{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7910763680017, 460.9853865202301, 1, 0, 0.2970388347121894, 0.00513370539680569, 0, -0.008107983971198131, 1, 0.2970388347121895, 0.001515576823028651],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.00151522510078229],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001515409614928128],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.4511760998545, 452.9698476864987, 0, 1, 0.2938026181109781, 0, 0.002207652463199056, 0.003486684451494151, 0.7061973818890219, 1, 0.001515745348986144],
[188.9784917657954, 452.4425320205579, 0, 1, 0.2946247234776342, 0, 0.002210225452355488, 0.003490748135174053, 0.7053752765223658, 1, 0.001515142252015943],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9511760998545, 452.4698476864987, 0, 0, 0.2945821373057941, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005004211497165295],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3525556578111, 452.0684681285422, 1, 0, 0.2952079034454618, 0.005281153964497593, 0, -0.008340858772343897, 1, 0.2952079034454618, 0.000574095549089068],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004402030244093041],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.5672474153271, 452.8537763710262, 0, 0, 0.2939835777477348, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004567017325457204],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.6605913155473, 452.7604324708059, 1, 0, 0.2941291044716162, 0.005300524041756203, 0, -0.008371451154219061, 1, 0.2941291044716161, 0.001058536390151454],
[189.1553147737241, 452.2657090126291, 1, 0, 0.2949003973351653, 0.005286660864888963, 0, -0.008349556166653277, 1, 0.2949003973351653, 0.001518336241106778],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.7539352157676, 452.7657090126291, 0, 1, 0.294229392527482, 0, 0.002208647828433727, 0.00348825649444255, 0.705770607472518, 1, 0.001518218004609835],
[188.7539352157676, 452.6670885705857, 1, 0, 0.2942746311954975, 0.005297902789983607, 0, -0.008367311246352533, 1, 0.2942746311954976, 0.001515823937814687],
[188.7539352157676, 452.6670885705857, 0, 1, 0.2942746311954975, 0, 0.002209129016111511, 0.003489016464420772, 0.7057253688045024, 1, 0.001516188724653039],
[188.7539352157676, 452.6670885705857, 0, 0, 0.2942746311954975, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000408108798123382],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.2539352157676, 452.1670885705857, 0, 1, 0.2950541503903135, 0, 0.00221157183987285, 0.003492874569701555, 0.7049458496096865, 1, 0.0008165391770058509],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000289974767481972],
[189.0672474153271, 452.3537763710262, 0, 1, 0.2947630969425508, 0, 0.002210659117344889, 0.00349143304958015, 0.7052369030574492, 1, 0.00151632620310285],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2955426161373669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006676590387493364],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.0008479566924006551],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 1, 0.2958336695851296, 0, 0.002214020072095029, 0.003496741216904869, 0.7041663304148704, 1, 0.001515610774711793],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 1, 0.2958336695851296, 0, 0.002214020072095029, 0.003496741216904869, 0.7041663304148704, 1, 0.001133313023048715],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003810458047057181],
[189.4511760998545, 451.9698476864987, 0, 1, 0.2953616565006101, 0, 0.002212536975903829, 0.003494398869766392, 0.7046383434993899, 1, 0.001515142252015943],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.352555657811, 452.0684681285422, 1, 0, 0.2952079034454618, 0.005281153964497594, 0, -0.008340858772343899, 1, 0.2952079034454618, 0.0007638905439717331],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007511063367350825],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0198412389064, 451.4011825474469, 0, 1, 0.2962482272832374, 0, 0.002215324280624563, 0.003498801035502786, 0.7037517727167626, 1, 0.001515609139957031],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0198412389064, 451.4011825474469, 0, 0, 0.2962482272832374, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006097806009245811],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.0296667251997, 460.7467961630321, 0, 1, 0.2974026635024866, 0, 0.002170389481441249, 0.003427832679633745, 0.7025973364975133, 1, 0.0009048078342557115],
[194.9342905363605, 460.7308839667083, 1, 0, 0.2973076779380603, 0.00512993377023871, 0, -0.008102027204031583, 1, 0.2973076779380603, 0.001515428977753497],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.2539352157676, 452.1670885705857, 0, 1, 0.2950541503903135, 0, 0.00221157183987285, 0.003492874569701555, 0.7049458496096865, 1, 0.001515905190423427],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515520119463949],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515883083781877],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001517338860907329],
[189.9603347872111, 451.6832657694682, 0, 0, 0.2960527224496663, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006069464979647019],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9999134993521, 460.8878377740428, 0, 1, 0.2973068381300963, 0, 0.002169725295485591, 0.003426783688960123, 0.7026931618699037, 1, 0.0009075205131635048],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6605913155473, 451.7604324708059, 1, 0, 0.2956881428612482, 0.005272576622606077, 0, -0.008327312036566037, 1, 0.2956881428612482, 0.0007707749628832563],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007441744357290728],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004174826963661978],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001098242567957531],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7637607020609, 461.0127021861709, 0, 1, 0.2969971807836227, 0, 0.002169137629522775, 0.003425855551126213, 0.7030028192163773, 1, 0.001515358121083254],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7637607020609, 461.0127021861709, 0, 1, 0.2969971807836227, 0, 0.002169137629522775, 0.003425855551126213, 0.7030028192163773, 1, 0.001515429911518363],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004531331827679506],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001062830946267513],
[189.1382710735575, 451.8988240282683, 0, 0, 0.2950504308077737, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004531219530581896],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5888816425253, 460.9956169034429, 1, 0, 0.2968173928366323, 0.005139039761979191, 0, -0.008116408869781166, 1, 0.2968173928366323, 0.00106284203991048],
[189.063117428097, 452.2398836968677, 0, 0, 0.2948109038885599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004531192950785664],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.551304819795, 461.1661467377425, 1, 0, 0.2966999038346071, 0.005140032347386513, 0, -0.00811797652237331, 1, 0.2966999038346071, 0.001062845329780835],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3700065312401, 452.0510172551132, 1, 0, 0.2952351100270703, 0.005280667294242456, 0, -0.00834009014338627, 1, 0.2952351100270703, 0.001515637398997941],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3700065312401, 452.0510172551132, 0, 0, 0.2952351100270703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006142157578054407],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.000901506523603508],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3700065312401, 452.0510172551132, 0, 0, 0.2952351100270703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006051290453430682],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.0009106375323490093],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.4751242283219, 0, 1, 0.2959222331256694, 0, 0.002214961459303516, 0.003498228008959952, 0.7040777668743305, 1, 0.001518031144704102],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.4751242283219, 0, 1, 0.2959222331256694, 0, 0.002214961459303516, 0.003498228008959952, 0.7040777668743305, 1, 0.001515892951780068],
[189.897399728422, 451.3569956019066, 0, 1, 0.2961342660748553, 0, 0.00221554115643306, 0.003499143561114039, 0.7038657339251447, 1, 0.002023304178905731],
[190.1678956717898, 451.2682598581151, 0, 3, 0.2964720557647515, 0, 0.006647930437082459, 0.0104994948598031, 0.3482122593560937, 1, 0.00458592525835694],
[189.8183957285867, 451.3324515588342, 0, 3, 0.2960588705944471, 0, 0.006646984921289068, 0.01049800154721408, 0.3488261396938409, 1, 0.004063621683220035],
[189.7539352157676, 451.2831598860582, 1, 0, 0.2960108497085118, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2960108497085119, 0.001515466290542277],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.6877848323378, 0, 1, 0.2972869464514414, 0, 0.002170667495262413, 0.003428271764355508, 0.7027130535485586, 1, 0.001515562150723545],
[189.1382710735575, 451.7068596860046, 0, 1, 0.2951388127883272, 0, 0.002213825135830638, 0.003496433341796167, 0.7048611872116728, 1, 0.001515773400877466],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5888816425253, 460.9956169034429, 1, 0, 0.2968173928366323, 0.005139039761979191, 0, -0.008116408869781166, 1, 0.2968173928366323, 0.001515215127583279],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2971129487687174, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7028870512312826, 1, 0.001515527817674164],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8591368909001, 460.9173259973318, 1, 0, 0.2971426208752343, 0.005131912292929283, 0, -0.008105152009415195, 1, 0.2971426208752344, 0.001515365303139107],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9406230162081, 451.4804007701452, 0, 0, 0.2961247230328922, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004534065989653037],
[194.9900576138506, 460.7864052743813, 1, 0, 0.297342263177695, 0.00512846661125848, 0, -0.008099710027533239, 1, 0.297342263177695, 0.00106124836335796],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6787815703071, 451.7422422160462, 0, 0, 0.2957165021667358, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004523819062168397],
[194.8591368909, 460.9173259973318, 1, 0, 0.2971426208752343, 0.005131912292929284, 0, -0.008105152009415197, 1, 0.2971426208752344, 0.001063122623200938],
[189.9406230162081, 451.4804007701452, 0, 0, 0.2961247230328922, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004534066034375933],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9900576138506, 460.7864052743813, 1, 0, 0.297342263177695, 0.00512846661125848, 0, -0.008099710027533239, 1, 0.297342263177695, 0.00106124836335796],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.2831598860582, 0, 0, 0.2960108497085118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004531222212502621],
[194.8967137136303, 460.6877848323378, 0, 1, 0.2972869464514414, 0, 0.002170667495262413, 0.003428271764355508, 0.7027130535485586, 1, 0.001062841797989522],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9406230162081, 451.4804007701452, 0, 0, 0.2961247230328922, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004534066295833783],
[194.9900576138506, 460.7864052743813, 1, 0, 0.297342263177695, 0.00512846661125848, 0, -0.008099710027533239, 1, 0.297342263177695, 0.001061248335574757],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004523925987164407],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0010631120189914],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2955426161373669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004531062188977582],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.001062864151599154],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2955426161373669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000453109151775659],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.001062860619741492],
[189.6787815703071, 451.7422422160462, 0, 0, 0.2957165021667358, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004526084195899952],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8591368909, 460.9173259973318, 1, 0, 0.2971426208752344, 0.005131912292929284, 0, -0.008105152009415197, 1, 0.2971426208752344, 0.001062925208164913],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004657441861354018],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001050150579957551],
[189.9458995580313, 451.4751242283219, 0, 1, 0.2961329493641592, 0, 0.002214961459303516, 0.003498228008959952, 0.7038670506358408, 1, 0.001517022632478164],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515845048847705],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004556278198877841],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001058860252249795],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0993441096028, 451.3806910074447, 1, 0, 0.2963449113033056, 0.005260407418467706, 0, -0.00830809244672406, 1, 0.2963449113033056, 0.001515103593278573],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001521273068423703],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515511680811468],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.4698476864987, 1, 0, 0.2959246682287974, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2959246682287975, 0.001515551087375145],
[189.7539352157676, 451.5684681285422, 0, 1, 0.295879161910228, 0, 0.002214503603726695, 0.003497504888836951, 0.7041208380897721, 1, 0.0009547682059277132],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005601507577288361],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515688450931166],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 2, 0, 0.2958336695851296, 0.01053996586540257, 0, -0.01664643131778331, 1, 0.08751756006020361, 0.003033655757265461],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 1, 0.2958336695851296, 0, 0.002214020072095029, 0.003496741216904869, 0.7041663304148704, 1, 0.001516054241161981],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 1, 0.2958336695851296, 0, 0.002214020072095029, 0.003496741216904869, 0.7041663304148704, 1, 0.001515806672313225],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 1, 0.2958336695851296, 0, 0.002214020072095029, 0.003496741216904869, 0.7041663304148704, 1, 0.001515628823027502],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 7.267285137129452e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001443478307179569],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5566943316806, 451.7217199024674, 0, 0, 0.2955918835316799, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004529894823629076],
[194.7980932715868, 460.9070648405424, 0, 1, 0.2970818375631494, 0, 0.002169634783849462, 0.003426640738237747, 0.7029181624368506, 1, 0.001062933931275074],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001515726858001036],
[189.6605913155473, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2957311796509725, 0.005272576622606077, 0, -0.008327312036566037, 1, 0.2957311796509725, 0.001515823601877253],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6605913155473, 451.7604324708059, 1, 0, 0.2956881428612482, 0.005272576622606077, 0, -0.008327312036566037, 1, 0.2956881428612482, 0.001516206815291293],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006058125513320949],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.000909134762416761],
[189.5672474153271, 451.4751242283219, 0, 1, 0.2957171878190701, 0, 0.002214961459303516, 0.003498228008959952, 0.7042828121809299, 1, 0.00151638592997314],
[189.6232180794483, 451.5521065757701, 0, 1, 0.2957431622644167, 0, 0.002214583844117668, 0.003497631617535535, 0.7042568377355833, 1, 0.001516215532966045],
[189.4686269732836, 451.7657090126292, 0, 1, 0.2954748620595482, 0, 0.002213536751573247, 0.003495977878391912, 0.7045251379404518, 1, 0.001516128754008403],
[189.3805596148866, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2953375216935468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004527343149381053],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4739035151068, 451.7604324708059, 1, 0, 0.2954830907858143, 0.005277771669069295, 0, -0.008335516900343303, 1, 0.2954830907858144, 0.001062637441894328],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2956286598780818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000674045164443845],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8033698134101, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2970998706113887, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970998706113888, 0.0008408278865912207],
[189.6605913155473, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2957311796509725, 0.005272576622606077, 0, -0.008327312036566037, 1, 0.2957311796509725, 0.001516707056246584],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515810221783047],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001514986364994335],
[190.2266195498267, 451.1944042365265, 0, 1, 0.2965706026081054, 0, 0.00221633954368764, 0.003500404504343655, 0.7034293973918946, 1, 0.001521074834579896],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515285707718666],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.2766626310199, 452.0510172551132, 1, 0, 0.2951325329738235, 0.00528327151429874, 0, -0.008344203151991509, 1, 0.2951325329738235, 0.001516026943396676],
[189.3700065312401, 452.0510172551132, 1, 0, 0.2952351100270703, 0.005280667294242456, 0, -0.00834009014338627, 1, 0.2952351100270703, 0.001516213319410702],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5619708735038, 451.8590529128494, 0, 1, 0.2955343898060999, 0, 0.002213079484750019, 0.003495255688124507, 0.7044656101939001, 1, 0.0008620270238378753],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006531155225178126],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6605913155473, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2957311796509725, 0.005272576622606077, 0, -0.008327312036566037, 1, 0.2957311796509725, 0.001515610210809148],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515425906711807],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515924606489289],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[192.899257119315, 456.5940489829025, 0.75, 1.75, 0.2969996077048968, 0.003888039856659989, 0.003832726256284453, -8.736024967719452e-05, 0.742609825231404, 0.5856294150642067, 0.001520750661351805],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4633504314604, 451.8643294546727, 1, 0, 0.2954236287838057, 0.005278065640255616, 0, -0.008335981187535974, 1, 0.2954236287838057, 0.001515741525295357],
[189.5566943316806, 451.8643294546727, 0, 0, 0.295526163474833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004773332178189756],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6553147737241, 451.7657090126291, 0, 1, 0.2956799165299813, 0, 0.002213536751573247, 0.003495977878391912, 0.7043200834700187, 1, 0.0006672370580224759],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003701725745507295],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515679890246792],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9900576138506, 460.7864052743813, 1, 0, 0.297342263177695, 0.00512846661125848, 0, -0.008099710027533239, 1, 0.297342263177695, 0.001515622400927713],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.8741365184702, 451.982355372484, 0, 0, 0.2958202322751113, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004565819773596315],
[194.9568143649816, 461.0373825755507, 0, 1, 0.2971928948064383, 0, 0.002169021510606309, 0.003425672157214664, 0.7028071051935617, 1, 0.001058713405873988],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001515823671063719],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515476729326298],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.4526843777515, 460.7606371925559, 0, 1, 0.2978493089869564, 0, 0.002170324283977607, 0.003427729709176871, 0.7021506910130435, 1, 0.001515889009048746],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515622400927713],
[189.3700065312401, 452.0510172551132, 0, 0, 0.2952351100270703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005089868270718761],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5619708735038, 451.8590529128494, 0, 1, 0.2955343898060999, 0, 0.002213079484750019, 0.003495255688124507, 0.7044656101939001, 1, 0.0005814429312697249],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004244653833670403],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515823645100762],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515447782405842],
[194.7980932715868, 460.978369616645, 0, 1, 0.2970495348577149, 0, 0.002169299181719983, 0.003426110700676923, 0.7029504651422851, 1, 0.00151720658111294],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515647990122763],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001515370513701797],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.00151609777473026],
[189.9458995580313, 451.4751242283219, 0, 1, 0.2961329493641592, 0, 0.002214961459303516, 0.003498228008959952, 0.7038670506358409, 1, 0.001515585878332514],
[189.5394470448828, 451.7702883563074, 0, 1, 0.2955505531602616, 0, 0.00221351431418462, 0.003495942441612183, 0.7044494468397384, 1, 0.00151758717199245],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 1, 0.2958336695851296, 0, 0.002214020072095029, 0.003496741216904869, 0.7041663304148704, 1, 0.0007758365287593638],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007389699736254034],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515476082663286],
[194.9999134993521, 460.8878377740428, 0, 1, 0.2973068381300963, 0, 0.002169725295485591, 0.003426783688960123, 0.7026931618699037, 1, 0.001515477255149593],
[194.8967137136303, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2971129487687174, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7028870512312826, 1, 0.001517085706702295],
[193.9953341556738, 461.7811287325581, 0, 1, 0.2958253995595716, 0, 0.002165528077651594, 0.003420154758725279, 0.7041746004404283, 1, 0.0015172141601422],
[194.551304819795, 461.1661467377425, 1, 0, 0.2966999038346071, 0.005140032347386513, 0, -0.00811797652237331, 1, 0.2966999038346072, 0.001515627868568165],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001516000306649272],
[195.2980932715868, 460.478369616645, 0, 1, 0.2978119897921263, 0, 0.00217165466606502, 0.003429830865321713, 0.7021880102078737, 1, 0.001515371143472082],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515822985501393],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515289862203607],
[194.9332012157035, 460.7319732873653, 0, 2, 0.2973060165402931, 0, 0.004340918616369979, 0.006855885922807955, 0.4937788343904707, 1, 0.003045039897843339],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001517361201890781],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515508900672602],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001515143584598633],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001516056743893872],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515831827153648],
[194.8741898850093, 460.7909846180596, 0, 1, 0.2972160143059377, 0, 0.002170181347686045, 0.003427503960897351, 0.7027839856940623, 1, 0.001518432140076223],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515290584501146],
[195.1822255427455, 460.5942373454864, 0, 1, 0.2976353019489381, 0, 0.002171108361587928, 0.003428968052284874, 0.7023646980510618, 1, 0.00151547609525735],
[194.8967137136303, 461.0633946802576, 0, 1, 0.2971167167327188, 0, 0.002168899139549972, 0.003425478888905202, 0.7028832832672812, 1, 0.001522040105593223],
[195.220083483348, 460.9577589628404, 0, 1, 0.2975109350775701, 0, 0.002169396176886164, 0.003426263891246286, 0.7024890649224299, 1, 0.001515508905037392],
[195.0793068748959, 460.4070648405424, 1, 0, 0.2976100118822674, 0.005126120325213676, 0, -0.008096004390342807, 1, 0.2976100118822673, 0.001515647964520529],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515509541284601],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001517034805423784],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515083769675985],
[195.3967137136303, 460.3797491746016, 0, 1, 0.2979623770774661, 0, 0.002172119867984776, 0.00343056558798638, 0.7020376229225339, 1, 0.001515476109445138],
[194.8967137136303, 461.0974832269021, 0, 1, 0.2971012771494048, 0, 0.002168738794672425, 0.003425225646150401, 0.7028987228505952, 1, 0.001515925340065892],
[194.9900576138506, 460.774111828973, 1, 0, 0.2973478373780711, 0.00512846661125848, 0, -0.008099710027533239, 1, 0.2973478373780711, 0.001515289993279154],
[194.8967137136303, 461.0974832269021, 1, 0, 0.2971012771494048, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971012771494048, 0.001515380706096816],
[194.7637607020609, 461.0127021861709, 0, 1, 0.2969971807836227, 0, 0.002169137629522775, 0.003425855551126213, 0.7030028192163773, 1, 0.001517214003216479],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001515627089271093],
[194.9192375422514, 461.2586049039371, 0, 1, 0.2970524527551938, 0, 0.002167981235186415, 0.003424029184784773, 0.7029475472448062, 1, 0.001517053593300653],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.00151529059182036],
[194.8967137136303, 460.7733035074641, 0, 1, 0.2972481714806099, 0, 0.002170264623379598, 0.003427635483440297, 0.7027518285193901, 1, 0.001515380719547171],
[194.7935139279085, 460.8716605751603, 0, 1, 0.2970929698615505, 0, 0.002169801455685117, 0.00342690397355561, 0.7029070301384495, 1, 0.001516094150511744],
[194.5455789215235, 461.2308839667083, 0, 1, 0.296664473233284, 0, 0.002168111535376239, 0.003424234976073692, 0.703335526766716, 1, 0.001515660601807166],
[195.0296667251997, 460.7467961630321, 0, 1, 0.2974026635024866, 0, 0.002170389481441249, 0.003427832679633745, 0.7025973364975133, 1, 0.001515647213456937],
[195.088678055894, 460.6877848323378, 0, 1, 0.2974926504630347, 0, 0.002170667495262413, 0.003428271764355508, 0.7025073495369653, 1, 0.001515509541614098],
[194.8591368909, 461.0502790089012, 1, 0, 0.2970823899876249, 0.005131912292929284, 0, -0.008105152009415197, 1, 0.2970823899876249, 0.001515381376497015],
[194.8967137136303, 460.6620151223011, 1, 0, 0.2972986326636308, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2972986326636309, 0.001518431923177557],
[194.9900576138506, 460.7864052743813, 1, 0, 0.297342263177695, 0.00512846661125848, 0, -0.008099710027533239, 1, 0.297342263177695, 0.001515289983467783],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515822986761291],
[194.7047493713666, 461.0127021861709, 0, 1, 0.2969339140034795, 0, 0.002169137629522775, 0.003425855551126213, 0.7030660859965205, 1, 0.001515470279929285],
[195.088678055894, 460.6877848323378, 0, 1, 0.2974926504630347, 0, 0.002170667495262413, 0.003428271764355508, 0.7025073495369653, 1, 0.001515085633287559],
[194.8967137136303, 460.978369616645, 1, 0, 0.2971552337741229, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971552337741229, 0.001517555234601757],
[194.9902612004818, 460.6928577875298, 0, 1, 0.2973849037038377, 0, 0.002170643592788662, 0.003428234013674653, 0.7026150962961624, 1, 0.001515730291591949],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.5566943316806, 450.8643294546727, 2, 0, 0.297085201864465, 0.01049556409977823, 0, -0.01657630481535505, 1, 0.08825961716684982, 0.003033446050704592],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9902612004818, 460.5942373454863, 0, 1, 0.297429639707702, 0, 0.002171108361587928, 0.003428968052284874, 0.7025703602922979, 1, 0.001515910612305236],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.00151636615329611],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.5672474153271, 452.8537763710262, 0, 0, 0.2939835777477348, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004742802618515002],
[189.0672474153271, 452.3537763710262, 0, 1, 0.2947630969425508, 0, 0.002210659117344889, 0.00349143304958015, 0.7052369030574492, 1, 0.001040913496545654],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 1, 0, 0.2955426161373669, 0.005275172866803715, 0, -0.008331412448395836, 1, 0.2955426161373669, 0.001515671170209383],
[189.7592117575908, 451.6618120287624, 0, 1, 0.2958418959163965, 0, 0.002214045937397777, 0.003496782067605072, 0.7041581040836036, 1, 0.001515679104750293],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4959426392245, 452.3264607050854, 1, 0, 0.295246693870186, 0.005277157843447179, 0, -0.008334547446913363, 1, 0.295246693870186, 0.001516439750669234],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2955426161373669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002866165216417296],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6605913155473, 451.7604324708059, 1, 0, 0.2956881428612482, 0.005272576622606077, 0, -0.008327312036566037, 1, 0.2956881428612482, 0.0009544276270195165],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002735825048475904],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.001516124006323226],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.5566943316806, 450.8643294546727, 1, 0, 0.297085201864465, 0.005247782049889114, 0, -0.008288152407677529, 1, 0.297085201864465, 0.001515374792836812],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.2980932715868, 460.478369616645, 0, 1, 0.2978119897921263, 0, 0.00217165466606502, 0.003429830865321713, 0.7021880102078737, 1, 0.001521498448797361],
[193.9537400321915, 460.993553064218, 4, 11, 0.2961364098708339, 0.02062347443950345, 0.02386150506201908, 0.005114025514970377, 0.5287867431656523, 0.6917461541997261, 0.02463835820869991],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006544422274946836],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0008606113212258907],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001516104709371525],
[194.8967137136303, 460.781128732558, 0, 1, 0.2972446239551331, 0, 0.002170227766815533, 0.003427577273549471, 0.7027553760448668, 1, 0.001515659768884205],
[189.7539352157676, 452.1025566751866, 1, 1, 0.2956329609703552, 0.005269982932701283, 0.00221188751365202, -0.004829842525726908, 0.9126011523879005, 0.5038670743286109, 0.00304472172776531],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 461.0974832269021, 1, 0, 0.2971012771494048, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971012771494048, 0.001515391345228007],
[194.9240293795712, 460.8524335086607, 0, 1, 0.2972415760716213, 0, 0.002169891981228319, 0.003427046946242302, 0.7027584239283786, 1, 0.00151538068760015],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004565710147554525],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001058724305601532],
[194.8591368909, 461.0502790089012, 1, 0, 0.2970823899876249, 0.005131912292929284, 0, -0.008105152009415197, 1, 0.2970823899876249, 0.001515380744358557],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.8719578771562, 451.5490659091971, 0, 0, 0.296017671445081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000456570984337026],
[194.9557250443246, 460.8207378439072, 0, 1, 0.2972899091036028, 0, 0.002170041228350118, 0.003427282661613122, 0.7027100908963972, 1, 0.001058724330318562],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515380729969575],
[189.9410301894705, 451.0960649123552, 0, 0, 0.2963027126523766, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004565819636784877],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9902612004818, 460.5942373454864, 0, 1, 0.297429639707702, 0, 0.002171108361587928, 0.003428968052284874, 0.7025703602922979, 1, 0.001058713425662799],
[195.1487787072453, 460.845418233287, 0, 1, 0.2974855259656147, 0, 0.002169925012672655, 0.003427099114880843, 0.7025144740343853, 1, 0.001515380743514755],
[194.9953341556738, 460.781128732558, 0, 1, 0.2973503094283945, 0, 0.002170227766815533, 0.003427577273549471, 0.7026496905716055, 1, 0.001515621752453471],
[189.7539352157676, 451.7851112319743, 0, 0, 0.2957792456537943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004565709880715349],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.9387605052959, 0, 1, 0.2971731804317913, 0, 0.002169485592627897, 0.003426405111153683, 0.7028268195682088, 1, 0.001058724329193238],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515823004940339],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.001515759566028805],
[194.8591368909, 461.0502790089012, 1, 0, 0.2970823899876249, 0.005131912292929284, 0, -0.008105152009415197, 1, 0.2970823899876249, 0.001515380726090733],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.9387605052959, 0, 1, 0.2971731804317913, 0, 0.002169485592627897, 0.003426405111153683, 0.7028268195682088, 1, 0.001518343602543801],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.2498052285375, 450.9486417874897, 0, 0, 0.2967097099406762, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004475885731064624],
[190.0018702221525, 451.3078651790377, 0, 1, 0.2962716137519591, 0, 0.002215782345391413, 0.003499524486012763, 0.7037283862480409, 1, 0.0006620045040464594],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004067438197755479],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.001515790955178566],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0071467639758, 452.3548656916832, 0, 1, 0.2946965100728396, 0, 0.002210653793832698, 0.003491424641822366, 0.7053034899271604, 1, 0.001516464126075494],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.551304819795, 461.1661467377425, 1, 0, 0.2966999038346071, 0.005140032347386513, 0, -0.00811797652237331, 1, 0.2966999038346071, 0.001515595253602377],
[193.9953341556738, 461.7811287325581, 0, 1, 0.2958253995595716, 0, 0.002165528077651594, 0.003420154758725279, 0.7041746004404283, 1, 0.001517115245017309],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515759566028805],
[194.8967137136303, 460.6877848323378, 0, 1, 0.2972869464514414, 0, 0.002170667495262413, 0.003428271764355508, 0.7027130535485586, 1, 0.001515823656381838],
[195.088678055894, 460.6877848323378, 0, 1, 0.2974926504630347, 0, 0.002170667495262413, 0.003428271764355508, 0.7025073495369653, 1, 0.001516842810109686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515758892942006],
[190.137863900295, 451.2831598860582, 0, 0, 0.2964322291431888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004133702302355341],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.088678055894, 460.6877848323378, 0, 1, 0.2974926504630347, 0, 0.002170667495262413, 0.003428271764355508, 0.7025073495369653, 1, 0.001104239378461515],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515823403768756],
[195.0296667251997, 460.7467961630321, 0, 1, 0.2974026635024866, 0, 0.002170389481441249, 0.003427832679633745, 0.7025973364975133, 1, 0.001515621752453471],
[194.8031662267788, 461.0666405616733, 0, 1, 0.2970149932357104, 0, 0.002168883870630493, 0.003425454773739872, 0.7029850067642895, 1, 0.00151547611944125],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515964673713376],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.001515759566028805],
[195.1822255427455, 460.5942373454864, 0, 1, 0.2976353019489381, 0, 0.002171108361587928, 0.003428968052284874, 0.7023646980510618, 1, 0.001515476112772548],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.00151596467165892],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515622412603482],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006825749957017855],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.0008323217363356117],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 1, 0.2958336695851296, 0, 0.002214020072095029, 0.003496741216904869, 0.7041663304148704, 1, 0.001516323420013872],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006872424446499499],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0008284016834641011],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515622418807399],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515332165949975],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001514777822785036],
[189.7539352157676, 451.5957837944831, 0, 1, 0.2958665601484964, 0, 0.002214369655087592, 0.003497293335322507, 0.7041334398515036, 1, 0.001516445759772035],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.5957837944831, 0, 1, 0.2958665601484964, 0, 0.002214369655087592, 0.003497293335322507, 0.7041334398515036, 1, 0.0007641011650709688],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007510223253376211],
[195.0023510592588, 460.774111828973, 1, 0, 0.2973610095739199, 0.005128143299647255, 0, -0.008099199401161272, 1, 0.2973610095739199, 0.001515621750381859],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.8247552873667, 451.19488894103, 0, 1, 0.2961293885398179, 0, 0.002216337162743653, 0.003500400743968994, 0.703870611460182, 1, 0.001516884024257182],
[194.9900576138506, 460.7864052743813, 1, 0, 0.297342263177695, 0.00512846661125848, 0, -0.008099710027533239, 1, 0.297342263177695, 0.001515144192974715],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515622388261599],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8693980476894, 460.9070648405424, 0, 1, 0.297158268214488, 0, 0.002169634783849462, 0.003426640738237747, 0.702841731785512, 1, 0.001517410266943306],
[194.7980932715868, 460.978369616645, 0, 1, 0.2970495348577149, 0, 0.002169299181719983, 0.003426110700676923, 0.7029504651422851, 1, 0.001515897290141366],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3525556578111, 452.0684681285422, 0, 1, 0.2952079034454618, 0, 0.002212054302614306, 0.003493636553468068, 0.7047920965545382, 1, 0.0007743612321672046],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007403178963170261],
[194.0663578139042, 461.3087255163712, 0, 2, 0.2961149466161574, 0, 0.004335491373507573, 0.006847314336646512, 0.4954541683771749, 1, 0.003040157098504348],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004531302286572628],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001062834502172686],
[190.4447530034381, 451.0942934443038, 0, 0, 0.2968560589693604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004534285093056266],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.2421226074656, 460.5933516114606, 1, 0, 0.2976998504693439, 0.005121845566135852, 0, -0.008089252994342308, 1, 0.2976998504693439, 0.001061226696641952],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8591368909001, 460.9173259973318, 1, 0, 0.2971426208752343, 0.005131912292929283, 0, -0.008105152009415195, 1, 0.2971426208752344, 0.001515370084216494],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.001516004215507799],
[189.9458995580313, 451.4751242283219, 0, 1, 0.2961329493641592, 0, 0.002214961459303516, 0.003498228008959952, 0.7038670506358409, 1, 0.001515028191760417],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001515561253689759],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005603562398324677],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.0009553568075693772],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.0009349937785910713],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005798219546751163],
[189.8472791159878, 451.5737446703654, 1, 0, 0.2959791963090109, 0.005267391793321656, 0, -0.008319123309422161, 1, 0.2959791963090108, 0.001516071923453134],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515836063735867],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006086449190956313],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0009062590401936755],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 2, 0, 0.2958336695851296, 0.01053996586540257, 0, -0.01664643131778331, 1, 0.08751756006020361, 0.003036319762674833],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515995408399861],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001516073836355814],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9458995580313, 451.4751242283219, 0, 1, 0.2961329493641592, 0, 0.002214961459303516, 0.003498228008959952, 0.7038670506358409, 1, 0.001515064633387716],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0015210543319557],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.612457238704, 1, 0, 0.295858868578365, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.295858868578365, 0.001516200516059847],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8524335086607, 1, 0, 0.2972123022030598, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2972123022030597, 0.001515843885474092],
[194.8967137136303, 460.9510539507042, 1, 0, 0.2971676101112831, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.297167610111283, 0.00151581935116083],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7980932715868, 460.9783696166451, 0, 1, 0.2970495348577149, 0, 0.002169299181719983, 0.003426110700676922, 0.7029504651422851, 1, 0.001515583447175784],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515801567934081],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 1, 0.2958336695851296, 0, 0.002214020072095029, 0.003496741216904869, 0.7041663304148704, 1, 0.001270385999704612],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000244662142280959],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515940696997805],
[189.1431404421182, 452.277883344235, 0, 1, 0.2948814170848237, 0, 0.002211030069845105, 0.003492018918205899, 0.7051185829151763, 1, 0.001515371149497061],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9511760998545, 452.4698476864987, 0, 0, 0.2945821373057941, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005737186053315669],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.4953341556738, 461.2811287325581, 1, 0, 0.296587854493983, 0.005141511514099364, 0, -0.008120312663439369, 1, 0.2965878544939831, 0.0009419945988162246],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9458995580313, 451.4751242283219, 0, 1, 0.2961329493641592, 0, 0.002214961459303516, 0.003498228008959952, 0.7038670506358409, 1, 0.0007684563550527852],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006148186027909948],
[189.1386847599463, 449.285797444911, 1, 0.5, 0.2962585082995856, 0.005287125694403522, 0.001112877377481106, -0.00659265303117446, 0.9631576123656425, 0.4096361777919, 0.00151690189624855],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001311240265733691],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9146075312818, 452.1627905377187, 1.666666666666667, 10.33333333333333, 0.2946829947527624, 0.008822328185451133, 0.02285312624031885, 0.0221597222549565, 0.2075626382310014, 0.934182127147374, 0.01851951784999853],
[189.6787815703071, 451.7422422160462, 0, 0, 0.2957165021667358, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006656895688722707],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8591368909001, 460.9173259973318, 1, 0, 0.2971426208752343, 0.005131912292929283, 0, -0.008105152009415195, 1, 0.2971426208752344, 0.0008495724272691059],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001515529399425397],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0015155095492586],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 1, 0, 0.2955426161373669, 0.005275172866803715, 0, -0.008331412448395836, 1, 0.2955426161373669, 0.001515599570964827],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2955426161373669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005172272892047615],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.0009985171061070103],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7592117575908, 451.6618120287624, 0, 1, 0.2958418959163965, 0, 0.002214045937397777, 0.003496782067605072, 0.7041581040836036, 1, 0.001515735018444873],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2955426161373669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005405195016374255],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6605913155473, 451.7604324708059, 1, 0, 0.2956881428612482, 0.005272576622606077, 0, -0.008327312036566037, 1, 0.2956881428612482, 0.000689396379083227],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000284885764340669],
[189.6605913155473, 451.7604324708059, 1, 0, 0.2956881428612482, 0.005272576622606077, 0, -0.008327312036566037, 1, 0.2956881428612482, 0.00151538804505788],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.5684681285422, 0, 1, 0.295879161910228, 0, 0.002214503603726695, 0.003497504888836951, 0.7041208380897721, 1, 0.001515082693819753],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.7811287325581, 0, 1, 0.2972446239551331, 0, 0.002170227766815533, 0.003427577273549471, 0.7027553760448668, 1, 0.00151650819432021],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001515492246539325],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005743990294492864],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.0009411569800615776],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 1, 0, 0.2955426161373669, 0.005275172866803715, 0, -0.008331412448395836, 1, 0.2955426161373669, 0.001515806942257432],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2955426161373669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006587685133981194],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.0008564002576661217],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0230547185341, 452.3979690678192, 0, 1, 0.2946941988317092, 0, 0.002210443168125915, 0.003491091987390036, 0.7053058011682909, 1, 0.001516569792630839],
[194.638517550456, 461.1379453377759, 1, 0, 0.296806196265738, 0.005137729225361424, 0, -0.008114339056835307, 1, 0.296806196265738, 0.001517305057245093],
[194.8591368909001, 460.9173259973318, 1, 0, 0.2971426208752343, 0.005131912292929283, 0, -0.008105152009415195, 1, 0.2971426208752344, 0.00151519145935062],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9568143649816, 460.9309369084132, 0, 1, 0.2972411269862508, 0, 0.002169522416323944, 0.003426463269133978, 0.7027588730137493, 1, 0.00151601441757822],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0426605245105, 452.3783632618428, 0, 1, 0.2947247650358861, 0, 0.002210538967402352, 0.003491243289215475, 0.7052752349641139, 1, 0.001516116446072337],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5070476843293, 451.8914713012015, 2, 5, 0.2954591288799098, 0.01055369720777611, 0.01106460359962697, 0.0008069066133960289, 0.6573491632195716, 0.6608837400768717, 0.6826676063614805],
[194.7910763680018, 460.9853865202301, 1, 0, 0.2970388347121894, 0.00513370539680569, 0, -0.008107983971198131, 1, 0.2970388347121895, 0.001515834432694567],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.001515934955076816],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7266195498267, 451.6944042365266, 0, 1, 0.2957910834132894, 0, 0.002213886181942509, 0.003496529755761966, 0.7042089165867107, 1, 0.001517154597089897],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.00151486663235383],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001515450893633828],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515281409484459],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.1553147737241, 451.2657090126291, 1, 0, 0.2964594357247973, 0.005258859060499851, 0, -0.008305647027555119, 1, 0.2964594357247974, 0.001516090320179257],
[189.9073797673391, 451.6249324041771, 0, 1, 0.2960215349473569, 0, 0.002214226736058629, 0.003497067614306897, 0.7039784650526431, 1, 0.001521765813212756],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0015151599457907],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.2527886611744, 451.3908118955048, 0, 1, 0.2965085111050967, 0, 0.002215375177444897, 0.003498881420053817, 0.7034914888949033, 1, 0.001514564905098231],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.0501582652019, 460.837593008193, 0, 1, 0.297383443869039, 0, 0.002169961858954119, 0.003427157308531708, 0.702616556130961, 1, 0.001520952109697683],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006094509289184714],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0009054887720296415],
[189.7539352157676, 451.5898887320672, 0, 1, 0.295869279675486, 0, 0.002214398561508338, 0.003497338989051726, 0.704130720324514, 1, 0.001516829981444361],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.9861948417391, 0, 1, 0.297151688466627, 0, 0.002169262357939611, 0.003426052542563448, 0.702848311533373, 1, 0.00151583629897151],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5426605245105, 451.8783632618428, 0, 0, 0.2955042842307021, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000607944027073572],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7910763680018, 460.9853865202301, 1, 0, 0.2970388347121894, 0.00513370539680569, 0, -0.008107983971198131, 1, 0.2970388347121895, 0.0009069550171184122],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7980932715868, 461.0056852825858, 0, 2, 0.2970371620929835, 0, 0.004338341291331464, 0.006851815391196645, 0.4941567514782864, 1, 0.003032917611412002],
[194.7980932715868, 460.978369616645, 0, 1, 0.2970495348577149, 0, 0.002169299181719983, 0.003426110700676923, 0.7029504651422851, 1, 0.001516058870317691],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6109431018444, 451.8673823504582, 0, 2, 0.2955843332167939, 0, 0.00442607738048427, 0.006990382517582431, 0.4962014316096287, 1, 0.003041097905696555],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001515205044311203],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001514734347350033],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515080119029796],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515693558809643],
[187.8724611339022, 450.5554015717294, 1.6875, 1.8125, 0.2942735931632218, 0.008982157309352907, 0.004022812718873699, -0.007832604978126198, 0.8806304612460902, 0.4084578036566359, 0.003050647669242504],
[188.7551527141433, 449.6695197719476, 0.75, 1, 0.2956576724691912, 0.003973401463301102, 0.002223855422771718, -0.002763168151860022, 0.8398790699817171, 0.4584711118328902, 0.001611596742369108],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001517295195170886],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001517376238586625],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8084443984989, 1, 0, 0.2972322412023818, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2972322412023818, 0.001515891628562262],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9902612004818, 460.5942373454863, 0, 1, 0.297429639707702, 0, 0.002171108361587928, 0.003428968052284874, 0.7025703602922979, 1, 0.001515978449701716],
[194.6112018845151, 461.1652610037168, 0, 1, 0.2967645423371712, 0, 0.002168420053634396, 0.003424722238372287, 0.7032354576628288, 1, 0.001516098627405041],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9680184897329, 460.8084443984989, 0, 1, 0.2973086554998278, 0, 0.002170099120699311, 0.003427374094643075, 0.7026913445001722, 1, 0.001515667073349149],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515848396661811],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3087593252956, 452.171275791752, 0, 1, 0.2951124726598131, 0, 0.002211551360154401, 0.003492842224793525, 0.7048875273401869, 1, 0.001516087293046189],
[194.7980932715868, 460.978369616645, 0, 1, 0.2970495348577149, 0, 0.002169299181719983, 0.003426110700676923, 0.7029504651422851, 1, 0.001515825416730646],
[194.6487787072453, 461.1866955116809, 0, 1, 0.2967951359128053, 0, 0.002168319272286276, 0.003424563068047542, 0.7032048640871946, 1, 0.001515546845294965],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515354283013785],
[195.0296667251997, 460.7467961630321, 0, 1, 0.2974026635024866, 0, 0.002170389481441249, 0.003427832679633745, 0.7025973364975133, 1, 0.001515363446802294],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.648297870139, 451.7727259162142, 1, 0, 0.2956689769079158, 0.005272918403331764, 0, -0.00832785183237264, 1, 0.2956689769079158, 0.0007719953654580729],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007429225993113787],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6359125543789, 451.7851112319743, 0, 0, 0.2956496677251781, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003987467389200003],
[194.837702382936, 460.9387605052959, 0, 1, 0.2971099351825066, 0, 0.002169485592627897, 0.003426405111153683, 0.7028900648174934, 1, 0.001117935189217677],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2955426161373669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000475648717032683],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.001039433463650486],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0619708735038, 451.795911594925, 0, 1, 0.2961122330422614, 0, 0.002213388776515951, 0.003495744172072605, 0.7038877669577386, 1, 0.0007616474815359977],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007532783018285506],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.9730930748218, 2, 0, 0.2971576244193436, 0.01026184568170134, 0, -0.01620717861097249, 1, 0.08830265375054758, 0.003032505908503949],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7980932715868, 460.9783696166451, 0, 1, 0.2970495348577148, 0, 0.002169299181719983, 0.003426110700676922, 0.7029504651422851, 1, 0.001515675318597139],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.2831598860582, 0, 0, 0.2960108497085118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004848068846194484],
[189.7539352157676, 451.4751242283219, 0, 1, 0.2959222331256694, 0, 0.002214961459303516, 0.003498228008959952, 0.7040777668743305, 1, 0.0005331264424538535],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004968727687223575],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005849346342193202],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.0006679148014372805],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002598939017764127],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004532852879483727],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001062241321848783],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2956286598780818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004881873047730661],
[194.8033698134101, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2970998706113887, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970998706113888, 0.001027535235661856],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9406230162081, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2960385599893366, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004859172691888345],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9900576138506, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2972999451958973, 0.00512846661125848, 0, -0.008099710027533239, 1, 0.2972999451958973, 0.001029599633903449],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515281821639676],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005090642804281624],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.0005798930844165851],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004257938590040615],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.00151612473161038],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.7467961630321, 0, 1, 0.2972601890778934, 0, 0.002170389481441249, 0.003427832679633745, 0.7027398109221066, 1, 0.001515878767660802],
[194.8967137136303, 460.9387605052959, 0, 1, 0.2971731804317913, 0, 0.002169485592627897, 0.003426405111153683, 0.7028268195682088, 1, 0.001515958775349654],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9568143649816, 460.9309369084132, 0, 1, 0.2972411269862508, 0, 0.002169522416323944, 0.003426463269133978, 0.7027588730137493, 1, 0.001515844582390681],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5426605245104, 451.8783632618428, 0, 0, 0.2955042842307021, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004659962528470815],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.648297870139, 451.7727259162142, 1, 0, 0.2956689769079158, 0.005272918403331764, 0, -0.00832785183237264, 1, 0.2956689769079158, 0.0005317719496347185],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005170530902582687],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004856733120230734],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001028865531042557],
[190.5866496346722, 450.834374151681, 0, 1, 0.2971319033318021, 0, 0.00221810948173964, 0.003503199878882395, 0.7028680966681979, 1, 0.001514900811074218],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.4880291926287, 450.9329945937245, 0, 0, 0.2969781502766538, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006120565110355248],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.2637607020609, 460.5127021861709, 0, 1, 0.2977596357180342, 0, 0.002171492762854848, 0.003429575161394141, 0.7022403642819658, 1, 0.0009036693156359994],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.296064850365, 451.1249589359882, 0, 1, 0.2966788704976241, 0, 0.002216680722695047, 0.003500943349818716, 0.7033211295023758, 1, 0.001515575878579339],
[190.4880291926287, 450.9329945937245, 0, 0, 0.2969781502766538, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000667571627078846],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.2637607020609, 460.5127021861709, 0, 1, 0.2977596357180342, 0, 0.002171492762854848, 0.003429575161394141, 0.7022403642819658, 1, 0.0008480149845002018],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.2766626310199, 452.0263384939448, 1, 0, 0.2951438903279627, 0.00528327151429874, 0, -0.008344203151991509, 1, 0.2951438903279626, 0.001515507996505531],
[189.5619708735038, 451.8000415821551, 0, 1, 0.2955615817464857, 0, 0.00221336854352228, 0.00349571221683254, 0.7044384182535144, 1, 0.00100142802965088],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005133949248521023],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001515644000182728],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7980932715868, 460.978369616645, 0, 1, 0.2970495348577149, 0, 0.002169299181719983, 0.003426110700676923, 0.7029504651422851, 1, 0.001517184389775651],
[194.5888816425253, 460.9956169034429, 1, 0, 0.2968173928366323, 0.005139039761979191, 0, -0.008116408869781166, 1, 0.2968173928366323, 0.001515473003421748],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[185.1408667027721, 447.5335072348321, 1.5, 3, 0.2926321569664699, 0.00810193895445095, 0.006703408686728398, -0.002208786854225299, 0.7444785392795701, 0.5934232068429699, 0.004584213862344816],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000666412732525887],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0008492114462832313],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7637607020609, 461.0127021861709, 0, 1, 0.2969971807836227, 0, 0.002169137629522775, 0.003425855551126213, 0.7030028192163773, 1, 0.00151683128004914],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515728701204022],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515341660113309],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2956286598780818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006068403957193432],
[194.8033698134101, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2970998706113887, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970998706113888, 0.0009083296365548231],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9458995580313, 451.5931468897106, 0, 1, 0.2960784703749186, 0, 0.002214382585048889, 0.003497313756424001, 0.7039215296250814, 1, 0.001515105451234533],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.9387605052959, 0, 1, 0.2971731804317913, 0, 0.002169485592627897, 0.003426405111153683, 0.7028268195682088, 1, 0.001515889040824468],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.1553147737241, 451.2657090126291, 1, 0, 0.2964594357247973, 0.005258859060499851, 0, -0.008305647027555119, 1, 0.2964594357247974, 0.001516371799277922],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001516387344599448],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001516024843998184],
[189.2580652029976, 452.2809812447443, 1, 0, 0.2950063074896784, 0.005283790674534283, 0, -0.00834502309441962, 1, 0.2950063074896785, 0.001515489712917009],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6487787072453, 461.1866955116809, 0, 1, 0.2967951359128053, 0, 0.002168319272286276, 0.003424563068047542, 0.7032048640871946, 1, 0.001516059747311791],
[194.9342905363605, 460.7092193403019, 1, 0, 0.2973175019654064, 0.00512993377023871, 0, -0.008102027204031583, 1, 0.2973175019654064, 0.001515940389977259],
[189.5619708735038, 451.8590529128494, 0, 1, 0.2955343898060999, 0, 0.002213079484750019, 0.003495255688124507, 0.7044656101939001, 1, 0.0015151417807886],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6799935348924, 451.7410302514608, 0, 1, 0.2957183916660514, 0, 0.002213657677814548, 0.003496168864814073, 0.7042816083339487, 1, 0.00151609479796784],
[189.4290178619344, 451.9920059244188, 0, 1, 0.295327110957046, 0, 0.002212428509559123, 0.00349422756204296, 0.704672889042954, 1, 0.001004695345510383],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3700065312401, 452.0510172551132, 0, 0, 0.2952351100270703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005126637863043338],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001516035189700548],
[190.4006747552029, 451.8231081470634, 0, 0, 0.2964709184309017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006639228604587503],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.220083483348, 460.9577589628404, 0, 1, 0.2975109350775701, 0, 0.002169396176886164, 0.003426263891246286, 0.7024890649224299, 1, 0.0008506941972823002],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9342905363605, 460.8421723518713, 1, 0, 0.297257223410875, 0.005129933770238709, 0, -0.008102027204031583, 1, 0.297257223410875, 0.001516368682903067],
[194.9568143649816, 461.2210280812068, 0, 1, 0.2971097189722153, 0, 0.002168157866002439, 0.003424308148947, 0.7028902810277846, 1, 0.001515284890057238],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.4058558256036, 450.2388905323698, 0, 0.5, 0.2950088557058266, 0, 0.001110521570912703, 0.001753916596428093, 0.8396375076746949, 1, 0.0005120592555699396],
[189.5797117718154, 451.9526003997009, 0, 1, 0.2955107765813212, 0, 0.002212621410111621, 0.003494532222023773, 0.7044892234186788, 1, 0.000582869669036486],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004198135206404055],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515418267656309],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1829115575372, 452.2381122288161, 0, 0, 0.2949434217805602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006818405545061175],
[194.6112018845151, 461.1652610037168, 0, 1, 0.2967645423371712, 0, 0.002168420053634397, 0.003424722238372288, 0.7032354576628288, 1, 0.000833559836282981],
[189.2817355862119, 452.1392882001414, 0, 1, 0.2950974922350822, 0, 0.002211707821235269, 0.00349308933362384, 0.7049025077649178, 1, 0.001515920799752253],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2955426161373669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006855075948132071],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.0008301376221411587],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006090720200990998],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0009061027341363629],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001515680467820229],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0198412389064, 451.4011825474469, 0, 0, 0.2962482272832374, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004880257641048498],
[195.0296667251997, 460.7467961630321, 0, 1, 0.2974026635024866, 0, 0.002170389481441249, 0.003427832679633745, 0.7025973364975133, 1, 0.001027333986412177],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.2000843660904, 451.7460238717334, 2.5, 4.75, 0.2962866850119237, 0.01314405305514002, 0.01051475773774313, -0.004152611542973427, 0.747390163912812, 0.5256093869136149, 0.007663225480034599],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 461.0974832269021, 1, 0, 0.2971012771494048, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971012771494048, 0.001517073984339034],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.847900478063, 449.5749535715952, 1.75, 0, 0.2958037909829805, 0.009266716736431412, 0, -0.01463550884929425, 1, 0.160216509016666, 0.0008176095307646822],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000697146311051103],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515704792930114],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515539654263589],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3700065312401, 451.9329945937245, 0, 0, 0.2952894438339598, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005096607540433501],
[189.5619708735038, 451.8000415821551, 0, 1, 0.2955615817464857, 0, 0.00221336854352228, 0.00349571221683254, 0.7044384182535143, 1, 0.0005834063483175861],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000421818348182438],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4880291926287, 451.9329945937245, 0, 0, 0.2954191118870217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005087804364913691],
[189.6209822041981, 451.8000415821551, 0, 1, 0.2956263907360757, 0, 0.00221336854352228, 0.00349571221683254, 0.7043736092639243, 1, 0.0005831429522516746],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004229727566216984],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9684233866523, 451.4526003997009, 0, 1, 0.2961680648776609, 0, 0.002215071967942224, 0.003498402542206811, 0.7038319351223391, 1, 0.000775246511017117],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007392246474084407],
[194.837702382936, 460.9387605052959, 0, 1, 0.2971099351825066, 0, 0.002169485592627897, 0.003426405111153683, 0.7028900648174934, 1, 0.001515681285396698],
[195.0296667251997, 460.7467961630321, 0, 1, 0.2974026635024866, 0, 0.002170389481441249, 0.003427832679633745, 0.7025973364975133, 1, 0.001515006250498856]
],
"NAMES": [
["epi_isl_465573_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_442621_England_20200412_null_1"],
["epi_isl_469821_England_20200420_null_1"],
["epi_isl_468251_Basel_Landschaft_20200427_null_1"],
["epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1"],
["epi_isl_468528_California_20200331_null_1"],
["epi_isl_468480_California_20200428_null_1"],
["epi_isl_468365_California_20200411_null_1"],
["epi_isl_468289_Vaud_20200501_null_1"],
["epi_isl_468239_Bern_20200420_null_1"],
["epi_isl_468206_Geneva_20200417_null_1"],
["epi_isl_467156_Basque_Country_20200313_null_1"],
["epi_isl_466607_England_20200416_null_1"],
["epi_isl_466567_England_20200416_null_1"],
["epi_isl_466561_England_20200414_null_1"],
["epi_isl_466542_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_466428_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_466384_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_466373_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_466358_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_466352_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_466288_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_466013_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_465905_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_465574_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_465258_England_20200418_null_1"],
["epi_isl_464271_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_459241_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_458506_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_456582_Victoria_20200517_null_1"],
["epi_isl_456567_Victoria_20200510_null_1"],
["epi_isl_456545_Victoria_20200509_null_1"],
["epi_isl_456418_Victoria_20200414_null_1"],
["epi_isl_454653_California_20200410_null_1"],
["epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2"],
["epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1"],
["epi_isl_423378_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_466416_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_467421_New_York_20200318_null_4"],
["Node1317"],
["epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1"],
["epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1"],
["epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1"],
["epi_isl_458747_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2"],
["epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1"],
["epi_isl_465850_England_20200323_null_3"],
["epi_isl_457312_England_20200504_null_1"],
["epi_isl_469034_Gujarat_20200605_null_2"],
["Node351"],
["epi_isl_465604_England_20200504_null_2"],
["Node350"],
["epi_isl_458314_England_20200429_null_1"],
["Node349"],
["epi_isl_465165_England_20200416_null_1"],
["epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1"],
["epi_isl_452182_Veneto_20200323_null_1"],
["Node338"],
["epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1"],
["epi_isl_470843_Western_Australia_20200401_null_729"],
["epi_isl_464625_England_20200308_null_1"],
["epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1"],
["epi_isl_464350_England_20200304_null_1"],
["epi_isl_462990_elinac_20200429_null_1"],
["epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1"],
["epi_isl_460855_Friesland_20200501_null_4"],
["Node321"],
["epi_isl_468283_Basel_Landschaft_20200430_null_1"],
["Node320"],
["epi_isl_466515_England_20200414_null_37"],
["Node319"],
["epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1"],
["epi_isl_467063_Andalusia_20200401_null_7"],
["Node345"],
["epi_isl_462374_Singapore_20200408_null_3"],
["Node344"],
["epi_isl_456556_Victoria_20200508_null_1"],
["epi_isl_460634_Washington_20200406_null_1"],
["Node364"],
["epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1"],
["epi_isl_452299_Michigan_20200316_null_1"],
["Node360"],
["epi_isl_456546_Victoria_20200502_null_1"],
["Node359"],
["epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1"],
["epi_isl_465163_Narayanganj_20200507_null_6"],
["Node370"],
["epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1"],
["Node369"],
["epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2"],
["epi_isl_461722_Scotland_20200506_null_22"],
["Node378"],
["epi_isl_445178_California_20200405_null_1"],
["Node377"],
["epi_isl_462461_Maglaj_20200411_null_2"],
["epi_isl_465392_England_20200421_null_1"],
["epi_isl_444084_England_20200404_null_1"],
["epi_isl_468236_Bern_20200420_null_5"],
["Node387"],
["epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1"],
["epi_isl_442065_England_20200404_null_1"],
["epi_isl_469408_England_20200515_null_1"],
["Node392"],
["epi_isl_463172_Connecticut_20200401_null_4"],
["epi_isl_463684_Washington_20200505_null_18"],
["epi_isl_466954_Basel_Stadt_20200310_null_1"],
["Node402"],
["epi_isl_447518_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2"],
["epi_isl_468021_South_Australia_20200325_null_6"],
["Node398"],
["epi_isl_468290_Basel_Landschaft_20200501_null_1"],
["epi_isl_459620_Scotland_20200323_null_4"],
["epi_isl_464610_England_20200308_null_1"],
["Node413"],
["epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1"],
["epi_isl_456438_Victoria_20200417_null_1"],
["epi_isl_452607_Andalusia_20200326_null_1"],
["epi_isl_456623_Victoria_20200101_null_4"],
["epi_isl_470088_Northern_Ireland_20200406_null_2"],
["epi_isl_454626_California_20200430_null_2"],
["epi_isl_466197_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_468257_Bern_20200427_null_1"],
["epi_isl_466368_England_20200410_null_1"],
["epi_isl_448615_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_453466_Northern_Ireland_20200325_null_1"],
["epi_isl_454614_California_20200429_null_4"],
["Node958"],
["epi_isl_454828_North_Carolina_20200301_null_2"],
["epi_isl_465917_England_20200330_null_1"],
["Node955"],
["epi_isl_424040_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_468348_California_20200425_null_1"],
["Node952"],
["epi_isl_462736_Michigan_20200427_null_1"],
["epi_isl_459573_Scotland_20200325_null_12"],
["epi_isl_464541_England_20200304_null_4"],
["Node275"],
["epi_isl_468302_Zurich_20200504_null_1"],
["Node274"],
["epi_isl_418703_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1"],
["Node279"],
["epi_isl_445458_Wales_20200404_null_5"],
["epi_isl_442846_England_20200411_null_1"],
["epi_isl_439458_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_461267_Zeeland_20200424_null_1"],
["epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1"],
["epi_isl_462984_Wyoming_20200330_null_1"],
["Node295"],
["epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4"],
["epi_isl_469863_Northern_Ireland_20200429_null_11"],
["Node283"],
["epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_471241_Wisconsin_20200404_null_37"],
["Node299"],
["epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1"],
["epi_isl_440052_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_465643_England_20200506_null_1"],
["epi_isl_443823_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_456655_Victoria_20200526_null_6"],
["epi_isl_440436_England_20200316_null_2"],
["epi_isl_463010_Odisha_20200507_null_5"],
["Node946"],
["epi_isl_462679_Michigan_20200429_null_3"],
["epi_isl_470573_Ceara_20200402_null_10"],
["Node943"],
["epi_isl_445465_Wales_20200401_null_1"],
["epi_isl_445761_Wales_20200412_null_1"],
["Node940"],
["epi_isl_446571_Wales_20200411_null_2"],
["epi_isl_467843_California_20200315_null_7"],
["Node937"],
["epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1"],
["epi_isl_469549_England_20200423_null_1"],
["Node934"],
["epi_isl_423549_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_440088_England_20200321_null_1"],
["Node742"],
["epi_isl_458476_England_20200429_null_3"],
["epi_isl_471405_Kinshasa_20200427_null_8"],
["Node739"],
["epi_isl_467961_California_20200319_null_8"],
["epi_isl_470000_Scotland_20200330_null_4"],
["Node736"],
["epi_isl_442012_England_20200324_null_2"],
["epi_isl_456422_Victoria_20200416_null_1"],
["Node733"],
["epi_isl_438511_England_20200401_null_2"],
["epi_isl_455574_Wisconsin_20200510_null_3"],
["Node266"],
["epi_isl_441307_England_20200401_null_2"],
["epi_isl_452407_Andalusia_20200315_null_9"],
["epi_isl_465516_England_20200429_null_1"],
["Node225"],
["epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1"],
["epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3"],
["epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1"],
["Node241"],
["epi_isl_423067_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_1"],
["epi_isl_470599_Mato_Grosso_20200319_null_19"],
["Node235"],
["epi_isl_459024_England_20200410_null_1"],
["epi_isl_462436_Uzice_20200428_null_1"],
["epi_isl_462239_Lovendegem_20200330_null_11"],
["epi_isl_462991_USA_20200511_null_1"],
["Node246"],
["epi_isl_465429_England_20200423_null_4"],
["Node245"],
["epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1"],
["epi_isl_466544_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4"],
["epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1"],
["epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1"],
["Node258"],
["epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4"],
["Node257"],
["epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1"],
["Node255"],
["epi_isl_465918_England_20200330_null_1"],
["Node254"],
["epi_isl_465213_England_20200417_null_1"],
["epi_isl_456627_Victoria_20200523_null_1"],
["epi_isl_464561_England_20200304_null_19"],
["Node723"],
["epi_isl_470216_England_20200420_null_8"],
["epi_isl_469024_Gujarat_20200527_null_1"],
["epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2"],
["epi_isl_466882_Bavaria_20200415_null_1"],
["Node181"],
["epi_isl_466240_England_20200405_null_1"],
["Node180"],
["epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1"],
["epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2"],
["epi_isl_461204_Noord_Holland_20200426_null_1"],
["epi_isl_432711_England_20200312_null_17"],
["epi_isl_456569_Victoria_20200510_null_1"],
["Node158"],
["epi_isl_470520_England_20200404_null_399"],
["epi_isl_455309_Odisha_20200404_null_1"],
["epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1"],
["epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1"],
["Node151"],
["epi_isl_470345_England_20200419_null_7"],
["Node150"],
["epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1"],
["epi_isl_439246_Scotland_20200425_null_3"],
["Node177"],
["epi_isl_458145_Amapa_20200420_null_1"],
["epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1"],
["epi_isl_468353_California_20200516_null_1"],
["Node171"],
["epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1"],
["epi_isl_461485_Gujarat_20200527_null_1"],
["epi_isl_452954_England_20200512_null_1"],
["epi_isl_456688_England_20200518_null_7"],
["Node189"],
["epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1"],
["Node188"],
["epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1"],
["epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1"],
["epi_isl_455478_Odisha_20200409_null_1"],
["Node198"],
["epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1"],
["epi_isl_464336_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_466477_England_20200410_null_1"],
["epi_isl_439434_England_20200401_null_9"],
["epi_isl_469244_Jeddah_20200315_null_1"],
["Node215"],
["epi_isl_456437_Victoria_20200418_null_1"],
["Node214"],
["epi_isl_466242_England_20200403_null_4"],
["Node213"],
["epi_isl_429065_California_20200328_null_1"],
["epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2"],
["epi_isl_443629_England_20200417_null_4"],
["epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1"],
["epi_isl_470238_England_20200417_null_7"],
["epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1"],
["epi_isl_454936_Hubei_20200211_null_1"],
["Node458"],
["epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1"],
["epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1"],
["epi_isl_468238_Bern_20200420_null_1"],
["epi_isl_468949_Basque_Country_20200410_null_29"],
["epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1"],
["epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_1"],
["epi_isl_466123_England_20200331_null_1"],
["Node61"],
["epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1"],
["Node60"],
["epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1"],
["epi_isl_429814_Nova_Scotia_20200315_null_1"],
["epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1"],
["epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1"],
["epi_isl_452832_Virginia_20200422_null_3"],
["epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1"],
["epi_isl_470298_England_20200419_null_6"],
["epi_isl_448539_England_20200406_null_1"],
["epi_isl_469213_British_Columbia_20200401_null_34"],
["Node51"],
["epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_3"],
["Node50"],
["epi_isl_466285_England_20200407_null_2"],
["epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2"],
["epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1"],
["epi_isl_470119_England_20200417_null_3"],
["epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1"],
["epi_isl_452002_Denmark_20200311_null_2"],
["epi_isl_455917_Bangkok_20200312_null_2"],
["epi_isl_462715_Michigan_20200417_null_1"],
["epi_isl_457704_Muscat_20200224_null_1"],
["epi_isl_463021_Odisha_20200509_null_1"],
["epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1"],
["epi_isl_471415_Kinshasa_20200428_null_43833"],
["epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1"],
["epi_isl_460852_Friesland_20200413_null_1"],
["epi_isl_433051_England_20200404_null_3"],
["epi_isl_455722_Comunitat_Valenciana_20200330_null_4"],
["Node517"],
["epi_isl_445096_California_20200313_null_1"],
["epi_isl_435059_EC_20200320_null_1"],
["epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1"],
["epi_isl_457836_Kenya_20200301_null_2"],
["epi_isl_456032_New_York_20200327_null_1"],
["epi_isl_457474_England_20200508_null_3"],
["epi_isl_448657_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1"],
["epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1"],
["epi_isl_449684_England_20200415_null_1"],
["Node535"],
["epi_isl_463017_Odisha_20200509_null_1"],
["epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2"],
["epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1"],
["epi_isl_432315_Wales_20200407_null_1"],
["epi_isl_450495_GP_20200325_null_1"],
["epi_isl_463139_Connecticut_20200330_null_3"],
["epi_isl_443744_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_458280_California_20200421_null_1"],
["epi_isl_460813_Overijssel_20200414_null_1"],
["epi_isl_459493_England_20200427_null_1"],
["epi_isl_465333_England_20200420_null_1"],
["epi_isl_455638_KZN_20200504_null_1"],
["epi_isl_461894_England_20200515_null_2"],
["epi_isl_467262_Galicia_20200414_null_1"],
["epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1"],
["epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1"],
["epi_isl_421787_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_467231_Madrid_20200402_null_3"],
["epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1"],
["epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1"],
["epi_isl_452334_Beijing_20200319_null_1"],
["epi_isl_469924_England_20200411_null_4"],
["epi_isl_464932_England_20200313_null_1"],
["epi_isl_469113_Singapore_20200406_null_1"],
["Node603"],
["epi_isl_461240_Utrecht_20200430_null_2"],
["epi_isl_452371_Andalusia_20200401_null_1"],
["epi_isl_465540_England_20200430_null_1"],
["Node586"],
["epi_isl_467846_Georgia_20200313_null_1"],
["epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3"],
["epi_isl_465716_England_20200421_null_1"],
["epi_isl_433666_England_20200403_null_2"],
["epi_isl_470530_England_20200406_null_159"],
["Node576"],
["epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1"],
["Node575"],
["epi_isl_462716_Michigan_20200417_null_10"],
["Node574"],
["epi_isl_442782_England_20200407_null_4"],
["epi_isl_470457_England_20200410_null_31"],
["epi_isl_461567_England_20200525_null_4"],
["epi_isl_470126_England_20200417_null_5"],
["Node595"],
["epi_isl_459878_Ontario_20200327_null_1"],
["Node592"],
["epi_isl_466337_England_20200407_null_3"],
["Node591"],
["epi_isl_459045_England_20200409_null_2"],
["epi_isl_467652_New_Mexico_20200402_null_3"],
["epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1"],
["epi_isl_458267_California_20200410_null_2"],
["Node617"],
["epi_isl_471402_Kinshasa_20200426_null_2"],
["epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1"],
["epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1"],
["Node622"],
["epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1"],
["epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1"],
["epi_isl_454496_Sormland_20200309_null_11"],
["Node628"],
["epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1"],
["epi_isl_441250_England_20200401_null_2"],
["epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2"],
["Node633"],
["epi_isl_438652_England_20200423_null_2"],
["epi_isl_452413_Andalusia_20200314_null_2"],
["epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_3"],
["epi_isl_469977_Scotland_20200330_null_3"],
["Node639"],
["epi_isl_464065_Houthalen_Helchteren_20200407_null_2"],
["epi_isl_469679_England_20200422_null_8"],
["epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1"],
["epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1"],
["epi_isl_465712_England_20200430_null_3"],
["epi_isl_466400_England_20200412_null_1"],
["epi_isl_465974_England_20200330_null_1"],
["Node67"],
["epi_isl_417938_California_20200318_null_1"],
["Node66"],
["epi_isl_455591_Nonthaburi_20200320_null_1"],
["epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1"],
["epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6"],
["epi_isl_464508_England_20200304_null_2"],
["epi_isl_468083_Washington_20200417_null_12"],
["Node654"],
["epi_isl_469595_England_20200422_null_10"],
["epi_isl_447679_France_20200301_null_1"],
["epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1"],
["epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1"],
["epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2"],
["epi_isl_470689_Utah_20200413_null_3"],
["epi_isl_441573_England_20200404_null_1"],
["epi_isl_470371_England_20200408_null_1"],
["Node671"],
["epi_isl_423427_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5"],
["epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1"],
["epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_454281_Portugal_20200421_null_1"],
["epi_isl_452076_Denmark_20200428_null_4"],
["epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1"],
["epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2"],
["epi_isl_454647_Virgin_Islands_20200427_null_2"],
["epi_isl_423216_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2"],
["Node692"],
["epi_isl_462228_Vlamertinge_20200402_null_8"],
["epi_isl_469111_Singapore_20200408_null_7"],
["Node696"],
["epi_isl_468371_California_20200412_null_3"],
["Node695"],
["epi_isl_468691_British_Columbia_20200401_null_2"],
["epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1"],
["epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1"],
["epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1"],
["epi_isl_460383_Massachusetts_20200404_null_1"],
["Node710"],
["epi_isl_465303_England_20200420_null_2"],
["Node709"],
["epi_isl_471266_Wisconsin_20200331_null_12"],
["epi_isl_465408_England_20200421_null_1"],
["epi_isl_469289_Kanto_20200401_null_2"],
["Node72"],
["epi_isl_465465_England_20200429_null_1"],
["epi_isl_469138_Singapore_20200417_null_1"],
["epi_isl_452438_Andalusia_20200312_null_1"],
["epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1"],
["epi_isl_454897_Stockholm_20200310_null_4"],
["epi_isl_442072_England_20200405_null_1"],
["epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1"],
["Node727"],
["epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1"],
["epi_isl_468286_Bern_20200430_null_1"],
["epi_isl_466946_Basel_Stadt_20200310_null_1"],
["epi_isl_469071_Vastra_Gotaland_20200527_null_1"],
["Node931"],
["epi_isl_420198_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_465882_England_20200329_null_1"],
["Node925"],
["epi_isl_468513_California_20200321_null_1"],
["epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1"],
["epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1"],
["epi_isl_464453_England_20200304_null_1"],
["epi_isl_464633_England_20200308_null_26"],
["Node802"],
["epi_isl_425380_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1"],
["epi_isl_462973_Wyoming_20200329_null_11"],
["Node775"],
["epi_isl_453286_England_20200403_null_1"],
["Node774"],
["epi_isl_466287_England_20200407_null_26"],
["epi_isl_466609_England_20200416_null_1"],
["Node764"],
["epi_isl_456297_Southern_20200401_null_1"],
["epi_isl_470184_England_20200421_null_75"],
["Node760"],
["epi_isl_423815_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_461148_Noord_Brabant_20200320_null_3"],
["epi_isl_465352_England_20200416_null_1"],
["Node142"],
["epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_469499_England_20200503_null_3"],
["Node139"],
["epi_isl_441198_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_466925_Bavaria_20200526_null_12"],
["epi_isl_443337_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_470125_England_20200417_null_8"],
["Node769"],
["epi_isl_470640_Rio_de_Janeiro_20200420_null_4"],
["Node768"],
["epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2"],
["epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1"],
["epi_isl_461237_Utrecht_20200428_null_5"],
["Node125"],
["epi_isl_468228_Basel_Landschaft_20200420_null_3"],
["epi_isl_440230_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_433949_England_20200412_null_2"],
["epi_isl_460224_Massachusetts_20200316_null_1"],
["epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1"],
["epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1"],
["epi_isl_452678_Basque_Country_20200325_null_3"],
["Node119"],
["epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5"],
["epi_isl_448684_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_454527_Maharashtra_20200313_null_1"],
["epi_isl_466672_Nebraska_20200504_null_25"],
["Node798"],
["epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1"],
["Node797"],
["epi_isl_471409_Kinshasa_20200427_null_390"],
["epi_isl_458970_England_20200410_null_1"],
["epi_isl_459072_England_20200410_null_1"],
["Node785"],
["epi_isl_466961_Vaud_20200311_null_51"],
["Node784"],
["epi_isl_423718_England_20200323_null_2"],
["Node783"],
["epi_isl_452240_Stockholm_20200424_null_3"],
["epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_1"],
["Node793"],
["epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1"],
["Node792"],
["epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1"],
["epi_isl_456255_Counties_Manukau_20200323_null_2"],
["Node110"],
["epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1"],
["epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1"],
["epi_isl_470594_Minas_Gerais_20200408_null_36"],
["Node105"],
["epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_8"],
["Node104"],
["epi_isl_456129_Pereira_20200319_null_5"],
["epi_isl_461329_Zuid_Holland_20200428_null_1"],
["Node810"],
["epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1"],
["Node809"],
["epi_isl_466932_Graub_nden_20200305_null_1"],
["Node808"],
["epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1"],
["epi_isl_456995_Scotland_20200521_null_7"],
["Node819"],
["epi_isl_460556_Michigan_20200506_null_6"],
["epi_isl_469796_England_20200417_null_17"],
["Node815"],
["epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3"],
["epi_isl_452115_Texas_20200311_null_1"],
["Node100"],
["epi_isl_458741_England_20200414_null_2"],
["Node99"],
["epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1"],
["epi_isl_465108_England_20200314_null_9"],
["Node95"],
["epi_isl_468274_Basel_Landschaft_20200428_null_3"],
["Node94"],
["epi_isl_452145_Connecticut_20200512_null_1"],
["epi_isl_471151_Wisconsin_20200612_null_1"],
["Node843"],
["epi_isl_468436_California_20200506_null_1"],
["epi_isl_466927_Basel_Stadt_20200305_null_1"],
["epi_isl_468601_California_20200422_null_3"],
["epi_isl_448433_England_20200429_null_9"],
["epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1"],
["epi_isl_463377_Washington_20200417_null_31"],
["epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4"],
["epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1"],
["epi_isl_470842_Western_Australia_20200401_null_1"],
["Node831"],
["epi_isl_461087_Netherlands_20200508_null_6"],
["epi_isl_468460_California_20200413_null_1"],
["epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1"],
["epi_isl_471258_Wisconsin_20200326_null_305"],
["Node85"],
["epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2"],
["epi_isl_456989_Scotland_20200520_null_4"],
["Node90"],
["epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5"],
["epi_isl_460452_Massachusetts_20200319_null_8"],
["epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4"],
["epi_isl_468655_California_20200513_null_19"],
["Node854"],
["epi_isl_465840_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_443673_England_20200412_null_1"],
["epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1"],
["Node849"],
["epi_isl_467008_Vaud_20200507_null_1"],
["epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2"],
["epi_isl_456528_Victoria_20200507_null_1"],
["Node867"],
["epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3"],
["epi_isl_469918_England_20200413_null_1"],
["Node863"],
["epi_isl_466304_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2"],
["epi_isl_465968_England_20200330_null_1"],
["Node873"],
["epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1"],
["epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1"],
["epi_isl_460272_Massachusetts_20200404_null_1"],
["epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1"],
["epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1"],
["Node883"],
["epi_isl_441046_England_20200404_null_1"],
["Node882"],
["epi_isl_421917_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_465833_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_460791_Noord_Holland_20200401_null_1"],
["epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1"],
["epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1"],
["Node895"],
["epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1"],
["epi_isl_465958_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_470196_England_20200420_null_2"],
["epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2"],
["epi_isl_433845_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_466007_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_424156_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_420758_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_468288_Basel_Landschaft_20200501_null_1"],
["epi_isl_453047_Scotland_20200414_null_1"],
["epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1"],
["epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3"],
["epi_isl_454247_Portugal_20200323_null_8"],
["Node919"],
["epi_isl_423528_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_453570_England_20200424_null_1"],
["epi_isl_470158_England_20200417_null_1"],
["epi_isl_455105_Jonkoping_20200507_null_1"],
["epi_isl_462341_Singapore_20200330_null_1"],
["epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2"],
["epi_isl_456807_Scotland_20200506_null_49"],
["Node962"],
["epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1"],
["epi_isl_466978_Vaud_20200312_null_1"],
["epi_isl_467299_Morocco_20200521_null_1"],
["Node978"],
["epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2"],
["epi_isl_456571_Victoria_20200510_null_1"],
["Node975"],
["epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1"],
["epi_isl_461687_Scotland_20200425_null_41"],
["epi_isl_468253_Vaud_20200427_null_1"],
["Node970"],
["epi_isl_440816_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_458498_England_20200416_null_1"],
["epi_isl_465261_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1"],
["epi_isl_466940_Basel_Stadt_20200308_null_1"],
["epi_isl_465894_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_465252_England_20200418_null_1"],
["epi_isl_457384_England_20200429_null_1"],
["epi_isl_465675_England_20200518_null_1"],
["epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1"],
["epi_isl_465632_England_20200505_null_1"],
["epi_isl_456475_Victoria_20200501_null_1"],
["epi_isl_468304_Zurich_20200504_null_1"],
["epi_isl_459173_England_20200507_null_1"],
["epi_isl_464634_England_20200308_null_1"],
["epi_isl_465529_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_465851_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_449004_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1"],
["epi_isl_423445_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_464759_England_20200310_null_1"],
["epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1"],
["epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1"],
["epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1"],
["epi_isl_458165_Dour_20200328_null_18"],
["Node1286"],
["epi_isl_458364_England_20200501_null_1"],
["Node1285"],
["epi_isl_466387_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_468114_Oregon_20200506_null_2"],
["Node1280"],
["epi_isl_465545_England_20200501_null_1"],
["Node1279"],
["epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1"],
["epi_isl_453618_England_20200505_null_7"],
["epi_isl_468272_Graubunden_20200428_null_1"],
["Node1291"],
["epi_isl_456568_Victoria_20200510_null_1"],
["epi_isl_423653_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_470183_England_20200420_null_2"],
["epi_isl_470531_England_20200405_null_38"],
["Node1297"],
["epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2"],
["epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1"],
["Node1301"],
["epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1"],
["Node1300"],
["epi_isl_443318_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_466283_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1"],
["epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1"],
["epi_isl_443107_England_20200411_null_1"],
["epi_isl_423856_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1"],
["epi_isl_469575_England_20200416_null_45"],
["Node1032"],
["epi_isl_468294_Bern_20200501_null_1"],
["Node1031"],
["epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1"],
["epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1"],
["epi_isl_468269_Luzern_20200427_null_1"],
["epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1"],
["epi_isl_463437_Washington_20200426_null_7"],
["epi_isl_465551_England_20200502_null_1"],
["epi_isl_465558_England_20200502_null_7"],
["Node1037"],
["epi_isl_421892_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2"],
["epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1"],
["Node1046"],
["epi_isl_468777_Aragon_20200323_null_4"],
["Node1045"],
["epi_isl_441103_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_440384_England_20200316_null_1"],
["epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1"],
["epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1"],
["epi_isl_456444_Victoria_20200422_null_1"],
["epi_isl_456473_Victoria_20200430_null_54"],
["Node1065"],
["epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1"],
["Node1064"],
["epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1"],
["epi_isl_466816_British_Columbia_20200401_null_21"],
["Node1059"],
["epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3"],
["Node1058"],
["epi_isl_465222_England_20200417_null_1"],
["epi_isl_437266_Bavaria_20200326_null_1"],
["epi_isl_457288_England_20200417_null_2"],
["Node1083"],
["epi_isl_459311_England_20200502_null_1"],
["Node1082"],
["epi_isl_448896_England_20200413_null_3"],
["epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1"],
["Node1075"],
["epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2"],
["Node1074"],
["epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_463969_Quebec_20200413_null_2"],
["epi_isl_465578_England_20200502_null_1"],
["epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1"],
["epi_isl_465719_England_20200314_null_1"],
["epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1"],
["epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1"],
["epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1"],
["epi_isl_468380_California_20200419_null_4"],
["Node1102"],
["epi_isl_457554_England_20200511_null_1"],
["Node1101"],
["epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1"],
["epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1"],
["epi_isl_470430_England_20200410_null_1"],
["epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1"],
["epi_isl_454302_Portugal_20200324_null_2"],
["epi_isl_469640_England_20200422_null_11"],
["epi_isl_462317_Singapore_20200423_null_1"],
["epi_isl_449030_England_20200419_null_3"],
["epi_isl_458042_Tamil_Nadu_20200506_null_6"],
["Node1126"],
["epi_isl_461309_Zuid_Holland_20200507_null_5"],
["epi_isl_461587_England_20200530_null_1"],
["epi_isl_468277_Ticino_20200428_null_4"],
["Node1120"],
["epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1"],
["epi_isl_439409_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2"],
["epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1"],
["epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_3"],
["Node1138"],
["epi_isl_466399_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_470421_England_20200410_null_16"],
["Node1130"],
["epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1"],
["epi_isl_461174_Noord_Brabant_20200101_null_19"],
["Node1142"],
["epi_isl_461787_Northern_Ireland_20200329_null_6"],
["epi_isl_466848_Telangana_20200513_null_2"],
["epi_isl_469615_England_20200415_null_3"],
["epi_isl_465270_England_20200419_null_18"],
["epi_isl_465271_England_20200419_null_1"],
["Node1154"],
["epi_isl_466411_England_20200409_null_1"],
["Node1153"],
["epi_isl_471268_Los_Rios_20200417_null_33"],
["Node1148"],
["epi_isl_455395_Hubei_20200315_null_1"],
["epi_isl_466031_England_20200401_null_1"],
["Node1159"],
["epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_443713_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_467613_New_Mexico_20200318_null_2"],
["Node1164"],
["epi_isl_458756_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1"],
["epi_isl_466037_England_20200402_null_1"],
["Node1173"],
["epi_isl_443381_England_20200412_null_1"],
["Node1172"],
["epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1"],
["epi_isl_469072_Uppsala_20200603_null_4"],
["epi_isl_452674_Basque_Country_20200326_null_2"],
["epi_isl_470385_England_20200405_null_10"],
["Node1181"],
["epi_isl_462888_Minnesota_20200511_null_2"],
["epi_isl_470074_Northern_Ireland_20200413_null_26"],
["Node1185"],
["epi_isl_446789_Wales_20200421_null_1"],
["Node1184"],
["epi_isl_438435_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_468249_Uri_20200426_null_1"],
["epi_isl_466202_England_20200402_null_7"],
["epi_isl_470308_England_20200419_null_13"],
["Node1193"],
["epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1"],
["epi_isl_468417_California_20200411_null_19"],
["Node1196"],
["epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_459208_England_20200505_null_1"],
["epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1"],
["epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2"],
["Node1216"],
["epi_isl_456609_Timor_Leste_20200412_null_1"],
["epi_isl_448978_England_20200421_null_1"],
["epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1"],
["epi_isl_457519_England_20200507_null_2"],
["epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2"],
["epi_isl_468548_California_20200420_null_1"],
["epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1"],
["epi_isl_454312_Portugal_20200328_null_1"],
["Node1223"],
["epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1"],
["epi_isl_455205_Netherlands_20200327_null_1"],
["epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1"],
["epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1"],
["epi_isl_456583_Victoria_20200517_null_1"],
["epi_isl_470572_Amazonas_20200402_null_2"],
["Node989"],
["epi_isl_445939_Wales_20200401_null_1"],
["Node988"],
["epi_isl_465251_England_20200418_null_2"],
["epi_isl_469441_England_20200511_null_8"],
["Node994"],
["epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1"],
["Node993"],
["epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_1"],
["epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_3"],
["Node999"],
["epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1"],
["epi_isl_460056_Minnesota_20200323_null_5"]
],
"RESOLVED": [
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7910763680017, 460.9853865202301, 1, 0, 0.2970388347121894, 0.00513370539680569, 0, -0.008107983971198131, 1, 0.2970388347121895, 0.001515576823028651],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.00151522510078229],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001515409614928128],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.4511760998545, 452.9698476864987, 0, 1, 0.2938026181109781, 0, 0.002207652463199056, 0.003486684451494151, 0.7061973818890219, 1, 0.001515745348986144],
[188.9784917657954, 452.4425320205579, 0, 1, 0.2946247234776342, 0, 0.002210225452355488, 0.003490748135174053, 0.7053752765223658, 1, 0.001515142252015943],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9511760998545, 452.4698476864987, 0, 0, 0.2945821373057941, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005004211497165295],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3525556578111, 452.0684681285422, 1, 0, 0.2952079034454618, 0.005281153964497593, 0, -0.008340858772343897, 1, 0.2952079034454618, 0.000574095549089068],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004402030244093041],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.5672474153271, 452.8537763710262, 0, 0, 0.2939835777477348, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004567017325457204],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.6605913155473, 452.7604324708059, 1, 0, 0.2941291044716162, 0.005300524041756203, 0, -0.008371451154219061, 1, 0.2941291044716161, 0.001058536390151454],
[189.1553147737241, 452.2657090126291, 1, 0, 0.2949003973351653, 0.005286660864888963, 0, -0.008349556166653277, 1, 0.2949003973351653, 0.001518336241106778],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.7539352157676, 452.7657090126291, 0, 1, 0.294229392527482, 0, 0.002208647828433727, 0.00348825649444255, 0.705770607472518, 1, 0.001518218004609835],
[188.7539352157676, 452.6670885705857, 1, 0, 0.2942746311954975, 0.005297902789983607, 0, -0.008367311246352533, 1, 0.2942746311954976, 0.001515823937814687],
[188.7539352157676, 452.6670885705857, 0, 1, 0.2942746311954975, 0, 0.002209129016111511, 0.003489016464420772, 0.7057253688045024, 1, 0.001516188724653039],
[188.7539352157676, 452.6670885705857, 0, 0, 0.2942746311954975, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000408108798123382],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.2539352157676, 452.1670885705857, 0, 1, 0.2950541503903135, 0, 0.00221157183987285, 0.003492874569701555, 0.7049458496096865, 1, 0.0008165391770058509],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000289974767481972],
[189.0672474153271, 452.3537763710262, 0, 1, 0.2947630969425508, 0, 0.002210659117344889, 0.00349143304958015, 0.7052369030574492, 1, 0.00151632620310285],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2955426161373669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006676590387493364],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.0008479566924006551],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 1, 0.2958336695851296, 0, 0.002214020072095029, 0.003496741216904869, 0.7041663304148704, 1, 0.001515610774711793],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 1, 0.2958336695851296, 0, 0.002214020072095029, 0.003496741216904869, 0.7041663304148704, 1, 0.001133313023048715],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003810458047057181],
[189.4511760998545, 451.9698476864987, 0, 1, 0.2953616565006101, 0, 0.002212536975903829, 0.003494398869766392, 0.7046383434993899, 1, 0.001515142252015943],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.352555657811, 452.0684681285422, 1, 0, 0.2952079034454618, 0.005281153964497594, 0, -0.008340858772343899, 1, 0.2952079034454618, 0.0007638905439717331],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007511063367350825],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0198412389064, 451.4011825474469, 0, 1, 0.2962482272832374, 0, 0.002215324280624563, 0.003498801035502786, 0.7037517727167626, 1, 0.001515609139957031],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0198412389064, 451.4011825474469, 0, 0, 0.2962482272832374, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006097806009245811],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.0296667251997, 460.7467961630321, 0, 1, 0.2974026635024866, 0, 0.002170389481441249, 0.003427832679633745, 0.7025973364975133, 1, 0.0009048078342557115],
[194.9342905363605, 460.7308839667083, 1, 0, 0.2973076779380603, 0.00512993377023871, 0, -0.008102027204031583, 1, 0.2973076779380603, 0.001515428977753497],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.2539352157676, 452.1670885705857, 0, 1, 0.2950541503903135, 0, 0.00221157183987285, 0.003492874569701555, 0.7049458496096865, 1, 0.001515905190423427],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515520119463949],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515883083781877],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001517338860907329],
[189.9603347872111, 451.6832657694682, 0, 0, 0.2960527224496663, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006069464979647019],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9999134993521, 460.8878377740428, 0, 1, 0.2973068381300963, 0, 0.002169725295485591, 0.003426783688960123, 0.7026931618699037, 1, 0.0009075205131635048],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6605913155473, 451.7604324708059, 1, 0, 0.2956881428612482, 0.005272576622606077, 0, -0.008327312036566037, 1, 0.2956881428612482, 0.0007707749628832563],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007441744357290728],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004174826963661978],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001098242567957531],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7637607020609, 461.0127021861709, 0, 1, 0.2969971807836227, 0, 0.002169137629522775, 0.003425855551126213, 0.7030028192163773, 1, 0.001515358121083254],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7637607020609, 461.0127021861709, 0, 1, 0.2969971807836227, 0, 0.002169137629522775, 0.003425855551126213, 0.7030028192163773, 1, 0.001515429911518363],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004531331827679506],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001062830946267513],
[189.1382710735575, 451.8988240282683, 0, 0, 0.2950504308077737, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004531219530581896],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5888816425253, 460.9956169034429, 1, 0, 0.2968173928366323, 0.005139039761979191, 0, -0.008116408869781166, 1, 0.2968173928366323, 0.00106284203991048],
[189.063117428097, 452.2398836968677, 0, 0, 0.2948109038885599, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004531192950785664],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.551304819795, 461.1661467377425, 1, 0, 0.2966999038346071, 0.005140032347386513, 0, -0.00811797652237331, 1, 0.2966999038346071, 0.001062845329780835],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3700065312401, 452.0510172551132, 1, 0, 0.2952351100270703, 0.005280667294242456, 0, -0.00834009014338627, 1, 0.2952351100270703, 0.001515637398997941],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3700065312401, 452.0510172551132, 0, 0, 0.2952351100270703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006142157578054407],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.000901506523603508],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3700065312401, 452.0510172551132, 0, 0, 0.2952351100270703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006051290453430682],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.0009106375323490093],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.4751242283219, 0, 1, 0.2959222331256694, 0, 0.002214961459303516, 0.003498228008959952, 0.7040777668743305, 1, 0.001518031144704102],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.4751242283219, 0, 1, 0.2959222331256694, 0, 0.002214961459303516, 0.003498228008959952, 0.7040777668743305, 1, 0.001515892951780068],
[189.897399728422, 451.3569956019066, 0, 1, 0.2961342660748553, 0, 0.00221554115643306, 0.003499143561114039, 0.7038657339251447, 1, 0.002023304178905731],
[190.1678956717898, 451.2682598581151, 0, 3, 0.2964720557647515, 0, 0.006647930437082459, 0.0104994948598031, 0.3482122593560937, 1, 0.00458592525835694],
[189.8183957285867, 451.3324515588342, 0, 3, 0.2960588705944471, 0, 0.006646984921289068, 0.01049800154721408, 0.3488261396938409, 1, 0.004063621683220035],
[189.7539352157676, 451.2831598860582, 1, 0, 0.2960108497085118, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2960108497085119, 0.001515466290542277],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.6877848323378, 0, 1, 0.2972869464514414, 0, 0.002170667495262413, 0.003428271764355508, 0.7027130535485586, 1, 0.001515562150723545],
[189.1382710735575, 451.7068596860046, 0, 1, 0.2951388127883272, 0, 0.002213825135830638, 0.003496433341796167, 0.7048611872116728, 1, 0.001515773400877466],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.5888816425253, 460.9956169034429, 1, 0, 0.2968173928366323, 0.005139039761979191, 0, -0.008116408869781166, 1, 0.2968173928366323, 0.001515215127583279],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2971129487687174, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7028870512312826, 1, 0.001515527817674164],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8591368909001, 460.9173259973318, 1, 0, 0.2971426208752343, 0.005131912292929283, 0, -0.008105152009415195, 1, 0.2971426208752344, 0.001515365303139107],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9406230162081, 451.4804007701452, 0, 0, 0.2961247230328922, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004534065989653037],
[194.9900576138506, 460.7864052743813, 1, 0, 0.297342263177695, 0.00512846661125848, 0, -0.008099710027533239, 1, 0.297342263177695, 0.00106124836335796],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6787815703071, 451.7422422160462, 0, 0, 0.2957165021667358, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004523819062168397],
[194.8591368909, 460.9173259973318, 1, 0, 0.2971426208752343, 0.005131912292929284, 0, -0.008105152009415197, 1, 0.2971426208752344, 0.001063122623200938],
[189.9406230162081, 451.4804007701452, 0, 0, 0.2961247230328922, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004534066034375933],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9900576138506, 460.7864052743813, 1, 0, 0.297342263177695, 0.00512846661125848, 0, -0.008099710027533239, 1, 0.297342263177695, 0.00106124836335796],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.2831598860582, 0, 0, 0.2960108497085118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004531222212502621],
[194.8967137136303, 460.6877848323378, 0, 1, 0.2972869464514414, 0, 0.002170667495262413, 0.003428271764355508, 0.7027130535485586, 1, 0.001062841797989522],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9406230162081, 451.4804007701452, 0, 0, 0.2961247230328922, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004534066295833783],
[194.9900576138506, 460.7864052743813, 1, 0, 0.297342263177695, 0.00512846661125848, 0, -0.008099710027533239, 1, 0.297342263177695, 0.001061248335574757],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004523925987164407],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0010631120189914],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2955426161373669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004531062188977582],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.001062864151599154],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2955426161373669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000453109151775659],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.001062860619741492],
[189.6787815703071, 451.7422422160462, 0, 0, 0.2957165021667358, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004526084195899952],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8591368909, 460.9173259973318, 1, 0, 0.2971426208752344, 0.005131912292929284, 0, -0.008105152009415197, 1, 0.2971426208752344, 0.001062925208164913],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004657441861354018],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001050150579957551],
[189.9458995580313, 451.4751242283219, 0, 1, 0.2961329493641592, 0, 0.002214961459303516, 0.003498228008959952, 0.7038670506358408, 1, 0.001517022632478164],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515845048847705],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004556278198877841],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001058860252249795],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0993441096028, 451.3806910074447, 1, 0, 0.2963449113033056, 0.005260407418467706, 0, -0.00830809244672406, 1, 0.2963449113033056, 0.001515103593278573],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001521273068423703],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515511680811468],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.4698476864987, 1, 0, 0.2959246682287974, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2959246682287975, 0.001515551087375145],
[189.7539352157676, 451.5684681285422, 0, 1, 0.295879161910228, 0, 0.002214503603726695, 0.003497504888836951, 0.7041208380897721, 1, 0.0009547682059277132],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005601507577288361],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515688450931166],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 2, 0, 0.2958336695851296, 0.01053996586540257, 0, -0.01664643131778331, 1, 0.08751756006020361, 0.003033655757265461],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 1, 0.2958336695851296, 0, 0.002214020072095029, 0.003496741216904869, 0.7041663304148704, 1, 0.001516054241161981],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 1, 0.2958336695851296, 0, 0.002214020072095029, 0.003496741216904869, 0.7041663304148704, 1, 0.001515806672313225],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 1, 0.2958336695851296, 0, 0.002214020072095029, 0.003496741216904869, 0.7041663304148704, 1, 0.001515628823027502],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 7.267285137129452e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001443478307179569],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5566943316806, 451.7217199024674, 0, 0, 0.2955918835316799, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004529894823629076],
[194.7980932715868, 460.9070648405424, 0, 1, 0.2970818375631494, 0, 0.002169634783849462, 0.003426640738237747, 0.7029181624368506, 1, 0.001062933931275074],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001515726858001036],
[189.6605913155473, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2957311796509725, 0.005272576622606077, 0, -0.008327312036566037, 1, 0.2957311796509725, 0.001515823601877253],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6605913155473, 451.7604324708059, 1, 0, 0.2956881428612482, 0.005272576622606077, 0, -0.008327312036566037, 1, 0.2956881428612482, 0.001516206815291293],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006058125513320949],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.000909134762416761],
[189.5672474153271, 451.4751242283219, 0, 1, 0.2957171878190701, 0, 0.002214961459303516, 0.003498228008959952, 0.7042828121809299, 1, 0.00151638592997314],
[189.6232180794483, 451.5521065757701, 0, 1, 0.2957431622644167, 0, 0.002214583844117668, 0.003497631617535535, 0.7042568377355833, 1, 0.001516215532966045],
[189.4686269732836, 451.7657090126292, 0, 1, 0.2954748620595482, 0, 0.002213536751573247, 0.003495977878391912, 0.7045251379404518, 1, 0.001516128754008403],
[189.3805596148866, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2953375216935468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004527343149381053],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4739035151068, 451.7604324708059, 1, 0, 0.2954830907858143, 0.005277771669069295, 0, -0.008335516900343303, 1, 0.2954830907858144, 0.001062637441894328],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2956286598780818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000674045164443845],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8033698134101, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2970998706113887, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970998706113888, 0.0008408278865912207],
[189.6605913155473, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2957311796509725, 0.005272576622606077, 0, -0.008327312036566037, 1, 0.2957311796509725, 0.001516707056246584],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515810221783047],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001514986364994335],
[190.2266195498267, 451.1944042365265, 0, 1, 0.2965706026081054, 0, 0.00221633954368764, 0.003500404504343655, 0.7034293973918946, 1, 0.001521074834579896],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515285707718666],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.2766626310199, 452.0510172551132, 1, 0, 0.2951325329738235, 0.00528327151429874, 0, -0.008344203151991509, 1, 0.2951325329738235, 0.001516026943396676],
[189.3700065312401, 452.0510172551132, 1, 0, 0.2952351100270703, 0.005280667294242456, 0, -0.00834009014338627, 1, 0.2952351100270703, 0.001516213319410702],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5619708735038, 451.8590529128494, 0, 1, 0.2955343898060999, 0, 0.002213079484750019, 0.003495255688124507, 0.7044656101939001, 1, 0.0008620270238378753],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006531155225178126],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6605913155473, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2957311796509725, 0.005272576622606077, 0, -0.008327312036566037, 1, 0.2957311796509725, 0.001515610210809148],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515425906711807],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515924606489289],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[192.89902517589, 456.5942809263275, 0, 1, 0.2969992505904772, 0, 0.002190128176750756, 0.003459007243191956, 0.7030007494095227, 1, 0.001520750661351805],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4633504314604, 451.8643294546727, 1, 0, 0.2954236287838057, 0.005278065640255616, 0, -0.008335981187535974, 1, 0.2954236287838057, 0.001515741525295357],
[189.5566943316806, 451.8643294546727, 0, 0, 0.295526163474833, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004773332178189756],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6553147737241, 451.7657090126291, 0, 1, 0.2956799165299813, 0, 0.002213536751573247, 0.003495977878391912, 0.7043200834700187, 1, 0.0006672370580224759],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003701725745507295],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515679890246792],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9900576138506, 460.7864052743813, 1, 0, 0.297342263177695, 0.00512846661125848, 0, -0.008099710027533239, 1, 0.297342263177695, 0.001515622400927713],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.8741365184702, 451.982355372484, 0, 0, 0.2958202322751113, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004565819773596315],
[194.9568143649816, 461.0373825755507, 0, 1, 0.2971928948064383, 0, 0.002169021510606309, 0.003425672157214664, 0.7028071051935617, 1, 0.001058713405873988],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001515823671063719],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515476729326298],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.4526843777515, 460.7606371925559, 0, 1, 0.2978493089869564, 0, 0.002170324283977607, 0.003427729709176871, 0.7021506910130435, 1, 0.001515889009048746],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515622400927713],
[189.3700065312401, 452.0510172551132, 0, 0, 0.2952351100270703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005089868270718761],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5619708735038, 451.8590529128494, 0, 1, 0.2955343898060999, 0, 0.002213079484750019, 0.003495255688124507, 0.7044656101939001, 1, 0.0005814429312697249],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004244653833670403],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515823645100762],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515447782405842],
[194.7980932715868, 460.978369616645, 0, 1, 0.2970495348577149, 0, 0.002169299181719983, 0.003426110700676923, 0.7029504651422851, 1, 0.00151720658111294],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515647990122763],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001515370513701797],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.00151609777473026],
[189.9458995580313, 451.4751242283219, 0, 1, 0.2961329493641592, 0, 0.002214961459303516, 0.003498228008959952, 0.7038670506358409, 1, 0.001515585878332514],
[189.5394470448828, 451.7702883563074, 0, 1, 0.2955505531602616, 0, 0.00221351431418462, 0.003495942441612183, 0.7044494468397384, 1, 0.00151758717199245],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 1, 0.2958336695851296, 0, 0.002214020072095029, 0.003496741216904869, 0.7041663304148704, 1, 0.0007758365287593638],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007389699736254034],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515476082663286],
[194.9999134993521, 460.8878377740428, 0, 1, 0.2973068381300963, 0, 0.002169725295485591, 0.003426783688960123, 0.7026931618699037, 1, 0.001515477255149593],
[194.8967137136303, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2971129487687174, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7028870512312826, 1, 0.001517085706702295],
[193.9953341556738, 461.7811287325581, 0, 1, 0.2958253995595716, 0, 0.002165528077651594, 0.003420154758725279, 0.7041746004404283, 1, 0.0015172141601422],
[194.551304819795, 461.1661467377425, 1, 0, 0.2966999038346071, 0.005140032347386513, 0, -0.00811797652237331, 1, 0.2966999038346072, 0.001515627868568165],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001516000306649272],
[195.2980932715868, 460.478369616645, 0, 1, 0.2978119897921263, 0, 0.00217165466606502, 0.003429830865321713, 0.7021880102078737, 1, 0.001515371143472082],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515822985501393],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515289862203607],
[194.9332012157035, 460.7319732873653, 0, 2, 0.2973060165402931, 0, 0.004340918616369979, 0.006855885922807955, 0.4937788343904707, 1, 0.003045039897843339],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001517361201890781],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515508900672602],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001515143584598633],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001516056743893872],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515831827153648],
[194.8741898850093, 460.7909846180596, 0, 1, 0.2972160143059377, 0, 0.002170181347686045, 0.003427503960897351, 0.7027839856940623, 1, 0.001518432140076223],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515290584501146],
[195.1822255427455, 460.5942373454864, 0, 1, 0.2976353019489381, 0, 0.002171108361587928, 0.003428968052284874, 0.7023646980510618, 1, 0.00151547609525735],
[194.8967137136303, 461.0633946802576, 0, 1, 0.2971167167327188, 0, 0.002168899139549972, 0.003425478888905202, 0.7028832832672812, 1, 0.001522040105593223],
[195.220083483348, 460.9577589628404, 0, 1, 0.2975109350775701, 0, 0.002169396176886164, 0.003426263891246286, 0.7024890649224299, 1, 0.001515508905037392],
[195.0793068748959, 460.4070648405424, 1, 0, 0.2976100118822674, 0.005126120325213676, 0, -0.008096004390342807, 1, 0.2976100118822673, 0.001515647964520529],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515509541284601],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001517034805423784],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515083769675985],
[195.3967137136303, 460.3797491746016, 0, 1, 0.2979623770774661, 0, 0.002172119867984776, 0.00343056558798638, 0.7020376229225339, 1, 0.001515476109445138],
[194.8967137136303, 461.0974832269021, 0, 1, 0.2971012771494048, 0, 0.002168738794672425, 0.003425225646150401, 0.7028987228505952, 1, 0.001515925340065892],
[194.9900576138506, 460.774111828973, 1, 0, 0.2973478373780711, 0.00512846661125848, 0, -0.008099710027533239, 1, 0.2973478373780711, 0.001515289993279154],
[194.8967137136303, 461.0974832269021, 1, 0, 0.2971012771494048, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971012771494048, 0.001515380706096816],
[194.7637607020609, 461.0127021861709, 0, 1, 0.2969971807836227, 0, 0.002169137629522775, 0.003425855551126213, 0.7030028192163773, 1, 0.001517214003216479],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001515627089271093],
[194.9192375422514, 461.2586049039371, 0, 1, 0.2970524527551938, 0, 0.002167981235186415, 0.003424029184784773, 0.7029475472448062, 1, 0.001517053593300653],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.00151529059182036],
[194.8967137136303, 460.7733035074641, 0, 1, 0.2972481714806099, 0, 0.002170264623379598, 0.003427635483440297, 0.7027518285193901, 1, 0.001515380719547171],
[194.7935139279085, 460.8716605751603, 0, 1, 0.2970929698615505, 0, 0.002169801455685117, 0.00342690397355561, 0.7029070301384495, 1, 0.001516094150511744],
[194.5455789215235, 461.2308839667083, 0, 1, 0.296664473233284, 0, 0.002168111535376239, 0.003424234976073692, 0.703335526766716, 1, 0.001515660601807166],
[195.0296667251997, 460.7467961630321, 0, 1, 0.2974026635024866, 0, 0.002170389481441249, 0.003427832679633745, 0.7025973364975133, 1, 0.001515647213456937],
[195.088678055894, 460.6877848323378, 0, 1, 0.2974926504630347, 0, 0.002170667495262413, 0.003428271764355508, 0.7025073495369653, 1, 0.001515509541614098],
[194.8591368909, 461.0502790089012, 1, 0, 0.2970823899876249, 0.005131912292929284, 0, -0.008105152009415197, 1, 0.2970823899876249, 0.001515381376497015],
[194.8967137136303, 460.6620151223011, 1, 0, 0.2972986326636308, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2972986326636309, 0.001518431923177557],
[194.9900576138506, 460.7864052743813, 1, 0, 0.297342263177695, 0.00512846661125848, 0, -0.008099710027533239, 1, 0.297342263177695, 0.001515289983467783],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515822986761291],
[194.7047493713666, 461.0127021861709, 0, 1, 0.2969339140034795, 0, 0.002169137629522775, 0.003425855551126213, 0.7030660859965205, 1, 0.001515470279929285],
[195.088678055894, 460.6877848323378, 0, 1, 0.2974926504630347, 0, 0.002170667495262413, 0.003428271764355508, 0.7025073495369653, 1, 0.001515085633287559],
[194.8967137136303, 460.978369616645, 1, 0, 0.2971552337741229, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971552337741229, 0.001517555234601757],
[194.9902612004818, 460.6928577875298, 0, 1, 0.2973849037038377, 0, 0.002170643592788662, 0.003428234013674653, 0.7026150962961624, 1, 0.001515730291591949],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.5566943316806, 450.8643294546727, 2, 0, 0.297085201864465, 0.01049556409977823, 0, -0.01657630481535505, 1, 0.08825961716684982, 0.003033446050704592],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9902612004818, 460.5942373454863, 0, 1, 0.297429639707702, 0, 0.002171108361587928, 0.003428968052284874, 0.7025703602922979, 1, 0.001515910612305236],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.00151636615329611],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.5672474153271, 452.8537763710262, 0, 0, 0.2939835777477348, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004742802618515002],
[189.0672474153271, 452.3537763710262, 0, 1, 0.2947630969425508, 0, 0.002210659117344889, 0.00349143304958015, 0.7052369030574492, 1, 0.001040913496545654],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 1, 0, 0.2955426161373669, 0.005275172866803715, 0, -0.008331412448395836, 1, 0.2955426161373669, 0.001515671170209383],
[189.7592117575908, 451.6618120287624, 0, 1, 0.2958418959163965, 0, 0.002214045937397777, 0.003496782067605072, 0.7041581040836036, 1, 0.001515679104750293],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4959426392245, 452.3264607050854, 1, 0, 0.295246693870186, 0.005277157843447179, 0, -0.008334547446913363, 1, 0.295246693870186, 0.001516439750669234],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2955426161373669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002866165216417296],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6605913155473, 451.7604324708059, 1, 0, 0.2956881428612482, 0.005272576622606077, 0, -0.008327312036566037, 1, 0.2956881428612482, 0.0009544276270195165],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002735825048475904],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.001516124006323226],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.5566943316806, 450.8643294546727, 1, 0, 0.297085201864465, 0.005247782049889114, 0, -0.008288152407677529, 1, 0.297085201864465, 0.001515374792836812],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.2980932715868, 460.478369616645, 0, 1, 0.2978119897921263, 0, 0.00217165466606502, 0.003429830865321713, 0.7021880102078737, 1, 0.001521498448797361],
[193.9537400321915, 460.993553064218, 4, 11, 0.2961364098708339, 0.02062347443950345, 0.02386150506201908, 0.005114025514970377, 0.5287867431656523, 0.6917461541997261, 0.02463835820869991],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006544422274946836],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0008606113212258907],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001516104709371525],
[194.8967137136303, 460.781128732558, 0, 1, 0.2972446239551331, 0, 0.002170227766815533, 0.003427577273549471, 0.7027553760448668, 1, 0.001515659768884205],
[189.7539352157676, 452.1025566751866, 1, 1, 0.2956329609703552, 0.005269982932701283, 0.00221188751365202, -0.004829842525726908, 0.9126011523879005, 0.5038670743286109, 0.00304472172776531],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 461.0974832269021, 1, 0, 0.2971012771494048, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971012771494048, 0.001515391345228007],
[194.9240293795712, 460.8524335086607, 0, 1, 0.2972415760716213, 0, 0.002169891981228319, 0.003427046946242302, 0.7027584239283786, 1, 0.00151538068760015],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004565710147554525],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001058724305601532],
[194.8591368909, 461.0502790089012, 1, 0, 0.2970823899876249, 0.005131912292929284, 0, -0.008105152009415197, 1, 0.2970823899876249, 0.001515380744358557],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.8719578771562, 451.5490659091971, 0, 0, 0.296017671445081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000456570984337026],
[194.9557250443246, 460.8207378439072, 0, 1, 0.2972899091036028, 0, 0.002170041228350118, 0.003427282661613122, 0.7027100908963972, 1, 0.001058724330318562],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515380729969575],
[189.9410301894705, 451.0960649123552, 0, 0, 0.2963027126523766, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004565819636784877],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9902612004818, 460.5942373454864, 0, 1, 0.297429639707702, 0, 0.002171108361587928, 0.003428968052284874, 0.7025703602922979, 1, 0.001058713425662799],
[195.1487787072453, 460.845418233287, 0, 1, 0.2974855259656147, 0, 0.002169925012672655, 0.003427099114880843, 0.7025144740343853, 1, 0.001515380743514755],
[194.9953341556738, 460.781128732558, 0, 1, 0.2973503094283945, 0, 0.002170227766815533, 0.003427577273549471, 0.7026496905716055, 1, 0.001515621752453471],
[189.7539352157676, 451.7851112319743, 0, 0, 0.2957792456537943, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004565709880715349],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.9387605052959, 0, 1, 0.2971731804317913, 0, 0.002169485592627897, 0.003426405111153683, 0.7028268195682088, 1, 0.001058724329193238],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515823004940339],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.001515759566028805],
[194.8591368909, 461.0502790089012, 1, 0, 0.2970823899876249, 0.005131912292929284, 0, -0.008105152009415197, 1, 0.2970823899876249, 0.001515380726090733],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.9387605052959, 0, 1, 0.2971731804317913, 0, 0.002169485592627897, 0.003426405111153683, 0.7028268195682088, 1, 0.001518343602543801],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.2498052285375, 450.9486417874897, 0, 0, 0.2967097099406762, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004475885731064624],
[190.0018702221525, 451.3078651790377, 0, 1, 0.2962716137519591, 0, 0.002215782345391413, 0.003499524486012763, 0.7037283862480409, 1, 0.0006620045040464594],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004067438197755479],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.001515790955178566],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0071467639758, 452.3548656916832, 0, 1, 0.2946965100728396, 0, 0.002210653793832698, 0.003491424641822366, 0.7053034899271604, 1, 0.001516464126075494],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.551304819795, 461.1661467377425, 1, 0, 0.2966999038346071, 0.005140032347386513, 0, -0.00811797652237331, 1, 0.2966999038346071, 0.001515595253602377],
[193.9953341556738, 461.7811287325581, 0, 1, 0.2958253995595716, 0, 0.002165528077651594, 0.003420154758725279, 0.7041746004404283, 1, 0.001517115245017309],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515759566028805],
[194.8967137136303, 460.6877848323378, 0, 1, 0.2972869464514414, 0, 0.002170667495262413, 0.003428271764355508, 0.7027130535485586, 1, 0.001515823656381838],
[195.088678055894, 460.6877848323378, 0, 1, 0.2974926504630347, 0, 0.002170667495262413, 0.003428271764355508, 0.7025073495369653, 1, 0.001516842810109686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515758892942006],
[190.137863900295, 451.2831598860582, 0, 0, 0.2964322291431888, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004133702302355341],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.088678055894, 460.6877848323378, 0, 1, 0.2974926504630347, 0, 0.002170667495262413, 0.003428271764355508, 0.7025073495369653, 1, 0.001104239378461515],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515823403768756],
[195.0296667251997, 460.7467961630321, 0, 1, 0.2974026635024866, 0, 0.002170389481441249, 0.003427832679633745, 0.7025973364975133, 1, 0.001515621752453471],
[194.8031662267788, 461.0666405616733, 0, 1, 0.2970149932357104, 0, 0.002168883870630493, 0.003425454773739872, 0.7029850067642895, 1, 0.00151547611944125],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515964673713376],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.001515759566028805],
[195.1822255427455, 460.5942373454864, 0, 1, 0.2976353019489381, 0, 0.002171108361587928, 0.003428968052284874, 0.7023646980510618, 1, 0.001515476112772548],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.00151596467165892],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515622412603482],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006825749957017855],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.0008323217363356117],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 1, 0.2958336695851296, 0, 0.002214020072095029, 0.003496741216904869, 0.7041663304148704, 1, 0.001516323420013872],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006872424446499499],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0008284016834641011],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515622418807399],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515332165949975],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001514777822785036],
[189.7539352157676, 451.5957837944831, 0, 1, 0.2958665601484964, 0, 0.002214369655087592, 0.003497293335322507, 0.7041334398515036, 1, 0.001516445759772035],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.5957837944831, 0, 1, 0.2958665601484964, 0, 0.002214369655087592, 0.003497293335322507, 0.7041334398515036, 1, 0.0007641011650709688],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007510223253376211],
[195.0023510592588, 460.774111828973, 1, 0, 0.2973610095739199, 0.005128143299647255, 0, -0.008099199401161272, 1, 0.2973610095739199, 0.001515621750381859],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.8247552873667, 451.19488894103, 0, 1, 0.2961293885398179, 0, 0.002216337162743653, 0.003500400743968994, 0.703870611460182, 1, 0.001516884024257182],
[194.9900576138506, 460.7864052743813, 1, 0, 0.297342263177695, 0.00512846661125848, 0, -0.008099710027533239, 1, 0.297342263177695, 0.001515144192974715],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515622388261599],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8693980476894, 460.9070648405424, 0, 1, 0.297158268214488, 0, 0.002169634783849462, 0.003426640738237747, 0.702841731785512, 1, 0.001517410266943306],
[194.7980932715868, 460.978369616645, 0, 1, 0.2970495348577149, 0, 0.002169299181719983, 0.003426110700676923, 0.7029504651422851, 1, 0.001515897290141366],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3525556578111, 452.0684681285422, 0, 1, 0.2952079034454618, 0, 0.002212054302614306, 0.003493636553468068, 0.7047920965545382, 1, 0.0007743612321672046],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007403178963170261],
[194.0663578139042, 461.3087255163712, 0, 2, 0.2961149466161574, 0, 0.004335491373507573, 0.006847314336646512, 0.4954541683771749, 1, 0.003040157098504348],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004531302286572628],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001062834502172686],
[190.4447530034381, 451.0942934443038, 0, 0, 0.2968560589693604, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004534285093056266],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.2421226074656, 460.5933516114606, 1, 0, 0.2976998504693439, 0.005121845566135852, 0, -0.008089252994342308, 1, 0.2976998504693439, 0.001061226696641952],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8591368909001, 460.9173259973318, 1, 0, 0.2971426208752343, 0.005131912292929283, 0, -0.008105152009415195, 1, 0.2971426208752344, 0.001515370084216494],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.001516004215507799],
[189.9458995580313, 451.4751242283219, 0, 1, 0.2961329493641592, 0, 0.002214961459303516, 0.003498228008959952, 0.7038670506358409, 1, 0.001515028191760417],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001515561253689759],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005603562398324677],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.0009553568075693772],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.0009349937785910713],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005798219546751163],
[189.8472791159878, 451.5737446703654, 1, 0, 0.2959791963090109, 0.005267391793321656, 0, -0.008319123309422161, 1, 0.2959791963090108, 0.001516071923453134],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515836063735867],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006086449190956313],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0009062590401936755],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 2, 0, 0.2958336695851296, 0.01053996586540257, 0, -0.01664643131778331, 1, 0.08751756006020361, 0.003036319762674833],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515995408399861],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001516073836355814],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9458995580313, 451.4751242283219, 0, 1, 0.2961329493641592, 0, 0.002214961459303516, 0.003498228008959952, 0.7038670506358409, 1, 0.001515064633387716],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0015210543319557],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.612457238704, 1, 0, 0.295858868578365, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.295858868578365, 0.001516200516059847],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8524335086607, 1, 0, 0.2972123022030598, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2972123022030597, 0.001515843885474092],
[194.8967137136303, 460.9510539507042, 1, 0, 0.2971676101112831, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.297167610111283, 0.00151581935116083],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7980932715868, 460.9783696166451, 0, 1, 0.2970495348577149, 0, 0.002169299181719983, 0.003426110700676922, 0.7029504651422851, 1, 0.001515583447175784],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515801567934081],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 1, 0.2958336695851296, 0, 0.002214020072095029, 0.003496741216904869, 0.7041663304148704, 1, 0.001270385999704612],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000244662142280959],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515940696997805],
[189.1431404421182, 452.277883344235, 0, 1, 0.2948814170848237, 0, 0.002211030069845105, 0.003492018918205899, 0.7051185829151763, 1, 0.001515371149497061],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9511760998545, 452.4698476864987, 0, 0, 0.2945821373057941, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005737186053315669],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.4953341556738, 461.2811287325581, 1, 0, 0.296587854493983, 0.005141511514099364, 0, -0.008120312663439369, 1, 0.2965878544939831, 0.0009419945988162246],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9458995580313, 451.4751242283219, 0, 1, 0.2961329493641592, 0, 0.002214961459303516, 0.003498228008959952, 0.7038670506358409, 1, 0.0007684563550527852],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006148186027909948],
[189.1385741111074, 449.2859080937499, 1, 0, 0.296258334984116, 0.005287128787449569, 0, -0.008350295186197234, 1, 0.296258334984116, 0.00151690189624855],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001311240265733691],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.9146075312818, 452.1627905377187, 1.666666666666667, 10.33333333333333, 0.2946829947527624, 0.008822328185451133, 0.02285312624031885, 0.0221597222549565, 0.2075626382310014, 0.934182127147374, 0.01851951784999853],
[189.6787815703071, 451.7422422160462, 0, 0, 0.2957165021667358, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006656895688722707],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8591368909001, 460.9173259973318, 1, 0, 0.2971426208752343, 0.005131912292929283, 0, -0.008105152009415195, 1, 0.2971426208752344, 0.0008495724272691059],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001515529399425397],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0015155095492586],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 1, 0, 0.2955426161373669, 0.005275172866803715, 0, -0.008331412448395836, 1, 0.2955426161373669, 0.001515599570964827],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2955426161373669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005172272892047615],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.0009985171061070103],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7592117575908, 451.6618120287624, 0, 1, 0.2958418959163965, 0, 0.002214045937397777, 0.003496782067605072, 0.7041581040836036, 1, 0.001515735018444873],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2955426161373669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005405195016374255],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6605913155473, 451.7604324708059, 1, 0, 0.2956881428612482, 0.005272576622606077, 0, -0.008327312036566037, 1, 0.2956881428612482, 0.000689396379083227],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000284885764340669],
[189.6605913155473, 451.7604324708059, 1, 0, 0.2956881428612482, 0.005272576622606077, 0, -0.008327312036566037, 1, 0.2956881428612482, 0.00151538804505788],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.5684681285422, 0, 1, 0.295879161910228, 0, 0.002214503603726695, 0.003497504888836951, 0.7041208380897721, 1, 0.001515082693819753],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.7811287325581, 0, 1, 0.2972446239551331, 0, 0.002170227766815533, 0.003427577273549471, 0.7027553760448668, 1, 0.00151650819432021],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001515492246539325],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005743990294492864],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.0009411569800615776],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 1, 0, 0.2955426161373669, 0.005275172866803715, 0, -0.008331412448395836, 1, 0.2955426161373669, 0.001515806942257432],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2955426161373669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006587685133981194],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.0008564002576661217],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0230547185341, 452.3979690678192, 0, 1, 0.2946941988317092, 0, 0.002210443168125915, 0.003491091987390036, 0.7053058011682909, 1, 0.001516569792630839],
[194.638517550456, 461.1379453377759, 1, 0, 0.296806196265738, 0.005137729225361424, 0, -0.008114339056835307, 1, 0.296806196265738, 0.001517305057245093],
[194.8591368909001, 460.9173259973318, 1, 0, 0.2971426208752343, 0.005131912292929283, 0, -0.008105152009415195, 1, 0.2971426208752344, 0.00151519145935062],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9568143649816, 460.9309369084132, 0, 1, 0.2972411269862508, 0, 0.002169522416323944, 0.003426463269133978, 0.7027588730137493, 1, 0.00151601441757822],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.0426605245105, 452.3783632618428, 0, 1, 0.2947247650358861, 0, 0.002210538967402352, 0.003491243289215475, 0.7052752349641139, 1, 0.001516116446072337],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5070476843293, 451.8914713012015, 2, 5, 0.2954591288799098, 0.01055369720777611, 0.01106460359962697, 0.0008069066133960289, 0.6573491632195716, 0.6608837400768717, 0.6826676063614805],
[194.7910763680018, 460.9853865202301, 1, 0, 0.2970388347121894, 0.00513370539680569, 0, -0.008107983971198131, 1, 0.2970388347121895, 0.001515834432694567],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.001515934955076816],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7266195498267, 451.6944042365266, 0, 1, 0.2957910834132894, 0, 0.002213886181942509, 0.003496529755761966, 0.7042089165867107, 1, 0.001517154597089897],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.00151486663235383],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001515450893633828],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515281409484459],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.1553147737241, 451.2657090126291, 1, 0, 0.2964594357247973, 0.005258859060499851, 0, -0.008305647027555119, 1, 0.2964594357247974, 0.001516090320179257],
[189.9073797673391, 451.6249324041771, 0, 1, 0.2960215349473569, 0, 0.002214226736058629, 0.003497067614306897, 0.7039784650526431, 1, 0.001521765813212756],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0015151599457907],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.2527886611744, 451.3908118955048, 0, 1, 0.2965085111050967, 0, 0.002215375177444897, 0.003498881420053817, 0.7034914888949033, 1, 0.001514564905098231],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.0501582652019, 460.837593008193, 0, 1, 0.297383443869039, 0, 0.002169961858954119, 0.003427157308531708, 0.702616556130961, 1, 0.001520952109697683],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006094509289184714],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0009054887720296415],
[189.7539352157676, 451.5898887320672, 0, 1, 0.295869279675486, 0, 0.002214398561508338, 0.003497338989051726, 0.704130720324514, 1, 0.001516829981444361],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.9861948417391, 0, 1, 0.297151688466627, 0, 0.002169262357939611, 0.003426052542563448, 0.702848311533373, 1, 0.00151583629897151],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5426605245105, 451.8783632618428, 0, 0, 0.2955042842307021, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000607944027073572],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7910763680018, 460.9853865202301, 1, 0, 0.2970388347121894, 0.00513370539680569, 0, -0.008107983971198131, 1, 0.2970388347121895, 0.0009069550171184122],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7980932715868, 461.0056852825858, 0, 2, 0.2970371620929835, 0, 0.004338341291331464, 0.006851815391196645, 0.4941567514782864, 1, 0.003032917611412002],
[194.7980932715868, 460.978369616645, 0, 1, 0.2970495348577149, 0, 0.002169299181719983, 0.003426110700676923, 0.7029504651422851, 1, 0.001516058870317691],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6109431018444, 451.8673823504582, 0, 2, 0.2955843332167939, 0, 0.00442607738048427, 0.006990382517582431, 0.4962014316096287, 1, 0.003041097905696555],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001515205044311203],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001514734347350033],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515080119029796],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515693558809643],
[187.8723249444864, 450.5556540816057, 1, 1, 0.2942733262271517, 0.005322763745514332, 0.002219481635489314, -0.004901208710154022, 0.9134032094712083, 0.5019498619255118, 0.003050647669242504],
[188.7551527141433, 449.6695197719476, 0.75, 1, 0.2956576724691912, 0.003973401463301102, 0.002223855422771718, -0.002763168151860022, 0.8398790699817171, 0.4584711118328902, 0.001611596742369108],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001517295195170886],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001517376238586625],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8084443984989, 1, 0, 0.2972322412023818, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2972322412023818, 0.001515891628562262],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9902612004818, 460.5942373454863, 0, 1, 0.297429639707702, 0, 0.002171108361587928, 0.003428968052284874, 0.7025703602922979, 1, 0.001515978449701716],
[194.6112018845151, 461.1652610037168, 0, 1, 0.2967645423371712, 0, 0.002168420053634396, 0.003424722238372287, 0.7032354576628288, 1, 0.001516098627405041],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9680184897329, 460.8084443984989, 0, 1, 0.2973086554998278, 0, 0.002170099120699311, 0.003427374094643075, 0.7026913445001722, 1, 0.001515667073349149],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515848396661811],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3087593252956, 452.171275791752, 0, 1, 0.2951124726598131, 0, 0.002211551360154401, 0.003492842224793525, 0.7048875273401869, 1, 0.001516087293046189],
[194.7980932715868, 460.978369616645, 0, 1, 0.2970495348577149, 0, 0.002169299181719983, 0.003426110700676923, 0.7029504651422851, 1, 0.001515825416730646],
[194.6487787072453, 461.1866955116809, 0, 1, 0.2967951359128053, 0, 0.002168319272286276, 0.003424563068047542, 0.7032048640871946, 1, 0.001515546845294965],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515354283013785],
[195.0296667251997, 460.7467961630321, 0, 1, 0.2974026635024866, 0, 0.002170389481441249, 0.003427832679633745, 0.7025973364975133, 1, 0.001515363446802294],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.648297870139, 451.7727259162142, 1, 0, 0.2956689769079158, 0.005272918403331764, 0, -0.00832785183237264, 1, 0.2956689769079158, 0.0007719953654580729],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007429225993113787],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6359125543789, 451.7851112319743, 0, 0, 0.2956496677251781, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003987467389200003],
[194.837702382936, 460.9387605052959, 0, 1, 0.2971099351825066, 0, 0.002169485592627897, 0.003426405111153683, 0.7028900648174934, 1, 0.001117935189217677],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2955426161373669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000475648717032683],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.001039433463650486],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0619708735038, 451.795911594925, 0, 1, 0.2961122330422614, 0, 0.002213388776515951, 0.003495744172072605, 0.7038877669577386, 1, 0.0007616474815359977],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007532783018285506],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.9730930748218, 2, 0, 0.2971576244193436, 0.01026184568170134, 0, -0.01620717861097249, 1, 0.08830265375054758, 0.003032505908503949],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7980932715868, 460.9783696166451, 0, 1, 0.2970495348577148, 0, 0.002169299181719983, 0.003426110700676922, 0.7029504651422851, 1, 0.001515675318597139],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.2831598860582, 0, 0, 0.2960108497085118, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004848068846194484],
[189.7539352157676, 451.4751242283219, 0, 1, 0.2959222331256694, 0, 0.002214961459303516, 0.003498228008959952, 0.7040777668743305, 1, 0.0005331264424538535],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004968727687223575],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005849346342193202],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.0006679148014372805],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002598939017764127],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004532852879483727],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001062241321848783],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2956286598780818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004881873047730661],
[194.8033698134101, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2970998706113887, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970998706113888, 0.001027535235661856],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9406230162081, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2960385599893366, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004859172691888345],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9900576138506, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2972999451958973, 0.00512846661125848, 0, -0.008099710027533239, 1, 0.2972999451958973, 0.001029599633903449],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.001515281821639676],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005090642804281624],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.0005798930844165851],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004257938590040615],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 1, 0.2971999221430547, 0, 0.002169763374917035, 0.003426843830202348, 0.7028000778569453, 1, 0.00151612473161038],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.7467961630321, 0, 1, 0.2972601890778934, 0, 0.002170389481441249, 0.003427832679633745, 0.7027398109221066, 1, 0.001515878767660802],
[194.8967137136303, 460.9387605052959, 0, 1, 0.2971731804317913, 0, 0.002169485592627897, 0.003426405111153683, 0.7028268195682088, 1, 0.001515958775349654],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9568143649816, 460.9309369084132, 0, 1, 0.2972411269862508, 0, 0.002169522416323944, 0.003426463269133978, 0.7027588730137493, 1, 0.001515844582390681],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5426605245104, 451.8783632618428, 0, 0, 0.2955042842307021, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004659962528470815],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.648297870139, 451.7727259162142, 1, 0, 0.2956689769079158, 0.005272918403331764, 0, -0.00832785183237264, 1, 0.2956689769079158, 0.0005317719496347185],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005170530902582687],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004856733120230734],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001028865531042557],
[190.5866496346722, 450.834374151681, 0, 1, 0.2971319033318021, 0, 0.00221810948173964, 0.003503199878882395, 0.7028680966681979, 1, 0.001514900811074218],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.4880291926287, 450.9329945937245, 0, 0, 0.2969781502766538, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006120565110355248],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.2637607020609, 460.5127021861709, 0, 1, 0.2977596357180342, 0, 0.002171492762854848, 0.003429575161394141, 0.7022403642819658, 1, 0.0009036693156359994],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.296064850365, 451.1249589359882, 0, 1, 0.2966788704976241, 0, 0.002216680722695047, 0.003500943349818716, 0.7033211295023758, 1, 0.001515575878579339],
[190.4880291926287, 450.9329945937245, 0, 0, 0.2969781502766538, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000667571627078846],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.2637607020609, 460.5127021861709, 0, 1, 0.2977596357180342, 0, 0.002171492762854848, 0.003429575161394141, 0.7022403642819658, 1, 0.0008480149845002018],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.2766626310199, 452.0263384939448, 1, 0, 0.2951438903279627, 0.00528327151429874, 0, -0.008344203151991509, 1, 0.2951438903279626, 0.001515507996505531],
[189.5619708735038, 451.8000415821551, 0, 1, 0.2955615817464857, 0, 0.00221336854352228, 0.00349571221683254, 0.7044384182535144, 1, 0.00100142802965088],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005133949248521023],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001515644000182728],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7980932715868, 460.978369616645, 0, 1, 0.2970495348577149, 0, 0.002169299181719983, 0.003426110700676923, 0.7029504651422851, 1, 0.001517184389775651],
[194.5888816425253, 460.9956169034429, 1, 0, 0.2968173928366323, 0.005139039761979191, 0, -0.008116408869781166, 1, 0.2968173928366323, 0.001515473003421748],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[185.1424055953631, 447.5317744843373, 1.5, 1.5, 0.2926346789939176, 0.008101871611619415, 0.003351717320470386, -0.007502217575110319, 0.8840773104416583, 0.4264221250244082, 0.004584213862344816],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000666412732525887],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0008492114462832313],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7637607020609, 461.0127021861709, 0, 1, 0.2969971807836227, 0, 0.002169137629522775, 0.003425855551126213, 0.7030028192163773, 1, 0.00151683128004914],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515728701204022],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515341660113309],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2956286598780818, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006068403957193432],
[194.8033698134101, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2970998706113887, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970998706113888, 0.0009083296365548231],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9458995580313, 451.5931468897106, 0, 1, 0.2960784703749186, 0, 0.002214382585048889, 0.003497313756424001, 0.7039215296250814, 1, 0.001515105451234533],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.9387605052959, 0, 1, 0.2971731804317913, 0, 0.002169485592627897, 0.003426405111153683, 0.7028268195682088, 1, 0.001515889040824468],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.1553147737241, 451.2657090126291, 1, 0, 0.2964594357247973, 0.005258859060499851, 0, -0.008305647027555119, 1, 0.2964594357247974, 0.001516371799277922],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 1, 0, 0.2958336695851296, 0.005269982932701283, 0, -0.008323215658891655, 1, 0.2958336695851296, 0.001516387344599448],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001516024843998184],
[189.2580652029976, 452.2809812447443, 1, 0, 0.2950063074896784, 0.005283790674534283, 0, -0.00834502309441962, 1, 0.2950063074896785, 0.001515489712917009],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.6487787072453, 461.1866955116809, 0, 1, 0.2967951359128053, 0, 0.002168319272286276, 0.003424563068047542, 0.7032048640871946, 1, 0.001516059747311791],
[194.9342905363605, 460.7092193403019, 1, 0, 0.2973175019654064, 0.00512993377023871, 0, -0.008102027204031583, 1, 0.2973175019654064, 0.001515940389977259],
[189.5619708735038, 451.8590529128494, 0, 1, 0.2955343898060999, 0, 0.002213079484750019, 0.003495255688124507, 0.7044656101939001, 1, 0.0015151417807886],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.6799935348924, 451.7410302514608, 0, 1, 0.2957183916660514, 0, 0.002213657677814548, 0.003496168864814073, 0.7042816083339487, 1, 0.00151609479796784],
[189.4290178619344, 451.9920059244188, 0, 1, 0.295327110957046, 0, 0.002212428509559123, 0.00349422756204296, 0.704672889042954, 1, 0.001004695345510383],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3700065312401, 452.0510172551132, 0, 0, 0.2952351100270703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005126637863043338],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001516035189700548],
[190.4006747552029, 451.8231081470634, 0, 0, 0.2964709184309017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006639228604587503],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[195.220083483348, 460.9577589628404, 0, 1, 0.2975109350775701, 0, 0.002169396176886164, 0.003426263891246286, 0.7024890649224299, 1, 0.0008506941972823002],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.9342905363605, 460.8421723518713, 1, 0, 0.297257223410875, 0.005129933770238709, 0, -0.008102027204031583, 1, 0.297257223410875, 0.001516368682903067],
[194.9568143649816, 461.2210280812068, 0, 1, 0.2971097189722153, 0, 0.002168157866002439, 0.003424308148947, 0.7028902810277846, 1, 0.001515284890057238],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.40587747964, 450.2388905323698, 0, 0, 0.2950088796094185, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005120592555699396],
[189.5797117718154, 451.9526003997009, 0, 1, 0.2955107765813212, 0, 0.002212621410111621, 0.003494532222023773, 0.7044892234186788, 1, 0.000582869669036486],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004198135206404055],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515418267656309],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.1829115575372, 452.2381122288161, 0, 0, 0.2949434217805602, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006818405545061175],
[194.6112018845151, 461.1652610037168, 0, 1, 0.2967645423371712, 0, 0.002168420053634397, 0.003424722238372288, 0.7032354576628288, 1, 0.000833559836282981],
[189.2817355862119, 452.1392882001414, 0, 1, 0.2950974922350822, 0, 0.002211707821235269, 0.00349308933362384, 0.7049025077649178, 1, 0.001515920799752253],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.5672474153271, 451.8537763710262, 0, 0, 0.2955426161373669, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006855075948132071],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8033698134101, 460.9730930748218, 1, 0, 0.2970575811084144, 0.005133381424345161, 0, -0.008107472301105274, 1, 0.2970575811084144, 0.0008301376221411587],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.7539352157676, 451.6670885705857, 0, 0, 0.2958336695851296, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006090720200990998],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.0009061027341363629],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.7047493713665, 461.0717135168653, 0, 1, 0.2969071938230746, 0, 0.002168860007421431, 0.003425417085072209, 0.7030928061769254, 1, 0.001515680467820229],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.0198412389064, 451.4011825474469, 0, 0, 0.2962482272832374, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004880257641048498],
[195.0296667251997, 460.7467961630321, 0, 1, 0.2974026635024866, 0, 0.002170389481441249, 0.003427832679633745, 0.7025973364975133, 1, 0.001027333986412177],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[190.1996972166954, 451.7467981705235, 2, 3.75, 0.2962859032386614, 0.01051526384777254, 0.008301110301581961, -0.003496952020942816, 0.7745882541156586, 0.5464001750494285, 0.007663225480034599],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 461.0974832269021, 1, 0, 0.2971012771494048, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971012771494048, 0.001517073984339034],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[188.847900478063, 449.5749873945158, 1, 0, 0.2958037753116312, 0.005295266706532235, 0, -0.008363147913882429, 1, 0.2958037753116312, 0.0008176095307646822],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000697146311051103],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515704792930114],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 1, 0, 0.2971999221430547, 0.005130922840850672, 0, -0.008103589305486247, 1, 0.2971999221430547, 0.001515539654263589],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.3700065312401, 451.9329945937245, 0, 0, 0.2952894438339598, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005096607540433501],
[189.5619708735038, 451.8000415821551, 0, 1, 0.2955615817464857, 0, 0.00221336854352228, 0.00349571221683254, 0.7044384182535143, 1, 0.0005834063483175861],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000421818348182438],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.4880291926287, 451.9329945937245, 0, 0, 0.2954191118870217, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005087804364913691],
[189.6209822041981, 451.8000415821551, 0, 1, 0.2956263907360757, 0, 0.00221336854352228, 0.00349571221683254, 0.7043736092639243, 1, 0.0005831429522516746],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004229727566216984],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[189.9684233866523, 451.4526003997009, 0, 1, 0.2961680648776609, 0, 0.002215071967942224, 0.003498402542206811, 0.7038319351223391, 1, 0.000775246511017117],
[194.8967137136303, 460.8797491746016, 0, 0, 0.2971999221430547, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007392246474084407],
[194.837702382936, 460.9387605052959, 0, 1, 0.2971099351825066, 0, 0.002169485592627897, 0.003426405111153683, 0.7028900648174934, 1, 0.001515681285396698],
[195.0296667251997, 460.7467961630321, 0, 1, 0.2974026635024866, 0, 0.002170389481441249, 0.003427832679633745, 0.7025973364975133, 1, 0.001515006250498856]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.0006097601891465231, 6.233656264770353, 0, 1, 9.780785528004227e-05, 0, 0.1604194966045084, 0.2533606053721624, 0.99990219214472, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.155738985982667, 1, 3, 0.3333665296312032, 0.4811902936673972, 0.7218932685905005, 0.3801573545125062, 0.5925335769520815, 0.8025084766243538, 0.6331666928600346],
[1.289600585461657, 4.944483534311789, 0, 10.5, 0.2068628784413199, 0, 2.123578716995661, 3.353901493781025, 0.08773177310786576, 1, 0.6331666928600346],
[2.077455107819914, 4.157084614782273, 1, 2, 0.3332170778042329, 0.4813581753154715, 0.4811063967493358, -0.0003976497326454321, 0.7408957345943842, 0.7035486692993025, 0.6331666928600346],
[1.668277865280271, 4.566261857321921, 0, 1, 0.2675863719710106, 0, 0.218997515089179, 0.345876555982375, 0.7324136280289895, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.2405951468336986, 0.3799870548258351, 0.6666666666666667, 1, 0.6331666928600346],
[2.077843790052528, 4.156695932549659, 0, 1, 0.3332794211767846, 0, 0.2405756919021532, 0.3799563284282452, 0.6667205788232153, 1, 0.6331666928600346],
[1.52607441122511, 4.708465311377077, 0, 3, 0.2447773980319037, 0, 0.637150281802245, 1.006291532683465, 0.4307496533060786, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 3, 0, 0.3333333333333333, 1.443570881002192, 0, -2.27992232895501, 1, 0.03703703703703698, 0.6331666928600346],
[2.077861695959084, 4.156678026643103, 1, 2, 0.3332822932262626, 0.4812639849633627, 0.4811534564814929, -0.0001745645864133499, 0.7408087916114765, 0.7036356450172914, 0.6331666928600346],
[1.186952511633141, 4.142606145615425, 0, 1, 0.2227112201905881, 0, 0.2413939353270187, 0.3812486317570408, 0.7772887798094119, 1, 0.6331666928600346],
[1.031297545611151, 4.299460313754317, 0, 2, 0.1934617127280114, 0, 0.4651746624109636, 0.7346796154260018, 0.6505040088356329, 1, 0.6331666928600346],
[2.077694994230367, 4.15684472837182, 0, 1, 0.3332555548083305, 0, 0.2405670804046815, 0.3799427277484104, 0.6667444451916695, 1, 0.6331666928600346],
[1.186573089067704, 4.5847153155871, 1, 1, 0.205599340367513, 0.842763087426586, 0.2181160510883202, -0.9865443703564298, 0.9577289112404437, 0.3689275919754695, 0.6331666928600346],
[1.030996751385826, 4.741372940737761, 0, 3, 0.1786089260347659, 0, 0.6327281227393173, 0.9993073386113597, 0.5541788374079898, 1, 0.6331666928600346],
[2.077878332080163, 4.156661390522024, 1, 2, 0.3332849616062584, 0.4812601318186425, 0.4811553821921553, -0.0001654376764735572, 0.7408052340367904, 0.7036392033878425, 0.6331666928600346],
[2.077401811443747, 4.157137911158439, 1, 2, 0.3332085292379334, 0.4813705247060618, 0.4811002287491287, -0.0004268954131371624, 0.7409071306213237, 0.703537267089102, 0.6331666928600346],
[1.186689893261063, 4.142868763987503, 0, 0, 0.2226619443707751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.186743859863428, 3.380921151060087, 0, 2, 0.2598141188168013, 0, 0.5915547599721162, 0.934279655962388, 0.5478751387029483, 1, 0.6331666928600346],
[0, 4.173525528027913, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.668277865280271, 4.566261857321921, 0, 0, 0.2675863719710106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[3.746457772814332, 2.488081949787851, 0, 0, 0.6009197053043442, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.083660807683186, 4.149499634755679, 2, 2, 0.3342864068597449, 0.9598491235355104, 0.4819858238444596, -0.7547195787139825, 0.8880398957251494, 0.4091017568828313, 0.6331666928600346],
[0.8921733830632681, 5.342366339538918, 0, 1, 0.1431017240661498, 0, 0.1871829703251512, 0.2956298435087286, 0.8568982759338502, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.2405951468336986, 0.3799870548258351, 0.6666666666666667, 1, 0.6331666928600346],
[1.668066758564129, 4.566472964038063, 1, 1, 0.2675525111367654, 0.5994963899771011, 0.2189873908977915, -0.600961805745874, 0.928415653784411, 0.4635206760579418, 0.6331666928600346],
[3.745500445444171, 2.488442286992938, 1, 0, 0.6008236851383295, 0.2669870193758346, 0, -0.4216693998382093, 1, 0.6008236851383295, 0.6331666928600346],
[1.668164234632862, 4.56637548796933, 1, 0, 0.2675681459828118, 0.5994613595226042, 0, -0.9467670461546511, 1, 0.2675681459828119, 0.6331666928600346],
[2.076079919519991, 4.158459803082197, 1, 1, 0.3329965020502703, 0.4816770253387979, 0.240473648262468, -0.3809476711208645, 0.8891133296222842, 0.555106333722825, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 2, 0, 0.3333333333333333, 0.9623805873347945, 0, -1.51994821930334, 1, 0.1111111111111109, 0.6331666928600346],
[0.0003705415739390105, 4.173680491536193, 0, 1, 8.877265059764157e-05, 0, 0.2395966825989436, 0.3784101174316001, 0.9999112273494024, 1, 0.6331666928600346],
[1.525400834413241, 4.709138888188946, 0, 1, 0.2446693584906001, 0, 0.2123530487724865, 0.3353825322258833, 0.7553306415093999, 1, 0.6331666928600346],
[1.280766381162057, 4.708924715822797, 0, 2, 0.21382845299097, 0, 0.4247254141226034, 0.6707955723383124, 0.6180657013265715, 1, 0.6331666928600346],
[2.078003393503857, 4.156294594254494, 0.6875, 1.8125, 0.3333179449529391, 0.3308464279457991, 0.4360855466081572, 0.1662107622670257, 0.6747610439311864, 0.6370916894029626, 0.6331666928600346],
[3.744247234645927, 2.488913994467831, 1, 0, 0.6006979599945774, 0.2670763807333263, 0, -0.4218105338531527, 1, 0.6006979599945774, 0.6331666928600346],
[1.186689893261063, 3.379571964060858, 0, 0, 0.2598821378056159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.280590828079005, 4.95394889452318, 0, 1, 0.205402625543704, 0, 0.2018591675633849, 0.3188088853056696, 0.794597374456296, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0.4811902936673972, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.6331666928600346],
[1.280307029423114, 4.156359815068125, 0, 0, 0.235494847494729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.07794359127582, 4.156596131326368, 2, 4, 0.3332954289700992, 0.9624900350504877, 0.9623258728106456, -0.0002592717552790596, 0.680458958478852, 0.6487591421312764, 0.6331666928600346],
[1.667506396860206, 4.567033325741985, 1, 0, 0.2674626309324751, 0.5996978493653325, 0, -0.9471405494443775, 1, 0.2674626309324751, 0.6331666928600346],
[1.458444829561728, 4.775562058137209, 1, 2, 0.2339498264654727, 0.6856618637405067, 0.4187988713479592, -0.4214735162191156, 0.8614117638121401, 0.550456579347651, 0.6331666928600346],
[1.280198707305768, 4.953805804621553, 0, 2, 0.2053573597607131, 0, 0.4037299964673908, 0.637636188100371, 0.6314569256864647, 1, 0.6331666928600346],
[1.45944253958478, 4.775097183017403, 0, 0, 0.2340898614044976, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.280530419374949, 4.954009303227237, 1, 0, 0.2053929361830224, 0.7809263918057635, 0, -1.233366190312844, 1, 0.2053929361830225, 0.6331666928600346],
[2.309123567217475, 3.68024929853811, 1, 1, 0.3855367864004522, 0.4330647411844718, 0.2717207229404883, -0.2548207605728396, 0.851361386332012, 0.6224349591329166, 0.6331666928600346],
[1.280754093256592, 4.156359815068125, 1, 0, 0.2355577085290858, 0.7807900089995304, 0, -1.233150792365082, 1, 0.2355577085290859, 0.6331666928600346],
[0.8921733830553701, 5.342366339546816, 0, 1, 0.143101724064883, 0, 0.1871829703248745, 0.2956298435082915, 0.856898275935117, 1, 0.6331666928600346],
[1.525579352954674, 4.708960369647513, 0, 0, 0.2446979922870591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.030507097287134, 4.741478053339706, 0, 0, 0.1785359924523056, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.466906988677863, 2.970078057196917, 1, 0, 0.4537270137517826, 0.4053659114792769, 0, -0.6402198916184707, 1, 0.4537270137517826, 0.6331666928600346],
[1.526661928629932, 4.707877793972255, 0, 1, 0.2448716339227573, 0, 0.2124099315577717, 0.3354723707880292, 0.7551283660772427, 1, 0.6331666928600346],
[1.666054128631168, 4.568485593971023, 3, 1, 0.2672296918072703, 1.800661784299171, 0.2188909167886374, -2.498190263871309, 0.9949003679343278, 0.06103441888011507, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[0, 4.173525528027913, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6331666928600346],
[3.743211971600379, 2.491327751001804, 1, 0, 0.600399089291235, 0.267150246255613, 0, -0.4219271943204824, 1, 0.600399089291235, 0.6331666928600346],
[2.466906988716463, 2.970078057021745, 1, 0, 0.4537270137702794, 0.405365911472934, 0, -0.6402198916084531, 1, 0.4537270137702794, 0.6331666928600346],
[0, 4.173525528027913, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078471243406329, 4.155470642728202, 1, 1, 0.3334120338897036, 0.4811228460207789, 0.2406466284992131, -0.3797992222795656, 0.8888364156575312, 0.5556604834369383, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.468157880474133, 2.969970266975182, 2, 1, 0.4538616622397528, 0.8103209344192357, 0.3367037074813775, -0.7480134888310593, 0.9065088508149692, 0.4309889269830328, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.4811902936673972, 0.7599741096516701, 0.4444444444444445, 1, 0.6331666928600346],
[1.280307029423114, 4.708924861736975, 0, 3, 0.2137681513572392, 0, 0.6370881014426283, 1.006193327328828, 0.486017488256216, 1, 0.6331666928600346],
[1.280307029423114, 4.954232693179073, 0, 0, 0.2053571051575138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078313937942307, 4.156084472905442, 2, 1, 0.3333623873517733, 0.9623185234373957, 0.2406110863528523, -1.139837968773385, 0.9629532774459895, 0.2592979987945992, 0.6331666928600346],
[2.078981421441584, 4.155558301160603, 1.75, 1, 0.3334618935708462, 0.8417583639523507, 0.2406415522363651, -0.949381605972862, 0.9266585704608854, 0.3340990332786284, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 2.75, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0.6616366537926712, 0.2849902911193763, 0.6284860284717878, 0.7813961640098129, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 13, 2, 0.3333333333333333, 6.255473817676164, 0.4811902936673972, -9.119689315820041, 0.9999978395567006, 3.143096543745116e-05, 0.6331666928600346],
[2.075797776674977, 4.158741945927209, 1, 4, 0.3329512472507876, 0.4817424949755003, 0.9618293349308027, 0.7582313557694175, 0.4616603037681253, 0.8679349554209508, 0.6331666928600346],
[1.665049719601469, 4.156359815068125, 6, 0, 0.2860217460539773, 3.603495997366436, 0, -5.691227978353263, 1, 0.0005475128559323528, 0.6331666928600346],
[1.61562533555871, 4.156359815068125, 0, 0, 0.2799080894002741, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[0.8914900142729997, 5.343049708329186, 0, 0, 0.1429921139231923, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.28025301378129, 4.95401982197616, 0, 1, 0.2053572321118575, 0, 0.2018562775150746, 0.318804320870517, 0.7946427678881425, 1, 0.6331666928600346],
[0.001331070993782075, 4.173240357398337, 0, 1, 0.0003188521304795953, 0, 0.2396219518550366, 0.3784500267578138, 0.9996811478695204, 1, 0.6331666928600346],
[1.964517371814943, 4.270022350787248, 1, 0, 0.3151022303527785, 0.5090308766657217, 0, -0.8039444942474985, 1, 0.3151022303527784, 0.6331666928600346],
[2.077943594732286, 4.156596127869901, 2, 1, 0.3332954295245053, 0.9624900334494749, 0.2405814684027198, -1.140155622820068, 0.9629755961292614, 0.2592087222842961, 0.6331666928600346],
[2.076038336269971, 4.157603401283548, 1, 4, 0.3330378009636373, 0.4816866733765165, 0.9620927284129862, 0.7587355122336898, 0.4614892467149775, 0.8680206144816276, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 3.254515206650597, 2, 1, 0.3897053671803259, 0.9623805873347945, 0.3072654255713728, -1.034664598044861, 0.9408153394152508, 0.3372414984579594, 0.6331666928600346],
[1.525897604812614, 4.708642117789573, 0, 1, 0.2447490388553867, 0, 0.2123754524095028, 0.3354179156995703, 0.7552509611446133, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.4811902936673972, 0.7599741096516701, 0.4444444444444445, 1, 0.6331666928600346],
[1.964401957262558, 4.270137765339634, 1, 0, 0.3150837182319932, 0.5090607837682694, 0, -0.8039917284164542, 1, 0.3150837182319932, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[0.00421948100801496, 6.230320241594169, 0, 2, 0.0006767911017902418, 0, 0.3210107863553824, 0.5069925344704508, 0.998646875842615, 1, 0.6331666928600346],
[2.077719878666925, 4.156819843935263, 0, 3, 0.3332595461914422, 0, 0.7217055616150782, 1.139835006726444, 0.2963946900416374, 1, 0.6331666928600346],
[1.280530419376395, 4.708891337655446, 1, 1, 0.2137986722796732, 0.7809263918048815, 0.2123642123578709, -0.8979660267327024, 0.9542901277314488, 0.3818874722907953, 0.6331666928600346],
[2.081914212198784, 4.168534754060658, 1, 1, 0.3330823471141303, 0.4803271883829759, 0.2398924463867979, -0.3807027185342867, 0.8890561500409422, 0.5552208442692025, 0.6315550961176655],
[2.083022145162575, 4.166966031835926, 0, 2, 0.3332841736930976, 0, 0.4799655156101233, 0.7599740997429948, 0.4445099930480956, 1, 0.6315550961176655],
[2.0827726436475, 4.167333895620934, 1, 2, 0.3332379425153424, 0.4801292176801058, 0.4799231475312346, -0.0003262900578872983, 0.7408679193969178, 0.7035764977466982, 0.6315550961176655],
[2.316349324774629, 3.688626272890811, 1, 2, 0.3857383409976151, 0.4317138133287801, 0.5422072750223572, 0.1749545880839366, 0.6684089505150216, 0.7682283966769676, 0.6315550961176655],
[0, 6.250448966259439, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6315550961176655],
[0, 4.184175493781512, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6315550961176655],
[2.084446527273027, 4.166002438986415, 2, 0, 0.3334874884228446, 0.9594873141775895, 0, -1.51924562096927, 1, 0.1112139049345769, 0.6315550961176655],
[1.672706086177475, 4.577742880081972, 0, 2, 0.2676137498613156, 0, 0.4368965344694472, 0.6917789709166541, 0.5363896193922036, 1, 0.6315550961176655],
[1.672534962071319, 4.166965977506295, 0, 0, 0.286417448918554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6315550961176655],
[1.672534962071319, 4.577914004188128, 0, 0, 0.2675863719710106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6315550961176655],
[1.529472312936409, 4.720976653323032, 0, 0, 0.2446979922870591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6315550961176655],
[2.083021774627258, 4.167427191632185, 0, 2, 0.3332595443737915, 0, 0.4799124035126081, 0.7598900024127035, 0.444542835168644, 1, 0.6315550961176655],
[2.075854977373214, 4.158460797444739, 1.75, 2, 0.3329723825921909, 0.8430261357729572, 0.4809471815218135, -0.571854076239578, 0.8401841670276466, 0.4734157957592051, 0.6331666928600346],
[1.667510442649884, 4.567029279952308, 1, 0, 0.2674632798640495, 0.5996963943511348, 0, -0.9471382514488983, 1, 0.2674632798640495, 0.6331666928600346],
[1.616062419436193, 4.155228323066324, 1, 0, 0.2800175024167027, 0.6187879799524558, 0, -0.9772907939256412, 1, 0.2800175024167026, 0.6331666928600346],
[3.742978367742849, 2.491377835631816, 2, 0, 0.6003792926873138, 0.5343338388584042, 0, -0.8439070546253797, 0.9999999999999998, 0.3604552950877193, 0.6331666928600346],
[1.280307029423114, 4.954232693179073, 0, 0, 0.2053571051575138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0.2405951468336986, -0.3799870548258351, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.075770867621158, 4.158768854981028, 3, 1, 0.3329469311256177, 1.445246219992485, 0.2404557778685591, -1.902801356593551, 0.9877114662982912, 0.110767941095296, 0.6331666928600346],
[2.077720463578355, 4.156819259023833, 0, 2, 0.333259640009343, 0, 0.4811371087781358, 0.7598901114094044, 0.4445427076404708, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[0.005321876638942588, 6.229217845963242, 0, 3, 0.0008536117942514821, 0, 0.4816013942976979, 0.7606233867455799, 0.9974413499545446, 1, 0.6331666928600346],
[0, 4.173525528027913, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 3.746457772814332, 0, 0, 0.3567912755407231, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.668054370033567, 4.566485352568625, 1, 0, 0.2675505240565456, 0.5995008423975273, 0, -0.9468294039434741, 1, 0.2675505240565456, 0.6331666928600346],
[1.280597168724621, 4.953942553877566, 1, 0, 0.205403642562746, 0.7808856871016863, 0, -1.233301902812354, 1, 0.205403642562746, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[1.186689893261063, 4.142868763987503, 0, 0, 0.2226619443707751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[1.667017049321232, 4.56752267328096, 3, 1, 0.2673841411704804, 1.799621666270015, 0.2189370631589391, -2.49647465815214, 0.9948885680774947, 0.06113144973451656, 0.6331666928600346],
[1.525579352954674, 4.708960369647513, 0, 0, 0.2446979922870591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[2.079141171999416, 4.155398550602771, 3, 0, 0.3334875170434585, 1.442903464373723, 0, -2.278868235876529, 0.9999999999999998, 0.03708845538336081, 0.6331666928600346],
[1.667697430131878, 4.566842292470314, 2, 0, 0.2674932720511738, 1.199258309009833, 0, -1.894064110657407, 1, 0.07155265059264315, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.079140537659693, 4.155399184942494, 0, 1, 0.3334874152974193, 0, 0.2406507667478976, 0.3800748988562084, 0.6665125847025808, 1, 0.6331666928600346],
[2.077471522560958, 4.157068200041229, 1, 1, 0.3332197106755875, 0.4813543719565752, 0.2405541482312179, -0.3803109456652793, 0.888964624417278, 0.5554040457684526, 0.6331666928600346],
[1.280990186342024, 4.945250748262865, 1, 7, 0.2057405422945321, 0.780646105381638, 1.415499507777015, 1.002663926505236, 0.4865856572198711, 0.8416204300452876, 0.6331666928600346],
[2.077707681402774, 4.156832041199412, 0, 2, 0.3332575897897361, 0, 0.4811356292911272, 0.759887774762475, 0.4445454415729919, 1, 0.6331666928600346],
[2.077719871893556, 4.156819850708631, 1, 1, 0.3332595451050157, 0.4812968357898207, 0.2405685201463628, -0.3801973767067253, 0.8889380755963978, 0.5554571658064296, 0.6331666928600346],
[1.525832218843693, 4.708707503758494, 1, 0, 0.2447385511575243, 0.6553800527018762, 0, -1.035082956972204, 1, 0.2447385511575243, 0.6331666928600346],
[3.740229587476769, 2.494027546257812, 1, 2.5, 0.5999479179704952, 0.2673632665086261, 1.002394702396591, 1.160881398495243, 0.2530513896581402, 0.9595043967895194, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0.4811902936673972, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.6331666928600346],
[1.61489110089218, 4.157779373210183, 0, 1.5, 0.2797476675893736, 0, 0.3607695034673915, 0.5697859782197069, 0.611261453808292, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156102988722549, 3, 2, 0.3333470652706361, 1.443570881002192, 0.4812200288171239, -1.519901256710295, 0.9547257287352573, 0.2098968872397226, 0.6331666928600346],
[2.076095837587348, 4.15844388501484, 1.5, 2.5, 0.3329990552567723, 0.7225099982586379, 0.6011864219230839, -0.1916139583835837, 0.7411863330262839, 0.6044428958606523, 0.6331666928600346],
[3.744267960754088, 2.489812298674178, 1.5, 0.5, 0.600612729534778, 0.4006123535287531, 0.2008183509520976, -0.3155472402917777, 0.8196321745603919, 0.6006127295347778, 0.6331666928600346],
[1.186573104237605, 4.142985553010962, 1, 0, 0.2226400309195929, 0.8427630766521701, 0, -1.33102875775948, 1, 0.2226400309195928, 0.6331666928600346],
[1.280307029423114, 4.954232693179073, 0, 1, 0.2053571051575138, 0, 0.2018476042469277, 0.3187906226323679, 0.7946428948424862, 1, 0.6331666928600346],
[1.186689893261063, 4.142868763987503, 0, 0, 0.2226619443707751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078114455436499, 4.156425267165688, 1, 1, 0.3333228350286508, 0.4812054491916588, 0.2405913581316262, -0.3800169746345483, 0.8888958876484629, 0.5555415577057644, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.964393312902303, 4.270146409699889, 1, 0, 0.3150823317045766, 0.5090630239025529, 0, -0.8039952664014883, 1, 0.3150823317045766, 0.6331666928600346],
[2.076974543666311, 3.254882531962972, 2, 0.75, 0.3895405511073605, 0.9629391010587767, 0.2304230621643006, -1.156908673742261, 0.9611683804186075, 0.2909988861100765, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.4811902936673972, 0.7599741096516701, 0.4444444444444445, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 5, 0, 0.3333333333333333, 2.405951468336986, 0, -3.79987054825835, 1, 0.004115226337448097, 0.6331666928600346],
[1.964711546864368, 4.269828175737824, 0, 1, 0.3151333754024636, 0, 0.2342014617080465, 0.3698891055847409, 0.6848666245975363, 1, 0.6331666928600346],
[2.077720475433118, 4.156819247169069, 1, 1, 0.3332596419108088, 0.4812966959819471, 0.2405685550751414, -0.380197100734135, 0.8889380110734795, 0.5554572948950971, 0.6331666928600346],
[2.077720381460805, 4.156819341141381, 1, 1, 0.3332596268379539, 0.4812967177503063, 0.2405685496366603, -0.3801971437036099, 0.8889380211198277, 0.5554572747957356, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 3.251378749714506, 0, 0, 0.3899347096419689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.280700062263249, 4.952878071161879, 1, 1, 0.20545183438, 0.7808229494678116, 0.2019028099687125, -0.9143250048168169, 0.9577895437498931, 0.3686932125098931, 0.6331666928600346],
[2.07772033804425, 4.156819384557937, 0, 1, 0.3332596198740789, 0, 0.2405685471240041, 0.3799450442305298, 0.6667403801259211, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[1.526804592057116, 4.707735130545071, 0, 1.5, 0.2448945166748981, 0, 0.3186245526575168, 0.5032238054378372, 0.6561625443443072, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 2, 1, 0.3333333333333333, 0.9623805873347945, 0.2405951468336986, -1.139961164477505, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.6331666928600346],
[2.077150040134823, 3.252929727882264, 1, 1, 0.3897033685309312, 0.4814288716163673, 0.307415186817154, -0.2748307622013216, 0.8481312845556451, 0.6275380216175077, 0.6331666928600346],
[1.668054406100746, 4.566485316501447, 1, 0, 0.2675505298416044, 0.599500829434938, 0, -0.9468293834708412, 1, 0.2675505298416043, 0.6331666928600346],
[1.281115905484733, 4.952826826863103, 1, 2, 0.205506524600722, 0.7805694986056959, 0.4038097979021628, -0.5950403028966942, 0.8906594910552064, 0.4984999218495683, 0.6331666928600346],
[3.743009790724843, 2.489602703351146, 0, 2, 0.6005523035938014, 0, 0.803341029999641, 1.268767038851844, 0.1595584621642186, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 3.251378749714506, 0, 0, 0.3899347096419689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.01207004386072, 1.918410057644813, 2, 4, 0.3453598075416957, 1.976147809266883, 2.085059961013083, 0.08277041555356537, 0.6564267294536918, 0.6721565877459588, 1.315834299221515],
[0.616071315472541, 2.265518873743754, 0, 0.5, 0.2137956041695484, 0, 0.2206999931868824, 0.1677262808223306, 0.8866816767196961, 1, 1.315834299221515],
[0.7542238556216941, 2.245776144378308, 2, 0, 0.2514079518738979, 2.651732619026527, 0, -2.015248136178976, 1, 0.06320595826542807, 1.315834299221515],
[0.803636421788263, 2.196363578211738, 2, 2, 0.2678788072627542, 2.488687602721604, 0.9105960505994113, -1.199308722272885, 0.9385571654247736, 0.2922205770453308, 1.315834299221515],
[0.5279469772922147, 2.307983673492984, 0, 5, 0.1861635710824027, 0, 2.166393141088743, 1.646402698554402, 0.3570143141887792, 1, 1.315834299221515],
[0.8196729764167933, 2.180327023583209, 1, 2, 0.2732243254722642, 1.219998741902542, 0.9172935886989767, -0.230048079292852, 0.8168386328792909, 0.6161149948117773, 1.315834299221515],
[3.719517322673523, 2.503141176247135, 2, 2, 0.5977376588026944, 0.5377041767780868, 0.7989960849905094, 0.4126747524133946, 0.5287056035193148, 0.8181839653621903, 0.6331666928600346],
[2.070279451487036, 4.156373140058363, 0.6666666666666666, 2.333333333333333, 0.3324867448519737, 0.3220177190030142, 0.5613868761794013, 0.3780507722147367, 0.5937213766276452, 0.7025734850310172, 0.6331666928600346],
[1.187380782042459, 4.587859447000168, 1, 1, 0.205598509317645, 0.8421898140206227, 0.2179665727671459, -0.9858750441117489, 0.9577292529663624, 0.3689262716016523, 0.6331666928600346],
[1.19309313310939, 4.145026768429381, 1.5, 3.5, 0.2235043714108909, 1.257236303163327, 0.8443853792833785, -0.6520414426966887, 0.8054961568297759, 0.5145765194109376, 0.6331666928600346],
[1.959507419081547, 4.272862251243454, 1.5, 2.5, 0.314408085966339, 0.7654985050799525, 0.5850878996327276, -0.2849338215064731, 0.7656026821868429, 0.5764279619705655, 0.6331666928600346],
[2.072565134831699, 4.161974587770489, 0, 2, 0.332432741958158, 0, 0.4805411368624842, 0.7589488554615282, 0.4456460440095033, 1, 0.6331666928600346],
[2.077861711033715, 4.156678011568472, 1, 1, 0.3332822956441847, 0.4812639814718517, 0.2405767291132233, -0.3801325228770898, 0.8889229114101422, 0.5554875026985115, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 2, 0, 0.3333333333333333, 0.9623805873347945, 0, -1.51994821930334, 1, 0.1111111111111109, 0.6331666928600346],
[2.077493116799353, 3.747892182868201, 0, 3, 0.3566275894090495, 0, 0.800449920548181, 1.26420092777231, 0.2663098929432346, 1, 0.6331666928600346],
[2.374377437988895, 2.192845726874391, 1, 0, 0.519873313013372, 0.4211630316227242, 0, -0.6651692774936045, 1, 0.519873313013372, 0.6331666928600346],
[2.058553216550379, 4.175986506051808, 3, 7, 0.330185275600614, 1.457334197571657, 1.676250627212433, 0.345748492631416, 0.5678620249084778, 0.6934366366027789, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.280602088644929, 4.156359815068125, 1, 0, 0.2355363365283781, 0.780882687032122, 0, -1.233297164613713, 1, 0.235536336528378, 0.6331666928600346],
[1.667982441085109, 4.156359815068125, 1, 0, 0.2863812543507275, 0.5995266948670323, 0, -0.946870234375328, 1, 0.2863812543507275, 0.6331666928600346],
[1.234643542960315, 4.771040236996453, 1, 0, 0.2055791793568596, 0.8099503745042813, 0, -1.33099862140085, 1, 0.2055791793568597, 0.6085283346513346],
[2.310197193995871, 3.67982540415115, 2, 1, 0.3856742034179498, 0.8657269627016848, 0.2717520235802265, -0.9381019971825336, 0.9426330482831262, 0.3314998701124636, 0.6331666928600346],
[2.070758440854106, 3.251654035455391, 0, 2, 0.3890638784707545, 0, 0.6150715845512457, 0.9714212568146111, 0.373242944589197, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[2.071640852680005, 3.867317583999633, 2, 2, 0.3488222513707676, 0.9654183047281936, 0.5171543211953058, -0.7079715161706702, 0.8746413212460666, 0.4349285707881443, 0.6331666928600346],
[1.032977143371525, 3.535206006853903, 2, 2, 0.2261242838568218, 1.936151262236275, 0.5657378936680033, -2.164380066137197, 0.9615945821336256, 0.2221388116664117, 0.6331666928600346],
[2.161816562537688, 4.324994476134362, 0, 1, 0.3332633785152227, 0, 0.2312141681378031, 0.3799562895789901, 0.6667366214847773, 1, 0.6085283346513346],
[2.162322153783425, 4.32464430756685, 2, 0, 0.3333333333333333, 0.9249315586489232, 0, -1.51994821930334, 1, 0.1111111111111109, 0.6085283346513346],
[2.162322153783425, 4.324398673916149, 1, 2, 0.3333459557177001, 0.4624657793244616, 0.4624920482155296, 4.316790126642138e-05, 0.740723910735598, 0.7037205332308789, 0.6085283346513346],
[2.161844088525094, 4.324975411849407, 0, 1, 0.3332671871631829, 0, 0.2312151873188081, 0.3799579644081591, 0.6667328128368171, 1, 0.6085283346513346],
[1.735521778205344, 4.751444683144936, 1, 1, 0.2675398105641031, 0.5761955929092821, 0.2104623049800739, -0.6010127501109058, 0.9284224497633239, 0.4635020708915301, 0.6085283346513346],
[2.162555163080526, 3.898172451861181, 1, 2, 0.3568144454717135, 0.4624159499244939, 0.513060934244995, 0.08322535112439576, 0.7089071218110043, 0.733922074574713, 0.6085283346513346],
[2.162322153783425, 4.324571171516236, 2.75, 0, 0.3333370914779976, 1.271780893142269, 0, -2.089928801542093, 1, 0.07328371790656873, 0.6085283346513346],
[1.332748013138118, 5.154218448212156, 1, 1, 0.2054501161796825, 0.7503293872075472, 0.1940158357756199, -0.9141949844466576, 0.9577902497617548, 0.3686904821211201, 0.6085283346513346],
[2.162322153783425, 4.32464430756685, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.4624657793244616, 0.7599741096516701, 0.4444444444444445, 1, 0.6085283346513346],
[2.162322153783425, 4.32464430756685, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.4624657793244616, 0.2312328896622308, -0.3799870548258351, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.6085283346513346],
[1.664332747496837, 4.157553419679426, 2, 1, 0.2858751785427081, 1.201682778283374, 0.240526073643837, -1.518015264349994, 0.9766369603217268, 0.1984477737639292, 0.6331666928600346],
[1.280766962415684, 4.951476457616557, 0, 3, 0.2055065689987215, 0, 0.6058798876818411, 0.9569042315619318, 0.5014999940757364, 1, 0.6331666928600346],
[2.074342299199373, 4.160197423402814, 1, 1, 0.3327177933728167, 0.4820805131274462, 0.2403732078613843, -0.3817435566205515, 0.8892988699731236, 0.5547344567187571, 0.6331666928600346],
[0.3274929630491167, 0.8382057450524086, 0, 0, 0.2809413451117886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.9531438946087369],
[1.668277865280271, 4.156359815068125, 0, 0, 0.286417448918554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.445778863202207, 4.769465114476326, 0, 1, 0.2326181994455225, 0, 0.2096671169613529, 0.3311404711045044, 0.7673818005544775, 1, 0.6331666928600346],
[1.523283050384728, 4.711256672217459, 0, 1, 0.2443296727843986, 0, 0.2122575927346636, 0.3352317724987857, 0.7556703272156013, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[0.7354521584755515, 0.4884254278037524, 0, 0, 0.6009197053043442, 0, 0, 0, 1, 1, 0.9531438946087369],
[0.2513319581854836, 0.9243971981116268, 0, 0, 0.2137668840135246, 0, 0, 0, 1, 1, 0.9531438946087369],
[0.4842863103666257, 0.5829640386717263, 0, 0, 0.4537701119545127, 0, 0, 0, 1, 1, 0.9531438946087369],
[0.2994803881676776, 0.9243971981116268, 0, 0, 0.244697992287059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.9531438946087369],
[1.668271437369626, 4.564989082454336, 2, 2, 0.2676402553790165, 1.198845676548543, 0.4381171485572783, -1.201466433041557, 0.9387074476820947, 0.2918096010338085, 0.6331666928600346],
[1.280198271760239, 4.15870446474287, 0, 4, 0.2353780410832149, 0, 0.9618380036166665, 1.519091282695261, 0.3418118106601447, 1, 0.6331666928600346],
[1.19313246448743, 4.577912841986299, 1, 3, 0.2067446019092973, 0.8381299057431988, 0.6553204710420694, -0.2887224434933133, 0.8087546632557916, 0.6040392441568219, 0.6331666928600346],
[2.482423370319986, 2.996474044966293, 0, 1, 0.4530881274385526, 0, 0.3337255671144146, 0.5309191504342868, 0.5469118725614475, 1, 0.6285807676016777],
[1.668054406100746, 4.566485316501447, 1, 0, 0.2675505298416044, 0.599500829434938, 0, -0.9468293834708412, 1, 0.2675505298416043, 0.6331666928600346],
[2.075946452682307, 4.158281530607357, 0, 3.5, 0.3329917446469252, 0, 0.8416938521930215, 1.329340064290279, 0.2423590445820818, 1, 0.6331666928600346],
[1.668054401473235, 4.566013128202743, 1, 2, 0.2675707944344218, 0.5995008310980712, 0.4380188895311461, -0.2550385915555758, 0.8235306063974175, 0.607086491450573, 0.6331666928600346],
[1.281057047203332, 4.953023105913493, 1, 2, 0.205492553149617, 0.7806053619416046, 0.4037937956744374, -0.5951222174449782, 0.8906731777244112, 0.4984734642111343, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0.2405951468336986, -0.3799870548258351, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.6331666928600346],
[1.281056642977557, 4.95348307962463, 1, 1, 0.2054773407463135, 0.7806056082545286, 0.2018781499654944, -0.9140206912573109, 0.9577790624398235, 0.3687337439324504, 0.6331666928600346],
[1.668277865280271, 4.566261857321921, 0, 0, 0.2675863719710106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.280490807969217, 4.954048914632969, 0, 1, 0.2053865826417035, 0, 0.2018550921138992, 0.3188024486918494, 0.7946134173582965, 1, 0.6331666928600346],
[1.667508912978496, 4.567030809623697, 1, 0, 0.267463034509708, 0.5996969444761799, 0, -0.9471391202959987, 1, 0.267463034509708, 0.6331666928600346],
[1.280307029423114, 4.954232693179073, 0, 0, 0.2053571051575138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.525897610158943, 4.708642112443243, 0, 1, 0.2447490397129205, 0, 0.2123754526506401, 0.3354179160804136, 0.7552509602870795, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[2.310814126710249, 3.678453272360382, 0, 0, 0.3858258402469764, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.031619717327975, 3.536023168717054, 0, 1, 0.2258538469545766, 0, 0.2828035768676317, 0.4466494843406856, 0.7741461530454233, 1, 0.6331666928600346]
],
"RESOLVED": [
[0.0006097601891465231, 6.233656264770353, 0, 1, 9.780785528004227e-05, 0, 0.1604194966045084, 0.2533606053721624, 0.99990219214472, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.155738985982667, 1, 3, 0.3333665296312032, 0.4811902936673972, 0.7218932685905005, 0.3801573545125062, 0.5925335769520815, 0.8025084766243538, 0.6331666928600346],
[1.289370637267859, 4.944713482505587, 0, 10, 0.2068259927995192, 0, 2.022361868969766, 3.19404335663124, 0.09855637848502379, 1, 0.6331666928600346],
[2.077455107819914, 4.157084614782273, 1, 2, 0.3332170778042329, 0.4813581753154715, 0.4811063967493358, -0.0003976497326454321, 0.7408957345943842, 0.7035486692993025, 0.6331666928600346],
[1.668277865280271, 4.566261857321921, 0, 1, 0.2675863719710106, 0, 0.218997515089179, 0.345876555982375, 0.7324136280289895, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.2405951468336986, 0.3799870548258351, 0.6666666666666667, 1, 0.6331666928600346],
[2.077843790052528, 4.156695932549659, 0, 1, 0.3332794211767846, 0, 0.2405756919021532, 0.3799563284282452, 0.6667205788232153, 1, 0.6331666928600346],
[1.52607441122511, 4.708465311377077, 0, 3, 0.2447773980319037, 0, 0.637150281802245, 1.006291532683465, 0.4307496533060786, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 3, 0, 0.3333333333333333, 1.443570881002192, 0, -2.27992232895501, 1, 0.03703703703703698, 0.6331666928600346],
[2.077861695959084, 4.156678026643103, 1, 2, 0.3332822932262626, 0.4812639849633627, 0.4811534564814929, -0.0001745645864133499, 0.7408087916114765, 0.7036356450172914, 0.6331666928600346],
[1.186952511633141, 4.142606145615425, 0, 1, 0.2227112201905881, 0, 0.2413939353270187, 0.3812486317570408, 0.7772887798094119, 1, 0.6331666928600346],
[1.031297545611151, 4.299460313754317, 0, 2, 0.1934617127280114, 0, 0.4651746624109636, 0.7346796154260018, 0.6505040088356329, 1, 0.6331666928600346],
[2.077694994230367, 4.15684472837182, 0, 1, 0.3332555548083305, 0, 0.2405670804046815, 0.3799427277484104, 0.6667444451916695, 1, 0.6331666928600346],
[1.186573089067704, 4.5847153155871, 1, 1, 0.205599340367513, 0.842763087426586, 0.2181160510883202, -0.9865443703564298, 0.9577289112404437, 0.3689275919754695, 0.6331666928600346],
[1.030996751385826, 4.741372940737761, 0, 3, 0.1786089260347659, 0, 0.6327281227393173, 0.9993073386113597, 0.5541788374079898, 1, 0.6331666928600346],
[2.077878332080163, 4.156661390522024, 1, 2, 0.3332849616062584, 0.4812601318186425, 0.4811553821921553, -0.0001654376764735572, 0.7408052340367904, 0.7036392033878425, 0.6331666928600346],
[2.077401811443747, 4.157137911158439, 1, 2, 0.3332085292379334, 0.4813705247060618, 0.4811002287491287, -0.0004268954131371624, 0.7409071306213237, 0.703537267089102, 0.6331666928600346],
[1.186689893261063, 4.142868763987503, 0, 0, 0.2226619443707751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.186743859863428, 3.380921151060087, 0, 2, 0.2598141188168013, 0, 0.5915547599721162, 0.934279655962388, 0.5478751387029483, 1, 0.6331666928600346],
[0, 4.173525528027913, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.668277865280271, 4.566261857321921, 0, 0, 0.2675863719710106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[3.746457772814332, 2.488081949787851, 0, 0, 0.6009197053043442, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.083660807683186, 4.149499634755679, 2, 2, 0.3342864068597449, 0.9598491235355104, 0.4819858238444596, -0.7547195787139825, 0.8880398957251494, 0.4091017568828313, 0.6331666928600346],
[0.8921733830632681, 5.342366339538918, 0, 1, 0.1431017240661498, 0, 0.1871829703251512, 0.2956298435087286, 0.8568982759338502, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.2405951468336986, 0.3799870548258351, 0.6666666666666667, 1, 0.6331666928600346],
[1.668066758564129, 4.566472964038063, 1, 1, 0.2675525111367654, 0.5994963899771011, 0.2189873908977915, -0.600961805745874, 0.928415653784411, 0.4635206760579418, 0.6331666928600346],
[3.745500445444171, 2.488442286992938, 1, 0, 0.6008236851383295, 0.2669870193758346, 0, -0.4216693998382093, 1, 0.6008236851383295, 0.6331666928600346],
[1.668164234632862, 4.56637548796933, 1, 0, 0.2675681459828118, 0.5994613595226042, 0, -0.9467670461546511, 1, 0.2675681459828119, 0.6331666928600346],
[2.076079919519991, 4.158459803082197, 1, 1, 0.3329965020502703, 0.4816770253387979, 0.240473648262468, -0.3809476711208645, 0.8891133296222842, 0.555106333722825, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 2, 0, 0.3333333333333333, 0.9623805873347945, 0, -1.51994821930334, 1, 0.1111111111111109, 0.6331666928600346],
[0.0003705415739390105, 4.173680491536193, 0, 1, 8.877265059764157e-05, 0, 0.2395966825989436, 0.3784101174316001, 0.9999112273494024, 1, 0.6331666928600346],
[1.525400834413241, 4.709138888188946, 0, 1, 0.2446693584906001, 0, 0.2123530487724865, 0.3353825322258833, 0.7553306415093999, 1, 0.6331666928600346],
[1.280766381162057, 4.708924715822797, 0, 2, 0.21382845299097, 0, 0.4247254141226034, 0.6707955723383124, 0.6180657013265715, 1, 0.6331666928600346],
[2.077720367396167, 4.156819355206021, 0, 1, 0.3332596245820313, 0, 0.2405685488226942, 0.379945046913378, 0.6667403754179686, 1, 0.6331666928600346],
[3.744247234645927, 2.488913994467831, 1, 0, 0.6006979599945774, 0.2670763807333263, 0, -0.4218105338531527, 1, 0.6006979599945774, 0.6331666928600346],
[1.186689893261063, 3.379571964060858, 0, 0, 0.2598821378056159, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.280590828079005, 4.95394889452318, 0, 1, 0.205402625543704, 0, 0.2018591675633849, 0.3188088853056696, 0.794597374456296, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0.4811902936673972, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.6331666928600346],
[1.280307029423114, 4.156359815068125, 0, 0, 0.235494847494729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.07794359127582, 4.156596131326368, 2, 4, 0.3332954289700992, 0.9624900350504877, 0.9623258728106456, -0.0002592717552790596, 0.680458958478852, 0.6487591421312764, 0.6331666928600346],
[1.667506396860206, 4.567033325741985, 1, 0, 0.2674626309324751, 0.5996978493653325, 0, -0.9471405494443775, 1, 0.2674626309324751, 0.6331666928600346],
[1.458444829561728, 4.775562058137209, 1, 2, 0.2339498264654727, 0.6856618637405067, 0.4187988713479592, -0.4214735162191156, 0.8614117638121401, 0.550456579347651, 0.6331666928600346],
[1.280198707305768, 4.953805804621553, 0, 2, 0.2053573597607131, 0, 0.4037299964673908, 0.637636188100371, 0.6314569256864647, 1, 0.6331666928600346],
[1.45944253958478, 4.775097183017403, 0, 0, 0.2340898614044976, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.280530419374949, 4.954009303227237, 1, 0, 0.2053929361830224, 0.7809263918057635, 0, -1.233366190312844, 1, 0.2053929361830225, 0.6331666928600346],
[2.309123567217475, 3.68024929853811, 1, 1, 0.3855367864004522, 0.4330647411844718, 0.2717207229404883, -0.2548207605728396, 0.851361386332012, 0.6224349591329166, 0.6331666928600346],
[1.280754093256592, 4.156359815068125, 1, 0, 0.2355577085290858, 0.7807900089995304, 0, -1.233150792365082, 1, 0.2355577085290859, 0.6331666928600346],
[0.8921733830553701, 5.342366339546816, 0, 1, 0.143101724064883, 0, 0.1871829703248745, 0.2956298435082915, 0.856898275935117, 1, 0.6331666928600346],
[1.525579352954674, 4.708960369647513, 0, 0, 0.2446979922870591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.030507097287134, 4.741478053339706, 0, 0, 0.1785359924523056, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.466906988677863, 2.970078057196917, 1, 0, 0.4537270137517826, 0.4053659114792769, 0, -0.6402198916184707, 1, 0.4537270137517826, 0.6331666928600346],
[1.526661928629932, 4.707877793972255, 0, 1, 0.2448716339227573, 0, 0.2124099315577717, 0.3354723707880292, 0.7551283660772427, 1, 0.6331666928600346],
[1.666054128631168, 4.568485593971023, 3, 1, 0.2672296918072703, 1.800661784299171, 0.2188909167886374, -2.498190263871309, 0.9949003679343278, 0.06103441888011507, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[0, 4.173525528027913, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6331666928600346],
[3.743211971600379, 2.491327751001804, 1, 0, 0.600399089291235, 0.267150246255613, 0, -0.4219271943204824, 1, 0.600399089291235, 0.6331666928600346],
[2.466906988716463, 2.970078057021745, 1, 0, 0.4537270137702794, 0.405365911472934, 0, -0.6402198916084531, 1, 0.4537270137702794, 0.6331666928600346],
[0, 4.173525528027913, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078471243406329, 4.155470642728202, 1, 1, 0.3334120338897036, 0.4811228460207789, 0.2406466284992131, -0.3797992222795656, 0.8888364156575312, 0.5556604834369383, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.468157880474133, 2.969970266975182, 2, 1, 0.4538616622397528, 0.8103209344192357, 0.3367037074813775, -0.7480134888310593, 0.9065088508149692, 0.4309889269830328, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.4811902936673972, 0.7599741096516701, 0.4444444444444445, 1, 0.6331666928600346],
[1.280307029423114, 4.708924861736975, 0, 3, 0.2137681513572392, 0, 0.6370881014426283, 1.006193327328828, 0.486017488256216, 1, 0.6331666928600346],
[1.280307029423114, 4.954232693179073, 0, 0, 0.2053571051575138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078313937942307, 4.156084472905442, 2, 1, 0.3333623873517733, 0.9623185234373957, 0.2406110863528523, -1.139837968773385, 0.9629532774459895, 0.2592979987945992, 0.6331666928600346],
[2.078499401276042, 4.156040321326145, 1, 1, 0.3333845790958427, 0.4811163281481223, 0.240613642478067, -0.3798410250919814, 0.8888547224210877, 0.5556238806127732, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0.4811902936673972, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 13, 2, 0.3333333333333333, 6.255473817676164, 0.4811902936673972, -9.119689315820041, 0.9999978395567006, 3.143096543745116e-05, 0.6331666928600346],
[2.075797776674977, 4.158741945927209, 1, 4, 0.3329512472507876, 0.4817424949755003, 0.9618293349308027, 0.7582313557694175, 0.4616603037681253, 0.8679349554209508, 0.6331666928600346],
[1.665049719601469, 4.156359815068125, 6, 0, 0.2860217460539773, 3.603495997366436, 0, -5.691227978353263, 1, 0.0005475128559323528, 0.6331666928600346],
[1.61562533555871, 4.156359815068125, 0, 0, 0.2799080894002741, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[0.8914900142729997, 5.343049708329186, 0, 0, 0.1429921139231923, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.28025301378129, 4.95401982197616, 0, 1, 0.2053572321118575, 0, 0.2018562775150746, 0.318804320870517, 0.7946427678881425, 1, 0.6331666928600346],
[0.001331070993782075, 4.173240357398337, 0, 1, 0.0003188521304795953, 0, 0.2396219518550366, 0.3784500267578138, 0.9996811478695204, 1, 0.6331666928600346],
[1.964517371814943, 4.270022350787248, 1, 0, 0.3151022303527785, 0.5090308766657217, 0, -0.8039444942474985, 1, 0.3151022303527784, 0.6331666928600346],
[2.077943594732286, 4.156596127869901, 2, 1, 0.3332954295245053, 0.9624900334494749, 0.2405814684027198, -1.140155622820068, 0.9629755961292614, 0.2592087222842961, 0.6331666928600346],
[2.076038336269971, 4.157603401283548, 1, 4, 0.3330378009636373, 0.4816866733765165, 0.9620927284129862, 0.7587355122336898, 0.4614892467149775, 0.8680206144816276, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 3.254515206650597, 2, 1, 0.3897053671803259, 0.9623805873347945, 0.3072654255713728, -1.034664598044861, 0.9408153394152508, 0.3372414984579594, 0.6331666928600346],
[1.525897604812614, 4.708642117789573, 0, 1, 0.2447490388553867, 0, 0.2123754524095028, 0.3354179156995703, 0.7552509611446133, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.4811902936673972, 0.7599741096516701, 0.4444444444444445, 1, 0.6331666928600346],
[1.964401957262558, 4.270137765339634, 1, 0, 0.3150837182319932, 0.5090607837682694, 0, -0.8039917284164542, 1, 0.3150837182319932, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[0.00421948100801496, 6.230320241594169, 0, 2, 0.0006767911017902418, 0, 0.3210107863553824, 0.5069925344704508, 0.998646875842615, 1, 0.6331666928600346],
[2.077719878666925, 4.156819843935263, 0, 3, 0.3332595461914422, 0, 0.7217055616150782, 1.139835006726444, 0.2963946900416374, 1, 0.6331666928600346],
[1.280530419376395, 4.708891337655446, 1, 1, 0.2137986722796732, 0.7809263918048815, 0.2123642123578709, -0.8979660267327024, 0.9542901277314488, 0.3818874722907953, 0.6331666928600346],
[2.081914212198784, 4.168534754060658, 1, 1, 0.3330823471141303, 0.4803271883829759, 0.2398924463867979, -0.3807027185342867, 0.8890561500409422, 0.5552208442692025, 0.6315550961176655],
[2.083022145162575, 4.166966031835926, 0, 2, 0.3332841736930976, 0, 0.4799655156101233, 0.7599740997429948, 0.4445099930480956, 1, 0.6315550961176655],
[2.0827726436475, 4.167333895620934, 1, 2, 0.3332379425153424, 0.4801292176801058, 0.4799231475312346, -0.0003262900578872983, 0.7408679193969178, 0.7035764977466982, 0.6315550961176655],
[2.316349324774629, 3.688626272890811, 1, 2, 0.3857383409976151, 0.4317138133287801, 0.5422072750223572, 0.1749545880839366, 0.6684089505150216, 0.7682283966769676, 0.6315550961176655],
[0, 6.250448966259439, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6315550961176655],
[0, 4.184175493781512, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6315550961176655],
[2.084446527273027, 4.166002438986415, 2, 0, 0.3334874884228446, 0.9594873141775895, 0, -1.51924562096927, 1, 0.1112139049345769, 0.6315550961176655],
[1.672706086177475, 4.577742880081972, 0, 2, 0.2676137498613156, 0, 0.4368965344694472, 0.6917789709166541, 0.5363896193922036, 1, 0.6315550961176655],
[1.672534962071319, 4.166965977506295, 0, 0, 0.286417448918554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6315550961176655],
[1.672534962071319, 4.577914004188128, 0, 0, 0.2675863719710106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6315550961176655],
[1.529472312936409, 4.720976653323032, 0, 0, 0.2446979922870591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6315550961176655],
[2.083021774627258, 4.167427191632185, 0, 2, 0.3332595443737915, 0, 0.4799124035126081, 0.7598900024127035, 0.444542835168644, 1, 0.6315550961176655],
[2.075854977373214, 4.158460797444739, 1.75, 2, 0.3329723825921909, 0.8430261357729572, 0.4809471815218135, -0.571854076239578, 0.8401841670276466, 0.4734157957592051, 0.6331666928600346],
[1.667510442649884, 4.567029279952308, 1, 0, 0.2674632798640495, 0.5996963943511348, 0, -0.9471382514488983, 1, 0.2674632798640495, 0.6331666928600346],
[1.616062419436193, 4.155228323066324, 1, 0, 0.2800175024167027, 0.6187879799524558, 0, -0.9772907939256412, 1, 0.2800175024167026, 0.6331666928600346],
[3.742978367742849, 2.491377835631816, 2, 0, 0.6003792926873138, 0.5343338388584042, 0, -0.8439070546253797, 0.9999999999999998, 0.3604552950877193, 0.6331666928600346],
[1.280307029423114, 4.954232693179073, 0, 0, 0.2053571051575138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0.2405951468336986, -0.3799870548258351, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.075770867621158, 4.158768854981028, 3, 1, 0.3329469311256177, 1.445246219992485, 0.2404557778685591, -1.902801356593551, 0.9877114662982912, 0.110767941095296, 0.6331666928600346],
[2.077720463578355, 4.156819259023833, 0, 2, 0.333259640009343, 0, 0.4811371087781358, 0.7598901114094044, 0.4445427076404708, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[0.005321876638942588, 6.229217845963242, 0, 3, 0.0008536117942514821, 0, 0.4816013942976979, 0.7606233867455799, 0.9974413499545446, 1, 0.6331666928600346],
[0, 4.173525528027913, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 3.746457772814332, 0, 0, 0.3567912755407231, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.668054370033567, 4.566485352568625, 1, 0, 0.2675505240565456, 0.5995008423975273, 0, -0.9468294039434741, 1, 0.2675505240565456, 0.6331666928600346],
[1.280597168724621, 4.953942553877566, 1, 0, 0.205403642562746, 0.7808856871016863, 0, -1.233301902812354, 1, 0.205403642562746, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[1.186689893261063, 4.142868763987503, 0, 0, 0.2226619443707751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[1.667017049321232, 4.56752267328096, 3, 1, 0.2673841411704804, 1.799621666270015, 0.2189370631589391, -2.49647465815214, 0.9948885680774947, 0.06113144973451656, 0.6331666928600346],
[1.525579352954674, 4.708960369647513, 0, 0, 0.2446979922870591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[2.079141171999416, 4.155398550602771, 3, 0, 0.3334875170434585, 1.442903464373723, 0, -2.278868235876529, 0.9999999999999998, 0.03708845538336081, 0.6331666928600346],
[1.667697430131878, 4.566842292470314, 2, 0, 0.2674932720511738, 1.199258309009833, 0, -1.894064110657407, 1, 0.07155265059264315, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.079140537659693, 4.155399184942494, 0, 1, 0.3334874152974193, 0, 0.2406507667478976, 0.3800748988562084, 0.6665125847025808, 1, 0.6331666928600346],
[2.077471522560958, 4.157068200041229, 1, 1, 0.3332197106755875, 0.4813543719565752, 0.2405541482312179, -0.3803109456652793, 0.888964624417278, 0.5554040457684526, 0.6331666928600346],
[1.280990186342024, 4.945250748262865, 1, 7, 0.2057405422945321, 0.780646105381638, 1.415499507777015, 1.002663926505236, 0.4865856572198711, 0.8416204300452876, 0.6331666928600346],
[2.077707681402774, 4.156832041199412, 0, 2, 0.3332575897897361, 0, 0.4811356292911272, 0.759887774762475, 0.4445454415729919, 1, 0.6331666928600346],
[2.077719871893556, 4.156819850708631, 1, 1, 0.3332595451050157, 0.4812968357898207, 0.2405685201463628, -0.3801973767067253, 0.8889380755963978, 0.5554571658064296, 0.6331666928600346],
[1.525832218843693, 4.708707503758494, 1, 0, 0.2447385511575243, 0.6553800527018762, 0, -1.035082956972204, 1, 0.2447385511575243, 0.6331666928600346],
[3.741682609054179, 2.492574524680402, 1, 2, 0.6001809884945754, 0.2672594403331232, 0.8023832307507195, 0.8451546748304537, 0.3517393962337698, 0.9360868351751226, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0.4811902936673972, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.6331666928600346],
[1.615183153399892, 4.157084449101884, 0, 1, 0.2798177881946863, 0, 0.2405532079619034, 0.3799208181266085, 0.7201822118053136, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156102988722549, 3, 2, 0.3333470652706361, 1.443570881002192, 0.4812200288171239, -1.519901256710295, 0.9547257287352573, 0.2098968872397226, 0.6331666928600346],
[2.076095837587348, 4.15844388501484, 1.5, 2.5, 0.3329990552567723, 0.7225099982586379, 0.6011864219230839, -0.1916139583835837, 0.7411863330262839, 0.6044428958606523, 0.6331666928600346],
[3.745720982331497, 2.488359277096768, 1, 0, 0.6008458066715717, 0.266971299975888, 0, -0.4216445732007316, 1, 0.6008458066715717, 0.6331666928600346],
[1.186573104237605, 4.142985553010962, 1, 0, 0.2226400309195929, 0.8427630766521701, 0, -1.33102875775948, 1, 0.2226400309195928, 0.6331666928600346],
[1.280307029423114, 4.954232693179073, 0, 1, 0.2053571051575138, 0, 0.2018476042469277, 0.3187906226323679, 0.7946428948424862, 1, 0.6331666928600346],
[1.186689893261063, 4.142868763987503, 0, 0, 0.2226619443707751, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078114455436499, 4.156425267165688, 1, 1, 0.3333228350286508, 0.4812054491916588, 0.2405913581316262, -0.3800169746345483, 0.8888958876484629, 0.5555415577057644, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.964393312902303, 4.270146409699889, 1, 0, 0.3150823317045766, 0.5090630239025529, 0, -0.8039952664014883, 1, 0.3150823317045766, 0.6331666928600346],
[2.076974543666311, 3.254882531962972, 2, 0.75, 0.3895405511073605, 0.9629391010587767, 0.2304230621643006, -1.156908673742261, 0.9611683804186075, 0.2909988861100765, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.4811902936673972, 0.7599741096516701, 0.4444444444444445, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 5, 0, 0.3333333333333333, 2.405951468336986, 0, -3.79987054825835, 1, 0.004115226337448097, 0.6331666928600346],
[1.964711546864368, 4.269828175737824, 0, 1, 0.3151333754024636, 0, 0.2342014617080465, 0.3698891055847409, 0.6848666245975363, 1, 0.6331666928600346],
[2.077720475433118, 4.156819247169069, 1, 1, 0.3332596419108088, 0.4812966959819471, 0.2405685550751414, -0.380197100734135, 0.8889380110734795, 0.5554572948950971, 0.6331666928600346],
[2.077720381460805, 4.156819341141381, 1, 1, 0.3332596268379539, 0.4812967177503063, 0.2405685496366603, -0.3801971437036099, 0.8889380211198277, 0.5554572747957356, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 3.251378749714506, 0, 0, 0.3899347096419689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.280700062263249, 4.952878071161879, 1, 1, 0.20545183438, 0.7808229494678116, 0.2019028099687125, -0.9143250048168169, 0.9577895437498931, 0.3686932125098931, 0.6331666928600346],
[2.07772033804425, 4.156819384557937, 0, 1, 0.3332596198740789, 0, 0.2405685471240041, 0.3799450442305298, 0.6667403801259211, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[1.526000025963073, 4.708539696639114, 0, 1, 0.2447654668765423, 0, 0.2123800720452214, 0.3354252117809509, 0.7552345331234578, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 2, 1, 0.3333333333333333, 0.9623805873347945, 0.2405951468336986, -1.139961164477505, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.6331666928600346],
[2.077150040134823, 3.252929727882264, 1, 1, 0.3897033685309312, 0.4814288716163673, 0.307415186817154, -0.2748307622013216, 0.8481312845556451, 0.6275380216175077, 0.6331666928600346],
[1.668054406100746, 4.566485316501447, 1, 0, 0.2675505298416044, 0.599500829434938, 0, -0.9468293834708412, 1, 0.2675505298416043, 0.6331666928600346],
[1.281115905484733, 4.952826826863103, 1, 2, 0.205506524600722, 0.7805694986056959, 0.4038097979021628, -0.5950403028966942, 0.8906594910552064, 0.4984999218495683, 0.6331666928600346],
[3.743009790724843, 2.489602703351146, 0, 2, 0.6005523035938014, 0, 0.803341029999641, 1.268767038851844, 0.1595584621642186, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 3.251378749714506, 0, 0, 0.3899347096419689, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.01207004386072, 1.918410057644813, 2, 4, 0.3453598075416957, 1.976147809266883, 2.085059961013083, 0.08277041555356537, 0.6564267294536918, 0.6721565877459588, 1.315834299221515],
[0.616071315472541, 2.265906023138822, 0, 0, 0.2137668840135244, 0, 0, 0, 1, 1, 1.315834299221515],
[0.7542238556216941, 2.245776144378308, 2, 0, 0.2514079518738979, 2.651732619026527, 0, -2.015248136178976, 1, 0.06320595826542807, 1.315834299221515],
[0.803636421788263, 2.196363578211738, 2, 2, 0.2678788072627542, 2.488687602721604, 0.9105960505994113, -1.199308722272885, 0.9385571654247736, 0.2922205770453308, 1.315834299221515],
[0.5279469772922147, 2.307983673492984, 0, 5, 0.1861635710824027, 0, 2.166393141088743, 1.646402698554402, 0.3570143141887792, 1, 1.315834299221515],
[0.8196729764167933, 2.180327023583209, 1, 2, 0.2732243254722642, 1.219998741902542, 0.9172935886989767, -0.230048079292852, 0.8168386328792909, 0.6161149948117773, 1.315834299221515],
[3.719517322673523, 2.503141176247135, 2, 2, 0.5977376588026944, 0.5377041767780868, 0.7989960849905094, 0.4126747524133946, 0.5287056035193148, 0.8181839653621903, 0.6331666928600346],
[2.070279451487036, 4.156373140058363, 0.6666666666666666, 2.333333333333333, 0.3324867448519737, 0.3220177190030142, 0.5613868761794013, 0.3780507722147367, 0.5937213766276452, 0.7025734850310172, 0.6331666928600346],
[1.187380782042459, 4.587859447000168, 1, 1, 0.205598509317645, 0.8421898140206227, 0.2179665727671459, -0.9858750441117489, 0.9577292529663624, 0.3689262716016523, 0.6331666928600346],
[1.19309313310939, 4.145026768429381, 1.5, 3.5, 0.2235043714108909, 1.257236303163327, 0.8443853792833785, -0.6520414426966887, 0.8054961568297759, 0.5145765194109376, 0.6331666928600346],
[1.959507419081547, 4.272862251243454, 1.5, 2.5, 0.314408085966339, 0.7654985050799525, 0.5850878996327276, -0.2849338215064731, 0.7656026821868429, 0.5764279619705655, 0.6331666928600346],
[2.072565134831699, 4.161974587770489, 0, 2, 0.332432741958158, 0, 0.4805411368624842, 0.7589488554615282, 0.4456460440095033, 1, 0.6331666928600346],
[2.077861711033715, 4.156678011568472, 1, 1, 0.3332822956441847, 0.4812639814718517, 0.2405767291132233, -0.3801325228770898, 0.8889229114101422, 0.5554875026985115, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 2, 0, 0.3333333333333333, 0.9623805873347945, 0, -1.51994821930334, 1, 0.1111111111111109, 0.6331666928600346],
[2.077493116799353, 3.747892182868201, 0, 3, 0.3566275894090495, 0, 0.800449920548181, 1.26420092777231, 0.2663098929432346, 1, 0.6331666928600346],
[2.374377437988895, 2.192845726874391, 1, 0, 0.519873313013372, 0.4211630316227242, 0, -0.6651692774936045, 1, 0.519873313013372, 0.6331666928600346],
[2.058553216550379, 4.175986506051808, 3, 7, 0.330185275600614, 1.457334197571657, 1.676250627212433, 0.345748492631416, 0.5678620249084778, 0.6934366366027789, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.280602088644929, 4.156359815068125, 1, 0, 0.2355363365283781, 0.780882687032122, 0, -1.233297164613713, 1, 0.235536336528378, 0.6331666928600346],
[1.667982441085109, 4.156359815068125, 1, 0, 0.2863812543507275, 0.5995266948670323, 0, -0.946870234375328, 1, 0.2863812543507275, 0.6331666928600346],
[1.234643542960315, 4.771040236996453, 1, 0, 0.2055791793568596, 0.8099503745042813, 0, -1.33099862140085, 1, 0.2055791793568597, 0.6085283346513346],
[2.310197193995871, 3.67982540415115, 2, 1, 0.3856742034179498, 0.8657269627016848, 0.2717520235802265, -0.9381019971825336, 0.9426330482831262, 0.3314998701124636, 0.6331666928600346],
[2.070758440854106, 3.251654035455391, 0, 2, 0.3890638784707545, 0, 0.6150715845512457, 0.9714212568146111, 0.373242944589197, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[2.071640852680005, 3.867317583999633, 2, 2, 0.3488222513707676, 0.9654183047281936, 0.5171543211953058, -0.7079715161706702, 0.8746413212460666, 0.4349285707881443, 0.6331666928600346],
[1.032977143371525, 3.535206006853903, 2, 2, 0.2261242838568218, 1.936151262236275, 0.5657378936680033, -2.164380066137197, 0.9615945821336256, 0.2221388116664117, 0.6331666928600346],
[2.161816562537688, 4.324994476134362, 0, 1, 0.3332633785152227, 0, 0.2312141681378031, 0.3799562895789901, 0.6667366214847773, 1, 0.6085283346513346],
[2.162322153783425, 4.32464430756685, 2, 0, 0.3333333333333333, 0.9249315586489232, 0, -1.51994821930334, 1, 0.1111111111111109, 0.6085283346513346],
[2.162322153783425, 4.324398673916149, 1, 2, 0.3333459557177001, 0.4624657793244616, 0.4624920482155296, 4.316790126642138e-05, 0.740723910735598, 0.7037205332308789, 0.6085283346513346],
[2.161844088525094, 4.324975411849407, 0, 1, 0.3332671871631829, 0, 0.2312151873188081, 0.3799579644081591, 0.6667328128368171, 1, 0.6085283346513346],
[1.735521778205344, 4.751444683144936, 1, 1, 0.2675398105641031, 0.5761955929092821, 0.2104623049800739, -0.6010127501109058, 0.9284224497633239, 0.4635020708915301, 0.6085283346513346],
[2.162555163080526, 3.898172451861181, 1, 2, 0.3568144454717135, 0.4624159499244939, 0.513060934244995, 0.08322535112439576, 0.7089071218110043, 0.733922074574713, 0.6085283346513346],
[2.162322153783425, 4.32464430756685, 2, 0, 0.3333333333333333, 0.9249315586489232, 0, -1.51994821930334, 1, 0.1111111111111109, 0.6085283346513346],
[1.332748013138118, 5.154218448212156, 1, 1, 0.2054501161796825, 0.7503293872075472, 0.1940158357756199, -0.9141949844466576, 0.9577902497617548, 0.3686904821211201, 0.6085283346513346],
[2.162322153783425, 4.32464430756685, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 0.4624657793244616, 0.7599741096516701, 0.4444444444444445, 1, 0.6085283346513346],
[2.162322153783425, 4.32464430756685, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.4624657793244616, 0.2312328896622308, -0.3799870548258351, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.6085283346513346],
[1.664332747496837, 4.157553419679426, 2, 1, 0.2858751785427081, 1.201682778283374, 0.240526073643837, -1.518015264349994, 0.9766369603217268, 0.1984477737639292, 0.6331666928600346],
[1.280766962415684, 4.951476457616557, 0, 3, 0.2055065689987215, 0, 0.6058798876818411, 0.9569042315619318, 0.5014999940757364, 1, 0.6331666928600346],
[2.074342299199373, 4.160197423402814, 1, 1, 0.3327177933728167, 0.4820805131274462, 0.2403732078613843, -0.3817435566205515, 0.8892988699731236, 0.5547344567187571, 0.6331666928600346],
[0.3274929630491167, 0.8382057450524086, 0, 0, 0.2809413451117886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.9531438946087369],
[1.668277865280271, 4.156359815068125, 0, 0, 0.286417448918554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.445778863202207, 4.769465114476326, 0, 1, 0.2326181994455225, 0, 0.2096671169613529, 0.3311404711045044, 0.7673818005544775, 1, 0.6331666928600346],
[1.523283050384728, 4.711256672217459, 0, 1, 0.2443296727843986, 0, 0.2122575927346636, 0.3352317724987857, 0.7556703272156013, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[0.7354521584755515, 0.4884254278037524, 0, 0, 0.6009197053043442, 0, 0, 0, 1, 1, 0.9531438946087369],
[0.2513319581854836, 0.9243971981116268, 0, 0, 0.2137668840135246, 0, 0, 0, 1, 1, 0.9531438946087369],
[0.4842863103666257, 0.5829640386717263, 0, 0, 0.4537701119545127, 0, 0, 0, 1, 1, 0.9531438946087369],
[0.2994803881676776, 0.9243971981116268, 0, 0, 0.244697992287059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.9531438946087369],
[1.668271437369626, 4.564989082454336, 2, 2, 0.2676402553790165, 1.198845676548543, 0.4381171485572783, -1.201466433041557, 0.9387074476820947, 0.2918096010338085, 0.6331666928600346],
[1.280198271760239, 4.15870446474287, 0, 4, 0.2353780410832149, 0, 0.9618380036166665, 1.519091282695261, 0.3418118106601447, 1, 0.6331666928600346],
[1.19313246448743, 4.577912841986299, 1, 3, 0.2067446019092973, 0.8381299057431988, 0.6553204710420694, -0.2887224434933133, 0.8087546632557916, 0.6040392441568219, 0.6331666928600346],
[2.482423370319986, 2.996474044966293, 0, 1, 0.4530881274385526, 0, 0.3337255671144146, 0.5309191504342868, 0.5469118725614475, 1, 0.6285807676016777],
[1.668054406100746, 4.566485316501447, 1, 0, 0.2675505298416044, 0.599500829434938, 0, -0.9468293834708412, 1, 0.2675505298416043, 0.6331666928600346],
[2.075991453665699, 4.158281530607357, 0, 3, 0.3329965593265995, 0, 0.7214518733083042, 1.139434340820239, 0.2967455551769337, 1, 0.6331666928600346],
[1.668054401473235, 4.566013128202743, 1, 2, 0.2675707944344218, 0.5995008310980712, 0.4380188895311461, -0.2550385915555758, 0.8235306063974175, 0.607086491450573, 0.6331666928600346],
[1.281057047203332, 4.953023105913493, 1, 2, 0.205492553149617, 0.7806053619416046, 0.4037937956744374, -0.5951222174449782, 0.8906731777244112, 0.4984734642111343, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0.2405951468336986, -0.3799870548258351, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.6331666928600346],
[1.281056642977557, 4.95348307962463, 1, 1, 0.2054773407463135, 0.7806056082545286, 0.2018781499654944, -0.9140206912573109, 0.9577790624398235, 0.3687337439324504, 0.6331666928600346],
[1.668277865280271, 4.566261857321921, 0, 0, 0.2675863719710106, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.280490807969217, 4.954048914632969, 0, 1, 0.2053865826417035, 0, 0.2018550921138992, 0.3188024486918494, 0.7946134173582965, 1, 0.6331666928600346],
[1.667508912978496, 4.567030809623697, 1, 0, 0.267463034509708, 0.5996969444761799, 0, -0.9471391202959987, 1, 0.267463034509708, 0.6331666928600346],
[1.280307029423114, 4.954232693179073, 0, 0, 0.2053571051575138, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.525897610158943, 4.708642112443243, 0, 1, 0.2447490397129205, 0, 0.2123754526506401, 0.3354179160804136, 0.7552509602870795, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.4811902936673972, 0, -0.7599741096516701, 1, 0.3333333333333333, 0.6331666928600346],
[2.310814126710249, 3.678453272360382, 0, 0, 0.3858258402469764, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[2.078179907534063, 4.156359815068125, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.6331666928600346],
[1.031619717327975, 3.536023168717054, 0, 1, 0.2258538469545766, 0, 0.2828035768676317, 0.4466494843406856, 0.7741461530454233, 1, 0.6331666928600346]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node100":{
"Global MG94xREV":0.0005743990294492864,
"Nucleotide GTR":0.0005695024921294747,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "S", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "TCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1031":{
"Global MG94xREV":0.0004257938590040615,
"Nucleotide GTR":0.000422164125292361,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1032":{
"Global MG94xREV":0.0005798930844165851,
"Nucleotide GTR":0.0005749497123289456,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTT", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1037":{
"Global MG94xREV":0.001515844582390681,
"Nucleotide GTR":0.001502922573145947,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "N", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node104":{
"Global MG94xREV":0.0009985171061070103,
"Nucleotide GTR":0.0009900051204944798,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1045":{
"Global MG94xREV":0.0005170530902582687,
"Nucleotide GTR":0.0005126454056645106,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1046":{
"Global MG94xREV":0.0005317719496347185,
"Nucleotide GTR":0.0005272387922588921,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATT", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node105":{
"Global MG94xREV":0.0005172272892047615,
"Nucleotide GTR":0.0005128181196300074,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1058":{
"Global MG94xREV":0.0009036693156359994,
"Nucleotide GTR":0.000895965872033348,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATT", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1059":{
"Global MG94xREV":0.0006120565110355248,
"Nucleotide GTR":0.0006068389577416197,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATT", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1064":{
"Global MG94xREV":0.001028865531042557,
"Nucleotide GTR":0.001020094836435627,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1065":{
"Global MG94xREV":0.0004856733120230734,
"Nucleotide GTR":0.0004815331283256229,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1074":{
"Global MG94xREV":0.0005133949248521023,
"Nucleotide GTR":0.0005090184247529465,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1075":{
"Global MG94xREV":0.00100142802965088,
"Nucleotide GTR":0.0009928912295017011,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "C", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "TGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1082":{
"Global MG94xREV":0.0008480149845002018,
"Nucleotide GTR":0.0008407859732963606,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "I", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATT", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1083":{
"Global MG94xREV":0.000667571627078846,
"Nucleotide GTR":0.0006618808281428294,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "I", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATT", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node110":{
"Global MG94xREV":0.0015155095492586,
"Nucleotide GTR":0.001502590396046259,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCT", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1101":{
"Global MG94xREV":0.0008492114462832313,
"Nucleotide GTR":0.0008419722356892931,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACT", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1102":{
"Global MG94xREV":0.000666412732525887,
"Nucleotide GTR":0.0006607318127333529,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACT", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1120":{
"Global MG94xREV":0.001515889040824468,
"Nucleotide GTR":0.001502966652588178,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "F", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TTT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1126":{
"Global MG94xREV":0.0009083296365548231,
"Nucleotide GTR":0.0009005864654558982,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAT", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1130":{
"Global MG94xREV":0.001516024843998184,
"Nucleotide GTR":0.001503101298090534,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1138":{
"Global MG94xREV":0.001516387344599448,
"Nucleotide GTR":0.00150346070850948,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1142":{
"Global MG94xREV":0.001516059747311791,
"Nucleotide GTR":0.001503135903866419,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "F", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTT", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1148":{
"Global MG94xREV":0.001516035189700548,
"Nucleotide GTR":0.001503111555599645,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "F", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "TTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1153":{
"Global MG94xREV":0.0005126637863043338,
"Nucleotide GTR":0.0005082935188883847,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "F", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "TTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1154":{
"Global MG94xREV":0.001004695345510383,
"Nucleotide GTR":0.0009961306927130935,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "I", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1159":{
"Global MG94xREV":0.0008506941972823002,
"Nucleotide GTR":0.0008434423467895626,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "R"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1164":{
"Global MG94xREV":0.001516368682903067,
"Nucleotide GTR":0.001503442205897094,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAA", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1172":{
"Global MG94xREV":0.0004198135206404055,
"Nucleotide GTR":0.0004162347670809712,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1173":{
"Global MG94xREV":0.000582869669036486,
"Nucleotide GTR":0.0005779009226760342,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "I", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "ATA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1181":{
"Global MG94xREV":0.000833559836282981,
"Nucleotide GTR":0.00082645404982201,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "I", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ATA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1184":{
"Global MG94xREV":0.0008301376221411587,
"Nucleotide GTR":0.0008230610087783344,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAT", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1185":{
"Global MG94xREV":0.0006855075948132071,
"Nucleotide GTR":0.0006796638984472231,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAT", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node119":{
"Global MG94xREV":0.000244662142280959,
"Nucleotide GTR":0.0002425764888431871,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1193":{
"Global MG94xREV":0.0009061027341363629,
"Nucleotide GTR":0.0008983785465493175,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCT", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1196":{
"Global MG94xREV":0.001515680467820229,
"Nucleotide GTR":0.001502759857590949,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "H", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CAT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1216":{
"Global MG94xREV":0.001027333986412177,
"Nucleotide GTR":0.001018576347651538,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "V", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "GTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1223":{
"Global MG94xREV":0.000697146311051103,
"Nucleotide GTR":0.0006912033989735814,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node125":{
"Global MG94xREV":0.001515843885474092,
"Nucleotide GTR":0.00150292188217031,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCA", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1279":{
"Global MG94xREV":0.0002598939017764127,
"Nucleotide GTR":0.0002576784032745092,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1280":{
"Global MG94xREV":0.0006679148014372805,
"Nucleotide GTR":0.0006622210770679552,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCT", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1285":{
"Global MG94xREV":0.0004968727687223575,
"Nucleotide GTR":0.0004926371138369722,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1286":{
"Global MG94xREV":0.0005331264424538535,
"Nucleotide GTR":0.0005285817385323369,
"amino-acid": [
["M", "A", "Y", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "TAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1291":{
"Global MG94xREV":0.001062241321848783,
"Nucleotide GTR":0.001053186111083428,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACC", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1297":{
"Global MG94xREV":0.001027535235661856,
"Nucleotide GTR":0.001018775881326486,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAT", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1300":{
"Global MG94xREV":0.001029599633903449,
"Nucleotide GTR":0.001020822681343646,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1301":{
"Global MG94xREV":0.0004859172691888345,
"Nucleotide GTR":0.0004817750058476079,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1317":{
"Global MG94xREV":0.001515576823028651,
"Nucleotide GTR":0.001502657096332529,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATT", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node139":{
"Global MG94xREV":0.001515995408399861,
"Nucleotide GTR":0.001503072113419697,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACT", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node142":{
"Global MG94xREV":0.0009062590401936755,
"Nucleotide GTR":0.0008985335201558378,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCT", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node150":{
"Global MG94xREV":0.0008408278865912207,
"Nucleotide GTR":0.0008336601427143223,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node151":{
"Global MG94xREV":0.000674045164443845,
"Nucleotide GTR":0.0006682991810181732,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node158":{
"Global MG94xREV":0.001062637441894328,
"Nucleotide GTR":0.001053578854353446,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node171":{
"Global MG94xREV":0.001515285707718666,
"Nucleotide GTR":0.001502368462671899,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACT", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node177":{
"Global MG94xREV":0.001515810221783047,
"Nucleotide GTR":0.001502888505449667,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACA", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node180":{
"Global MG94xREV":0.000909134762416761,
"Nucleotide GTR":0.0009013847279203937,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "V", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GTT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node181":{
"Global MG94xREV":0.0006058125513320949,
"Nucleotide GTR":0.0006006482254639749,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "V", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GTT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node188":{
"Global MG94xREV":0.0006531155225178126,
"Nucleotide GTR":0.0006475479564771416,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node189":{
"Global MG94xREV":0.0008620270238378753,
"Nucleotide GTR":0.000854678565228961,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "F", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "TTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node198":{
"Global MG94xREV":0.001515425906711807,
"Nucleotide GTR":0.001502507466520955,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "S", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "TCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node213":{
"Global MG94xREV":0.0003701725745507295,
"Nucleotide GTR":0.0003670169915272064,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node214":{
"Global MG94xREV":0.0006672370580224759,
"Nucleotide GTR":0.0006615491111627803,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "F", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TTC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node215":{
"Global MG94xREV":0.0004773332178189756,
"Nucleotide GTR":0.0004732641303115026,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "F", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TTC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node225":{
"Global MG94xREV":0.001515845048847705,
"Nucleotide GTR":0.001502923035626598,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "N", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AAT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node235":{
"Global MG94xREV":0.001521273068423703,
"Nucleotide GTR":0.001508304783361831,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node241":{
"Global MG94xREV":0.001058860252249795,
"Nucleotide GTR":0.001049833863840718,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node245":{
"Global MG94xREV":0.0005601507577288361,
"Nucleotide GTR":0.0005553756816069808,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node246":{
"Global MG94xREV":0.0009547682059277132,
"Nucleotide GTR":0.0009466291633590368,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "TCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node254":{
"Global MG94xREV":0.001443478307179569,
"Nucleotide GTR":0.00143117319341881,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node255":{
"Global MG94xREV":7.267285137129452e-05,
"Nucleotide GTR":7.205334243998973e-05,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node257":{
"Global MG94xREV":0.001515806672313225,
"Nucleotide GTR":0.00150288498623775,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node258":{
"Global MG94xREV":0.001516054241161981,
"Nucleotide GTR":0.00150313044465448,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node266":{
"Global MG94xREV":0.001050150579957551,
"Nucleotide GTR":0.001041198438253702,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACT", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node274":{
"Global MG94xREV":0.000901506523603508,
"Nucleotide GTR":0.0008938215169956273,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "F", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node275":{
"Global MG94xREV":0.0006142157578054407,
"Nucleotide GTR":0.0006089797977388052,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "F", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node279":{
"Global MG94xREV":0.0009106375323490093,
"Nucleotide GTR":0.0009028746872999103,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "F", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "TTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node283":{
"Global MG94xREV":0.001515562150723545,
"Nucleotide GTR":0.001502642549103349,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node295":{
"Global MG94xREV":0.004063621683220035,
"Nucleotide GTR":0.0040289808252009,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "L", "S", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "TTA", "TCA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node299":{
"Global MG94xREV":0.001515215127583279,
"Nucleotide GTR":0.00150229848420582,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "TTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node319":{
"Global MG94xREV":0.000289974767481972,
"Nucleotide GTR":0.0002875028408282301,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node320":{
"Global MG94xREV":0.0008165391770058509,
"Nucleotide GTR":0.0008095784853119056,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node321":{
"Global MG94xREV":0.000408108798123382,
"Nucleotide GTR":0.000404629822954377,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node338":{
"Global MG94xREV":0.001058536390151454,
"Nucleotide GTR":0.001049512762545877,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node344":{
"Global MG94xREV":0.0008479566924006551,
"Nucleotide GTR":0.0008407281781152035,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAT", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node345":{
"Global MG94xREV":0.0006676590387493364,
"Nucleotide GTR":0.0006619674946614574,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAT", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node349":{
"Global MG94xREV":0.0004402030244093041,
"Nucleotide GTR":0.0004364504579410411,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node350":{
"Global MG94xREV":0.000574095549089068,
"Nucleotide GTR":0.0005692015988260467,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node351":{
"Global MG94xREV":0.0005004211497165295,
"Nucleotide GTR":0.0004961552462076757,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node359":{
"Global MG94xREV":0.0003810458047057181,
"Nucleotide GTR":0.0003777975314537803,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node360":{
"Global MG94xREV":0.001133313023048715,
"Nucleotide GTR":0.001123651952559605,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "S", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "TCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node364":{
"Global MG94xREV":0.001515610774711793,
"Nucleotide GTR":0.001502690758590248,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "P", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "CCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node369":{
"Global MG94xREV":0.0007511063367350825,
"Nucleotide GTR":0.0007447034355802942,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node370":{
"Global MG94xREV":0.0007638905439717331,
"Nucleotide GTR":0.0007573786622222204,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTT", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node377":{
"Global MG94xREV":0.0009048078342557115,
"Nucleotide GTR":0.0008970946852068035,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "T", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ACT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node378":{
"Global MG94xREV":0.0006097806009245811,
"Nucleotide GTR":0.0006045824489148408,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "T", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ACT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node387":{
"Global MG94xREV":0.001515520119463949,
"Nucleotide GTR":0.001502600876144553,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node392":{
"Global MG94xREV":0.001515883083781877,
"Nucleotide GTR":0.001502960746327155,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "V", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GTT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node398":{
"Global MG94xREV":0.0007441744357290728,
"Nucleotide GTR":0.0007378306264428855,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node402":{
"Global MG94xREV":0.0009075205131635048,
"Nucleotide GTR":0.0008997842395394699,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "R", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AGG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node413":{
"Global MG94xREV":0.001098242567957531,
"Nucleotide GTR":0.001088880460007304,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTC", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node458":{
"Global MG94xREV":0.001058713405873988,
"Nucleotide GTR":0.00104968826927545,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "D", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAT", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node50":{
"Global MG94xREV":0.0007389699736254034,
"Nucleotide GTR":0.0007326705304359782,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node51":{
"Global MG94xREV":0.0007758365287593638,
"Nucleotide GTR":0.0007692228119486203,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node517":{
"Global MG94xREV":0.001516056743893872,
"Nucleotide GTR":0.001503132926051516,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACG", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node535":{
"Global MG94xREV":0.001515083769675985,
"Nucleotide GTR":0.001502168246075655,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCC", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node574":{
"Global MG94xREV":0.0002735825048475904,
"Nucleotide GTR":0.0002712503161140577,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node575":{
"Global MG94xREV":0.0009544276270195165,
"Nucleotide GTR":0.0009462914877589037,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node576":{
"Global MG94xREV":0.0002866165216417296,
"Nucleotide GTR":0.0002841732227802412,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node586":{
"Global MG94xREV":0.001040913496545654,
"Nucleotide GTR":0.001032040097529958,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node591":{
"Global MG94xREV":0.0008606113212258907,
"Nucleotide GTR":0.0008532749309533037,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "C", "Y", "R", "I", "G", "L", "C", "L", "I", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "CTG", "TGT", "TTA", "ATT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node592":{
"Global MG94xREV":0.0006544422274946836,
"Nucleotide GTR":0.0006488633517893041,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "C", "Y", "R", "I", "G", "L", "C", "L", "I", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "CTG", "TGT", "TTA", "ATT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node595":{
"Global MG94xREV":0.001521498448797361,
"Nucleotide GTR":0.001508528242451933,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "CTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node60":{
"Global MG94xREV":0.0004244653833670403,
"Nucleotide GTR":0.0004208469744142647,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node603":{
"Global MG94xREV":0.001515910612305236,
"Nucleotide GTR":0.001502988040180126,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "TTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node61":{
"Global MG94xREV":0.0005814429312697249,
"Nucleotide GTR":0.0005764863473161752,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "F", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "TTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node617":{
"Global MG94xREV":0.001515391345228007,
"Nucleotide GTR":0.001502473199660905,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGG", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node622":{
"Global MG94xREV":0.001058724305601532,
"Nucleotide GTR":0.001049699076086886,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "V", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GTT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node628":{
"Global MG94xREV":0.001058724330318562,
"Nucleotide GTR":0.001049699100593212,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "I", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "ATT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node633":{
"Global MG94xREV":0.001058713425662799,
"Nucleotide GTR":0.00104968828889557,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "L", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "TTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node639":{
"Global MG94xREV":0.001058724329193238,
"Nucleotide GTR":0.001049699099477482,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "F", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TTT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node654":{
"Global MG94xREV":0.001515595253602377,
"Nucleotide GTR":0.001502675369792496,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "TTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node66":{
"Global MG94xREV":0.0004067438197755479,
"Nucleotide GTR":0.0004032764805374525,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node67":{
"Global MG94xREV":0.0006620045040464594,
"Nucleotide GTR":0.0006563611627562517,
"amino-acid": [
["K", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AAG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node671":{
"Global MG94xREV":0.001104239378461515,
"Nucleotide GTR":0.001094826149940175,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "L", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CTT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node692":{
"Global MG94xREV":0.0008323217363356117,
"Nucleotide GTR":0.0008252265042145446,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "S", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "TCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node695":{
"Global MG94xREV":0.0008284016834641011,
"Nucleotide GTR":0.0008213398683305238,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTT", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node696":{
"Global MG94xREV":0.0006872424446499499,
"Nucleotide GTR":0.0006813839593366766,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTT", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node709":{
"Global MG94xREV":0.0007510223253376211,
"Nucleotide GTR":0.0007446201403486366,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node710":{
"Global MG94xREV":0.0007641011650709688,
"Nucleotide GTR":0.0007575874878552034,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "S", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "TCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node72":{
"Global MG94xREV":0.001515144192974715,
"Nucleotide GTR":0.001502228154288317,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAC", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node723":{
"Global MG94xREV":0.001062933931275074,
"Nucleotide GTR":0.001053872816272891,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "C", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "TGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node727":{
"Global MG94xREV":0.0007403178963170261,
"Nucleotide GTR":0.0007340069625897937,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node733":{
"Global MG94xREV":0.001062925208164913,
"Nucleotide GTR":0.001053864167523989,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAG", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node736":{
"Global MG94xREV":0.001062860619741492,
"Nucleotide GTR":0.001053800129692767,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node739":{
"Global MG94xREV":0.001062864151599154,
"Nucleotide GTR":0.00105380363144266,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAT", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node742":{
"Global MG94xREV":0.0010631120189914,
"Nucleotide GTR":0.00105404938585791,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTG", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node760":{
"Global MG94xREV":0.001515836063735867,
"Nucleotide GTR":0.001502914127109485,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTA", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node764":{
"Global MG94xREV":0.0005798219546751163,
"Nucleotide GTR":0.0005748791889419733,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node768":{
"Global MG94xREV":0.0015210543319557,
"Nucleotide GTR":0.001508087911540569,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node769":{
"Global MG94xREV":0.001515064633387716,
"Nucleotide GTR":0.001502149272917097,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node774":{
"Global MG94xREV":0.0009553568075693772,
"Nucleotide GTR":0.0009472127473914123,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node775":{
"Global MG94xREV":0.0005603562398324677,
"Nucleotide GTR":0.0005555794120523801,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node783":{
"Global MG94xREV":0.0001311240265733691,
"Nucleotide GTR":0.0001300062431915689,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node784":{
"Global MG94xREV":0.0006148186027909948,
"Nucleotide GTR":0.0006095775036958809,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node785":{
"Global MG94xREV":0.0007684563550527852,
"Nucleotide GTR":0.0007619055514680896,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node792":{
"Global MG94xREV":0.0008495724272691059,
"Nucleotide GTR":0.0008423301394470052,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAG", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node793":{
"Global MG94xREV":0.0006656895688722707,
"Nucleotide GTR":0.0006600148137799474,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAG", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node797":{
"Global MG94xREV":0.0009419945988162246,
"Nucleotide GTR":0.0009339644464801617,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTT", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node798":{
"Global MG94xREV":0.0005737186053315669,
"Nucleotide GTR":0.0005688278683733764,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTT", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node802":{
"Global MG94xREV":0.001516004215507799,
"Nucleotide GTR":0.001503080845450325,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTT", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node808":{
"Global MG94xREV":0.000284885764340669,
"Nucleotide GTR":0.0002824572195391319,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node809":{
"Global MG94xREV":0.000689396379083227,
"Nucleotide GTR":0.0006835195322829102,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node810":{
"Global MG94xREV":0.0005405195016374255,
"Nucleotide GTR":0.0005359117746459797,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node815":{
"Global MG94xREV":0.00151650819432021,
"Nucleotide GTR":0.001503580528031482,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "Y", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "TAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node819":{
"Global MG94xREV":0.001515082693819753,
"Nucleotide GTR":0.001502167179390695,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "H", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "CAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node831":{
"Global MG94xREV":0.001515834432694567,
"Nucleotide GTR":0.001502912509972201,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATT", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node843":{
"Global MG94xREV":0.001517305057245093,
"Nucleotide GTR":0.001504370597997378,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATA", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node849":{
"Global MG94xREV":0.001520952109697683,
"Nucleotide GTR":0.001507986560689145,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node85":{
"Global MG94xREV":0.00151486663235383,
"Nucleotide GTR":0.00150195295976812,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node854":{
"Global MG94xREV":0.0015151599457907,
"Nucleotide GTR":0.001502243772817425,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTT", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node863":{
"Global MG94xREV":0.00151583629897151,
"Nucleotide GTR":0.001502914360339832,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "K", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "AAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node867":{
"Global MG94xREV":0.0009054887720296415,
"Nucleotide GTR":0.000897769818240384,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGT", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node871":{
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "C", "Y", "R", "I", "G", "L", "C", "L", "I", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "TGC", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "CTG", "TGT", "TTA", "ATT", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node873":{
"Global MG94xREV":0.0009069550171184122,
"Nucleotide GTR":0.0008992235641370791,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATT", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node882":{
"Global MG94xREV":0.001514734347350033,
"Nucleotide GTR":0.001501821802444602,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACG", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node883":{
"Global MG94xREV":0.001515205044311203,
"Nucleotide GTR":0.001502288486889875,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACT", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node895":{
"Global MG94xREV":0.001517295195170886,
"Nucleotide GTR":0.001504360819993671,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "F", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TTT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node90":{
"Global MG94xREV":0.001515281409484459,
"Nucleotide GTR":0.001502364201078535,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGC", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node919":{
"Global MG94xREV":0.001515825416730646,
"Nucleotide GTR":0.001502903570866009,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "F", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "TTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node925":{
"Global MG94xREV":0.001061226696641952,
"Nucleotide GTR":0.001052180135177755,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "CTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node931":{
"Global MG94xREV":0.001062834502172686,
"Nucleotide GTR":0.001053774234766488,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGT", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node934":{
"Global MG94xREV":0.001061248335574757,
"Nucleotide GTR":0.001052201589646736,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAC", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node937":{
"Global MG94xREV":0.001062841797989522,
"Nucleotide GTR":0.001053781468389209,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "Y", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "TAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node94":{
"Global MG94xREV":0.0008564002576661217,
"Nucleotide GTR":0.000849099765138516,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTT", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node940":{
"Global MG94xREV":0.00106124836335796,
"Nucleotide GTR":0.001052201617193097,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGC", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node943":{
"Global MG94xREV":0.001063122623200938,
"Nucleotide GTR":0.001054059899670522,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAG", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node946":{
"Global MG94xREV":0.00106124836335796,
"Nucleotide GTR":0.001052201617193097,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAC", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node95":{
"Global MG94xREV":0.0006587685133981194,
"Nucleotide GTR":0.000653152757720288,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTT", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node952":{
"Global MG94xREV":0.001062845329780835,
"Nucleotide GTR":0.001053784970073318,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "TTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node955":{
"Global MG94xREV":0.00106284203991048,
"Nucleotide GTR":0.00105378170824788,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "TTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node958":{
"Global MG94xREV":0.001062830946267513,
"Nucleotide GTR":0.001053770709174078,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTT", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node962":{
"Global MG94xREV":0.0007429225993113787,
"Nucleotide GTR":0.0007365894614633787,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node970":{
"Global MG94xREV":0.0007532783018285506,
"Nucleotide GTR":0.0007468568854820712,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node975":{
"Global MG94xREV":0.001039433463650486,
"Nucleotide GTR":0.00103057268136277,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAT", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node978":{
"Global MG94xREV":0.001117935189217677,
"Nucleotide GTR":0.001108405209021884,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "F", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "TTT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node988":{
"Global MG94xREV":0.000421818348182438,
"Nucleotide GTR":0.0004182225042165507,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node989":{
"Global MG94xREV":0.0005834063483175861,
"Nucleotide GTR":0.000578433026966589,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "C", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "TGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node99":{
"Global MG94xREV":0.0009411569800615776,
"Nucleotide GTR":0.0009331339681127376,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "S", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "TCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node993":{
"Global MG94xREV":0.0004229727566216984,
"Nucleotide GTR":0.000419367071754773,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node994":{
"Global MG94xREV":0.0005831429522516746,
"Nucleotide GTR":0.0005781718762538205,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "I", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ATT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node999":{
"Global MG94xREV":0.0007392246474084407,
"Nucleotide GTR":0.0007329230332200771,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCY", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00304472172776531,
"Nucleotide GTR":0.003018766611541076,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "A", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GCT", "GGT", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515529399425397,
"Nucleotide GTR":0.001502610076997793,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCT", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515609139957031,
"Nucleotide GTR":0.001502689137771161,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "T", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ACT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515332165949975,
"Nucleotide GTR":0.001502414524864128,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "P", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "CCC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151538804505788,
"Nucleotide GTR":0.001502469927623497,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "H", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "CAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004565710147554525,
"Nucleotide GTR":0.0004526789172791773,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "V", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GTT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003033655757265461,
"Nucleotide GTR":0.003007794974309135,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACT", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.007663225480034599,
"Nucleotide GTR":0.00759789934327373,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "RGW", "P", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "IV", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "YC", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "V", "H", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTR", "KAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "NGG", "CCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "RTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TRT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GTG", "CAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004584213862344816,
"Nucleotide GTR":0.004545135150320373,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "PL", "T", "RS", "P", "M", "LV", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CYG", "ACT", "AGW", "CCC", "ATG", "STA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1.5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["KRM", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ADG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417938_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "TA", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "RCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418703_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "LF", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "YTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418703_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "GC", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "YF", "S", "RC", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "KGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TWC", "AGT", "YGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAR", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "RC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "YGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "ED", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAK", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCR", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420198_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004534285093056266,
"Nucleotide GTR":0.0004495632005153067,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "CTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420198_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "GC", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "KGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAW", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420758_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515667073349149,
"Nucleotide GTR":0.001502746577302735,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "I", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "ATC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420758_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCK", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421787_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515822986761291,
"Nucleotide GTR":0.001502901161611236,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "V", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GTG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421787_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "NK", "PL", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAS", "CYC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421892_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "SL", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TYA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421917_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTR", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "HP", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TS", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CMC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "WCG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515476082663286,
"Nucleotide GTR":0.001502557214741177,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTC", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACT", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515647990122763,
"Nucleotide GTR":0.001502727656753731,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "H", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "CAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423067_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "SF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TYC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423067_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423216_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "AS", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "KCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423216_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423378_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "AV", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GYT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423378_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423427_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515823403768756,
"Nucleotide GTR":0.001502901575063869,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "V", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GTT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423427_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423445_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "GV", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GKC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423445_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423528_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515546845294965,
"Nucleotide GTR":0.001502627374147835,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "F", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTT", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423528_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTR", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423549_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423653_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "AV", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GYT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423653_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423718_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00151690189624855,
"Nucleotide GTR":0.001503970873797841,
"amino-acid": [
["M", "A", "DG", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GRT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGT", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423718_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423815_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "DEAGV", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GNS", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 6.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423815_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423856_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "RC", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "YGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423856_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424040_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004531192950785664,
"Nucleotide GTR":0.0004492566222241115,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "TTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424040_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424156_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "NS", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "ARC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424156_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515281821639676,
"Nucleotide GTR":0.001502364609720283,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "A", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "GCG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515477255149593,
"Nucleotide GTR":0.001502558377232476,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "R", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AGG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425380_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515028191760417,
"Nucleotide GTR":0.00150211314194107,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425380_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0015172141601422,
"Nucleotide GTR":0.001504280475758358,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "M", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "ATG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001518336241106778,
"Nucleotide GTR":0.001505392991401551,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTA", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515599570964827,
"Nucleotide GTR":0.001502679650351044,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001516116446072337,
"Nucleotide GTR":0.001503192119291194,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATT", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151547611944125,
"Nucleotide GTR":0.001502557251205621,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "S", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TCA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515704792930114,
"Nucleotide GTR":0.001502783975338352,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGG", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001518431923177557,
"Nucleotide GTR":0.001505487857818391,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGA", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151612473161038,
"Nucleotide GTR":0.001503200334198119,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "N", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001517073984339034,
"Nucleotide GTR":0.001504141494901588,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGT", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515380726090733,
"Nucleotide GTR":0.001502462671047812,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTG", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "LF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "LF", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "YTT", "CTR", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTW", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "NT", "R", "P", "LF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "AMC", "AGA", "CCG", "YTT", "CTR", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "LF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "YTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515773400877466,
"Nucleotide GTR":0.001502851998428563,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "TTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACR", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006825749957017855,
"Nucleotide GTR":0.0006767562986485739,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "S", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "TCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515878767660802,
"Nucleotide GTR":0.001502956466999399,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "Y", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TAT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515823656381838,
"Nucleotide GTR":0.001502901825523519,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "Y", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "TAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516215532966045,
"Nucleotide GTR":0.001503290361506122,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "L", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "TTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515380729969575,
"Nucleotide GTR":0.001502462674893589,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "S", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AGT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429065_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "NTSIYCF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "WNC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 10, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429065_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGR", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "TISF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "WYC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "IL", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "MTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515561253689759,
"Nucleotide GTR":0.001502641659716442,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTA", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006051290453430682,
"Nucleotide GTR":0.0005999705461083722,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "F", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "TTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516445759772035,
"Nucleotide GTR":0.001503518625714526,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "A", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "GCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001515679104750293,
"Nucleotide GTR":0.001502758506140675,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429814_Nova_Scotia_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515447782405842,
"Nucleotide GTR":0.001502529155732865,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "V", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GTC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429814_Nova_Scotia_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151632620310285,
"Nucleotide GTR":0.001503400088221321,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAT", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "TI", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "RGW", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "RC", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AYT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "NGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "YGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "TP", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "MCC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006094509289184714,
"Nucleotide GTR":0.0006042555872395271,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGT", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTY", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTR", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "DA", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GMT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAY", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "AS", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "MI", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "IM", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "LF", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "KCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATK", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATN", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "YTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "DY", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "YS", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "PL", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "KAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACY", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TMC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CYA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTK", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "HY", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "YF", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "YAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TWC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AS", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "NTSI", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "QHPRL", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "TS", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "KCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ANT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTS", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CNN", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AST", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "NHDY", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAR", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAN", "NAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "DY", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "KAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "ND", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "GV", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "TPAS", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGR", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "RAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GKC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "NCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "YF", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TWC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTR", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATM", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432315_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515380706096816,
"Nucleotide GTR":0.001502462651224336,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGG", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432315_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432711_England_20200312_null_17":{
"Global MG94xREV":0.0004527343149381053,
"Nucleotide GTR":0.0004488749238956465,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432711_England_20200312_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433051_England_20200404_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001515143584598633,
"Nucleotide GTR":0.001502227551098414,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACT", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433051_England_20200404_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515823645100762,
"Nucleotide GTR":0.001502901814338607,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCT", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001516829981444361,
"Nucleotide GTR":0.001503899572040515,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "Q", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "CAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433666_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516439750669234,
"Nucleotide GTR":0.001503512667837084,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGC", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433666_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433845_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515978449701716,
"Nucleotide GTR":0.001503055299288123,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "L", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "TTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433845_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433949_England_20200412_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515583447175784,
"Nucleotide GTR":0.001502663664011283,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "H", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CAC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433949_England_20200412_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003050647669242504,
"Nucleotide GTR":0.003024642036579156,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "QHPRL", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "F", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "M", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTC", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CNN", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TTT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ATG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151522510078229,
"Nucleotide GTR":0.001502308372387033,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "L", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CTT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001517555234601757,
"Nucleotide GTR":0.001504618642685461,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCT", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515085633287559,
"Nucleotide GTR":0.001502170093800636,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "L", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "CTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "S", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "TCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "V", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GTT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515806942257432,
"Nucleotide GTR":0.001502885253880782,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTT", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001515466290542277,
"Nucleotide GTR":0.001502547506094345,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515450893633828,
"Nucleotide GTR":0.001502532240438794,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGC", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "CW", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TG-", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003045039897843339,
"Nucleotide GTR":0.003019082069337951,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "I", "A", "Y", "A", "N", "R", "K", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "ATT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAA", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001518432140076223,
"Nucleotide GTR":0.00150548807286808,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "K", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAA", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "-", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAC", "---", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001514900811074218,
"Nucleotide GTR":0.001501986847127674,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "L", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "CTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATT", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515476729326298,
"Nucleotide GTR":0.001502557855891629,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACC", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000475648717032683,
"Nucleotide GTR":0.0004715939892656389,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAT", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151720658111294,
"Nucleotide GTR":0.001504272961337492,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "D", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GAC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "CF", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "VF", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "QH", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TKT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "KTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAN", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "KQE", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "H", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCY", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "NAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CAT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "S", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "TCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TPAS", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "IV", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "NCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "RTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TPAS", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "AV", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "NCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GYT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TPAS", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "NCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCY", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "DY", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "RM", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "KAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AKG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "RM", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AKG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "TA", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "RCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "IL", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "MTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001516464126075494,
"Nucleotide GTR":0.001503536835452104,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "V", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "GTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "NIYF", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "WWC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515473003421748,
"Nucleotide GTR":0.001502554161749023,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "TTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001521074834579896,
"Nucleotide GTR":0.001508108239387548,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATC", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACT", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516200516059847,
"Nucleotide GTR":0.001503275472613442,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCA", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515675318597139,
"Nucleotide GTR":0.001502754752263062,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "D", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GAC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437266_Bavaria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "I", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATT", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437266_Bavaria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516842810109686,
"Nucleotide GTR":0.001503912291346257,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "L", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CTT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0004556278198877841,
"Nucleotide GTR":0.0004517437627956891,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515628823027502,
"Nucleotide GTR":0.0015027086530508,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "V", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GTT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACY", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "A", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACT", "GCT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001517376238586625,
"Nucleotide GTR":0.001504441172544542,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "D", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GAT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516707056246584,
"Nucleotide GTR":0.001503777694734163,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACA", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515370084216494,
"Nucleotide GTR":0.001502452119891578,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAG", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "LF", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTK", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0004659962528470815,
"Nucleotide GTR":0.000462023808734239,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATT", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438435_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "LF", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "YTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438435_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438511_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACY", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438511_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438652_England_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515380743514755,
"Nucleotide GTR":0.001502462688323301,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "G", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GGG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438652_England_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "LF", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "YTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "WC", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGK", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439246_Scotland_20200425_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACA", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439246_Scotland_20200425_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439409_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516371799277922,
"Nucleotide GTR":0.001503445295706019,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTG", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439409_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439434_England_20200401_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "F", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TTC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439434_England_20200401_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439458_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "QPRL", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "HY", "GC", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CNA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "YAT", "KGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439458_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440052_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515527817674164,
"Nucleotide GTR":0.001502608508730399,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "H", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "CAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440052_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440088_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004523925987164407,
"Nucleotide GTR":0.0004485361206772185,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTG", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440088_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440230_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "PR", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CSC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCK", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440230_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440384_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTS", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440384_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440436_England_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAY", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440436_England_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440816_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGR", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440816_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441046_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACG", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441046_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441103_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "IV", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "RTC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441103_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441198_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACK", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441198_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441250_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0004565819636784877,
"Nucleotide GTR":0.0004526897728667306,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "L", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "TTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441250_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441307_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001517022632478164,
"Nucleotide GTR":0.001504090580796166,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "T", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441307_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441573_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004133702302355341,
"Nucleotide GTR":0.0004098464033217105,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "L", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CTT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441573_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442012_England_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0004526084195899952,
"Nucleotide GTR":0.0004487501017583857,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAG", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442012_England_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442065_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "AV", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "RC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GYT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "YGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442065_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442072_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "PL", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CYA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442072_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442621_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTY", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442621_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442782_England_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001516124006323226,
"Nucleotide GTR":0.001503199615093768,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442782_England_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442846_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001518031144704102,
"Nucleotide GTR":0.001505090495831826,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "N", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "AAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442846_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443107_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "SF", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TYT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443107_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTK", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443318_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAY", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443318_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443337_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "RC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "YGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443337_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443381_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "RI", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AKA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443381_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443629_England_20200417_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001515679890246792,
"Nucleotide GTR":0.00150275928494111,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "A", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "GCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443629_England_20200417_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443673_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001514564905098231,
"Nucleotide GTR":0.001501653804624749,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443673_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443713_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAR", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443713_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443744_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001517053593300653,
"Nucleotide GTR":0.001504121277689198,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "H", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAT", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443744_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443823_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "KN", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAW", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443823_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444084_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515905190423427,
"Nucleotide GTR":0.001502982664517836,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444084_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515290584501146,
"Nucleotide GTR":0.001502373297881628,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTC", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151609777473026,
"Nucleotide GTR":0.001503173607115339,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001517361201890781,
"Nucleotide GTR":0.001504426264030919,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "N", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "AAT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0004880257641048498,
"Nucleotide GTR":0.0004838655266315032,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "V", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "GTT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002023304178905731,
"Nucleotide GTR":0.002006056266020428,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "F", "S", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "TTT", "TCA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445096_California_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515831827153648,
"Nucleotide GTR":0.00150290992664255,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "N", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AAT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445096_California_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445178_California_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "TI", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGR", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "AYT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445178_California_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445458_Wales_20200404_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "HY", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "YAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445458_Wales_20200404_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445465_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004534066034375933,
"Nucleotide GTR":0.0004495414813866217,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGC", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445465_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000607944027073572,
"Nucleotide GTR":0.0006027615311703729,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATT", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445761_Wales_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGY", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445761_Wales_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001521765813212756,
"Nucleotide GTR":0.001508793327685486,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTT", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCY", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001514777822785036,
"Nucleotide GTR":0.001501864907267751,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "A", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "GCC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445939_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "RC", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "YGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445939_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515289983467783,
"Nucleotide GTR":0.001502372701971851,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTC", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515688450931166,
"Nucleotide GTR":0.001502767772648845,
"amino-acid": [
["M", "T", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "ACA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAC", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "HY", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "YAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "VL", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "KTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCC", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515489712917009,
"Nucleotide GTR":0.001502570728802076,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "F", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTT", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515924606489289,
"Nucleotide GTR":0.001503001915068983,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "T", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "ACT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446571_Wales_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "HY", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "YAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446571_Wales_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "S", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "TCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "MI", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATK", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446789_Wales_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAY", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446789_Wales_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00151596467165892,
"Nucleotide GTR":0.001503041638697997,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCG", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151638592997314,
"Nucleotide GTR":0.001503459305942334,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTY", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "HR", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CRT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATY", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515681285396698,
"Nucleotide GTR":0.001502760668197885,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "S", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "AGT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515925340065892,
"Nucleotide GTR":0.001503002642392119,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "V", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GTA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515476112772548,
"Nucleotide GTR":0.00150255724459377,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "T", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ACA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "ML", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "MTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447518_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTY", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447518_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447679_France_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515759566028805,
"Nucleotide GTR":0.001502838281516821,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "V", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GTT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447679_France_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515380744358557,
"Nucleotide GTR":0.001502462689159908,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "GV", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GKT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGY", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448433_England_20200429_null_9":{
"Global MG94xREV":0.00151601441757822,
"Nucleotide GTR":0.001503090960551906,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "N", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAT", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448433_England_20200429_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448539_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151758717199245,
"Nucleotide GTR":0.001504650307821818,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "K", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "AAA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448539_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448615_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "ED", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAW", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448615_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448657_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515647964520529,
"Nucleotide GTR":0.001502727631369747,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "CGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448657_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448684_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515940696997805,
"Nucleotide GTR":0.001503017868411921,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "S", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "TCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448684_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448896_England_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "C", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "TGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448896_England_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448978_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGW", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448978_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449004_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAY", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449004_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449030_England_20200419_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAY", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449030_England_20200419_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515823937814687,
"Nucleotide GTR":0.001502902104557256,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTC", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449684_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001517034805423784,
"Nucleotide GTR":0.001504102649971966,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCA", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449684_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCM", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "F", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "TTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001611596742369108,
"Nucleotide GTR":0.001597858481702019,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CT-", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003036319762674833,
"Nucleotide GTR":0.003010436270066787,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCA", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACT", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515509541284601,
"Nucleotide GTR":0.001502590388140233,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "S", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AGC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515289993279154,
"Nucleotide GTR":0.001502372711699584,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGC", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450495_GP_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001517214003216479,
"Nucleotide GTR":0.001504280320170369,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "I", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "ATT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450495_GP_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001517154597089897,
"Nucleotide GTR":0.001504221420458841,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "I", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "ATC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515823671063719,
"Nucleotide GTR":0.00150290184008024,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "F", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "TTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001515621752453471,
"Nucleotide GTR":0.001502701642750774,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "T", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ACT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003041097905696555,
"Nucleotide GTR":0.003015173681202788,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "K", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACT", "AAA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515507996505531,
"Nucleotide GTR":0.001502588856529829,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "C", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "TGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515142252015943,
"Nucleotide GTR":0.001502226229875494,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "V", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTT", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "GTG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TM", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTY", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "AYG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "LVF", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "BTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "TR", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "TM", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "HY", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ASA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "AYG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTY", "GCT", "GCA", "YAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "LF", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "YTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AV", "D", "SF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "LF", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GYA", "GAT", "TYC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "YTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "RI", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AKA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCY", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "GC", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "KGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "GC", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "KGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATY", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTY", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "DG", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "GV", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GRT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTT", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GKT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "RI", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AKA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTK", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "MV", "RW", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TWG", "RTG", "WGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "PA", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "AV", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTY", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "SCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GYT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0007743612321672046,
"Nucleotide GTR":0.0007677600917092247,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "P", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CCA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTK", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTK", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "VL", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "KTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515622400927713,
"Nucleotide GTR":0.001502702285697016,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCC", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004567017325457204,
"Nucleotide GTR":0.0004528085207490766,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "ED", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "NK", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAW", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATY", "AAS", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "SC", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TST", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGR", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTY", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAY", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "TI", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATY", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "AYT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "HY", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "MV", "RW", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "YAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TWG", "RTG", "WGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCR", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "GV", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GKG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "TI", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "AYC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCY", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "SI", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AKT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003032917611412002,
"Nucleotide GTR":0.00300706312087355,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "C", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "P", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "TGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "CCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001517410266943306,
"Nucleotide GTR":0.001504474910822185,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "I", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "ATC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "PS", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "YCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAY", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTY", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "LF", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "YTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452002_Denmark_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515627868568165,
"Nucleotide GTR":0.001502707706727874,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "TTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452002_Denmark_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515409614928128,
"Nucleotide GTR":0.00150249131361865,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "H", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CAT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452076_Denmark_20200428_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001515759566028805,
"Nucleotide GTR":0.001502838281516821,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAT", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452076_Denmark_20200428_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452115_Texas_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515492246539325,
"Nucleotide GTR":0.001502573240826207,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "S", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "TCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452115_Texas_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452145_Connecticut_20200512_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATA", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452145_Connecticut_20200512_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452182_Veneto_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAY", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452182_Veneto_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452240_Stockholm_20200424_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAG", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452240_Stockholm_20200424_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452299_Michigan_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "AS", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "KCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452299_Michigan_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452334_Beijing_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515730291591949,
"Nucleotide GTR":0.001502809256633611,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "L", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TTA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452334_Beijing_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452371_Andalusia_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "CF", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TM", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TKT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "AYG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452371_Andalusia_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452407_Andalusia_20200315_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "N", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AAT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452407_Andalusia_20200315_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452413_Andalusia_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515621752453471,
"Nucleotide GTR":0.001502701642750774,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "L", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "CTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452413_Andalusia_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452438_Andalusia_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "LF", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "YTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452438_Andalusia_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452607_Andalusia_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "LV", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACW", "STT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452607_Andalusia_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452674_Basque_Country_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "TI", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "AYA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452674_Basque_Country_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452678_Basque_Country_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001270385999704612,
"Nucleotide GTR":0.001259556433254813,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "T", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "ACT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452678_Basque_Country_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452832_Virginia_20200422_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001515370513701797,
"Nucleotide GTR":0.00150245254571568,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "F", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "TTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452832_Virginia_20200422_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452954_England_20200512_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516213319410702,
"Nucleotide GTR":0.00150328816682051,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "F", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "TTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACT", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452954_England_20200512_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453047_Scotland_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515848396661811,
"Nucleotide GTR":0.001502926354901839,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "N", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AAC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453047_Scotland_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453286_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "AS", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "KCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453286_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453466_Northern_Ireland_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTY", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453466_Northern_Ireland_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453570_England_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCM", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453570_England_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453618_England_20200505_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0004532852879483727,
"Nucleotide GTR":0.0004494212000666629,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACC", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453618_England_20200505_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454247_Portugal_20200323_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001516087293046189,
"Nucleotide GTR":0.001503163214783713,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "F", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "F", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTT", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "TTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454247_Portugal_20200323_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454281_Portugal_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515964673713376,
"Nucleotide GTR":0.001503041640734945,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTG", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454281_Portugal_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454302_Portugal_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515728701204022,
"Nucleotide GTR":0.001502807679803149,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCA", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454302_Portugal_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454312_Portugal_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008176095307646822,
"Nucleotide GTR":0.000810639714704475,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GG-", "TTC", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454312_Portugal_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454496_Sormland_20200309_null_11":{
"Global MG94xREV":0.000456570984337026,
"Nucleotide GTR":0.0004526788871200574,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "I", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "ATT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454496_Sormland_20200309_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454527_Maharashtra_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515371149497061,
"Nucleotide GTR":0.001502453176091025,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTT", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454527_Maharashtra_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454614_California_20200429_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0004531331827679506,
"Nucleotide GTR":0.0004492703915261277,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTT", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454614_California_20200429_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454626_California_20200430_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "IV", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "RTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454626_California_20200430_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454647_Virgin_Islands_20200427_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515622412603482,
"Nucleotide GTR":0.001502702297273254,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTC", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454647_Virgin_Islands_20200427_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454653_California_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAR", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454653_California_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454828_North_Carolina_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0004531219530581896,
"Nucleotide GTR":0.0004492592575454508,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "TTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454828_North_Carolina_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454897_Stockholm_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001515897290141366,
"Nucleotide GTR":0.001502974831582731,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "F", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "TTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454897_Stockholm_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454936_Hubei_20200211_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004565819773596315,
"Nucleotide GTR":0.000452689786431248,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "D", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAT", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454936_Hubei_20200211_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455105_Jonkoping_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515363446802294,
"Nucleotide GTR":0.001502445539058856,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "V", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "GTT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455105_Jonkoping_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455205_Netherlands_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515539654263589,
"Nucleotide GTR":0.001502620244417317,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGC", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455205_Netherlands_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["KTRMQPLEAGVSW", "A", "D", "S", "N", "G", "NT", "SI", "T", "V", "EG", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["NNG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AMT", "AKT", "ACC", "GTT", "GRA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTY", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[21.5, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455309_Odisha_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "NT", "SI", "T", "V", "EG", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AMT", "AKT", "ACC", "GTT", "GRA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455309_Odisha_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["-", "A", "D", "S", "N", "G", "NT", "SI", "T", "V", "EG", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["---", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AMT", "AKT", "ACC", "GTT", "GRA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "NT", "SI", "T", "V", "EG", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AMT", "AKT", "ACC", "GTT", "GRA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455395_Hubei_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006639228604587503,
"Nucleotide GTR":0.000658263165896192,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "R"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CGG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455395_Hubei_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0004565709880715349,
"Nucleotide GTR":0.0004526788908227301,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "F", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TTT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455478_Odisha_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515610210809148,
"Nucleotide GTR":0.001502690199494662,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "S", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "TCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455478_Odisha_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455574_Wisconsin_20200510_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0004657441861354018,
"Nucleotide GTR":0.0004617738907971878,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACT", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455574_Wisconsin_20200510_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455591_Nonthaburi_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515790955178566,
"Nucleotide GTR":0.001502869403085797,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAT", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455591_Nonthaburi_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455638_KZN_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515647213456937,
"Nucleotide GTR":0.00150272688670869,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "L", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455638_KZN_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455722_Comunitat_Valenciana_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACG", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455722_Comunitat_Valenciana_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455917_Bangkok_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516000306649272,
"Nucleotide GTR":0.00150307696991336,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "A", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "GCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455917_Bangkok_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456032_New_York_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001522040105593223,
"Nucleotide GTR":0.001509065281825791,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "E", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "GAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456032_New_York_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456129_Pereira_20200319_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456129_Pereira_20200319_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456255_Counties_Manukau_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCT", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456255_Counties_Manukau_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456297_Southern_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516071923453134,
"Nucleotide GTR":0.001503147976210703,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAC", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTA", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456297_Southern_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456418_Victoria_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "HY", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "YAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456418_Victoria_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456422_Victoria_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAR", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456422_Victoria_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456437_Victoria_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "SF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "TI", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TYC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "AYC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456437_Victoria_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456438_Victoria_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "IV", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "RTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456438_Victoria_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456444_Victoria_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAY", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456444_Victoria_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456473_Victoria_20200430_null_54":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCG", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456473_Victoria_20200430_null_54",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456475_Victoria_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "QHL", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "EAGV", "SC", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "DY", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CWW", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GNA", "WGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "KAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456475_Victoria_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456528_Victoria_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "ED", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "TI", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "YC", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "KE", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "GC", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAW", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "AYT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TRC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGY", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "RAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "KGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456528_Victoria_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456545_Victoria_20200509_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "NI", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AWC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456545_Victoria_20200509_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456546_Victoria_20200502_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "KQE", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "AS", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "VF", "A", "T", "S", "R", "TM", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "NAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "YAA", "TTT", "KCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTN", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "KTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "AYG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456546_Victoria_20200502_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456556_Victoria_20200508_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "VF", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "PA", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "GV", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "VF", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "SI", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "KTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "SCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GKC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "KTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AKC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456556_Victoria_20200508_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456567_Victoria_20200510_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAY", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456567_Victoria_20200510_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456568_Victoria_20200510_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACW", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456568_Victoria_20200510_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456569_Victoria_20200510_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "IF", "L", "RC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "AV", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAY", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "WTC", "CTT", "YGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GYT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456569_Victoria_20200510_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456571_Victoria_20200510_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAY", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456571_Victoria_20200510_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456582_Victoria_20200517_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "WC", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGK", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456582_Victoria_20200517_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456583_Victoria_20200517_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "KE", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "RC", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "RAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "YGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456583_Victoria_20200517_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456609_Timor_Leste_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "PA", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "SCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456609_Timor_Leste_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456623_Victoria_20200101_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001515358121083254,
"Nucleotide GTR":0.001502440258739583,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "I", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "ATT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456623_Victoria_20200101_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456627_Victoria_20200523_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "RC", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "YGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456627_Victoria_20200523_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456655_Victoria_20200526_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001515365303139107,
"Nucleotide GTR":0.001502447379571091,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAG", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456655_Victoria_20200526_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456688_England_20200518_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "F", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "TTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456688_England_20200518_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456807_Scotland_20200506_null_49":{
"Global MG94xREV":0.0007719953654580729,
"Nucleotide GTR":0.0007654143931306798,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATT", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456807_Scotland_20200506_null_49",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456989_Scotland_20200520_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGC", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456989_Scotland_20200520_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456995_Scotland_20200521_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "H", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "CAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456995_Scotland_20200521_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457288_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515575878579339,
"Nucleotide GTR":0.001502656159934297,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "S", "G", "I", "A", "I", "A", "I", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "AGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATT", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457288_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457312_England_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515142252015943,
"Nucleotide GTR":0.001502226229875494,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "V", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "GTC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457312_England_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457384_England_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "WL", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TKG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTN", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457384_England_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457474_England_20200508_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001515508905037392,
"Nucleotide GTR":0.001502589757316796,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "R", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CGG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457474_England_20200508_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457519_England_20200507_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "AV", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GYA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457519_England_20200507_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457554_England_20200511_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACY", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457554_England_20200511_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457704_Muscat_20200224_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515822985501393,
"Nucleotide GTR":0.001502901160362077,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCT", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457704_Muscat_20200224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457836_Kenya_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00151547609525735,
"Nucleotide GTR":0.001502557227227883,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "T", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ACA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457836_Kenya_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458042_Tamil_Nadu_20200506_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006068403957193432,
"Nucleotide GTR":0.0006016673078614859,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAT", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458042_Tamil_Nadu_20200506_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458145_Amapa_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001514986364994335,
"Nucleotide GTR":0.001502071671732557,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACC", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458145_Amapa_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005089868270718761,
"Nucleotide GTR":0.0005046479043608825,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "F", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "TTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458165_Dour_20200328_null_18":{
"Global MG94xREV":0.0004848068846194484,
"Nucleotide GTR":0.000480674086892202,
"amino-acid": [
["M", "A", "Y", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "TAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458165_Dour_20200328_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458267_California_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGG", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458267_California_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458280_California_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151529059182036,
"Nucleotide GTR":0.001502373305138449,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGC", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458280_California_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458314_England_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "AV", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTK", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GYT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458314_England_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458364_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "DY", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "KAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458364_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458476_England_20200429_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAY", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458476_England_20200429_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458498_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "DY", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "KAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458498_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458506_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "EG", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GRA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458506_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458741_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "AS", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "KCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458741_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458747_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "QE", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "HR", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "SAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CRT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458747_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458756_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515284890057238,
"Nucleotide GTR":0.001502367651980729,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "H", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAT", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458756_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458970_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACY", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458970_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459024_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "CW", "VF", "V", "QHPRL", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGN", "KTT", "GTR", "CNN", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 13, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459024_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459045_England_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516104709371525,
"Nucleotide GTR":0.001503180482641376,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "T", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "ACA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459045_England_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459072_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "CW", "VF", "V", "QHPRL", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGN", "KTT", "GTG", "CNN", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 13, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459072_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 11, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459173_England_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "QE", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "RW", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "SAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "YGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459173_England_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459208_England_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "KE", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "RAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459208_England_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459241_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "TI", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "AYT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459241_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459311_England_20200502_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "MI", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATK", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459311_England_20200502_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459493_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516094150511744,
"Nucleotide GTR":0.001503170013791934,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "K", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AAG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459493_England_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459573_Scotland_20200325_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001515637398997941,
"Nucleotide GTR":0.001502717155914293,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "F", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459573_Scotland_20200325_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459620_Scotland_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0004174826963661978,
"Nucleotide GTR":0.000413923812213673,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTC", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459620_Scotland_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459878_Ontario_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.02463835820869991,
"Nucleotide GTR":0.02442832540174433,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "-", "V", "Q", "A", "K", "Q", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "Y", "C", "H", "C", "Y", "W", "N", "G", "L", "C", "L", "I", "F", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "---", "GTA", "CAA", "GCA", "AAG", "CAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TAT", "TGT", "CAC", "TGC", "TAC", "TGG", "AAT", "GGT", "CTG", "TGT", "TTA", "ATT", "TTC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459878_Ontario_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460056_Minnesota_20200323_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001515006250498856,
"Nucleotide GTR":0.001502091387720574,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "T", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ACT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460056_Minnesota_20200323_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460224_Massachusetts_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515801567934081,
"Nucleotide GTR":0.001502879925371533,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "L", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CTC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460224_Massachusetts_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460272_Massachusetts_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516058870317691,
"Nucleotide GTR":0.001503135034348366,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "S", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "AGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460272_Massachusetts_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460383_Massachusetts_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "S", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "TCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460383_Massachusetts_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460452_Massachusetts_20200319_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001516090320179257,
"Nucleotide GTR":0.001503166216111604,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTG", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460452_Massachusetts_20200319_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460556_Michigan_20200506_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "DY", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "KAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460556_Michigan_20200506_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460634_Washington_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "P", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "CCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460634_Washington_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460791_Noord_Holland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515693558809643,
"Nucleotide GTR":0.001502772836984564,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "S", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "TCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460791_Noord_Holland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460813_Overijssel_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515380719547171,
"Nucleotide GTR":0.001502462664560031,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "E", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "GAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460813_Overijssel_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460852_Friesland_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515508900672602,
"Nucleotide GTR":0.001502589752989215,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTG", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460852_Friesland_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460855_Friesland_20200501_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001516188724653039,
"Nucleotide GTR":0.001503263781723976,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "V", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GTT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460855_Friesland_20200501_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461087_Netherlands_20200508_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001515934955076816,
"Nucleotide GTR":0.001503012175438663,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAT", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461087_Netherlands_20200508_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461148_Noord_Brabant_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006086449190956313,
"Nucleotide GTR":0.0006034564483495664,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCT", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461148_Noord_Brabant_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461174_Noord_Brabant_20200101_null_19":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "F", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTT", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461174_Noord_Brabant_20200101_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461204_Noord_Holland_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516128754008403,
"Nucleotide GTR":0.0015032043223067,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "S", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "AGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461204_Noord_Holland_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461237_Utrecht_20200428_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCA", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461237_Utrecht_20200428_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461240_Utrecht_20200430_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00151636615329611,
"Nucleotide GTR":0.001503439697854094,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTC", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461240_Utrecht_20200430_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461267_Zeeland_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515892951780068,
"Nucleotide GTR":0.001502970530204344,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "D", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "GAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461267_Zeeland_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461309_Zuid_Holland_20200507_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "F", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TTT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461309_Zuid_Holland_20200507_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461329_Zuid_Holland_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515735018444873,
"Nucleotide GTR":0.001502813943191881,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAT", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461329_Zuid_Holland_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461485_Gujarat_20200527_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516026943396676,
"Nucleotide GTR":0.001503103379592437,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "F", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "TTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461485_Gujarat_20200527_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461567_England_20200525_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001515374792836812,
"Nucleotide GTR":0.001502456788372665,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "CTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTG", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461567_England_20200525_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461587_England_20200530_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515105451234533,
"Nucleotide GTR":0.001502189742807009,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "S", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TCT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461587_England_20200530_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461687_Scotland_20200425_null_41":{
"Global MG94xREV":0.0007616474815359977,
"Nucleotide GTR":0.0007551547210564801,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "C", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGT", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461687_Scotland_20200425_null_41",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461722_Scotland_20200506_null_22":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "T", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ACT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461722_Scotland_20200506_null_22",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461787_Northern_Ireland_20200329_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001515940389977259,
"Nucleotide GTR":0.001503017564008613,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTA", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461787_Northern_Ireland_20200329_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461894_England_20200515_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515509541614098,
"Nucleotide GTR":0.001502590388466922,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "G", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "GGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461894_England_20200515_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462228_Vlamertinge_20200402_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTT", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462228_Vlamertinge_20200402_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462239_Lovendegem_20200330_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "TCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462239_Lovendegem_20200330_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAY", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462317_Singapore_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "HR", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CRT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462317_Singapore_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462341_Singapore_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "IL", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "MTT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462341_Singapore_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462374_Singapore_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAY", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462374_Singapore_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462436_Uzice_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515511680811468,
"Nucleotide GTR":0.001502592509428434,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTT", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462436_Uzice_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462461_Maglaj_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515428977753497,
"Nucleotide GTR":0.001502510511383162,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGA", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462461_Maglaj_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462679_Michigan_20200429_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAR", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462679_Michigan_20200429_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462715_Michigan_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515371143472082,
"Nucleotide GTR":0.001502453170117407,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "L", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CTA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462715_Michigan_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462716_Michigan_20200417_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTY", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462716_Michigan_20200417_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462736_Michigan_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAY", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462736_Michigan_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462888_Minnesota_20200511_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515920799752253,
"Nucleotide GTR":0.00150299814078296,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "I", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAT", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ATA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462888_Minnesota_20200511_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462973_Wyoming_20200329_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "S", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "TCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462973_Wyoming_20200329_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462984_Wyoming_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00458592525835694,
"Nucleotide GTR":0.004546831957320303,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "K", "L", "-", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "AAA", "TTA", "---", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462984_Wyoming_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462990_elinac_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001518218004609835,
"Nucleotide GTR":0.001505275762826609,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "T", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "ACA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462990_elinac_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462991_USA_20200511_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515551087375145,
"Nucleotide GTR":0.001502631580065865,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "TCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462991_USA_20200511_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515103593278573,
"Nucleotide GTR":0.001502187900689429,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "CTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463010_Odisha_20200507_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0004534065989653037,
"Nucleotide GTR":0.0004495414769524564,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAC", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463010_Odisha_20200507_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463017_Odisha_20200509_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515476109445138,
"Nucleotide GTR":0.001502557241294725,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "T", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ACG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463017_Odisha_20200509_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463021_Odisha_20200509_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515289862203607,
"Nucleotide GTR":0.001502372581741407,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCC", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463021_Odisha_20200509_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000775246511017117,
"Nucleotide GTR":0.0007686378238873901,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "G", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GGA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463139_Connecticut_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001515627089271093,
"Nucleotide GTR":0.001502706934074017,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "F", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "TTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463139_Connecticut_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463172_Connecticut_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001517338860907329,
"Nucleotide GTR":0.001504404113496011,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "D", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GAT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463172_Connecticut_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463377_Washington_20200417_null_31":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATT", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463377_Washington_20200417_null_31",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463437_Washington_20200426_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001515958775349654,
"Nucleotide GTR":0.001503035792652571,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "F", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TTT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463437_Washington_20200426_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463684_Washington_20200505_null_18":{
"Global MG94xREV":0.0006069464979647019,
"Nucleotide GTR":0.0006017725056248087,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "R", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AGG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463684_Washington_20200505_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003040157098504348,
"Nucleotide GTR":0.003014240894040718,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "E", "H", "H", "Q", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GAA", "CAC", "CAT", "CAA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463969_Quebec_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515644000182728,
"Nucleotide GTR":0.001502723700826445,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "S", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "AGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463969_Quebec_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464065_Houthalen_Helchteren_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515823004940339,
"Nucleotide GTR":0.001502901179635316,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCT", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464065_Houthalen_Helchteren_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003032505908503949,
"Nucleotide GTR":0.003006654927579107,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTT", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAC", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464271_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "SF", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TYT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464271_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464336_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "GV", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "WAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GKG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464336_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464350_England_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "NS", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "ART", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464350_England_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464453_England_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "HR", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTT", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CRT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464453_England_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464508_England_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "YTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464508_England_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464541_England_20200304_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "F", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "TTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464541_England_20200304_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464561_England_20200304_null_19":{
"Global MG94xREV":0.0004529894823629076,
"Nucleotide GTR":0.0004491279161133989,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "C", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "TGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464561_England_20200304_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464610_England_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "TS", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "ILVF", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "WCG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACN", "NTY", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464610_England_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464625_England_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACY", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464625_England_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464633_England_20200308_null_26":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTT", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464633_England_20200308_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464634_England_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "HY", "Y", "KQE", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "YAT", "TAC", "NAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464634_England_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464759_England_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "GV", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "GC", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAY", "GKC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "KGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464759_England_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464932_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003033446050704592,
"Nucleotide GTR":0.003007587055418425,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "CTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "CTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464932_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465108_England_20200314_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTT", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465108_England_20200314_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465163_Narayanganj_20200507_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTT", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465163_Narayanganj_20200507_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465165_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "MI", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATK", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465165_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465213_England_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "AV", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GYT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465213_England_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465222_England_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "LF", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "YTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465222_England_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465251_England_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "TI", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "AYT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465251_England_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465252_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "LF", "R", "L", "ILVF", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "YTC", "AGA", "CTG", "NTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465252_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465258_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "SR", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "MGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465258_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465261_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "WL", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "AV", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TKG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GYT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465261_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465270_England_20200419_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "I", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465270_England_20200419_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465271_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151609479796784,
"Nucleotide GTR":0.001503170655728708,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "I", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "R", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CGT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465271_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465303_England_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "PS", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "YCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465303_England_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465333_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515660601807166,
"Nucleotide GTR":0.001502740160928231,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "M", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "ATG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465333_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465352_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCY", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465352_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465392_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "RS", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGK", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465392_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465408_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAC", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465408_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465429_England_20200423_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AS", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "KCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465429_England_20200423_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465465_England_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["-", "EAGV", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["---", "GNA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAY", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465465_England_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465516_England_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "NS", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "ART", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465516_England_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465529_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "DV", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GWC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465529_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465540_England_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004742802618515002,
"Nucleotide GTR":0.0004702371996540717,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465540_England_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465545_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCW", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465545_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465551_England_20200502_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "N", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "HD", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "SAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465551_England_20200502_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465558_England_20200502_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "N", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAT", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465558_England_20200502_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465573_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "AV", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GYA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465573_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465574_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "RI", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AKA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465574_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465578_England_20200502_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "TI", "GC", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "AYC", "KGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465578_England_20200502_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465604_England_20200504_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTK", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465604_England_20200504_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465632_England_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "HPRL", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "ILVF", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CNC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "NTY", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465632_England_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465643_England_20200506_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "NY", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "WAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465643_England_20200506_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465675_England_20200518_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "TI", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "CW", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "AYC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGN", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465675_England_20200518_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465712_England_20200430_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001518343602543801,
"Nucleotide GTR":0.00150540029008507,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "S", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "AGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465712_England_20200430_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465716_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["RM", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AKG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465716_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465719_England_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001517184389775651,
"Nucleotide GTR":0.00150425095917307,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "N", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "AAC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465719_England_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465833_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515080119029796,
"Nucleotide GTR":0.001502164626549862,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTC", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465833_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465840_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "HPRL", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "KN", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CNT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAK", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465840_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465850_England_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001515745348986144,
"Nucleotide GTR":0.001502824185669141,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465850_England_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465851_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "-", "ILV", "NI", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "---", "NTA", "AWT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465851_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465882_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "YTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465882_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465894_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "RC", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "EAGV", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "YGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GNG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465894_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465905_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGM", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465905_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465917_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "YTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465917_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465918_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "AV", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACY", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GYT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465918_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465958_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCY", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465958_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465968_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATY", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465968_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465974_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004475885731064624,
"Nucleotide GTR":0.0004437730475923642,
"amino-acid": [
["K", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AAG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465974_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466007_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516098627405041,
"Nucleotide GTR":0.001503174452521388,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "I", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "ATA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466007_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466013_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "VL", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "KTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466013_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466031_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "LV", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "IM", "DAGV", "L", "L", "V", "QHPRL"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "STT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATN", "GNT", "TTG", "CTT", "GTA", "CNN"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 13]
],
"original name":"epi_isl_466031_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 11]
]
},
"epi_isl_466037_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005120592555699396,
"Nucleotide GTR":0.0005076941415528474,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "I", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "TR", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "ATA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ASA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466037_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466123_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "LF", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "YTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466123_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466197_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "VF", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "KTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466197_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466202_England_20200402_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCY", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466202_England_20200402_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466240_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "AV", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GYT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466240_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466242_England_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "SF", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TYC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466242_England_20200403_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466283_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "GV", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GKA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466283_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466285_England_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AG", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GSA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466285_England_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466287_England_20200407_null_26":{
"Global MG94xREV":0.0009349937785910713,
"Nucleotide GTR":0.0009270233056342286,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTT", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466287_England_20200407_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466288_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "AG", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GSC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466288_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466304_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "KAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466304_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466337_England_20200407_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGY", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466337_England_20200407_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466352_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "RS", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGK", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466352_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466358_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "AV", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GYC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466358_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466368_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "GC", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "KGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466368_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466373_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "AS", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "KCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466373_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466384_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACY", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466384_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466387_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "NHDY", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCN", "NAY", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466387_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466399_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAY", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466399_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466400_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["KM", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["AWG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466400_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466411_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "ILVF", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "SI", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "NTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATY", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AKT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466411_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466416_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "RC", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "AV", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATT", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "YGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GYT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466416_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466428_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "PS", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "YCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466428_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466477_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001520750661351805,
"Nucleotide GTR":0.001507786829615223,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "Q", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "TPAS", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "CAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTN", "NCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466477_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466515_England_20200414_null_37":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TM", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "AYG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466515_England_20200414_null_37",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466542_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "PL", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CYG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466542_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466544_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AS", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "IL", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "KCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "WTA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466544_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466561_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "RL", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CKG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466561_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466567_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "LF", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "YTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466567_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466607_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "AS", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "KCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466607_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466609_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "NTSIHPRLDAGVYCF", "Y", "K", "L", "AG", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTK", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCN", "NNT", "TAC", "AAA", "TTG", "GSA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 24, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466609_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466672_Nebraska_20200504_null_25":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTT", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466672_Nebraska_20200504_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466816_British_Columbia_20200401_null_21":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "I", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATT", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466816_British_Columbia_20200401_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466848_Telangana_20200513_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0015151417807886,
"Nucleotide GTR":0.001502225762665189,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "L", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "CTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466848_Telangana_20200513_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466882_Bavaria_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516206815291293,
"Nucleotide GTR":0.001503281718146291,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "V", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GTT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466882_Bavaria_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466925_Bavaria_20200526_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001516073836355814,
"Nucleotide GTR":0.001503149872806599,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACA", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466925_Bavaria_20200526_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466927_Basel_Stadt_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "KN", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAY", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAY", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAM", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466927_Basel_Stadt_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466932_Graub_nden_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAY", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466932_Graub_nden_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466940_Basel_Stadt_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "RS", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "ND", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGK", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "RAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466940_Basel_Stadt_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466946_Basel_Stadt_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGY", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466946_Basel_Stadt_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466954_Basel_Stadt_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "KR", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "ARG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466954_Basel_Stadt_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466961_Vaud_20200311_null_51":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "DG", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GRT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466961_Vaud_20200311_null_51",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466978_Vaud_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "IF", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGR", "WTT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466978_Vaud_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467008_Vaud_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "KN", "D", "L", "P", "KE", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAK", "GAC", "CTG", "CCT", "RAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467008_Vaud_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467063_Andalusia_20200401_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAT", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467063_Andalusia_20200401_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467156_Basque_Country_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "AS", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "KCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467156_Basque_Country_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467231_Madrid_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001515470279929285,
"Nucleotide GTR":0.001502551461473318,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "C", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "TGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467231_Madrid_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467262_Galicia_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515381376497015,
"Nucleotide GTR":0.001502463315909625,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTG", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467262_Galicia_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467299_Morocco_20200521_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003987467389200003,
"Nucleotide GTR":0.0003953475718111232,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "F", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "TTT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467299_Morocco_20200521_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467421_New_York_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATT", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467421_New_York_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467613_New_Mexico_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAA", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467613_New_Mexico_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467652_New_Mexico_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001515659768884205,
"Nucleotide GTR":0.001502739335105626,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "S", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "TCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467652_New_Mexico_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.01851951784999853,
"Nucleotide GTR":0.01836164587311796,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "Q", "W", "R", "A", "R", "D", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CAG", "TGG", "AGG", "GCT", "AGA", "GAT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2.333333333333333, 1, 1.5, 1.5, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.6666666666666666, 0, 0.5, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467843_California_20200315_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0004531222212502621,
"Nucleotide GTR":0.0004492595234512856,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "Y", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "TAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467843_California_20200315_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467846_Georgia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515671170209383,
"Nucleotide GTR":0.001502750639238766,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467846_Georgia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467961_California_20200319_null_8":{
"Global MG94xREV":0.000453109151775659,
"Nucleotide GTR":0.0004492465653890754,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAT", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467961_California_20200319_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468021_South_Australia_20200325_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0007707749628832563,
"Nucleotide GTR":0.0007642043940322715,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTT", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468021_South_Australia_20200325_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "AV", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GYA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468083_Washington_20200417_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "TTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468083_Washington_20200417_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468114_Oregon_20200506_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005849346342193202,
"Nucleotide GTR":0.0005799482848014756,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCT", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468114_Oregon_20200506_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468206_Geneva_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGR", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468206_Geneva_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468228_Basel_Landschaft_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00151581935116083,
"Nucleotide GTR":0.001502897557002913,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCT", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468228_Basel_Landschaft_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468236_Bern_20200420_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "S", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "TCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468236_Bern_20200420_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468238_Bern_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TRG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468238_Bern_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468239_Bern_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "PL", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CYT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468239_Bern_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468249_Uri_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "KE", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "RAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468249_Uri_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468251_Basel_Landschaft_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "KR", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "ARA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468251_Basel_Landschaft_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468253_Vaud_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "TI", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "WC", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "AYC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGK", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAY", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468253_Vaud_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468257_Bern_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515429911518363,
"Nucleotide GTR":0.001502511437188029,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "I", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "ATT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468257_Bern_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468269_Luzern_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "TI", "L", "A", "CF", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "DY", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGY", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "AYT", "TTA", "GCT", "TKT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "KAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468269_Luzern_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468272_Graubunden_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "RL", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACY", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "KGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CKC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468272_Graubunden_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468274_Basel_Landschaft_20200428_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTY", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468274_Basel_Landschaft_20200428_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468277_Ticino_20200428_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "CF", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TKT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468277_Ticino_20200428_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468283_Basel_Landschaft_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TM", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAY", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "AYG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468283_Basel_Landschaft_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468286_Bern_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "EG", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GRA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468286_Bern_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468288_Basel_Landschaft_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "TS", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "ASC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468288_Basel_Landschaft_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468289_Vaud_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "PS", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "YCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468289_Vaud_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468290_Basel_Landschaft_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "KR", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "LF", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "TM", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "ARG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTM", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "AYG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468290_Basel_Landschaft_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468294_Bern_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "DY", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTY", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "KAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468294_Bern_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468302_Zurich_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "IL", "Q", "F", "A", "Y", "PA", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "IL", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "LF", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "MTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "SCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "MTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "YTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGM", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468302_Zurich_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468304_Zurich_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "RS", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "KE", "T", "N", "I", "LF", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "YF", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGK", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "RAA", "ACT", "AAC", "ATT", "YTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TWC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468304_Zurich_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468348_California_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "YTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468348_California_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468353_California_20200516_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACT", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468353_California_20200516_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468365_California_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTK", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468365_California_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468371_California_20200412_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTY", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468371_California_20200412_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468380_California_20200419_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACT", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468380_California_20200419_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468417_California_20200411_null_19":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "H", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CAT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468417_California_20200411_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468436_California_20200506_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151519145935062,
"Nucleotide GTR":0.001502275017736012,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAG", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468436_California_20200506_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468460_California_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAR", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468460_California_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468480_California_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "LF", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "YTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468480_California_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468513_California_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "QH", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAW", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468513_California_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468528_California_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "SI", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AKT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468528_California_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468548_California_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGR", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468548_California_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468601_California_20200422_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAY", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468601_California_20200422_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468655_California_20200513_null_19":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTT", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468655_California_20200513_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468691_British_Columbia_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515622418807399,
"Nucleotide GTR":0.001502702303424288,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTC", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468691_British_Columbia_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468777_Aragon_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATY", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468777_Aragon_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468949_Basque_Country_20200410_null_29":{
"Global MG94xREV":0.001515889009048746,
"Nucleotide GTR":0.001502966621083337,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "L", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TTG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468949_Basque_Country_20200410_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469024_Gujarat_20200527_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515823601877253,
"Nucleotide GTR":0.001502901771483564,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "V", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GTT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469024_Gujarat_20200527_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469034_Gujarat_20200605_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTT", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469034_Gujarat_20200605_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469071_Vastra_Gotaland_20200527_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004531302286572628,
"Nucleotide GTR":0.0004492674625981314,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGT", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469071_Vastra_Gotaland_20200527_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469072_Uppsala_20200603_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001515418267656309,
"Nucleotide GTR":0.001502499892585554,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTC", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469072_Uppsala_20200603_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469111_Singapore_20200408_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001516323420013872,
"Nucleotide GTR":0.001503397328857138,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "S", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "TCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTT", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469111_Singapore_20200408_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469113_Singapore_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "VL", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "KTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469113_Singapore_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469138_Singapore_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515622388261599,
"Nucleotide GTR":0.001502702273138877,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "A", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GCT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469138_Singapore_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469213_British_Columbia_20200401_null_34":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "V", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469213_British_Columbia_20200401_null_34",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469244_Jeddah_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515741525295357,
"Nucleotide GTR":0.001502820394573892,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "F", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TTC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469244_Jeddah_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469289_Kanto_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001516884024257182,
"Nucleotide GTR":0.001503953154158529,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "Q", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAA", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469289_Kanto_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469408_England_20200515_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "V", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GTT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469408_England_20200515_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469441_England_20200511_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0005087804364913691,
"Nucleotide GTR":0.0005044432731830358,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "I", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ATT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469441_England_20200511_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469499_England_20200503_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACT", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469499_England_20200503_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469549_England_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004534066295833783,
"Nucleotide GTR":0.0004495415073095235,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAC", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469549_England_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469575_England_20200416_null_45":{
"Global MG94xREV":0.0005090642804281624,
"Nucleotide GTR":0.000504724697456218,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTT", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469575_England_20200416_null_45",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469595_England_20200422_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001517115245017309,
"Nucleotide GTR":0.001504182403847983,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "M", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "ATG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469595_England_20200422_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469615_England_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "VF", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "KTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469615_England_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469640_England_20200422_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001515341660113309,
"Nucleotide GTR":0.001502423938093262,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCT", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469640_England_20200422_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469679_England_20200422_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001515759566028805,
"Nucleotide GTR":0.001502838281516821,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAT", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469679_England_20200422_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469796_England_20200417_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "Y", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "TAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469796_England_20200417_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469821_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGY", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469821_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469863_Northern_Ireland_20200429_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "Y", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "TAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469863_Northern_Ireland_20200429_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469918_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "K", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "AAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469918_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469924_England_20200411_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "TTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469924_England_20200411_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469977_Scotland_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "CF", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TKT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469977_Scotland_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470000_Scotland_20200330_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAY", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470000_Scotland_20200330_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470074_Northern_Ireland_20200413_null_26":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAT", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470074_Northern_Ireland_20200413_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470088_Northern_Ireland_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "VL", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "KTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470088_Northern_Ireland_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470119_England_20200417_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001517085706702295,
"Nucleotide GTR":0.001504153117336081,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "F", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TTT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470119_England_20200417_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470125_England_20200417_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470125_England_20200417_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470126_England_20200417_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "L", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "CTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470126_England_20200417_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470158_England_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001515354283013785,
"Nucleotide GTR":0.001502436453388222,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCG", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470158_England_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470183_England_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAY", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470183_England_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470184_England_20200421_null_75":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTA", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470184_England_20200421_null_75",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470196_England_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001515891628562262,
"Nucleotide GTR":0.001502969218266475,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCG", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470196_England_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470216_England_20200420_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001515726858001036,
"Nucleotide GTR":0.001502805852312781,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "F", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "TTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470216_England_20200420_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470238_England_20200417_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001515622400927713,
"Nucleotide GTR":0.001502702285697016,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAC", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470238_England_20200417_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470298_England_20200419_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001515585878332514,
"Nucleotide GTR":0.001502666074443308,
"amino-acid": [
["M", "V", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GTA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470298_England_20200419_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470308_England_20200419_null_13":{
"Global MG94xREV":0.0006090720200990998,
"Nucleotide GTR":0.0006038799084764057,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCT", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470308_England_20200419_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470345_England_20200419_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAY", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470345_England_20200419_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470371_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "HL", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CWT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470371_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470385_England_20200405_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0006818405545061175,
"Nucleotide GTR":0.0006760281182899537,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "I", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ATA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470385_England_20200405_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470421_England_20200410_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTT", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470421_England_20200410_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470430_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00151683128004914,
"Nucleotide GTR":0.001503900859575172,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "I", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "ATT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470430_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470457_England_20200410_null_31":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGT", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470457_England_20200410_null_31",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470520_England_20200404_null_399":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAT", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470520_England_20200404_null_399",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470530_England_20200406_null_159":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTT", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470530_England_20200406_null_159",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470531_England_20200405_null_38":{
"Global MG94xREV":0.0004881873047730661,
"Nucleotide GTR":0.0004840256902258212,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAT", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470531_England_20200405_null_38",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470572_Amazonas_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005096607540433501,
"Nucleotide GTR":0.0005053160863564822,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "C", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "TGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470572_Amazonas_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470573_Ceara_20200402_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0004523819062168397,
"Nucleotide GTR":0.0004485255193271848,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAG", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470573_Ceara_20200402_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470594_Minas_Gerais_20200408_null_36":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAT", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470594_Minas_Gerais_20200408_null_36",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470599_Mato_Grosso_20200319_null_19":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTC", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470599_Mato_Grosso_20200319_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470640_Rio_de_Janeiro_20200420_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTC", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470640_Rio_de_Janeiro_20200420_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470689_Utah_20200413_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001515758892942006,
"Nucleotide GTR":0.001502837614167835,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTT", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470689_Utah_20200413_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470842_Western_Australia_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.6826676063614805,
"Nucleotide GTR":0.6768481198369635,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "P", "C", "D", "F", "N", "S", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CCA", "TGT", "GAT", "TTT", "AAT", "AGC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470842_Western_Australia_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_470843_Western_Australia_20200401_null_729":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "M", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ATG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_470843_Western_Australia_20200401_null_729",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471151_Wisconsin_20200612_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001516569792630839,
"Nucleotide GTR":0.001503641601239508,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "M", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATG", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471151_Wisconsin_20200612_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471241_Wisconsin_20200404_null_37":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "TTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471241_Wisconsin_20200404_null_37",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471258_Wisconsin_20200326_null_305":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCC", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471258_Wisconsin_20200326_null_305",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471266_Wisconsin_20200331_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001515621750381859,
"Nucleotide GTR":0.001502701640696824,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATC", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471266_Wisconsin_20200331_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471268_Los_Rios_20200417_null_33":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "F", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "TTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471268_Los_Rios_20200417_null_33",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471402_Kinshasa_20200426_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00151538068760015,
"Nucleotide GTR":0.001502462632885349,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "V", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "GTC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471402_Kinshasa_20200426_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471405_Kinshasa_20200427_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0004531062188977582,
"Nucleotide GTR":0.0004492436575128632,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAT", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471405_Kinshasa_20200427_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471409_Kinshasa_20200427_null_390":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "G", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GGT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471409_Kinshasa_20200427_null_390",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_471415_Kinshasa_20200428_null_43833":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "A", "D", "S", "N", "G", "T", "I", "T", "V", "E", "E", "L", "K", "K", "L", "L", "E", "Q", "W", "N", "L", "V", "I", "G", "F", "L", "F", "L", "T", "W", "I", "C", "L", "L", "Q", "F", "A", "Y", "A", "N", "R", "N", "R", "F", "L", "Y", "I", "I", "K", "L", "I", "F", "L", "W", "L", "L", "W", "P", "V", "T", "L", "A", "C", "F", "V", "L", "A", "A", "V", "Y", "R", "I", "N", "W", "I", "T", "G", "G", "I", "A", "I", "A", "M", "A", "C", "L", "V", "G", "L", "M", "W", "L", "S", "Y", "F", "I", "A", "S", "F", "R", "L", "F", "A", "R", "T", "R", "S", "M", "W", "S", "F", "N", "P", "E", "T", "N", "I", "L", "L", "N", "V", "P", "L", "H", "G", "T", "I", "L", "T", "R", "P", "L", "L", "E", "S", "E", "L", "V", "I", "G", "A", "V", "I", "L", "R", "G", "H", "L", "R", "I", "A", "G", "H", "H", "L", "G", "R", "C", "D", "I", "K", "D", "L", "P", "K", "E", "I", "T", "V", "A", "T", "S", "R", "T", "L", "S", "Y", "Y", "K", "L", "G", "A", "S", "Q", "R", "V", "A", "G", "D", "S", "G", "F", "A", "A", "Y", "S", "R", "-", "Y", "R", "I", "G", "-", "-", "-", "-", "N", "Y", "K", "L", "N", "T", "D", "H", "S", "S", "S", "S", "D", "N", "I", "A", "L", "L", "V", "Q"]
],
"codon": [
["ATG", "GCA", "GAT", "TCC", "AAC", "GGT", "ACT", "ATT", "ACC", "GTT", "GAA", "GAG", "CTT", "AAA", "AAG", "CTC", "CTT", "GAA", "CAA", "TGG", "AAC", "CTA", "GTA", "ATA", "GGT", "TTC", "CTA", "TTC", "CTT", "ACA", "TGG", "ATT", "TGT", "CTT", "CTA", "CAA", "TTT", "GCC", "TAT", "GCC", "AAC", "AGG", "AAT", "AGG", "TTT", "TTG", "TAT", "ATA", "ATT", "AAG", "TTA", "ATT", "TTC", "CTC", "TGG", "CTG", "TTA", "TGG", "CCA", "GTA", "ACT", "TTA", "GCT", "TGT", "TTT", "GTG", "CTT", "GCT", "GCT", "GTT", "TAC", "AGA", "ATA", "AAT", "TGG", "ATC", "ACC", "GGT", "GGA", "ATT", "GCT", "ATC", "GCA", "ATG", "GCT", "TGT", "CTT", "GTA", "GGC", "TTG", "ATG", "TGG", "CTC", "AGC", "TAC", "TTC", "ATT", "GCT", "TCT", "TTC", "AGA", "CTG", "TTT", "GCG", "CGT", "ACG", "CGT", "TCC", "ATG", "TGG", "TCA", "TTC", "AAT", "CCA", "GAA", "ACT", "AAC", "ATT", "CTT", "CTC", "AAC", "GTG", "CCA", "CTC", "CAT", "GGC", "ACT", "ATT", "CTG", "ACC", "AGA", "CCG", "CTT", "CTA", "GAA", "AGT", "GAA", "CTC", "GTA", "ATC", "GGA", "GCT", "GTG", "ATC", "CTT", "CGT", "GGA", "CAT", "CTT", "CGT", "ATT", "GCT", "GGA", "CAC", "CAT", "CTA", "GGA", "CGC", "TGT", "GAC", "ATC", "AAG", "GAC", "CTG", "CCT", "AAA", "GAA", "ATC", "ACT", "GTT", "GCT", "ACA", "TCA", "CGA", "ACG", "CTT", "TCT", "TAT", "TAC", "AAA", "TTG", "GGA", "GCT", "TCG", "CAG", "CGT", "GTA", "GCA", "GGT", "GAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GCT", "GCA", "TAC", "AGT", "CGC", "---", "TAC", "AGG", "ATT", "GGC", "---", "---", "---", "---", "AAC", "TAT", "AAA", "TTA", "AAC", "ACA", "GAC", "CAT", "TCC", "AGT", "AGC", "AGT", "GAC", "AAT", "ATT", "GCT", "TTG", "CTT", "GTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_471415_Kinshasa_20200428_null_43833",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":10278.92939815877,
"Equilibrium frequencies": [
[0.01846399133185421],
[0.01579851335352366],
[0.01183790099486263],
[0.02547097856108009],
[0.01549537388422439],
[0.01325844812358763],
[0.009934618069461986],
[0.0213757864649823],
[0.01621851550038597],
[0.01387719638197246],
[0.01039824907445586],
[0.02237335650662869],
[0.02769539049275556],
[0.02369725963724827],
[0.01775646905237015],
[0.03820564496608636],
[0.01349196465629333],
[0.01154425280843727],
[0.008650163388662455],
[0.01861209401211232],
[0.01132274344287245],
[0.009688182271410271],
[0.007259400931136252],
[0.01561966480066866],
[0.0118511557970266],
[0.01014031255479428],
[0.0075981842971221],
[0.01634860685345495],
[0.02023751110767964],
[0.01731600625944686],
[0.01297496562738507],
[0.0279175397284788],
[0.01594670121845962],
[0.01364462144811819],
[0.01022397957331704],
[0.02199839013976319],
[0.01338281052882372],
[0.01145085626651809],
[0.008580180916782901],
[0.01846151646955059],
[0.01400736256008839],
[0.01198524741892741],
[0.008980602742127692],
[0.01932308269933845],
[0.02391953664723629],
[0.02046649136362608],
[0.01533563906003719],
[0.03299687452092959],
[0.01341815441492479],
[0.02163327116823831],
[0.0131606889105893],
[0.01126080031985348],
[0.008437771094430925],
[0.01815510086989415],
[0.01178632189832033],
[0.00883154690594847],
[0.01900236722711305],
[0.02352253138619201],
[0.02012679813016975],
[0.0150811053088989],
[0.03244920785932055]
],
"Log Likelihood":-4248.344045935186,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.5635016604485291, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":886
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":11328.92957043136,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2537515471722593],
[0.2189747270010401],
[0.2084329457938661],
[0.3188407800328343]
],
"Log Likelihood":-4295.426376157257,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.3440543571094284,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.2548110385204979,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.1604584404621683,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.541340279539999,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.6989133587104814
},
"display order":0,
"estimated parameters":1365
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-06-21/sequences.M.compressed.fas",
"number of sequences":680,
"number of sites":227,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_465573_England_20200501_null_1,epi_isl_442621_England_20200412_null_1,epi_isl_469821_England_20200420_null_1,epi_isl_468251_Basel_Landschaft_20200427_null_1,epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1,epi_isl_468528_California_20200331_null_1,epi_isl_468480_California_20200428_null_1,epi_isl_468365_California_20200411_null_1,epi_isl_468289_Vaud_20200501_null_1,epi_isl_468239_Bern_20200420_null_1,epi_isl_468206_Geneva_20200417_null_1,epi_isl_467156_Basque_Country_20200313_null_1,epi_isl_466607_England_20200416_null_1,epi_isl_466567_England_20200416_null_1,epi_isl_466561_England_20200414_null_1,epi_isl_466542_England_20200415_null_1,epi_isl_466428_England_20200408_null_1,epi_isl_466384_England_20200413_null_1,epi_isl_466373_England_20200409_null_1,epi_isl_466358_England_20200409_null_1,epi_isl_466352_England_20200409_null_1,epi_isl_466288_England_20200408_null_1,epi_isl_466013_England_20200401_null_1,epi_isl_465905_England_20200330_null_1,epi_isl_465574_England_20200501_null_1,epi_isl_465258_England_20200418_null_1,epi_isl_464271_England_20200303_null_1,epi_isl_459241_England_20200501_null_1,epi_isl_458506_England_20200501_null_1,epi_isl_456582_Victoria_20200517_null_1,epi_isl_456567_Victoria_20200510_null_1,epi_isl_456545_Victoria_20200509_null_1,epi_isl_456418_Victoria_20200414_null_1,epi_isl_454653_California_20200410_null_1,epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2,epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1,epi_isl_423378_England_20200328_null_1,(epi_isl_466416_England_20200409_null_1,epi_isl_467421_New_York_20200318_null_4)Node1317,epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1,epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1,epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1,epi_isl_458747_England_20200419_null_1,epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1,epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2,epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1,(((epi_isl_465850_England_20200323_null_3,epi_isl_457312_England_20200504_null_1,epi_isl_469034_Gujarat_20200605_null_2)Node351,epi_isl_465604_England_20200504_null_2)Node350,epi_isl_458314_England_20200429_null_1)Node349,(((epi_isl_465165_England_20200416_null_1,(epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1,epi_isl_452182_Veneto_20200323_null_1)Node338,epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1,epi_isl_470843_Western_Australia_20200401_null_729,epi_isl_464625_England_20200308_null_1,epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1,epi_isl_464350_England_20200304_null_1,epi_isl_462990_elinac_20200429_null_1,epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1,epi_isl_460855_Friesland_20200501_null_4)Node321,epi_isl_468283_Basel_Landschaft_20200430_null_1)Node320,epi_isl_466515_England_20200414_null_37)Node319,((epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1,epi_isl_467063_Andalusia_20200401_null_7)Node345,epi_isl_462374_Singapore_20200408_null_3)Node344,(((epi_isl_456556_Victoria_20200508_null_1,epi_isl_460634_Washington_20200406_null_1)Node364,epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1,epi_isl_452299_Michigan_20200316_null_1)Node360,epi_isl_456546_Victoria_20200502_null_1)Node359,((epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1,epi_isl_465163_Narayanganj_20200507_null_6)Node370,epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1)Node369,epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1,((epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2,epi_isl_461722_Scotland_20200506_null_22)Node378,epi_isl_445178_California_20200405_null_1)Node377,epi_isl_462461_Maglaj_20200411_null_2,epi_isl_465392_England_20200421_null_1,(epi_isl_444084_England_20200404_null_1,epi_isl_468236_Bern_20200420_null_5)Node387,epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1,(epi_isl_442065_England_20200404_null_1,epi_isl_469408_England_20200515_null_1)Node392,epi_isl_463172_Connecticut_20200401_null_4,(epi_isl_463684_Washington_20200505_null_18,epi_isl_466954_Basel_Stadt_20200310_null_1)Node402,(epi_isl_447518_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2,epi_isl_468021_South_Australia_20200325_null_6)Node398,epi_isl_468290_Basel_Landschaft_20200501_null_1,(epi_isl_459620_Scotland_20200323_null_4,epi_isl_464610_England_20200308_null_1)Node413,epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1,epi_isl_456438_Victoria_20200417_null_1,epi_isl_452607_Andalusia_20200326_null_1,epi_isl_456623_Victoria_20200101_null_4,epi_isl_470088_Northern_Ireland_20200406_null_2,epi_isl_454626_California_20200430_null_2,epi_isl_466197_England_20200403_null_1,epi_isl_468257_Bern_20200427_null_1,epi_isl_466368_England_20200410_null_1,epi_isl_448615_England_20200101_null_1,(epi_isl_453466_Northern_Ireland_20200325_null_1,epi_isl_454614_California_20200429_null_4)Node958,(epi_isl_454828_North_Carolina_20200301_null_2,epi_isl_465917_England_20200330_null_1)Node955,(epi_isl_424040_England_20200321_null_1,epi_isl_468348_California_20200425_null_1)Node952,epi_isl_462736_Michigan_20200427_null_1,((epi_isl_459573_Scotland_20200325_null_12,epi_isl_464541_England_20200304_null_4)Node275,epi_isl_468302_Zurich_20200504_null_1)Node274,(epi_isl_418703_England_20200317_null_1,epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1)Node279,(epi_isl_445458_Wales_20200404_null_5,epi_isl_442846_England_20200411_null_1,epi_isl_439458_England_20200330_null_1,epi_isl_461267_Zeeland_20200424_null_1,(epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1,epi_isl_462984_Wyoming_20200330_null_1)Node295,epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4,epi_isl_469863_Northern_Ireland_20200429_null_11)Node283,(epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1,epi_isl_471241_Wisconsin_20200404_null_37)Node299,epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1,epi_isl_440052_England_20200322_null_1,epi_isl_465643_England_20200506_null_1,epi_isl_443823_England_20200326_null_1,epi_isl_456655_Victoria_20200526_null_6,(epi_isl_440436_England_20200316_null_2,epi_isl_463010_Odisha_20200507_null_5)Node946,(epi_isl_462679_Michigan_20200429_null_3,epi_isl_470573_Ceara_20200402_null_10)Node943,(epi_isl_445465_Wales_20200401_null_1,epi_isl_445761_Wales_20200412_null_1)Node940,(epi_isl_446571_Wales_20200411_null_2,epi_isl_467843_California_20200315_null_7)Node937,(epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1,epi_isl_469549_England_20200423_null_1)Node934,(epi_isl_423549_England_20200331_null_1,epi_isl_440088_England_20200321_null_1)Node742,(epi_isl_458476_England_20200429_null_3,epi_isl_471405_Kinshasa_20200427_null_8)Node739,(epi_isl_467961_California_20200319_null_8,epi_isl_470000_Scotland_20200330_null_4)Node736,(epi_isl_442012_England_20200324_null_2,epi_isl_456422_Victoria_20200416_null_1)Node733,(epi_isl_438511_England_20200401_null_2,epi_isl_455574_Wisconsin_20200510_null_3)Node266,(epi_isl_441307_England_20200401_null_2,epi_isl_452407_Andalusia_20200315_null_9,epi_isl_465516_England_20200429_null_1)Node225,epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1,((epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3,epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1)Node241,epi_isl_423067_England_20200324_null_1,epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_1,epi_isl_470599_Mato_Grosso_20200319_null_19)Node235,epi_isl_459024_England_20200410_null_1,epi_isl_462436_Uzice_20200428_null_1,((epi_isl_462239_Lovendegem_20200330_null_11,epi_isl_462991_USA_20200511_null_1)Node246,epi_isl_465429_England_20200423_null_4)Node245,epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1,epi_isl_466544_England_20200415_null_1,((epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4,((epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1)Node258,epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4)Node257,epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1)Node255,epi_isl_465918_England_20200330_null_1)Node254,epi_isl_465213_England_20200417_null_1,(epi_isl_456627_Victoria_20200523_null_1,epi_isl_464561_England_20200304_null_19)Node723,epi_isl_470216_England_20200420_null_8,((epi_isl_469024_Gujarat_20200527_null_1,epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2,epi_isl_466882_Bavaria_20200415_null_1)Node181,epi_isl_466240_England_20200405_null_1)Node180,((epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1,epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2,epi_isl_461204_Noord_Holland_20200426_null_1,(epi_isl_432711_England_20200312_null_17,epi_isl_456569_Victoria_20200510_null_1)Node158,epi_isl_470520_England_20200404_null_399,epi_isl_455309_Odisha_20200404_null_1,epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1,epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1)Node151,epi_isl_470345_England_20200419_null_7)Node150,(epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1,epi_isl_439246_Scotland_20200425_null_3)Node177,(epi_isl_458145_Amapa_20200420_null_1,epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1,epi_isl_468353_California_20200516_null_1)Node171,epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1,((epi_isl_461485_Gujarat_20200527_null_1,epi_isl_452954_England_20200512_null_1,epi_isl_456688_England_20200518_null_7)Node189,epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1)Node188,epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1,(epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1,epi_isl_455478_Odisha_20200409_null_1)Node198,epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1,epi_isl_464336_England_20200303_null_1,epi_isl_466477_England_20200410_null_1,(((epi_isl_439434_England_20200401_null_9,epi_isl_469244_Jeddah_20200315_null_1)Node215,epi_isl_456437_Victoria_20200418_null_1)Node214,epi_isl_466242_England_20200403_null_4)Node213,epi_isl_429065_California_20200328_null_1,epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2,epi_isl_443629_England_20200417_null_4,epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1,epi_isl_470238_England_20200417_null_7,(epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1,epi_isl_454936_Hubei_20200211_null_1)Node458,epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1,epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1,epi_isl_468238_Bern_20200420_null_1,epi_isl_468949_Basque_Country_20200410_null_29,epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1,((epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_1,epi_isl_466123_England_20200331_null_1)Node61,epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1)Node60,epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1,epi_isl_429814_Nova_Scotia_20200315_null_1,epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1,epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1,epi_isl_452832_Virginia_20200422_null_3,((epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1,epi_isl_470298_England_20200419_null_6,epi_isl_448539_England_20200406_null_1,epi_isl_469213_British_Columbia_20200401_null_34)Node51,epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_3)Node50,epi_isl_466285_England_20200407_null_2,epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2,epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1,epi_isl_470119_England_20200417_null_3,epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1,epi_isl_452002_Denmark_20200311_null_2,epi_isl_455917_Bangkok_20200312_null_2,epi_isl_462715_Michigan_20200417_null_1,epi_isl_457704_Muscat_20200224_null_1,epi_isl_463021_Odisha_20200509_null_1,epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1,epi_isl_471415_Kinshasa_20200428_null_43833,epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1,epi_isl_460852_Friesland_20200413_null_1,(epi_isl_433051_England_20200404_null_3,epi_isl_455722_Comunitat_Valenciana_20200330_null_4)Node517,epi_isl_445096_California_20200313_null_1,epi_isl_435059_EC_20200320_null_1,epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1,epi_isl_457836_Kenya_20200301_null_2,epi_isl_456032_New_York_20200327_null_1,epi_isl_457474_England_20200508_null_3,epi_isl_448657_England_20200101_null_1,epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1,(epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1,epi_isl_449684_England_20200415_null_1)Node535,epi_isl_463017_Odisha_20200509_null_1,epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2,epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1,epi_isl_432315_Wales_20200407_null_1,epi_isl_450495_GP_20200325_null_1,epi_isl_463139_Connecticut_20200330_null_3,epi_isl_443744_England_20200325_null_1,epi_isl_458280_California_20200421_null_1,epi_isl_460813_Overijssel_20200414_null_1,epi_isl_459493_England_20200427_null_1,epi_isl_465333_England_20200420_null_1,epi_isl_455638_KZN_20200504_null_1,epi_isl_461894_England_20200515_null_2,epi_isl_467262_Galicia_20200414_null_1,epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1,epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1,epi_isl_421787_England_20200326_null_1,epi_isl_467231_Madrid_20200402_null_3,epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1,epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1,epi_isl_452334_Beijing_20200319_null_1,(epi_isl_469924_England_20200411_null_4,epi_isl_464932_England_20200313_null_1,epi_isl_469113_Singapore_20200406_null_1)Node603,epi_isl_461240_Utrecht_20200430_null_2,((((epi_isl_452371_Andalusia_20200401_null_1,epi_isl_465540_England_20200430_null_1)Node586,epi_isl_467846_Georgia_20200313_null_1,epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3,epi_isl_465716_England_20200421_null_1,epi_isl_433666_England_20200403_null_2,epi_isl_470530_England_20200406_null_159)Node576,epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1)Node575,epi_isl_462716_Michigan_20200417_null_10)Node574,((epi_isl_442782_England_20200407_null_4,epi_isl_470457_England_20200410_null_31,(epi_isl_461567_England_20200525_null_4,epi_isl_470126_England_20200417_null_5)Node595,epi_isl_459878_Ontario_20200327_null_1)Node592,epi_isl_466337_England_20200407_null_3)Node591,epi_isl_459045_England_20200409_null_2,epi_isl_467652_New_Mexico_20200402_null_3,(epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1,epi_isl_458267_California_20200410_null_2)Node617,epi_isl_471402_Kinshasa_20200426_null_2,(epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1,epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1)Node622,epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1,(epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1,epi_isl_454496_Sormland_20200309_null_11)Node628,epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1,(epi_isl_441250_England_20200401_null_2,epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2)Node633,epi_isl_438652_England_20200423_null_2,epi_isl_452413_Andalusia_20200314_null_2,(epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_3,epi_isl_469977_Scotland_20200330_null_3)Node639,epi_isl_464065_Houthalen_Helchteren_20200407_null_2,epi_isl_469679_England_20200422_null_8,epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1,epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1,epi_isl_465712_England_20200430_null_3,((epi_isl_466400_England_20200412_null_1,epi_isl_465974_England_20200330_null_1)Node67,epi_isl_417938_California_20200318_null_1)Node66,epi_isl_455591_Nonthaburi_20200320_null_1,epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1,(epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6,epi_isl_464508_England_20200304_null_2,epi_isl_468083_Washington_20200417_null_12)Node654,epi_isl_469595_England_20200422_null_10,epi_isl_447679_France_20200301_null_1,epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1,epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1,epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2,epi_isl_470689_Utah_20200413_null_3,(epi_isl_441573_England_20200404_null_1,epi_isl_470371_England_20200408_null_1)Node671,epi_isl_423427_England_20200331_null_1,epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5,epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1,epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_454281_Portugal_20200421_null_1,epi_isl_452076_Denmark_20200428_null_4,epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1,epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1,epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2,epi_isl_454647_Virgin_Islands_20200427_null_2,(epi_isl_423216_England_20200325_null_1,epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2)Node692,((epi_isl_462228_Vlamertinge_20200402_null_8,epi_isl_469111_Singapore_20200408_null_7)Node696,epi_isl_468371_California_20200412_null_3)Node695,epi_isl_468691_British_Columbia_20200401_null_2,epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1,((epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1,epi_isl_460383_Massachusetts_20200404_null_1)Node710,epi_isl_465303_England_20200420_null_2)Node709,epi_isl_471266_Wisconsin_20200331_null_12,(epi_isl_465408_England_20200421_null_1,epi_isl_469289_Kanto_20200401_null_2)Node72,epi_isl_465465_England_20200429_null_1,epi_isl_469138_Singapore_20200417_null_1,epi_isl_452438_Andalusia_20200312_null_1,epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1,epi_isl_454897_Stockholm_20200310_null_4,(epi_isl_442072_England_20200405_null_1,epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1)Node727,epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1,epi_isl_468286_Bern_20200430_null_1,(epi_isl_466946_Basel_Stadt_20200310_null_1,epi_isl_469071_Vastra_Gotaland_20200527_null_1)Node931,(epi_isl_420198_England_20200328_null_1,epi_isl_465882_England_20200329_null_1)Node925,epi_isl_468513_California_20200321_null_1,epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1,(epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1,epi_isl_464453_England_20200304_null_1,epi_isl_464633_England_20200308_null_26)Node802,((epi_isl_425380_England_20200318_null_1,epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1,epi_isl_462973_Wyoming_20200329_null_11)Node775,epi_isl_453286_England_20200403_null_1)Node774,(epi_isl_466287_England_20200407_null_26,epi_isl_466609_England_20200416_null_1)Node764,(epi_isl_456297_Southern_20200401_null_1,epi_isl_470184_England_20200421_null_75)Node760,epi_isl_423815_England_20200323_null_1,(epi_isl_461148_Noord_Brabant_20200320_null_3,epi_isl_465352_England_20200416_null_1)Node142,(epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1,epi_isl_469499_England_20200503_null_3)Node139,epi_isl_441198_England_20200403_null_1,epi_isl_466925_Bavaria_20200526_null_12,((epi_isl_443337_England_20200415_null_1,epi_isl_470125_England_20200417_null_8)Node769,epi_isl_470640_Rio_de_Janeiro_20200420_null_4)Node768,epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2,(epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1,epi_isl_461237_Utrecht_20200428_null_5)Node125,epi_isl_468228_Basel_Landschaft_20200420_null_3,epi_isl_440230_England_20200323_null_1,epi_isl_433949_England_20200412_null_2,epi_isl_460224_Massachusetts_20200316_null_1,epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1,(epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1,epi_isl_452678_Basque_Country_20200325_null_3)Node119,epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5,epi_isl_448684_England_20200101_null_1,((epi_isl_454527_Maharashtra_20200313_null_1,epi_isl_466672_Nebraska_20200504_null_25)Node798,epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1)Node797,(((epi_isl_471409_Kinshasa_20200427_null_390,epi_isl_458970_England_20200410_null_1,epi_isl_459072_England_20200410_null_1)Node785,epi_isl_466961_Vaud_20200311_null_51)Node784,epi_isl_423718_England_20200323_null_2)Node783,((epi_isl_452240_Stockholm_20200424_null_3,epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_1)Node793,epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1)Node792,(epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1,epi_isl_456255_Counties_Manukau_20200323_null_2)Node110,epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1,((epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1,epi_isl_470594_Minas_Gerais_20200408_null_36)Node105,epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_8)Node104,(((epi_isl_456129_Pereira_20200319_null_5,epi_isl_461329_Zuid_Holland_20200428_null_1)Node810,epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1)Node809,epi_isl_466932_Graub_nden_20200305_null_1)Node808,((epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1,epi_isl_456995_Scotland_20200521_null_7)Node819,epi_isl_460556_Michigan_20200506_null_6,epi_isl_469796_England_20200417_null_17)Node815,((epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3,epi_isl_452115_Texas_20200311_null_1)Node100,epi_isl_458741_England_20200414_null_2)Node99,((epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1,epi_isl_465108_England_20200314_null_9)Node95,epi_isl_468274_Basel_Landschaft_20200428_null_3)Node94,(epi_isl_452145_Connecticut_20200512_null_1,epi_isl_471151_Wisconsin_20200612_null_1)Node843,epi_isl_468436_California_20200506_null_1,epi_isl_466927_Basel_Stadt_20200305_null_1,epi_isl_468601_California_20200422_null_3,epi_isl_448433_England_20200429_null_9,epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1,(epi_isl_463377_Washington_20200417_null_31,epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4,epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1,epi_isl_470842_Western_Australia_20200401_null_1)Node831,epi_isl_461087_Netherlands_20200508_null_6,(epi_isl_468460_California_20200413_null_1,epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1,epi_isl_471258_Wisconsin_20200326_null_305)Node85,(epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2,epi_isl_456989_Scotland_20200520_null_4)Node90,(epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5,epi_isl_460452_Massachusetts_20200319_null_8,epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4,epi_isl_468655_California_20200513_null_19)Node854,epi_isl_465840_England_20200327_null_1,(epi_isl_443673_England_20200412_null_1,epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1)Node849,epi_isl_467008_Vaud_20200507_null_1,(epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2,epi_isl_456528_Victoria_20200507_null_1)Node867,(epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3,epi_isl_469918_England_20200413_null_1)Node863,epi_isl_466304_England_20200408_null_1,(epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2,epi_isl_465968_England_20200330_null_1)Node873,epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1,epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1,epi_isl_460272_Massachusetts_20200404_null_1,((epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1,epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1)Node883,epi_isl_441046_England_20200404_null_1)Node882,epi_isl_421917_England_20200327_null_1,epi_isl_465833_England_20200325_null_1,epi_isl_460791_Noord_Holland_20200401_null_1,(epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1,epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1)Node895,epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1,epi_isl_465958_England_20200330_null_1,epi_isl_470196_England_20200420_null_2,epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2,epi_isl_433845_England_20200408_null_1,epi_isl_466007_England_20200331_null_1,epi_isl_424156_England_20200320_null_1,epi_isl_420758_England_20200327_null_1,epi_isl_468288_Basel_Landschaft_20200501_null_1,epi_isl_453047_Scotland_20200414_null_1,epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1,(epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3,epi_isl_454247_Portugal_20200323_null_8)Node919,epi_isl_423528_England_20200326_null_1,epi_isl_453570_England_20200424_null_1,epi_isl_470158_England_20200417_null_1,epi_isl_455105_Jonkoping_20200507_null_1,epi_isl_462341_Singapore_20200330_null_1,(epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2,epi_isl_456807_Scotland_20200506_null_49)Node962,epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1,(epi_isl_466978_Vaud_20200312_null_1,epi_isl_467299_Morocco_20200521_null_1)Node978,(epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2,epi_isl_456571_Victoria_20200510_null_1)Node975,epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1,(epi_isl_461687_Scotland_20200425_null_41,epi_isl_468253_Vaud_20200427_null_1)Node970,epi_isl_440816_England_20200403_null_1,epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_458498_England_20200416_null_1,epi_isl_465261_England_20200419_null_1,epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1,epi_isl_466940_Basel_Stadt_20200308_null_1,epi_isl_465894_England_20200331_null_1,epi_isl_465252_England_20200418_null_1,epi_isl_457384_England_20200429_null_1,epi_isl_465675_England_20200518_null_1,epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1,epi_isl_465632_England_20200505_null_1,epi_isl_456475_Victoria_20200501_null_1,epi_isl_468304_Zurich_20200504_null_1,epi_isl_459173_England_20200507_null_1,epi_isl_464634_England_20200308_null_1,epi_isl_465529_England_20200501_null_1,epi_isl_465851_England_20200328_null_1,epi_isl_449004_England_20200419_null_1,epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1,epi_isl_423445_England_20200327_null_1,epi_isl_464759_England_20200310_null_1,epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1,epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1,((epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1,epi_isl_458165_Dour_20200328_null_18)Node1286,epi_isl_458364_England_20200501_null_1)Node1285,((epi_isl_466387_England_20200413_null_1,epi_isl_468114_Oregon_20200506_null_2)Node1280,epi_isl_465545_England_20200501_null_1)Node1279,epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1,(epi_isl_453618_England_20200505_null_7,epi_isl_468272_Graubunden_20200428_null_1)Node1291,epi_isl_456568_Victoria_20200510_null_1,epi_isl_423653_England_20200323_null_1,(epi_isl_470183_England_20200420_null_2,epi_isl_470531_England_20200405_null_38)Node1297,((epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2,epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1)Node1301,epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1)Node1300,epi_isl_443318_England_20200415_null_1,epi_isl_466283_England_20200408_null_1,epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1,epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1,epi_isl_443107_England_20200411_null_1,epi_isl_423856_England_20200317_null_1,((epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1,epi_isl_469575_England_20200416_null_45)Node1032,epi_isl_468294_Bern_20200501_null_1)Node1031,epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1,epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1,epi_isl_468269_Luzern_20200427_null_1,epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1,epi_isl_463437_Washington_20200426_null_7,(epi_isl_465551_England_20200502_null_1,epi_isl_465558_England_20200502_null_7)Node1037,epi_isl_421892_England_20200327_null_1,((epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2,epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1)Node1046,epi_isl_468777_Aragon_20200323_null_4)Node1045,epi_isl_441103_England_20200401_null_1,epi_isl_440384_England_20200316_null_1,epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1,((epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1,epi_isl_456444_Victoria_20200422_null_1,epi_isl_456473_Victoria_20200430_null_54)Node1065,epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1)Node1064,((epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1,epi_isl_466816_British_Columbia_20200401_null_21)Node1059,epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3)Node1058,epi_isl_465222_England_20200417_null_1,((epi_isl_437266_Bavaria_20200326_null_1,epi_isl_457288_England_20200417_null_2)Node1083,epi_isl_459311_England_20200502_null_1)Node1082,((epi_isl_448896_England_20200413_null_3,epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1)Node1075,epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2)Node1074,epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1,epi_isl_463969_Quebec_20200413_null_2,epi_isl_465578_England_20200502_null_1,epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1,epi_isl_465719_England_20200314_null_1,epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1,epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1,((epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1,epi_isl_468380_California_20200419_null_4)Node1102,epi_isl_457554_England_20200511_null_1)Node1101,epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1,epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1,epi_isl_470430_England_20200410_null_1,epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1,epi_isl_454302_Portugal_20200324_null_2,epi_isl_469640_England_20200422_null_11,epi_isl_462317_Singapore_20200423_null_1,(epi_isl_449030_England_20200419_null_3,epi_isl_458042_Tamil_Nadu_20200506_null_6)Node1126,(epi_isl_461309_Zuid_Holland_20200507_null_5,epi_isl_461587_England_20200530_null_1,epi_isl_468277_Ticino_20200428_null_4)Node1120,epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1,(epi_isl_439409_England_20200331_null_1,epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2,(epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1,epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_3)Node1138,epi_isl_466399_England_20200413_null_1,epi_isl_470421_England_20200410_null_16)Node1130,(epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1,epi_isl_461174_Noord_Brabant_20200101_null_19)Node1142,epi_isl_461787_Northern_Ireland_20200329_null_6,(epi_isl_466848_Telangana_20200513_null_2,epi_isl_469615_England_20200415_null_3,((epi_isl_465270_England_20200419_null_18,epi_isl_465271_England_20200419_null_1)Node1154,epi_isl_466411_England_20200409_null_1)Node1153,epi_isl_471268_Los_Rios_20200417_null_33)Node1148,(epi_isl_455395_Hubei_20200315_null_1,epi_isl_466031_England_20200401_null_1)Node1159,epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1,(epi_isl_443713_England_20200330_null_1,epi_isl_467613_New_Mexico_20200318_null_2)Node1164,epi_isl_458756_England_20200419_null_1,((epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1,epi_isl_466037_England_20200402_null_1)Node1173,epi_isl_443381_England_20200412_null_1)Node1172,epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1,epi_isl_469072_Uppsala_20200603_null_4,(epi_isl_452674_Basque_Country_20200326_null_2,epi_isl_470385_England_20200405_null_10)Node1181,((epi_isl_462888_Minnesota_20200511_null_2,epi_isl_470074_Northern_Ireland_20200413_null_26)Node1185,epi_isl_446789_Wales_20200421_null_1)Node1184,epi_isl_438435_England_20200329_null_1,epi_isl_468249_Uri_20200426_null_1,(epi_isl_466202_England_20200402_null_7,epi_isl_470308_England_20200419_null_13)Node1193,(epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1,epi_isl_468417_California_20200411_null_19)Node1196,epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1,epi_isl_459208_England_20200505_null_1,(epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1,epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2)Node1216,epi_isl_456609_Timor_Leste_20200412_null_1,epi_isl_448978_England_20200421_null_1,epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_457519_England_20200507_null_2,epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2,epi_isl_468548_California_20200420_null_1,(epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1,epi_isl_454312_Portugal_20200328_null_1)Node1223,epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1,epi_isl_455205_Netherlands_20200327_null_1,epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1,epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1,((epi_isl_456583_Victoria_20200517_null_1,epi_isl_470572_Amazonas_20200402_null_2)Node989,epi_isl_445939_Wales_20200401_null_1)Node988,((epi_isl_465251_England_20200418_null_2,epi_isl_469441_England_20200511_null_8)Node994,epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1)Node993,(epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_1,epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_3)Node999,epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1,epi_isl_460056_Minnesota_20200323_null_5)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node100":"test",
"Node1031":"test",
"Node1032":"test",
"Node1037":"test",
"Node104":"test",
"Node1045":"test",
"Node1046":"test",
"Node105":"test",
"Node1058":"test",
"Node1059":"test",
"Node1064":"test",
"Node1065":"test",
"Node1074":"test",
"Node1075":"test",
"Node1082":"test",
"Node1083":"test",
"Node110":"test",
"Node1101":"test",
"Node1102":"test",
"Node1120":"test",
"Node1126":"test",
"Node1130":"test",
"Node1138":"test",
"Node1142":"test",
"Node1148":"test",
"Node1153":"test",
"Node1154":"test",
"Node1159":"test",
"Node1164":"test",
"Node1172":"test",
"Node1173":"test",
"Node1181":"test",
"Node1184":"test",
"Node1185":"test",
"Node119":"test",
"Node1193":"test",
"Node1196":"test",
"Node1216":"test",
"Node1223":"test",
"Node125":"test",
"Node1279":"test",
"Node1280":"test",
"Node1285":"test",
"Node1286":"test",
"Node1291":"test",
"Node1297":"test",
"Node1300":"test",
"Node1301":"test",
"Node1317":"test",
"Node139":"test",
"Node142":"test",
"Node150":"test",
"Node151":"test",
"Node158":"test",
"Node171":"test",
"Node177":"test",
"Node180":"test",
"Node181":"test",
"Node188":"test",
"Node189":"test",
"Node198":"test",
"Node213":"test",
"Node214":"test",
"Node215":"test",
"Node225":"test",
"Node235":"test",
"Node241":"test",
"Node245":"test",
"Node246":"test",
"Node254":"test",
"Node255":"test",
"Node257":"test",
"Node258":"test",
"Node266":"test",
"Node274":"test",
"Node275":"test",
"Node279":"test",
"Node283":"test",
"Node295":"test",
"Node299":"test",
"Node319":"test",
"Node320":"test",
"Node321":"test",
"Node338":"test",
"Node344":"test",
"Node345":"test",
"Node349":"test",
"Node350":"test",
"Node351":"test",
"Node359":"test",
"Node360":"test",
"Node364":"test",
"Node369":"test",
"Node370":"test",
"Node377":"test",
"Node378":"test",
"Node387":"test",
"Node392":"test",
"Node398":"test",
"Node402":"test",
"Node413":"test",
"Node458":"test",
"Node50":"test",
"Node51":"test",
"Node517":"test",
"Node535":"test",
"Node574":"test",
"Node575":"test",
"Node576":"test",
"Node586":"test",
"Node591":"test",
"Node592":"test",
"Node595":"test",
"Node60":"test",
"Node603":"test",
"Node61":"test",
"Node617":"test",
"Node622":"test",
"Node628":"test",
"Node633":"test",
"Node639":"test",
"Node654":"test",
"Node66":"test",
"Node67":"test",
"Node671":"test",
"Node692":"test",
"Node695":"test",
"Node696":"test",
"Node709":"test",
"Node710":"test",
"Node72":"test",
"Node723":"test",
"Node727":"test",
"Node733":"test",
"Node736":"test",
"Node739":"test",
"Node742":"test",
"Node760":"test",
"Node764":"test",
"Node768":"test",
"Node769":"test",
"Node774":"test",
"Node775":"test",
"Node783":"test",
"Node784":"test",
"Node785":"test",
"Node792":"test",
"Node793":"test",
"Node797":"test",
"Node798":"test",
"Node802":"test",
"Node808":"test",
"Node809":"test",
"Node810":"test",
"Node815":"test",
"Node819":"test",
"Node831":"test",
"Node843":"test",
"Node849":"test",
"Node85":"test",
"Node854":"test",
"Node863":"test",
"Node867":"test",
"Node873":"test",
"Node882":"test",
"Node883":"test",
"Node895":"test",
"Node90":"test",
"Node919":"test",
"Node925":"test",
"Node931":"test",
"Node934":"test",
"Node937":"test",
"Node94":"test",
"Node940":"test",
"Node943":"test",
"Node946":"test",
"Node95":"test",
"Node952":"test",
"Node955":"test",
"Node958":"test",
"Node962":"test",
"Node970":"test",
"Node975":"test",
"Node978":"test",
"Node988":"test",
"Node989":"test",
"Node99":"test",
"Node993":"test",
"Node994":"test",
"Node999":"test",
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1":"test",
"epi_isl_408485_Beijing_20200118_null_1":"test",
"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_2":"test",
"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_416829_Selangor_20200124_null_1":"test",
"epi_isl_417088_Washington_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417920_Kuala_Lumpur_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418089_Wales_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418703_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419493_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419590_Luxembourg_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_419661_Austria_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420014_Victoria_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420198_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420565_Abruzzo_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420566_Abruzzo_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420758_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420784_Arizona_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_421787_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421892_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422309_Wales_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422602_Netherlands_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_422671_Netherlands_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_422678_Netherlands_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_423067_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423216_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423378_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_423427_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423445_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423528_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423549_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423653_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423718_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_423815_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423856_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_424040_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424156_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424179_Washington_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_424638_Li_ge_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_424655_Li_ge_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_425380_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_425682_Scotland_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_426187_South_Korea_20200212_null_1":"test",
"epi_isl_426891_Czech_Republic_20200326_null_4":"test",
"epi_isl_427154_Victoria_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_427165_Connecticut_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427198_Washington_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_427252_Washington_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427293_Bahia_20200306_null_2":"test",
"epi_isl_427320_Saint_Petersburg_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_427411_Doha_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_427412_Doha_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_427415_Doha_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_427487_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_427599_New_York_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_427702_New_South_Wales_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_428451_Guangdong_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_428474_Guangdong_20200128_null_1":"test",
"epi_isl_428721_Ankara_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_428907_Republic_of_Sakha_Yakutia_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_429065_California_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429168_Bangkok_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_429231_Abruzzo_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_429234_Abruzzo_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_429532_Unknown_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_429575_Unknown_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_429671_Minas_gerais_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_429798_Luxembourg_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_429814_Nova_Scotia_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_430111_St_Petersburg_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430509_Victoria_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_430534_Victoria_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_430585_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430588_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430594_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430599_Victoria_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_430603_Victoria_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_430608_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_430685_Victoria_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_430710_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430712_Victoria_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_432008_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_432089_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_432315_Wales_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_432711_England_20200312_null_17":"test",
"epi_isl_433051_England_20200404_null_3":"test",
"epi_isl_433316_Scotland_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_3":"test",
"epi_isl_433666_England_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_433845_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_433949_England_20200412_null_2":"test",
"epi_isl_434078_Washington_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_434294_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_434326_Washington_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_434386_Antwerp_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_434610_Wisconsin_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_434803_Texas_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_434978_Texas_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_4":"test",
"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_435057_Ad_yaman_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_435058_KZN_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_435455_Louisiana_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_435684_Singapore_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_435712_Connecticut_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_436071_New_York_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_436128_Victoria_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_436424_Delhi_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_436427_Delhi_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_436434_Delhi_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_436443_Madhya_Pradesh_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_436446_Maharashtra_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_5":"test",
"epi_isl_436463_Madhya_Pradesh_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_436609_Wisconsin_20200417_null_6":"test",
"epi_isl_436728_Abruzzo_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_436984_Unknown_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_437042_Unknown_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_437129_Michigan_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_437242_Bavaria_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_437266_Bavaria_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_437272_Bavaria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_437332_Istanbul_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_437333_Ankara_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_437335_Denizli_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_437457_Indiana_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_437711_Makkah_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_437985_Ischgl_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_438231_District_of_Columbia_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_438435_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_438511_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_438652_England_20200423_null_2":"test",
"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_439074_Scotland_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_439246_Scotland_20200425_null_3":"test",
"epi_isl_439409_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_439434_England_20200401_null_9":"test",
"epi_isl_439458_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_440052_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_440088_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_440230_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_440384_England_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_440436_England_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_440816_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_441046_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_441103_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_441198_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_441250_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_441307_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_441573_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_442012_England_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_442065_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_442072_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_442621_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_442782_England_20200407_null_4":"test",
"epi_isl_442846_England_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_443107_England_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_443219_Singapore_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_443318_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_443337_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_443381_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_443629_England_20200417_null_4":"test",
"epi_isl_443673_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_443713_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_443744_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_443823_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_444084_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_444521_Illinois_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_444575_Illinois_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_444731_New_York_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_445074_Luxembourg_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_445096_California_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_445178_California_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_445458_Wales_20200404_null_5":"test",
"epi_isl_445465_Wales_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_445567_Wales_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_445761_Wales_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_445778_Wales_20200407_null_4":"test",
"epi_isl_445791_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_445792_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_445939_Wales_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_445953_Wales_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_445961_Wales_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_446027_Wales_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_446032_Wales_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_446056_Wales_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_446431_Wales_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_446480_Wales_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_446492_Wales_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_446571_Wales_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_446604_Wales_20200413_null_3":"test",
"epi_isl_446724_Wales_20200414_null_3":"test",
"epi_isl_446789_Wales_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_446974_Wales_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_447036_Gujarat_20200503_null_1":"test",
"epi_isl_447184_Michigan_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_447196_Michigan_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_447250_Israel_20200315_null_2":"test",
"epi_isl_447255_New_Taipei_City_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_447347_Jerusalem_District_20200415_null_2":"test",
"epi_isl_447349_Jerusalem_District_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_447479_Comunitat_Valenciana_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_447518_Comunitat_Valenciana_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_447679_France_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_447841_Florida_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_448433_England_20200429_null_9":"test",
"epi_isl_448539_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_448615_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_448657_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_448684_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_448896_England_20200413_null_3":"test",
"epi_isl_448978_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_449004_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_449030_England_20200419_null_3":"test",
"epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_449684_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_449813_Utah_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_450048_New_York_20200315_null_3":"test",
"epi_isl_450088_New_York_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_450139_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_450314_Quebec_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_450338_Wielkopolskie_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_450495_GP_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_450802_Pennsylvania_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_450831_Jonkoping_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_451130_South_Australia_20200316_null_5":"test",
"epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_451299_Lazio_20200204_null_1":"test",
"epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_451700_Basel_Stadt_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_451728_Basel_Stadt_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_451733_Bern_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_451747_Zurich_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451760_Graubunden_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451768_Aargau_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451779_Bern_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_451788_Graubunden_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_451798_Zurich_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_451804_Sankt_Gallen_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451820_Basel_Stadt_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451826_Bern_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451847_Zurich_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_451871_Luzern_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_5":"test",
"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_452002_Denmark_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_452012_Denmark_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_452076_Denmark_20200428_null_4":"test",
"epi_isl_452115_Texas_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_452145_Connecticut_20200512_null_1":"test",
"epi_isl_452182_Veneto_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_452240_Stockholm_20200424_null_3":"test",
"epi_isl_452299_Michigan_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_452334_Beijing_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_452371_Andalusia_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_452407_Andalusia_20200315_null_9":"test",
"epi_isl_452413_Andalusia_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_452438_Andalusia_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_452607_Andalusia_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_452674_Basque_Country_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_452678_Basque_Country_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_452832_Virginia_20200422_null_3":"test",
"epi_isl_452954_England_20200512_null_1":"test",
"epi_isl_453047_Scotland_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_453286_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_453466_Northern_Ireland_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_453570_England_20200424_null_1":"test",
"epi_isl_453618_England_20200505_null_7":"test",
"epi_isl_454159_Portugal_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_454247_Portugal_20200323_null_8":"test",
"epi_isl_454281_Portugal_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_454302_Portugal_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_454312_Portugal_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_454496_Sormland_20200309_null_11":"test",
"epi_isl_454527_Maharashtra_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_454614_California_20200429_null_4":"test",
"epi_isl_454626_California_20200430_null_2":"test",
"epi_isl_454647_Virgin_Islands_20200427_null_2":"test",
"epi_isl_454653_California_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_454828_North_Carolina_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_454897_Stockholm_20200310_null_4":"test",
"epi_isl_454936_Hubei_20200211_null_1":"test",
"epi_isl_455105_Jonkoping_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_455205_Netherlands_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_455309_Odisha_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_455395_Hubei_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_455478_Odisha_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_455574_Wisconsin_20200510_null_3":"test",
"epi_isl_455591_Nonthaburi_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_455638_KZN_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_455722_Comunitat_Valenciana_20200330_null_4":"test",
"epi_isl_455917_Bangkok_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_456032_New_York_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_456129_Pereira_20200319_null_5":"test",
"epi_isl_456255_Counties_Manukau_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_456297_Southern_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_456418_Victoria_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_456422_Victoria_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_456437_Victoria_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_456438_Victoria_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_456444_Victoria_20200422_null_1":"test",
"epi_isl_456473_Victoria_20200430_null_54":"test",
"epi_isl_456475_Victoria_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_456528_Victoria_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_456545_Victoria_20200509_null_1":"test",
"epi_isl_456546_Victoria_20200502_null_1":"test",
"epi_isl_456556_Victoria_20200508_null_1":"test",
"epi_isl_456567_Victoria_20200510_null_1":"test",
"epi_isl_456568_Victoria_20200510_null_1":"test",
"epi_isl_456569_Victoria_20200510_null_1":"test",
"epi_isl_456571_Victoria_20200510_null_1":"test",
"epi_isl_456582_Victoria_20200517_null_1":"test",
"epi_isl_456583_Victoria_20200517_null_1":"test",
"epi_isl_456609_Timor_Leste_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_456623_Victoria_20200101_null_4":"test",
"epi_isl_456627_Victoria_20200523_null_1":"test",
"epi_isl_456655_Victoria_20200526_null_6":"test",
"epi_isl_456688_England_20200518_null_7":"test",
"epi_isl_456807_Scotland_20200506_null_49":"test",
"epi_isl_456989_Scotland_20200520_null_4":"test",
"epi_isl_456995_Scotland_20200521_null_7":"test",
"epi_isl_457288_England_20200417_null_2":"test",
"epi_isl_457312_England_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_457384_England_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_457474_England_20200508_null_3":"test",
"epi_isl_457519_England_20200507_null_2":"test",
"epi_isl_457554_England_20200511_null_1":"test",
"epi_isl_457704_Muscat_20200224_null_1":"test",
"epi_isl_457836_Kenya_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_458042_Tamil_Nadu_20200506_null_6":"test",
"epi_isl_458145_Amapa_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_1":"test",
"epi_isl_458165_Dour_20200328_null_18":"test",
"epi_isl_458267_California_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_458280_California_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_458314_England_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_458364_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_458476_England_20200429_null_3":"test",
"epi_isl_458498_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_458506_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_458741_England_20200414_null_2":"test",
"epi_isl_458747_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_458756_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_458970_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_459024_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_459045_England_20200409_null_2":"test",
"epi_isl_459072_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_459173_England_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_459208_England_20200505_null_1":"test",
"epi_isl_459241_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_459311_England_20200502_null_1":"test",
"epi_isl_459493_England_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_459573_Scotland_20200325_null_12":"test",
"epi_isl_459620_Scotland_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_459878_Ontario_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_460056_Minnesota_20200323_null_5":"test",
"epi_isl_460224_Massachusetts_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_460272_Massachusetts_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_460383_Massachusetts_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_460452_Massachusetts_20200319_null_8":"test",
"epi_isl_460556_Michigan_20200506_null_6":"test",
"epi_isl_460634_Washington_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_460791_Noord_Holland_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_460813_Overijssel_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_460852_Friesland_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_460855_Friesland_20200501_null_4":"test",
"epi_isl_461087_Netherlands_20200508_null_6":"test",
"epi_isl_461148_Noord_Brabant_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_461174_Noord_Brabant_20200101_null_19":"test",
"epi_isl_461204_Noord_Holland_20200426_null_1":"test",
"epi_isl_461237_Utrecht_20200428_null_5":"test",
"epi_isl_461240_Utrecht_20200430_null_2":"test",
"epi_isl_461267_Zeeland_20200424_null_1":"test",
"epi_isl_461309_Zuid_Holland_20200507_null_5":"test",
"epi_isl_461329_Zuid_Holland_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_461485_Gujarat_20200527_null_1":"test",
"epi_isl_461567_England_20200525_null_4":"test",
"epi_isl_461587_England_20200530_null_1":"test",
"epi_isl_461687_Scotland_20200425_null_41":"test",
"epi_isl_461722_Scotland_20200506_null_22":"test",
"epi_isl_461787_Northern_Ireland_20200329_null_6":"test",
"epi_isl_461894_England_20200515_null_2":"test",
"epi_isl_462228_Vlamertinge_20200402_null_8":"test",
"epi_isl_462239_Lovendegem_20200330_null_11":"test",
"epi_isl_462283_Singapore_20200127_null_8":"test",
"epi_isl_462317_Singapore_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_462341_Singapore_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_462374_Singapore_20200408_null_3":"test",
"epi_isl_462436_Uzice_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_462461_Maglaj_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_462679_Michigan_20200429_null_3":"test",
"epi_isl_462715_Michigan_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_462716_Michigan_20200417_null_10":"test",
"epi_isl_462736_Michigan_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_462888_Minnesota_20200511_null_2":"test",
"epi_isl_462973_Wyoming_20200329_null_11":"test",
"epi_isl_462984_Wyoming_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_462990_elinac_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_462991_USA_20200511_null_1":"test",
"epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_463010_Odisha_20200507_null_5":"test",
"epi_isl_463017_Odisha_20200509_null_1":"test",
"epi_isl_463021_Odisha_20200509_null_1":"test",
"epi_isl_463050_Odisha_20200512_null_3":"test",
"epi_isl_463139_Connecticut_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_463172_Connecticut_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_463377_Washington_20200417_null_31":"test",
"epi_isl_463437_Washington_20200426_null_7":"test",
"epi_isl_463684_Washington_20200505_null_18":"test",
"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1":"test",
"epi_isl_463969_Quebec_20200413_null_2":"test",
"epi_isl_464065_Houthalen_Helchteren_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_464161_Dhaka_20200601_null_1":"test",
"epi_isl_464271_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_464336_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_464350_England_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_464453_England_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_464508_England_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_464541_England_20200304_null_4":"test",
"epi_isl_464561_England_20200304_null_19":"test",
"epi_isl_464610_England_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_464625_England_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_464633_England_20200308_null_26":"test",
"epi_isl_464634_England_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_464759_England_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_464932_England_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_465108_England_20200314_null_9":"test",
"epi_isl_465163_Narayanganj_20200507_null_6":"test",
"epi_isl_465165_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_465213_England_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_465222_England_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_465251_England_20200418_null_2":"test",
"epi_isl_465252_England_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_465258_England_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_465261_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_465270_England_20200419_null_18":"test",
"epi_isl_465271_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_465303_England_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_465333_England_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_465352_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_465392_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_465408_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_465429_England_20200423_null_4":"test",
"epi_isl_465465_England_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_465516_England_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_465529_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_465540_England_20200430_null_1":"test",
"epi_isl_465545_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_465551_England_20200502_null_1":"test",
"epi_isl_465558_England_20200502_null_7":"test",
"epi_isl_465573_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_465574_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_465578_England_20200502_null_1":"test",
"epi_isl_465604_England_20200504_null_2":"test",
"epi_isl_465632_England_20200505_null_1":"test",
"epi_isl_465643_England_20200506_null_1":"test",
"epi_isl_465675_England_20200518_null_1":"test",
"epi_isl_465712_England_20200430_null_3":"test",
"epi_isl_465716_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_465719_England_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_465833_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_465840_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_465850_England_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_465851_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_465882_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_465894_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_465905_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_465917_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_465918_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_465958_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_465968_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_465974_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_466007_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_466013_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_466031_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_466037_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_466123_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_466197_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_466202_England_20200402_null_7":"test",
"epi_isl_466240_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_466242_England_20200403_null_4":"test",
"epi_isl_466283_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_466285_England_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_466287_England_20200407_null_26":"test",
"epi_isl_466288_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_466304_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_466337_England_20200407_null_3":"test",
"epi_isl_466352_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_466358_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_466368_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_466373_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_466384_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_466387_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_466399_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_466400_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_466411_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_466416_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_466428_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_466477_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_466515_England_20200414_null_37":"test",
"epi_isl_466542_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_466544_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_466561_England_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_466567_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_466607_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_466609_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_466672_Nebraska_20200504_null_25":"test",
"epi_isl_466816_British_Columbia_20200401_null_21":"test",
"epi_isl_466848_Telangana_20200513_null_2":"test",
"epi_isl_466882_Bavaria_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_466925_Bavaria_20200526_null_12":"test",
"epi_isl_466927_Basel_Stadt_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_466932_Graub_nden_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_466940_Basel_Stadt_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_466946_Basel_Stadt_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_466954_Basel_Stadt_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_466961_Vaud_20200311_null_51":"test",
"epi_isl_466978_Vaud_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_467008_Vaud_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_467063_Andalusia_20200401_null_7":"test",
"epi_isl_467156_Basque_Country_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_467231_Madrid_20200402_null_3":"test",
"epi_isl_467262_Galicia_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_467299_Morocco_20200521_null_1":"test",
"epi_isl_467421_New_York_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_467613_New_Mexico_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_467652_New_Mexico_20200402_null_3":"test",
"epi_isl_467666_Mongolia_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_467843_California_20200315_null_7":"test",
"epi_isl_467846_Georgia_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_467961_California_20200319_null_8":"test",
"epi_isl_468021_South_Australia_20200325_null_6":"test",
"epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_3":"test",
"epi_isl_468083_Washington_20200417_null_12":"test",
"epi_isl_468114_Oregon_20200506_null_2":"test",
"epi_isl_468206_Geneva_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_468228_Basel_Landschaft_20200420_null_3":"test",
"epi_isl_468236_Bern_20200420_null_5":"test",
"epi_isl_468238_Bern_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_468239_Bern_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_468249_Uri_20200426_null_1":"test",
"epi_isl_468251_Basel_Landschaft_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_468253_Vaud_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_468257_Bern_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_468269_Luzern_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_468272_Graubunden_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_468274_Basel_Landschaft_20200428_null_3":"test",
"epi_isl_468277_Ticino_20200428_null_4":"test",
"epi_isl_468283_Basel_Landschaft_20200430_null_1":"test",
"epi_isl_468286_Bern_20200430_null_1":"test",
"epi_isl_468288_Basel_Landschaft_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_468289_Vaud_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_468290_Basel_Landschaft_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_468294_Bern_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_468302_Zurich_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_468304_Zurich_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_468348_California_20200425_null_1":"test",
"epi_isl_468353_California_20200516_null_1":"test",
"epi_isl_468365_California_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_468371_California_20200412_null_3":"test",
"epi_isl_468380_California_20200419_null_4":"test",
"epi_isl_468417_California_20200411_null_19":"test",
"epi_isl_468436_California_20200506_null_1":"test",
"epi_isl_468460_California_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_468480_California_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_468513_California_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_468528_California_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_468548_California_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_468601_California_20200422_null_3":"test",
"epi_isl_468655_California_20200513_null_19":"test",
"epi_isl_468691_British_Columbia_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_468777_Aragon_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_468949_Basque_Country_20200410_null_29":"test",
"epi_isl_469024_Gujarat_20200527_null_1":"test",
"epi_isl_469034_Gujarat_20200605_null_2":"test",
"epi_isl_469071_Vastra_Gotaland_20200527_null_1":"test",
"epi_isl_469072_Uppsala_20200603_null_4":"test",
"epi_isl_469111_Singapore_20200408_null_7":"test",
"epi_isl_469113_Singapore_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_469138_Singapore_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_469213_British_Columbia_20200401_null_34":"test",
"epi_isl_469244_Jeddah_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_469289_Kanto_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_469408_England_20200515_null_1":"test",
"epi_isl_469441_England_20200511_null_8":"test",
"epi_isl_469499_England_20200503_null_3":"test",
"epi_isl_469549_England_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_469575_England_20200416_null_45":"test",
"epi_isl_469595_England_20200422_null_10":"test",
"epi_isl_469615_England_20200415_null_3":"test",
"epi_isl_469640_England_20200422_null_11":"test",
"epi_isl_469679_England_20200422_null_8":"test",
"epi_isl_469796_England_20200417_null_17":"test",
"epi_isl_469821_England_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_469863_Northern_Ireland_20200429_null_11":"test",
"epi_isl_469918_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_469924_England_20200411_null_4":"test",
"epi_isl_469977_Scotland_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_470000_Scotland_20200330_null_4":"test",
"epi_isl_470074_Northern_Ireland_20200413_null_26":"test",
"epi_isl_470088_Northern_Ireland_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_470119_England_20200417_null_3":"test",
"epi_isl_470125_England_20200417_null_8":"test",
"epi_isl_470126_England_20200417_null_5":"test",
"epi_isl_470158_England_20200417_null_1":"test",
"epi_isl_470183_England_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_470184_England_20200421_null_75":"test",
"epi_isl_470196_England_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_470216_England_20200420_null_8":"test",
"epi_isl_470238_England_20200417_null_7":"test",
"epi_isl_470298_England_20200419_null_6":"test",
"epi_isl_470308_England_20200419_null_13":"test",
"epi_isl_470345_England_20200419_null_7":"test",
"epi_isl_470371_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_470385_England_20200405_null_10":"test",
"epi_isl_470421_England_20200410_null_16":"test",
"epi_isl_470430_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_470457_England_20200410_null_31":"test",
"epi_isl_470520_England_20200404_null_399":"test",
"epi_isl_470530_England_20200406_null_159":"test",
"epi_isl_470531_England_20200405_null_38":"test",
"epi_isl_470572_Amazonas_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_470573_Ceara_20200402_null_10":"test",
"epi_isl_470594_Minas_Gerais_20200408_null_36":"test",
"epi_isl_470599_Mato_Grosso_20200319_null_19":"test",
"epi_isl_470640_Rio_de_Janeiro_20200420_null_4":"test",
"epi_isl_470689_Utah_20200413_null_3":"test",
"epi_isl_470842_Western_Australia_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_470843_Western_Australia_20200401_null_729":"test",
"epi_isl_471151_Wisconsin_20200612_null_1":"test",
"epi_isl_471241_Wisconsin_20200404_null_37":"test",
"epi_isl_471258_Wisconsin_20200326_null_305":"test",
"epi_isl_471266_Wisconsin_20200331_null_12":"test",
"epi_isl_471268_Los_Rios_20200417_null_33":"test",
"epi_isl_471402_Kinshasa_20200426_null_2":"test",
"epi_isl_471405_Kinshasa_20200427_null_8":"test",
"epi_isl_471409_Kinshasa_20200427_null_390":"test",
"epi_isl_471415_Kinshasa_20200428_null_43833":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":41
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":14
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":57
}
}
}