{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721359295384233],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720072713894318],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720458931811241],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[161.8629407046063, 411.2148466472154, 1.5, 4.5, 0.2824449739232975, 0.009267099642885164, 0.01094318465563717, 0.003845350454205925, 0.6174914437668519, 0.7023130100539682, 0.01047880584176355],
[162.0595725232944, 410.967175422817, 1, 0, 0.282813277223378, 0.006170570392293614, 0, -0.01415680319326778, 1, 0.282813277223378, 0.001720523993693296],
[162.1521427530765, 410.6910164070909, 1, 0, 0.283065513064351, 0.006167047706071878, 0, -0.01414872128634795, 1, 0.283065513064351, 0.001721838432740099],
[162.3025676523211, 410.528428536524, 0, 1, 0.2833341225110919, 0, 0.002435884899773833, 0.005588517905997514, 0.7166658774889081, 1, 0.001721085185753081],
[162.0297775480879, 410.8772987308548, 1, 0, 0.2828203460157598, 0.006171705072564306, 0, -0.01415940642834302, 1, 0.2828203460157599, 0.001721086021752008],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721362646517321],
[162.146480473175, 410.7605958057678, 0, 1, 0.2830240490767258, 0, 0.002434508105721173, 0.005585359202473847, 0.7169759509232743, 1, 0.001721116984958807],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.00172108513787594],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268022, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001722697508909046],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268022, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721717611810528],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085972629088],
[162.1058576381854, 410.7170042286966, 0, 1, 0.2829947413583802, 0, 0.002434766492996665, 0.005585952006311131, 0.7170052586416198, 1, 0.001721085179754264],
[162.2488531218916, 410.6582231570511, 0, 1, 0.2832027388729516, 0, 0.0024351150022328, 0.005586751572048711, 0.7167972611270483, 1, 0.001719884437891325],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001719886025352073],
[162.1058576381854, 410.8418414757468, 0, 1, 0.2829330807836096, 0, 0.002434026671694375, 0.005584254674636934, 0.7170669192163904, 1, 0.001721116997145365],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085180751891],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001720073468388832],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001720519420861986],
[162.2661521403436, 410.6409241385991, 0, 1, 0.2832329340287951, 0, 0.002435217586015565, 0.005586986924428005, 0.7167670659712049, 1, 0.00172106371750121],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001719883654932988],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721086035535622],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721350652072376],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721531964216007],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085137263206],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001719883607000394],
[162.1058576381854, 410.8854330528179, 1, 0, 0.2829115560250359, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829115560250359, 0.001725014928651322],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268022, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001722128652965406],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001721002628273341],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268022, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001720902332988837],
[162.2488531218916, 410.6582231570511, 0, 1, 0.2832027388729516, 0, 0.0024351150022328, 0.005586751572048711, 0.7167972611270483, 1, 0.001721360076411089],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001719884409516722],
[162.0297775480879, 410.8772987308548, 1, 0, 0.2828203460157598, 0.006171705072564306, 0, -0.01415940642834302, 1, 0.2828203460157599, 0.001721087704145808],
[162.1348437346244, 410.8361496630936, 0, 1, 0.2829721671827832, 0, 0.002434060393225013, 0.005584332040105971, 0.7170278328172168, 1, 0.001721116997256773],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721085137263206],
[161.7488531218915, 411.1582231570511, 0, 1, 0.2823299969908866, 0, 0.00243215371523295, 0.00557995765275269, 0.7176700030091134, 1, 0.00172108513915877],
[162.4455631360272, 411.0423291107316, 0, 1, 0.2832589237405043, 0, 0.002432839464887831, 0.005581530930794559, 0.7167410762594957, 1, 0.001721117037124077],
[161.7488531218916, 411.1582231570511, 0, 1, 0.2823299969908867, 0, 0.00243215371523295, 0.00557995765275269, 0.7176700030091133, 1, 0.001721086863400616],
[162.1285575392587, 410.778518739684, 0, 1, 0.2829927648865694, 0, 0.002434401884178646, 0.005585115504180686, 0.7170072351134306, 1, 0.001719883654933367],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720073450757203],
[162.1521427530765, 410.6352618586975, 1, 0, 0.2830930663759629, 0.006167047706071878, 0, -0.01414872128634795, 1, 0.283093066375963, 0.001721362691552947],
[162.5216432261248, 410.3854330528179, 1, 0, 0.283678889570906, 0.006153026637865384, 0, -0.0141165535140774, 1, 0.2836788895709059, 0.001726350250317255],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.2986406533701, 410.6084356255726, 0, 1, 0.2832896422008034, 0, 0.002435410267391302, 0.005587428982802175, 0.7167103577991966, 1, 0.0017201105037313],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720743486830041],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001722198932564581],
[162.1900720502461, 410.7170042286966, 0, 1, 0.2831001374667562, 0, 0.002434766492996665, 0.005585952006311131, 0.7168998625332438, 1, 0.001719883654932988],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.00172108597512993],
[162.1285575392587, 410.7785187396839, 0, 1, 0.2829927648865694, 0, 0.002434401884178647, 0.005585115504180687, 0.7170072351134306, 1, 0.001720519627652369],
[162.1285575392587, 410.7785187396839, 0, 1, 0.2829927648865694, 0, 0.002434401884178647, 0.005585115504180687, 0.7170072351134306, 1, 0.001721063142349674],
[162.0595725232944, 410.8475037556483, 1, 0, 0.2828723526612354, 0.006170570392293614, 0, -0.01415680319326778, 1, 0.2828723526612354, 0.00171988365571343],
[162.3025676523211, 410.5284285365241, 0, 1, 0.283334122511092, 0, 0.002435884899773833, 0.005588517905997513, 0.7166658774889081, 1, 0.001721086033281547],
[162.181937728283, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2830483512918952, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830483512918951, 0.001720075141353831],
[162.2488531218916, 410.822105801723, 0, 1, 0.2831217506234127, 0, 0.002434143601032596, 0.005584522939241901, 0.7168782493765873, 1, 0.001720638970930766],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720072659676096],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085138281071],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720075138542553],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721117040450948],
[161.7488531218915, 411.1582231570511, 0, 1, 0.2823299969908866, 0, 0.00243215371523295, 0.00557995765275269, 0.7176700030091134, 1, 0.001721085137263206],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001719883654932988],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721362647894004],
[162.6646387098309, 410.6582231570512, 0, 1, 0.2837225750603322, 0, 0.002435115002232799, 0.00558675157204871, 0.7162774249396677, 1, 0.001725013047825193],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085138605235],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720072713452879],
[162.1058576381854, 410.7170042286966, 1, 0, 0.2829947413583802, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829947413583802, 0.001726352972932069],
[161.181937728283, 411.7251385506597, 1, 0, 0.2813404553757076, 0.006204169115312278, 0, -0.01423388691147872, 1, 0.2813404553757075, 0.001721897328544478],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[161.6058576381854, 411.3012186407573, 0, 1, 0.2820804006957337, 0, 0.002431308137876999, 0.005578017690731054, 0.7179195993042663, 1, 0.001721002595281135],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720458307225106],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.00172007265856036],
[161.7488531218916, 411.1582231570511, 0, 1, 0.2823299969908867, 0, 0.00243215371523295, 0.00557995765275269, 0.7176700030091133, 1, 0.001721360966501251],
[162.1348437346244, 410.8361496630936, 0, 1, 0.2829721671827831, 0, 0.002434060393225013, 0.00558433204010597, 0.7170278328172168, 1, 0.001721350659862781],
[162.1521427530765, 410.7549335258662, 1, 0, 0.2830339324943619, 0.006167047706071878, 0, -0.01414872128634795, 1, 0.2830339324943618, 0.00172153213098904],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085137762869],
[162.0595725232944, 410.967175422817, 1, 0, 0.282813277223378, 0.006170570392293614, 0, -0.01415680319326778, 1, 0.282813277223378, 0.001719884416481997],
[162.1348437346244, 410.8361496630936, 0, 1, 0.2829721671827832, 0, 0.002434060393225013, 0.005584332040105971, 0.7170278328172168, 1, 0.001721567916212289],
[162.1521427530765, 410.7549335258662, 1, 0, 0.2830339324943619, 0.006167047706071878, 0, -0.01414872128634795, 1, 0.2830339324943618, 0.001721532065248216],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720072713939876],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720073464626625],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721116047507255],
[162.00888587209, 410.8981904068526, 1, 0, 0.2827838799345002, 0.006172500937939443, 0, -0.01416123233887768, 1, 0.2827838799345002, 0.001721087705948316],
[161.9861859710167, 410.920890307926, 0, 1, 0.2827442576257294, 0, 0.002433558438098983, 0.005583180431830028, 0.7172557423742707, 1, 0.001721085138625468],
[162.181937728283, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2830483512918952, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830483512918951, 0.001720073462681104],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001725013039512708],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721087741084095],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001721085143846509],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001719883655688956],
[162.1058576381854, 410.8854330528179, 1, 0, 0.2829115560250359, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829115560250359, 0.001725013948563216],
[162.4861859710167, 410.420890307926, 0, 1, 0.2836169995077943, 0, 0.002436523148833217, 0.005589982206013161, 0.7163830004922057, 1, 0.001720076779579963],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720459931792686],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.00172188505225784],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720994391223813],
[162.1849360031162, 410.7860573946018, 0, 1, 0.2830595926704065, 0, 0.002434357208573412, 0.005585013007375588, 0.7169404073295935, 1, 0.001719883654933367],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721360916210981],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.00172391105025975],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.00172115445679377],
[162.2661521403436, 410.6815469735886, 0, 1, 0.2832128523969804, 0, 0.002434976704868386, 0.005586434283946366, 0.7167871476030196, 1, 0.00172007265856036],
[162.1058576381854, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2828739968517703, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7171260031482296, 1, 0.001720072659676096],
[161.9861859710167, 410.920890307926, 0, 1, 0.2827442576257294, 0, 0.002433558438098983, 0.005583180431830028, 0.7172557423742707, 1, 0.001721085980768667],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720102314576755],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720040512329536],
[162.1058576381854, 410.9011841666537, 0, 1, 0.2829037792059058, 0, 0.002433675147537222, 0.005583448191930455, 0.7170962207940943, 1, 0.001721360916885056],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721087757138433],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721116000181658],
[162.4628621544793, 410.4442141244634, 0, 1, 0.2835762881647106, 0, 0.002436384691481506, 0.005589664550860685, 0.7164237118352894, 1, 0.001719883655688956],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720072713432785],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001728708507642108],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[161.3918486055977, 411.515227673345, 1, 0, 0.2817068514039747, 0.006196099794629381, 0, -0.01421537390902537, 1, 0.2817068514039747, 0.001721896514414709],
[161.7488531218915, 411.1582231570511, 0, 1, 0.2823299969908866, 0, 0.00243215371523295, 0.00557995765275269, 0.7176700030091134, 1, 0.001721002586601584],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720458431767392],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398375, 0.006165914737530044, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720072713432785],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001721085180232246],
[162.2488531218916, 410.7221402758265, 0, 1, 0.2831711465178295, 0, 0.002434736046438683, 0.00558588215443329, 0.7168288534821705, 1, 0.001720638080570791],
[162.6535227994208, 410.2535534795219, 0.5, 1.5, 0.2839090832249145, 0.003074018880098799, 0.003656275460085378, 0.001335839523222953, 0.7160909167750856, 0.4872137989122175, 0.003447152900296158],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268022, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721360121744605],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001719883654932988],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001722984604468076],
[162.1849360031162, 410.7221402758265, 0, 1, 0.2830911725798793, 0, 0.002434736046438683, 0.00558588215443329, 0.7169088274201207, 1, 0.001719886124297224],
[162.0595725232943, 410.8475037556483, 1, 0, 0.2828723526612354, 0.006170570392293615, 0, -0.01415680319326778, 1, 0.2828723526612353, 0.001719883655688956],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721360922083124],
[162.3025676523211, 410.528428536524, 0, 1, 0.2833341225110919, 0, 0.002435884899773833, 0.005588517905997514, 0.7166658774889081, 1, 0.001721087711629847],
[162.1646387098309, 411.1582231570511, 0, 1, 0.2828504661087166, 0, 0.00243215371523295, 0.00557995765275269, 0.7171495338912834, 1, 0.001720638087409538],
[162.0297775480879, 410.8772987308548, 1, 0, 0.2828203460157598, 0.006171705072564306, 0, -0.01415940642834302, 1, 0.2828203460157599, 0.001721085181628147],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721086055535745],
[161.9861859710167, 410.920890307926, 0, 1, 0.2827442576257294, 0, 0.002433558438098983, 0.005583180431830028, 0.7172557423742707, 1, 0.001723911105892749],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721154584391969],
[162.2255293053541, 410.6815469735886, 0, 1, 0.283162027529868, 0, 0.002434976704868386, 0.005586434283946366, 0.716837972470132, 1, 0.001719883620460425],
[162.1521427530765, 410.7549335258662, 1, 0, 0.2830339324943619, 0.006167047706071878, 0, -0.01414872128634795, 1, 0.2830339324943618, 0.00172136013608457],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720074294480023],
[162.812350523862, 410.0947257550806, 1, 3, 0.2841863144392204, 0.006142040187875296, 0.007315383036141945, 0.002691936518848293, 0.6794727230976063, 0.7374572744835375, 0.00692472874410148],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.4861859710167, 410.420890307926, 0, 1, 0.2836169995077943, 0, 0.002436523148833217, 0.005589982206013161, 0.7163830004922057, 1, 0.001721955267294886],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001725811890360624],
[162.0297775480879, 410.8772987308548, 1, 0, 0.2828203460157598, 0.006171705072564306, 0, -0.01415940642834302, 1, 0.2828203460157599, 0.001721085197022275],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001719883620460425],
[161.7488531218916, 411.1582231570511, 0, 1, 0.2823299969908867, 0, 0.00243215371523295, 0.00557995765275269, 0.7176700030091133, 1, 0.001721362710046215],
[162.146480473175, 410.7605958057678, 0, 1, 0.2830240490767258, 0, 0.002434508105721173, 0.005585359202473847, 0.7169759509232743, 1, 0.001721116983253362],
[162.0267792732546, 410.8802970056881, 0, 1, 0.282815112575718, 0, 0.002433798863775053, 0.005583732027349135, 0.7171848874242821, 1, 0.001721360136120198],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721360072339785],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720075080358037],
[162.1348437346244, 411.1880181322576, 0, 1, 0.2827984971795351, 0, 0.002431977479651054, 0.005579553325066604, 0.7172015028204649, 1, 0.0017211170426138],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720072623816788],
[162.0831577371121, 410.8239185418306, 0, 1, 0.2829135202690278, 0, 0.002434132860495022, 0.005584498297812187, 0.7170864797309722, 1, 0.001721360123524607],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085136030534],
[162.0297775480879, 410.8772987308548, 1, 0, 0.2828203460157598, 0.006171705072564306, 0, -0.01415940642834302, 1, 0.2828203460157599, 0.001721087698948354],
[163.0216432261248, 409.8854330528179, 0, 1, 0.2845516314529709, 0, 0.002439706121176402, 0.005597284725904735, 0.7154483685470291, 1, 0.001720639033975737],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001719883612440171],
[162.1058576381854, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2828739968517703, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7171260031482296, 1, 0.001720072713311762],
[161.8867820643817, 410.8599997124028, 1, 0, 0.2826498327274296, 0.006177156573550916, 0, -0.01417191350980695, 1, 0.2826498327274296, 0.00172108522709037],
[161.3923266556659, 411.3899123762266, 0, 6, 0.28176908370701, 0, 0.01458470375547966, 0.03346089057768493, 0.1372728253884817, 1, 0.01050038673673802],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[161.3918486055977, 411.515227673345, 0, 1, 0.2817068514039747, 0, 0.002430043732898715, 0.005575116835332581, 0.7182931485960253, 1, 0.001721986181188771],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[161.7488531218915, 411.1582231570511, 0, 1, 0.2823299969908866, 0, 0.00243215371523295, 0.00557995765275269, 0.7176700030091134, 1, 0.001721553499724207],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721838196833317],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085138282517],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.0017200726721321],
[162.2661521403436, 410.6409241385991, 0, 1, 0.2832329340287951, 0, 0.002435217586015565, 0.005586986924428005, 0.7167670659712049, 1, 0.001720075125619037],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721116995301326],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001719885240493599],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001719883654932988],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001722319435564569],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001720912600026213],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001719884357117983],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001728962926575196],
[162.0595725232944, 410.8475037556483, 1, 0, 0.2828723526612354, 0.006170570392293614, 0, -0.01415680319326778, 1, 0.2828723526612354, 0.001719883654933367],
[162.2488531218916, 410.6582231570511, 0, 1, 0.2832027388729516, 0, 0.0024351150022328, 0.005586751572048711, 0.7167972611270483, 1, 0.001721360966902996],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721350798502146],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721532037083512],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268022, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721360067556314],
[162.181937728283, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2830483512918952, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830483512918951, 0.001720072712824405],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001721916812496052],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721032701344685],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.0017219351029474],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721087737950317],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721117043549237],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721085137593751],
[162.0595725232944, 410.8475037556483, 1, 0, 0.2828723526612354, 0.006170570392293614, 0, -0.01415680319326778, 1, 0.2828723526612354, 0.001719883654932988],
[162.1058576381854, 410.7170042286966, 0, 1, 0.2829947413583802, 0, 0.002434766492996665, 0.005585952006311131, 0.7170052586416198, 1, 0.001721116990313358],
[162.0297775480879, 410.8772987308548, 1, 0, 0.2828203460157598, 0.006171705072564306, 0, -0.01415940642834302, 1, 0.2828203460157599, 0.001721087749399598],
[161.9455631360272, 410.920890307926, 0, 1, 0.2826933959257771, 0, 0.002433558438098983, 0.005583180431830028, 0.7173066040742229, 1, 0.001721085145720202],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398375, 0.006165914737530044, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.00172007351322148],
[162.5216432261248, 410.9453573446362, 0, 1, 0.2834019098995583, 0, 0.002433413547877991, 0.005582848018096317, 0.7165980901004416, 1, 0.001729313605274833],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001719886042500989],
[162.0297775480879, 410.8772987308548, 1, 0, 0.2828203460157598, 0.006171705072564306, 0, -0.01415940642834302, 1, 0.2828203460157599, 0.001721085132333631],
[162.3566527477699, 410.9662091191121, 0, 1, 0.2831853804313615, 0, 0.002433290080329124, 0.005582564753231169, 0.7168146195686385, 1, 0.001719883656972545],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.2745079580651, 410.3932249865402, 1, 0, 0.2833659007181431, 0.006162397363475103, 0, -0.0141380522588937, 1, 0.283365900718143, 0.001721548899218256],
[162.2745079580651, 410.3932249865402, 1, 0, 0.283365900718143, 0.006162397363475103, 0, -0.0141380522588937, 1, 0.283365900718143, 0.001721548893570877],
[162.1521427530765, 410.6352618586976, 1, 0, 0.2830930663759629, 0.006167047706071878, 0, -0.01414872128634795, 1, 0.283093066375963, 0.001721324263253338],
[162.1348437346244, 411.1880181322576, 0, 1, 0.2827984971795351, 0, 0.002431977479651054, 0.005579553325066604, 0.7172015028204649, 1, 0.001721121962287734],
[162.1058576381854, 410.8239185418306, 1, 0, 0.282941931765214, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.282941931765214, 0.001719883654933367],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001719884445467181],
[161.9861859710167, 410.9208903079259, 0, 1, 0.2827442576257294, 0, 0.002433558438098984, 0.005583180431830028, 0.7172557423742707, 1, 0.001721532065248216],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.00172156795302486],
[162.2661521403436, 410.640924138599, 0, 1, 0.2832329340287951, 0, 0.002435217586015565, 0.005586986924428006, 0.7167670659712049, 1, 0.001719883654932988],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720072659676096],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720075135087074],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720965631507064],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085143846509],
[162.0595725232944, 410.8475037556483, 1, 0, 0.2828723526612354, 0.006170570392293614, 0, -0.01415680319326778, 1, 0.2828723526612354, 0.001719884444653637],
[162.1348437346244, 410.9361151889901, 0, 1, 0.2829228059979839, 0, 0.002433468276547314, 0.005582973579098198, 0.7170771940020161, 1, 0.001721567970270323],
[162.1521427530765, 410.7549335258662, 1, 0, 0.2830339324943619, 0.006167047706071878, 0, -0.01414872128634795, 1, 0.2830339324943618, 0.001721532062275812],
[162.1521427530765, 410.7549335258662, 1, 0, 0.2830339324943619, 0.006167047706071878, 0, -0.01414872128634795, 1, 0.2830339324943618, 0.001721360085228407],
[161.9628621544793, 410.9442141244634, 0, 1, 0.2827035462826457, 0, 0.002433420317476786, 0.005582863549217713, 0.7172964537173543, 1, 0.001719884400307342],
[161.8829280095557, 410.9602311506117, 0, 1, 0.2825955506685087, 0, 0.002433325475801362, 0.005582645959133144, 0.7174044493314913, 1, 0.001722606621660771],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.00888587209, 410.8981904068526, 1, 0, 0.2827838799345002, 0.006172500937939443, 0, -0.01416123233887768, 1, 0.2827838799345002, 0.00172099066246368],
[162.0768715417464, 410.7662876184209, 0, 1, 0.2829341137273311, 0, 0.002434474371784241, 0.005585281808541728, 0.7170658862726689, 1, 0.001721314791753368],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720072713432785],
[162.0595725232944, 410.8475037556483, 1, 0, 0.2828723526612354, 0.006170570392293614, 0, -0.01415680319326778, 1, 0.2828723526612354, 0.001719884373710997],
[162.2661521403436, 410.6409241385991, 0, 1, 0.2832329340287951, 0, 0.002435217586015565, 0.005586986924428005, 0.7167670659712049, 1, 0.00171988606772187],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.00172635123398418],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720072611379921],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721360922077271],
[162.0831577371121, 410.8239185418306, 0, 1, 0.2829135202690278, 0, 0.002434132860495022, 0.005584498297812187, 0.7170864797309722, 1, 0.00172108513796024],
[162.2661521403436, 410.6409241385991, 0, 1, 0.2832329340287951, 0, 0.002435217586015565, 0.005586986924428005, 0.7167670659712049, 1, 0.001719886135862237],
[162.8786477424187, 410.028428536524, 0, 1, 0.2843020351578179, 0, 0.002438855285154754, 0.005595332699213126, 0.7156979648421821, 1, 0.001720638042185419],
[162.5216432261248, 410.3854330528179, 0, 1, 0.283678889570906, 0, 0.00243673366415834, 0.005590465179844989, 0.7163211104290941, 1, 0.001721085138308546],
[162.0595725232944, 410.8475037556483, 1, 0, 0.2828723526612354, 0.006170570392293614, 0, -0.01415680319326778, 1, 0.2828723526612354, 0.001719884414221565],
[162.1849360031162, 410.7221402758265, 0, 1, 0.2830911725798793, 0, 0.002434736046438683, 0.00558588215443329, 0.7169088274201207, 1, 0.001719884458098358],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721532113732677],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721350180894335],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001721085138281071],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001721086020268195],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.4628621544793, 410.2839196223052, 2, 1, 0.2836556525913325, 0.01231050575791458, 0.002437336566640412, -0.02265147372911655, 0.9771769160685938, 0.1957354198782324, 0.0052146614615802],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720026742093474],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720074332299337],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001719886110519246],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721117035260279],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085185754516],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001721085180232246],
[162.2661521403436, 410.6409241385991, 0, 1, 0.2832329340287951, 0, 0.002435217586015565, 0.005586986924428005, 0.7167670659712049, 1, 0.001719886068335483],
[162.0885586197334, 411.2343032471487, 0, 1, 0.282717765853489, 0, 0.002431703756481151, 0.005578925336922979, 0.717282234146511, 1, 0.001725013015934851],
[162.1058576381854, 410.7170042286966, 0, 1, 0.2829947413583802, 0, 0.002434766492996665, 0.005585952006311131, 0.7170052586416198, 1, 0.001721085138308546],
[161.7488531218915, 411.1582231570511, 0, 1, 0.2823299969908866, 0, 0.00243215371523295, 0.00557995765275269, 0.7176700030091134, 1, 0.001721086021625864],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001723911475716147],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001721153818512912],
[161.9861859710167, 410.920890307926, 0, 1, 0.2827442576257294, 0, 0.002433558438098983, 0.005583180431830028, 0.7172557423742707, 1, 0.001721085145725337],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.00172108597416783],
[162.3249332119891, 410.7424375691118, 1, 0, 0.2832562827486363, 0.006160483052187951, 0, -0.01413366035888771, 1, 0.2832562827486362, 0.00172062960034856],
[161.9091476240498, 411.1582231570512, 0, 1, 0.2825307387565353, 0, 0.002432153715232949, 0.005579957652752688, 0.7174692612434648, 1, 0.001721760432860518]
],
"NAMES": [
["epi_isl_462097_Dhaka_20200523_null_2"],
["epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1"],
["epi_isl_465582_England_20200504_null_2"],
["epi_isl_429694_Minas_gerais_20200318_null_1"],
["epi_isl_435588_California_20200302_null_1"],
["Node119"],
["epi_isl_463007_Taipei_20200412_null_2"],
["epi_isl_460959_Gelderland_20200518_null_4"],
["epi_isl_437869_Connecticut_20200403_null_1"],
["epi_isl_434248_Washington_20200401_null_1"],
["epi_isl_440305_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_458903_England_20200414_null_17"],
["epi_isl_454434_Maryland_20200315_null_1"],
["epi_isl_462048_England_20200419_null_2"],
["Node135"],
["epi_isl_424636_Li_ge_20200403_null_1"],
["epi_isl_468688_British_Columbia_20200401_null_12"],
["epi_isl_441455_England_20200409_null_1"],
["epi_isl_434875_Texas_20200324_null_3"],
["epi_isl_466127_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_467716_England_20200520_null_6"],
["epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1"],
["epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_461920_England_20200519_null_5"],
["epi_isl_463059_Odisha_20200513_null_1"],
["epi_isl_447159_Liege_20200419_null_2"],
["epi_isl_446991_Wales_20200417_null_12"],
["epi_isl_456688_England_20200518_null_3"],
["epi_isl_460453_Massachusetts_20200326_null_2"],
["epi_isl_465655_England_20200512_null_3"],
["epi_isl_450190_California_20200508_null_1"],
["epi_isl_456838_Scotland_20200507_null_1"],
["epi_isl_462399_Singapore_20200414_null_5"],
["Node167"],
["epi_isl_468711_LA_20200408_null_16"],
["epi_isl_468563_California_20200313_null_123"],
["epi_isl_437691_Makkah_20200405_null_1"],
["epi_isl_434385_Antwerp_20200411_null_1"],
["epi_isl_467363_Rio_de_Janeiro_20200427_null_12"],
["epi_isl_449404_England_20200328_null_2"],
["epi_isl_465839_England_20200327_null_30"],
["epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1"],
["epi_isl_456506_Victoria_20200101_null_9"],
["epi_isl_461662_Scotland_20200424_null_9"],
["epi_isl_444278_Taoyuan_20200320_null_1"],
["epi_isl_456755_England_20200521_null_2"],
["epi_isl_467245_Madrid_20200401_null_8"],
["epi_isl_454949_Hubei_20200322_null_1"],
["epi_isl_466064_England_20200401_null_1"],
["Node201"],
["epi_isl_468310_Sao_Paulo_20200322_null_3"],
["epi_isl_463016_Odisha_20200509_null_1"],
["epi_isl_444411_England_20200419_null_2"],
["epi_isl_461154_Noord_Brabant_20200324_null_33"],
["epi_isl_463448_Washington_20200429_null_2"],
["epi_isl_467251_Madrid_20200402_null_2"],
["epi_isl_451142_South_Australia_20200330_null_10"],
["epi_isl_434838_Texas_20200321_null_1"],
["epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_2"],
["epi_isl_456931_Scotland_20200420_null_1"],
["epi_isl_438353_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_432107_Wales_20200325_null_2"],
["epi_isl_446670_Wales_20200415_null_8"],
["epi_isl_466559_England_20200403_null_15"],
["epi_isl_465710_England_20200429_null_3"],
["epi_isl_427480_New_York_20200401_null_1"],
["epi_isl_450516_Beirut_20200315_null_1"],
["epi_isl_460850_Friesland_20200414_null_2"],
["epi_isl_465675_England_20200518_null_2"],
["epi_isl_455117_Friesland_20200331_null_1"],
["epi_isl_458294_North_Carolina_20200401_null_1"],
["epi_isl_464079_Soignies_20200406_null_13"],
["Node241"],
["epi_isl_468620_California_20200331_null_27"],
["epi_isl_465193_England_20200416_null_2"],
["epi_isl_421980_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_429470_Unknown_20200323_null_1"],
["epi_isl_461738_Scotland_20200402_null_2"],
["epi_isl_468624_California_20200402_null_8"],
["epi_isl_447886_California_20200323_null_1"],
["epi_isl_419986_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_421393_New_York_20200318_null_2"],
["epi_isl_469065_Stockholm_20200528_null_2"],
["epi_isl_444383_England_20200101_null_3"],
["epi_isl_436321_Comunitat_Valenciana_20200319_null_2"],
["epi_isl_457090_England_20200418_null_3"],
["epi_isl_462264_Sint_Niklaas_20200323_null_6"],
["epi_isl_442361_England_20200417_null_2"],
["epi_isl_433733_England_20200405_null_4"],
["epi_isl_452202_Maharashtra_20200316_null_6"],
["epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_6"],
["epi_isl_439380_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_455083_New_South_Wales_20200406_null_1"],
["epi_isl_453738_England_20200421_null_1"],
["epi_isl_462070_England_20200518_null_5"],
["Node283"],
["epi_isl_437465_Makkah_20200323_null_1"],
["epi_isl_461038_Limburg_20200406_null_6"],
["Node286"],
["epi_isl_449357_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_442004_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_465660_England_20200513_null_3"],
["epi_isl_468699_British_Columbia_20200401_null_28"],
["epi_isl_463083_Odisha_20200516_null_1"],
["epi_isl_467486_KZN_20200514_null_1"],
["epi_isl_444246_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_452198_Maharashtra_20200420_null_1"],
["epi_isl_468662_British_Columbia_20200401_null_1"],
["Node301"],
["epi_isl_447043_Gujarat_20200503_null_1"],
["epi_isl_437356_Kinshasa_20200418_null_2"],
["epi_isl_463404_Washington_20200427_null_1"],
["epi_isl_462979_Wyoming_20200330_null_1"],
["epi_isl_463531_Washington_20200503_null_1"],
["epi_isl_449207_Scotland_20200427_null_1"],
["epi_isl_461990_England_20200507_null_8"],
["epi_isl_467393_New_York_20200425_null_1"],
["Node314"],
["epi_isl_445832_Wales_20200410_null_2"],
["epi_isl_453534_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_468280_Basel_Landschaft_20200428_null_30"],
["epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1"],
["epi_isl_437538_West_Bengal_20200405_null_1"],
["epi_isl_469253_Shanghai_20200228_null_45432"],
["epi_isl_466429_England_20200410_null_4"],
["epi_isl_464703_England_20200311_null_1"],
["epi_isl_428349_Ile_De_France_20200323_null_2"],
["epi_isl_446467_Wales_20200413_null_4"],
["epi_isl_469139_Singapore_20200606_null_3"],
["epi_isl_444006_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_436895_Wisconsin_20200428_null_2"],
["epi_isl_444589_Illinois_20200320_null_1"],
["epi_isl_461398_Zuid_Holland_20200503_null_42"],
["epi_isl_452634_Basque_Country_20200328_null_4"],
["epi_isl_464856_England_20200311_null_1"],
["epi_isl_465187_England_20200418_null_3"],
["epi_isl_458215_Morlanwelz_20200329_null_2"],
["epi_isl_440703_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_444871_Unknown_20200327_null_2"],
["epi_isl_447576_Telangana_20200402_null_1"],
["epi_isl_467853_Massachusetts_20200314_null_4"],
["Node359"],
["epi_isl_454472_Stockholm_20200307_null_1"],
["epi_isl_459564_Scotland_20200326_null_2"],
["epi_isl_437584_California_20200315_null_1"],
["epi_isl_433360_Scotland_20200328_null_1"],
["epi_isl_444919_Unknown_20200329_null_2"],
["epi_isl_453066_Scotland_20200416_null_1"],
["epi_isl_465184_England_20200417_null_7"],
["epi_isl_426787_Victoria_20200323_null_2"],
["epi_isl_447857_Telangana_20200402_null_6"],
["epi_isl_460835_Flevoland_20200501_null_1"],
["epi_isl_458178_Etterbeek_20200328_null_3"],
["epi_isl_440033_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_433057_England_20200404_null_1"],
["epi_isl_439006_Scotland_20200423_null_1"],
["epi_isl_465539_England_20200501_null_7"],
["epi_isl_460957_Gelderland_20200518_null_1"],
["epi_isl_468428_California_20200429_null_20"],
["epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1"],
["epi_isl_461208_Noord_Holland_20200427_null_1"],
["Node397"],
["epi_isl_466692_Chattogram_20200526_null_12"],
["Node396"],
["epi_isl_453017_Scotland_20200409_null_1"],
["epi_isl_465974_England_20200330_null_12"],
["epi_isl_440669_England_20200401_null_4"],
["epi_isl_430228_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_444746_New_York_20200402_null_1"],
["epi_isl_446113_Wales_20200407_null_1"],
["epi_isl_462707_Michigan_20200417_null_2"],
["epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1"],
["epi_isl_435457_Louisiana_20200402_null_1"],
["Node406"],
["epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1"],
["epi_isl_448969_Northern_Ireland_20200328_null_1"],
["epi_isl_462644_Michigan_20200429_null_5"],
["epi_isl_445169_California_20200328_null_1"],
["epi_isl_454729_Utah_20200416_null_1"],
["epi_isl_459321_England_20200430_null_6"],
["epi_isl_452415_Andalusia_20200314_null_2"],
["epi_isl_465797_England_20200318_null_2"],
["epi_isl_457580_England_20200505_null_1"],
["epi_isl_467350_Rio_de_Janeiro_20200417_null_9"],
["Node43"],
["epi_isl_469003_Balear_Islands_20200327_null_39"],
["epi_isl_426025_New_York_20200303_null_1"],
["epi_isl_468739_Ghent_20200313_null_1"],
["epi_isl_467349_Rio_de_Janeiro_20200417_null_8"],
["epi_isl_442715_England_20200406_null_3"],
["epi_isl_428720_Ankara_20200321_null_1"],
["epi_isl_450783_Gujarat_20200411_null_10"],
["epi_isl_467366_Rio_de_Janeiro_20200427_null_19"],
["epi_isl_442883_England_20200410_null_1"],
["epi_isl_435059_EC_20200320_null_1"],
["epi_isl_453012_Scotland_20200403_null_5"],
["epi_isl_460945_Gelderland_20200504_null_3"],
["epi_isl_465244_England_20200414_null_2"],
["epi_isl_465960_England_20200330_null_86"],
["epi_isl_455283_Netherlands_20200317_null_1"],
["epi_isl_460691_Netherlands_20200330_null_1"],
["Node445"],
["epi_isl_465694_Quebec_20200327_null_6"],
["epi_isl_460462_Massachusetts_20200326_null_2"],
["epi_isl_423992_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_429023_California_20200331_null_2"],
["epi_isl_459075_England_20200409_null_2"],
["epi_isl_454183_Portugal_20200417_null_3"],
["epi_isl_437634_Unknown_20200401_null_1"],
["epi_isl_432600_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_452668_Basque_Country_20200326_null_2"],
["epi_isl_464512_England_20200306_null_7"],
["epi_isl_448534_England_20200406_null_2"],
["epi_isl_423898_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_465682_Quebec_20200327_null_5"],
["epi_isl_448755_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1"],
["epi_isl_467149_Basque_Country_20200318_null_1"],
["epi_isl_468320_Sao_Paulo_20200413_null_5"],
["Node16"],
["epi_isl_467117_Basque_Country_20200317_null_4"],
["epi_isl_468768_Aragon_20200321_null_2"],
["epi_isl_452008_Denmark_20200311_null_1"],
["epi_isl_434980_Texas_20200331_null_1"],
["epi_isl_461732_Scotland_20200331_null_2"],
["epi_isl_467375_North_Sulawesi_20200323_null_4"],
["epi_isl_452101_Denmark_20200327_null_1"],
["epi_isl_460616_British_Columbia_20200301_null_2"],
["epi_isl_435534_New_York_20200420_null_2"],
["epi_isl_453636_England_20200422_null_2"],
["epi_isl_460029_Michigan_20200330_null_3"],
["epi_isl_441895_England_20200430_null_1"],
["epi_isl_444464_Gujarat_20200429_null_1"],
["epi_isl_458754_England_20200409_null_3"],
["epi_isl_465846_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_457491_England_20200507_null_1"],
["epi_isl_452163_Utah_20200415_null_2"],
["epi_isl_420349_Haulchin_20200305_null_2"],
["epi_isl_424171_Washington_20200319_null_1"],
["Node79"],
["epi_isl_454344_Portugal_20200325_null_1"],
["epi_isl_433749_England_20200406_null_2"],
["epi_isl_446270_Wales_20200402_null_4"],
["epi_isl_463101_Virginia_20200430_null_3"],
["epi_isl_440670_England_20200404_null_3"],
["epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1"],
["epi_isl_438187_Washington_20200417_null_5"],
["epi_isl_469137_Singapore_20200417_null_18"],
["epi_isl_449118_England_20200408_null_2"],
["epi_isl_439903_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_467325_British_Columbia_20200401_null_4"],
["epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_2"],
["epi_isl_450748_Minnesota_20200329_null_1"],
["epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1"],
["epi_isl_458571_England_20200507_null_1"]
],
"RESOLVED": [
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721359295384233],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720072713894318],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720458931811241],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[161.8629407046063, 411.2148466472154, 1.5, 4.5, 0.2824449739232975, 0.009267099642885164, 0.01094318465563717, 0.003845350454205925, 0.6174914437668519, 0.7023130100539682, 0.01047880584176355],
[162.0595725232944, 410.967175422817, 1, 0, 0.282813277223378, 0.006170570392293614, 0, -0.01415680319326778, 1, 0.282813277223378, 0.001720523993693296],
[162.1521427530765, 410.6910164070909, 1, 0, 0.283065513064351, 0.006167047706071878, 0, -0.01414872128634795, 1, 0.283065513064351, 0.001721838432740099],
[162.3025676523211, 410.528428536524, 0, 1, 0.2833341225110919, 0, 0.002435884899773833, 0.005588517905997514, 0.7166658774889081, 1, 0.001721085185753081],
[162.0297775480879, 410.8772987308548, 1, 0, 0.2828203460157598, 0.006171705072564306, 0, -0.01415940642834302, 1, 0.2828203460157599, 0.001721086021752008],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721362646517321],
[162.146480473175, 410.7605958057678, 0, 1, 0.2830240490767258, 0, 0.002434508105721173, 0.005585359202473847, 0.7169759509232743, 1, 0.001721116984958807],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.00172108513787594],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268022, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001722697508909046],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268022, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721717611810528],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085972629088],
[162.1058576381854, 410.7170042286966, 0, 1, 0.2829947413583802, 0, 0.002434766492996665, 0.005585952006311131, 0.7170052586416198, 1, 0.001721085179754264],
[162.2488531218916, 410.6582231570511, 0, 1, 0.2832027388729516, 0, 0.0024351150022328, 0.005586751572048711, 0.7167972611270483, 1, 0.001719884437891325],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001719886025352073],
[162.1058576381854, 410.8418414757468, 0, 1, 0.2829330807836096, 0, 0.002434026671694375, 0.005584254674636934, 0.7170669192163904, 1, 0.001721116997145365],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085180751891],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001720073468388832],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001720519420861986],
[162.2661521403436, 410.6409241385991, 0, 1, 0.2832329340287951, 0, 0.002435217586015565, 0.005586986924428005, 0.7167670659712049, 1, 0.00172106371750121],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001719883654932988],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721086035535622],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721350652072376],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721531964216007],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085137263206],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001719883607000394],
[162.1058576381854, 410.8854330528179, 1, 0, 0.2829115560250359, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829115560250359, 0.001725014928651322],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268022, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001722128652965406],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001721002628273341],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268022, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001720902332988837],
[162.2488531218916, 410.6582231570511, 0, 1, 0.2832027388729516, 0, 0.0024351150022328, 0.005586751572048711, 0.7167972611270483, 1, 0.001721360076411089],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001719884409516722],
[162.0297775480879, 410.8772987308548, 1, 0, 0.2828203460157598, 0.006171705072564306, 0, -0.01415940642834302, 1, 0.2828203460157599, 0.001721087704145808],
[162.1348437346244, 410.8361496630936, 0, 1, 0.2829721671827832, 0, 0.002434060393225013, 0.005584332040105971, 0.7170278328172168, 1, 0.001721116997256773],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721085137263206],
[161.7488531218915, 411.1582231570511, 0, 1, 0.2823299969908866, 0, 0.00243215371523295, 0.00557995765275269, 0.7176700030091134, 1, 0.00172108513915877],
[162.4455631360272, 411.0423291107316, 0, 1, 0.2832589237405043, 0, 0.002432839464887831, 0.005581530930794559, 0.7167410762594957, 1, 0.001721117037124077],
[161.7488531218916, 411.1582231570511, 0, 1, 0.2823299969908867, 0, 0.00243215371523295, 0.00557995765275269, 0.7176700030091133, 1, 0.001721086863400616],
[162.1285575392587, 410.778518739684, 0, 1, 0.2829927648865694, 0, 0.002434401884178646, 0.005585115504180686, 0.7170072351134306, 1, 0.001719883654933367],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720073450757203],
[162.1521427530765, 410.6352618586975, 1, 0, 0.2830930663759629, 0.006167047706071878, 0, -0.01414872128634795, 1, 0.283093066375963, 0.001721362691552947],
[162.5216432261248, 410.3854330528179, 1, 0, 0.283678889570906, 0.006153026637865384, 0, -0.0141165535140774, 1, 0.2836788895709059, 0.001726350250317255],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.2986406533701, 410.6084356255726, 0, 1, 0.2832896422008034, 0, 0.002435410267391302, 0.005587428982802175, 0.7167103577991966, 1, 0.0017201105037313],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720743486830041],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001722198932564581],
[162.1900720502461, 410.7170042286966, 0, 1, 0.2831001374667562, 0, 0.002434766492996665, 0.005585952006311131, 0.7168998625332438, 1, 0.001719883654932988],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.00172108597512993],
[162.1285575392587, 410.7785187396839, 0, 1, 0.2829927648865694, 0, 0.002434401884178647, 0.005585115504180687, 0.7170072351134306, 1, 0.001720519627652369],
[162.1285575392587, 410.7785187396839, 0, 1, 0.2829927648865694, 0, 0.002434401884178647, 0.005585115504180687, 0.7170072351134306, 1, 0.001721063142349674],
[162.0595725232944, 410.8475037556483, 1, 0, 0.2828723526612354, 0.006170570392293614, 0, -0.01415680319326778, 1, 0.2828723526612354, 0.00171988365571343],
[162.3025676523211, 410.5284285365241, 0, 1, 0.283334122511092, 0, 0.002435884899773833, 0.005588517905997513, 0.7166658774889081, 1, 0.001721086033281547],
[162.181937728283, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2830483512918952, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830483512918951, 0.001720075141353831],
[162.2488531218916, 410.822105801723, 0, 1, 0.2831217506234127, 0, 0.002434143601032596, 0.005584522939241901, 0.7168782493765873, 1, 0.001720638970930766],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720072659676096],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085138281071],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720075138542553],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721117040450948],
[161.7488531218915, 411.1582231570511, 0, 1, 0.2823299969908866, 0, 0.00243215371523295, 0.00557995765275269, 0.7176700030091134, 1, 0.001721085137263206],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001719883654932988],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721362647894004],
[162.6646387098309, 410.6582231570512, 0, 1, 0.2837225750603322, 0, 0.002435115002232799, 0.00558675157204871, 0.7162774249396677, 1, 0.001725013047825193],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085138605235],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720072713452879],
[162.1058576381854, 410.7170042286966, 1, 0, 0.2829947413583802, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829947413583802, 0.001726352972932069],
[161.181937728283, 411.7251385506597, 1, 0, 0.2813404553757076, 0.006204169115312278, 0, -0.01423388691147872, 1, 0.2813404553757075, 0.001721897328544478],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[161.6058576381854, 411.3012186407573, 0, 1, 0.2820804006957337, 0, 0.002431308137876999, 0.005578017690731054, 0.7179195993042663, 1, 0.001721002595281135],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720458307225106],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.00172007265856036],
[161.7488531218916, 411.1582231570511, 0, 1, 0.2823299969908867, 0, 0.00243215371523295, 0.00557995765275269, 0.7176700030091133, 1, 0.001721360966501251],
[162.1348437346244, 410.8361496630936, 0, 1, 0.2829721671827831, 0, 0.002434060393225013, 0.00558433204010597, 0.7170278328172168, 1, 0.001721350659862781],
[162.1521427530765, 410.7549335258662, 1, 0, 0.2830339324943619, 0.006167047706071878, 0, -0.01414872128634795, 1, 0.2830339324943618, 0.00172153213098904],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085137762869],
[162.0595725232944, 410.967175422817, 1, 0, 0.282813277223378, 0.006170570392293614, 0, -0.01415680319326778, 1, 0.282813277223378, 0.001719884416481997],
[162.1348437346244, 410.8361496630936, 0, 1, 0.2829721671827832, 0, 0.002434060393225013, 0.005584332040105971, 0.7170278328172168, 1, 0.001721567916212289],
[162.1521427530765, 410.7549335258662, 1, 0, 0.2830339324943619, 0.006167047706071878, 0, -0.01414872128634795, 1, 0.2830339324943618, 0.001721532065248216],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720072713939876],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720073464626625],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721116047507255],
[162.00888587209, 410.8981904068526, 1, 0, 0.2827838799345002, 0.006172500937939443, 0, -0.01416123233887768, 1, 0.2827838799345002, 0.001721087705948316],
[161.9861859710167, 410.920890307926, 0, 1, 0.2827442576257294, 0, 0.002433558438098983, 0.005583180431830028, 0.7172557423742707, 1, 0.001721085138625468],
[162.181937728283, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2830483512918952, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830483512918951, 0.001720073462681104],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001725013039512708],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721087741084095],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001721085143846509],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001719883655688956],
[162.1058576381854, 410.8854330528179, 1, 0, 0.2829115560250359, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829115560250359, 0.001725013948563216],
[162.4861859710167, 410.420890307926, 0, 1, 0.2836169995077943, 0, 0.002436523148833217, 0.005589982206013161, 0.7163830004922057, 1, 0.001720076779579963],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720459931792686],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.00172188505225784],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720994391223813],
[162.1849360031162, 410.7860573946018, 0, 1, 0.2830595926704065, 0, 0.002434357208573412, 0.005585013007375588, 0.7169404073295935, 1, 0.001719883654933367],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721360916210981],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.00172391105025975],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.00172115445679377],
[162.2661521403436, 410.6815469735886, 0, 1, 0.2832128523969804, 0, 0.002434976704868386, 0.005586434283946366, 0.7167871476030196, 1, 0.00172007265856036],
[162.1058576381854, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2828739968517703, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7171260031482296, 1, 0.001720072659676096],
[161.9861859710167, 410.920890307926, 0, 1, 0.2827442576257294, 0, 0.002433558438098983, 0.005583180431830028, 0.7172557423742707, 1, 0.001721085980768667],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720102314576755],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720040512329536],
[162.1058576381854, 410.9011841666537, 0, 1, 0.2829037792059058, 0, 0.002433675147537222, 0.005583448191930455, 0.7170962207940943, 1, 0.001721360916885056],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721087757138433],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721116000181658],
[162.4628621544793, 410.4442141244634, 0, 1, 0.2835762881647106, 0, 0.002436384691481506, 0.005589664550860685, 0.7164237118352894, 1, 0.001719883655688956],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720072713432785],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001728708507642108],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[161.3918486055977, 411.515227673345, 1, 0, 0.2817068514039747, 0.006196099794629381, 0, -0.01421537390902537, 1, 0.2817068514039747, 0.001721896514414709],
[161.7488531218915, 411.1582231570511, 0, 1, 0.2823299969908866, 0, 0.00243215371523295, 0.00557995765275269, 0.7176700030091134, 1, 0.001721002586601584],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720458431767392],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398375, 0.006165914737530044, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720072713432785],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001721085180232246],
[162.2488531218916, 410.7221402758265, 0, 1, 0.2831711465178295, 0, 0.002434736046438683, 0.00558588215443329, 0.7168288534821705, 1, 0.001720638080570791],
[162.6535227994208, 410.2535534795219, 0.5, 1.5, 0.2839090832249145, 0.003074018880098799, 0.003656275460085378, 0.001335839523222953, 0.7160909167750856, 0.4872137989122175, 0.003447152900296158],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268022, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721360121744605],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001719883654932988],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001722984604468076],
[162.1849360031162, 410.7221402758265, 0, 1, 0.2830911725798793, 0, 0.002434736046438683, 0.00558588215443329, 0.7169088274201207, 1, 0.001719886124297224],
[162.0595725232943, 410.8475037556483, 1, 0, 0.2828723526612354, 0.006170570392293615, 0, -0.01415680319326778, 1, 0.2828723526612353, 0.001719883655688956],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721360922083124],
[162.3025676523211, 410.528428536524, 0, 1, 0.2833341225110919, 0, 0.002435884899773833, 0.005588517905997514, 0.7166658774889081, 1, 0.001721087711629847],
[162.1646387098309, 411.1582231570511, 0, 1, 0.2828504661087166, 0, 0.00243215371523295, 0.00557995765275269, 0.7171495338912834, 1, 0.001720638087409538],
[162.0297775480879, 410.8772987308548, 1, 0, 0.2828203460157598, 0.006171705072564306, 0, -0.01415940642834302, 1, 0.2828203460157599, 0.001721085181628147],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721086055535745],
[161.9861859710167, 410.920890307926, 0, 1, 0.2827442576257294, 0, 0.002433558438098983, 0.005583180431830028, 0.7172557423742707, 1, 0.001723911105892749],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721154584391969],
[162.2255293053541, 410.6815469735886, 0, 1, 0.283162027529868, 0, 0.002434976704868386, 0.005586434283946366, 0.716837972470132, 1, 0.001719883620460425],
[162.1521427530765, 410.7549335258662, 1, 0, 0.2830339324943619, 0.006167047706071878, 0, -0.01414872128634795, 1, 0.2830339324943618, 0.00172136013608457],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720074294480023],
[162.812350523862, 410.0947257550806, 1, 3, 0.2841863144392204, 0.006142040187875296, 0.007315383036141945, 0.002691936518848293, 0.6794727230976063, 0.7374572744835375, 0.00692472874410148],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.4861859710167, 410.420890307926, 0, 1, 0.2836169995077943, 0, 0.002436523148833217, 0.005589982206013161, 0.7163830004922057, 1, 0.001721955267294886],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001725811890360624],
[162.0297775480879, 410.8772987308548, 1, 0, 0.2828203460157598, 0.006171705072564306, 0, -0.01415940642834302, 1, 0.2828203460157599, 0.001721085197022275],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001719883620460425],
[161.7488531218916, 411.1582231570511, 0, 1, 0.2823299969908867, 0, 0.00243215371523295, 0.00557995765275269, 0.7176700030091133, 1, 0.001721362710046215],
[162.146480473175, 410.7605958057678, 0, 1, 0.2830240490767258, 0, 0.002434508105721173, 0.005585359202473847, 0.7169759509232743, 1, 0.001721116983253362],
[162.0267792732546, 410.8802970056881, 0, 1, 0.282815112575718, 0, 0.002433798863775053, 0.005583732027349135, 0.7171848874242821, 1, 0.001721360136120198],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721360072339785],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720075080358037],
[162.1348437346244, 411.1880181322576, 0, 1, 0.2827984971795351, 0, 0.002431977479651054, 0.005579553325066604, 0.7172015028204649, 1, 0.0017211170426138],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720072623816788],
[162.0831577371121, 410.8239185418306, 0, 1, 0.2829135202690278, 0, 0.002434132860495022, 0.005584498297812187, 0.7170864797309722, 1, 0.001721360123524607],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085136030534],
[162.0297775480879, 410.8772987308548, 1, 0, 0.2828203460157598, 0.006171705072564306, 0, -0.01415940642834302, 1, 0.2828203460157599, 0.001721087698948354],
[163.0216432261248, 409.8854330528179, 0, 1, 0.2845516314529709, 0, 0.002439706121176402, 0.005597284725904735, 0.7154483685470291, 1, 0.001720639033975737],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001719883612440171],
[162.1058576381854, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2828739968517703, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7171260031482296, 1, 0.001720072713311762],
[161.8867820643817, 410.8599997124028, 1, 0, 0.2826498327274296, 0.006177156573550916, 0, -0.01417191350980695, 1, 0.2826498327274296, 0.00172108522709037],
[161.3923266556659, 411.3899123762266, 0, 6, 0.28176908370701, 0, 0.01458470375547966, 0.03346089057768493, 0.1372728253884817, 1, 0.01050038673673802],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[161.3918486055977, 411.515227673345, 0, 1, 0.2817068514039747, 0, 0.002430043732898715, 0.005575116835332581, 0.7182931485960253, 1, 0.001721986181188771],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[161.7488531218915, 411.1582231570511, 0, 1, 0.2823299969908866, 0, 0.00243215371523295, 0.00557995765275269, 0.7176700030091134, 1, 0.001721553499724207],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721838196833317],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085138282517],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.0017200726721321],
[162.2661521403436, 410.6409241385991, 0, 1, 0.2832329340287951, 0, 0.002435217586015565, 0.005586986924428005, 0.7167670659712049, 1, 0.001720075125619037],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721116995301326],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001719885240493599],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001719883654932988],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001722319435564569],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001720912600026213],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001719884357117983],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001728962926575196],
[162.0595725232944, 410.8475037556483, 1, 0, 0.2828723526612354, 0.006170570392293614, 0, -0.01415680319326778, 1, 0.2828723526612354, 0.001719883654933367],
[162.2488531218916, 410.6582231570511, 0, 1, 0.2832027388729516, 0, 0.0024351150022328, 0.005586751572048711, 0.7167972611270483, 1, 0.001721360966902996],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721350798502146],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721532037083512],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268022, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721360067556314],
[162.181937728283, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2830483512918952, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830483512918951, 0.001720072712824405],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001721916812496052],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721032701344685],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.0017219351029474],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721087737950317],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721117043549237],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721085137593751],
[162.0595725232944, 410.8475037556483, 1, 0, 0.2828723526612354, 0.006170570392293614, 0, -0.01415680319326778, 1, 0.2828723526612354, 0.001719883654932988],
[162.1058576381854, 410.7170042286966, 0, 1, 0.2829947413583802, 0, 0.002434766492996665, 0.005585952006311131, 0.7170052586416198, 1, 0.001721116990313358],
[162.0297775480879, 410.8772987308548, 1, 0, 0.2828203460157598, 0.006171705072564306, 0, -0.01415940642834302, 1, 0.2828203460157599, 0.001721087749399598],
[161.9455631360272, 410.920890307926, 0, 1, 0.2826933959257771, 0, 0.002433558438098983, 0.005583180431830028, 0.7173066040742229, 1, 0.001721085145720202],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398375, 0.006165914737530044, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.00172007351322148],
[162.5216432261248, 410.9453573446362, 0, 1, 0.2834019098995583, 0, 0.002433413547877991, 0.005582848018096317, 0.7165980901004416, 1, 0.001729313605274833],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001719886042500989],
[162.0297775480879, 410.8772987308548, 1, 0, 0.2828203460157598, 0.006171705072564306, 0, -0.01415940642834302, 1, 0.2828203460157599, 0.001721085132333631],
[162.3566527477699, 410.9662091191121, 0, 1, 0.2831853804313615, 0, 0.002433290080329124, 0.005582564753231169, 0.7168146195686385, 1, 0.001719883656972545],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.2745079580651, 410.3932249865402, 1, 0, 0.2833659007181431, 0.006162397363475103, 0, -0.0141380522588937, 1, 0.283365900718143, 0.001721548899218256],
[162.2745079580651, 410.3932249865402, 1, 0, 0.283365900718143, 0.006162397363475103, 0, -0.0141380522588937, 1, 0.283365900718143, 0.001721548893570877],
[162.1521427530765, 410.6352618586976, 1, 0, 0.2830930663759629, 0.006167047706071878, 0, -0.01414872128634795, 1, 0.283093066375963, 0.001721324263253338],
[162.1348437346244, 411.1880181322576, 0, 1, 0.2827984971795351, 0, 0.002431977479651054, 0.005579553325066604, 0.7172015028204649, 1, 0.001721121962287734],
[162.1058576381854, 410.8239185418306, 1, 0, 0.282941931765214, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.282941931765214, 0.001719883654933367],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001719884445467181],
[161.9861859710167, 410.9208903079259, 0, 1, 0.2827442576257294, 0, 0.002433558438098984, 0.005583180431830028, 0.7172557423742707, 1, 0.001721532065248216],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.00172156795302486],
[162.2661521403436, 410.640924138599, 0, 1, 0.2832329340287951, 0, 0.002435217586015565, 0.005586986924428006, 0.7167670659712049, 1, 0.001719883654932988],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720072659676096],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720075135087074],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720965631507064],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085143846509],
[162.0595725232944, 410.8475037556483, 1, 0, 0.2828723526612354, 0.006170570392293614, 0, -0.01415680319326778, 1, 0.2828723526612354, 0.001719884444653637],
[162.1348437346244, 410.9361151889901, 0, 1, 0.2829228059979839, 0, 0.002433468276547314, 0.005582973579098198, 0.7170771940020161, 1, 0.001721567970270323],
[162.1521427530765, 410.7549335258662, 1, 0, 0.2830339324943619, 0.006167047706071878, 0, -0.01414872128634795, 1, 0.2830339324943618, 0.001721532062275812],
[162.1521427530765, 410.7549335258662, 1, 0, 0.2830339324943619, 0.006167047706071878, 0, -0.01414872128634795, 1, 0.2830339324943618, 0.001721360085228407],
[161.9628621544793, 410.9442141244634, 0, 1, 0.2827035462826457, 0, 0.002433420317476786, 0.005582863549217713, 0.7172964537173543, 1, 0.001719884400307342],
[161.8829280095557, 410.9602311506117, 0, 1, 0.2825955506685087, 0, 0.002433325475801362, 0.005582645959133144, 0.7174044493314913, 1, 0.001722606621660771],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.00888587209, 410.8981904068526, 1, 0, 0.2827838799345002, 0.006172500937939443, 0, -0.01416123233887768, 1, 0.2827838799345002, 0.00172099066246368],
[162.0768715417464, 410.7662876184209, 0, 1, 0.2829341137273311, 0, 0.002434474371784241, 0.005585281808541728, 0.7170658862726689, 1, 0.001721314791753368],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720072713432785],
[162.0595725232944, 410.8475037556483, 1, 0, 0.2828723526612354, 0.006170570392293614, 0, -0.01415680319326778, 1, 0.2828723526612354, 0.001719884373710997],
[162.2661521403436, 410.6409241385991, 0, 1, 0.2832329340287951, 0, 0.002435217586015565, 0.005586986924428005, 0.7167670659712049, 1, 0.00171988606772187],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.00172635123398418],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720072611379921],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721360922077271],
[162.0831577371121, 410.8239185418306, 0, 1, 0.2829135202690278, 0, 0.002434132860495022, 0.005584498297812187, 0.7170864797309722, 1, 0.00172108513796024],
[162.2661521403436, 410.6409241385991, 0, 1, 0.2832329340287951, 0, 0.002435217586015565, 0.005586986924428005, 0.7167670659712049, 1, 0.001719886135862237],
[162.8786477424187, 410.028428536524, 0, 1, 0.2843020351578179, 0, 0.002438855285154754, 0.005595332699213126, 0.7156979648421821, 1, 0.001720638042185419],
[162.5216432261248, 410.3854330528179, 0, 1, 0.283678889570906, 0, 0.00243673366415834, 0.005590465179844989, 0.7163211104290941, 1, 0.001721085138308546],
[162.0595725232944, 410.8475037556483, 1, 0, 0.2828723526612354, 0.006170570392293614, 0, -0.01415680319326778, 1, 0.2828723526612354, 0.001719884414221565],
[162.1849360031162, 410.7221402758265, 0, 1, 0.2830911725798793, 0, 0.002434736046438683, 0.00558588215443329, 0.7169088274201207, 1, 0.001719884458098358],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721532113732677],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721350180894335],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001721085138281071],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001721086020268195],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[162.4628621544793, 410.2839196223052, 2, 1, 0.2836556525913325, 0.01231050575791458, 0.002437336566640412, -0.02265147372911655, 0.9771769160685938, 0.1957354198782324, 0.0052146614615802],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001720026742093474],
[162.181937728283, 410.7251385506597, 1, 0, 0.2830859391398374, 0.006165914737530045, 0, -0.0141461219783989, 1, 0.2830859391398375, 0.001720074332299337],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001719886110519246],
[161.9455631360272, 410.9615131429155, 0, 1, 0.2826733511268023, 0, 0.002433317885055191, 0.005582628544098097, 0.7173266488731977, 1, 0.001721117035260279],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 0, 1, 0.2829531425777986, 0, 0.002434267364904029, 0.005584806883943756, 0.7170468574222013, 1, 0.001721085185754516],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001721085180232246],
[162.2661521403436, 410.6409241385991, 0, 1, 0.2832329340287951, 0, 0.002435217586015565, 0.005586986924428005, 0.7167670659712049, 1, 0.001719886068335483],
[162.0885586197334, 411.2343032471487, 0, 1, 0.282717765853489, 0, 0.002431703756481151, 0.005578925336922979, 0.717282234146511, 1, 0.001725013015934851],
[162.1058576381854, 410.7170042286966, 0, 1, 0.2829947413583802, 0, 0.002434766492996665, 0.005585952006311131, 0.7170052586416198, 1, 0.001721085138308546],
[161.7488531218915, 411.1582231570511, 0, 1, 0.2823299969908866, 0, 0.00243215371523295, 0.00557995765275269, 0.7176700030091134, 1, 0.001721086021625864],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001723911475716147],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.001721153818512912],
[161.9861859710167, 410.920890307926, 0, 1, 0.2827442576257294, 0, 0.002433558438098983, 0.005583180431830028, 0.7172557423742707, 1, 0.001721085145725337],
[162.1058576381854, 410.8012186407573, 1, 0, 0.2829531425777986, 0.006168808546276994, 0, -0.01415276108601862, 1, 0.2829531425777987, 0.00172108597416783],
[162.3249332119891, 410.7424375691118, 1, 0, 0.2832562827486363, 0.006160483052187951, 0, -0.01413366035888771, 1, 0.2832562827486362, 0.00172062960034856],
[161.9091476240498, 411.1582231570512, 0, 1, 0.2825307387565353, 0, 0.002432153715232949, 0.005579957652752688, 0.7174692612434648, 1, 0.001721760432860518]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.147122736898693, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4358731493299284],
[0.285426730541701, 2.714573269458297, 0, 1, 0.0951422435139004, 0, 0.3683820257316369, 0.8451587951631199, 0.9048577564860996, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.294245473797386, 1, 0.3333333333333333, 0.4358731493299284],
[1.00077672756796, 1.830583609154187, 1, 1, 0.3534614491091426, 0.9992238752695144, 0.5462738740799966, -1.039178490085571, 0.8750650039936649, 0.5819879022119502, 0.4358731493299284],
[0.6214388028056298, 2.050795907850802, 0, 0, 0.2325539745170715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6803118234687434, 2.319688176531257, 1, 0, 0.2267706078229144, 1.469914185676275, 0, -3.372343967358364, 1, 0.2267706078229145, 0.4358731493299284],
[0.6808046552244523, 2.319195344775548, 2, 3, 0.2269348850748174, 2.937700241401296, 1.29355209631569, -3.772079440115019, 0.9193014382856032, 0.3186294092781765, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.147122736898693, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4358731493299284],
[0.9993670624452855, 2.000632937554714, 1, 1, 0.3331223541484286, 1.000633338418384, 0.4998418156717225, -1.148938684377629, 0.889029497166609, 0.5552742054634661, 0.4358731493299284],
[1.001641767558349, 1.9980257040977, 1, 2, 0.3339176015418019, 0.9983609234243986, 1.000988123375115, 0.006027441595692749, 0.7399613754923455, 0.7044820454424343, 0.4358731493299284],
[1.000776728707891, 1.830827325107594, 1, 1, 0.3534310269683998, 0.9992238741313523, 0.5462011552297714, -1.039345322367337, 0.8750865091760622, 0.5819485631128618, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 2.000632565230687, 0, 1, 0.2535074450251916, 0, 0.4998419086938601, 1.146760036635134, 0.7464925549748085, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.294245473797386, 1, 0.3333333333333333, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 3, 0.3333333333333333, 1, 1.5, 1.147122736898693, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.4358731493299284],
[0.6836820954188967, 2.314400187088772, 0, 1, 0.228039803779851, 0, 0.4320773933473778, 0.9912916040173939, 0.771960196220149, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 1, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0.5000000000000002, -3.441368210696079, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.4358731493299284],
[0.9993663639069666, 2.000633636093033, 1, 1, 0.3331221213023223, 1.000634037842295, 0.499841641147684, -1.148940689428755, 0.8890296522990407, 0.5552738949036855, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.147122736898693, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4358731493299284],
[0.7139405699351528, 1.456133768602744, 0, 1, 0.3289936004755373, 0, 0.6867500923074984, 1.575573290906415, 0.6710063995244626, 1, 0.4358731493299284],
[0.7138263990716337, 1.958803097888056, 1, 1, 0.2670876752215985, 1.400900837095054, 0.5105158354498117, -2.042761759961675, 0.9286641737447219, 0.462839524187919, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.147122736898693, 0.6666666666666667, 1, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2535672939978582, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6216215930320754, 2.050613117624356, 1, 0, 0.2326223780243371, 1.608695726160852, 0, -3.690742888461732, 1, 0.2326223780243372, 0.4358731493299284],
[0.622428399000959, 1.547641046568569, 0, 1, 0.2868241844848448, 0, 0.6461446613975514, 1.482414464829676, 0.7131758155151553, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.147122736898693, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4358731493299284],
[0.9988942276186653, 2.001105772381334, 0, 2, 0.3329647425395552, 0, 0.9994474193235583, 2.292977718081551, 0.4449360346953218, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.294245473797386, 0.4444444444444445, 1, 0.4358731493299284],
[0.6791819707060975, 2.320313007283778, 0, 2, 0.2264321079681401, 0, 0.8619526735064312, 1.977531019819685, 0.5984072835826153, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6800434913871313, 2.319956508612869, 0, 1, 0.2266811637957104, 0, 0.4310425632064596, 0.9889174496504434, 0.7733188362042897, 1, 0.4358731493299284],
[0.9993670624454071, 2.000632937554593, 2, 1, 0.3331223541484691, 2.001266676836525, 0.4998418156717528, -3.444637191974147, 0.9630332448550923, 0.2589779982104391, 0.4358731493299284],
[0.7143906360308537, 1.957844074625576, 1, 1, 0.2673382817691807, 1.399794383582613, 0.5107659046807611, -2.039649563797549, 0.9285302431007022, 0.4632068066390636, 0.4358731493299284],
[0.9993670507147611, 2.000632949285238, 0, 1, 0.3331223502382538, 0, 0.4998418127409468, 1.146759816495597, 0.6668776497617462, 1, 0.4358731493299284],
[0.9993670507128524, 2.000632949287147, 0, 1, 0.3331223502376175, 0, 0.4998418127404698, 1.146759816494503, 0.6668776497623825, 1, 0.4358731493299284],
[0.9988937264567074, 2.001106273543292, 0, 2, 0.3329645754855692, 0, 0.9994471690194978, 2.292977143822593, 0.4449362575571469, 1, 0.4358731493299284],
[0.7138263990641003, 2.158339363385268, 1, 0, 0.2485324518510216, 1.400900837109839, 0, -3.214010404778216, 1, 0.2485324518510216, 0.4358731493299284],
[0.6215532591866708, 2.250864890544888, 0, 1, 0.2163867608359033, 0, 0.4442736675136109, 1.019272850820466, 0.7836132391640966, 1, 0.4358731493299284],
[1.300849798489226, 1.617904531531736, 0, 0, 0.4456866359423555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6214388028056298, 2.250726959643738, 0, 0, 0.2163659252994054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6217508330087117, 2.250667135863605, 0, 1, 0.2164555575638615, 0, 0.4443127035825711, 1.019362409144993, 0.7835444424361385, 1, 0.4358731493299284],
[0.9993670624451817, 2.000632937554818, 0, 1, 0.333122354148394, 0, 0.4998418156716966, 1.146759823219457, 0.666877645851606, 1, 0.4358731493299284],
[1.300849798489226, 1.617904531531736, 0, 0, 0.4456866359423555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 2.320589004316404, 0, 0, 0.226470331894532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.147122736898693, 0.6666666666666667, 1, 0.4358731493299284],
[0.7138263991478774, 2.158339363301491, 1, 0, 0.2485324518801902, 1.400900836945424, 0, -3.214010404401009, 1, 0.2485324518801901, 0.4358731493299284],
[0.9993670614819351, 2.000632938518065, 1, 1, 0.3331223538273118, 1.000633339382955, 0.4998418154310372, -1.148938687142783, 0.8890294973805513, 0.5552742050351749, 0.4358731493299284],
[0.7140090325877355, 1.958225678068694, 0, 0, 0.2671954786532731, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 2.320589004316404, 0, 0, 0.226470331894532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.8312707665054745, 2.168729233494527, 1, 0, 0.2770902555018247, 1.202977465698494, 0, -2.759925605759018, 1, 0.2770902555018246, 0.4358731493299284],
[0.9987339605648869, 2.001105636441753, 2, 3, 0.332929121130831, 2.002535288645631, 1.499171230827385, -1.154840711321796, 0.7907219263793656, 0.5382959645871519, 0.4358731493299284],
[0.6797114858504284, 2.320288514149572, 1, 0, 0.2265704952834761, 1.471212449424537, 0, -3.375322503086608, 1, 0.2265704952834761, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999667465509977, 0, 2, 0.3333702857059819, 0, 1.000166294894405, 2.29462699510619, 0.4443951759797242, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.147122736898693, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4358731493299284],
[0.005116007642839379, 2.994883992357161, 0, 2, 0.00170533588094646, 0, 0.6678054993461952, 1.532109744252011, 0.996592236408574, 1, 0.4358731493299284],
[0.7140090325877355, 1.454419791533556, 0, 0, 0.3292748300729087, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.999366898067604, 2.000633101932395, 0, 2, 0.3331222993558681, 0, 0.9996835492066068, 2.293519457996963, 0.4447258676164044, 1, 0.4358731493299284],
[0.6214388028056298, 2.250726959643738, 0, 0, 0.2163659252994054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[1.301032588987036, 1.617249130267659, 1, 0, 0.4458214504798764, 0.7686202547613239, 0, -1.76340354055516, 1, 0.4458214504798763, 0.4358731493299284],
[0.7138263990673318, 1.958408311589098, 1, 0, 0.2671271337883271, 1.400900837103497, 0, -3.214010404763666, 1, 0.2671271337883272, 0.4358731493299284],
[0.6217360976568347, 2.250682118198184, 1, 1, 0.2164504090055582, 1.608399453994622, 0.444309745882979, -2.670707543929257, 0.9531492204413266, 0.386050038452443, 0.4358731493299284],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.294245473797386, 1, 0.3333333333333333, 0.4358731493299284],
[0.6797112281696974, 2.320288771830302, 1, 0, 0.2265704093898991, 1.471213007165947, 0, -3.375323782682315, 1, 0.2265704093898991, 0.4358731493299284],
[0.7138263991479602, 1.454602424973331, 1, 0, 0.3291906062156422, 1.400900836945262, 0, -3.214010404400636, 1, 0.3291906062156422, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999103673570381, 2.000089632642961, 1, 2, 0.3333034557856795, 1.000089640677693, 0.9999551856869323, -0.0003084727539814452, 0.7407805765782245, 0.7036638651881363, 0.4358731493299284],
[0.7162204664440032, 1.453853872124314, 0, 1, 0.3300442080323026, 0, 0.6878270362473494, 1.578044064665951, 0.6699557919676975, 1, 0.4358731493299284],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6797112286112952, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2536509237838816, 1.471213006210123, 0, -3.37532378048942, 1, 0.2536509237838815, 0.4358731493299284],
[0.7143210632388223, 2.157844699210546, 0, 1, 0.2487046787402872, 0, 0.4634253801331731, 1.063211580813365, 0.7512953212597128, 1, 0.4358731493299284],
[0.621621593026675, 1.546807231094615, 1, 0, 0.2866691247191727, 1.608695726174828, 0, -3.690742888493796, 1, 0.2866691247191726, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.294245473797386, 0.4444444444444445, 1, 0.4358731493299284],
[0.8718534643754203, 2.000312298073948, 0, 1, 0.3035526276978903, 0, 0.4999219376708706, 1.146943642753413, 0.6964473723021097, 1, 0.4358731493299284],
[0.9955052164511525, 2.003182614448189, 1, 2, 0.3319802769041781, 1.004515077846474, 0.9984112210113876, -0.0140037459166032, 0.7425429802636663, 0.7018959644643052, 0.4358731493299284],
[0.621736097660114, 2.051145900199908, 1, 1, 0.2326088836536337, 1.608399453986139, 0.4875323593034207, -2.571544258704252, 0.9458931072454101, 0.4111108745526778, 0.4358731493299284],
[0.8312707662118187, 2.168729233788182, 1, 0, 0.2770902554039394, 1.202977466123459, 0, -2.759925606733994, 1, 0.2770902554039394, 0.4358731493299284],
[0.6217360832160033, 2.250682100780206, 1, 1, 0.2164504063788589, 1.608399491352315, 0.4443097493214821, -2.670707621748203, 0.953149221578427, 0.3860500343361445, 0.4358731493299284],
[0.7795955326672617, 2.220404467332739, 0, 0, 0.2598651775557539, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.997971235675325, 1, 1, 0.3335589041349621, 1, 0.5005077060891692, -1.145957934501598, 0.8887384574722832, 0.5558562657422073, 0.4358731493299284],
[0.7140090325877355, 2.158156729861633, 0, 0, 0.2485960392407269, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.147122736898693, 0.6666666666666667, 1, 0.4358731493299284],
[0.9995274652063887, 2.000472534793611, 0, 1, 0.333175821735463, 0, 0.4998818942061457, 1.146851773215713, 0.666824178264537, 1, 0.4358731493299284],
[0.6746836764716071, 2.325316323528393, 0, 2, 0.224894558823869, 0, 0.8600980347332856, 1.973276023208867, 0.6007884449408447, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.294245473797386, 0.4444444444444445, 1, 0.4358731493299284],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6214388028056298, 1.54699002131566, 0, 0, 0.2865848285601234, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9871687403588663, 2.012831259641133, 2, 2, 0.3290562467862889, 2.025996081756943, 0.9936252680995125, -2.368512066514084, 0.8926541576626641, 0.3998040119653988, 0.4358731493299284],
[0.01527319571260322, 2.984726804287397, 0, 3, 0.005091065237534405, 0, 1.005117116813058, 2.305985395884635, 0.9848044291681139, 1, 0.4358731493299284],
[0.9991001868470174, 2.000899813152982, 1, 1, 0.3330333956156726, 1.000900623545895, 0.4997751478742047, -1.149704854364337, 0.8890887574046948, 0.5551555486360401, 0.4358731493299284],
[0.8315711758787103, 2.168428824121291, 0, 0, 0.27719039195957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9995274654356548, 2.000472534564344, 1, 2, 0.333175821811885, 1.000472757958821, 0.9997637885268706, -0.001626549910313472, 0.7409507312849768, 0.703493638718106, 0.4358731493299284],
[0.004331272875711562, 2.995668727124288, 0.5, 1.5, 0.001443757625237187, 115.4395057406439, 0.5007229225375447, -263.6977822442211, 0.9985562423747628, 0.002885430814393963, 0.4358731493299284],
[0.9987338083599383, 2.001266191640061, 0, 2, 0.3329112694533128, 0, 0.9993673047366959, 2.292793915553257, 0.4450073744223906, 1, 0.4358731493299284],
[0.8721657624493685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3036613603058864, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6214388028056298, 2.250726959643738, 0, 0, 0.2163659252994054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[1.300849798489226, 1.617904531531736, 0, 0, 0.4456866359423555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6797112281781273, 2.320288771821873, 1, 0, 0.2265704093927091, 1.471213007147701, 0, -3.375323782640454, 1, 0.2265704093927091, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 2.320589004316404, 0, 1, 0.226470331894532, 0, 0.4309250789950108, 0.9886479120300843, 0.773529668105468, 1, 0.4358731493299284],
[0.6803437248035, 2.3196562751965, 1, 1, 0.2267812416011667, 1.469845261362298, 0.4310983531020298, -2.383140392697149, 0.9485702684578332, 0.4021327516601666, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.294245473797386, 0.4444444444444445, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.294245473797386, 1, 0.3333333333333333, 0.4358731493299284],
[0.8312707666607192, 2.168729233339282, 1, 1, 0.2770902555535729, 1.202977465473831, 0.4610995160794041, -1.702050127508249, 0.9232209902772557, 0.4774015013844015, 0.4358731493299284],
[0.831270766649428, 2.168729233350573, 1, 1, 0.2770902555498093, 1.202977465490171, 0.4610995160770035, -1.702050127551244, 0.9232209902793415, 0.4774015013789599, 0.4358731493299284],
[0.7606566656626348, 2.239343334337366, 0, 0, 0.2535522218875448, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9535404061946604, 2.04645959380534, 1, 1, 0.3178468020648867, 1.048723256511749, 0.4886487879003391, -1.284948314601202, 0.8989734104171248, 0.5346670145468981, 0.4358731493299284],
[0.8312707666521151, 2.168729233347886, 1, 0, 0.2770902555507049, 1.202977465486282, 0, -2.759925605272153, 1, 0.2770902555507049, 0.4358731493299284],
[0.6797112281803014, 2.320288771819699, 1, 0, 0.2265704093934338, 1.471213007142995, 0, -3.375323782629657, 1, 0.2265704093934338, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.8721657624493685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3036613603058864, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6797112281781273, 2.320288771821873, 1, 0, 0.2265704093927091, 1.471213007147701, 0, -3.375323782640454, 1, 0.2265704093927091, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.294245473797386, 1, 0.3333333333333333, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 2.239343334337366, 0, 0, 0.2327742998770015, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.147122736898693, 0.6666666666666667, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 1, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0.5000000000000002, -3.441368210696079, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.4358731493299284],
[1.300849798489226, 1.617904531531736, 0, 0, 0.4456866359423555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.8315711758787103, 2.168428824121291, 0, 0, 0.27719039195957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.2873996484322468, 2.712600351567751, 0, 1, 0.095799882810749, 0, 0.3686499559074556, 0.8457734927562857, 0.904200117189251, 1, 0.4358731493299284],
[0.2859909674122645, 2.714009032587733, 0, 0, 0.0953303224707549, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.147122736898693, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4358731493299284],
[0.9987332993375463, 2.001266700662453, 0, 2, 0.3329110997791822, 0, 0.9993670505475188, 2.292793332380888, 0.4450076007978202, 1, 0.4358731493299284],
[0.9985903348993305, 2.001409665100669, 0, 2, 0.3328634449664435, 0, 0.9992956638886832, 2.292629553861965, 0.4450711830620415, 1, 0.4358731493299284],
[0.9985903341749878, 2.001409665825011, 0, 1, 0.332863444724996, 0, 0.499647831763511, 1.146314776516112, 0.6671365552750039, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -4.588490947594773, 1, 0.1111111111111109, 0.4358731493299284],
[0.714573516715727, 2.157844562786743, 0, 1, 0.2487707210224418, 0, 0.4634254094319715, 1.063211648032001, 0.7512292789775582, 1, 0.4358731493299284],
[1.830706135822286, 1.168660926590087, 1, 0, 0.6103641527455662, 0.546237312713674, 0, -1.253202482312594, 1, 0.6103641527455662, 0.4358731493299284],
[0.0005647209908140288, 2.999435279009186, 0, 1, 0.000188240330271343, 0, 0.3333960919237883, 0.7648924748778883, 0.9998117596697287, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999103530360249, 2.000089646963974, 1, 1, 0.3333034510120084, 1.000089655001274, 0.4999775892635338, -1.14737984321027, 0.8889088095434857, 0.5555157115675025, 0.4358731493299284],
[0.2890416073840367, 2.710958392615961, 0, 1, 0.09634720246134566, 0, 0.3688732378644299, 0.8462857563754547, 0.9036527975386544, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999667471664056, 1, 1, 0.3333702850220437, 1, 0.5000831459081712, -1.146931979775207, 0.8888642530643214, 0.5556048231084088, 0.4358731493299284],
[0.8312707662127259, 2.168729233787275, 1, 0, 0.2770902554042419, 1.202977466122146, 0, -2.759925606730981, 1, 0.2770902554042418, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2535672939978582, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.8315711758787103, 2.168428824121291, 0, 0, 0.27719039195957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.679711228318289, 2.000632565210962, 1, 1, 0.2535910616985825, 1.471213006844326, 0.4998419086987881, -2.228563745297996, 0.9356915734265856, 0.4428736968237509, 0.4358731493299284],
[0.7143210629365317, 2.157844699512836, 0, 1, 0.248704678635039, 0, 0.4634253800682523, 1.063211580664421, 0.751295321364961, 1, 0.4358731493299284],
[0.6797112283162077, 2.320288771683793, 1, 0, 0.2265704094387359, 1.471213006848831, 0, -3.375323781954771, 1, 0.2265704094387359, 0.4358731493299284],
[0.9940753436403339, 2.005924656359665, 3, 1, 0.3313584478801114, 3.017879901350243, 0.4985232106448063, -5.780022684532108, 0.9879443067499658, 0.1093634576743864, 0.4358731493299284],
[0.6800435608941481, 2.239031483719503, 0, 2, 0.232965425862888, 0, 0.8932433574706055, 2.049319529876517, 0.5883420379217007, 1, 0.4358731493299284],
[0.6803437250543266, 2.319656274945674, 1, 1, 0.2267812416847755, 1.469845260820401, 0.4310983531486448, -2.383140391346958, 0.9485702684199113, 0.4021327517894625, 0.4358731493299284],
[0.9987339226569416, 2.001266077343058, 0, 2, 0.332911307552314, 0, 0.9993673618129087, 2.2927940465001, 0.4450073235915634, 1, 0.4358731493299284],
[0.9985903348977779, 2.001409665102222, 0, 1, 0.332863444965926, 0, 0.499647831943954, 1.146314776930093, 0.667136555034074, 1, 0.4358731493299284],
[0.9957697431849649, 2.004230256815034, 1, 1, 0.3319232477283217, 1.004248227910104, 0.4989446679590206, -1.159290405311478, 0.8898269576174833, 0.5536734530741265, 0.4358731493299284],
[0.6803437945879027, 2.319656205412097, 1, 1, 0.2267812648626343, 1.469845110596943, 0.4310983660711676, -2.38314001705003, 0.9485702579073036, 0.4021327876325723, 0.4358731493299284],
[0.9995274654376042, 2.000472534562395, 1, 2, 0.3331758218125348, 1.00047275795687, 0.9997637885278448, -0.001626549903602309, 0.7409507312841106, 0.7034936387189727, 0.4358731493299284],
[0.6797112281874041, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2536509236658201, 1.471213007127622, 0, -3.375323782594386, 1, 0.2536509236658202, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 1, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0.5000000000000002, -3.441368210696079, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.831904463294322, 1, 0, 0.3531192570093665, 1, 0, -2.294245473797386, 1, 0.3531192570093665, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.294245473797386, 0.4444444444444445, 1, 0.4358731493299284],
[1.301763825989527, 1.614627256256066, 1, 0, 0.4463612009769216, 0.7681884993538337, 0, -1.762412987665739, 1, 0.4463612009769216, 0.4358731493299284],
[0.001649616809858748, 1.757694260359488, 0, 1, 0.0009376318247191439, 0, 0.5689271578980279, 1.305258556927961, 0.9990623681752808, 1, 0.4358731493299284],
[0.7143908835679689, 1.958490765000362, 1, 1, 0.2672736684583907, 1.399793898552539, 0.5105972506333544, -2.040035384804396, 0.9285647861487942, 0.4631121230655757, 0.4358731493299284],
[0.9543965300519472, 2.045603469948054, 1, 2, 0.3181321766839822, 1.047782518599026, 0.9777065933754931, -0.1607713742662536, 0.7607708492235488, 0.6829698319011881, 0.4358731493299284],
[0.7140090325877355, 1.454419791533556, 0, 0, 0.3292748300729087, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6215532595168515, 1.548517367289705, 0, 1, 0.286420751398087, 0, 0.6457790019819099, 1.481575552370389, 0.713579248601913, 1, 0.4358731493299284],
[0.9993670510780123, 2.000632948921987, 0, 1, 0.3331223503593375, 0, 0.499841812831702, 1.146759816703812, 0.6668776496406625, 1, 0.4358731493299284],
[0.9985901089797392, 2.00140989102026, 1, 1, 0.3328633696599131, 1.001411881619478, 0.4996477755439838, -1.151170029277693, 0.8892019771386481, 0.5549287164584743, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 2.320589004316404, 0, 0, 0.226470331894532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 2.320589004316404, 0, 0, 0.226470331894532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 2.320589004316404, 0, 0, 0.226470331894532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.7140090325877355, 2.158156729861633, 0, 0, 0.2485960392407269, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.7606566656626348, 2.239343334337366, 0, 0, 0.2535522218875448, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.7142410747560761, 1.455829090475362, 0, 1, 0.3291327101766326, 0, 0.6868938164118403, 1.575903029282277, 0.6708672898233674, 1, 0.4358731493299284],
[0.9993666085261141, 2.000633391473885, 1, 2, 0.3331222028420381, 1.000633792912913, 0.999683404527494, -0.002180424251597525, 0.7410222034675604, 0.7034221072203968, 0.4358731493299284],
[0.6798716342876885, 2.320128365712312, 1, 1, 0.2266238780958962, 1.470865895218168, 0.4310106349193253, -2.385683224345022, 0.9486416178767763, 0.4018893740685687, 0.4358731493299284],
[0.7140090325877355, 1.958225678068694, 0, 0, 0.2671954786532731, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.7611288703407917, 2.23887112965921, 0, 1, 0.2537096234469304, 0, 0.4466536669987858, 1.024733153866969, 0.7462903765530695, 1, 0.4358731493299284],
[0.6795714016443328, 2.320428598355667, 0, 1, 0.2265238005481109, 0, 0.4309548678673557, 0.9887162550156311, 0.7734761994518891, 1, 0.4358731493299284],
[0.000564721282954807, 2.999435278717045, 0, 1, 0.0001882404276516023, 0, 0.3333960919562606, 0.7648924749523877, 0.9998117595723484, 1, 0.4358731493299284],
[0.8316030624030217, 2.16839693759698, 1, 2, 0.2772010208010071, 1.202496774254744, 0.9223403544446999, -0.6427475981044731, 0.8120792601274882, 0.622382083567085, 0.4358731493299284],
[0.6803444155268121, 2.319655584473189, 1, 3, 0.2267814718422707, 1.469843769094023, 1.293295444410263, -0.4050451948122292, 0.7767925712751075, 0.6425551791077959, 0.4358731493299284],
[1.00077672795045, 1.830494038553011, 0, 1, 0.3534726313677095, 0, 0.5463006046119062, 1.253347689463641, 0.6465273686322905, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.147122736898693, 0.6666666666666667, 1, 0.4358731493299284],
[0.6797112281875103, 2.32028877181249, 1, 0, 0.2265704093958367, 1.471213007127392, 0, -3.37532378259386, 1, 0.2265704093958367, 0.4358731493299284],
[1.393325173495427, 1.287823983011404, 2, 1, 0.519674621650195, 1.435415104847788, 0.7765036318562991, -1.511704664543891, 0.8596557817929402, 0.5294967007476997, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.001341383200224786, 1.758074458855982, 0, 1, 0.0007624025930431141, 0, 0.5688041225800653, 1.304976283706608, 0.9992375974069568, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.7606566656626348, 2.239343334337366, 0, 0, 0.2535522218875448, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9985901075516782, 2.001409892448321, 1, 1, 0.3328633691838928, 1.001411883051574, 0.4996477751874714, -1.1511700333812, 0.8892019774555475, 0.5549287158233331, 0.4358731493299284],
[0.9985903334855274, 2.001409666514472, 0, 1, 0.3328634444951759, 0, 0.4996478315913885, 1.146314776121221, 0.6671365555048241, 1, 0.4358731493299284],
[0.9964236240193437, 2.000949779355788, 1.5, 1.5, 0.3324322631599189, 1.50538381853026, 0.7496440018014493, -1.73385265389854, 0.8526019313697714, 0.4802796489856687, 0.4358731493299284],
[1.387395492388992, 1.299218537274086, 1, 1, 0.516410424821232, 0.7207750100716227, 0.7696934513404634, 0.112230912466261, 0.7333202731359547, 0.7661411227784187, 0.4358731493299284],
[0.7833566295574758, 2.216390877367907, 2, 2, 0.2611408552716438, 2.553115560060832, 0.9023679083064609, -3.787220328419127, 0.9427179598576932, 0.2806517090355027, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.147122736898693, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 2.320589004316404, 0, 1, 0.226470331894532, 0, 0.4309250789950108, 0.9886479120300843, 0.773529668105468, 1, 0.4358731493299284],
[0.9993670621077079, 2.000632937892292, 0, 1, 0.3331223540359027, 0, 0.4998418155873814, 1.146759823026017, 0.6668776459640973, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.147122736898693, 0.6666666666666667, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.294245473797386, 1, 0.3333333333333333, 0.4358731493299284],
[0.7140090325877355, 2.158156729861633, 0, 0, 0.2485960392407269, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[1.393420028271331, 1.285990967412264, 0, 0, 0.5200471411500756, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6215532591896872, 1.548517362923922, 0, 1, 0.2864207518667322, 0, 0.6457790038025744, 1.481575556547441, 0.7135792481332679, 1, 0.4358731493299284]
],
"RESOLVED": [
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.147122736898693, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4358731493299284],
[0.285426730541701, 2.714573269458297, 0, 1, 0.0951422435139004, 0, 0.3683820257316369, 0.8451587951631199, 0.9048577564860996, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.294245473797386, 1, 0.3333333333333333, 0.4358731493299284],
[1.00077672756796, 1.830583609154187, 1, 1, 0.3534614491091426, 0.9992238752695144, 0.5462738740799966, -1.039178490085571, 0.8750650039936649, 0.5819879022119502, 0.4358731493299284],
[0.6214388028056298, 2.050795907850802, 0, 0, 0.2325539745170715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6803118234687434, 2.319688176531257, 1, 0, 0.2267706078229144, 1.469914185676275, 0, -3.372343967358364, 1, 0.2267706078229145, 0.4358731493299284],
[0.6808046552244523, 2.319195344775548, 2, 3, 0.2269348850748174, 2.937700241401296, 1.29355209631569, -3.772079440115019, 0.9193014382856032, 0.3186294092781765, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.147122736898693, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4358731493299284],
[0.9993670624452855, 2.000632937554714, 1, 1, 0.3331223541484286, 1.000633338418384, 0.4998418156717225, -1.148938684377629, 0.889029497166609, 0.5552742054634661, 0.4358731493299284],
[1.001641767558349, 1.9980257040977, 1, 2, 0.3339176015418019, 0.9983609234243986, 1.000988123375115, 0.006027441595692749, 0.7399613754923455, 0.7044820454424343, 0.4358731493299284],
[1.000776728707891, 1.830827325107594, 1, 1, 0.3534310269683998, 0.9992238741313523, 0.5462011552297714, -1.039345322367337, 0.8750865091760622, 0.5819485631128618, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 2.000632565230687, 0, 1, 0.2535074450251916, 0, 0.4998419086938601, 1.146760036635134, 0.7464925549748085, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.294245473797386, 1, 0.3333333333333333, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 3, 0.3333333333333333, 1, 1.5, 1.147122736898693, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.4358731493299284],
[0.6836820954188967, 2.314400187088772, 0, 1, 0.228039803779851, 0, 0.4320773933473778, 0.9912916040173939, 0.771960196220149, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 1, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0.5000000000000002, -3.441368210696079, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.4358731493299284],
[0.9993663639069666, 2.000633636093033, 1, 1, 0.3331221213023223, 1.000634037842295, 0.499841641147684, -1.148940689428755, 0.8890296522990407, 0.5552738949036855, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.147122736898693, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4358731493299284],
[0.7139405699351528, 1.456133768602744, 0, 1, 0.3289936004755373, 0, 0.6867500923074984, 1.575573290906415, 0.6710063995244626, 1, 0.4358731493299284],
[0.7138263990716337, 1.958803097888056, 1, 1, 0.2670876752215985, 1.400900837095054, 0.5105158354498117, -2.042761759961675, 0.9286641737447219, 0.462839524187919, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.147122736898693, 0.6666666666666667, 1, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2535672939978582, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6216215930320754, 2.050613117624356, 1, 0, 0.2326223780243371, 1.608695726160852, 0, -3.690742888461732, 1, 0.2326223780243372, 0.4358731493299284],
[0.622428399000959, 1.547641046568569, 0, 1, 0.2868241844848448, 0, 0.6461446613975514, 1.482414464829676, 0.7131758155151553, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.147122736898693, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4358731493299284],
[0.9988942276186653, 2.001105772381334, 0, 2, 0.3329647425395552, 0, 0.9994474193235583, 2.292977718081551, 0.4449360346953218, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.294245473797386, 0.4444444444444445, 1, 0.4358731493299284],
[0.6791819707060975, 2.320313007283778, 0, 2, 0.2264321079681401, 0, 0.8619526735064312, 1.977531019819685, 0.5984072835826153, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6800434913871313, 2.319956508612869, 0, 1, 0.2266811637957104, 0, 0.4310425632064596, 0.9889174496504434, 0.7733188362042897, 1, 0.4358731493299284],
[0.9993670624454071, 2.000632937554593, 2, 1, 0.3331223541484691, 2.001266676836525, 0.4998418156717528, -3.444637191974147, 0.9630332448550923, 0.2589779982104391, 0.4358731493299284],
[0.7143906360308537, 1.957844074625576, 1, 1, 0.2673382817691807, 1.399794383582613, 0.5107659046807611, -2.039649563797549, 0.9285302431007022, 0.4632068066390636, 0.4358731493299284],
[0.9993670507147611, 2.000632949285238, 0, 1, 0.3331223502382538, 0, 0.4998418127409468, 1.146759816495597, 0.6668776497617462, 1, 0.4358731493299284],
[0.9993670507128524, 2.000632949287147, 0, 1, 0.3331223502376175, 0, 0.4998418127404698, 1.146759816494503, 0.6668776497623825, 1, 0.4358731493299284],
[0.9988937264567074, 2.001106273543292, 0, 2, 0.3329645754855692, 0, 0.9994471690194978, 2.292977143822593, 0.4449362575571469, 1, 0.4358731493299284],
[0.7138263990641003, 2.158339363385268, 1, 0, 0.2485324518510216, 1.400900837109839, 0, -3.214010404778216, 1, 0.2485324518510216, 0.4358731493299284],
[0.6215532591866708, 2.250864890544888, 0, 1, 0.2163867608359033, 0, 0.4442736675136109, 1.019272850820466, 0.7836132391640966, 1, 0.4358731493299284],
[1.300849798489226, 1.617904531531736, 0, 0, 0.4456866359423555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6214388028056298, 2.250726959643738, 0, 0, 0.2163659252994054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6217508330087117, 2.250667135863605, 0, 1, 0.2164555575638615, 0, 0.4443127035825711, 1.019362409144993, 0.7835444424361385, 1, 0.4358731493299284],
[0.9993670624451817, 2.000632937554818, 0, 1, 0.333122354148394, 0, 0.4998418156716966, 1.146759823219457, 0.666877645851606, 1, 0.4358731493299284],
[1.300849798489226, 1.617904531531736, 0, 0, 0.4456866359423555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 2.320589004316404, 0, 0, 0.226470331894532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.147122736898693, 0.6666666666666667, 1, 0.4358731493299284],
[0.7138263991478774, 2.158339363301491, 1, 0, 0.2485324518801902, 1.400900836945424, 0, -3.214010404401009, 1, 0.2485324518801901, 0.4358731493299284],
[0.9993670614819351, 2.000632938518065, 1, 1, 0.3331223538273118, 1.000633339382955, 0.4998418154310372, -1.148938687142783, 0.8890294973805513, 0.5552742050351749, 0.4358731493299284],
[0.7140090325877355, 1.958225678068694, 0, 0, 0.2671954786532731, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 2.320589004316404, 0, 0, 0.226470331894532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.8312707665054745, 2.168729233494527, 1, 0, 0.2770902555018247, 1.202977465698494, 0, -2.759925605759018, 1, 0.2770902555018246, 0.4358731493299284],
[0.9987339605648869, 2.001105636441753, 2, 3, 0.332929121130831, 2.002535288645631, 1.499171230827385, -1.154840711321796, 0.7907219263793656, 0.5382959645871519, 0.4358731493299284],
[0.6797114858504284, 2.320288514149572, 1, 0, 0.2265704952834761, 1.471212449424537, 0, -3.375322503086608, 1, 0.2265704952834761, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999667465509977, 0, 2, 0.3333702857059819, 0, 1.000166294894405, 2.29462699510619, 0.4443951759797242, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.147122736898693, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4358731493299284],
[0.005116007642839379, 2.994883992357161, 0, 2, 0.00170533588094646, 0, 0.6678054993461952, 1.532109744252011, 0.996592236408574, 1, 0.4358731493299284],
[0.7140090325877355, 1.454419791533556, 0, 0, 0.3292748300729087, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.999366898067604, 2.000633101932395, 0, 2, 0.3331222993558681, 0, 0.9996835492066068, 2.293519457996963, 0.4447258676164044, 1, 0.4358731493299284],
[0.6214388028056298, 2.250726959643738, 0, 0, 0.2163659252994054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[1.301032588987036, 1.617249130267659, 1, 0, 0.4458214504798764, 0.7686202547613239, 0, -1.76340354055516, 1, 0.4458214504798763, 0.4358731493299284],
[0.7138263990673318, 1.958408311589098, 1, 0, 0.2671271337883271, 1.400900837103497, 0, -3.214010404763666, 1, 0.2671271337883272, 0.4358731493299284],
[0.6217360976568347, 2.250682118198184, 1, 1, 0.2164504090055582, 1.608399453994622, 0.444309745882979, -2.670707543929257, 0.9531492204413266, 0.386050038452443, 0.4358731493299284],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.294245473797386, 1, 0.3333333333333333, 0.4358731493299284],
[0.6797112281696974, 2.320288771830302, 1, 0, 0.2265704093898991, 1.471213007165947, 0, -3.375323782682315, 1, 0.2265704093898991, 0.4358731493299284],
[0.7138263991479602, 1.454602424973331, 1, 0, 0.3291906062156422, 1.400900836945262, 0, -3.214010404400636, 1, 0.3291906062156422, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999103673570381, 2.000089632642961, 1, 2, 0.3333034557856795, 1.000089640677693, 0.9999551856869323, -0.0003084727539814452, 0.7407805765782245, 0.7036638651881363, 0.4358731493299284],
[0.7162204664440032, 1.453853872124314, 0, 1, 0.3300442080323026, 0, 0.6878270362473494, 1.578044064665951, 0.6699557919676975, 1, 0.4358731493299284],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6797112286112952, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2536509237838816, 1.471213006210123, 0, -3.37532378048942, 1, 0.2536509237838815, 0.4358731493299284],
[0.7143210632388223, 2.157844699210546, 0, 1, 0.2487046787402872, 0, 0.4634253801331731, 1.063211580813365, 0.7512953212597128, 1, 0.4358731493299284],
[0.621621593026675, 1.546807231094615, 1, 0, 0.2866691247191727, 1.608695726174828, 0, -3.690742888493796, 1, 0.2866691247191726, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.294245473797386, 0.4444444444444445, 1, 0.4358731493299284],
[0.8718534643754203, 2.000312298073948, 0, 1, 0.3035526276978903, 0, 0.4999219376708706, 1.146943642753413, 0.6964473723021097, 1, 0.4358731493299284],
[0.9955052164511525, 2.003182614448189, 1, 2, 0.3319802769041781, 1.004515077846474, 0.9984112210113876, -0.0140037459166032, 0.7425429802636663, 0.7018959644643052, 0.4358731493299284],
[0.621736097660114, 2.051145900199908, 1, 1, 0.2326088836536337, 1.608399453986139, 0.4875323593034207, -2.571544258704252, 0.9458931072454101, 0.4111108745526778, 0.4358731493299284],
[0.8312707662118187, 2.168729233788182, 1, 0, 0.2770902554039394, 1.202977466123459, 0, -2.759925606733994, 1, 0.2770902554039394, 0.4358731493299284],
[0.6217360832160033, 2.250682100780206, 1, 1, 0.2164504063788589, 1.608399491352315, 0.4443097493214821, -2.670707621748203, 0.953149221578427, 0.3860500343361445, 0.4358731493299284],
[0.7795955326672617, 2.220404467332739, 0, 0, 0.2598651775557539, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.997971235675325, 1, 1, 0.3335589041349621, 1, 0.5005077060891692, -1.145957934501598, 0.8887384574722832, 0.5558562657422073, 0.4358731493299284],
[0.7140090325877355, 2.158156729861633, 0, 0, 0.2485960392407269, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.147122736898693, 0.6666666666666667, 1, 0.4358731493299284],
[0.9995274652063887, 2.000472534793611, 0, 1, 0.333175821735463, 0, 0.4998818942061457, 1.146851773215713, 0.666824178264537, 1, 0.4358731493299284],
[0.6746836764716071, 2.325316323528393, 0, 2, 0.224894558823869, 0, 0.8600980347332856, 1.973276023208867, 0.6007884449408447, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.294245473797386, 0.4444444444444445, 1, 0.4358731493299284],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6214388028056298, 1.54699002131566, 0, 0, 0.2865848285601234, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9871687403588663, 2.012831259641133, 2, 2, 0.3290562467862889, 2.025996081756943, 0.9936252680995125, -2.368512066514084, 0.8926541576626641, 0.3998040119653988, 0.4358731493299284],
[0.01527319571260322, 2.984726804287397, 0, 3, 0.005091065237534405, 0, 1.005117116813058, 2.305985395884635, 0.9848044291681139, 1, 0.4358731493299284],
[0.9991001868470174, 2.000899813152982, 1, 1, 0.3330333956156726, 1.000900623545895, 0.4997751478742047, -1.149704854364337, 0.8890887574046948, 0.5551555486360401, 0.4358731493299284],
[0.8315711758787103, 2.168428824121291, 0, 0, 0.27719039195957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9995274654356548, 2.000472534564344, 1, 2, 0.333175821811885, 1.000472757958821, 0.9997637885268706, -0.001626549910313472, 0.7409507312849768, 0.703493638718106, 0.4358731493299284],
[0.004331272875711562, 2.995668727124288, 0.5, 1.5, 0.001443757625237187, 115.4395057406439, 0.5007229225375447, -263.6977822442211, 0.9985562423747628, 0.002885430814393963, 0.4358731493299284],
[0.9987338083599383, 2.001266191640061, 0, 2, 0.3329112694533128, 0, 0.9993673047366959, 2.292793915553257, 0.4450073744223906, 1, 0.4358731493299284],
[0.8721657624493685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3036613603058864, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6214388028056298, 2.250726959643738, 0, 0, 0.2163659252994054, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[1.300849798489226, 1.617904531531736, 0, 0, 0.4456866359423555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6797112281781273, 2.320288771821873, 1, 0, 0.2265704093927091, 1.471213007147701, 0, -3.375323782640454, 1, 0.2265704093927091, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 2.320589004316404, 0, 1, 0.226470331894532, 0, 0.4309250789950108, 0.9886479120300843, 0.773529668105468, 1, 0.4358731493299284],
[0.6803437248035, 2.3196562751965, 1, 1, 0.2267812416011667, 1.469845261362298, 0.4310983531020298, -2.383140392697149, 0.9485702684578332, 0.4021327516601666, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.294245473797386, 0.4444444444444445, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.294245473797386, 1, 0.3333333333333333, 0.4358731493299284],
[0.8312707666607192, 2.168729233339282, 1, 1, 0.2770902555535729, 1.202977465473831, 0.4610995160794041, -1.702050127508249, 0.9232209902772557, 0.4774015013844015, 0.4358731493299284],
[0.831270766649428, 2.168729233350573, 1, 1, 0.2770902555498093, 1.202977465490171, 0.4610995160770035, -1.702050127551244, 0.9232209902793415, 0.4774015013789599, 0.4358731493299284],
[0.7606566656626348, 2.239343334337366, 0, 0, 0.2535522218875448, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9535404061946604, 2.04645959380534, 1, 1, 0.3178468020648867, 1.048723256511749, 0.4886487879003391, -1.284948314601202, 0.8989734104171248, 0.5346670145468981, 0.4358731493299284],
[0.8312707666521151, 2.168729233347886, 1, 0, 0.2770902555507049, 1.202977465486282, 0, -2.759925605272153, 1, 0.2770902555507049, 0.4358731493299284],
[0.6797112281803014, 2.320288771819699, 1, 0, 0.2265704093934338, 1.471213007142995, 0, -3.375323782629657, 1, 0.2265704093934338, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.8721657624493685, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3036613603058864, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6797112281781273, 2.320288771821873, 1, 0, 0.2265704093927091, 1.471213007147701, 0, -3.375323782640454, 1, 0.2265704093927091, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.294245473797386, 1, 0.3333333333333333, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 2.239343334337366, 0, 0, 0.2327742998770015, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.147122736898693, 0.6666666666666667, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 1, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0.5000000000000002, -3.441368210696079, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.4358731493299284],
[1.300849798489226, 1.617904531531736, 0, 0, 0.4456866359423555, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.8315711758787103, 2.168428824121291, 0, 0, 0.27719039195957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.2873996484322468, 2.712600351567751, 0, 1, 0.095799882810749, 0, 0.3686499559074556, 0.8457734927562857, 0.904200117189251, 1, 0.4358731493299284],
[0.2859909674122645, 2.714009032587733, 0, 0, 0.0953303224707549, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.147122736898693, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4358731493299284],
[0.9987332993375463, 2.001266700662453, 0, 2, 0.3329110997791822, 0, 0.9993670505475188, 2.292793332380888, 0.4450076007978202, 1, 0.4358731493299284],
[0.9985903348993305, 2.001409665100669, 0, 2, 0.3328634449664435, 0, 0.9992956638886832, 2.292629553861965, 0.4450711830620415, 1, 0.4358731493299284],
[0.9985903341749878, 2.001409665825011, 0, 1, 0.332863444724996, 0, 0.499647831763511, 1.146314776516112, 0.6671365552750039, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -4.588490947594773, 1, 0.1111111111111109, 0.4358731493299284],
[0.714573516715727, 2.157844562786743, 0, 1, 0.2487707210224418, 0, 0.4634254094319715, 1.063211648032001, 0.7512292789775582, 1, 0.4358731493299284],
[1.830706135822286, 1.168660926590087, 1, 0, 0.6103641527455662, 0.546237312713674, 0, -1.253202482312594, 1, 0.6103641527455662, 0.4358731493299284],
[0.0005647209908140288, 2.999435279009186, 0, 1, 0.000188240330271343, 0, 0.3333960919237883, 0.7648924748778883, 0.9998117596697287, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999103530360249, 2.000089646963974, 1, 1, 0.3333034510120084, 1.000089655001274, 0.4999775892635338, -1.14737984321027, 0.8889088095434857, 0.5555157115675025, 0.4358731493299284],
[0.2890416073840367, 2.710958392615961, 0, 1, 0.09634720246134566, 0, 0.3688732378644299, 0.8462857563754547, 0.9036527975386544, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999667471664056, 1, 1, 0.3333702850220437, 1, 0.5000831459081712, -1.146931979775207, 0.8888642530643214, 0.5556048231084088, 0.4358731493299284],
[0.8312707662127259, 2.168729233787275, 1, 0, 0.2770902554042419, 1.202977466122146, 0, -2.759925606730981, 1, 0.2770902554042418, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2535672939978582, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.8315711758787103, 2.168428824121291, 0, 0, 0.27719039195957, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.679711228318289, 2.000632565210962, 1, 1, 0.2535910616985825, 1.471213006844326, 0.4998419086987881, -2.228563745297996, 0.9356915734265856, 0.4428736968237509, 0.4358731493299284],
[0.7143210629365317, 2.157844699512836, 0, 1, 0.248704678635039, 0, 0.4634253800682523, 1.063211580664421, 0.751295321364961, 1, 0.4358731493299284],
[0.6797112283162077, 2.320288771683793, 1, 0, 0.2265704094387359, 1.471213006848831, 0, -3.375323781954771, 1, 0.2265704094387359, 0.4358731493299284],
[0.9940753436403339, 2.005924656359665, 3, 1, 0.3313584478801114, 3.017879901350243, 0.4985232106448063, -5.780022684532108, 0.9879443067499658, 0.1093634576743864, 0.4358731493299284],
[0.6800435608941481, 2.239031483719503, 0, 2, 0.232965425862888, 0, 0.8932433574706055, 2.049319529876517, 0.5883420379217007, 1, 0.4358731493299284],
[0.6803437250543266, 2.319656274945674, 1, 1, 0.2267812416847755, 1.469845260820401, 0.4310983531486448, -2.383140391346958, 0.9485702684199113, 0.4021327517894625, 0.4358731493299284],
[0.9987339226569416, 2.001266077343058, 0, 2, 0.332911307552314, 0, 0.9993673618129087, 2.2927940465001, 0.4450073235915634, 1, 0.4358731493299284],
[0.9985903348977779, 2.001409665102222, 0, 1, 0.332863444965926, 0, 0.499647831943954, 1.146314776930093, 0.667136555034074, 1, 0.4358731493299284],
[0.9957697431849649, 2.004230256815034, 1, 1, 0.3319232477283217, 1.004248227910104, 0.4989446679590206, -1.159290405311478, 0.8898269576174833, 0.5536734530741265, 0.4358731493299284],
[0.6803437945879027, 2.319656205412097, 1, 1, 0.2267812648626343, 1.469845110596943, 0.4310983660711676, -2.38314001705003, 0.9485702579073036, 0.4021327876325723, 0.4358731493299284],
[0.9995274654376042, 2.000472534562395, 1, 2, 0.3331758218125348, 1.00047275795687, 0.9997637885278448, -0.001626549903602309, 0.7409507312841106, 0.7034936387189727, 0.4358731493299284],
[0.6797112281874041, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2536509236658201, 1.471213007127622, 0, -3.375323782594386, 1, 0.2536509236658202, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 1, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0.5000000000000002, -3.441368210696079, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.831904463294322, 1, 0, 0.3531192570093665, 1, 0, -2.294245473797386, 1, 0.3531192570093665, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 2.294245473797386, 0.4444444444444445, 1, 0.4358731493299284],
[1.301763825989527, 1.614627256256066, 1, 0, 0.4463612009769216, 0.7681884993538337, 0, -1.762412987665739, 1, 0.4463612009769216, 0.4358731493299284],
[0.001649616809858748, 1.757694260359488, 0, 1, 0.0009376318247191439, 0, 0.5689271578980279, 1.305258556927961, 0.9990623681752808, 1, 0.4358731493299284],
[0.7143908835679689, 1.958490765000362, 1, 1, 0.2672736684583907, 1.399793898552539, 0.5105972506333544, -2.040035384804396, 0.9285647861487942, 0.4631121230655757, 0.4358731493299284],
[0.9543965300519472, 2.045603469948054, 1, 2, 0.3181321766839822, 1.047782518599026, 0.9777065933754931, -0.1607713742662536, 0.7607708492235488, 0.6829698319011881, 0.4358731493299284],
[0.7140090325877355, 1.454419791533556, 0, 0, 0.3292748300729087, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6215532595168515, 1.548517367289705, 0, 1, 0.286420751398087, 0, 0.6457790019819099, 1.481575552370389, 0.713579248601913, 1, 0.4358731493299284],
[0.9993670510780123, 2.000632948921987, 0, 1, 0.3331223503593375, 0, 0.499841812831702, 1.146759816703812, 0.6668776496406625, 1, 0.4358731493299284],
[0.9985901089797392, 2.00140989102026, 1, 1, 0.3328633696599131, 1.001411881619478, 0.4996477755439838, -1.151170029277693, 0.8892019771386481, 0.5549287164584743, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 2.320589004316404, 0, 0, 0.226470331894532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 2.320589004316404, 0, 0, 0.226470331894532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 2.320589004316404, 0, 0, 0.226470331894532, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.7140090325877355, 2.158156729861633, 0, 0, 0.2485960392407269, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.7606566656626348, 2.239343334337366, 0, 0, 0.2535522218875448, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.7142410747560761, 1.455829090475362, 0, 1, 0.3291327101766326, 0, 0.6868938164118403, 1.575903029282277, 0.6708672898233674, 1, 0.4358731493299284],
[0.9993666085261141, 2.000633391473885, 1, 2, 0.3331222028420381, 1.000633792912913, 0.999683404527494, -0.002180424251597525, 0.7410222034675604, 0.7034221072203968, 0.4358731493299284],
[0.6798716342876885, 2.320128365712312, 1, 1, 0.2266238780958962, 1.470865895218168, 0.4310106349193253, -2.385683224345022, 0.9486416178767763, 0.4018893740685687, 0.4358731493299284],
[0.7140090325877355, 1.958225678068694, 0, 0, 0.2671954786532731, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.7611288703407917, 2.23887112965921, 0, 1, 0.2537096234469304, 0, 0.4466536669987858, 1.024733153866969, 0.7462903765530695, 1, 0.4358731493299284],
[0.6795714016443328, 2.320428598355667, 0, 1, 0.2265238005481109, 0, 0.4309548678673557, 0.9887162550156311, 0.7734761994518891, 1, 0.4358731493299284],
[0.000564721282954807, 2.999435278717045, 0, 1, 0.0001882404276516023, 0, 0.3333960919562606, 0.7648924749523877, 0.9998117595723484, 1, 0.4358731493299284],
[0.8316030624030217, 2.16839693759698, 1, 2, 0.2772010208010071, 1.202496774254744, 0.9223403544446999, -0.6427475981044731, 0.8120792601274882, 0.622382083567085, 0.4358731493299284],
[0.6803444155268121, 2.319655584473189, 1, 3, 0.2267814718422707, 1.469843769094023, 1.293295444410263, -0.4050451948122292, 0.7767925712751075, 0.6425551791077959, 0.4358731493299284],
[1.00077672795045, 1.830494038553011, 0, 1, 0.3534726313677095, 0, 0.5463006046119062, 1.253347689463641, 0.6465273686322905, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.147122736898693, 0.6666666666666667, 1, 0.4358731493299284],
[0.6797112281875103, 2.32028877181249, 1, 0, 0.2265704093958367, 1.471213007127392, 0, -3.37532378259386, 1, 0.2265704093958367, 0.4358731493299284],
[1.393325173495427, 1.287823983011404, 2, 1, 0.519674621650195, 1.435415104847788, 0.7765036318562991, -1.511704664543891, 0.8596557817929402, 0.5294967007476997, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.001341383200224786, 1.758074458855982, 0, 1, 0.0007624025930431141, 0, 0.5688041225800653, 1.304976283706608, 0.9992375974069568, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.7606566656626348, 2.239343334337366, 0, 0, 0.2535522218875448, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.9985901075516782, 2.001409892448321, 1, 1, 0.3328633691838928, 1.001411883051574, 0.4996477751874714, -1.1511700333812, 0.8892019774555475, 0.5549287158233331, 0.4358731493299284],
[0.9985903334855274, 2.001409666514472, 0, 1, 0.3328634444951759, 0, 0.4996478315913885, 1.146314776121221, 0.6671365555048241, 1, 0.4358731493299284],
[0.9964236240193437, 2.000949779355788, 1.5, 1.5, 0.3324322631599189, 1.50538381853026, 0.7496440018014493, -1.73385265389854, 0.8526019313697714, 0.4802796489856687, 0.4358731493299284],
[1.387395492388992, 1.299218537274086, 1, 1, 0.516410424821232, 0.7207750100716227, 0.7696934513404634, 0.112230912466261, 0.7333202731359547, 0.7661411227784187, 0.4358731493299284],
[0.7833566295574758, 2.216390877367907, 2, 2, 0.2611408552716438, 2.553115560060832, 0.9023679083064609, -3.787220328419127, 0.9427179598576932, 0.2806517090355027, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -1.147122736898693, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4358731493299284],
[0.6794109956835961, 2.320589004316404, 0, 1, 0.226470331894532, 0, 0.4309250789950108, 0.9886479120300843, 0.773529668105468, 1, 0.4358731493299284],
[0.9993670621077079, 2.000632937892292, 0, 1, 0.3331223540359027, 0, 0.4998418155873814, 1.146759823026017, 0.6668776459640973, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 1.147122736898693, 0.6666666666666667, 1, 0.4358731493299284],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -2.294245473797386, 1, 0.3333333333333333, 0.4358731493299284],
[0.7140090325877355, 2.158156729861633, 0, 0, 0.2485960392407269, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[1.393420028271331, 1.285990967412264, 0, 0, 0.5200471411500756, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4358731493299284],
[0.6215532591896872, 1.548517362923922, 0, 1, 0.2864207518667322, 0, 0.6457790038025744, 1.481575556547441, 0.7135792481332679, 1, 0.4358731493299284]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node119":{
"Global MG94xREV":0.001720523993693296,
"Nucleotide GTR":0.001684634265880657,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTG", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node135":{
"Global MG94xREV":0.001721717611810528,
"Nucleotide GTR":0.001685802985403339,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "F", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "TTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node16":{
"Global MG94xREV":0.00172099066246368,
"Nucleotide GTR":0.00168509120004972,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATT", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node167":{
"Global MG94xREV":0.001721002628273341,
"Nucleotide GTR":0.001685102916255394,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTT", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node201":{
"Global MG94xREV":0.001720743486830041,
"Nucleotide GTR":0.001684849180441947,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTC", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node241":{
"Global MG94xREV":0.001721002595281135,
"Nucleotide GTR":0.001685102883951396,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "M", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ATG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node255":{
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node283":{
"Global MG94xREV":0.001720459931792686,
"Nucleotide GTR":0.001684571540296302,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCC", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node286":{
"Global MG94xREV":0.001720994391223813,
"Nucleotide GTR":0.001685094851028791,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCT", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node301":{
"Global MG94xREV":0.001720040512329536,
"Nucleotide GTR":0.001684160869824989,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCG", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node314":{
"Global MG94xREV":0.001721002586601584,
"Nucleotide GTR":0.001685102875452899,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "I", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ATA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node359":{
"Global MG94xREV":0.001721955267294886,
"Nucleotide GTR":0.001686035683449916,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "I", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATT", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node396":{
"Global MG94xREV":0.001721553499724207,
"Nucleotide GTR":0.001685642296656728,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "I", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ATA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node397":{
"Global MG94xREV":0.001721986181188771,
"Nucleotide GTR":0.001686065952487209,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "S", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "I", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "TCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ATA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node406":{
"Global MG94xREV":0.001720912600026213,
"Nucleotide GTR":0.001685014765976428,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "P", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CCT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node43":{
"Global MG94xREV":0.001721032701344685,
"Nucleotide GTR":0.001685132362009507,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "V", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GTT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node445":{
"Global MG94xREV":0.001721324263253338,
"Nucleotide GTR":0.001685417842004986,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTA", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node79":{
"Global MG94xREV":0.001720026742093474,
"Nucleotide GTR":0.001684147386832825,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCC", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001722319435564569,
"Nucleotide GTR":0.001686392255254729,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "H", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CAT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1":{
"Global MG94xREV":0.01050038673673802,
"Nucleotide GTR":0.01028135112706892,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "S", "R", "C", "E", "D", "K", "R", "S", "K", "L", "T", "M", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "TCT", "AGA", "TGT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "TCA", "AAA", "CTT", "ACT", "ATG", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720519420861986,
"Nucleotide GTR":0.001684629788437541,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "S", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AGT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720073468388832,
"Nucleotide GTR":0.0016841931384286,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "P", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "CCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001719884357117983,
"Nucleotide GTR":0.001684007971974599,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCG", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721117037124077,
"Nucleotide GTR":0.001685214938564277,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "C", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGT", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419986_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721567916212289,
"Nucleotide GTR":0.001685656412420242,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "N", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAT", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419986_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420349_Haulchin_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCC", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420349_Haulchin_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001721532065248216,
"Nucleotide GTR":0.00168562130929889,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAA", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001719884400307342,
"Nucleotide GTR":0.001684008014263035,
"amino-acid": [
["A", "M", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATG", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421980_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721360966501251,
"Nucleotide GTR":0.001685453779631737,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "I", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "ATA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421980_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423898_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721567970270323,
"Nucleotide GTR":0.001685656465350638,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "D", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAT", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423898_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423992_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001719884445467181,
"Nucleotide GTR":0.001684008058480853,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "S", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AGT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423992_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424171_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0052146614615802,
"Nucleotide GTR":0.005105884844004859,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "L", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCA", "TTA", "GCA", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424171_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424636_Li_ge_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721085972629088,
"Nucleotide GTR":0.001685184522067384,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "S", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "TCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424636_Li_ge_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426025_New_York_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721087737950317,
"Nucleotide GTR":0.001685186250564424,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "V", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GTA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426025_New_York_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426787_Victoria_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001720075080358037,
"Nucleotide GTR":0.001684194716772504,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTC", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426787_Victoria_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427480_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721362647894004,
"Nucleotide GTR":0.001685455425951031,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "T", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "ACA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427480_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428349_Ile_De_France_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001722984604468076,
"Nucleotide GTR":0.001687043548890597,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "N", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "AAT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428349_Ile_De_France_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428720_Ankara_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721116990313358,
"Nucleotide GTR":0.001685214892730022,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "S", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "TCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428720_Ankara_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001719886068335483,
"Nucleotide GTR":0.001684009647496501,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "G", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "GGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429023_California_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001721532065248216,
"Nucleotide GTR":0.00168562130929889,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "I", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "ATT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429023_California_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429470_Unknown_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721350659862781,
"Nucleotide GTR":0.001685443687987335,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "N", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAT", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429470_Unknown_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429694_Minas_gerais_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTG", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429694_Minas_gerais_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430228_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720075125619037,
"Nucleotide GTR":0.001684194761089371,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "L", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "CTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430228_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432107_Wales_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001720075138542553,
"Nucleotide GTR":0.001684194773743305,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCC", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432107_Wales_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432600_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720075135087074,
"Nucleotide GTR":0.001684194770359906,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCC", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432600_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433057_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721087698948354,
"Nucleotide GTR":0.001685186212376037,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAT", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433057_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433360_Scotland_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721362710046215,
"Nucleotide GTR":0.00168545548680676,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "I", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "ATA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433360_Scotland_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433733_England_20200405_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001725013039512708,
"Nucleotide GTR":0.001689029671254958,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCT", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433733_England_20200405_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433749_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001719886110519246,
"Nucleotide GTR":0.001684009688800319,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "S", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AGT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433749_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434248_Washington_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721362646517321,
"Nucleotide GTR":0.001685455424603067,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "T", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "ACT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434248_Washington_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434385_Antwerp_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721087704145808,
"Nucleotide GTR":0.001685186217465072,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAT", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434385_Antwerp_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434838_Texas_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720075141353831,
"Nucleotide GTR":0.00168419477649594,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAC", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434838_Texas_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434875_Texas_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001719886025352073,
"Nucleotide GTR":0.001684009605409714,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCG", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434875_Texas_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434980_Texas_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00171988606772187,
"Nucleotide GTR":0.001684009646895689,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "G", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GGT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434980_Texas_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001729313605274833,
"Nucleotide GTR":0.00169324052822185,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "C", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGC", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435457_Louisiana_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "P", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CCT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435457_Louisiana_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435534_New_York_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001719886135862237,
"Nucleotide GTR":0.00168400971361466,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "G", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GGT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435534_New_York_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435588_California_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.01047880584176355,
"Nucleotide GTR":0.01026022040451251,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435588_California_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436321_Comunitat_Valenciana_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001721116047507255,
"Nucleotide GTR":0.001685213969590633,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "F", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "TTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436321_Comunitat_Valenciana_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436895_Wisconsin_20200428_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001721087711629847,
"Nucleotide GTR":0.001685186224792993,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "L", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TTA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436895_Wisconsin_20200428_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437356_Kinshasa_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001721087757138433,
"Nucleotide GTR":0.001685186269352283,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "F", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TTT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437356_Kinshasa_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437465_Makkah_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00172188505225784,
"Nucleotide GTR":0.001685966933082112,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCT", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCC", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437465_Makkah_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437538_West_Bengal_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003447152900296158,
"Nucleotide GTR":0.003375246097616475,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "T", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ACA", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437538_West_Bengal_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437584_California_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001719883620460425,
"Nucleotide GTR":0.001684007250683544,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCG", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437584_California_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437634_Unknown_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720072659676096,
"Nucleotide GTR":0.001684192346585422,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAC", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437634_Unknown_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437691_Makkah_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001719884409516722,
"Nucleotide GTR":0.001684008023280312,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "A", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "GCT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437691_Makkah_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437869_Connecticut_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721086021752008,
"Nucleotide GTR":0.001685184570165615,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAT", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437869_Connecticut_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438187_Washington_20200417_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001725013015934851,
"Nucleotide GTR":0.001689029648168931,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "H", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAT", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438187_Washington_20200417_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438353_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721085138281071,
"Nucleotide GTR":0.001685183705123672,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "L", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CTC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438353_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439006_Scotland_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720639033975737,
"Nucleotide GTR":0.001684746906449736,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "L", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "CTG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439006_Scotland_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439380_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001719883655688956,
"Nucleotide GTR":0.001684007285177218,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "S", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AGC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439380_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439903_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001723911475716147,
"Nucleotide GTR":0.001687951085821367,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCA", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439903_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440033_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721085136030534,
"Nucleotide GTR":0.00168518370292008,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "V", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GTA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440033_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440305_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721116984958807,
"Nucleotide GTR":0.001685214887487164,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "I", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "ATT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440305_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440669_England_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0017200726721321,
"Nucleotide GTR":0.001684192358781597,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAC", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440669_England_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440670_England_20200404_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001721085180232246,
"Nucleotide GTR":0.001685183746199753,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCT", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440670_England_20200404_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440703_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00172136013608457,
"Nucleotide GTR":0.001685452966537354,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAA", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440703_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441455_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001719884437891325,
"Nucleotide GTR":0.001684008051063027,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "G", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GGA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441455_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441895_England_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001719884414221565,
"Nucleotide GTR":0.001684008027887014,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAG", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441895_England_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442004_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721360916210981,
"Nucleotide GTR":0.001685453730390514,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "N", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "AAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442004_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442361_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001720073462681104,
"Nucleotide GTR":0.001684193132839935,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAC", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442361_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442715_England_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001719883654932988,
"Nucleotide GTR":0.001684007284437018,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAG", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442715_England_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442883_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00172007351322148,
"Nucleotide GTR":0.00168419318232605,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGC", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442883_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444006_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721360922083124,
"Nucleotide GTR":0.001685453736140162,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "T", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "ACC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444006_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444246_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721085980768667,
"Nucleotide GTR":0.001685184530037174,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "I", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ATT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444246_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444278_Taoyuan_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720073450757203,
"Nucleotide GTR":0.001684193121164764,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAC", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444278_Taoyuan_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444383_England_20200101_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001720073464626625,
"Nucleotide GTR":0.001684193134744872,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACC", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444383_England_20200101_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444411_England_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00172108597512993,
"Nucleotide GTR":0.00168518452451606,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "V", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GTT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444411_England_20200419_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444464_Gujarat_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001719884458098358,
"Nucleotide GTR":0.001684008070848546,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "R", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AGA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444464_Gujarat_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444589_Illinois_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720638087409538,
"Nucleotide GTR":0.001684745979628684,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "H", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAC", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444589_Illinois_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444746_New_York_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721116995301326,
"Nucleotide GTR":0.001685214897613942,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "S", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "TCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444746_New_York_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444871_Unknown_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001720074294480023,
"Nucleotide GTR":0.001684193947287724,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAC", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444871_Unknown_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444919_Unknown_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001721116983253362,
"Nucleotide GTR":0.001685214885817296,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "I", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "ATT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444919_Unknown_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445169_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721360966902996,
"Nucleotide GTR":0.001685453780025101,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "I", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATA", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445169_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445832_Wales_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001720458431767392,
"Nucleotide GTR":0.001684570071561185,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGC", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445832_Wales_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446113_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001719885240493599,
"Nucleotide GTR":0.001684008836923205,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTG", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446113_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446270_Wales_20200402_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001721117035260279,
"Nucleotide GTR":0.00168521493673936,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "F", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "TTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446270_Wales_20200402_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446467_Wales_20200413_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001719886124297224,
"Nucleotide GTR":0.001684009702290894,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "R", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AGA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446467_Wales_20200413_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446670_Wales_20200415_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001721117040450948,
"Nucleotide GTR":0.001685214941821753,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "F", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "TTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446670_Wales_20200415_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446991_Wales_20200417_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001721350652072376,
"Nucleotide GTR":0.001685443680359432,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "L", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CTT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446991_Wales_20200417_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447043_Gujarat_20200503_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721360916885056,
"Nucleotide GTR":0.001685453731050526,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "K", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "AAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447043_Gujarat_20200503_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447159_Liege_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001721086035535622,
"Nucleotide GTR":0.001685184583661703,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "S", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "TCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447159_Liege_20200419_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720638080570791,
"Nucleotide GTR":0.001684745972932592,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "T", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "ACA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447576_Telangana_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00692472874410148,
"Nucleotide GTR":0.006780280523261123,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "S", "F", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACC", "TCT", "TTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447576_Telangana_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00172062960034856,
"Nucleotide GTR":0.001684737669605814,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "CTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447857_Telangana_20200402_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0017211170426138,
"Nucleotide GTR":0.00168521494393949,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "H"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_447857_Telangana_20200402_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447886_California_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001719884416481997,
"Nucleotide GTR":0.001684008030100293,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTG", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447886_California_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448534_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001719884444653637,
"Nucleotide GTR":0.001684008057684278,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAG", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448534_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448755_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721360085228407,
"Nucleotide GTR":0.001685452916742041,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAA", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448755_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448969_Northern_Ireland_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001728962926575196,
"Nucleotide GTR":0.00169289716459781,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACC", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448969_Northern_Ireland_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449118_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001721086021625864,
"Nucleotide GTR":0.001685184570042099,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "I", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ATA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449118_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449207_Scotland_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001728708507642108,
"Nucleotide GTR":0.00169264805278412,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "L", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "CTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449207_Scotland_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449357_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001719883654933367,
"Nucleotide GTR":0.001684007284437392,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "R", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AGG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449357_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449404_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001721085137263206,
"Nucleotide GTR":0.001685183704127041,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "F", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TTT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449404_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450190_California_20200508_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001725014928651322,
"Nucleotide GTR":0.001689031520986584,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCT", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450190_California_20200508_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450516_Beirut_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001725013047825193,
"Nucleotide GTR":0.001689029679394045,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "L", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CTA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450516_Beirut_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450748_Minnesota_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00172108597416783,
"Nucleotide GTR":0.00168518452357403,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCT", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450748_Minnesota_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450783_Gujarat_20200411_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001721087749399598,
"Nucleotide GTR":0.001685186261774878,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAT", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450783_Gujarat_20200411_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451142_South_Australia_20200330_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001721086033281547,
"Nucleotide GTR":0.001685184581454647,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "L", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TTA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451142_South_Australia_20200330_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452008_Denmark_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001719884373710997,
"Nucleotide GTR":0.001684007988221484,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAG", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452008_Denmark_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452101_Denmark_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721360922077271,
"Nucleotide GTR":0.001685453736134432,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "T", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "ACA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452101_Denmark_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452163_Utah_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001721086020268195,
"Nucleotide GTR":0.00168518456871275,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTT", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452163_Utah_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452198_Maharashtra_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCG", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452198_Maharashtra_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452202_Maharashtra_20200316_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001721087741084095,
"Nucleotide GTR":0.001685186253632833,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "V", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GTT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452202_Maharashtra_20200316_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452415_Andalusia_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001721360067556314,
"Nucleotide GTR":0.001685452899438581,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "D", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GAT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452415_Andalusia_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452634_Basque_Country_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001721086055535745,
"Nucleotide GTR":0.001685184603244629,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "F", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TTT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452634_Basque_Country_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452668_Basque_Country_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001720965631507064,
"Nucleotide GTR":0.001685066691232997,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCG", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452668_Basque_Country_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453012_Scotland_20200403_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001719886042500989,
"Nucleotide GTR":0.00168400962220091,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTG", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453012_Scotland_20200403_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453017_Scotland_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721838196833317,
"Nucleotide GTR":0.001685921055050776,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "F", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TTT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453017_Scotland_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453066_Scotland_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721360136120198,
"Nucleotide GTR":0.001685452966572239,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "K", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453066_Scotland_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453534_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720072713432785,
"Nucleotide GTR":0.001684192399220758,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAC", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453534_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453636_England_20200422_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001720638042185419,
"Nucleotide GTR":0.001684745935347931,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "L", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "CTA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453636_England_20200422_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453738_England_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720076779579963,
"Nucleotide GTR":0.001684196380549055,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "I", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCC", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATT", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453738_England_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454183_Portugal_20200417_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001719883654932988,
"Nucleotide GTR":0.001684007284437018,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "G", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GGT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454183_Portugal_20200417_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454344_Portugal_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720074332299337,
"Nucleotide GTR":0.001684193984318135,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTC", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454344_Portugal_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454434_Maryland_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001722697508909046,
"Nucleotide GTR":0.00168676244207773,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "V", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "GTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454434_Maryland_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454472_Stockholm_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001725811890360624,
"Nucleotide GTR":0.001689811858261164,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACT", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454472_Stockholm_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454729_Utah_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721350798502146,
"Nucleotide GTR":0.001685443823734713,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "S", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "TCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454729_Utah_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454949_Hubei_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTC", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454949_Hubei_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455083_New_South_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001725013948563216,
"Nucleotide GTR":0.001689030561342886,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCT", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455083_New_South_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455117_Friesland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001726352972932069,
"Nucleotide GTR":0.001690341653976807,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCA", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455117_Friesland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455283_Netherlands_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721548899218256,
"Nucleotide GTR":0.001685637792116253,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAC", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTA", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455283_Netherlands_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456506_Victoria_20200101_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001721086863400616,
"Nucleotide GTR":0.001685185394257627,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "I", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ATA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456506_Victoria_20200101_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456688_England_20200518_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001721531964216007,
"Nucleotide GTR":0.001685621210374186,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "H", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CAT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456688_England_20200518_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456755_England_20200521_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001721362691552947,
"Nucleotide GTR":0.00168545546869926,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTA", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456755_England_20200521_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456838_Scotland_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001722128652965406,
"Nucleotide GTR":0.001686205452335929,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "F", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "TTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTT", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456838_Scotland_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456931_Scotland_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720072659676096,
"Nucleotide GTR":0.001684192346585422,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAC", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456931_Scotland_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457090_England_20200418_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001721087705948316,
"Nucleotide GTR":0.00168518621922998,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATT", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457090_England_20200418_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457491_England_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721085138281071,
"Nucleotide GTR":0.001685183705123672,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACT", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457491_England_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457580_England_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721916812496052,
"Nucleotide GTR":0.001685998030809187,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "V", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACT", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GTT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457580_England_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001721085143846509,
"Nucleotide GTR":0.001685183710573017,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCT", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458178_Etterbeek_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001721360123524607,
"Nucleotide GTR":0.00168545295423939,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "I", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "ATC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458178_Etterbeek_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458215_Morlanwelz_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001719883620460425,
"Nucleotide GTR":0.001684007250683544,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "V", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "GTT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458215_Morlanwelz_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458294_North_Carolina_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721897328544478,
"Nucleotide GTR":0.001685978953288284,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "M", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGC", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ATG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458294_North_Carolina_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458571_England_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721760432860518,
"Nucleotide GTR":0.001685844913216248,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "V", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "GTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458571_England_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458754_England_20200409_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001721532113732677,
"Nucleotide GTR":0.001685621356771975,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "H", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CAT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458754_England_20200409_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458903_England_20200414_null_17":{
"Global MG94xREV":0.00172108513787594,
"Nucleotide GTR":0.001685183704726994,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "F", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TTT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458903_England_20200414_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459075_England_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00172156795302486,
"Nucleotide GTR":0.001685656448464911,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "F", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "TTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459075_England_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459321_England_20200430_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001721532037083512,
"Nucleotide GTR":0.001685621281721694,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "T", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "ACT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459321_England_20200430_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_459564_Scotland_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001721085197022275,
"Nucleotide GTR":0.00168518376263955,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAT", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_459564_Scotland_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460029_Michigan_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001721085138308546,
"Nucleotide GTR":0.001685183705150576,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "L", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CTA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460029_Michigan_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460453_Massachusetts_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001721085137263206,
"Nucleotide GTR":0.001685183704127041,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "V", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GTT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460453_Massachusetts_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460462_Massachusetts_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001719883654933367,
"Nucleotide GTR":0.001684007284437392,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCG", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460462_Massachusetts_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460616_British_Columbia_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00172108513796024,
"Nucleotide GTR":0.001685183704809534,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "I", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ATC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460616_British_Columbia_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460691_Netherlands_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721548893570877,
"Nucleotide GTR":0.001685637786586678,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTA", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAC", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460691_Netherlands_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460835_Flevoland_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720072623816788,
"Nucleotide GTR":0.001684192311474132,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGC", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460835_Flevoland_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460850_Friesland_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001721085138605235,
"Nucleotide GTR":0.001685183705441071,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "V", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GTT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460850_Friesland_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460945_Gelderland_20200504_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001721085132333631,
"Nucleotide GTR":0.001685183699300295,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAT", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460945_Gelderland_20200504_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460957_Gelderland_20200518_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720072713311762,
"Nucleotide GTR":0.00168419239910226,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "H", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "CAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460957_Gelderland_20200518_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_460959_Gelderland_20200518_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001721085185753081,
"Nucleotide GTR":0.001685183751605427,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "L", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TTA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_460959_Gelderland_20200518_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461038_Limburg_20200406_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCT", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461038_Limburg_20200406_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461154_Noord_Brabant_20200324_null_33":{
"Global MG94xREV":0.001720519627652369,
"Nucleotide GTR":0.001684629990914325,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "V", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "GTC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461154_Noord_Brabant_20200324_null_33",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461208_Noord_Holland_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "S", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "I", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "TCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ATA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461208_Noord_Holland_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461398_Zuid_Holland_20200503_null_42":{
"Global MG94xREV":0.001721085181628147,
"Nucleotide GTR":0.001685183747566537,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAT", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461398_Zuid_Holland_20200503_null_42",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461662_Scotland_20200424_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001719883654933367,
"Nucleotide GTR":0.001684007284437392,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "V", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "GTC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461662_Scotland_20200424_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461732_Scotland_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00172635123398418,
"Nucleotide GTR":0.001690339951302966,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACA", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461732_Scotland_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461738_Scotland_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00172153213098904,
"Nucleotide GTR":0.001685621373668372,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAA", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461738_Scotland_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461920_England_20200519_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00172106371750121,
"Nucleotide GTR":0.001685162731176267,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "T", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "ACT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461920_England_20200519_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_461990_England_20200507_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "I", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ATA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_461990_England_20200507_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462048_England_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "F", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "TTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462048_England_20200419_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462070_England_20200518_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCC", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462070_England_20200518_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462097_Dhaka_20200523_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001721359295384233,
"Nucleotide GTR":0.001685452143373829,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "T", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "ACT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462097_Dhaka_20200523_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462264_Sint_Niklaas_20200323_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001721085138625468,
"Nucleotide GTR":0.001685183705460886,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "I", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ATT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462264_Sint_Niklaas_20200323_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462399_Singapore_20200414_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTT", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462399_Singapore_20200414_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462644_Michigan_20200429_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001719883654933367,
"Nucleotide GTR":0.001684007284437392,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAG", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462644_Michigan_20200429_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462707_Michigan_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001719883654932988,
"Nucleotide GTR":0.001684007284437018,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "A", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "GCC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462707_Michigan_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_462979_Wyoming_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001719883655688956,
"Nucleotide GTR":0.001684007285177218,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "V", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "GTA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_462979_Wyoming_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001720638970930766,
"Nucleotide GTR":0.001684746844719866,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "A", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GCA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463007_Taipei_20200412_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001721838432740099,
"Nucleotide GTR":0.001685921286036597,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGA", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463007_Taipei_20200412_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463016_Odisha_20200509_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001719883654932988,
"Nucleotide GTR":0.001684007284437018,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "G", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463016_Odisha_20200509_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463059_Odisha_20200513_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001719883654932988,
"Nucleotide GTR":0.001684007284437018,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "D", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "GAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463059_Odisha_20200513_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463083_Odisha_20200516_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00172007265856036,
"Nucleotide GTR":0.001684192345492959,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "R", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "CGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463083_Odisha_20200516_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463101_Virginia_20200430_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001721085185754516,
"Nucleotide GTR":0.001685183751606832,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "V", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GTT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463101_Virginia_20200430_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463404_Washington_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721116000181658,
"Nucleotide GTR":0.001685213923252236,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "S", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "TCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463404_Washington_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463448_Washington_20200429_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001721063142349674,
"Nucleotide GTR":0.001685162168022256,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "L", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "CTC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463448_Washington_20200429_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463531_Washington_20200503_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720072713432785,
"Nucleotide GTR":0.001684192399220758,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCC", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463531_Washington_20200503_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720072713894318,
"Nucleotide GTR":0.001684192399672663,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAC", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464079_Soignies_20200406_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "M", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ATG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464079_Soignies_20200406_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464512_England_20200306_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001721085143846509,
"Nucleotide GTR":0.001685183710573017,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "V", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GTA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464512_England_20200306_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464703_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001719883654932988,
"Nucleotide GTR":0.001684007284437018,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "A", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "GCT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464703_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_464856_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001723911105892749,
"Nucleotide GTR":0.001687950723712397,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "I", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "ATT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_464856_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465184_England_20200417_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001721360072339785,
"Nucleotide GTR":0.001685452904122271,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "T", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "ACC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465184_England_20200417_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465187_England_20200418_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001721154584391969,
"Nucleotide GTR":0.00168525170260495,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "F", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "TTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465187_England_20200418_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465193_England_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00172007265856036,
"Nucleotide GTR":0.001684192345492959,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCC", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465193_England_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465244_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001719883656972545,
"Nucleotide GTR":0.001684007286434032,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "R", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CGG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465244_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465539_England_20200501_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001719883612440171,
"Nucleotide GTR":0.001684007242830592,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACG", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465539_England_20200501_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465582_England_20200504_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001720458931811241,
"Nucleotide GTR":0.001684570561174239,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCC", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465582_England_20200504_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465655_England_20200512_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001719883607000394,
"Nucleotide GTR":0.001684007237504286,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "A", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "GCA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465655_England_20200512_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465660_England_20200513_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00172391105025975,
"Nucleotide GTR":0.001687950669239891,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCA", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465660_England_20200513_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465675_England_20200518_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001720072713452879,
"Nucleotide GTR":0.001684192399240434,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTC", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465675_England_20200518_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465682_Quebec_20200327_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001721532062275812,
"Nucleotide GTR":0.001685621306388487,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAA", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465682_Quebec_20200327_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465694_Quebec_20200327_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001721121962287734,
"Nucleotide GTR":0.001685219760990173,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "H", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAT", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465694_Quebec_20200327_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465710_England_20200429_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001719883654932988,
"Nucleotide GTR":0.001684007284437018,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "S", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AGC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465710_England_20200429_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465797_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001720072712824405,
"Nucleotide GTR":0.001684192398625069,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAC", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465797_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465839_England_20200327_null_30":{
"Global MG94xREV":0.00172108513915877,
"Nucleotide GTR":0.001685183705983063,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "I", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ATA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465839_England_20200327_null_30",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465846_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721350180894335,
"Nucleotide GTR":0.001685443219010056,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "L", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CTT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465846_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465960_England_20200330_null_86":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTA", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465960_England_20200330_null_86",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_465974_England_20200330_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001721085138282517,
"Nucleotide GTR":0.001685183705125088,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "V", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GTT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_465974_England_20200330_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466064_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0017201105037313,
"Nucleotide GTR":0.001684229401222493,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "I", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTC", "ATT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466064_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466127_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721116997145365,
"Nucleotide GTR":0.001685214899419514,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "F", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TTT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466127_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466429_England_20200410_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001721360121744605,
"Nucleotide GTR":0.001685452952496519,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "S", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "AGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466429_England_20200410_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466559_England_20200403_null_15":{
"Global MG94xREV":0.001721085137263206,
"Nucleotide GTR":0.001685183704127041,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "I", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ATA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466559_England_20200403_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_466692_Chattogram_20200526_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "I", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ATA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_466692_Chattogram_20200526_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467117_Basque_Country_20200317_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001721314791753368,
"Nucleotide GTR":0.001685408568078288,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "K", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAG", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467117_Basque_Country_20200317_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467149_Basque_Country_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001722606621660771,
"Nucleotide GTR":0.001686673450716181,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "K", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAG", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATT", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467149_Basque_Country_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467245_Madrid_20200401_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001726350250317255,
"Nucleotide GTR":0.001690338988155103,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTA", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467245_Madrid_20200401_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467251_Madrid_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00171988365571343,
"Nucleotide GTR":0.001684007285201182,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAG", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467251_Madrid_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467325_British_Columbia_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001721153818512912,
"Nucleotide GTR":0.001685250952701951,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCT", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467325_British_Columbia_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467349_Rio_de_Janeiro_20200417_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001721085137593751,
"Nucleotide GTR":0.00168518370445069,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "F", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "TTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467349_Rio_de_Janeiro_20200417_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467350_Rio_de_Janeiro_20200417_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "V", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GTT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467350_Rio_de_Janeiro_20200417_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467363_Rio_de_Janeiro_20200427_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001721116997256773,
"Nucleotide GTR":0.001685214899528598,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "N", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAT", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467363_Rio_de_Janeiro_20200427_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467366_Rio_de_Janeiro_20200427_null_19":{
"Global MG94xREV":0.001721085145720202,
"Nucleotide GTR":0.001685183712407626,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "C", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "TGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467366_Rio_de_Janeiro_20200427_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467375_North_Sulawesi_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001720072611379921,
"Nucleotide GTR":0.001684192299296695,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAC", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467375_North_Sulawesi_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467393_New_York_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721896514414709,
"Nucleotide GTR":0.001685978156141067,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "I", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGC", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ATA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467393_New_York_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467486_KZN_20200514_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720072659676096,
"Nucleotide GTR":0.001684192346585422,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "H", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "CAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467486_KZN_20200514_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467716_England_20200520_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001721085180751891,
"Nucleotide GTR":0.001685183746708561,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "V", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GTA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467716_England_20200520_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_467853_Massachusetts_20200314_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "I", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATT", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_467853_Massachusetts_20200314_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001721085145725337,
"Nucleotide GTR":0.001685183712412653,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "I", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ATT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468280_Basel_Landschaft_20200428_null_30":{
"Global MG94xREV":0.001721085180232246,
"Nucleotide GTR":0.001685183746199753,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTT", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468280_Basel_Landschaft_20200428_null_30",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468310_Sao_Paulo_20200322_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001722198932564581,
"Nucleotide GTR":0.001686274265919116,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "N", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AAT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468310_Sao_Paulo_20200322_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468320_Sao_Paulo_20200413_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATT", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468320_Sao_Paulo_20200413_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468428_California_20200429_null_20":{
"Global MG94xREV":0.00172108522709037,
"Nucleotide GTR":0.001685183792080431,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "TTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468428_California_20200429_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468563_California_20200313_null_123":{
"Global MG94xREV":0.001721360076411089,
"Nucleotide GTR":0.001685452908108651,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "I", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATA", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468563_California_20200313_null_123",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468620_California_20200331_null_27":{
"Global MG94xREV":0.001720458307225106,
"Nucleotide GTR":0.001684569949616823,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGC", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468620_California_20200331_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468624_California_20200402_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001721085137762869,
"Nucleotide GTR":0.001685183704616279,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "V", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GTT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468624_California_20200402_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468662_British_Columbia_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001720102314576755,
"Nucleotide GTR":0.001684221382891794,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCT", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468662_British_Columbia_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468688_British_Columbia_20200401_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001721085179754264,
"Nucleotide GTR":0.001685183745731747,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "S", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "TCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468688_British_Columbia_20200401_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468699_British_Columbia_20200401_null_28":{
"Global MG94xREV":0.00172115445679377,
"Nucleotide GTR":0.001685251577668421,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCT", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468699_British_Columbia_20200401_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468711_LA_20200408_null_16":{
"Global MG94xREV":0.001720902332988837,
"Nucleotide GTR":0.001685004713107046,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "F", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "TTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468711_LA_20200408_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468739_Ghent_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001721117043549237,
"Nucleotide GTR":0.00168521494485541,
"amino-acid": [
["S", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468739_Ghent_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_468768_Aragon_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001720072713432785,
"Nucleotide GTR":0.001684192399220758,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCC", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_468768_Aragon_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469003_Balear_Islands_20200327_null_39":{
"Global MG94xREV":0.0017219351029474,
"Nucleotide GTR":0.001686015939726002,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACT", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469003_Balear_Islands_20200327_null_39",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469065_Stockholm_20200528_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001720072713939876,
"Nucleotide GTR":0.001684192399717274,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACC", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469065_Stockholm_20200528_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469137_Singapore_20200417_null_18":{
"Global MG94xREV":0.001721085138308546,
"Nucleotide GTR":0.001685183705150576,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "S", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "TCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469137_Singapore_20200417_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469139_Singapore_20200606_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001719883655688956,
"Nucleotide GTR":0.001684007285177218,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAG", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469139_Singapore_20200606_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_469253_Shanghai_20200228_null_45432":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "I", "A", "S", "E", "F", "S", "S", "L", "P", "S", "Y", "A", "A", "F", "A", "T", "A", "Q", "E", "A", "Y", "E", "Q", "A", "V", "A", "N", "G", "D", "S", "E", "V", "V", "L", "K", "K", "L", "K", "K", "S", "L", "N", "V", "A", "K", "S", "E", "F", "D", "R", "D", "A", "A", "M", "Q", "R", "K", "L", "E", "K", "M", "A", "D", "Q", "A", "M", "T", "Q", "M", "Y", "K", "Q", "A", "R", "S", "E", "D", "K", "R", "A", "K", "V", "T", "S", "A", "M", "Q", "T", "M", "L", "F", "T", "M", "L", "R", "K", "L", "D", "N", "D", "A", "L", "N", "N", "I", "I", "N", "N", "A", "R", "D", "G", "C", "V", "P", "L", "N", "I", "I", "P", "L", "T", "T", "A", "A", "K", "L", "M", "V", "V", "I", "P", "D", "Y", "N", "T", "Y", "K", "N", "T", "C", "D", "G", "T", "T", "F", "T", "Y", "A", "S", "A", "L", "W", "E", "I", "Q", "Q", "V", "V", "D", "A", "D", "S", "K", "I", "V", "Q", "L", "S", "E", "I", "S", "M", "D", "N", "S", "P", "N", "L", "A", "W", "P", "L", "I", "V", "T", "A", "L", "R", "A", "N", "S", "A", "V", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "ATA", "GCC", "TCA", "GAG", "TTT", "AGT", "TCC", "CTT", "CCA", "TCA", "TAT", "GCA", "GCT", "TTT", "GCT", "ACT", "GCT", "CAA", "GAA", "GCT", "TAT", "GAG", "CAG", "GCT", "GTT", "GCT", "AAT", "GGT", "GAT", "TCT", "GAA", "GTT", "GTT", "CTT", "AAA", "AAG", "TTG", "AAG", "AAG", "TCT", "TTG", "AAT", "GTG", "GCT", "AAA", "TCT", "GAA", "TTT", "GAC", "CGT", "GAT", "GCA", "GCC", "ATG", "CAA", "CGT", "AAG", "TTG", "GAA", "AAG", "ATG", "GCT", "GAT", "CAA", "GCT", "ATG", "ACC", "CAA", "ATG", "TAT", "AAA", "CAG", "GCT", "AGA", "TCT", "GAG", "GAC", "AAG", "AGG", "GCA", "AAA", "GTT", "ACT", "AGT", "GCT", "ATG", "CAG", "ACA", "ATG", "CTT", "TTC", "ACT", "ATG", "CTT", "AGA", "AAG", "TTG", "GAT", "AAT", "GAT", "GCA", "CTC", "AAC", "AAC", "ATT", "ATC", "AAC", "AAT", "GCA", "AGA", "GAT", "GGT", "TGT", "GTT", "CCC", "TTG", "AAC", "ATA", "ATA", "CCT", "CTT", "ACA", "ACA", "GCA", "GCC", "AAA", "CTA", "ATG", "GTT", "GTC", "ATA", "CCA", "GAC", "TAT", "AAC", "ACA", "TAT", "AAA", "AAT", "ACG", "TGT", "GAT", "GGT", "ACA", "ACA", "TTT", "ACT", "TAT", "GCA", "TCA", "GCA", "TTG", "TGG", "GAA", "ATC", "CAA", "CAG", "GTT", "GTA", "GAT", "GCA", "GAT", "AGT", "AAA", "ATT", "GTT", "CAA", "CTT", "AGT", "GAA", "ATT", "AGT", "ATG", "GAC", "AAT", "TCA", "CCT", "AAT", "TTA", "GCA", "TGG", "CCT", "CTT", "ATT", "GTA", "ACA", "GCT", "TTA", "AGG", "GCC", "AAT", "TCT", "GCT", "GTC", "AAA", "TTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_469253_Shanghai_20200228_null_45432",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":6078.682114681296,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03810072538840335],
[0.01359215117557602],
[0.02394825674940551],
[0.05171924130572447],
[0.02907971435520079],
[0.01037397240155329],
[0.01827808941899269],
[0.03947380918621389],
[0.01036545568868744],
[0.003697799432639048],
[0.006515219634973863],
[0.01407042775543034],
[0.02822259455982425],
[0.01006820127211746],
[0.01773934574113812],
[0.03831032515610445],
[0.01522801170833621],
[0.005432480225327834],
[0.00957158506712282],
[0.02067102933398619],
[0.01162251443146677],
[0.004146245815070303],
[0.00730534541904429],
[0.01577680273361023],
[0.004142841874543828],
[0.001477928109800383],
[0.002603988240968281],
[0.005623636726512492],
[0.01127994273115438],
[0.00402403590196095],
[0.007090021564956765],
[0.01531178406920545],
[0.03587826600405594],
[0.01279930527498794],
[0.02255132723142637],
[0.04870239813490595],
[0.02738346097933909],
[0.009768846591433919],
[0.01721190732027743],
[0.03717125623564611],
[0.009760826668281113],
[0.003482102514359257],
[0.006135179337283378],
[0.01324968342870011],
[0.02657633797308731],
[0.009480911445674237],
[0.01670458918433578],
[0.03607563957485563],
[0.008325465411215711],
[0.03167907338750447],
[0.01781190871885643],
[0.006354266318140633],
[0.01119569663957056],
[0.02417850042893048],
[0.002264976373229957],
[0.003990702797281803],
[0.00861841941615106],
[0.01728690564042552],
[0.00616697536404642],
[0.01086570532343887],
[0.02346584310750634]
],
"Log Likelihood":-2767.779364386088,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.5200664273346072, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":270
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":6593.515455785699,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3248097218685454],
[0.1800002829414594],
[0.2035763800469683],
[0.2916136151430269]
],
"Log Likelihood":-2814.112174624342,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2505175585676968,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1249864895353577,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.147498020292182,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.886041519313507,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.5874701641264396
},
"display order":0,
"estimated parameters":481
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-06-18/sequences.nsp8.compressed.fas",
"number of sequences":238,
"number of sites":198,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_462097_Dhaka_20200523_null_2,epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1,epi_isl_465582_England_20200504_null_2,(epi_isl_429694_Minas_gerais_20200318_null_1,epi_isl_435588_California_20200302_null_1)Node119,epi_isl_463007_Taipei_20200412_null_2,epi_isl_460959_Gelderland_20200518_null_4,epi_isl_437869_Connecticut_20200403_null_1,epi_isl_434248_Washington_20200401_null_1,epi_isl_440305_England_20200319_null_1,epi_isl_458903_England_20200414_null_17,(epi_isl_454434_Maryland_20200315_null_1,epi_isl_462048_England_20200419_null_2)Node135,epi_isl_424636_Li_ge_20200403_null_1,epi_isl_468688_British_Columbia_20200401_null_12,epi_isl_441455_England_20200409_null_1,epi_isl_434875_Texas_20200324_null_3,epi_isl_466127_England_20200331_null_1,epi_isl_467716_England_20200520_null_6,epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_461920_England_20200519_null_5,epi_isl_463059_Odisha_20200513_null_1,epi_isl_447159_Liege_20200419_null_2,epi_isl_446991_Wales_20200417_null_12,epi_isl_456688_England_20200518_null_3,epi_isl_460453_Massachusetts_20200326_null_2,epi_isl_465655_England_20200512_null_3,epi_isl_450190_California_20200508_null_1,(epi_isl_456838_Scotland_20200507_null_1,epi_isl_462399_Singapore_20200414_null_5)Node167,epi_isl_468711_LA_20200408_null_16,epi_isl_468563_California_20200313_null_123,epi_isl_437691_Makkah_20200405_null_1,epi_isl_434385_Antwerp_20200411_null_1,epi_isl_467363_Rio_de_Janeiro_20200427_null_12,epi_isl_449404_England_20200328_null_2,epi_isl_465839_England_20200327_null_30,epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1,epi_isl_456506_Victoria_20200101_null_9,epi_isl_461662_Scotland_20200424_null_9,epi_isl_444278_Taoyuan_20200320_null_1,epi_isl_456755_England_20200521_null_2,epi_isl_467245_Madrid_20200401_null_8,(epi_isl_454949_Hubei_20200322_null_1,epi_isl_466064_England_20200401_null_1)Node201,epi_isl_468310_Sao_Paulo_20200322_null_3,epi_isl_463016_Odisha_20200509_null_1,epi_isl_444411_England_20200419_null_2,epi_isl_461154_Noord_Brabant_20200324_null_33,epi_isl_463448_Washington_20200429_null_2,epi_isl_467251_Madrid_20200402_null_2,epi_isl_451142_South_Australia_20200330_null_10,epi_isl_434838_Texas_20200321_null_1,epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_2,epi_isl_456931_Scotland_20200420_null_1,epi_isl_438353_England_20200329_null_1,epi_isl_432107_Wales_20200325_null_2,epi_isl_446670_Wales_20200415_null_8,epi_isl_466559_England_20200403_null_15,epi_isl_465710_England_20200429_null_3,epi_isl_427480_New_York_20200401_null_1,epi_isl_450516_Beirut_20200315_null_1,epi_isl_460850_Friesland_20200414_null_2,epi_isl_465675_England_20200518_null_2,epi_isl_455117_Friesland_20200331_null_1,(epi_isl_458294_North_Carolina_20200401_null_1,epi_isl_464079_Soignies_20200406_null_13)Node241,epi_isl_468620_California_20200331_null_27,epi_isl_465193_England_20200416_null_2,epi_isl_421980_England_20200331_null_1,epi_isl_429470_Unknown_20200323_null_1,epi_isl_461738_Scotland_20200402_null_2,epi_isl_468624_California_20200402_null_8,epi_isl_447886_California_20200323_null_1,epi_isl_419986_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_421393_New_York_20200318_null_2,epi_isl_469065_Stockholm_20200528_null_2,epi_isl_444383_England_20200101_null_3,epi_isl_436321_Comunitat_Valenciana_20200319_null_2,epi_isl_457090_England_20200418_null_3,epi_isl_462264_Sint_Niklaas_20200323_null_6,epi_isl_442361_England_20200417_null_2,epi_isl_433733_England_20200405_null_4,epi_isl_452202_Maharashtra_20200316_null_6,epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_6,epi_isl_439380_England_20200331_null_1,epi_isl_455083_New_South_Wales_20200406_null_1,(epi_isl_453738_England_20200421_null_1,epi_isl_462070_England_20200518_null_5)Node283,(epi_isl_437465_Makkah_20200323_null_1,epi_isl_461038_Limburg_20200406_null_6)Node286,epi_isl_449357_England_20200329_null_1,epi_isl_442004_England_20200325_null_1,epi_isl_465660_England_20200513_null_3,epi_isl_468699_British_Columbia_20200401_null_28,epi_isl_463083_Odisha_20200516_null_1,epi_isl_467486_KZN_20200514_null_1,epi_isl_444246_England_20200419_null_1,(epi_isl_452198_Maharashtra_20200420_null_1,epi_isl_468662_British_Columbia_20200401_null_1)Node301,epi_isl_447043_Gujarat_20200503_null_1,epi_isl_437356_Kinshasa_20200418_null_2,epi_isl_463404_Washington_20200427_null_1,epi_isl_462979_Wyoming_20200330_null_1,epi_isl_463531_Washington_20200503_null_1,epi_isl_449207_Scotland_20200427_null_1,(epi_isl_461990_England_20200507_null_8,epi_isl_467393_New_York_20200425_null_1)Node314,epi_isl_445832_Wales_20200410_null_2,epi_isl_453534_England_20200501_null_1,epi_isl_468280_Basel_Landschaft_20200428_null_30,epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1,epi_isl_437538_West_Bengal_20200405_null_1,epi_isl_469253_Shanghai_20200228_null_45432,epi_isl_466429_England_20200410_null_4,epi_isl_464703_England_20200311_null_1,epi_isl_428349_Ile_De_France_20200323_null_2,epi_isl_446467_Wales_20200413_null_4,epi_isl_469139_Singapore_20200606_null_3,epi_isl_444006_England_20200327_null_1,epi_isl_436895_Wisconsin_20200428_null_2,epi_isl_444589_Illinois_20200320_null_1,epi_isl_461398_Zuid_Holland_20200503_null_42,epi_isl_452634_Basque_Country_20200328_null_4,epi_isl_464856_England_20200311_null_1,epi_isl_465187_England_20200418_null_3,epi_isl_458215_Morlanwelz_20200329_null_2,epi_isl_440703_England_20200401_null_1,epi_isl_444871_Unknown_20200327_null_2,(epi_isl_447576_Telangana_20200402_null_1,epi_isl_467853_Massachusetts_20200314_null_4)Node359,epi_isl_454472_Stockholm_20200307_null_1,epi_isl_459564_Scotland_20200326_null_2,epi_isl_437584_California_20200315_null_1,epi_isl_433360_Scotland_20200328_null_1,epi_isl_444919_Unknown_20200329_null_2,epi_isl_453066_Scotland_20200416_null_1,epi_isl_465184_England_20200417_null_7,epi_isl_426787_Victoria_20200323_null_2,epi_isl_447857_Telangana_20200402_null_6,epi_isl_460835_Flevoland_20200501_null_1,epi_isl_458178_Etterbeek_20200328_null_3,epi_isl_440033_England_20200322_null_1,epi_isl_433057_England_20200404_null_1,epi_isl_439006_Scotland_20200423_null_1,epi_isl_465539_England_20200501_null_7,epi_isl_460957_Gelderland_20200518_null_1,epi_isl_468428_California_20200429_null_20,((epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1,epi_isl_461208_Noord_Holland_20200427_null_1)Node397,epi_isl_466692_Chattogram_20200526_null_12)Node396,epi_isl_453017_Scotland_20200409_null_1,epi_isl_465974_England_20200330_null_12,epi_isl_440669_England_20200401_null_4,epi_isl_430228_Washington_20200323_null_1,epi_isl_444746_New_York_20200402_null_1,epi_isl_446113_Wales_20200407_null_1,epi_isl_462707_Michigan_20200417_null_2,(epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1,epi_isl_435457_Louisiana_20200402_null_1)Node406,epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1,epi_isl_448969_Northern_Ireland_20200328_null_1,epi_isl_462644_Michigan_20200429_null_5,epi_isl_445169_California_20200328_null_1,epi_isl_454729_Utah_20200416_null_1,epi_isl_459321_England_20200430_null_6,epi_isl_452415_Andalusia_20200314_null_2,epi_isl_465797_England_20200318_null_2,(epi_isl_457580_England_20200505_null_1,epi_isl_467350_Rio_de_Janeiro_20200417_null_9)Node43,epi_isl_469003_Balear_Islands_20200327_null_39,epi_isl_426025_New_York_20200303_null_1,epi_isl_468739_Ghent_20200313_null_1,epi_isl_467349_Rio_de_Janeiro_20200417_null_8,epi_isl_442715_England_20200406_null_3,epi_isl_428720_Ankara_20200321_null_1,epi_isl_450783_Gujarat_20200411_null_10,epi_isl_467366_Rio_de_Janeiro_20200427_null_19,epi_isl_442883_England_20200410_null_1,epi_isl_435059_EC_20200320_null_1,epi_isl_453012_Scotland_20200403_null_5,epi_isl_460945_Gelderland_20200504_null_3,epi_isl_465244_England_20200414_null_2,(epi_isl_465960_England_20200330_null_86,epi_isl_455283_Netherlands_20200317_null_1,epi_isl_460691_Netherlands_20200330_null_1)Node445,epi_isl_465694_Quebec_20200327_null_6,epi_isl_460462_Massachusetts_20200326_null_2,epi_isl_423992_England_20200321_null_1,epi_isl_429023_California_20200331_null_2,epi_isl_459075_England_20200409_null_2,epi_isl_454183_Portugal_20200417_null_3,epi_isl_437634_Unknown_20200401_null_1,epi_isl_432600_England_20200329_null_1,epi_isl_452668_Basque_Country_20200326_null_2,epi_isl_464512_England_20200306_null_7,epi_isl_448534_England_20200406_null_2,epi_isl_423898_England_20200318_null_1,epi_isl_465682_Quebec_20200327_null_5,epi_isl_448755_England_20200101_null_1,epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1,(epi_isl_467149_Basque_Country_20200318_null_1,epi_isl_468320_Sao_Paulo_20200413_null_5)Node16,epi_isl_467117_Basque_Country_20200317_null_4,epi_isl_468768_Aragon_20200321_null_2,epi_isl_452008_Denmark_20200311_null_1,epi_isl_434980_Texas_20200331_null_1,epi_isl_461732_Scotland_20200331_null_2,epi_isl_467375_North_Sulawesi_20200323_null_4,epi_isl_452101_Denmark_20200327_null_1,epi_isl_460616_British_Columbia_20200301_null_2,epi_isl_435534_New_York_20200420_null_2,epi_isl_453636_England_20200422_null_2,epi_isl_460029_Michigan_20200330_null_3,epi_isl_441895_England_20200430_null_1,epi_isl_444464_Gujarat_20200429_null_1,epi_isl_458754_England_20200409_null_3,epi_isl_465846_England_20200328_null_1,epi_isl_457491_England_20200507_null_1,epi_isl_452163_Utah_20200415_null_2,(epi_isl_420349_Haulchin_20200305_null_2,epi_isl_424171_Washington_20200319_null_1)Node79,epi_isl_454344_Portugal_20200325_null_1,epi_isl_433749_England_20200406_null_2,epi_isl_446270_Wales_20200402_null_4,epi_isl_463101_Virginia_20200430_null_3,epi_isl_440670_England_20200404_null_3,epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1,epi_isl_438187_Washington_20200417_null_5,epi_isl_469137_Singapore_20200417_null_18,epi_isl_449118_England_20200408_null_2,epi_isl_439903_England_20200401_null_1,epi_isl_467325_British_Columbia_20200401_null_4,epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_2,epi_isl_450748_Minnesota_20200329_null_1,epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1,epi_isl_458571_England_20200507_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node119":"test",
"Node135":"test",
"Node16":"test",
"Node167":"test",
"Node201":"test",
"Node241":"test",
"Node283":"test",
"Node286":"test",
"Node301":"test",
"Node314":"test",
"Node359":"test",
"Node396":"test",
"Node397":"test",
"Node406":"test",
"Node43":"test",
"Node445":"test",
"Node79":"test",
"epi_isl_406592_Guangdong_20200113_null_1":"test",
"epi_isl_406799_Wuhan_20191231_null_1":"test",
"epi_isl_413870_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":"test",
"epi_isl_419986_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420349_Haulchin_20200305_null_2":"test",
"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_421482_Portugal_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421980_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423898_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423992_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424171_Washington_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424636_Li_ge_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_426025_New_York_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_426787_Victoria_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_427480_New_York_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_428349_Ile_De_France_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_428720_Ankara_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_428729_Wisconsin_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_429023_California_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_429470_Unknown_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_429694_Minas_gerais_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_430228_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_432107_Wales_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_432600_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_433057_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_433360_Scotland_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_433733_England_20200405_null_4":"test",
"epi_isl_433749_England_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_434248_Washington_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_434385_Antwerp_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_434838_Texas_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_434875_Texas_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_434980_Texas_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_435059_EC_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_435457_Louisiana_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_435534_New_York_20200420_null_2":"test",
"epi_isl_435588_California_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_436321_Comunitat_Valenciana_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_436895_Wisconsin_20200428_null_2":"test",
"epi_isl_437356_Kinshasa_20200418_null_2":"test",
"epi_isl_437465_Makkah_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_437538_West_Bengal_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_437584_California_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_437634_Unknown_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_437691_Makkah_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_437869_Connecticut_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_438187_Washington_20200417_null_5":"test",
"epi_isl_438353_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_439006_Scotland_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_439380_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_439903_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_440033_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_440305_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_440669_England_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_440670_England_20200404_null_3":"test",
"epi_isl_440703_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_441455_England_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_441895_England_20200430_null_1":"test",
"epi_isl_442004_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_442361_England_20200417_null_2":"test",
"epi_isl_442715_England_20200406_null_3":"test",
"epi_isl_442883_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_444006_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_444246_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_444278_Taoyuan_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_444383_England_20200101_null_3":"test",
"epi_isl_444411_England_20200419_null_2":"test",
"epi_isl_444464_Gujarat_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_444589_Illinois_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_444746_New_York_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_444871_Unknown_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_444919_Unknown_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_445169_California_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_445832_Wales_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_446113_Wales_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_446270_Wales_20200402_null_4":"test",
"epi_isl_446467_Wales_20200413_null_4":"test",
"epi_isl_446670_Wales_20200415_null_8":"test",
"epi_isl_446991_Wales_20200417_null_12":"test",
"epi_isl_447043_Gujarat_20200503_null_1":"test",
"epi_isl_447159_Liege_20200419_null_2":"test",
"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1":"test",
"epi_isl_447576_Telangana_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_447857_Telangana_20200402_null_6":"test",
"epi_isl_447886_California_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_448534_England_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_448755_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_448969_Northern_Ireland_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_449118_England_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_449207_Scotland_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_449357_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_449404_England_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_450190_California_20200508_null_1":"test",
"epi_isl_450516_Beirut_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_450748_Minnesota_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_450783_Gujarat_20200411_null_10":"test",
"epi_isl_451142_South_Australia_20200330_null_10":"test",
"epi_isl_452008_Denmark_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_452101_Denmark_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_452163_Utah_20200415_null_2":"test",
"epi_isl_452198_Maharashtra_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_452202_Maharashtra_20200316_null_6":"test",
"epi_isl_452415_Andalusia_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_452634_Basque_Country_20200328_null_4":"test",
"epi_isl_452668_Basque_Country_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_453012_Scotland_20200403_null_5":"test",
"epi_isl_453017_Scotland_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_453066_Scotland_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_453534_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_453636_England_20200422_null_2":"test",
"epi_isl_453738_England_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_454183_Portugal_20200417_null_3":"test",
"epi_isl_454344_Portugal_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_454434_Maryland_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_454472_Stockholm_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_454729_Utah_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_454949_Hubei_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_455083_New_South_Wales_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_455117_Friesland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_455283_Netherlands_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_456506_Victoria_20200101_null_9":"test",
"epi_isl_456688_England_20200518_null_3":"test",
"epi_isl_456755_England_20200521_null_2":"test",
"epi_isl_456838_Scotland_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_456931_Scotland_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_457090_England_20200418_null_3":"test",
"epi_isl_457491_England_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_457580_England_20200505_null_1":"test",
"epi_isl_458150_Casablanca_20200515_null_6":"test",
"epi_isl_458178_Etterbeek_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_458215_Morlanwelz_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_458294_North_Carolina_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_458571_England_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_458754_England_20200409_null_3":"test",
"epi_isl_458903_England_20200414_null_17":"test",
"epi_isl_459075_England_20200409_null_2":"test",
"epi_isl_459321_England_20200430_null_6":"test",
"epi_isl_459564_Scotland_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_460029_Michigan_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_460453_Massachusetts_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_460462_Massachusetts_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_460616_British_Columbia_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_460691_Netherlands_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_460835_Flevoland_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_460850_Friesland_20200414_null_2":"test",
"epi_isl_460945_Gelderland_20200504_null_3":"test",
"epi_isl_460957_Gelderland_20200518_null_1":"test",
"epi_isl_460959_Gelderland_20200518_null_4":"test",
"epi_isl_461038_Limburg_20200406_null_6":"test",
"epi_isl_461154_Noord_Brabant_20200324_null_33":"test",
"epi_isl_461208_Noord_Holland_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_461398_Zuid_Holland_20200503_null_42":"test",
"epi_isl_461662_Scotland_20200424_null_9":"test",
"epi_isl_461732_Scotland_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_461738_Scotland_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_461920_England_20200519_null_5":"test",
"epi_isl_461990_England_20200507_null_8":"test",
"epi_isl_462048_England_20200419_null_2":"test",
"epi_isl_462070_England_20200518_null_5":"test",
"epi_isl_462097_Dhaka_20200523_null_2":"test",
"epi_isl_462264_Sint_Niklaas_20200323_null_6":"test",
"epi_isl_462399_Singapore_20200414_null_5":"test",
"epi_isl_462644_Michigan_20200429_null_5":"test",
"epi_isl_462707_Michigan_20200417_null_2":"test",
"epi_isl_462979_Wyoming_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_463002_Tunisia_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_463007_Taipei_20200412_null_2":"test",
"epi_isl_463016_Odisha_20200509_null_1":"test",
"epi_isl_463059_Odisha_20200513_null_1":"test",
"epi_isl_463083_Odisha_20200516_null_1":"test",
"epi_isl_463101_Virginia_20200430_null_3":"test",
"epi_isl_463404_Washington_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_463448_Washington_20200429_null_2":"test",
"epi_isl_463531_Washington_20200503_null_1":"test",
"epi_isl_463893_Tuzla_20200525_null_1":"test",
"epi_isl_464079_Soignies_20200406_null_13":"test",
"epi_isl_464512_England_20200306_null_7":"test",
"epi_isl_464703_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_464856_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_465184_England_20200417_null_7":"test",
"epi_isl_465187_England_20200418_null_3":"test",
"epi_isl_465193_England_20200416_null_2":"test",
"epi_isl_465244_England_20200414_null_2":"test",
"epi_isl_465539_England_20200501_null_7":"test",
"epi_isl_465582_England_20200504_null_2":"test",
"epi_isl_465655_England_20200512_null_3":"test",
"epi_isl_465660_England_20200513_null_3":"test",
"epi_isl_465675_England_20200518_null_2":"test",
"epi_isl_465682_Quebec_20200327_null_5":"test",
"epi_isl_465694_Quebec_20200327_null_6":"test",
"epi_isl_465710_England_20200429_null_3":"test",
"epi_isl_465797_England_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_465839_England_20200327_null_30":"test",
"epi_isl_465846_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_465960_England_20200330_null_86":"test",
"epi_isl_465974_England_20200330_null_12":"test",
"epi_isl_466064_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_466127_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_466429_England_20200410_null_4":"test",
"epi_isl_466559_England_20200403_null_15":"test",
"epi_isl_466692_Chattogram_20200526_null_12":"test",
"epi_isl_467117_Basque_Country_20200317_null_4":"test",
"epi_isl_467149_Basque_Country_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_467245_Madrid_20200401_null_8":"test",
"epi_isl_467251_Madrid_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_467325_British_Columbia_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_467349_Rio_de_Janeiro_20200417_null_8":"test",
"epi_isl_467350_Rio_de_Janeiro_20200417_null_9":"test",
"epi_isl_467363_Rio_de_Janeiro_20200427_null_12":"test",
"epi_isl_467366_Rio_de_Janeiro_20200427_null_19":"test",
"epi_isl_467375_North_Sulawesi_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_467393_New_York_20200425_null_1":"test",
"epi_isl_467486_KZN_20200514_null_1":"test",
"epi_isl_467716_England_20200520_null_6":"test",
"epi_isl_467853_Massachusetts_20200314_null_4":"test",
"epi_isl_468075_Dhaka_20200514_null_2":"test",
"epi_isl_468280_Basel_Landschaft_20200428_null_30":"test",
"epi_isl_468310_Sao_Paulo_20200322_null_3":"test",
"epi_isl_468320_Sao_Paulo_20200413_null_5":"test",
"epi_isl_468428_California_20200429_null_20":"test",
"epi_isl_468563_California_20200313_null_123":"test",
"epi_isl_468620_California_20200331_null_27":"test",
"epi_isl_468624_California_20200402_null_8":"test",
"epi_isl_468662_British_Columbia_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_468688_British_Columbia_20200401_null_12":"test",
"epi_isl_468699_British_Columbia_20200401_null_28":"test",
"epi_isl_468711_LA_20200408_null_16":"test",
"epi_isl_468739_Ghent_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_468768_Aragon_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_469003_Balear_Islands_20200327_null_39":"test",
"epi_isl_469065_Stockholm_20200528_null_2":"test",
"epi_isl_469137_Singapore_20200417_null_18":"test",
"epi_isl_469139_Singapore_20200606_null_3":"test",
"epi_isl_469253_Shanghai_20200228_null_45432":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":4
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":3
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":8
}
}
}