucleotide GTR":0.001502550452395173,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCG", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516698840421521,
"Nucleotide GTR":0.001503382247708099,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTY", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "HR", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CRT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATY", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "S", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "AGT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516471713059403,
"Nucleotide GTR":0.001503157114520762,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "V", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GTA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516081778852601,
"Nucleotide GTR":0.001502770603930354,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "T", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ACA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "ML", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "MTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447679_France_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "V", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447679_France_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515982249598181,
"Nucleotide GTR":0.001502671948541273,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "GV", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GKT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGY", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448539_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001518034876484473,
"Nucleotide GTR":0.001504706553394773,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "K", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "AAA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448539_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448615_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "ED", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAW", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448615_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448657_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516590438137774,
"Nucleotide GTR":0.001503274797194754,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "CGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448657_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448684_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515717425428894,
"Nucleotide GTR":0.001502409449524157,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "S", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "TCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448684_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448896_England_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "C", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "TGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448896_England_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448978_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGW", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448978_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449004_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAY", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449004_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449030_England_20200419_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAY", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449030_England_20200419_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516389864683619,
"Nucleotide GTR":0.001503075984772471,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTC", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449684_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151659895213575,
"Nucleotide GTR":0.001503283236439957,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCA", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449684_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCM", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "F", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "TTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001611282728456286,
"Nucleotide GTR":0.001597135690646815,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CT-", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003037605550989292,
"Nucleotide GTR":0.00301093542052667,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCA", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACT", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515982238070518,
"Nucleotide GTR":0.001502671937114823,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "S", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AGC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516081725062464,
"Nucleotide GTR":0.001502770550612496,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGC", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450495_GP_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516908365417677,
"Nucleotide GTR":0.001503589933077981,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "I", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "ATT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450495_GP_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001517416468463786,
"Nucleotide GTR":0.001504093574987085,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "I", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "ATC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516389879714861,
"Nucleotide GTR":0.001503075999671738,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "F", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "TTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00151608172008807,
"Nucleotide GTR":0.001502770545681774,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "T", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ACT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003040166253118067,
"Nucleotide GTR":0.003013473639729765,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "K", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACT", "AAA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516273825998672,
"Nucleotide GTR":0.00150296096490541,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "C", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "TGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515837490532333,
"Nucleotide GTR":0.001502528460457818,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "V", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTT", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "GTG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TM", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTY", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "AYG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "LVF", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "BTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "TR", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "TM", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "HY", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ASA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "AYG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTY", "GCT", "GCA", "YAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "LF", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "YTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AV", "D", "SF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "LF", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GYA", "GAT", "TYC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "YTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "RI", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AKA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCY", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "GC", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "KGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "GC", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "KGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATY", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTY", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "DG", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "GV", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GRT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTT", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GKT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "RI", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AKA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTK", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "MV", "RW", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TWG", "RTG", "WGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "PA", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "AV", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTY", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "SCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GYT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0007805581166798777,
"Nucleotide GTR":0.000773704828306497,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "P", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CCA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTK", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTK", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "VL", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "KTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516081716467664,
"Nucleotide GTR":0.001502770542093156,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCC", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004483210522730162,
"Nucleotide GTR":0.0004443848002638081,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "ED", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "NK", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAW", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATY", "AAS", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "SC", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TST", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGR", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTY", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAY", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "TI", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATY", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "AYT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "HY", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "MV", "RW", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "YAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TWG", "RTG", "WGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCR", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "GV", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GKG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "TI", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "AYC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCY", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "SI", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AKT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003033486585056831,
"Nucleotide GTR":0.003006852619052349,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "C", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "P", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "TGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "CCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516963372196169,
"Nucleotide GTR":0.001503644456897797,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "I", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "ATC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "PS", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "YCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAY", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTY", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "LF", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "YTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452002_Denmark_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516356785701152,
"Nucleotide GTR":0.001503043196222966,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "TTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452002_Denmark_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452076_Denmark_20200428_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001516389860146011,
"Nucleotide GTR":0.001503075980274704,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAT", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452076_Denmark_20200428_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452115_Texas_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515933773008391,
"Nucleotide GTR":0.001502623897575204,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "S", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "TCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452115_Texas_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452145_Connecticut_20200512_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATA", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452145_Connecticut_20200512_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452182_Veneto_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAY", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452182_Veneto_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452240_Stockholm_20200424_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAG", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452240_Stockholm_20200424_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452299_Michigan_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "AS", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "KCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452299_Michigan_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452334_Beijing_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516389909222389,
"Nucleotide GTR":0.001503076028920189,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "L", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TTA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452334_Beijing_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452371_Andalusia_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "CF", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TM", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TKT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "AYG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452371_Andalusia_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452407_Andalusia_20200315_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "N", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AAT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452407_Andalusia_20200315_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452438_Andalusia_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "LF", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "YTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452438_Andalusia_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452607_Andalusia_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "LV", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACW", "STT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452607_Andalusia_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452832_Virginia_20200422_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001516389854063329,
"Nucleotide GTR":0.001503075974245427,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "F", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "TTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452832_Virginia_20200422_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452954_England_20200512_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516780651899343,
"Nucleotide GTR":0.001503463340882394,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "F", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "TTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACT", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452954_England_20200512_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453047_Scotland_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515907192576043,
"Nucleotide GTR":0.001502597550518647,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "N", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AAC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453047_Scotland_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453286_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "AS", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "KCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453286_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453466_Northern_Ireland_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTY", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453466_Northern_Ireland_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453570_England_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCM", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453570_England_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453618_England_20200505_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0004469832908332781,
"Nucleotide GTR":0.0004430587843491315,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACC", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453618_England_20200505_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454247_Portugal_20200323_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001516780472867668,
"Nucleotide GTR":0.001503463163422611,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "F", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "F", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTT", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "TTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454247_Portugal_20200323_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454281_Portugal_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515859665707241,
"Nucleotide GTR":0.001502550440935027,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTG", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454281_Portugal_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454302_Portugal_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515873195945311,
"Nucleotide GTR":0.001502563852377813,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCA", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454302_Portugal_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454312_Portugal_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008592398423210323,
"Nucleotide GTR":0.0008516957295951643,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GG-", "TTC", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454312_Portugal_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454496_Sormland_20200309_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0004382525267438292,
"Nucleotide GTR":0.0004344046762353833,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "I", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "ATT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454496_Sormland_20200309_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454527_Maharashtra_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515869348102252,
"Nucleotide GTR":0.001502560038318759,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTT", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454527_Maharashtra_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454614_California_20200429_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0004634752839278585,
"Nucleotide GTR":0.0004594059779955814,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTT", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454614_California_20200429_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454626_California_20200430_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "IV", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "RTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454626_California_20200430_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454647_Virgin_Islands_20200427_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516081703001482,
"Nucleotide GTR":0.001502770528745205,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTC", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454647_Virgin_Islands_20200427_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454653_California_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAR", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454653_California_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454828_North_Carolina_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0004634623278274865,
"Nucleotide GTR":0.0004593931356495741,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "TTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454828_North_Carolina_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454897_Stockholm_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001516289421425192,
"Nucleotide GTR":0.001502976423404321,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "F", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "TTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454897_Stockholm_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454936_Hubei_20200211_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515638948247997,
"Nucleotide GTR":0.001502331661371713,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "D", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAT", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454936_Hubei_20200211_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455105_Jonkoping_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515224883611481,
"Nucleotide GTR":0.001501921232216397,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "V", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "GTT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455105_Jonkoping_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455205_Netherlands_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515395631880995,
"Nucleotide GTR":0.001502090481318706,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGC", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455205_Netherlands_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["KTRMQPLEAGVSW", "A", "D", "S", "N", "G", "NT", "SI", "T", "V", "EG", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["NNG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AMT", "AKT", "ACC", "GTT", "GRA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTY", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[21.5, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455309_Odisha_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "NT", "SI", "T", "V", "EG", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AMT", "AKT", "ACC", "GTT", "GRA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455309_Odisha_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["-", "A", "D", "S", "N", "G", "NT", "SI", "T", "V", "EG", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["---", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AMT", "AKT", "ACC", "GTT", "GRA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "NT", "SI", "T", "V", "EG", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AMT", "AKT", "ACC", "GTT", "GRA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455395_Hubei_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006706507110172808,
"Nucleotide GTR":0.0006647624079912813,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "R"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455395_Hubei_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0004382525355638589,
"Nucleotide GTR":0.0004344046849779727,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "F", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TTT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455478_Odisha_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516281391513886,
"Nucleotide GTR":0.001502968463995514,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "S", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "TCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455478_Odisha_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455591_Nonthaburi_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516389832391745,
"Nucleotide GTR":0.001503075952764117,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAT", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455591_Nonthaburi_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455638_KZN_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516590463188632,
"Nucleotide GTR":0.001503274822025665,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "L", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455638_KZN_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455917_Bangkok_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516616529391394,
"Nucleotide GTR":0.001503300659367564,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "A", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "GCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455917_Bangkok_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456032_New_York_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001522272449879696,
"Nucleotide GTR":0.001508906920960141,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "E", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "GAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456032_New_York_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456255_Counties_Manukau_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCT", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456255_Counties_Manukau_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456297_Southern_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516762466514218,
"Nucleotide GTR":0.001503445315164673,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAC", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTA", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456297_Southern_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456418_Victoria_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "HY", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "YAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456418_Victoria_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456422_Victoria_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAR", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456422_Victoria_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456437_Victoria_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "SF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "TI", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TYC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "AYC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456437_Victoria_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456438_Victoria_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "IV", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "RTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456438_Victoria_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456444_Victoria_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAY", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456444_Victoria_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456473_Victoria_20200430_null_54":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456473_Victoria_20200430_null_54",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456475_Victoria_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "QHL", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "EAGV", "SC", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "DY", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CWW", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GNA", "WGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "KAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456475_Victoria_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456528_Victoria_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "ED", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "TI", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "YC", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "KE", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "GC", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAW", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "AYT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TRC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGY", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "RAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "KGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456528_Victoria_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456545_Victoria_20200509_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "NI", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AWC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456545_Victoria_20200509_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456546_Victoria_20200502_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "KQE", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "AS", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "VF", "A", "T", "S", "R", "TM", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "NAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "YAA", "TTT", "KCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTN", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "KTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "AYG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456546_Victoria_20200502_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456556_Victoria_20200508_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "VF", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "PA", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "GV", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "VF", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "SI", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "KTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "SCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GKC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "KTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AKC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456556_Victoria_20200508_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456567_Victoria_20200510_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAY", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456567_Victoria_20200510_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456568_Victoria_20200510_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACW", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456568_Victoria_20200510_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456569_Victoria_20200510_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "IF", "L", "RC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "AV", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAY", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "WTC", "CTT", "YGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GYT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456569_Victoria_20200510_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456571_Victoria_20200510_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAY", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456571_Victoria_20200510_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456582_Victoria_20200517_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "WC", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGK", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456582_Victoria_20200517_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456583_Victoria_20200517_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "KE", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "RC", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "RAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "YGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456583_Victoria_20200517_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456609_Timor_Leste_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "PA", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "SCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456609_Timor_Leste_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456623_Victoria_20200101_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001515911273011347,
"Nucleotide GTR":0.001502601595127789,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "I", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "ATT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456623_Victoria_20200101_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456627_Victoria_20200523_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "RC", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "YGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456627_Victoria_20200523_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456655_Victoria_20200526_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001515224846558957,
"Nucleotide GTR":0.001501921195489194,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAG", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456655_Victoria_20200526_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456688_England_20200518_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "F", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "TTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456688_England_20200518_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456995_Scotland_20200521_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "H", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "CAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456995_Scotland_20200521_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457288_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516518809418368,
"Nucleotide GTR":0.001503203797374412,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "S", "G", "I", "A", "I", "A", "I", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "AGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATT", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457288_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457312_England_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515837490471393,
"Nucleotide GTR":0.001502528460397412,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "V", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "GTC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457312_England_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457384_England_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "WL", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TKG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTN", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457384_England_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457474_England_20200508_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001515982216388936,
"Nucleotide GTR":0.001502671915623605,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "R", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CGG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457474_England_20200508_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457519_England_20200507_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "AV", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GYA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457519_England_20200507_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457554_England_20200511_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACY", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457554_England_20200511_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457704_Muscat_20200224_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516389851355243,
"Nucleotide GTR":0.001503075971561116,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCT", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457704_Muscat_20200224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457836_Kenya_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00151608172704185,
"Nucleotide GTR":0.001502770552574503,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "T", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ACA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457836_Kenya_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458042_Tamil_Nadu_20200506_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006039398136473148,
"Nucleotide GTR":0.0005986372312839468,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAT", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458042_Tamil_Nadu_20200506_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458145_Amapa_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151513099641864,
"Nucleotide GTR":0.001501828169351681,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACC", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458145_Amapa_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005275825863721564,
"Nucleotide GTR":0.0005229504193010337,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "F", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "TTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458267_California_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGG", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458267_California_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458314_England_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "AV", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTK", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GYT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458314_England_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458364_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "DY", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "KAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458364_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458476_England_20200429_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAY", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458476_England_20200429_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458498_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "DY", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "KAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458498_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458506_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "EG", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GRA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458506_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458741_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "AS", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "KCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458741_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458747_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "QE", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "HR", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "SAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CRT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458747_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458756_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515726025574394,
"Nucleotide GTR":0.001502417974160511,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "H", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAT", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458756_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458970_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACY", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458970_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459024_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "CW", "VF", "V", "QHPRL", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGN", "KTT", "GTR", "CNN", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 13, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459024_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459045_England_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515990670856299,
"Nucleotide GTR":0.001502680295860874,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "T", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "ACA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459045_England_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459072_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "CW", "VF", "V", "QHPRL", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGN", "KTT", "GTG", "CNN", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 13, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459072_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459173_England_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "QE", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "RW", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "SAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "YGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459173_England_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459208_England_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "KE", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "RAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459208_England_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459241_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "TI", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "AYT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459241_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459311_England_20200502_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "MI", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATK", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459311_England_20200502_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459493_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515990709160038,
"Nucleotide GTR":0.001502680333828306,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "K", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AAG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459493_England_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459573_Scotland_20200325_null_12":{
"Global MG94xREV":0.00151642633199982,
"Nucleotide GTR":0.00150311213190619,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "F", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459573_Scotland_20200325_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459620_Scotland_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0004906832879641346,
"Nucleotide GTR":0.0004863750961709084,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTC", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459620_Scotland_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459878_Ontario_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.02466208854706972,
"Nucleotide GTR":0.02444555578533018,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "V", "Q", "A", "K", "Q", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "Y", "C", "H", "C", "Y", "W", "N", "G", "L", "C", "L", "I", "F", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "GTA", "CAA", "GCA", "AAG", "CAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TAT", "TGT", "CAC", "TGC", "TAC", "TGG", "AAT", "GGT", "CTG", "TGT", "TTA", "ATT", "TTC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459878_Ontario_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460056_Minnesota_20200323_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001515368438272915,
"Nucleotide GTR":0.001502063526470091,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "T", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ACT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460056_Minnesota_20200323_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460272_Massachusetts_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515998818068064,
"Nucleotide GTR":0.001502688371540243,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "S", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "AGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460272_Massachusetts_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460383_Massachusetts_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "S", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "TCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460383_Massachusetts_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460452_Massachusetts_20200319_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001516168809944795,
"Nucleotide GTR":0.001502856870890885,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTG", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460452_Massachusetts_20200319_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460634_Washington_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "P", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "CCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460634_Washington_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460791_Noord_Holland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516058633658308,
"Nucleotide GTR":0.001502747661950515,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "S", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "TCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460791_Noord_Holland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460813_Overijssel_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515982220143534,
"Nucleotide GTR":0.001502671919345235,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "E", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "GAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460813_Overijssel_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460852_Friesland_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515982217373953,
"Nucleotide GTR":0.001502671916599973,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTG", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460852_Friesland_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460855_Friesland_20200501_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001516780087094677,
"Nucleotide GTR":0.001503462781036702,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "V", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GTT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460855_Friesland_20200501_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461087_Netherlands_20200508_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001516375533644676,
"Nucleotide GTR":0.001503061779559829,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAT", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461087_Netherlands_20200508_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461148_Noord_Brabant_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006013306645646155,
"Nucleotide GTR":0.0005960509904904455,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCT", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461148_Noord_Brabant_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461204_Noord_Holland_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516971168091501,
"Nucleotide GTR":0.001503652184345287,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "S", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "AGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461204_Noord_Holland_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461237_Utrecht_20200428_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCA", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461237_Utrecht_20200428_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461240_Utrecht_20200430_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516590863517555,
"Nucleotide GTR":0.001503275218839706,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTC", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461240_Utrecht_20200430_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461267_Zeeland_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516170169311824,
"Nucleotide GTR":0.001502858218322693,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "D", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "GAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461267_Zeeland_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461309_Zuid_Holland_20200507_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "F", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TTT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461309_Zuid_Holland_20200507_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461329_Zuid_Holland_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516319202964555,
"Nucleotide GTR":0.001503005943462223,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461329_Zuid_Holland_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461485_Gujarat_20200527_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516730873830237,
"Nucleotide GTR":0.001503413999863977,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "F", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "TTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461485_Gujarat_20200527_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461567_England_20200525_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001515837485111859,
"Nucleotide GTR":0.001502528455084933,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "CTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTG", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461567_England_20200525_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461722_Scotland_20200506_null_22":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "T", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ACT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461722_Scotland_20200506_null_22",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462228_Vlamertinge_20200402_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001515635172920235,
"Nucleotide GTR":0.001502327919191272,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTT", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462228_Vlamertinge_20200402_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAY", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462317_Singapore_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "HR", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CRT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462317_Singapore_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462341_Singapore_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "IL", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "MTT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462341_Singapore_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462374_Singapore_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAY", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462374_Singapore_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462436_Uzice_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515717838083949,
"Nucleotide GTR":0.001502409858556109,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTT", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462436_Uzice_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462461_Maglaj_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515907565654945,
"Nucleotide GTR":0.001502597920321919,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGA", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462461_Maglaj_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462679_Michigan_20200429_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAR", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462679_Michigan_20200429_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462715_Michigan_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516389854081422,
"Nucleotide GTR":0.001503075974263359,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "L", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CTA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462715_Michigan_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462716_Michigan_20200417_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTY", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462716_Michigan_20200417_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462736_Michigan_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAY", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462736_Michigan_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462888_Minnesota_20200511_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516698475689266,
"Nucleotide GTR":0.001503381886178189,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "I", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAT", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ATA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462888_Minnesota_20200511_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462973_Wyoming_20200329_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462973_Wyoming_20200329_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462984_Wyoming_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "K", "L", "-", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "AAA", "TTA", "---", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462984_Wyoming_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462990_elinac_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0015193215433267,
"Nucleotide GTR":0.001505981923321727,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "T", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "ACA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462990_elinac_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462991_USA_20200511_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515968884799437,
"Nucleotide GTR":0.001502658701085258,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "TCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462991_USA_20200511_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515629040543145,
"Nucleotide GTR":0.001502321840656359,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "CTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463010_Odisha_20200507_null_5":{
"Global MG94xREV":0.000447820831208907,
"Nucleotide GTR":0.0004438889711330214,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAC", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463010_Odisha_20200507_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463017_Odisha_20200509_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516081714717735,
"Nucleotide GTR":0.001502770540358589,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "T", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ACG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463017_Odisha_20200509_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463021_Odisha_20200509_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516081715749206,
"Nucleotide GTR":0.001502770541381007,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCC", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463021_Odisha_20200509_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001516014118777003,
"Nucleotide GTR":0.001502703537909192,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "G", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GGA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463139_Connecticut_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001516356813535743,
"Nucleotide GTR":0.001503043223813168,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "F", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "TTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463139_Connecticut_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463172_Connecticut_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001516962794362314,
"Nucleotide GTR":0.001503643884137314,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "D", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GAT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463172_Connecticut_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463684_Washington_20200505_null_18":{
"Global MG94xREV":0.0006031617356054626,
"Nucleotide GTR":0.0005978659847554491,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "R", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AGG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463684_Washington_20200505_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003041297976473038,
"Nucleotide GTR":0.003014595426570918,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "E", "H", "H", "Q", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GAA", "CAC", "CAT", "CAA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463969_Quebec_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515908926607314,
"Nucleotide GTR":0.001502599269325148,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "S", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "AGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463969_Quebec_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464065_Houthalen_Helchteren_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516389872013439,
"Nucleotide GTR":0.001503075992037934,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCT", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464065_Houthalen_Helchteren_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003033618805151917,
"Nucleotide GTR":0.003006983678257014,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTT", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAC", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464271_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "SF", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TYT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464271_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464336_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "GV", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "WAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GKG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464336_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464350_England_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "NS", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "ART", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464350_England_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464453_England_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "HR", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTT", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CRT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464453_England_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464508_England_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "YTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464508_England_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464561_England_20200304_null_19":{
"Global MG94xREV":0.0004635919474694421,
"Nucleotide GTR":0.0004595216172330475,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "C", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "TGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464561_England_20200304_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464610_England_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "TS", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "ILVF", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "WCG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACN", "NTY", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464610_England_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464625_England_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACY", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464625_England_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464634_England_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "HY", "Y", "KQE", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "YAT", "TAC", "NAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464634_England_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464759_England_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "GV", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "GC", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAY", "GKC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "KGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464759_England_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464932_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003032935261882975,
"Nucleotide GTR":0.003006306136487559,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "CTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "CTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464932_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465108_England_20200314_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTT", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465108_England_20200314_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465165_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "MI", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATK", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465165_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465213_England_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "AV", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GYT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465213_England_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465222_England_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "LF", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "YTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465222_England_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465251_England_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "TI", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AYT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465251_England_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465252_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "LF", "R", "L", "ILVF", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "YTC", "AGA", "CTG", "NTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465252_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465258_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "SR", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "MGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465258_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465261_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "WL", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "AV", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TKG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GYT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465261_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465270_England_20200419_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "I", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465270_England_20200419_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465271_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151666272597562,
"Nucleotide GTR":0.001503346450346484,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "I", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "R", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CGT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465271_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465303_England_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "PS", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "YCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465303_England_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465333_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515691243704074,
"Nucleotide GTR":0.001502383497674484,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "M", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "ATG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465333_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465352_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCY", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465352_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465392_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "RS", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGK", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465392_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465408_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAC", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465408_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465465_England_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["-", "EAGV", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["---", "GNA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAY", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465465_England_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465516_England_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "NS", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "ART", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465516_England_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465529_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "DV", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GWC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465529_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465540_England_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000457329606064666,
"Nucleotide GTR":0.0004533142590904041,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465540_England_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465545_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCW", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465545_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465551_England_20200502_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "N", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "HD", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "SAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465551_England_20200502_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465558_England_20200502_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "N", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465558_England_20200502_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465573_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "AV", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GYA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465573_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465574_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "RI", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AKA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465574_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465578_England_20200502_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "TI", "GC", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "AYC", "KGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465578_England_20200502_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465604_England_20200504_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTK", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465604_England_20200504_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465632_England_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "HPRL", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "ILVF", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CNC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "NTY", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465632_England_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465643_England_20200506_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "NY", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "WAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465643_England_20200506_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465675_England_20200518_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "TI", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "CW", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "AYC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGN", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465675_England_20200518_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465712_England_20200430_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001518253801651061,
"Nucleotide GTR":0.001504923556401735,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "S", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "AGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465712_England_20200430_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465716_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["RM", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AKG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465716_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465719_England_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516969293962859,
"Nucleotide GTR":0.001503650326671465,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "N", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "AAC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465719_England_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465833_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515677326964326,
"Nucleotide GTR":0.001502369703123498,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTC", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465833_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465840_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "HPRL", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "KN", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CNT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAK", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465840_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465850_England_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001516261075787432,
"Nucleotide GTR":0.00150294832664083,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465850_England_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465851_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "-", "ILV", "NI", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "---", "NTA", "AWT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465851_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465882_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "YTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465882_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465894_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "RC", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "EAGV", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "YGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GNG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465894_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465905_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGM", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465905_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465917_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "YTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465917_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465918_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "AV", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACY", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GYT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465918_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465958_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCY", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465958_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465968_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATY", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465968_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465974_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004597556596336306,
"Nucleotide GTR":0.0004557190119459926,
"amino-acid": [
["K", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AAG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465974_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466013_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "VL", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "KTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466013_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466031_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "LV", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "IM", "DAGV", "L", "L", "V", "QHPRL"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "STT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATN", "GNT", "TTG", "CTT", "GTA", "CNN"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 13]
],
"original name":"epi_isl_466031_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 11]
]
},
"epi_isl_466037_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005332785700009487,
"Nucleotide GTR":0.000528596392280338,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "I", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "TR", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "ATA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ASA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466037_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466123_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "LF", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "YTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466123_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466197_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "VF", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "KTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466197_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466202_England_20200402_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCY", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466202_England_20200402_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466240_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "AV", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GYT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466240_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466242_England_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "SF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TYC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466242_England_20200403_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466283_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "GV", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GKA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466283_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466285_England_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AG", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GSA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466285_England_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466288_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "AG", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GSC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466288_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466304_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "KAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466304_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466352_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "RS", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGK", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466352_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466358_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "AV", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GYC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466358_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466368_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "GC", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "KGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466368_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466373_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "AS", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "KCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466373_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466384_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACY", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466384_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466387_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "NHDY", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCN", "NAY", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466387_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466399_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAY", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466399_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466400_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["KM", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AWG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466400_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466411_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "ILVF", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "SI", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "NTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATY", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AKT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466411_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466416_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "RC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "AV", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATT", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "YGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GYT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466416_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466428_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "PS", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "YCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466428_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466477_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001520602766375932,
"Nucleotide GTR":0.001507251897252104,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "Q", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "TPAS", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "CAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTN", "NCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466477_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466515_England_20200414_null_37":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TM", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "AYG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466515_England_20200414_null_37",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466542_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "PL", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CYG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466542_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466544_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AS", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "IL", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "KCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "WTA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466544_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466561_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "RL", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CKG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466561_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466567_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "LF", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "YTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466567_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466607_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "AS", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "KCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466607_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466609_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "NTSIHPRLDAGVYCF", "Y", "K", "L", "AG", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTK", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCN", "NNT", "TAC", "AAA", "TTG", "GSA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 24, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466609_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466672_Nebraska_20200504_null_25":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTT", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466672_Nebraska_20200504_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466848_Telangana_20200513_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "L", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "CTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466848_Telangana_20200513_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466882_Bavaria_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516698842901632,
"Nucleotide GTR":0.001503382250166436,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "V", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GTT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466882_Bavaria_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466925_Bavaria_20200526_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001515905396290414,
"Nucleotide GTR":0.001502595770004377,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACA", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466925_Bavaria_20200526_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466927_Basel_Stadt_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "KN", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAY", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAY", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAM", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466927_Basel_Stadt_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466932_Graub_nden_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAY", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466932_Graub_nden_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466940_Basel_Stadt_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "RS", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "ND", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGK", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "RAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466940_Basel_Stadt_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466946_Basel_Stadt_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGY", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466946_Basel_Stadt_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466961_Vaud_20200311_null_51":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "DG", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GRT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466961_Vaud_20200311_null_51",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466978_Vaud_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "IF", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGR", "WTT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466978_Vaud_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467008_Vaud_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "KN", "D", "L", "P", "KE", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAK", "GAC", "CTG", "CCT", "RAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467008_Vaud_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467156_Basque_Country_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "AS", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "KCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467156_Basque_Country_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467231_Madrid_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001516471749150402,
"Nucleotide GTR":0.001503157150294883,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "C", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "TGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467231_Madrid_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467262_Galicia_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515982254332999,
"Nucleotide GTR":0.001502671953234517,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTG", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467262_Galicia_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467299_Morocco_20200521_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000434344461247856,
"Nucleotide GTR":0.0004305309234949291,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "F", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "TTT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467299_Morocco_20200521_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467421_New_York_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATT", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467421_New_York_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467613_New_Mexico_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAA", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467613_New_Mexico_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467652_New_Mexico_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001515691274912524,
"Nucleotide GTR":0.001502383528608925,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "S", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "TCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467652_New_Mexico_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.01852681464179548,
"Nucleotide GTR":0.01836414949147911,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "Q", "W", "R", "A", "R", "D", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CAG", "TGG", "AGG", "GCT", "AGA", "GAT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2.333333333333333, 1, 1.5, 1.5, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.6666666666666666, 0, 0.5, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467846_Georgia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516418606308879,
"Nucleotide GTR":0.001503104474046697,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467846_Georgia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467961_California_20200319_null_8":{
"Global MG94xREV":0.000463452646220053,
"Nucleotide GTR":0.0004593835390465056,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467961_California_20200319_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AV", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GYA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468114_Oregon_20200506_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006223899828029527,
"Nucleotide GTR":0.000616925408235469,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCT", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468114_Oregon_20200506_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468206_Geneva_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGR", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468206_Geneva_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468228_Basel_Landschaft_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001515715617454423,
"Nucleotide GTR":0.001502407657423673,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCT", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468228_Basel_Landschaft_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468236_Bern_20200420_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468236_Bern_20200420_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468238_Bern_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TRG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468238_Bern_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468239_Bern_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "PL", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CYT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468239_Bern_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468249_Uri_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "KE", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "RAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468249_Uri_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468251_Basel_Landschaft_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "KR", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "ARA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468251_Basel_Landschaft_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468253_Vaud_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "TI", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "WC", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "AYC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGK", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAY", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468253_Vaud_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468257_Bern_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515907571935058,
"Nucleotide GTR":0.001502597926546894,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "I", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "ATT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468257_Bern_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468269_Luzern_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "TI", "L", "A", "CF", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "DY", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGY", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "AYT", "TTA", "GCT", "TKT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "KAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468269_Luzern_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468272_Graubunden_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "RL", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACY", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "KGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CKC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468272_Graubunden_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468277_Ticino_20200428_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "CF", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TKT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468277_Ticino_20200428_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468283_Basel_Landschaft_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TM", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAY", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "AYG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468283_Basel_Landschaft_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468286_Bern_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "EG", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GRA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468286_Bern_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468288_Basel_Landschaft_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "TS", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "ASC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468288_Basel_Landschaft_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468289_Vaud_20200501_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "PS", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "YCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468289_Vaud_20200501_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468290_Basel_Landschaft_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "KR", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "LF", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TM", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "ARG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTM", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "AYG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468290_Basel_Landschaft_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468294_Bern_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "DY", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTY", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "KAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468294_Bern_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468302_Zurich_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "IL", "Q", "F", "A", "Y", "PA", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "IL", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "LF", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "MTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "SCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "MTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "YTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGM", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468302_Zurich_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468304_Zurich_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "RS", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "KE", "T", "N", "I", "LF", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "YF", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGK", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "RAA", "ACT", "AAC", "ATT", "YTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TWC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468304_Zurich_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468348_California_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "YTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468348_California_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468353_California_20200516_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACT", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468353_California_20200516_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468365_California_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTK", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468365_California_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468371_California_20200412_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTY", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468371_California_20200412_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468417_California_20200411_null_19":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "H", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CAT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468417_California_20200411_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468436_California_20200506_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515315930247743,
"Nucleotide GTR":0.001502011479464579,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAG", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468436_California_20200506_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468460_California_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAR", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468460_California_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468480_California_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "LF", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "YTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468480_California_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468513_California_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "QH", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAW", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468513_California_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468528_California_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "SI", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AKT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468528_California_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468548_California_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGR", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468548_California_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468601_California_20200422_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAY", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468601_California_20200422_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468691_British_Columbia_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516081716626849,
"Nucleotide GTR":0.001502770542250944,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTC", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468691_British_Columbia_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468777_Aragon_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATY", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468777_Aragon_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468949_Basque_Country_20200410_null_29":{
"Global MG94xREV":0.001515715053964222,
"Nucleotide GTR":0.001502407098880909,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "L", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TTG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468949_Basque_Country_20200410_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469024_Gujarat_20200527_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516730822676108,
"Nucleotide GTR":0.001503413949158977,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "V", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GTT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469024_Gujarat_20200527_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469034_Gujarat_20200605_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469034_Gujarat_20200605_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469071_Vastra_Gotaland_20200527_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004634618375278832,
"Nucleotide GTR":0.0004593926496547939,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGT", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469071_Vastra_Gotaland_20200527_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469111_Singapore_20200408_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001516245375740736,
"Nucleotide GTR":0.001502932764440303,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "S", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "TCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTT", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469111_Singapore_20200408_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469113_Singapore_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "VL", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "KTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469113_Singapore_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469213_British_Columbia_20200401_null_34":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469213_British_Columbia_20200401_null_34",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469244_Jeddah_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516730762380438,
"Nucleotide GTR":0.001503413889392704,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "F", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TTC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469244_Jeddah_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469289_Kanto_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516652392033039,
"Nucleotide GTR":0.001503336207135761,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "Q", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAA", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469289_Kanto_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469408_England_20200515_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "V", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GTT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469408_England_20200515_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469499_England_20200503_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACT", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469499_England_20200503_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469549_England_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004478208734509782,
"Nucleotide GTR":0.0004438890130042088,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAC", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469549_England_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469595_England_20200422_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001516943371321332,
"Nucleotide GTR":0.001503624631630337,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "M", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "ATG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469595_England_20200422_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469821_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGY", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469821_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469918_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "K", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "AAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469918_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469977_Scotland_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "CF", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TKT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469977_Scotland_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470000_Scotland_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAY", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470000_Scotland_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470088_Northern_Ireland_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "VL", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "KTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470088_Northern_Ireland_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470119_England_20200417_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001518183837256242,
"Nucleotide GTR":0.001504854206293235,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "F", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TTT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470119_England_20200417_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470125_England_20200417_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470125_England_20200417_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470126_England_20200417_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "CTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470126_England_20200417_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470158_England_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515224920365805,
"Nucleotide GTR":0.00150192126864802,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCG", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470158_England_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470183_England_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAY", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470183_England_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470184_England_20200421_null_75":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTA", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470184_England_20200421_null_75",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470196_England_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515860206004274,
"Nucleotide GTR":0.001502550976488259,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCG", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470196_England_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470216_England_20200420_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001516389881254926,
"Nucleotide GTR":0.001503076001198281,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "F", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "TTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470216_England_20200420_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470238_England_20200417_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001516081713590679,
"Nucleotide GTR":0.001502770539241431,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAC", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470238_England_20200417_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470298_England_20200419_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001516319109837132,
"Nucleotide GTR":0.001503005851152459,
"amino-acid": [
["M", "V", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470298_England_20200419_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470345_England_20200419_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAY", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470345_England_20200419_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470371_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "HL", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CWT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470371_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470385_England_20200405_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0007059762981880212,
"Nucleotide GTR":0.0006997778370448159,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "I", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ATA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470385_England_20200405_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470430_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516971886915051,
"Nucleotide GTR":0.001503652896857575,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "I", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "ATT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470430_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470572_Amazonas_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0004905881714123739,
"Nucleotide GTR":0.0004862808147410228,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "C", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "TGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470572_Amazonas_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470573_Ceara_20200402_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0004501714678198648,
"Nucleotide GTR":0.0004462189691903455,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAG", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470573_Ceara_20200402_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470599_Mato_Grosso_20200319_null_19":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470599_Mato_Grosso_20200319_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470689_Utah_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001516389887704312,
"Nucleotide GTR":0.001503076007591041,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTT", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470689_Utah_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470842_Western_Australia_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.6814110162959029,
"Nucleotide GTR":0.6754282379534803,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "P", "C", "D", "F", "N", "S", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CCA", "TGT", "GAT", "TTT", "AAT", "AGC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470842_Western_Australia_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471151_Wisconsin_20200612_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516474704798174,
"Nucleotide GTR":0.001503160079992112,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "M", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATG", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471151_Wisconsin_20200612_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471266_Wisconsin_20200331_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001516081715749206,
"Nucleotide GTR":0.001502770541381007,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATC", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471266_Wisconsin_20200331_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471402_Kinshasa_20200426_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0015159822500604,
"Nucleotide GTR":0.001502671948999435,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "V", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "GTC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471402_Kinshasa_20200426_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471424_Valcea_20200607_null_20":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTT", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471424_Valcea_20200607_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471433_Liege_20200523_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471433_Liege_20200523_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471512_England_20200604_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "IM", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATS", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471512_England_20200604_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471620_Telangana_20200526_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516726883907103,
"Nucleotide GTR":0.001503410044972305,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "I", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ATT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471620_Telangana_20200526_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471630_Telangana_20200601_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471630_Telangana_20200601_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471692_Michigan_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516389869929828,
"Nucleotide GTR":0.001503075989972617,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAT", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471692_Michigan_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471712_Michigan_20200516_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "HR", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CRT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471712_Michigan_20200516_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471725_Michigan_20200427_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0004634526938321298,
"Nucleotide GTR":0.0004593835862405495,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAT", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471725_Michigan_20200427_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471753_Michigan_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515718767410896,
"Nucleotide GTR":0.001502410779723577,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "L", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CTC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471753_Michigan_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471767_Michigan_20200430_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0004634623354779662,
"Nucleotide GTR":0.0004593931432328822,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "Y", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "TAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471767_Michigan_20200430_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471790_Michigan_20200422_null_39":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "TTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471790_Michigan_20200422_null_39",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471822_Michigan_20200519_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGY", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471822_Michigan_20200519_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471888_Michigan_20200508_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "VL", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "KTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471888_Michigan_20200508_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471896_Michigan_20200515_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "DY", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "KAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471896_Michigan_20200515_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471903_Michigan_20200516_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AS", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "KCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471903_Michigan_20200516_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471949_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515691232254913,
"Nucleotide GTR":0.001502383486325845,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "I", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "ATT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471949_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472008_England_20200421_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001515904792150939,
"Nucleotide GTR":0.001502595171169237,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAA", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472008_England_20200421_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472078_England_20200608_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTY", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472078_England_20200608_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472131_England_20200603_null_27":{
"Global MG94xREV":0.0007909872480870087,
"Nucleotide GTR":0.0007840423920987519,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTT", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472131_England_20200603_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472151_Northern_Ireland_20200329_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001515870395182013,
"Nucleotide GTR":0.001502561076205173,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTA", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472151_Northern_Ireland_20200329_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472322_England_20200505_null_35":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472322_England_20200505_null_35",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472510_Wales_20200503_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "TI", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "AYA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472510_Wales_20200503_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472511_Wales_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0004501850497167659,
"Nucleotide GTR":0.0004462324318383985,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTG", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472511_Wales_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472519_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTY", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472519_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472640_Wales_20200505_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "HY", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "YAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472640_Wales_20200505_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472708_Wales_20200506_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAY", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472708_Wales_20200506_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472852_Wales_20200520_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "KR", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "ARG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "TTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472852_Wales_20200520_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472891_Wales_20200519_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "KR", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "ARG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472891_Wales_20200519_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_472992_Wales_20200519_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGR", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_472992_Wales_20200519_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473012_Wales_20200520_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473012_Wales_20200520_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473059_Wales_20200423_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473059_Wales_20200423_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473060_Wales_20200529_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516245710028658,
"Nucleotide GTR":0.001502933095793184,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "TTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTT", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473060_Wales_20200529_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473106_Wales_20200601_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCS", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473106_Wales_20200601_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473145_Wales_20200513_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "VF", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "KTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473145_Wales_20200513_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473159_Wales_20200528_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "RC", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "YGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473159_Wales_20200528_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473223_Wales_20200603_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001074708053906572,
"Nucleotide GTR":0.001065272133565439,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "H", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CAT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473223_Wales_20200603_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473310_England_20200505_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "F", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TTC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473310_England_20200505_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473316_England_20200503_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00151608170645442,
"Nucleotide GTR":0.00150277053216783,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGC", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473316_England_20200503_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473371_England_20200529_null_19":{
"Global MG94xREV":0.0005270502934571775,
"Nucleotide GTR":0.000522422799909739,
"amino-acid": [
["M", "A", "Y", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "TAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473371_England_20200529_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473375_England_20200531_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACG", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473375_England_20200531_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473394_England_20200515_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001515982232175946,
"Nucleotide GTR":0.001502671931272006,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "G", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "GGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473394_England_20200515_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473437_England_20200603_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00151582353190935,
"Nucleotide GTR":0.001502514624391332,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTG", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473437_England_20200603_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473439_England_20200602_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "I", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ATT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473439_England_20200602_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473446_England_20200606_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "F", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473446_England_20200606_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473447_England_20200602_null_62":{
"Global MG94xREV":0.0005090038352265687,
"Nucleotide GTR":0.0005045347893074748,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTT", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473447_England_20200602_null_62",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473462_England_20200531_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACT", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473462_England_20200531_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473477_England_20200602_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001515182621576514,
"Nucleotide GTR":0.001501879341241456,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "S", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TCT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473477_England_20200602_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473488_England_20200604_null_40":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAT", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473488_England_20200604_null_40",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473507_England_20200612_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001515644313804865,
"Nucleotide GTR":0.001502336979819073,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCT", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473507_England_20200612_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473546_Scotland_20200418_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACA", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473546_Scotland_20200418_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473579_Scotland_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515906395173665,
"Nucleotide GTR":0.001502596760117447,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTA", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473579_Scotland_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473623_Scotland_20200422_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473623_Scotland_20200422_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473627_Scotland_20200422_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAT", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473627_Scotland_20200422_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473700_Scotland_20200516_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516081706441188,
"Nucleotide GTR":0.001502770532154714,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "A", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GCT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473700_Scotland_20200516_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473747_Scotland_20200525_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "KN", "ILV", "-", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "---", "AAN", "NTA", "---", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473747_Scotland_20200525_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473811_Scotland_20200514_null_28":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAT", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473811_Scotland_20200514_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473815_Scotland_20200518_null_47":{
"Global MG94xREV":0.001515717291606561,
"Nucleotide GTR":0.001502409316876783,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "C", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGT", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473815_Scotland_20200518_null_47",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473829_Scotland_20200412_null_27":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTT", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473829_Scotland_20200412_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473947_Scotland_20200606_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGC", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473947_Scotland_20200606_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_473993_Wales_20200429_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTS", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_473993_Wales_20200429_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474044_Wales_20200423_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "TCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474044_Wales_20200423_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474116_Wales_20200510_null_37":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "F", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "TTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474116_Wales_20200510_null_37",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474127_Wales_20200502_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTY", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474127_Wales_20200502_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474198_Wales_20200508_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001515898650505797,
"Nucleotide GTR":0.001502589083447645,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "I", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "ATA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474198_Wales_20200508_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474254_Wales_20200402_null_38":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474254_Wales_20200402_null_38",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474301_Wales_20200404_null_25":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATT", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474301_Wales_20200404_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474349_Wales_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "I", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATT", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474349_Wales_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474352_Wales_20200415_null_20":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "F", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTT", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474352_Wales_20200415_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474354_Wales_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00151598225640384,
"Nucleotide GTR":0.00150267195528718,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGG", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474354_Wales_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474478_Wales_20200425_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001515658533271419,
"Nucleotide GTR":0.001502351074438927,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "F", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TTT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474478_Wales_20200425_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474505_Wales_20200424_null_50":{
"Global MG94xREV":0.0007784039729690825,
"Nucleotide GTR":0.0007715695979446663,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATT", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474505_Wales_20200424_null_50",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474541_Wales_20200427_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0004478076011006169,
"Nucleotide GTR":0.0004438758571848808,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGC", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474541_Wales_20200427_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474639_Wales_20200429_null_78":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "TTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474639_Wales_20200429_null_78",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474695_Wales_20200501_null_15":{
"Global MG94xREV":0.0006052882395424545,
"Nucleotide GTR":0.0005999738180202687,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCT", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474695_Wales_20200501_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474783_Wales_20200430_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0004755513453410544,
"Nucleotide GTR":0.0004713760117735365,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACT", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474783_Wales_20200430_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474799_Castilla_La_Mancha_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "GV", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GKT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474799_Castilla_La_Mancha_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474814_Castilla_La_Mancha_20200514_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "MI", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATK", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474814_Castilla_La_Mancha_20200514_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474821_Castilla_La_Mancha_20200525_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "NTSI", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "DV", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "KQE", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ANC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GWC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "NAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474821_Castilla_La_Mancha_20200525_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474824_Castilla_La_Mancha_20200520_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "HY", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "YAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474824_Castilla_La_Mancha_20200520_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474895_Andalusia_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "AS", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "KCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474895_Andalusia_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474909_Andalusia_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGY", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474909_Andalusia_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474958_BAT_YAM_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000447807650124879,
"Nucleotide GTR":0.0004438759057787106,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "P", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CCT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474958_BAT_YAM_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474982_HOLON_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516780454167513,
"Nucleotide GTR":0.001503463144886647,
"amino-acid": [
["M", "A", "Y", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "TAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAT", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474982_HOLON_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_474989_BEIT_SHEMESH_20200411_null_13":{
"Global MG94xREV":0.001516458701899319,
"Nucleotide GTR":0.001503144217598465,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAT", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_474989_BEIT_SHEMESH_20200411_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475071_Ghent_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0004634752815304627,
"Nucleotide GTR":0.0004594059756192354,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "TTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475071_Ghent_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475169_Dhaka_20200524_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "Y", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "TAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475169_Dhaka_20200524_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475264_England_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001518183835797852,
"Nucleotide GTR":0.00150485420484765,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTT", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475264_England_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475295_England_20200330_null_759":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475295_England_20200330_null_759",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475341_England_20200324_null_171":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475341_England_20200324_null_171",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475346_England_20200429_null_32":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATT", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475346_England_20200429_null_32",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475347_England_20200525_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516696192603381,
"Nucleotide GTR":0.001503379623137762,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475347_England_20200525_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475492_England_20200324_null_19":{
"Global MG94xREV":0.0004464701441943752,
"Nucleotide GTR":0.0004425501431299007,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475492_England_20200324_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475497_England_20200528_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTT", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475497_England_20200528_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475521_Uppsala_20200519_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00151532051437078,
"Nucleotide GTR":0.001502016023339087,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTC", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475521_Uppsala_20200519_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475572_London_20200317_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "TTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475572_London_20200317_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475579_California_20200402_null_406":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475579_California_20200402_null_406",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475586_California_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516698473381776,
"Nucleotide GTR":0.001503381883890959,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "V", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTT", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475586_California_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475587_California_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003035151196315373,
"Nucleotide GTR":0.003008502615049397,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "D", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "V", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GAT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GTA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475587_California_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475597_California_20200405_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001516081715908394,
"Nucleotide GTR":0.001502770541538795,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "L", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "CTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475597_California_20200405_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475654_California_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001504648335483965,
"Nucleotide GTR":0.001491437546020318,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "N", "S", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AAT", "AGT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475654_California_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475664_California_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515859695313099,
"Nucleotide GTR":0.001502550470280947,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "A", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "GCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475664_California_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475686_California_20200403_null_310":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475686_California_20200403_null_310",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475701_California_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001521031460081823,
"Nucleotide GTR":0.001507676827033788,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "L", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "CTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475701_California_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475721_Donostia_San_Sebatian_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001275564092466613,
"Nucleotide GTR":0.001264364659166773,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "T", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "ACT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475721_Donostia_San_Sebatian_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475736_Utah_20200512_null_47687":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475736_Utah_20200512_null_47687",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475752_Egypt_20200501_null_30":{
"Global MG94xREV":0.0009442765553192275,
"Nucleotide GTR":0.0009359858215486894,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475752_Egypt_20200501_null_30",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_475753_Egypt_20200501_null_460":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_475753_Egypt_20200501_null_460",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":10624.94026640091,
"Equilibrium frequencies": [
[0.01846436216695942],
[0.01579614405430958],
[0.0118384742968572],
[0.02547147119130841],
[0.01549482526672327],
[0.01325572417808688],
[0.009934547914286483],
[0.02137501376039634],
[0.01621776268240164],
[0.01387419252576369],
[0.010398061137021],
[0.02237230136719607],
[0.02769676607595714],
[0.02369440670727367],
[0.01775785431045189],
[0.03820751417335978],
[0.01349369415921394],
[0.01154376928032489],
[0.008651517449075904],
[0.01861446601474148],
[0.01132356651743766],
[0.009687238925483918],
[0.007260134412079373],
[0.0156207886155904],
[0.01185188676458231],
[0.01013921352689414],
[0.007598868326079564],
[0.01634960306546131],
[0.02024070407896473],
[0.01731579322919165],
[0.01297738057899974],
[0.0279219236590639],
[0.01594749331960835],
[0.01364297880987436],
[0.01022477722524951],
[0.02199946648527412],
[0.01338273264980369],
[0.01144884241681999],
[0.008580374185895965],
[0.01846139531212361],
[0.01400712679365644],
[0.01198300762403275],
[0.008980706131092321],
[0.01932274309675634],
[0.02392143243168505],
[0.02046463285650307],
[0.01533728922915424],
[0.03299946521460772],
[0.01341596189862324],
[0.02163339900102027],
[0.01316004619161914],
[0.01125833557230403],
[0.008437598178382777],
[0.01815420074709865],
[0.0117836123588039],
[0.00883126866621413],
[0.01900121584703653],
[0.02352338375191924],
[0.02012410475001588],
[0.01508207927271514],
[0.03245035957057221]
],
"Log Likelihood":-4384.132869757981,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.5531636592723418, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":923
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":11718.79600429809,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2537527443779634],
[0.2189670235685515],
[0.2084327185785096],
[0.3188475134749755]
],
"Log Likelihood":-4434.194647223371,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.3535274321897255,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.2461597415455464,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.1680063052276619,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.548674666465807,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.7109101404554268
},
"display order":0,
"estimated parameters":1421
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-06-24/sequences.M.compressed.fas",
"number of sequences":708,
"number of sites":227,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_465573_England_20200501_null_1,epi_isl_442621_England_20200412_null_1,epi_isl_469821_England_20200420_null_1,epi_isl_468251_Basel_Landschaft_20200427_null_1,epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1,epi_isl_474814_Castilla_La_Mancha_20200514_null_1,epi_isl_472992_Wales_20200519_null_1,epi_isl_471888_Michigan_20200508_null_1,epi_isl_468528_California_20200331_null_1,epi_isl_468480_California_20200428_null_1,epi_isl_468206_Geneva_20200417_null_1,epi_isl_467156_Basque_Country_20200313_null_1,epi_isl_466607_England_20200416_null_1,epi_isl_466567_England_20200416_null_1,epi_isl_466561_England_20200414_null_1,epi_isl_466542_England_20200415_null_1,epi_isl_466428_England_20200408_null_1,epi_isl_466384_England_20200413_null_1,epi_isl_466373_England_20200409_null_1,epi_isl_466358_England_20200409_null_1,epi_isl_466352_England_20200409_null_1,epi_isl_466288_England_20200408_null_1,epi_isl_466013_England_20200401_null_1,epi_isl_465905_England_20200330_null_1,epi_isl_465574_England_20200501_null_1,epi_isl_465258_England_20200418_null_1,epi_isl_464271_England_20200303_null_1,epi_isl_459241_England_20200501_null_1,epi_isl_458506_England_20200501_null_1,epi_isl_456582_Victoria_20200517_null_1,epi_isl_456567_Victoria_20200510_null_1,epi_isl_456545_Victoria_20200509_null_1,epi_isl_456418_Victoria_20200414_null_1,epi_isl_454653_California_20200410_null_1,epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2,epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1,epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1,epi_isl_423653_England_20200323_null_1,epi_isl_458498_England_20200416_null_1,epi_isl_465261_England_20200419_null_1,epi_isl_464634_England_20200308_null_1,epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1,epi_isl_466940_Basel_Stadt_20200308_null_1,epi_isl_465894_England_20200331_null_1,epi_isl_465252_England_20200418_null_1,epi_isl_457384_England_20200429_null_1,epi_isl_465675_England_20200518_null_1,epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1,epi_isl_465632_England_20200505_null_1,epi_isl_474821_Castilla_La_Mancha_20200525_null_1,epi_isl_456475_Victoria_20200501_null_1,epi_isl_468304_Zurich_20200504_null_1,epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_459173_England_20200507_null_1,epi_isl_465529_England_20200501_null_1,epi_isl_465851_England_20200328_null_1,epi_isl_449004_England_20200419_null_1,epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1,epi_isl_423445_England_20200327_null_1,epi_isl_464759_England_20200310_null_1,epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1,epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1,(epi_isl_459620_Scotland_20200323_null_4,epi_isl_464610_England_20200308_null_1)Node1343,epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1,epi_isl_456438_Victoria_20200417_null_1,epi_isl_452607_Andalusia_20200326_null_1,epi_isl_456623_Victoria_20200101_null_4,((epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2,epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1)Node1361,epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1)Node1360,((epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1,epi_isl_473371_England_20200529_null_19)Node1351,epi_isl_458364_England_20200501_null_1)Node1350,((epi_isl_473488_England_20200604_null_40,epi_isl_474982_HOLON_20200416_null_1)Node1356,epi_isl_470183_England_20200420_null_2)Node1355,((epi_isl_466387_England_20200413_null_1,epi_isl_468114_Oregon_20200506_null_2)Node1367,epi_isl_465545_England_20200501_null_1)Node1366,epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1,(epi_isl_453618_England_20200505_null_7,epi_isl_468272_Graubunden_20200428_null_1)Node1373,epi_isl_456568_Victoria_20200510_null_1,epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1,epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1,epi_isl_459208_England_20200505_null_1,(epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1,epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2)Node1270,epi_isl_456609_Timor_Leste_20200412_null_1,epi_isl_448978_England_20200421_null_1,epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_457519_England_20200507_null_2,epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2,epi_isl_468548_California_20200420_null_1,(epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1,epi_isl_454312_Portugal_20200328_null_1)Node1277,epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1,epi_isl_455205_Netherlands_20200327_null_1,epi_isl_448615_England_20200101_null_1,epi_isl_423378_England_20200328_null_1,(epi_isl_466416_England_20200409_null_1,epi_isl_467421_New_York_20200318_null_4)Node1036,epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1,epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1,epi_isl_423856_England_20200317_null_1,((epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1,epi_isl_473447_England_20200602_null_62)Node1058,epi_isl_468294_Bern_20200501_null_1)Node1057,epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1,epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1,epi_isl_468269_Luzern_20200427_null_1,epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1,epi_isl_474478_Wales_20200425_null_8,(epi_isl_465551_England_20200502_null_1,epi_isl_465558_England_20200502_null_7)Node1063,epi_isl_421892_England_20200327_null_1,epi_isl_443318_England_20200415_null_1,epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1,epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1,((epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2,epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1)Node1081,epi_isl_468777_Aragon_20200323_null_4)Node1080,epi_isl_441103_England_20200401_null_1,epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1,((epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2,epi_isl_468253_Vaud_20200427_null_1)Node1098,epi_isl_456571_Victoria_20200510_null_1)Node1097,(epi_isl_466978_Vaud_20200312_null_1,epi_isl_467299_Morocco_20200521_null_1)Node1094,epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1,epi_isl_440816_England_20200403_null_1,epi_isl_473815_Scotland_20200518_null_47,epi_isl_443107_England_20200411_null_1,epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1,((epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1,epi_isl_456444_Victoria_20200422_null_1,epi_isl_456473_Victoria_20200430_null_54)Node1117,epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1)Node1116,((epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1,epi_isl_474301_Wales_20200404_null_25)Node1111,epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3)Node1110,epi_isl_465222_England_20200417_null_1,((epi_isl_457288_England_20200417_null_2,epi_isl_474349_Wales_20200415_null_2)Node1135,epi_isl_459311_England_20200502_null_1)Node1134,((epi_isl_448896_England_20200413_null_3,epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1)Node1127,epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2)Node1126,epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1,epi_isl_463969_Quebec_20200413_null_2,epi_isl_465578_England_20200502_null_1,epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1,epi_isl_465719_England_20200314_null_1,epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1,epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1,((epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1,epi_isl_473462_England_20200531_null_5)Node1154,epi_isl_457554_England_20200511_null_1)Node1153,epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1,epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1,epi_isl_470430_England_20200410_null_1,epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1,epi_isl_454302_Portugal_20200324_null_2,epi_isl_473507_England_20200612_null_12,epi_isl_462317_Singapore_20200423_null_1,(epi_isl_449030_England_20200419_null_3,epi_isl_458042_Tamil_Nadu_20200506_null_6)Node1178,(epi_isl_461309_Zuid_Holland_20200507_null_5,epi_isl_468277_Ticino_20200428_null_4,epi_isl_473477_England_20200602_null_3)Node1172,epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1,(epi_isl_439409_England_20200331_null_1,epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2,(epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1,epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_3)Node1190,epi_isl_466399_England_20200413_null_1,epi_isl_473059_Wales_20200423_null_17)Node1182,(epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1,epi_isl_474352_Wales_20200415_null_20)Node1194,epi_isl_472151_Northern_Ireland_20200329_null_8,((((epi_isl_465270_England_20200419_null_18,epi_isl_465271_England_20200419_null_1)Node1206,epi_isl_466411_England_20200409_null_1)Node1205,epi_isl_466848_Telangana_20200513_null_2)Node1204,epi_isl_473145_Wales_20200513_null_4,epi_isl_474116_Wales_20200510_null_37)Node1200,(epi_isl_455395_Hubei_20200315_null_1,epi_isl_466031_England_20200401_null_1)Node1211,epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1,(epi_isl_443713_England_20200330_null_1,epi_isl_467613_New_Mexico_20200318_null_2)Node1216,epi_isl_458756_England_20200419_null_1,((epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1,epi_isl_466037_England_20200402_null_1)Node1225,epi_isl_443381_England_20200412_null_1)Node1224,epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1,epi_isl_473437_England_20200603_null_3,epi_isl_475521_Uppsala_20200519_null_5,(epi_isl_470385_England_20200405_null_10,epi_isl_472510_Wales_20200503_null_3)Node1235,((epi_isl_462888_Minnesota_20200511_null_2,epi_isl_473811_Scotland_20200514_null_28)Node1239,epi_isl_472708_Wales_20200506_null_2)Node1238,epi_isl_438435_England_20200329_null_1,epi_isl_468249_Uri_20200426_null_1,(epi_isl_466202_England_20200402_null_7,epi_isl_474695_Wales_20200501_null_15)Node1247,(epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1,epi_isl_468417_California_20200411_null_19)Node1250,epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1,(epi_isl_468348_California_20200425_null_1,epi_isl_475071_Ghent_20200318_null_2)Node659,(epi_isl_471822_Michigan_20200519_null_2,epi_isl_474541_Wales_20200427_null_2)Node656,(epi_isl_468239_Bern_20200420_null_1,epi_isl_474958_BAT_YAM_20200409_null_1)Node653,(epi_isl_471767_Michigan_20200430_null_8,epi_isl_472640_Wales_20200505_null_3)Node650,(epi_isl_466946_Basel_Stadt_20200310_null_1,epi_isl_469071_Vastra_Gotaland_20200527_null_1)Node647,(epi_isl_462679_Michigan_20200429_null_3,epi_isl_470573_Ceara_20200402_null_10)Node641,(epi_isl_458476_England_20200429_null_3,epi_isl_471725_Michigan_20200427_null_9)Node638,(epi_isl_467961_California_20200319_null_8,epi_isl_470000_Scotland_20200330_null_4)Node632,(epi_isl_454828_North_Carolina_20200301_null_2,epi_isl_465917_England_20200330_null_1)Node629,(epi_isl_453466_Northern_Ireland_20200325_null_1,epi_isl_454614_California_20200429_null_4)Node626,(epi_isl_440436_England_20200316_null_2,epi_isl_463010_Odisha_20200507_null_5)Node623,(epi_isl_423549_England_20200331_null_1,epi_isl_472511_Wales_20200326_null_2)Node620,(epi_isl_420198_England_20200328_null_1,epi_isl_465882_England_20200329_null_1)Node610,(epi_isl_442012_England_20200324_null_2,epi_isl_456422_Victoria_20200416_null_1)Node607,(epi_isl_456627_Victoria_20200523_null_1,epi_isl_464561_England_20200304_null_19)Node597,epi_isl_452832_Virginia_20200422_null_3,epi_isl_471692_Michigan_20200429_null_1,epi_isl_468238_Bern_20200420_null_1,epi_isl_468949_Basque_Country_20200410_null_29,epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1,epi_isl_454936_Hubei_20200211_null_1,epi_isl_472008_England_20200421_null_3,epi_isl_460813_Overijssel_20200414_null_1,(epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_3,epi_isl_469977_Scotland_20200330_null_3)Node222,epi_isl_474354_Wales_20200415_null_3,epi_isl_463017_Odisha_20200509_null_1,(epi_isl_441573_England_20200404_null_1,epi_isl_470371_England_20200408_null_1)Node235,epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1,epi_isl_473316_England_20200503_null_2,epi_isl_463021_Odisha_20200509_null_1,epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1,epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1,epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1,epi_isl_452002_Denmark_20200311_null_2,epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1,epi_isl_455638_KZN_20200504_null_1,epi_isl_459493_England_20200427_null_1,epi_isl_465333_England_20200420_null_1,epi_isl_470216_England_20200420_null_8,epi_isl_448657_England_20200101_null_1,epi_isl_471402_Kinshasa_20200426_null_2,epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1,epi_isl_435059_EC_20200320_null_1,epi_isl_445096_California_20200313_null_1,epi_isl_471949_England_20200421_null_1,(epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1,epi_isl_449684_England_20200415_null_1)Node290,epi_isl_473700_Scotland_20200516_null_2,epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1,epi_isl_456032_New_York_20200327_null_1,epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1,epi_isl_475264_England_20200430_null_1,epi_isl_471266_Wisconsin_20200331_null_12,epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1,epi_isl_470119_England_20200417_null_3,epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1,epi_isl_455917_Bangkok_20200312_null_2,epi_isl_450495_GP_20200325_null_1,epi_isl_463139_Connecticut_20200330_null_3,(epi_isl_433051_England_20200404_null_3,epi_isl_473375_England_20200531_null_6)Node309,epi_isl_470689_Utah_20200413_null_3,epi_isl_438652_England_20200423_null_2,epi_isl_443744_England_20200325_null_1,epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1,epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1,epi_isl_473394_England_20200515_null_4,epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2,epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1,epi_isl_475736_Utah_20200512_null_47687,epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1,epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2,epi_isl_475597_California_20200405_null_3,epi_isl_429814_Nova_Scotia_20200315_null_1,epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1,epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1,epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1,epi_isl_452334_Beijing_20200319_null_1,epi_isl_467231_Madrid_20200402_null_3,epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1,epi_isl_461240_Utrecht_20200430_null_2,(((epi_isl_465850_England_20200323_null_3,epi_isl_457312_England_20200504_null_1,epi_isl_469034_Gujarat_20200605_null_2)Node382,epi_isl_465604_England_20200504_null_2)Node381,epi_isl_458314_England_20200429_null_1)Node380,(((epi_isl_465165_England_20200416_null_1,(epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1,epi_isl_452182_Veneto_20200323_null_1)Node369,epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_475295_England_20200330_null_759,epi_isl_464625_England_20200308_null_1,epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1,epi_isl_464350_England_20200304_null_1,epi_isl_462990_elinac_20200429_null_1,epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1,epi_isl_460855_Friesland_20200501_null_4)Node352,epi_isl_468283_Basel_Landschaft_20200430_null_1)Node351,epi_isl_466515_England_20200414_null_37)Node350,((epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1,epi_isl_473627_Scotland_20200422_null_8)Node376,epi_isl_462374_Singapore_20200408_null_3)Node375,(((epi_isl_456556_Victoria_20200508_null_1,epi_isl_460634_Washington_20200406_null_1)Node395,epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1,epi_isl_452299_Michigan_20200316_null_1)Node391,epi_isl_456546_Victoria_20200502_null_1)Node390,((epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1,epi_isl_475497_England_20200528_null_7)Node401,epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1)Node400,epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1,(epi_isl_463684_Washington_20200505_null_18,epi_isl_472891_Wales_20200519_null_3)Node412,(epi_isl_472078_England_20200608_null_6,epi_isl_472131_England_20200603_null_27)Node408,epi_isl_468290_Basel_Landschaft_20200501_null_1,((epi_isl_459573_Scotland_20200325_null_12,epi_isl_473446_England_20200606_null_5)Node419,epi_isl_468302_Zurich_20200504_null_1)Node418,(epi_isl_418703_England_20200317_null_1,epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1)Node423,((((epi_isl_452371_Andalusia_20200401_null_1,epi_isl_465540_England_20200430_null_1)Node439,epi_isl_467846_Georgia_20200313_null_1,epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3,epi_isl_465716_England_20200421_null_1,epi_isl_433666_England_20200403_null_2,epi_isl_475341_England_20200324_null_171)Node429,epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1)Node428,epi_isl_462716_Michigan_20200417_null_10)Node427,((epi_isl_442782_England_20200407_null_4,epi_isl_472322_England_20200505_null_35,(epi_isl_461567_England_20200525_null_4,epi_isl_470126_England_20200417_null_5)Node448,epi_isl_459878_Ontario_20200327_null_1)Node445,epi_isl_474909_Andalusia_20200318_null_4)Node444,((epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2,epi_isl_461722_Scotland_20200506_null_22)Node458,epi_isl_445178_California_20200405_null_1)Node457,epi_isl_462461_Maglaj_20200411_null_2,epi_isl_465392_England_20200421_null_1,(epi_isl_444084_England_20200404_null_1,epi_isl_468236_Bern_20200420_null_5)Node467,epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1,(epi_isl_442065_England_20200404_null_1,epi_isl_469408_England_20200515_null_1)Node472,epi_isl_463172_Connecticut_20200401_null_4,epi_isl_459045_England_20200409_null_2,epi_isl_467652_New_Mexico_20200402_null_3,epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1,epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1,(epi_isl_441250_England_20200401_null_2,epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2)Node488,epi_isl_423427_England_20200331_null_1,epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1,epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1,epi_isl_465712_England_20200430_null_3,epi_isl_468691_British_Columbia_20200401_null_2,epi_isl_468289_Vaud_20200501_null_2,epi_isl_475664_California_20200406_null_1,epi_isl_457836_Kenya_20200323_null_2,epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1,epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1,epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2,epi_isl_462715_Michigan_20200417_null_1,(epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1,epi_isl_454496_Sormland_20200309_null_11)Node511,epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1,epi_isl_457474_England_20200508_null_3,epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1,(epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6,epi_isl_464508_England_20200304_null_2,epi_isl_475572_London_20200317_null_13)Node519,epi_isl_469595_England_20200422_null_10,epi_isl_460852_Friesland_20200413_null_1,epi_isl_467262_Galicia_20200414_null_1,epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_454281_Portugal_20200421_null_1,epi_isl_452076_Denmark_20200428_null_4,(epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1,epi_isl_458267_California_20200410_null_2)Node539,epi_isl_474799_Castilla_La_Mancha_20200331_null_1,epi_isl_475587_California_20200402_null_1,((epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1,epi_isl_460383_Massachusetts_20200404_null_1)Node553,epi_isl_465303_England_20200420_null_2)Node552,epi_isl_455591_Nonthaburi_20200320_null_1,epi_isl_421787_England_20200326_null_1,epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1,epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2,epi_isl_454647_Virgin_Islands_20200427_null_2,(epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1,epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1)Node559,epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5,epi_isl_457704_Muscat_20200224_null_1,epi_isl_470238_England_20200417_null_7,epi_isl_470088_Northern_Ireland_20200406_null_2,epi_isl_475701_California_20200404_null_1,epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1,epi_isl_464065_Houthalen_Helchteren_20200407_null_2,epi_isl_452438_Andalusia_20200312_null_1,epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1,epi_isl_454897_Stockholm_20200310_null_4,(epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1,epi_isl_469549_England_20200423_null_1)Node190,((epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2,epi_isl_469111_Singapore_20200408_null_7)Node593,epi_isl_423216_England_20200325_null_1)Node592,epi_isl_468371_California_20200412_null_3,(epi_isl_447679_France_20200301_null_1,epi_isl_475586_California_20200322_null_1)Node587,epi_isl_462228_Vlamertinge_20200402_null_8,epi_isl_465833_England_20200325_null_1,epi_isl_460791_Noord_Holland_20200401_null_1,(epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1,epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1)Node160,epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1,epi_isl_465958_England_20200330_null_1,epi_isl_470196_England_20200420_null_2,epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2,epi_isl_433845_England_20200408_null_1,epi_isl_474198_Wales_20200508_null_4,epi_isl_424156_England_20200320_null_1,epi_isl_420758_England_20200327_null_1,epi_isl_468288_Basel_Landschaft_20200501_null_1,epi_isl_453047_Scotland_20200414_null_1,epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1,(epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3,epi_isl_454247_Portugal_20200323_null_8)Node184,epi_isl_423528_England_20200326_null_1,(epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2,epi_isl_465968_England_20200330_null_1)Node138,epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1,epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1,epi_isl_460272_Massachusetts_20200404_null_1,((epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1,epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1)Node148,epi_isl_441046_England_20200404_null_1)Node147,epi_isl_421917_England_20200327_null_1,epi_isl_471712_Michigan_20200516_null_1,(epi_isl_458747_England_20200419_null_1,epi_isl_473223_Wales_20200603_null_3)Node602,epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1,epi_isl_468513_California_20200321_null_1,(epi_isl_442072_England_20200405_null_1,epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1)Node614,epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1,epi_isl_468286_Bern_20200430_null_1,epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1,(((epi_isl_461329_Zuid_Holland_20200428_null_1,epi_isl_471433_Liege_20200523_null_6)Node122,epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1)Node121,epi_isl_466932_Graub_nden_20200305_null_1)Node120,((epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1,epi_isl_456995_Scotland_20200521_null_7)Node131,epi_isl_471896_Michigan_20200515_null_12,epi_isl_475169_Dhaka_20200524_null_18)Node127,epi_isl_453570_England_20200424_null_1,epi_isl_470158_England_20200417_null_1,((epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1,epi_isl_464453_England_20200304_null_1,epi_isl_473829_Scotland_20200412_null_27)Node113,epi_isl_472519_Wales_20200329_null_1)Node112,epi_isl_455105_Jonkoping_20200507_null_1,epi_isl_462341_Singapore_20200330_null_1,((epi_isl_425380_England_20200318_null_1,epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1,epi_isl_462973_Wyoming_20200329_null_11)Node85,epi_isl_453286_England_20200403_null_1)Node84,epi_isl_454626_California_20200430_null_2,epi_isl_466197_England_20200403_null_1,epi_isl_468257_Bern_20200427_null_1,(epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2,epi_isl_474505_Wales_20200424_null_50)Node668,epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1,epi_isl_468365_California_20200411_null_1,epi_isl_473993_Wales_20200429_null_2,epi_isl_473579_Scotland_20200421_null_1,epi_isl_462736_Michigan_20200427_null_1,(epi_isl_466609_England_20200416_null_1,epi_isl_475752_Egypt_20200501_null_30)Node74,((epi_isl_442846_England_20200411_null_1,epi_isl_439458_England_20200330_null_1,epi_isl_461267_Zeeland_20200424_null_1,epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4,epi_isl_473623_Scotland_20200422_null_12)Node683,epi_isl_474824_Castilla_La_Mancha_20200520_null_6)Node682,((epi_isl_462984_Wyoming_20200330_null_1,epi_isl_473747_Scotland_20200525_null_1)Node694,epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1)Node693,(epi_isl_456297_Southern_20200401_null_1,epi_isl_470184_England_20200421_null_75)Node70,epi_isl_423815_England_20200323_null_1,(epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1,epi_isl_471790_Michigan_20200422_null_39)Node699,epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1,epi_isl_440052_England_20200322_null_1,epi_isl_465643_England_20200506_null_1,epi_isl_443823_England_20200326_null_1,epi_isl_456655_Victoria_20200526_null_6,epi_isl_466283_England_20200408_null_1,epi_isl_466368_England_20200410_null_1,((epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_1,epi_isl_466123_England_20200331_null_1)Node731,epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1)Node730,((epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1,epi_isl_470298_England_20200419_null_6,epi_isl_448539_England_20200406_null_1,epi_isl_469213_British_Columbia_20200401_null_34)Node721,epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_3)Node720,epi_isl_466285_England_20200407_null_2,((epi_isl_466400_England_20200412_null_1,epi_isl_465974_England_20200330_null_1)Node737,epi_isl_417938_California_20200318_null_1)Node736,(epi_isl_465408_England_20200421_null_1,epi_isl_469289_Kanto_20200401_null_2)Node742,epi_isl_465465_England_20200429_null_1,((epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1,epi_isl_474254_Wales_20200402_null_38)Node775,epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_8)Node774,((epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3,epi_isl_452115_Texas_20200311_null_1)Node770,epi_isl_458741_England_20200414_null_2)Node769,((epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1,epi_isl_465108_England_20200314_null_9)Node765,epi_isl_474127_Wales_20200502_null_5)Node764,epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1,(epi_isl_468460_California_20200413_null_1,epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1,epi_isl_475686_California_20200403_null_310)Node755,(epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2,epi_isl_473947_Scotland_20200606_null_6)Node760,((epi_isl_443337_England_20200415_null_1,epi_isl_470125_England_20200417_null_8)Node79,epi_isl_471630_Telangana_20200601_null_5)Node78,epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2,(epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1,epi_isl_456255_Counties_Manukau_20200323_null_2)Node780,epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1,epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1,(epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1,epi_isl_475721_Donostia_San_Sebatian_20200327_null_4)Node789,epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5,epi_isl_448684_England_20200101_null_1,(epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1,epi_isl_461237_Utrecht_20200428_null_5)Node798,epi_isl_468228_Basel_Landschaft_20200420_null_3,epi_isl_473106_Wales_20200601_null_1,epi_isl_440230_England_20200323_null_1,epi_isl_433949_England_20200412_null_2,epi_isl_471753_Michigan_20200420_null_2,(epi_isl_461148_Noord_Brabant_20200320_null_3,epi_isl_465352_England_20200416_null_1)Node814,(epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1,epi_isl_469499_England_20200503_null_3)Node811,epi_isl_441198_England_20200403_null_1,epi_isl_466925_Bavaria_20200526_null_12,((epi_isl_469024_Gujarat_20200527_null_1,epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2,epi_isl_466882_Bavaria_20200415_null_1)Node857,epi_isl_466240_England_20200405_null_1)Node856,((epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1,epi_isl_455309_Odisha_20200404_null_1,(epi_isl_456569_Victoria_20200510_null_1,epi_isl_475492_England_20200324_null_19)Node833,epi_isl_475753_Egypt_20200501_null_460,epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1,epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1,epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2,epi_isl_461204_Noord_Holland_20200426_null_1)Node824,epi_isl_470345_England_20200419_null_7)Node823,(epi_isl_473012_Wales_20200520_null_10,epi_isl_475347_England_20200525_null_1)Node842,(epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1,epi_isl_473546_Scotland_20200418_null_4)Node853,(epi_isl_458145_Amapa_20200420_null_1,epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1,epi_isl_468353_California_20200516_null_1)Node847,epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1,((epi_isl_461485_Gujarat_20200527_null_1,epi_isl_452954_England_20200512_null_1,epi_isl_456688_England_20200518_null_7)Node865,epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1)Node864,epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1,(epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1,epi_isl_455478_Odisha_20200409_null_1)Node877,epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1,epi_isl_474895_Andalusia_20200403_null_1,epi_isl_464336_England_20200303_null_1,epi_isl_466477_England_20200410_null_1,(((epi_isl_469244_Jeddah_20200315_null_1,epi_isl_473310_England_20200505_null_10)Node893,epi_isl_456437_Victoria_20200418_null_1)Node892,epi_isl_466242_England_20200403_null_4)Node891,epi_isl_429065_California_20200328_null_1,epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2,epi_isl_443629_England_20200417_null_4,epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1,(epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5,epi_isl_460452_Massachusetts_20200319_null_8,epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4,epi_isl_471424_Valcea_20200607_null_20)Node902,(epi_isl_464932_England_20200313_null_1,epi_isl_469113_Singapore_20200406_null_1,epi_isl_473060_Wales_20200529_null_1,epi_isl_472852_Wales_20200520_null_1,epi_isl_474639_Wales_20200429_null_78)Node909,((epi_isl_454527_Maharashtra_20200313_null_1,epi_isl_466672_Nebraska_20200504_null_25)Node108,epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1)Node107,epi_isl_465840_England_20200327_null_1,(epi_isl_443673_England_20200412_null_1,epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1)Node920,epi_isl_467008_Vaud_20200507_null_1,(((epi_isl_475579_California_20200402_null_406,epi_isl_458970_England_20200410_null_1,epi_isl_459072_England_20200410_null_1)Node95,epi_isl_466961_Vaud_20200311_null_51)Node94,epi_isl_423718_England_20200323_null_2)Node93,((epi_isl_452240_Stockholm_20200424_null_3,epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_1)Node103,epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1)Node102,epi_isl_468436_California_20200506_null_1,epi_isl_466927_Basel_Stadt_20200305_null_1,epi_isl_468601_California_20200422_null_3,epi_isl_474989_BEIT_SHEMESH_20200411_null_13,(epi_isl_475346_England_20200429_null_32,epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4,epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1,epi_isl_470842_Western_Australia_20200401_null_1)Node931,epi_isl_461087_Netherlands_20200508_null_6,(epi_isl_452145_Connecticut_20200512_null_1,epi_isl_471151_Wisconsin_20200612_null_1)Node944,epi_isl_471512_England_20200604_null_1,(epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2,epi_isl_456528_Victoria_20200507_null_1)Node954,(epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3,epi_isl_469918_England_20200413_null_1)Node950,epi_isl_466304_England_20200408_null_1,epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_3,((epi_isl_456583_Victoria_20200517_null_1,epi_isl_470572_Amazonas_20200402_null_2)Node975,epi_isl_473159_Wales_20200528_null_2)Node974,(((epi_isl_471620_Telangana_20200526_null_1,epi_isl_473439_England_20200602_null_9)Node962,epi_isl_465251_England_20200418_null_2)Node961,epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1)Node960,((epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_1,epi_isl_475654_California_20200401_null_1)Node969,epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1)Node968,epi_isl_460056_Minnesota_20200323_null_5,(epi_isl_438511_England_20200401_null_2,epi_isl_474783_Wales_20200430_null_4)Node1027,((epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4,((epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1)Node1019,epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4)Node1018,epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1)Node1016,epi_isl_465918_England_20200330_null_1)Node1015,epi_isl_465213_England_20200417_null_1,((epi_isl_462991_USA_20200511_null_1,epi_isl_474044_Wales_20200423_null_13)Node1007,epi_isl_471903_Michigan_20200516_null_4)Node1006,epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1,epi_isl_466544_England_20200415_null_1,(epi_isl_441307_England_20200401_null_2,epi_isl_452407_Andalusia_20200315_null_9,epi_isl_465516_England_20200429_null_1)Node986,epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1,((epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3,epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1)Node1002,epi_isl_423067_England_20200324_null_1,epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_1,epi_isl_470599_Mato_Grosso_20200319_null_19)Node996,epi_isl_459024_England_20200410_null_1,epi_isl_462436_Uzice_20200428_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node1002":"test",
"Node1006":"test",
"Node1007":"test",
"Node1015":"test",
"Node1016":"test",
"Node1018":"test",
"Node1019":"test",
"Node102":"test",
"Node1027":"test",
"Node103":"test",
"Node1036":"test",
"Node1057":"test",
"Node1058":"test",
"Node1063":"test",
"Node107":"test",
"Node108":"test",
"Node1080":"test",
"Node1081":"test",
"Node1094":"test",
"Node1097":"test",
"Node1098":"test",
"Node1110":"test",
"Node1111":"test",
"Node1116":"test",
"Node1117":"test",
"Node112":"test",
"Node1126":"test",
"Node1127":"test",
"Node113":"test",
"Node1134":"test",
"Node1135":"test",
"Node1153":"test",
"Node1154":"test",
"Node1172":"test",
"Node1178":"test",
"Node1182":"test",
"Node1190":"test",
"Node1194":"test",
"Node120":"test",
"Node1200":"test",
"Node1204":"test",
"Node1205":"test",
"Node1206":"test",
"Node121":"test",
"Node1211":"test",
"Node1216":"test",
"Node122":"test",
"Node1224":"test",
"Node1225":"test",
"Node1235":"test",
"Node1238":"test",
"Node1239":"test",
"Node1247":"test",
"Node1250":"test",
"Node127":"test",
"Node1270":"test",
"Node1277":"test",
"Node131":"test",
"Node1343":"test",
"Node1350":"test",
"Node1351":"test",
"Node1355":"test",
"Node1356":"test",
"Node1360":"test",
"Node1361":"test",
"Node1366":"test",
"Node1367":"test",
"Node1373":"test",
"Node138":"test",
"Node147":"test",
"Node148":"test",
"Node160":"test",
"Node184":"test",
"Node190":"test",
"Node222":"test",
"Node235":"test",
"Node290":"test",
"Node309":"test",
"Node350":"test",
"Node351":"test",
"Node352":"test",
"Node369":"test",
"Node375":"test",
"Node376":"test",
"Node380":"test",
"Node381":"test",
"Node382":"test",
"Node390":"test",
"Node391":"test",
"Node395":"test",
"Node400":"test",
"Node401":"test",
"Node408":"test",
"Node412":"test",
"Node418":"test",
"Node419":"test",
"Node423":"test",
"Node427":"test",
"Node428":"test",
"Node429":"test",
"Node439":"test",
"Node444":"test",
"Node445":"test",
"Node448":"test",
"Node457":"test",
"Node458":"test",
"Node467":"test",
"Node472":"test",
"Node488":"test",
"Node511":"test",
"Node519":"test",
"Node539":"test",
"Node552":"test",
"Node553":"test",
"Node559":"test",
"Node587":"test",
"Node592":"test",
"Node593":"test",
"Node597":"test",
"Node602":"test",
"Node607":"test",
"Node610":"test",
"Node614":"test",
"Node620":"test",
"Node623":"test",
"Node626":"test",
"Node629":"test",
"Node632":"test",
"Node638":"test",
"Node641":"test",
"Node647":"test",
"Node650":"test",
"Node653":"test",
"Node656":"test",
"Node659":"test",
"Node668":"test",
"Node682":"test",
"Node683":"test",
"Node693":"test",
"Node694":"test",
"Node699":"test",
"Node70":"test",
"Node720":"test",
"Node721":"test",
"Node730":"test",
"Node731":"test",
"Node736":"test",
"Node737":"test",
"Node74":"test",
"Node742":"test",
"Node755":"test",
"Node760":"test",
"Node764":"test",
"Node765":"test",
"Node769":"test",
"Node770":"test",
"Node774":"test",
"Node775":"test",
"Node78":"test",
"Node780":"test",
"Node789":"test",
"Node79":"test",
"Node798":"test",
"Node811":"test",
"Node814":"test",
"Node823":"test",
"Node824":"test",
"Node833":"test",
"Node84":"test",
"Node842":"test",
"Node847":"test",
"Node85":"test",
"Node853":"test",
"Node856":"test",
"Node857":"test",
"Node864":"test",
"Node865":"test",
"Node877":"test",
"Node891":"test",
"Node892":"test",
"Node893":"test",
"Node902":"test",
"Node909":"test",
"Node920":"test",
"Node93":"test",
"Node931":"test",
"Node94":"test",
"Node944":"test",
"Node95":"test",
"Node950":"test",
"Node954":"test",
"Node960":"test",
"Node961":"test",
"Node962":"test",
"Node968":"test",
"Node969":"test",
"Node974":"test",
"Node975":"test",
"Node986":"test",
"Node996":"test",
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1":"test",
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":"test",
"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2":"test",
"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1":"test",
"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418703_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420198_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420758_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_421787_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_423067_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423216_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423378_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423427_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423445_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423528_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423653_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423718_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_423815_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423856_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_424156_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_425380_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1":"test",
"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4":"test",
"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2":"test",
"epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1":"test",
"epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_429065_California_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_429814_Nova_Scotia_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_433051_England_20200404_null_3":"test",
"epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3":"test",
"epi_isl_433666_England_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_433845_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_433949_England_20200412_null_2":"test",
"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5":"test",
"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6":"test",
"epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_438435_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_438511_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_438652_England_20200423_null_2":"test",
"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_439409_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_439458_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_440052_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_440230_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_440436_England_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_440816_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_441046_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_441103_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_441198_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_441250_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_441307_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_441573_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_442012_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_442065_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_442072_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_442621_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_442782_England_20200407_null_4":"test",
"epi_isl_442846_England_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_443107_England_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_443318_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_443337_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_443381_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_443629_England_20200417_null_4":"test",
"epi_isl_443673_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_443713_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_443744_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_443823_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_444084_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_445096_California_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_445178_California_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4":"test",
"epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3":"test",
"epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3":"test",
"epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1":"test",
"epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2":"test",
"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2":"test",
"epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_447679_France_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_448539_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_448615_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_448657_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_448684_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_448896_England_20200413_null_3":"test",
"epi_isl_448978_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_449004_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_449030_England_20200419_null_3":"test",
"epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_449684_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3":"test",
"epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_450495_GP_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5":"test",
"epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1":"test",
"epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5":"test",
"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_452002_Denmark_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_452076_Denmark_20200428_null_4":"test",
"epi_isl_452115_Texas_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_452145_Connecticut_20200512_null_1":"test",
"epi_isl_452182_Veneto_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_452240_Stockholm_20200424_null_3":"test",
"epi_isl_452299_Michigan_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_452334_Beijing_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_452371_Andalusia_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_452407_Andalusia_20200315_null_9":"test",
"epi_isl_452438_Andalusia_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_452607_Andalusia_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_452832_Virginia_20200422_null_3":"test",
"epi_isl_452954_England_20200512_null_1":"test",
"epi_isl_453047_Scotland_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_453286_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_453466_Northern_Ireland_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_453570_England_20200424_null_1":"test",
"epi_isl_453618_England_20200505_null_7":"test",
"epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_454247_Portugal_20200323_null_8":"test",
"epi_isl_454281_Portugal_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_454302_Portugal_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_454312_Portugal_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_454496_Sormland_20200309_null_11":"test",
"epi_isl_454527_Maharashtra_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_454614_California_20200429_null_4":"test",
"epi_isl_454626_California_20200430_null_2":"test",
"epi_isl_454647_Virgin_Islands_20200427_null_2":"test",
"epi_isl_454653_California_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_454828_North_Carolina_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_454897_Stockholm_20200310_null_4":"test",
"epi_isl_454936_Hubei_20200211_null_1":"test",
"epi_isl_455105_Jonkoping_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_455205_Netherlands_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_455309_Odisha_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_455395_Hubei_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_455478_Odisha_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_455591_Nonthaburi_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_455638_KZN_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_455917_Bangkok_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_456032_New_York_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_456255_Counties_Manukau_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_456297_Southern_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_456418_Victoria_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_456422_Victoria_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_456437_Victoria_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_456438_Victoria_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_456444_Victoria_20200422_null_1":"test",
"epi_isl_456473_Victoria_20200430_null_54":"test",
"epi_isl_456475_Victoria_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_456528_Victoria_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_456545_Victoria_20200509_null_1":"test",
"epi_isl_456546_Victoria_20200502_null_1":"test",
"epi_isl_456556_Victoria_20200508_null_1":"test",
"epi_isl_456567_Victoria_20200510_null_1":"test",
"epi_isl_456568_Victoria_20200510_null_1":"test",
"epi_isl_456569_Victoria_20200510_null_1":"test",
"epi_isl_456571_Victoria_20200510_null_1":"test",
"epi_isl_456582_Victoria_20200517_null_1":"test",
"epi_isl_456583_Victoria_20200517_null_1":"test",
"epi_isl_456609_Timor_Leste_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_456623_Victoria_20200101_null_4":"test",
"epi_isl_456627_Victoria_20200523_null_1":"test",
"epi_isl_456655_Victoria_20200526_null_6":"test",
"epi_isl_456688_England_20200518_null_7":"test",
"epi_isl_456995_Scotland_20200521_null_7":"test",
"epi_isl_457288_England_20200417_null_2":"test",
"epi_isl_457312_England_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_457384_England_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_457474_England_20200508_null_3":"test",
"epi_isl_457519_England_20200507_null_2":"test",
"epi_isl_457554_England_20200511_null_1":"test",
"epi_isl_457704_Muscat_20200224_null_1":"test",
"epi_isl_457836_Kenya_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_458042_Tamil_Nadu_20200506_null_6":"test",
"epi_isl_458145_Amapa_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_1":"test",
"epi_isl_458267_California_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_458314_England_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_458364_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_458476_England_20200429_null_3":"test",
"epi_isl_458498_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_458506_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_458741_England_20200414_null_2":"test",
"epi_isl_458747_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_458756_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_458970_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_459024_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_459045_England_20200409_null_2":"test",
"epi_isl_459072_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_459173_England_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_459208_England_20200505_null_1":"test",
"epi_isl_459241_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_459311_England_20200502_null_1":"test",
"epi_isl_459493_England_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_459573_Scotland_20200325_null_12":"test",
"epi_isl_459620_Scotland_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_459878_Ontario_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_460056_Minnesota_20200323_null_5":"test",
"epi_isl_460272_Massachusetts_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_460383_Massachusetts_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_460452_Massachusetts_20200319_null_8":"test",
"epi_isl_460634_Washington_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_460791_Noord_Holland_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_460813_Overijssel_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_460852_Friesland_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_460855_Friesland_20200501_null_4":"test",
"epi_isl_461087_Netherlands_20200508_null_6":"test",
"epi_isl_461148_Noord_Brabant_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_461204_Noord_Holland_20200426_null_1":"test",
"epi_isl_461237_Utrecht_20200428_null_5":"test",
"epi_isl_461240_Utrecht_20200430_null_2":"test",
"epi_isl_461267_Zeeland_20200424_null_1":"test",
"epi_isl_461309_Zuid_Holland_20200507_null_5":"test",
"epi_isl_461329_Zuid_Holland_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_461485_Gujarat_20200527_null_1":"test",
"epi_isl_461567_England_20200525_null_4":"test",
"epi_isl_461722_Scotland_20200506_null_22":"test",
"epi_isl_462228_Vlamertinge_20200402_null_8":"test",
"epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_8":"test",
"epi_isl_462317_Singapore_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_462341_Singapore_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_462374_Singapore_20200408_null_3":"test",
"epi_isl_462436_Uzice_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_462461_Maglaj_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_462679_Michigan_20200429_null_3":"test",
"epi_isl_462715_Michigan_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_462716_Michigan_20200417_null_10":"test",
"epi_isl_462736_Michigan_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_462888_Minnesota_20200511_null_2":"test",
"epi_isl_462973_Wyoming_20200329_null_11":"test",
"epi_isl_462984_Wyoming_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_462990_elinac_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_462991_USA_20200511_null_1":"test",
"epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_463010_Odisha_20200507_null_5":"test",
"epi_isl_463017_Odisha_20200509_null_1":"test",
"epi_isl_463021_Odisha_20200509_null_1":"test",
"epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_3":"test",
"epi_isl_463139_Connecticut_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_463172_Connecticut_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_463684_Washington_20200505_null_18":"test",
"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1":"test",
"epi_isl_463969_Quebec_20200413_null_2":"test",
"epi_isl_464065_Houthalen_Helchteren_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1":"test",
"epi_isl_464271_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_464336_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_464350_England_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_464453_England_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_464508_England_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_464561_England_20200304_null_19":"test",
"epi_isl_464610_England_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_464625_England_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_464634_England_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_464759_England_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_464932_England_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_465108_England_20200314_null_9":"test",
"epi_isl_465165_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_465213_England_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_465222_England_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_465251_England_20200418_null_2":"test",
"epi_isl_465252_England_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_465258_England_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_465261_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_465270_England_20200419_null_18":"test",
"epi_isl_465271_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_465303_England_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_465333_England_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_465352_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_465392_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_465408_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_465465_England_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_465516_England_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_465529_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_465540_England_20200430_null_1":"test",
"epi_isl_465545_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_465551_England_20200502_null_1":"test",
"epi_isl_465558_England_20200502_null_7":"test",
"epi_isl_465573_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_465574_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_465578_England_20200502_null_1":"test",
"epi_isl_465604_England_20200504_null_2":"test",
"epi_isl_465632_England_20200505_null_1":"test",
"epi_isl_465643_England_20200506_null_1":"test",
"epi_isl_465675_England_20200518_null_1":"test",
"epi_isl_465712_England_20200430_null_3":"test",
"epi_isl_465716_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_465719_England_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_465833_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_465840_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_465850_England_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_465851_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_465882_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_465894_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_465905_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_465917_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_465918_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_465958_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_465968_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_465974_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_466013_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_466031_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_466037_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_466123_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_466197_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_466202_England_20200402_null_7":"test",
"epi_isl_466240_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_466242_England_20200403_null_4":"test",
"epi_isl_466283_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_466285_England_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_466288_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_466304_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_466352_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_466358_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_466368_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_466373_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_466384_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_466387_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_466399_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_466400_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_466411_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_466416_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_466428_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_466477_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_466515_England_20200414_null_37":"test",
"epi_isl_466542_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_466544_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_466561_England_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_466567_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_466607_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_466609_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_466672_Nebraska_20200504_null_25":"test",
"epi_isl_466848_Telangana_20200513_null_2":"test",
"epi_isl_466882_Bavaria_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_466925_Bavaria_20200526_null_12":"test",
"epi_isl_466927_Basel_Stadt_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_466932_Graub_nden_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_466940_Basel_Stadt_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_466946_Basel_Stadt_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_466961_Vaud_20200311_null_51":"test",
"epi_isl_466978_Vaud_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_467008_Vaud_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_467156_Basque_Country_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_467231_Madrid_20200402_null_3":"test",
"epi_isl_467262_Galicia_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_467299_Morocco_20200521_null_1":"test",
"epi_isl_467421_New_York_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_467613_New_Mexico_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_467652_New_Mexico_20200402_null_3":"test",
"epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_467846_Georgia_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_467961_California_20200319_null_8":"test",
"epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_3":"test",
"epi_isl_468114_Oregon_20200506_null_2":"test",
"epi_isl_468206_Geneva_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_468228_Basel_Landschaft_20200420_null_3":"test",
"epi_isl_468236_Bern_20200420_null_5":"test",
"epi_isl_468238_Bern_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_468239_Bern_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_468249_Uri_20200426_null_1":"test",
"epi_isl_468251_Basel_Landschaft_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_468253_Vaud_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_468257_Bern_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_468269_Luzern_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_468272_Graubunden_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_468277_Ticino_20200428_null_4":"test",
"epi_isl_468283_Basel_Landschaft_20200430_null_1":"test",
"epi_isl_468286_Bern_20200430_null_1":"test",
"epi_isl_468288_Basel_Landschaft_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_468289_Vaud_20200501_null_2":"test",
"epi_isl_468290_Basel_Landschaft_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_468294_Bern_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_468302_Zurich_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_468304_Zurich_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_468348_California_20200425_null_1":"test",
"epi_isl_468353_California_20200516_null_1":"test",
"epi_isl_468365_California_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_468371_California_20200412_null_3":"test",
"epi_isl_468417_California_20200411_null_19":"test",
"epi_isl_468436_California_20200506_null_1":"test",
"epi_isl_468460_California_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_468480_California_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_468513_California_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_468528_California_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_468548_California_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_468601_California_20200422_null_3":"test",
"epi_isl_468691_British_Columbia_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_468777_Aragon_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_468949_Basque_Country_20200410_null_29":"test",
"epi_isl_469024_Gujarat_20200527_null_1":"test",
"epi_isl_469034_Gujarat_20200605_null_2":"test",
"epi_isl_469071_Vastra_Gotaland_20200527_null_1":"test",
"epi_isl_469111_Singapore_20200408_null_7":"test",
"epi_isl_469113_Singapore_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_469213_British_Columbia_20200401_null_34":"test",
"epi_isl_469244_Jeddah_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_469289_Kanto_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_469408_England_20200515_null_1":"test",
"epi_isl_469499_England_20200503_null_3":"test",
"epi_isl_469549_England_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_469595_England_20200422_null_10":"test",
"epi_isl_469821_England_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_469918_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_469977_Scotland_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_470000_Scotland_20200330_null_4":"test",
"epi_isl_470088_Northern_Ireland_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_470119_England_20200417_null_3":"test",
"epi_isl_470125_England_20200417_null_8":"test",
"epi_isl_470126_England_20200417_null_5":"test",
"epi_isl_470158_England_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_470183_England_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_470184_England_20200421_null_75":"test",
"epi_isl_470196_England_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_470216_England_20200420_null_8":"test",
"epi_isl_470238_England_20200417_null_7":"test",
"epi_isl_470298_England_20200419_null_6":"test",
"epi_isl_470345_England_20200419_null_7":"test",
"epi_isl_470371_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_470385_England_20200405_null_10":"test",
"epi_isl_470430_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_470572_Amazonas_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_470573_Ceara_20200402_null_10":"test",
"epi_isl_470599_Mato_Grosso_20200319_null_19":"test",
"epi_isl_470689_Utah_20200413_null_3":"test",
"epi_isl_470842_Western_Australia_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_471151_Wisconsin_20200612_null_1":"test",
"epi_isl_471266_Wisconsin_20200331_null_12":"test",
"epi_isl_471402_Kinshasa_20200426_null_2":"test",
"epi_isl_471424_Valcea_20200607_null_20":"test",
"epi_isl_471433_Liege_20200523_null_6":"test",
"epi_isl_471512_England_20200604_null_1":"test",
"epi_isl_471620_Telangana_20200526_null_1":"test",
"epi_isl_471630_Telangana_20200601_null_5":"test",
"epi_isl_471692_Michigan_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_471712_Michigan_20200516_null_1":"test",
"epi_isl_471725_Michigan_20200427_null_9":"test",
"epi_isl_471753_Michigan_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_471767_Michigan_20200430_null_8":"test",
"epi_isl_471790_Michigan_20200422_null_39":"test",
"epi_isl_471822_Michigan_20200519_null_2":"test",
"epi_isl_471888_Michigan_20200508_null_1":"test",
"epi_isl_471896_Michigan_20200515_null_12":"test",
"epi_isl_471903_Michigan_20200516_null_4":"test",
"epi_isl_471949_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_472008_England_20200421_null_3":"test",
"epi_isl_472078_England_20200608_null_6":"test",
"epi_isl_472131_England_20200603_null_27":"test",
"epi_isl_472151_Northern_Ireland_20200329_null_8":"test",
"epi_isl_472322_England_20200505_null_35":"test",
"epi_isl_472510_Wales_20200503_null_3":"test",
"epi_isl_472511_Wales_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_472519_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_472640_Wales_20200505_null_3":"test",
"epi_isl_472708_Wales_20200506_null_2":"test",
"epi_isl_472852_Wales_20200520_null_1":"test",
"epi_isl_472891_Wales_20200519_null_3":"test",
"epi_isl_472992_Wales_20200519_null_1":"test",
"epi_isl_473012_Wales_20200520_null_10":"test",
"epi_isl_473059_Wales_20200423_null_17":"test",
"epi_isl_473060_Wales_20200529_null_1":"test",
"epi_isl_473106_Wales_20200601_null_1":"test",
"epi_isl_473145_Wales_20200513_null_4":"test",
"epi_isl_473159_Wales_20200528_null_2":"test",
"epi_isl_473223_Wales_20200603_null_3":"test",
"epi_isl_473310_England_20200505_null_10":"test",
"epi_isl_473316_England_20200503_null_2":"test",
"epi_isl_473371_England_20200529_null_19":"test",
"epi_isl_473375_England_20200531_null_6":"test",
"epi_isl_473394_England_20200515_null_4":"test",
"epi_isl_473437_England_20200603_null_3":"test",
"epi_isl_473439_England_20200602_null_9":"test",
"epi_isl_473446_England_20200606_null_5":"test",
"epi_isl_473447_England_20200602_null_62":"test",
"epi_isl_473462_England_20200531_null_5":"test",
"epi_isl_473477_England_20200602_null_3":"test",
"epi_isl_473488_England_20200604_null_40":"test",
"epi_isl_473507_England_20200612_null_12":"test",
"epi_isl_473546_Scotland_20200418_null_4":"test",
"epi_isl_473579_Scotland_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_473623_Scotland_20200422_null_12":"test",
"epi_isl_473627_Scotland_20200422_null_8":"test",
"epi_isl_473700_Scotland_20200516_null_2":"test",
"epi_isl_473747_Scotland_20200525_null_1":"test",
"epi_isl_473811_Scotland_20200514_null_28":"test",
"epi_isl_473815_Scotland_20200518_null_47":"test",
"epi_isl_473829_Scotland_20200412_null_27":"test",
"epi_isl_473947_Scotland_20200606_null_6":"test",
"epi_isl_473993_Wales_20200429_null_2":"test",
"epi_isl_474044_Wales_20200423_null_13":"test",
"epi_isl_474116_Wales_20200510_null_37":"test",
"epi_isl_474127_Wales_20200502_null_5":"test",
"epi_isl_474198_Wales_20200508_null_4":"test",
"epi_isl_474254_Wales_20200402_null_38":"test",
"epi_isl_474301_Wales_20200404_null_25":"test",
"epi_isl_474349_Wales_20200415_null_2":"test",
"epi_isl_474352_Wales_20200415_null_20":"test",
"epi_isl_474354_Wales_20200415_null_3":"test",
"epi_isl_474478_Wales_20200425_null_8":"test",
"epi_isl_474505_Wales_20200424_null_50":"test",
"epi_isl_474541_Wales_20200427_null_2":"test",
"epi_isl_474639_Wales_20200429_null_78":"test",
"epi_isl_474695_Wales_20200501_null_15":"test",
"epi_isl_474783_Wales_20200430_null_4":"test",
"epi_isl_474799_Castilla_La_Mancha_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_474814_Castilla_La_Mancha_20200514_null_1":"test",
"epi_isl_474821_Castilla_La_Mancha_20200525_null_1":"test",
"epi_isl_474824_Castilla_La_Mancha_20200520_null_6":"test",
"epi_isl_474895_Andalusia_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_474909_Andalusia_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_474958_BAT_YAM_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_474982_HOLON_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_474989_BEIT_SHEMESH_20200411_null_13":"test",
"epi_isl_475071_Ghent_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_475169_Dhaka_20200524_null_18":"test",
"epi_isl_475264_England_20200430_null_1":"test",
"epi_isl_475295_England_20200330_null_759":"test",
"epi_isl_475341_England_20200324_null_171":"test",
"epi_isl_475346_England_20200429_null_32":"test",
"epi_isl_475347_England_20200525_null_1":"test",
"epi_isl_475492_England_20200324_null_19":"test",
"epi_isl_475497_England_20200528_null_7":"test",
"epi_isl_475521_Uppsala_20200519_null_5":"test",
"epi_isl_475572_London_20200317_null_13":"test",
"epi_isl_475579_California_20200402_null_406":"test",
"epi_isl_475586_California_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_475587_California_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_475597_California_20200405_null_3":"test",
"epi_isl_475654_California_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_475664_California_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_475686_California_20200403_null_310":"test",
"epi_isl_475701_California_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_475721_Donostia_San_Sebatian_20200327_null_4":"test",
"epi_isl_475736_Utah_20200512_null_47687":"test",
"epi_isl_475752_Egypt_20200501_null_30":"test",
"epi_isl_475753_Egypt_20200501_null_460":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":60
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":14
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":75
}
}
}